The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
7
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sequence length |
68
|
structure length |
68
|
Chain Sequence |
GSSGSSGNTYVALYKFVPQENEDLEMRPGDIITLLEDSNEDWWKGKIQDRIGFFPANFVQRLSGPSSG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution structure of the first SH3 domain of Stac protein
rcsb |
| molecule keywords |
Protein Stac
|
| molecule tags |
Signaling protein
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
7
|
| structure length |
68
|
| sequence length |
68
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2006-04-17 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1UTI A; 2O2O A; 3PVL A; 4OMQ A; 2GTJ A; 3EG3 A; 1W70 A; 1CSK A; 3I9Q A; 1X6B A; 1AWX A; 5FW9 A; 2O31 A; 1PKS A; 2O9V A; 2KRM A; 2L3Q A; 2EYX A; 3PVQ A; 2VKN A; 2HBW A; 1U06 A; 4JZ4 A; 4E6R A; 2RQT A; 1SEM A; 1SRM A; 2QDL A; 2KR3 A; 2X3X D; 3VS6 A; 1J3T A; 2BZX A; 4GLM A; 4F16 A; 2EKH A; 1MV0 B; 2DRM A; 3GBQ A; 4J9G A; 1VA7 A; 4OMO A; 2L3P A; 1AWW A; 1PKT A; 3REB B; 4JPB W; 3VS2 A; 3A98 A; 1VYV A; 2K6D A; 2BTT A; 1ZX6 A; 4RUG A; 1JXO A; 1QKX A; 1ARK A; 2YT6 A; 3VS0 A; 2KEA A; 1UDL A; 4IIM A; 2KT1 A; 1FYN A; 3THK A; 2EYZ A; 1YCS B; 1K0X A; 1UEC A; 3VS4 A; 1LCK A; 1WA7 A; 2CH4 W; 3NPF A; 3SEM A; 2HCK A; 1M3B A; 4RTZ A; 5FWC A; 1U5S A; 1SSH A; 2JMC A; 4J9I A; 2JM9 A; 2DVJ A; 2CSQ A; 3KFV A; 2I0N A; 2SEM A; 3VS7 A; 4AG1 C; 2DRK A; 4AFQ C; 2M51 A; 1UHF A; 2D8H A; 3I5S A; 1VYT A; 1Y57 A; 3EG0 A; 3VS5 A; 3NHN A; 3M0R A; 2W0Z A; 2DIL A; 2EYY A; 2FPF A; 3NGP A; 1CKB A; 2DL7 A; 2MIO A; 4AG2 C; 3R6N A; 4HVW A; 3I35 A; 1AD5 A; 2LJ1 A; 1KIK A; 1X43 A; 4RTW A; 4Y92 A; 2RF0 A; 3UA6 A; 4FSS A; 3UA7 A; 2LQN A; 2RMO A; 3RBB B; 2GGR A; 4CC2 A; 1E6G A; 2RNA A; 1XOV A; 2EQI A; 4AFZ C; 1GBR A; 1KJW A; 1OPL A; 2EGA A; 2J06 A; 1T3L A; 3UF4 A; 4J9F A; 2HEQ A; 4DEY A; 2LZ6 B; 2DX1 A; 2AKK A; 1PRM C; 1KFZ A; 1ZUY A; 1T0J A; 2DE0 X; 5IXF A; 1NM7 A; 1ZSG A; 2W10 A; 1Z9Q A; 2FO0 A; 3O5Z A; 2DF6 A; 1K9A A; 1ABO A; 1W1F A; 1SRL A; 1NYF A; 1GCQ C; 3QWX X; 2A28 A; 2YUQ A; 1NLP C; 2F2V A; 1M3C A; 3EG2 A; 2A37 A; 2K9G A; 2ENM A; 5IHI A; 2ED0 A; 2EVR A; 2C0I A; 4LN2 A; 3VRZ A; 4D8D A; 2DMO A; 2DL4 A; 1H3H A; 2LX7 A; 4J9C A; 2MCN A; 5I22 A; 2LNH B; 1W6X A; 3REA B; 2V1Q A; 2PZ1 A; 1M8M A; 1VYU A; 1WXB A; 1AOJ A; 2K2M A; 2DL8 A; 2RPN A; 1A0N B; 2DBK A; 1GFD A; 4ZNX A; 2JS0 A; 2J6O A; 3EHQ A; 3JV3 A; 4OML A; 1M27 C; 2K3B A; 2OAW A; 1GRI A; 1EFN A; 4HCK A; 2ABL A; 2JTE A; 2RQR A; 1UE9 A; 1UJY A; 1WXU A; 2J6F A; 3H0F A; 4A63 B; 2A08 A; 2ESW A; 3H0H A; 1X2K A; 1H8K A; 2CUB A; 2KE9 A; 4JZ3 A; 1X69 A; 1JQQ A; 2EPD A; 3EG1 A; 1X6G A; 2J7I A; 3M0S A; 1V1C A; 4RTT A; 2NWM A; 1M30 A; 1UGV A; 2C0T A; 1H92 A; 3U23 A; 2B86 A; 4EIK A; 2DLP A; 1PNJ A; 1TG0 A; 2KYB A; 1K4U S; 2D0N A; 2ED1 A; 1UJ0 A; 2FPE A; 2AK5 A; 1K0S A; 2A36 A; 4RTV A; 1UFF A; 1UG1 A; 1HJD A; 1IO6 A; 2F2W A; 2HSP A; 4HVU A; 4JJB A; 1RI9 A; 1PRL C; 2YUN A; 1GBQ A; 1NEG A; 2JMA A; 1WXT A; 2L0A A; 2VWF A; 3FJ5 A; 2GNC A; 4CC3 A; 1NYG A; 1X27 A; 4J9H A; 1YWO A; 2P4R A; 3ULR B; 3TSW A; 4LE9 A; 3TSZ A; 2AKL A; 2KXC A; 4AFS C; 2H8H A; 4GBQ A; 4JJC A; 4J9B A; 1SHG A; 2CRE A; 1T3S A; 2D8J A; 1ABQ A; 1AEY A; 1SHF A; 2YDL A; 1B3Q A; 2J6K A; 3VS3 A; 5IXB A; 2KRN A; 1WLP B; 2DBM A; 1B07 A; 2CT4 A; 1T0H A; 1UUE A; 3VS1 A; 3ZL7 C; 1AZE A; 1GL5 A; 4KRT A; 1U3O A; 4CC4 B; 2FRW A; 5FWB A; 2KYM A; 1YWP A; 1BK2 A; 1YN8 A; 3SHW A; 2CSI A; 1S1N A; 1ZLM A; 4RTU A; 2YSQ A; 2E5K A; 2EGC A; 2RQW A; 1TUC A; 2CDT A; 2FG0 A; 3NMZ C; 2KBT A; 2PNI A; 2BZ8 A; 4D8K A; 1JEG A; 1PHT A; 3CQT A; 1G83 A; 2CUD A; 1BU1 A; 2BZY A; 4DEX A; 1TUD A; 4CC7 A; 2O88 A; 3EHR A; 3PE0 A; 1MUZ A; 1AZG B; 2DM1 A; 4Z8A A; 1OOT A; 2IIM A; 1WFW A; 2JM8 A; 1OEB A; 2L3S A; 4LUE A; 2JW4 A; 1AWJ A; 1QKW A; 1WIE A; 2OJ2 A; 4X1V A; 5IHN A; 1YP5 A; 3QWY A; 1I0C A; 1ZUK A; 1NLO C; 2GTO A; 3M0U A; 1QCF A; 1I07 A; 2JXB A; 3LH5 A; 2NUZ A; 1KSW A; 4OMP A; 4K11 A; 4F17 A; 2G6F X; 1HD3 A; 5L23 A; 2ROT A; 3VRY A; 3IQL A; 1OPK A; 2V1R A; 2CT3 A; 5GJW B; 1JO8 A; 2RN8 A; 2ROL A; 1QLY A; 2EYW A; 4QT7 A; 3M0P A; 1RLQ C; 1FMK A; 4LNP A; 1BBZ A; 2JT4 A; 2D1X A; 2DYB A; 2ECZ A; 1CKA A; 5EC7 A; 1RUW A; 2YUP A; 4ORZ A; 1YNZ A; 1WI7 A; 3H41 A; 3M0T A; 2AZS A; 2KNB B; 3TVT A; 4R0K A; 3C0C A; 2CH4 A; 1QWE A; 2YUO A; 2X3W D; 2HDA A; 5I11 A; 2LCS A; 1WDX A; 3I5R A; 4M4Z A; 1I1J A; 2OI3 A; 2SRC A; 4Z88 A; 1BB9 A; 2K7A A; 2LMJ A; 1G2B A; 4J9D A; 1Z9Z A; 2DJQ A; 2XMF A; 2K79 A; 4JJD A; 2LP5 A; 2LJ3 A; 1QWF A; 2DL5 A; 2FEI A; 1RLP C; 1AWO A; 1NG2 A; 2LQW A; 2FRY A; 2DA9 A; 1GFC A; 2F2X A; 2GQI A; 4HVV A; 1MV3 A; 1NEB A; 1JXM A; 1WX6 A; 1ZUU A; 2GBQ A; 2JS2 A; 1GCP A; 4OMN A; 2EGE A; 1PWT A; 5IH2 A; 5HCK A; 2LJ0 A; 2MOX A; 4IIO A; 1SPK A; 2KT8 A; 3M0Q A; 4OMM A; 3RNJ A; 5IHK A; 1K76 A; 1ZBJ A; 2RQU A; 2C0O A; 1HSQ A; 1OV3 A; 1N5Z A; 3UAT A; 2PTK A; 2RQV A; 1X2Q A; 1GCQ A; 2VVK A; 4ESR A; 2J05 A; 2L2P A; 2FPD A; 1E7O A; 2O9S A; 1E6H A; 5ECA A; 4RTX A; 2EBP A; 2M0Y A; 3EGU A; 2KRO A; 4WCI A; 4Z89 A; 2KGT A; 4LUD A; 4F14 A; 2KXD A; 1AVZ C; 1JU5 C; 2DL3 A; 2EW3 A; 2AZV A; 1Y0M A; 4AFU C; 1M3A A; 3H0I A; 2DNU A; 1UHC A; 5GJV B; 4RTY A; 4HXJ A; 1WYX A; 1K1Z A; 4J9E A; 2KRS A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2XHC A; 2E65 A; 2P0K A; 3PVL A; 1X6B A; 1AWX A; 5FW9 A; 2V8K A; 4QVZ A; 5GAO p; 2O9V A; 3OYY A; 1VQ9 Q; 3OYC A; 1YBY A; 1YCY A; 2L3Q A; 2JOY A; 3PVQ A; 2HBW A; 4JRQ A; 1DJ7 B; 2ZPG B; 3VUZ A; 3OYE A; 4JZ4 A; 4L5G A; 3PIP A; 3HSB A; 4E6R A; 4C8Q B; 3D7S B; 2RQT A; 2QDL A; 3RES A; 4FYY B; 3PTA A; 2E6Z A; 2QGG A; 2DPP B; 3C95 A; 1N8R U; 4M78 D; 1J3T A; 2BZX A; 3QJY A; 1QVF S; 1ZSZ A; 1S72 A; 1VQ9 T; 1JJ2 A; 3LLR A; 3TEE A; 4J9G A; 2CP0 A; 3REB B; 3DLL A; 1YJW A; 3A98 A; 1Y96 A; 2K6D A; 2BTT A; 1PD1 A; 1QKX A; 1VOM A; 1ARK A; 3L2Q A; 2P4T A; 4NS5 A; 3THK A; 5GAO r; 1RAE B; 5GAN 6; 1K0X A; 1RAC B; 2MWP A; 3RKY A; 2X4J A; 1NBE B; 2FHD A; 1OX9 A; 3SEM A; 2QEX Q; 1M3B A; 4N4G A; 2E4H A; 2DJZ A; 2GCX A; 4PL6 A; 5GAM g; 4HCC A; 3C94 A; 2BIV A; 2SEM A; 4M78 E; 2JN0 A; 2VYT A; 1IGQ A; 1IHV A; 1MMN A; 3VV0 A; 5FRO A; 1XJW B; 5GMK e; 2QEX T; 4OB2 B; 3GOX A; 4M75 G; 4ME7 A; 2FPF A; 2DER A; 4J7I A; 4DOW A; 2MIO A; 2QQB A; 1RAI B; 2QQR A; 3G6E Q; 2RMO A; 2GGR A; 1I8F A; 1E6G A; 3CCR A; 1R77 A; 2EQI A; 3JB9 D; 4C5G A; 2X4Y A; 4B9X A; 4QQ6 A; 2FZG B; 3UF4 A; 2LZ6 B; 1F1B B; 4ZGE B; 1KFZ A; 4OF1 A; 4F7U A; 1T0J A; 3G6E T; 4ZGD B; 1KQS P; 2DXT A; 2E70 A; 2EFI A; 4OP0 A; 1Z9Q A; 3O5Z A; 4D6W A; 1K9A A; 1I5L A; 1ACM B; 1QVG S; 3JB9 I; 1M8V A; 5FRN A; 1NLP C; 2F2V A; 2RHU A; 2ENM A; 4M7A C; 4J6X A; 4PJO C; 3M56 A; 5HK3 A; 3JB9 G; 4DBH A; 2RJE A; 4PFO A; 4J9C A; 4B9W A; 5CKB A; 4KT0 E; 1S72 Q; 3JCM h; 2P84 A; 1W6X A; 2FYK A; 4IUP A; 3OYK A; 2V1Q A; 3E9F A; 3LW5 E; 2DD4 A; 3M4Y A; 1YJW Q; 5LJ5 d; 1FX7 A; 1YJN Q; 4ZNX A; 4ZTF A; 4KBM B; 4XK8 E; 1S72 T; 3WXM B; 2VV5 A; 1X01 A; 2K3B A; 2OAW A; 4JUV A; 2ABL A; 2JTE A; 2DTH A; 3HRS A; 1YJW T; 1XTD A; 3CXC S; 3H0F A; 1YJN T; 1BI1 A; 2RI2 A; 1B34 A; 1X2K A; 1H8K A; 2WSC E; 3QII A; 4C0G A; 2JZ2 A; 1UGS B; 3M5A A; 2J7I A; 4PLI A; 3R6O A; 3EH1 A; 2B86 A; 2DZC A; 3OS2 A; 2LNV A; 2D0N A; 2FPE A; 1KC8 R; 4RG2 A; 1WJS A; 3RMS A; 1WHL A; 3OW2 S; 1UG1 A; 2EAY A; 2DTI A; 1IO6 A; 1PRL C; 1GBQ A; 2LCL A; 1NEG A; 3OYJ A; 2JUF A; 2VC8 A; 4PLL A; 1X27 A; 4J9H A; 4M78 B; 1YWO A; 4X9C A; 4FW2 A; 3TSW A; 3ULR B; 1QCN A; 4LE9 A; 2DYI A; 4OB0 B; 1KD1 C; 2R5M A; 4R55 A; 4AFS C; 2EQU A; 4GBQ A; 3EGX A; 4C5H A; 1KQS A; 2C06 A; 3NTI A; 1B3Q A; 3TU4 K; 5A2Q E; 1EZZ B; 1D1A A; 2DBM A; 1B07 A; 2CZ1 B; 2XD0 A; 2XID A; 3V8K A; 1UEB A; 4AMC A; 1MMA A; 1AZE A; 1GL5 A; 5FWB A; 4O5V A; 4Y28 E; 2CP3 A; 2CSI A; 3A8O B; 3CD6 A; 1ZLM A; 3LX7 A; 5GAN g; 2DFU A; 4M7A F; 2CDT A; 2KBT A; 1OX8 A; 4FM4 B; 2LT1 A; 2HD0 A; 4D8K A; 1PHT A; 1Q82 R; 2CUD A; 5C0M A; 1Q86 R; 4DEX A; 1V76 A; 1EIF A; 4AT1 B; 4XTW A; 1MUZ A; 2NYS A; 3V7C A; 4C92 D; 2QGF B; 4Z8A A; 1OOT A; 1HK9 A; 3M53 A; 4M77 C; 1AWJ A; 1OU8 A; 3PFS A; 5FLX E; 3OBY A; 3UDC A; 1D09 B; 5KH6 A; 2F69 A; 4XTY A; 2EIF A; 1LOJ A; 5I21 A; 3S3O A; 1VQN A; 5L23 A; 1AT1 B; 3IQL A; 2QK0 A; 2FVU A; 3L1A A; 2ROL A; 3I55 A; 2EYW A; 1TS9 A; 1G3S A; 3ASK A; 4HCB A; 2D1X A; 1OZ2 A; 2HQX A; 1TUG B; 2D9T A; 3HFO A; 1RUW A; 2YUP A; 4E7Z A; 1Y71 A; 4C92 E; 3RKX A; 2RA2 A; 3RMQ A; 2AZS A; 1XNI A; 2DET A; 3MEU A; 2E10 A; 4A53 A; 4R0K A; 4HKE A; 3C0C A; 2CH4 A; 2E3I A; 2X3W D; 2YRD A; 1WDX A; 5HY6 A; 4M4Z A; 2XKO C; 1Z9Z A; 2DJQ A; 2FL7 A; 2XMF A; 1NJI C; 5AT1 B; 4DA4 A; 1IRE B; 5FU6 C; 1NG2 A; 2LQW A; 2BUD A; 3S3M A; 1GFC A; 2F2X A; 2FZK B; 2CS7 A; 1WX6 A; 1ZBX A; 4MZM A; 5KE2 A; 4OMN A; 2QYZ A; 2EGE A; 3CD6 Q; 2CKK A; 4IIO A; 1SPK A; 3SFM A; 1K73 C; 4P5N A; 1HSQ A; 1N5Z A; 1OQK A; 5KCO A; 2QQA A; 4DOV A; 3UT1 A; 3OMC A; 3VJP A; 3CMA A; 3JB9 H; 5CCA A; 1W2B S; 3CD6 T; 3MP1 A; 2J05 A; 2GF7 A; 1Y7X A; 3H6Z A; 1D0Y A; 2RJC A; 2QXF A; 1E7O A; 3CCU A; 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3R6N A; 5CQX A; 3V7R A; 1KIK A; 2MF2 A; 3QDF A; 4RTW A; 2QA4 Q; 3G71 A; 3RBB B; 4BAC A; 3CMA T; 3EAE A; 4CC2 A; 2EKO A; 1YJ9 T; 3EFS A; 1VQO Q; 4AFZ C; 1GBR A; 2EGA A; 1T3L A; 2QI2 A; 4MZT A; 3CCU T; 4J9F A; 1MNE A; 9ATC B; 1NJI R; 3NTH A; 5CAI A; 2DX1 A; 1TU0 B; 2NUT A; 2QA4 T; 1ZUY A; 2DE0 X; 5IXF A; 2V8J A; 5D6Y A; 3G6E A; 3JSC A; 2FO0 A; 2M0O A; 1VQO T; 2RJF A; 1ABO A; 5KYX A; 4C0D C; 1SRL A; 1NYF A; 1GCQ C; 2HL5 C; 2ZPH B; 2Z0W A; 2A37 A; 1BI3 A; 3WVE B; 2ED0 A; 1YHQ A; 4LN2 A; 2YLB A; 2F5K A; 3VRZ A; 4M75 A; 1PC0 A; 2LX7 A; 2YHT A; 1H3H A; 4M7D D; 3P8H A; 5I22 A; 2PZ1 A; 1WXB A; 1AOJ A; 2K2M A; 2RPN A; 3CBM A; 3CCE Q; 1KC8 C; 1R8O B; 4A54 A; 5FU7 B; 3EHQ A; 4OML A; 3SDZ A; 2LX9 A; 3X20 B; 1K9M R; 1GRI A; 1R0B G; 3P8B B; 4HCK A; 2RQR A; 1QP3 A; 1UJY A; 2HKQ B; 3O8V A; 3CCE T; 1YJN A; 3JCM X; 1MND A; 2CUB A; 4FYW B; 4JZ3 A; 5I2M A; 4M7D E; 1X69 A; 1WHJ A; 5EG2 A; 1JQQ A; 2KSS A; 5GAO l; 2YWW A; 1D3B B; 5GAN d; 1X6G A; 3M0S A; 3VYH B; 5LL6 S; 2C0T A; 4M77 D; 2Y4Y A; 2DAQ A; 2DLP A; 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