The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
5
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sequence length |
69
|
structure length |
69
|
Chain Sequence |
GSSGSSGAQEYRALYDYTAQNPDELDLSAGDILEVILEGEDGWWTVERNGQRGFVPGSYLEKLSGPSSG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution structure of the SH3 domain of the human Proline-serine-threonine phosphatase-interacting protein 1
rcsb |
| molecule keywords |
Proline-serine-threonine phosphatase-interacting protein 1
|
| molecule tags |
Cell adhesion
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
5
|
| structure length |
69
|
| sequence length |
69
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2006-03-30 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF14604 | SH3_9 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2J05 A; 2ED0 A; 2O2O A; 2O9S A; 4RTY A; 1B07 A; 1X43 A; 1GL5 A; 2JMA A; 3REA B; 2IIM A; 4RTU A; 1ZUU A; 1ZLM A; 1K9A A; 2DLP A; 1WXT A; 4AFU C; 1UDL A; 2FRY A; 1QWF A; 2GQI A; 2QDL A; 3FJ5 A; 2CT3 A; 2EW3 A; 2P4R A; 4JZ4 A; 3UA6 A; 1W70 A; 3KFV A; 3TSZ A; 2RNA A; 1AWW A; 2M51 A; 1WXB A; 2KRO A; 1ZUK A; 3IQL A; 1RUW A; 2EGC A; 4J9G A; 1GFC A; 1U06 A; 2AZV A; 4CC2 A; 3PVQ A; 1GRI A; 3PVL A; 1U3O A; 2RN8 A; 4IIO A; 1PKT A; 1NEB A; 2LQN A; 4JZ3 A; 3VS3 A; 1AWX A; 5L23 A; 1UEC A; 2AKL A; 2DBK A; 1JXM A; 2I0N A; 1WFW A; 3ZL7 C; 4OMQ A; 1TG0 A; 2KYB A; 2LZ6 B; 1VA7 A; 4HVW A; 2YDL A; 4LUD A; 3SHW A; 2ABL A; 1WIE A; 2E5K A; 1SHF A; 1UJY A; 1UGV A; 2JM9 A; 2GTO A; 2FRW A; 2DA9 A; 5FWC A; 4J9F A; 1JU5 C; 2ESW A; 3UA7 A; 4R0K A; 3U23 A; 2DL5 A; 2X3W D; 2PNI A; 4D8D A; 2KR3 A; 1X2Q A; 1AD5 A; 1HD3 A; 2CDT A; 4X1V A; 3RNJ A; 4LN2 A; 2EBP A; 2JTE A; 2DM1 A; 5FW9 A; 2DBM A; 4OMN A; 2RMO A; 1ABQ A; 1AVZ C; 2EVR A; 4AG2 C; 2EYY A; 2YUO A; 1X6G A; 1PKS A; 1BB9 A; 2ECZ A; 1YP5 A; 2AK5 A; 1GCQ C; 1T3S A; 4ORZ A; 1OV3 A; 4CC4 B; 2AKK A; 1I1J A; 2K6D A; 5GJV B; 1AWO A; 2J6F A; 2J6K A; 1Z9Q A; 3M0R A; 1GBR A; 4QT7 A; 3QWX X; 1A0N B; 1KJW A; 1T0J A; 1Y57 A; 2LJ1 A; 1QWE A; 2CRE A; 1UG1 A; 2EQI A; 1ZSG A; 2DJQ A; 2A08 A; 2FEI A; 1ABO A; 2K2M A; 1H3H A; 1YWO A; 2KRN A; 3NHN A; 1AEY A; 2D8H A; 1RI9 A; 4A63 B; 2DNU A; 1WYX A; 2DF6 A; 1HJD A; 1T3L A; 2CSQ A; 4Y92 A; 5GJW B; 3NGP A; 1ZX6 A; 2W0Z A; 2FO0 A; 5IHN A; 1H92 A; 1NM7 A; 3UAT A; 4RTT A; 2SRC A; 1QLY A; 4KRT A; 2HDA A; 2SEM A; 1WI7 A; 2HBW A; 5EC7 A; 2RQV A; 1QKX A; 1X69 A; 1OPK A; 1YN8 A; 1CKA A; 3PE0 A; 2NUZ A; 2CH4 A; 2PTK A; 4J9C A; 1VYT A; 2HCK A; 3M0Q A; 2JXB A; 2FG0 A; 2KYM A; 4IIM A; 1K0S A; 1WA7 A; 2YUP A; 2YUN A; 4AFZ C; 4OMP A; 2C0I A; 1PWT A; 2YT6 A; 3M0U A; 4J9H A; 1UJ0 A; 2ROT A; 1MV0 B; 2JM8 A; 2ROL A; 1MUZ A; 2GGR A; 2GNC A; 1BBZ A; 2JMC A; 2KXD A; 2DMO A; 1AWJ A; 1Y0M A; 2OI3 A; 1ZUY A; 1CKB A; 3TSW A; 1SHG A; 1E6H A; 1VYU A; 3R6N A; 2LJ0 A; 1KFZ A; 2G6F X; 1YWP A; 2LMJ A; 1SRM A; 2EGA A; 2KT1 A; 2KGT A; 1JQQ A; 4F16 A; 1W1F A; 2FPD A; 1UE9 A; 4JJD A; 2BZX A; 2D1X A; 2RPN A; 3TVT A; 2MOX A; 2EPD A; 4ESR A; 5IXB A; 1GBQ A; 1TUC A; 1U5S A; 1FYN A; 3VS4 A; 2OAW A; 3I35 A; 4OML A; 1NLO C; 1W6X A; 1I07 A; 2F2V A; 2VKN A; 3I5S A; 1G2B A; 4AFQ C; 2HSP A; 1NYF A; 4RTV A; 2FPE A; 1FMK A; 4OMM A; 2MIO A; 4J9B A; 1UTI A; 2NWM A; 3VS1 A; 4Z8A A; 4RTW A; 1JO8 A; 1RLP C; 3RBB B; 2F2X A; 4LE9 A; 3CQT A; 1UHC A; 5FWB A; 2DRM A; 5HCK A; 1E7O A; 1S1N A; 1UUE A; 3EG2 A; 1BK2 A; 4Z89 A; 1JEG A; 1K1Z A; 2F2W A; 1Z9Z A; 2JS0 A; 2KRM A; 3H41 A; 2EYZ A; 2DVJ A; 1NEG A; 1X2K A; 4EIK A; 2DYB A; 2V1R A; 4GBQ A; 3SEM A; 4GLM A; 1AZG B; 3M0T A; 2L3P A; 3M0S A; 1WXU A; 2LP5 A; 2RQR A; 1M3C A; 1NYG A; 1ARK A; 4RUG A; 3M0P A; 4JPB W; 2DX1 A; 2C0T A; 2LCS A; 5ECA A; 1M8M A; 1SPK A; 2O9V A; 1X6B A; 3H0I A; 2RQT A; 1JXO A; 1PRL C; 4D8K A; 1M3A A; 4E6R A; 1HSQ A; 3EG0 A; 2DL8 A; 1NG2 A; 2DL7 A; 3EGU A; 2LNH B; 4JJC A; 3VS2 A; 2EGE A; 2RF0 A; 2J6O A; 2J7I A; 2DL3 A; 1KSW A; 2L0A A; 5IH2 A; 2YSQ A; 3A98 A; 1PNJ A; 2PZ1 A; 3EHR A; 1OEB A; 1BU1 A; 1K4U S; 4RTX A; 1AOJ A; 2L3S A; 1YCS B; 2EKH A; 3VS0 A; 3VS5 A; 2BZ8 A; 1EFN A; 2MCN A; 2OJ2 A; 1MV3 A; 1ZBJ A; 3C0C A; 2JS2 A; 2D0N A; 3I9Q A; 4AFS C; 1E6G A; 1GFD A; 3EHQ A; 4CC3 A; 1IO6 A; 2RQU A; 2BZY A; 4HCK A; 4F17 A; 2A36 A; 2RQW A; 4K11 A; 1XOV A; 5IHK A; 2O31 A; 5IXF A; 2CUD A; 3H0H A; 1YNZ A; 2JT4 A; 3NPF A; 2CT4 A; 2EYX A; 3I5R A; 2YUQ A; 2DRK A; 1I0C A; 2V1Q A; 2W10 A; 1SRL A; 4DEY A; 2GBQ A; 1RLQ C; 1PRM C; 1WLP B; 1UHF A; 1QCF A; 4JJB A; 2KT8 A; 2KRS A; 3JV3 A; 3GBQ A; 2M0Y A; 2D8J A; 4F14 A; 2KEA A; 4Z88 A; 1LCK A; 4AG1 C; 1H8K A; 1V1C A; 2H8H A; 2DE0 X; 2KBT A; 1KIK A; 2GTJ A; 2J06 A; 3NMZ C; 2X3X D; 3VS7 A; 1K76 A; 2ENM A; 1WX6 A; 1X27 A; 2FPF A; 3VRZ A; 1G83 A; 2BTT A; 1VYV A; 4J9E A; 1TUD A; 2LX7 A; 3H0F A; 4LUE A; 2AZS A; 2XMF A; 3EG1 A; 2JW4 A; 3THK A; 2VVK A; 1SSH A; 2K79 A; 2KNB B; 2C0O A; 1OOT A; 2L3Q A; 2VWF A; 4OMO A; 1WDX A; 2K3B A; 2L2P A; 2LJ3 A; 1M30 A; 2DIL A; 2EYW A; 2O88 A; 2B86 A; 4CC7 A; 5I22 A; 3EG3 A; 4J9I A; 4RTZ A; 2K9G A; 1N5Z A; 3REB B; 2K7A A; 5I11 A; 3QWY A; 1AZE A; 4HXJ A; 4LNP A; 4M4Z A; 3ULR B; 3O5Z A; 3UF4 A; 1NLP C; 1OPL A; 2LQW A; 2A37 A; 4DEX A; 2KE9 A; 3VRY A; 3VS6 A; 2CSI A; 1QKW A; 1M27 C; 1GCP A; 4FSS A; 2DL4 A; 1SEM A; 2KXC A; 1CSK A; 5IHI A; 1K0X A; 2CH4 W; 4WCI A; 1UFF A; 4J9D A; 2ED1 A; 1B3Q A; 3LH5 A; 1GCQ A; 4HVV A; 1M3B A; 1T0H A; 4HVU A; 2A28 A; 2CUB A; 2HEQ A; 4ZNX A; 1J3T A; 1PHT A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4FM4 B; 2QQR A; 1K73 R; 4RTY A; 2CKK A; 2Y90 A; 2JMA A; 3REA B; 3G4S A; 1VIF A; 3G6E Q; 1WHK A; 1YBY A; 1WXT A; 3QDF A; 2DXT A; 2MYS A; 2ZPE B; 4IUV A; 3TQ7 P; 1QWF A; 1VQ4 T; 1AHJ B; 3FJ5 A; 4C92 F; 4CI0 C; 3JSC A; 2YRV A; 2P4R A; 3HL8 A; 2PUK B; 3KFV A; 4J6W A; 3JCM h; 3TSZ A; 5KYW A; 5GAN 5; 1WXB A; 3CPW A; 2JN0 A; 4EMK B; 2O01 E; 1S72 T; 3SWN A; 4CC2 A; 1VQ4 A; 3FDR A; 2DIG A; 3ZBD A; 1BI3 A; 2LQN A; 1TUG B; 5L23 A; 1S72 A; 3GLX A; 1UEC A; 1R0B G; 2AKL A; 4BE0 A; 3JCM Q; 1O9S A; 3M4Y A; 3EGX B; 5CR2 A; 4FYY B; 2CZ7 B; 4RKU E; 2NUP A; 5A0L A; 2L8D A; 3VYG A; 5J3B A; 2LX9 A; 4HVW A; 2E3H A; 1VA7 A; 2DTI A; 3SHW A; 2QGG A; 1FXX A; 1YJ9 Q; 2JM9 A; 1WJS A; 1KQS S; 4E7I A; 3UPU A; 4M78 A; 3CBM A; 2DL5 A; 2LCL A; 1QVG A; 3G7Z A; 4PJO E; 2HKN A; 1QP3 A; 4XU0 A; 2DM1 A; 2DBM A; 4ATO A; 2EVR A; 4ZTF A; 2DD4 A; 3CXC P; 4KGZ B; 3NFC A; 1M90 R; 3MHX A; 1MMA A; 1JJ2 S; 3ASK A; 3OS0 A; 1IHV A; 4NOY A; 4ORZ A; 4BE2 A; 2AKK A; 2K6D A; 1QW1 A; 5GJV B; 5HK3 A; 1AWO A; 1HXD A; 1N9R A; 2J6F A; 4BI4 A; 3CCV Q; 4KH1 B; 1Z9Q A; 3A8L B; 4QT7 A; 1A0N B; 1T0J A; 2DXU A; 4DOV A; 1N8R U; 2QI2 A; 2CRE A; 2A0F B; 1UG1 A; 4RG8 A; 4A54 A; 2DJQ A; 4MMK A; 3DLL A; 1QMC A; 3NHN A; 1AEY A; 1RI9 A; 2DNU A; 3RER A; 3KBG A; 2DF6 A; 2K2V A; 3QYH B; 1HJD A; 2CSQ A; 1X75 C; 2XIC A; 5GJW B; 4N4I A; 4ELZ C; 2MWP A; 5GMK l; 1H92 A; 1NM7 A; 4RTT A; 3EFS A; 4M7A F; 1NPR A; 4QKU A; 5I2S A; 2FB7 A; 2QTV A; 4KRT A; 1WHG A; 4PJN A; 2HDA A; 2HZY A; 2F5K A; 2SEM A; 3TU4 K; 3S3O A; 4J7I A; 4XTW A; 1VQM Q; 2QA4 A; 4QVD A; 3PE0 A; 1Q82 R; 4C92 A; 2Y4X A; 3A8H B; 1YJW T; 1VQO Q; 4AFZ C; 4PFZ A; 2O4X B; 3OYL A; 3X25 B; 3M0U A; 2ROT A; 1MV0 B; 1MUZ A; 1YJW A; 2JMC A; 3C12 A; 5LJ5 g; 1BKB A; 2DET A; 3TSW A; 4PJO C; 4M7D B; 1KFZ A; 3JAM E; 1YWP A; 5EG2 A; 1SRM A; 1Y71 A; 4IUU A; 5KYX B; 4JS4 A; 2FPD A; 2MWO A; 1D1B A; 5IXB A; 4HCB A; 1GBQ A; 4QQ6 A; 3JCM c; 4RCB A; 1U5S A; 2LCC A; 3I35 A; 1VQK Q; 1WQW A; 1FMW A; 1QVF P; 1WGS A; 2LDM A; 3J7A F; 1UGR B; 2HQE A; 2P0K A; 3CBO A; 2XU8 A; 1K9M C; 1HYO A; 1TH7 A; 2VXE A; 2MIO A; 1U1T A; 2MPX C; 4J9B A; 3RBB B; 3GNF B; 1Q81 C; 4M78 D; 3OYB A; 5GMK m; 2ZPH B; 3CQT A; 5LJ3 g; 3MP8 A; 3P8B B; 1S1N A; 3SWN B; 3EGD A; 5GAN j; 3EG2 A; 1BK2 A; 4Z89 A; 1PC0 A; 3C95 A; 1Z9Z A; 2KRM A; 4EIK A; 3D7S B; 4GBQ A; 4GLM A; 2GQV A; 1AZG B; 1JBM A; 2RQR A; 2FHD A; 2NUT B; 3BW1 A; 2VGN A; 1M8M A; 3BDU A; 2O9V A; 1JXO A; 3JCM f; 2OTJ T; 1HSQ A; 2ZZD A; 1NG2 A; 3MET A; 2EGE A; 2RF0 A; 4XU1 A; 3HP9 A; 4A4E A; 2JJ9 A; 2L0A A; 1KC8 R; 2YSQ A; 3O8V A; 1ZSZ A; 1M1K C; 2P0Q A; 2ATC B; 3E9G A; 2OTJ A; 1N8R R; 2YHT A; 2PZ1 A; 3S3M A; 1K4U S; 1AOJ A; 2L3S A; 4M7A A; 8ATC B; 4ZGD B; 5M9O A; 2MCN A; 4OGE A; 1ZBJ A; 3G6E T; 1E6G A; 2ZPI B; 2RQU A; 4M77 E; 2A36 A; 4K11 A; 3RIR A; 1Q95 G; 3OYG A; 1QCO A; 1KQS A; 2JT4 A; 2QAZ A; 1NBE B; 3G6E A; 2RHY A; 2MF2 A; 4DEY A; 1G3S A; 3F70 A; 4O6J A; 1UHF A; 2AIR B; 2RB6 A; 4JJB A; 3V8K A; 3QDR B; 3VUZ A; 2E6N A; 4C92 D; 2M0Y A; 2QYZ A; 3BY7 A; 4FU6 A; 4F14 A; 4DBQ A; 1RAD B; 2M02 A; 3CCR Q; 4AG1 C; 1V1C A; 4EPC A; 3PFS A; 2E64 A; 4DBH A; 1JJ2 A; 1NZ9 A; 1KIK A; 1KQ2 A; 2J06 A; 3HFO A; 3VS7 A; 1I5L A; 1OYX A; 4MDX A; 1PCX A; 3VRZ A; 2Y4Y A; 2X4X A; 1EIF A; 4PJJ A; 3QII A; 2WSE E; 3P8H A; 4KGX B; 4J9E A; 1U8R A; 1YJ9 T; 1TUD A; 2QG9 B; 4LUE A; 5FU7 B; 2DPP B; 1IXD A; 1KG1 A; 2JW4 A; 3L2Q A; 3FRN A; 4EMK A; 3T9N A; 4M78 E; 2KNB B; 2C0O A; 2K4Y A; 4A4K A; 1VQ9 Q; 4XTY A; 1YJ9 A; 2EYW A; 4CC7 A; 5I22 A; 2YWW A; 3MCA B; 3SDZ A; 2CZ1 B; 5A0D A; 3CPW P; 1N5Z A; 3FLG A; 4ME7 A; 4M7D F; 2R58 A; 3OYC A; 3EGX A; 4R55 A; 1NLP C; 1Q81 U; 4A53 A; 3JCM g; 5IT9 E; 2ZPB B; 3GOX A; 4BI3 A; 2B8A A; 4GLK A; 5D6Y A; 4VUB A; 1Y7X A; 3EG9 B; 2CSI A; 2R5A A; 2YRD A; 3CCV T; 2EKO A; 2VYT A; 2DAQ A; 2GCX A; 4FSS A; 2DL4 A; 5GAN 8; 1W2B P; 2DJZ A; 1IB8 A; 4J9D A; 4M77 C; 5GAM e; 3CCE A; 4FCY A; 1T0H A; 2E70 A; 4IUR A; 2A28 A; 3CCV A; 2HEQ A; 4C5I A; 1UGQ B; 1J3T A; 2F5T X; 5FRO A; 1X01 A; 1PHT A; 3MPU B; 4C8Q C; 4DBR A; 2O9S A; 1B07 A; 3G71 Q; 3OY9 A; 2EQM A; 1GL5 A; 2IIM A; 3GNG A; 4AFU C; 3S6W A; 1QVG P; 4MZT A; 1M1K U; 1UDL A; 2D6F A; 2FRY A; 1V29 B; 2EW3 A; 4L59 A; 4JZ4 A; 3UA6 A; 1W70 A; 5CKD A; 2BE9 B; 3ZFJ A; 2RNA A; 3IQL A; 2M1H A; 1VQM T; 1PG5 B; 8AT1 B; 5LJ5 e; 3PVQ A; 1GRI A; 4M7A D; 2RD1 A; 5FRN A; 4F7U B; 3CC2 T; 4C5H A; 2X9H A; 3CCQ A; 1VQO T; 1VQM A; 4JZ3 A; 2KI7 A; 3VS3 A; 2COZ A; 2DBK A; 1JXM A; 4FYX B; 9ATC B; 3I56 Q; 3OYD A; 5D7U A; 4NS5 A; 2I0N A; 2HL5 C; 4B9X A; 2JVV A; 4M78 C; 1TG0 A; 3PGG A; 1U1S A; 2KYB A; 1VQO A; 2RHI A; 4OVA A; 4GY5 A; 2F1L A; 1DJ7 B; 4LUD A; 1IHW A; 2VB6 A; 4MML A; 2E5K A; 3VJP A; 2GF7 A; 3RES A; 3AT1 B; 1RAI B; 1UGV A; 2V8I A; 2EYQ A; 5GAO q; 3OS2 A; 3M54 A; 5J26 A; 2FRW A; 2DA9 A; 1R77 A; 2EJ9 A; 1JU5 C; 3L2R A; 3CCL Q; 1G5V A; 3CCU T; 1VQK T; 2PNI A; 5HK0 A; 3LGF A; 5LJ3 e; 4OGC A; 1PM3 A; 4LN2 A; 1KC8 C; 3MEW A; 4OMN A; 4Q5W A; 1ABQ A; 1AVZ C; 3ME9 A; 4QVC A; 2O4X A; 3ER0 A; 1PSE A; 3QZ5 B; 4C0F A; 2WSC E; 1YP5 A; 2PQW A; 1VQK A; 1IGU A; 1GCQ C; 3GPL A; 1G3W A; 1OV3 A; 2E5Q A; 3L2Z A; 4C92 G; 2DXC A; 3PTA A; 2CZ6 B; 4QW2 A; 4OB0 B; 4M7D A; 4N0A A; 1KJW A; 4XU2 A; 3UWN A; 4A4F A; 1RAC B; 4BDZ A; 1UB4 A; 1VUB A; 3JCM J; 4BB7 A; 3TEE A; 4AT1 B; 2QK0 A; 2FEI A; 2JTF A; 3FEO A; 1ABO A; 2K2M A; 4KBM B; 1H3H A; 4ANJ A; 4A63 B; 1WYX A; 1SKU B; 1X6O A; 1Q81 R; 3QSU A; 2RJF A; 1ZX6 A; 2FO0 A; 2RJE A; 2XDD A; 1Q7Y C; 5DY9 A; 1NJI C; 1QLY A; 3MEV A; 5AYF A; 1K8A C; 1QKX A; 4JUV A; 2LNV A; 3OS5 A; 2XKO C; 4FYW B; 4M7A E; 3MP6 A; 2XDB A; 2NUZ A; 3MEU A; 1D3B B; 2CH4 A; 3FIF A; 4ZGJ B; 2HCK A; 1ZA2 B; 3M0Q A; 2JXB A; 3LH0 A; 2XK0 A; 1K0S A; 1WA7 A; 1FMV A; 2FYK A; 3L2W A; 3JCM V; 3WXM B; 4OMP A; 2NUT A; 1PWT A; 2ROL A; 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