The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
5
|
sequence length |
73
|
structure length |
73
|
Chain Sequence |
GSSGSSGPCCRALYDFEPENEGELGFKEGDIITLTNQIDENWYEGMLHGHSGFFPINYVEILVALPHSGPSSG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution structures of the SH3 domain of human SH3-containing GRB2-like protein 2
rcsb |
| molecule keywords |
SH3-containing GRB2-like protein 2
|
| molecule tags |
Transferase, signaling protein
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
5
|
| structure length |
73
|
| sequence length |
73
|
| ec nomenclature |
ec
2.3.1.-: |
| pdb deposition date | 2005-12-15 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF07653 | SH3_2 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1AD5 A; 1ZX6 A; 1B3Q A; 3ZL7 C; 4X1V A; 2ESW A; 2KYB A; 4RTT A; 2LCS A; 4DEX A; 2VWF A; 3EG3 A; 2DL4 A; 1A0N B; 3H0H A; 2CT3 A; 2KRS A; 1UHC A; 1HJD A; 4OMQ A; 2DL5 A; 2EYX A; 4JPB W; 1KIK A; 2VVK A; 2NWM A; 1I07 A; 1K0X A; 2LQN A; 2DRK A; 1NYG A; 2EGA A; 2LQW A; 2J6F A; 2FPE A; 2RQU A; 4ZNX A; 3UAT A; 1I0C A; 1HD3 A; 1GCQ A; 1X2K A; 4FSS A; 4CC3 A; 1SPK A; 1JQQ A; 2EQI A; 4AG1 C; 1ZLM A; 2GNC A; 2YUQ A; 2ABL A; 2HBW A; 1AWW A; 4LNP A; 1ABQ A; 2YUN A; 2KR3 A; 3U23 A; 4D8D A; 2KXD A; 3TSW A; 2LNH B; 2GGR A; 2DLP A; 4QT7 A; 2LMJ A; 2JM9 A; 1LCK A; 1RUW A; 1MV0 B; 1YCS B; 3SEM A; 4AFS C; 1PWT A; 1ZUY A; 2DNU A; 1ZUK A; 2DL7 A; 4JJC A; 2MCN A; 1H3H A; 1JEG A; 2CUB A; 1UUE A; 1T3L A; 4J9I A; 2L3S A; 1FMK A; 2O31 A; 1AOJ A; 4K11 A; 2EBP A; 2A08 A; 2JS0 A; 2RQT A; 5HCK A; 4J9B A; 1AEY A; 2M51 A; 1W70 A; 2DL8 A; 3H0I A; 2FEI A; 2F2W A; 5IXF A; 2KT8 A; 1G83 A; 2BTT A; 2L2P A; 2K9G A; 2GQI A; 2KGT A; 4LUD A; 4GBQ A; 3VS2 A; 1GCQ C; 2O2O A; 4RTX A; 1SHG A; 4Z8A A; 2DA9 A; 2FRY A; 1BU1 A; 4RTZ A; 2RQW A; 3ULR B; 1H92 A; 1OPL A; 2D8H A; 2JTE A; 2LZ6 B; 1ZBJ A; 1UHF A; 1PKS A; 3R6N A; 2GBQ A; 3H41 A; 2KEA A; 3LH5 A; 2NUZ A; 2HEQ A; 4D8K A; 2KT1 A; 1X43 A; 2D8J A; 3NMZ C; 2IIM A; 4Y92 A; 1WXB A; 2LP5 A; 1WLP B; 2RQR A; 2EYY A; 1Y57 A; 2W0Z A; 4RTY A; 1SRL A; 2EVR A; 4LE9 A; 3UA6 A; 2B86 A; 3REB B; 4AFU C; 2MIO A; 1QKW A; 2E5K A; 4RUG A; 1MUZ A; 2RF0 A; 1VA7 A; 3JV3 A; 2KRN A; 1QKX A; 1AWX A; 2SRC A; 4RTW A; 1JU5 C; 4IIM A; 5IH2 A; 5GJV B; 1X2Q A; 3EG1 A; 1Y0M A; 4AFZ C; 1PNJ A; 1UDL A; 1OOT A; 2LJ0 A; 1MV3 A; 1KJW A; 1JO8 A; 1JXM A; 2AZS A; 1YWP A; 2JMC A; 4AG2 C; 2JT4 A; 2D1X A; 1QCF A; 4JZ4 A; 2YT6 A; 3RBB B; 1WFW A; 2K3B A; 3SHW A; 2F2X A; 2LX7 A; 2ROT A; 3M0T A; 2LJ1 A; 3FJ5 A; 2JM8 A; 1OV3 A; 2X3X D; 2DMO A; 2BZX A; 4CC4 B; 4HVV A; 1KSW A; 2KBT A; 1AVZ C; 4JZ3 A; 1T0J A; 1VYT A; 1Z9Z A; 3GBQ A; 1RI9 A; 1N5Z A; 1HSQ A; 1GFD A; 2DYB A; 2G6F X; 4OMO A; 1T0H A; 1PKT A; 2EGE A; 2A36 A; 1NEB A; 2DM1 A; 4A63 B; 2EYZ A; 1CSK A; 3VS4 A; 1K0S A; 2LJ3 A; 3EHQ A; 2AK5 A; 2PTK A; 1YN8 A; 4JJB A; 1WYX A; 2YDL A; 1PRM C; 2O9V A; 2OI3 A; 3RNJ A; 3M0S A; 1J3T A; 1OPK A; 4ESR A; 1UEC A; 4OMN A; 1BBZ A; 5FWC A; 3UF4 A; 2EGC A; 2HSP A; 1GBR A; 5EC7 A; 4KRT A; 3I9Q A; 1GFC A; 3EHR A; 5FWB A; 4HVU A; 2RPN A; 1NYF A; 1AZG B; 1BB9 A; 1YNZ A; 3EG0 A; 3PVL A; 2ROL A; 4J9E A; 1PHT A; 2M0Y A; 3NHN A; 2K7A A; 3NPF A; 1ARK A; 1UFF A; 4R0K A; 1WDX A; 1M27 C; 2ENM A; 2RMO A; 2KE9 A; 2FG0 A; 3A98 A; 2EYW A; 3VS7 A; 1GRI A; 1W1F A; 1K76 A; 1SHF A; 1ZSG A; 1JXO A; 1OEB A; 3IQL A; 5ECA A; 1X6G A; 1S1N A; 1GCP A; 3M0P A; 2OJ2 A; 1EFN A; 1TUD A; 1YWO A; 1BK2 A; 2OAW A; 1TG0 A; 2ED0 A; 4J9G A; 4ORZ A; 1E7O A; 2P4R A; 4Z89 A; 3H0F A; 2CH4 W; 2DBM A; 2KYM A; 4Z88 A; 1WX6 A; 4J9F A; 1M3C A; 1XOV A; 4AFQ C; 2EKH A; 2DBK A; 2CUD A; 1Z9Q A; 1ABO A; 2FPF A; 2CRE A; 2X3W D; 1K1Z A; 2J7I A; 3PE0 A; 1X69 A; 1NLP C; 3QWX X; 2W10 A; 2L0A A; 1E6H A; 1K4U S; 1UJ0 A; 1AWJ A; 4IIO A; 3CQT A; 1X27 A; 2FO0 A; 2YUP A; 1WI7 A; 1NEG A; 2PNI A; 1PRL C; 1WA7 A; 2FRW A; 2F2V A; 4F17 A; 1TUC A; 3VRY A; 3QWY A; 4J9D A; 2K2M A; 2RNA A; 5L23 A; 1SEM A; 4J9C A; 4CC7 A; 2GTO A; 3EGU A; 1GL5 A; 5IHN A; 1T3S A; 3M0Q A; 2H8H A; 4DEY A; 3VS1 A; 2J06 A; 1G2B A; 1SRM A; 2ED1 A; 3REA B; 4HVW A; 2C0I A; 1FYN A; 3PVQ A; 1AWO A; 4HXJ A; 2GTJ A; 1W6X A; 1I1J A; 2O88 A; 2D0N A; 4LN2 A; 4F16 A; 1VYV A; 2CSQ A; 1VYU A; 2J6O A; 1SSH A; 2DE0 X; 4OMP A; 1QWE A; 2SEM A; 2J6K A; 1NG2 A; 1K9A A; 2FPD A; 1UGV A; 2JXB A; 2KXC A; 2RQV A; 2BZY A; 1UG1 A; 2AZV A; 3C0C A; 3VRZ A; 1AZE A; 2BZ8 A; 3THK A; 3VS6 A; 2EPD A; 1WIE A; 2VKN A; 3VS5 A; 2JMA A; 1NLO C; 2EW3 A; 2O9S A; 1E6G A; 2KRO A; 1YP5 A; 2L3Q A; 2K79 A; 4RTU A; 4J9H A; 2C0O A; 2DVJ A; 3VS3 A; 3I35 A; 1RLP C; 4WCI A; 2DL3 A; 2A37 A; 2I0N A; 4OMM A; 2XMF A; 1WXT A; 3O5Z A; 1B07 A; 1H8K A; 2JW4 A; 1U5S A; 2DJQ A; 3M0U A; 2AKK A; 1GBQ A; 1M30 A; 2QDL A; 2A28 A; 4E6R A; 2CSI A; 4F14 A; 5GJW B; 1UTI A; 2MOX A; 1M8M A; 3NGP A; 1CKB A; 5I11 A; 4EIK A; 2DIL A; 4CC2 A; 3TSZ A; 4OML A; 1IO6 A; 2YSQ A; 2J05 A; 1M3B A; 2HCK A; 1QWF A; 5IXB A; 2KNB B; 2CT4 A; 1U06 A; 1RLQ C; 1V1C A; 2JS2 A; 2RN8 A; 2CH4 A; 2DRM A; 1X6B A; 1U3O A; 5I22 A; 3KFV A; 1KFZ A; 1NM7 A; 3M0R A; 4M4Z A; 5IHI A; 3VS0 A; 5IHK A; 1UE9 A; 5FW9 A; 2AKL A; 2K6D A; 2DF6 A; 1QLY A; 4GLM A; 2PZ1 A; 4LUE A; 3TVT A; 3I5S A; 1CKA A; 4HCK A; 2YUO A; 3EG2 A; 1WXU A; 1UJY A; 1M3A A; 2CDT A; 2HDA A; 2ECZ A; 2V1R A; 2DX1 A; 2KRM A; 2V1Q A; 4JJD A; 2L3P A; 2C0T A; 3I5R A; 4RTV A; 1ZUU A; 3UA7 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3FEO A; 1FX7 A; 1B3Q A; 1IRX A; 4PJO C; 4EMG A; 2DKG A; 2ESW A; 4B9X A; 2QEX T; 2EAY A; 4XK8 E; 4DEX A; 5L8R E; 4E7S A; 3DLM A; 2HZY A; 3JB9 D; 2CP2 A; 5LJ5 h; 2DL4 A; 4KGV B; 1A0N B; 1OI1 A; 3M59 A; 4MDW A; 1KD1 U; 3JB9 I; 1HJD A; 4OMQ A; 4F04 B; 2JVV A; 2VB6 A; 3OA6 A; 3S3N A; 4C92 A; 1VQO T; 2NWM A; 2EKO A; 3M4Y A; 4GY5 A; 2FPE A; 2E12 A; 2KAF A; 3UAT A; 3FC3 A; 1QMC A; 3HKS A; 1SPK A; 4Y91 A; 1YJW T; 2KMT A; 4M75 G; 1QW1 A; 2ABL A; 3BE3 A; 4D8D A; 2KXD A; 2YLC A; 1N27 A; 1YJN A; 5LJ3 g; 4EMH A; 5GAN 2; 2GGR A; 3TCJ A; 1HK9 A; 3CCM A; 2NUT A; 2XU8 A; 3INZ A; 1MMA A; 5FU6 B; 3CCQ Q; 3CCL T; 2DK3 A; 1RAB B; 4M7D F; 5GAO p; 2MCN A; 1YJ9 Q; 1H3H A; 3QHS A; 5GAO r; 2DET A; 2JS0 A; 1WZO A; 5HCK A; 2ATC B; 2BIV A; 3V8J A; 1LJO A; 5GAO m; 3OS0 A; 4M78 B; 1Y96 B; 2MPX C; 3F70 A; 3VJP A; 2BE9 B; 2BTT A; 3HFO A; 2QDY B; 2KGT A; 4LUD A; 1GCQ C; 1TUG B; 4N4I A; 4RTX A; 3CCE Q; 2DA9 A; 1VQK Q; 5KYU A; 3OW2 P; 1G3Y A; 2A3L A; 3L2R A; 1IB8 A; 4J6X A; 3RMQ A; 4PLI A; 2JTE A; 3H41 A; 3C12 A; 3CCQ A; 2NUZ A; 5FLX E; 2MAM A; 4ELY C; 2D8J A; 3NMZ C; 1SKU B; 2PVO B; 1AHJ B; 1WXB A; 1WLP B; 1YJ9 A; 2LX9 A; 1Y57 A; 3FJP A; 3JAM E; 1QKW A; 2XDB A; 4RUG A; 2RF0 A; 2XI9 A; 3V8L A; 2DZC A; 2KRN A; 2DPP B; 3A8H B; 5AYF A; 1QKX A; 2SRC A; 2MK5 A; 5IH2 A; 2JZ2 A; 4RCC A; 2LJ0 A; 3FDR A; 3CCE A; 3QO3 A; 1VQK A; 1JO8 A; 2EYQ A; 4M75 F; 2L8D A; 2O4X B; 3HPW A; 4A53 A; 4JRQ A; 5LJ5 f; 2WAC A; 1C0M A; 4OP0 A; 1ZHI A; 3L2Z A; 2CGH A; 3RBB B; 2HD0 A; 4L6V 5; 1RAI B; 2ROT A; 5KYY A; 1QCN A; 3FJ5 A; 3RES A; 2CZ7 B; 3CXC S; 1WHL A; 4HA8 A; 1Q82 R; 1N8R U; 1AVZ C; 3EH1 A; 1T0J A; 2VGM A; 1RI9 A; 1N5Z A; 1GFD A; 1WHK A; 4J8O A; 1T0H A; 4PJO D; 2FVU A; 2CP7 A; 3C4S A; 2QK0 A; 3OS1 A; 2DM1 A; 2HBP A; 2EYZ A; 4PFP A; 2AK5 A; 1Q81 U; 2EJ9 A; 4A4F A; 1TU0 B; 1VQ5 Q; 2X51 A; 4M7D B; 1VQ9 A; 2Z0W A; 4ESR A; 4C8Q G; 5HK3 A; 1UEC A; 4N0A A; 3JB9 J; 5KH6 A; 2PUK B; 3BY7 A; 2EGC A; 3RKX A; 2V8K A; 1GFC A; 3UDC A; 4HKE A; 4J7F A; 3CCS A; 2MF2 A; 4E7K A; 4BY6 B; 3PVL A; 2ZPH B; 2ROL A; 3OYL A; 3CCV T; 1PHT A; 1ARK A; 5FRO A; 3CC7 T; 1KC8 C; 1WDX A; 2ENM A; 2RMO A; 2QQS A; 1JXO A; 1VQ7 T; 2RO0 A; 3IQL A; 4IUR A; 4JJN K; 2YHT A; 1S1N A; 2DFU A; 3OW2 A; 1VQ6 Q; 4C0D C; 1EFN A; 1TUD A; 1WHM A; 1KD1 R; 1VQ5 A; 2MI6 A; 2ZCF B; 1NPR A; 1QVG P; 4C92 G; 2OAW A; 1TG0 A; 1Q7Y U; 2ED0 A; 4C0D B; 2HKN A; 3M9Q A; 3OS2 A; 3CME T; 2CH4 W; 4Z88 A; 1QVF P; 1PD1 A; 5A2Q E; 1Z9Q A; 1ZSZ A; 4RG2 A; 1PC0 A; 3OYH A; 4PFO A; 2X3W D; 2FB7 A; 3PE0 A; 4KUL A; 5GAM e; 4X9D A; 3MEA A; 4IIO A; 1MMN A; 1X27 A; 1RAG B; 1WI7 A; 2VGN A; 4M75 C; 3CC2 Q; 2DIG A; 1EIF A; 2PNI A; 2VAS A; 2FRW A; 1VQL T; 1TUC A; 3VRY A; 3I56 Q; 3DB3 A; 1Q86 C; 2FYK A; 2KI7 A; 4J9C A; 1B34 B; 5D6Y A; 2GTO A; 4CC7 A; 1PSF A; 1MMD A; 1LVK A; 2LQK A; 1VQ6 A; 1SG5 A; 2R57 A; 2RM4 A; 4HVW A; 2DJZ A; 2C0I A; 4F7U A; 3PVQ A; 1AWO A; 2GTJ A; 2DD5 A; 4A4E A; 1Y7X A; 4F16 A; 2COW A; 3QG1 A; 4KH0 B; 5CKE A; 4C8Q F; 1YIT Q; 5LJ5 d; 2GFA A; 4E47 A; 1YHQ Q; 1K9A A; 1BIB A; 3LGL A; 4E7L A; 4PJO E; 2E5Q A; 2RQV A; 2QG9 B; 2LDM A; 1M4Z A; 3C0C A; 5LJ5 e; 2JTM A; 4LDU A; 4TVR A; 5GAO q; 3CC2 A; 3GPL A; 3OYB A; 1VQ8 Q; 3JCM c; 2V8J A; 1P92 A; 3I56 A; 3CC4 Q; 4FT4 A; 2P0K A; 3RKW A; 3VS3 A; 2A37 A; 4XTZ A; 3NTI A; 3RDV A; 1KQS P; 4HCB A; 1U1S A; 2M16 A; 2NUP A; 4RMO A; 1KG1 A; 1B07 A; 2LT1 A; 1H8K A; 5GAN h; 2YRV A; 1GBQ A; 2QDL A; 4LDX A; 2CSI A; 2OTL Q; 3PGG A; 4ELZ C; 4C92 F; 1HXD A; 1TS9 A; 2MOX A; 4QQ6 A; 1M8M A; 3OBY A; 1YJN T; 3NGP A; 4MMK A; 3CCM T; 1YIT A; 5C6S A; 4LXC A; 3QII A; 4CC2 A; 1U8R A; 1YHQ A; 1SSF A; 1M3B A; 5KCO A; 3D7S B; 4BI8 B; 2VUB A; 1V1C A; 5GMK j; 2CH4 A; 4ZN1 A; 2QYZ A; 3QJ6 A; 3BW1 A; 2DRM A; 2PVD B; 1VQ8 A; 1NM7 A; 3M0R A; 5IHK A; 5IHI A; 1M90 C; 1R0C B; 3CC4 A; 3JCM h; 3P8H A; 2DF6 A; 4GLM A; 1VQN Q; 3BDL A; 3A5Z B; 3EGD B; 4BDY A; 4KBM B; 3EG2 A; 4OB3 B; 2OTJ Q; 1BCM A; 1N8R R; 1M3A A; 1JJ2 S; 1X75 C; 3LGF A; 1I5L A; 2ECZ A; 4XTU A; 1QVF A; 1R77 A; 5I2S A; 3LW5 E; 2L3P A; 2OTL A; 2C0T A; 1G3W A; 2QQR A; 3T9N A; 3ZL7 C; 3MP1 A; 4E7Z A; 2P0Q A; 2KYB A; 3MO8 A; 1Q81 R; 5GAN 8; 4GLK A; 2LCS A; 2DTI A; 4E7H A; 3CCQ T; 3EFS A; 3EG3 A; 2DXC A; 2CT3 A; 2KRS A; 4L59 A; 1YJ9 T; 3EGX A; 4BAC A; 1KIK A; 4IUP A; 2VVK A; 4NS5 A; 1W4S A; 1UGR B; 4C8Q C; 2EGA A; 3Q1J A; 4ZNX A; 2M1H A; 4MZT A; 1WPY A; 2EQI A; 1AWW A; 4LNP A; 2YUN A; 3U23 A; 3TSW A; 4M75 D; 2LNH B; 3CCE T; 2DLP A; 1VQK T; 1KQ2 A; 4QT7 A; 2RK2 A; 4M7A A; 1MGQ A; 1QP2 A; 2LMJ A; 4FCY A; 2E4H A; 3CEY A; 3QZ5 B; 2DNU A; 1ZUK A; 4R56 A; 4JJC A; 1BI2 A; 4XU1 A; 1JEG A; 1T3L A; 1D09 B; 1Q7Y R; 2RJF A; 2E10 A; 4HCZ A; 1AOJ A; 4K11 A; 3OMC A; 2PU9 B; 4XTY A; 1AEY A; 2DL8 A; 3H0I A; 1KQS A; 4BDZ A; 1H64 1; 3EFO B; 5IXF A; 5KYN A; 2K9G A; 2D0Q B; 4C92 B; 2GFU A; 1SHG A; 1FXX A; 1O75 A; 2LRQ A; 2PUO B; 4RTZ A; 1VQ4 Q; 1FMV A; 2R5A A; 1H92 A; 3HRS A; 3SB2 A; 4FW2 A; 5DLO A; 1PKS A; 2X4J A; 4Y28 E; 3SWN C; 2KEA A; 2KQW A; 3LH5 A; 3CXC P; 4KUD K; 1K8A U; 3G71 A; 3JCM f; 2NUT B; 2IIM A; 1HYO A; 3SWN B; 3X24 B; 3LH0 A; 2EYY A; 4LE9 A; 2B86 A; 4OMF B; 1KC8 U; 4BI4 A; 3E9G A; 1IXD A; 4ZGE B; 4MDX A; 3MPU B; 4UC4 A; 1MUZ A; 2EQK A; 2CZ0 B; 1YCY A; 3V8K A; 5CQX A; 4M7A D; 5CKD A; 3LYI A; 3LWH A; 1JU5 C; 4DQ2 A; 1O9S A; 4XAX B; 4IIM A; 1K73 C; 1WHH A; 3EG1 A; 4EMK A; 4LD6 A; 3OB9 A; 1UDL A; 1OOT A; 1M1F A; 1NZ9 A; 9ATC B; 1RAA B; 1YFN A; 5CR2 A; 1UGQ B; 2NLU A; 3JCM J; 1VQ4 A; 3NTK A; 4JUV A; 1VQ5 T; 2D1X A; 3ER0 A; 4JZ4 A; 2YT6 A; 3ZBD A; 1KHI A; 2K3B A; 3M0T A; 2WSC E; 2E3H A; 1OV3 A; 3QBY A; 2KVQ G; 2CZ6 B; 3VKI A; 4CC4 B; 3FB9 A; 1RAC B; 3EFR A; 3MP6 A; 1G3S A; 2DTH A; 2XHC A; 4O5V A; 5FU6 C; 3E1S A; 1Z9Z A; 2JNG A; 5GMK m; 3GBQ A; 1Q86 U; 4YTL A; 4OMO A; 5CVI A; 4M75 E; 2RHY A; 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