The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
6
|
sequence length |
68
|
structure length |
68
|
Chain Sequence |
GSSGSSGPRAKALCNYRGKNPGDLKFNKGDVILLRRQLDENWYQGEINGVSGIFPASSVEVISGPSSG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
The solution structure of the first SH3 domain of mouse SH3 domain containing ring finger 2
rcsb |
| molecule keywords |
SH3 domain containing ring finger 2
|
| molecule tags |
Structural genomics, unknown function
|
| source organism |
Mus musculus
|
| total genus |
6
|
| structure length |
68
|
| sequence length |
68
|
| ec nomenclature |
ec
2.3.2.27: RING-type E3 ubiquitin transferase. |
| pdb deposition date | 2006-04-05 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF07653 | SH3_2 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2C0I A; 2V1Q A; 1MUZ A; 1PKS A; 1NLO C; 2LJ1 A; 1QWE A; 2L3P A; 2HCK A; 4AG2 C; 2ABL A; 3H0I A; 1NM7 A; 3ZL7 C; 5GJV B; 2KT1 A; 1JEG A; 1B07 A; 2KT8 A; 4D8K A; 2NWM A; 1A0N B; 5EC7 A; 2KGT A; 2JXB A; 4HVW A; 4LN2 A; 1UE9 A; 5IHI A; 1GCQ C; 2FG0 A; 1ABO A; 2L3S A; 1U3O A; 2EYY A; 1QKX A; 1UDL A; 1SRL A; 2X3X D; 2YUQ A; 1WXB A; 1VYU A; 2DL7 A; 1W6X A; 2BZX A; 1T3S A; 4CC4 B; 1XOV A; 1Z9Z A; 3NPF A; 2HBW A; 1GBR A; 1TUD A; 1GCP A; 2KRO A; 2M0Y A; 4K11 A; 2LQW A; 2HDA A; 3PE0 A; 2FO0 A; 2BZY A; 1X43 A; 2FEI A; 2EKH A; 1ZX6 A; 3PVL A; 2CSI A; 3VS6 A; 2DBK A; 5I22 A; 2EYX A; 3VS3 A; 2CRE A; 2EW3 A; 1W1F A; 2LX7 A; 2P4R A; 4F14 A; 2RF0 A; 1X6B A; 2M51 A; 2J6F A; 4DEX A; 2ROL A; 2LCS A; 1AVZ C; 1NLP C; 2RPN A; 2A08 A; 1M8M A; 1MV3 A; 4J9D A; 4CC7 A; 2NUZ A; 4RTX A; 4LE9 A; 1AWJ A; 1CKA A; 1WX6 A; 1OPK A; 3H0H A; 3VS4 A; 4ORZ A; 1M30 A; 1Y57 A; 2KE9 A; 2EGE A; 2DIL A; 2VVK A; 2EYW A; 1FYN A; 2VWF A; 5HCK A; 5IXF A; 3UF4 A; 5IH2 A; 2MOX A; 1RLQ C; 2ED0 A; 1AZE A; 3A98 A; 1M3B A; 1BU1 A; 1QWF A; 1J3T A; 1AWX A; 4ESR A; 1JU5 C; 2GGR A; 2F2X A; 4RTZ A; 1LCK A; 2KYB A; 2GNC A; 4RTU A; 3R6N A; 4M4Z A; 2JMC A; 4F17 A; 1HSQ A; 1JXO A; 1Y0M A; 2JS2 A; 4RTW A; 1QLY A; 1ARK A; 1PRL C; 1UFF A; 2D0N A; 2K79 A; 1K0S A; 3VS5 A; 1K76 A; 3REB B; 4RTY A; 4AG1 C; 4D8D A; 1WYX A; 1W70 A; 2DRM A; 4KRT A; 2W10 A; 2ENM A; 1UEC A; 1CKB A; 4CC3 A; 4RTT A; 4FSS A; 1BB9 A; 4OMP A; 4WCI A; 2C0T A; 4HCK A; 1YCS B; 1X6G A; 2J6O A; 2MCN A; 3EG0 A; 2FRY A; 1HD3 A; 2L0A A; 1UGV A; 1GBQ A; 2J7I A; 2BTT A; 1X2K A; 3O5Z A; 1AEY A; 4AFQ C; 2LNH B; 4Y92 A; 3EG3 A; 2K2M A; 2DBM A; 1QKW A; 1PWT A; 1VA7 A; 2EPD A; 2LP5 A; 1SEM A; 2V1R A; 1K4U S; 2OI3 A; 1E7O A; 1UG1 A; 3TSZ A; 3C0C A; 2CSQ A; 1NYF A; 4GLM A; 4GBQ A; 1UHF A; 3M0R A; 5IHK A; 4AFS C; 1U06 A; 4JJC A; 2JW4 A; 1OPL A; 2DA9 A; 3CQT A; 3VS2 A; 1E6H A; 1H3H A; 4JJD A; 2YDL A; 2RQW A; 1YWO A; 2KNB B; 2KYM A; 1G2B A; 2RMO A; 1T0H A; 1S1N A; 1Z9Q A; 4CC2 A; 2OJ2 A; 2O9V A; 1M3A A; 2DL3 A; 2YUO A; 1JQQ A; 4OMM A; 1I07 A; 2L2P A; 1OV3 A; 3M0U A; 1RUW A; 1WXT A; 1WDX A; 2ECZ A; 2SEM A; 1T3L A; 2HSP A; 2JT4 A; 4OMN A; 1YNZ A; 1AD5 A; 5FWC A; 4JZ4 A; 2A37 A; 2EBP A; 2ESW A; 3NHN A; 2GQI A; 1K9A A; 1KJW A; 3VS0 A; 4ZNX A; 2RQV A; 2CUD A; 3THK A; 2RQT A; 3VRY A; 3H41 A; 2KEA A; 1GCQ A; 1WI7 A; 2XMF A; 4LUE A; 1VYV A; 1SRM A; 2LQN A; 4HVU A; 2K3B A; 2K7A A; 4J9B A; 2VKN A; 3EG1 A; 1ZBJ A; 2AKL A; 1KIK A; 3EHQ A; 4Z8A A; 1H92 A; 2EQI A; 5ECA A; 4DEY A; 1B3Q A; 1JO8 A; 2EGA A; 2AZS A; 4JPB W; 1UTI A; 3ULR B; 2J05 A; 2DE0 X; 4EIK A; 4Z89 A; 3REA B; 1UJY A; 2K6D A; 5GJW B; 2DVJ A; 4J9I A; 2O31 A; 3M0T A; 3QWY A; 3SEM A; 4J9C A; 1X2Q A; 2LJ3 A; 1T0J A; 1X69 A; 3FJ5 A; 4J9F A; 2GBQ A; 2PZ1 A; 1GRI A; 1ZUK A; 1PRM C; 2G6F X; 2X3W D; 4J9H A; 4J9E A; 3VRZ A; 3I35 A; 4X1V A; 2KXD A; 1MV0 B; 1UHC A; 1SHG A; 2JM9 A; 1YN8 A; 4HXJ A; 2E5K A; 1NG2 A; 2GTO A; 2JMA A; 2YUN A; 5L23 A; 2DLP A; 3EGU A; 3I9Q A; 1NEB A; 2PTK A; 4IIO A; 1RI9 A; 2CH4 A; 2ROT A; 2AKK A; 2KRS A; 2JTE A; 3KFV A; 3EG2 A; 4F16 A; 3RBB B; 1UJ0 A; 2DMO A; 4Z88 A; 4E6R A; 1WLP B; 2EGC A; 1AWO A; 3M0S A; 2DL8 A; 3M0P A; 4IIM A; 2DL4 A; 1WIE A; 4LUD A; 2EVR A; 2J6K A; 2LZ6 B; 1BBZ A; 3IQL A; 3I5S A; 3PVQ A; 2D1X A; 1M3C A; 3UA6 A; 5I11 A; 2YSQ A; 1K0X A; 2LJ0 A; 2FPD A; 2F2V A; 2O2O A; 2I0N A; 2L3Q A; 2LMJ A; 2KRN A; 1NYG A; 2EYZ A; 2BZ8 A; 2PNI A; 1SSH A; 2DL5 A; 2KBT A; 1ZSG A; 2CH4 W; 1NEG A; 2CT4 A; 2AK5 A; 3NMZ C; 2AZV A; 3TVT A; 4J9G A; 2H8H A; 2HEQ A; 1YWP A; 1JXM A; 3QWX X; 2QDL A; 1EFN A; 3U23 A; 2W0Z A; 3NGP A; 3TSW A; 4RTV A; 5IXB A; 1WA7 A; 1ABQ A; 2YUP A; 2JS0 A; 4R0K A; 1SPK A; 1TUC A; 1M27 C; 1E6G A; 2RN8 A; 1KFZ A; 2SRC A; 3M0Q A; 2DX1 A; 1AOJ A; 3EHR A; 1VYT A; 2DF6 A; 4LNP A; 2DM1 A; 2FPE A; 3SHW A; 2CT3 A; 4A63 B; 2JM8 A; 4AFU C; 1X27 A; 1BK2 A; 1I1J A; 3UA7 A; 4HVV A; 1AZG B; 3GBQ A; 4OMO A; 1SHF A; 1FMK A; 4OMQ A; 1PKT A; 1U5S A; 2RQU A; 2KXC A; 3I5R A; 3UAT A; 1OOT A; 2C0O A; 2YT6 A; 2CDT A; 1KSW A; 2DYB A; 2KRM A; 1ZUU A; 1GFD A; 2KR3 A; 2DNU A; 5IHN A; 2D8H A; 2A36 A; 1YP5 A; 1G83 A; 2J06 A; 1I0C A; 1IO6 A; 2GTJ A; 1PHT A; 4QT7 A; 1V1C A; 5FWB A; 4OML A; 2RQR A; 1OEB A; 2D8J A; 2O88 A; 2CUB A; 2B86 A; 5FW9 A; 1HJD A; 1H8K A; 1N5Z A; 2OAW A; 3VS7 A; 2ED1 A; 3LH5 A; 2A28 A; 3JV3 A; 4RUG A; 1TG0 A; 2FPF A; 2K9G A; 3H0F A; 2F2W A; 1AWW A; 1K1Z A; 2DRK A; 1RLP C; 2FRW A; 1ZUY A; 1QCF A; 2MIO A; 1PNJ A; 2O9S A; 1GFC A; 4JZ3 A; 3VS1 A; 1UUE A; 1ZLM A; 1WFW A; 2DJQ A; 3RNJ A; 4AFZ C; 1WXU A; 2RNA A; 4JJB A; 1GL5 A; 1CSK A; 2IIM A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1RAE B; 5KYU B; 2P0P A; 2V1Q A; 1M1G A; 4QQ6 A; 1OQK A; 2CP3 A; 2M1H A; 4QW2 A; 2HCK A; 4AG2 C; 3OYD A; 4BAC A; 1NJI C; 1BCM A; 5GJV B; 2KT1 A; 1VQP Q; 2KT8 A; 2NWM A; 3CME Q; 1KHC A; 4M7A C; 1QCO A; 1JBM A; 2FG0 A; 2FZC B; 2JUF A; 5C0M A; 5GAN h; 1K8A R; 1QKX A; 1RAC B; 2X3X D; 1WXB A; 2DL7 A; 2RK2 A; 4E7H A; 2MWP A; 4OF1 A; 4EMK C; 2KDS A; 3LW5 E; 3A8L B; 3QJY A; 2P0K A; 1N9R A; 2V8I A; 4M78 C; 3M57 A; 2FEI A; 3OBY A; 3VS6 A; 4C92 E; 5GAO q; 1W1F A; 2D9T A; 5IAY A; 5KCH A; 4F7U G; 4C8Q C; 2M51 A; 1MMA A; 4OB1 B; 1X6O A; 2CP6 A; 2J6F A; 1S72 T; 2DTO A; 4BE2 A; 4DEX A; 5LJ3 g; 2L8D A; 2LCS A; 2DD4 A; 3SD4 A; 2EQK A; 1M9S A; 3PTA A; 4VUB A; 2Y90 A; 3V7C A; 5GAN f; 4RTX A; 4LE9 A; 1CKA A; 5GAM e; 1N8R R; 1Y57 A; 3CMA T; 2EGE A; 1M1K C; 2DIL A; 2VVK A; 2EYW A; 4ANJ A; 4KGV B; 5LJ5 g; 2MOX A; 2DAQ A; 2YRC A; 2DZC A; 1AZE A; 4L59 A; 1PSE A; 3A98 A; 1D3B B; 2RI2 A; 1QWF A; 2PUK B; 4ESR A; 1VQ7 A; 1JU5 C; 2GGR A; 2K3Y A; 3QG1 A; 1LCK A; 1Q82 R; 4PFP A; 3OYY A; 2KYB A; 2F69 A; 3CPW A; 4RTW A; 2E41 A; 3FDR A; 3JAM E; 4E7J A; 2K3X A; 4DBQ A; 3OQ5 A; 4DBH A; 4PJO D; 1QLY A; 4B9W A; 1ARK A; 3V8J A; 1PRL C; 1WJS A; 4OB2 B; 4IUV A; 3X26 B; 4XU1 A; 4EMH A; 4AG1 C; 3MEA A; 4XTY A; 1WYX A; 1W70 A; 2W10 A; 3QHS A; 3L1A A; 4A4E A; 2BE7 D; 2QA4 Q; 1BB9 A; 4OMP A; 4GY5 A; 2FRY A; 4XTV A; 2EWN A; 3MP8 A; 2J7I A; 2BTT A; 3GOX A; 4AFQ C; 1IRX A; 4F7U B; 4X9C A; 2K2M A; 4IUR A; 2EPD A; 2CP0 A; 2OTJ Q; 1SEM A; 1VQK T; 4R56 A; 3X20 B; 1Q86 R; 2V8J A; 2LCL A; 1NYF A; 3I55 Q; 1VQ9 A; 4IKF A; 1UHF A; 5IHK A; 1PG5 B; 1KD1 R; 4KH1 B; 3QKJ A; 3MPU B; 3CQT A; 3OYC A; 3F70 A; 3L42 A; 5D7U A; 1Z9Q A; 3CBM A; 2OJ2 A; 5A0G A; 3MEU A; 3KXT A; 4M7A D; 4HKE A; 2F5T X; 2DL3 A; 4A4F A; 2NYS A; 1OV3 A; 3EGX B; 1WXT A; 2SEM A; 2JT4 A; 2HSP A; 2E10 A; 1AD5 A; 1MNE A; 1WJR A; 2EBP A; 5CCA A; 1KJW A; 3ER0 A; 4BB7 A; 1LJO A; 4ZNX A; 3VS0 A; 4GLK A; 2L3R A; 4YTL A; 2RQV A; 3A8M B; 3THK A; 2RQT A; 1EZZ B; 1RAI B; 2FB7 A; 4TVR A; 4M78 D; 4RG2 A; 3TRE A; 2XMF A; 4LUE A; 1VQ8 A; 1NJI U; 3RKW A; 1WHK A; 3OY9 A; 4HVU A; 4J9B A; 2VKN A; 4C5G A; 2ZAE A; 3VV0 A; 1KIK A; 1PM3 A; 4C8Q D; 2JN0 A; 2LDM A; 2RD1 A; 2HNI A; 1K9M C; 1IGQ A; 4JLG A; 4V2S A; 3QDF A; 3REA B; 5GJW B; 3I56 T; 2I2L A; 1KQS P; 3M0T A; 1YIT A; 3LH0 A; 4J9C A; 2XID A; 3QYG B; 2NUT B; 4E2F B; 1T0J A; 3OYI A; 4J9F A; 1YI2 Q; 2EQU A; 1GRI A; 4MZT A; 1PRM C; 3OS1 A; 2QQR A; 4C92 B; 4PJJ A; 3TQ7 P; 1QW1 A; 1UHC A; 1IHW A; 1VQM T; 2JM9 A; 1YN8 A; 2EKO A; 3G7Z A; 3JCM e; 2GTO A; 2RHY A; 4JRP A; 1VQP A; 1QVF A; 3M54 A; 3CME A; 1TWB A; 1NBE B; 4WF2 A; 3EGU A; 1NEB A; 3CC4 A; 2EFI A; 4ZTF A; 2ROT A; 2KRS A; 3CD6 Q; 3RBB B; 3HFN A; 3LX7 A; 1UJ0 A; 4E6R A; 2HAX A; 1AWO A; 1ZQ1 A; 3M0S A; 2DL8 A; 3PMI A; 3G6E Q; 1VQN A; 3OB9 A; 2P4T A; 5DY9 A; 1M1K U; 1VQ6 T; 2ZPE B; 2J6K A; 4OB0 B; 2CP5 A; 3BY7 A; 5I11 A; 2YSQ A; 3PIO A; 1NE8 A; 1PCX A; 4J7F A; 3VYH B; 1VQO T; 1WHG A; 4ZN1 A; 5KH6 A; 2L3Q A; 5J3B A; 2KRN A; 2EYZ A; 2BZ8 A; 2PNI A; 1SSH A; 2QQ9 A; 2A3L A; 1NEG A; 2KVQ G; 2CT4 A; 2RK1 A; 1HK9 A; 4C92 C; 2D0Q B; 3JCM b; 1F1B B; 3OA6 A; 4LDV A; 3TVT A; 4R55 A; 1LPL A; 2H8H A; 4HT8 A; 1N6A A; 5GAN e; 1BI3 A; 3OW2 P; 2ZPI B; 3OW2 A; 1U8R A; 1M27 C; 1E6G A; 2RM4 A; 1ZA1 B; 1R0B G; 2DX1 A; 4LNP A; 3EHR A; 1VYT A; 2FPE A; 3GPL A; 4A63 B; 2JM8 A; 4FCY A; 1OX9 A; 2P84 A; 1BK2 A; 3UA7 A; 1PSF A; 4OMQ A; 4ELY C; 1I5L A; 4XK8 E; 3HFO A; 3JCM J; 3H9N A; 3EG9 A; 3EH1 A; 1AT1 B; 2E3I A; 2YT6 A; 3PT9 A; 2DYB A; 3JCM Q; 3FLG A; 3QSU A; 4M77 E; 2LRQ A; 3WVD B; 2OTL A; 1VQL Q; 1G83 A; 2J06 A; 4C0F A; 1I0C A; 3JB9 D; 1BCO A; 3VYG A; 2DPP B; 3PMT A; 4OML A; 1R8O B; 3CCM A; 2O88 A; 2CUB A; 5FW9 A; 3LH5 A; 1KHI A; 2A28 A; 2FPF A; 3CBP A; 4B9X A; 3PIP A; 2F2W A; 4NL3 A; 2QG9 B; 3A8O B; 1RLP C; 2FRW A; 5LL6 S; 1QCF A; 3P8H A; 1VQ7 Q; 1HYO A; 4RMO A; 2M02 A; 1ZLM A; 3VS1 A; 2PUO B; 2RI5 A; 1WFW A; 2DTI A; 1Q81 U; 1OI1 A; 4RKU E; 1GL5 A; 1Y7X A; 2DXC A; 2QGG A; 3CCE Q; 2C0I A; 1G8X A; 1MUZ A; 4ZN3 A; 1MMD A; 4PFO A; 1ZHI A; 4B6M A; 3A1P A; 4OP0 A; 2ABL A; 1NM7 A; 4AT1 B; 1OU9 A; 3OYM A; 1M90 R; 3MO8 A; 3VJP A; 2HZY A; 1WPY A; 1K9M U; 5IHI A; 2MMP A; 3G71 T; 4M7D B; 2EYY A; 3L2W A; 2RJD A; 3WXM B; 1VYU A; 4CC4 B; 1XOV A; 2M0Y A; 2LQW A; 2QI2 A; 3CXC P; 3PE0 A; 2FO0 A; 2BZY A; 1VQ9 Q; 3OSS C; 5GAN g; 1ZX6 A; 3PVL A; 2CSI A; 3S6W A; 2DBK A; 3CC2 Q; 1IGU A; 3OYA A; 1BI1 A; 3D7S B; 5CIU A; 4MMK A; 5L8R E; 5FRO A; 4DBF A; 4M77 G; 2RI3 A; 4C92 D; 1TOV A; 5FLX E; 5C6S A; 4DQ2 A; 4QVD A; 2QAS A; 2ROL A; 3LGL A; 2E64 A; 2DEU A; 2A08 A; 1JJ2 P; 1M8M A; 1MGQ A; 3EH2 A; 1X01 A; 4XU0 A; 1YJN T; 2NUZ A; 4BI4 A; 1AWJ A; 2HKQ B; 2E1H A; 4BE0 A; 1M30 A; 2KE9 A; 1NPR A; 3H6Z A; 1FYN A; 5HCK A; 3M56 A; 3UF4 A; 2MK5 A; 3FC3 A; 4M7D C; 2LX9 A; 1AWX A; 3JCM h; 5CR2 A; 2MYS A; 5A0D A; 3AT1 B; 1R77 A; 4PLL A; 2GCX A; 1VUB A; 1HSQ A; 1Y0M A; 2WSF E; 2JZ2 A; 5GMK m; 2R57 A; 1G3W A; 3UDC A; 2ATC B; 3SFM A; 1UFF A; 4JRK A; 3CCR A; 1K0S A; 3REB B; 4RCB A; 2K5F A; 3FRN A; 4FIB A; 5CKF A; 1EIF A; 4JS5 A; 1D1B A; 1YIT Q; 1PD0 A; 4D8D A; 2QEX T; 4KRT A; 2ENM A; 1UEC A; 1CKB A; 4CC3 A; 2RHU A; 4RTT A; 4WCI A; 3JB9 J; 4HCC A; 4PJO A; 3OYG A; 2MI6 A; 3EG0 A; 1ZBX A; 2X9H A; 5CVI A; 3CCS T; 4J5Y A; 3CCL Q; 1X2K A; 3O5Z A; 3JCM f; 2LNH B; 3EG3 A; 1EX4 A; 2DBM A; 1TXQ A; 4M77 B; 1PWT A; 2V1R A; 4EDU A; 2XDD A; 3CC4 Q; 2X51 A; 3DLL A; 3C0C A; 3HRU A; 2ZZD A; 2WSC E; 4GBQ A; 4ZGJ B; 4AFS C; 5CKH A; 4FYY B; 1VQN Q; 4JJC A; 4M75 A; 2JW4 A; 2DA9 A; 3M53 A; 1H64 1; 3VS2 A; 1H3H A; 5GAO r; 5GAN 6; 2YDL A; 2KNB B; 1G2B A; 3CCJ T; 1S1N A; 2FZG B; 4HT9 A; 4CC2 A; 2CS7 A; 2O9V A; 3LWH A; 4QQG A; 2YUO A; 3HHT B; 1JQQ A; 1I07 A; 1RUW A; 3C12 A; 2ECZ A; 2H3E B; 1H3Z A; 2PVD B; 4KT0 E; 4JZ4 A; 2A37 A; 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