The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
6
|
sequence length |
85
|
structure length |
85
|
Chain Sequence |
GSSGSSGSGYVIALRSYITDNCSLLSFHRGDLIKLLPVATLEPGWQFGSAGGRSGLFPADIVQPAAAPDFSFSKEQRSGSGPSSG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution structure of the SH3 domain of human KIAA1783 protein
rcsb |
| molecule keywords |
KIAA1783 protein
|
| molecule tags |
Structural protein
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
6
|
| structure length |
85
|
| sequence length |
85
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2006-04-20 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF07653 | SH3_2 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1WDX A; 4CC3 A; 2JMA A; 2KRS A; 1SRL A; 3IQL A; 1X69 A; 2AKK A; 3I9Q A; 2RQR A; 2DMO A; 2I0N A; 2BZY A; 1VA7 A; 3A98 A; 2E5K A; 1GCQ A; 2K9G A; 2KEA A; 4IIO A; 1MV3 A; 4JJB A; 2K79 A; 1MV0 B; 2F2X A; 2CH4 A; 4F17 A; 2EKH A; 1KIK A; 2FPF A; 2GTJ A; 2X3W D; 2J05 A; 4HVW A; 1QWF A; 2O9S A; 1BBZ A; 1PHT A; 1AZG B; 4Y92 A; 1JEG A; 1H92 A; 2K7A A; 4Z88 A; 3PE0 A; 3U23 A; 3M0P A; 2DNU A; 2A08 A; 2D8J A; 1ZUU A; 4QT7 A; 4CC2 A; 2CDT A; 2DLP A; 1TG0 A; 3ZL7 C; 2DYB A; 2HSP A; 2JMC A; 4GLM A; 2L3P A; 1UG1 A; 1T0J A; 3VRY A; 1EFN A; 3VS2 A; 4X1V A; 1FMK A; 3GBQ A; 2SEM A; 1AVZ C; 1SRM A; 5IXB A; 3EG2 A; 1YCS B; 2CUD A; 4LE9 A; 1NLO C; 2FG0 A; 1UUE A; 4HVV A; 5I22 A; 1BU1 A; 1T3L A; 2ESW A; 1GBR A; 1B07 A; 2VVK A; 4IIM A; 1LCK A; 1AWW A; 3M0U A; 2JT4 A; 2VWF A; 3VS0 A; 1M27 C; 1ARK A; 2KE9 A; 4AFS C; 2L0A A; 1AZE A; 1BK2 A; 2ECZ A; 5IHK A; 2RQU A; 4RTV A; 2KRO A; 2YUP A; 5IXF A; 4JPB W; 2C0O A; 2A36 A; 1UFF A; 2CUB A; 2RF0 A; 2PTK A; 1NYG A; 2L2P A; 1ZLM A; 4ORZ A; 1AEY A; 2RPN A; 2LJ1 A; 4AFZ C; 1GFC A; 2EBP A; 4KRT A; 1VYT A; 3EG1 A; 1TUC A; 1YWP A; 1WLP B; 2CRE A; 2LMJ A; 2RQV A; 2EPD A; 1B3Q A; 2AZS A; 2DL5 A; 4RTT A; 1YP5 A; 3H41 A; 2VKN A; 2LNH B; 1X2K A; 1G83 A; 2HEQ A; 2YT6 A; 2LQW A; 4J9F A; 4J9I A; 2DL4 A; 2FRY A; 2QDL A; 2JTE A; 1JO8 A; 2D8H A; 2LJ3 A; 2EYX A; 2YDL A; 2DE0 X; 3QWX X; 1I0C A; 1WX6 A; 1RLP C; 2M51 A; 1K1Z A; 1WYX A; 1H8K A; 1SSH A; 2O88 A; 3NHN A; 5FWC A; 5ECA A; 4EIK A; 2X3X D; 4OMP A; 1WIE A; 2FO0 A; 1ZX6 A; 2BTT A; 3UA6 A; 4D8D A; 4J9D A; 3UF4 A; 1ZUY A; 2O31 A; 2RMO A; 2LCS A; 2RQW A; 4D8K A; 2LJ0 A; 2FPD A; 2J6K A; 1WI7 A; 3UA7 A; 3EGU A; 4JZ3 A; 1PWT A; 4RTU A; 2AZV A; 4RUG A; 1KSW A; 2FRW A; 2ROT A; 2CH4 W; 2PZ1 A; 2L3S A; 2ED1 A; 3C0C A; 2XMF A; 1NEG A; 1X6B A; 2DF6 A; 1OV3 A; 1ABO A; 4AG1 C; 4OMM A; 2DL7 A; 2KXC A; 1K0X A; 2V1R A; 3H0I A; 3REB B; 4RTZ A; 4AG2 C; 2K6D A; 2RNA A; 2DVJ A; 2NUZ A; 2KRM A; 1H3H A; 2YUO A; 1E7O A; 2C0I A; 2G6F X; 1QKX A; 5GJV B; 2JM9 A; 5I11 A; 1W70 A; 2EYY A; 1SPK A; 4HVU A; 2A28 A; 3EHQ A; 2CSI A; 2RQT A; 3KFV A; 1G2B A; 2DJQ A; 1NYF A; 2DRM A; 1Z9Q A; 2YUQ A; 2KR3 A; 2K2M A; 1UE9 A; 5GJW B; 2DL8 A; 2J7I A; 1OEB A; 3H0H A; 3M0Q A; 4F16 A; 1T0H A; 1NG2 A; 3NGP A; 1X6G A; 2C0T A; 1M8M A; 2AKL A; 1UGV A; 4M4Z A; 2W10 A; 4DEY A; 2EYZ A; 1PRM C; 2J06 A; 2NWM A; 1ZBJ A; 2DBM A; 2ABL A; 2JS0 A; 2FPE A; 1GRI A; 1WFW A; 1I1J A; 1GCQ C; 4OMQ A; 1U3O A; 2CSQ A; 1ZSG A; 4HXJ A; 1PNJ A; 2H8H A; 2W0Z A; 1E6H A; 2GGR A; 2ENM A; 4ESR A; 1BB9 A; 4J9C A; 2D0N A; 2EGA A; 1K76 A; 5L23 A; 4K11 A; 1JXM A; 1UHF A; 2EGE A; 1PKS A; 2B86 A; 1UEC A; 5IH2 A; 1AWJ A; 1AWX A; 3ULR B; 1X43 A; 1X27 A; 2JS2 A; 2HBW A; 2L3Q A; 2P4R A; 4J9B A; 3EG0 A; 2GTO A; 1HD3 A; 1OPK A; 1N5Z A; 1WXU A; 4ZNX A; 2RN8 A; 2A37 A; 1WXT A; 1RLQ C; 3UAT A; 4FSS A; 2KYM A; 1QLY A; 2EVR A; 2JW4 A; 3M0R A; 1UHC A; 3SEM A; 4R0K A; 3VS1 A; 1VYU A; 2YSQ A; 1I07 A; 2KBT A; 1XOV A; 4J9H A; 4OML A; 1WA7 A; 2D1X A; 2OJ2 A; 1V1C A; 1FYN A; 4JJC A; 4Z89 A; 3M0T A; 1YNZ A; 2DA9 A; 1AD5 A; 4LNP A; 2LP5 A; 2CT4 A; 1RI9 A; 4LUE A; 3RBB B; 2DBK A; 1KJW A; 2PNI A; 5FW9 A; 4A63 B; 3FJ5 A; 1M30 A; 1WXB A; 2GNC A; 1GCP A; 2SRC A; 4GBQ A; 2M0Y A; 2LX7 A; 3SHW A; 1HJD A; 1U06 A; 2KXD A; 3TSW A; 3VRZ A; 4OMO A; 2LZ6 B; 1T3S A; 2J6F A; 3I35 A; 1QCF A; 2CT3 A; 1SEM A; 4CC4 B; 4JJD A; 3EG3 A; 4OMN A; 2KT8 A; 1VYV A; 3VS3 A; 1UDL A; 2DM1 A; 2O9V A; 1UTI A; 1K0S A; 3NPF A; 1CKB A; 2AK5 A; 1UJ0 A; 1ZUK A; 2KT1 A; 1PRL C; 2EGC A; 3VS6 A; 1M3B A; 1X2Q A; 1JXO A; 4JZ4 A; 5EC7 A; 3NMZ C; 5IHN A; 3PVQ A; 1E6G A; 3LH5 A; 1U5S A; 3QWY A; 3H0F A; 2J6O A; 1K9A A; 2BZX A; 5HCK A; 2KGT A; 2DL3 A; 2F2V A; 2ROL A; 1W1F A; 3THK A; 2EW3 A; 1W6X A; 4J9G A; 2OI3 A; 1QWE A; 2EYW A; 2OAW A; 1Y0M A; 1K4U S; 2F2W A; 1S1N A; 1IO6 A; 3R6N A; 5IHI A; 2YUN A; 1NEB A; 4AFU C; 2MCN A; 3EHR A; 1Y57 A; 2HCK A; 1UJY A; 3I5S A; 2K3B A; 4LUD A; 3REA B; 3CQT A; 4F14 A; 2DX1 A; 1CSK A; 2DIL A; 1GBQ A; 2JM8 A; 4RTY A; 2V1Q A; 1GFD A; 2ED0 A; 3TVT A; 4LN2 A; 1YN8 A; 2HDA A; 2BZ8 A; 2MIO A; 3I5R A; 3VS7 A; 2KNB B; 1NM7 A; 1JU5 C; 2KYB A; 4RTX A; 1M3A A; 2IIM A; 2GBQ A; 3PVL A; 1CKA A; 1NLP C; 4HCK A; 4J9E A; 5FWB A; 1J3T A; 3VS5 A; 1RUW A; 1OPL A; 2JXB A; 1SHF A; 4AFQ C; 3VS4 A; 1HSQ A; 4Z8A A; 2DRK A; 4E6R A; 1JQQ A; 1SHG A; 1AOJ A; 1QKW A; 1YWO A; 1A0N B; 1M3C A; 4WCI A; 2GQI A; 3M0S A; 4RTW A; 3JV3 A; 4DEX A; 1KFZ A; 1GL5 A; 3RNJ A; 2EQI A; 2FEI A; 1Z9Z A; 1AWO A; 1OOT A; 2KRN A; 2MOX A; 2O2O A; 4CC7 A; 2LQN A; 3O5Z A; 1TUD A; 3TSZ A; 1MUZ A; 1PKT A; 1ABQ A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1QW1 A; 1U1T A; 3RKX A; 5LJ3 e; 2DIG A; 2KY9 A; 4PFP A; 2RQR A; 5I2S A; 4RCB A; 2DMO A; 3FIF A; 1X6O A; 3OYD A; 3QYG B; 2GFU A; 2LRQ A; 2E5K A; 4GY5 A; 1GCQ A; 3FB9 A; 1W2B A; 3JCM P; 1YJW Q; 4JJB A; 1MV0 B; 2XU8 A; 4C92 B; 2CH4 A; 2MPX C; 2GTJ A; 2X3W D; 5GAN 3; 1QWF A; 3A5Z B; 4OP0 A; 1BBZ A; 3G4S A; 4ME7 A; 1VQN A; 1JEG A; 1BKB A; 4Z88 A; 5C6S A; 1B7T A; 3EGD B; 5LJ3 j; 4PJN A; 2A08 A; 2V8I A; 3CCV Q; 1WPY A; 1ZUU A; 3AHU A; 4M75 A; 1PSE A; 2R5M A; 1RAD B; 1QVP A; 4ELY C; 3I56 T; 2CDT A; 1I5O B; 3O8V A; 2CYZ B; 2HSP A; 4A4K A; 2JMC A; 1EFN A; 3H8Z A; 2QXF A; 1OUL A; 1FMK A; 3GBQ A; 1AVZ C; 3CCS Q; 3LGL A; 3EG2 A; 2WAC A; 1YCS B; 4LE9 A; 3VYG A; 2FG0 A; 4XU1 A; 8AT1 B; 1VQL T; 5GAN h; 4M78 E; 1WNL A; 2OX7 A; 2EIF A; 1ZSZ B; 5GAM j; 1R0C B; 4BI4 A; 2VVK A; 4IIM A; 1LCK A; 4J5Y A; 1AWW A; 3S3O A; 4FM4 B; 3M4G A; 4M78 C; 3E9F A; 2X4J A; 4KUD K; 2L0A A; 3OW2 P; 1H64 1; 1MMN A; 1LJO A; 2LC4 A; 2KRO A; 5CCA A; 3OYN A; 4A4G A; 1YFN A; 1NJI C; 2JTF A; 1UEB A; 3VJP A; 4M7A G; 5GAN f; 1MNE A; 3CC7 T; 1ZLM A; 2X4Y A; 4MML A; 1KQS A; 4DA4 A; 2RK1 A; 4KRT A; 3CCJ Q; 1SF9 A; 1VQO T; 4HCZ A; 1R8O B; 4C92 E; 1M2V B; 1FXX A; 4RTT A; 1U8R A; 2HQH A; 3URG A; 3V7S A; 4C92 C; 4OB3 B; 1X2K A; 4JLI A; 4DBQ A; 1G83 A; 1VQK A; 2LQW A; 3TU4 K; 4J9F A; 2HD0 A; 2K57 A; 2XG8 D; 2JTE A; 4ATO A; 4N0A C; 1JO8 A; 4M7A D; 2DTH A; 2IVW A; 2HQX A; 1Y96 A; 2RO0 A; 1Q82 U; 2DZC A; 3CCR A; 2LJ3 A; 1K73 R; 3MEV A; 4KUI A; 2EYX A; 2YDL A; 3G6E Q; 1WX6 A; 3MPU B; 2OAU A; 1W2B P; 2O4X B; 4A4H A; 4HKE A; 3NHN A; 4M78 A; 2DYI A; 2X3X D; 1WIE A; 3JCM Q; 2ZPE B; 2RMO A; 1ZSZ C; 2RQW A; 4D8K A; 2OTL Q; 1QVF A; 2FPD A; 1WI7 A; 1PM3 A; 3EGU A; 1MGQ A; 2ZPG B; 2F69 A; 4RTU A; 3EFS A; 1KSW A; 3MP1 A; 2CS7 A; 3CME T; 4E7J A; 2CH4 W; 4ZGD B; 4ZTF A; 5FRO A; 1NJI R; 2DER A; 3OBW A; 4F7U B; 3CC4 T; 2F1L A; 4E7K A; 1ZA2 B; 3CC2 A; 3DLL A; 2DFU A; 1ABO A; 4LDX A; 1N8R U; 2RK2 A; 2DL7 A; 2KXC A; 2V1R A; 1MND A; 4RTZ A; 4M7D B; 4AG2 C; 1K8A U; 4OB2 B; 1M1K U; 1JBM A; 2I2L A; 1QP2 A; 1E7O A; 2A7Y A; 2E3I A; 2YWW A; 5GJV B; 3LWH A; 4M7A A; 2A3L A; 3HRU A; 5CQX A; 1FWZ A; 4QKU A; 3EAE A; 2RQT A; 3KFV A; 1G2B A; 2YUQ A; 3EFO A; 1ZBX A; 1UE9 A; 2DL8 A; 4WF2 A; 3CBP A; 3H0H A; 3M0Q A; 3M54 A; 1PCX A; 2BUD A; 2WSC E; 3RMS A; 1VQN T; 2EYZ A; 3VKI A; 4IUV A; 5HY6 A; 2NWM A; 2ABL A; 2FPE A; 2YXY A; 1I1J A; 4OMQ A; 1S72 T; 2O01 E; 2RH2 A; 4M77 G; 5GAO r; 1PNJ A; 4C0D B; 4HCC A; 1E6H A; 2QEX A; 3V8J A; 3M56 A; 2X51 A; 3QJY A; 1PG5 B; 4D6W A; 5DM7 R; 4K11 A; 2QQ9 A; 3JCM d; 5HKC A; 1UEC A; 5IH2 A; 1Y07 A; 1AWX A; 1BI0 A; 4F7U E; 4MZM A; 2LT4 A; 3OMG A; 3HL8 A; 1WXU A; 2E6N A; 2RN8 A; 2ZPB B; 3OYK A; 3UAT A; 5LJ5 h; 1QLY A; 4AMC A; 4M7D E; 2DEQ A; 3G71 Q; 4RCC A; 4M77 D; 5HK3 A; 5KH6 A; 3OYG A; 1YI2 T; 2H3E B; 2KBT A; 1M1G A; 1TH7 A; 1WHK A; 1N6A A; 2D1X A; 4M7D C; 4FYV B; 4KH1 B; 3X24 B; 3CEY A; 4JJC A; 2NUT A; 4J6X A; 5KE2 A; 1KQS S; 2LP5 A; 2ATC B; 2CT4 A; 3M5A A; 3X25 B; 3RBB B; 3OYC A; 1KJW A; 4LDY A; 3BE3 A; 6AT1 B; 2XID A; 3CD6 Q; 1M30 A; 3A8O B; 4KGX B; 3CBM A; 1HJD A; 1IZ6 A; 2DO3 A; 3TSW A; 1GXI E; 1VQ5 A; 3SWN A; 2LNV A; 3I35 A; 4JRP A; 1VYV A; 3VS3 A; 4A53 A; 1YJN A; 1UDL A; 4XAX B; 3EGX B; 2QDY B; 2LT1 A; 3JB9 J; 1UTI A; 3V8L A; 1VQ9 A; 4B9W A; 4LD6 A; 2KT1 A; 1PRL C; 1RAA B; 3VS6 A; 4C0D C; 1AHJ B; 1YJW A; 4FT2 A; 3GPL A; 5IHN A; 4KH0 B; 2J6O A; 1YIT Q; 4J9G A; 1BI1 A; 4BI3 A; 1Y0M A; 2DZ9 A; 2GQV A; 4LDV A; 2F2W A; 3JCM e; 2EJF A; 4BDZ A; 3QDF A; 1Q82 C; 2NYS A; 1QVF S; 3EHR A; 2E6Z A; 2ZCF B; 1I8F A; 3JB9 I; 3CQT A; 2XKO C; 2RHU A; 3FJP A; 5GAN 4; 2QA4 T; 2PUK B; 3DB4 A; 3I5R A; 3VS7 A; 2KNB B; 3FRN A; 5CKH A; 1NM7 A; 3GOX A; 2KMT A; 3MEU A; 2GBQ A; 3CC2 T; 5IT9 E; 2LTO A; 1OPL A; 4C8Q F; 1SHF A; 4HT9 A; 2Y4Y A; 1HSQ A; 4Z8A A; 5IN1 A; 4BY6 B; 1JQQ A; 2E10 A; 3M59 A; 5CIU A; 2RA2 A; 3FEO A; 3OS1 A; 1R0B G; 5DLQ E; 2KAF A; 1TSF A; 5CKF A; 1HXD A; 3JB9 F; 3HHT B; 1D1B A; 1AWO A; 1VQ8 Q; 1N8R C; 1ZHI A; 1XJW B; 2QYZ A; 2RI2 A; 3O5Z A; 2E5Q A; 3Q1J A; 2CP0 A; 3TSZ A; 1K8A C; 1MUZ A; 1M1K C; 1PKT A; 3CCJ A; 5DY9 A; 1KK7 A; 3SD4 A; 4MZT A; 2B8A A; 2F5K A; 2KRS A; 4C5E A; 3SFM A; 1O75 A; 4FIB A; 4BAC A; 2K4Y A; 2I0N A; 2BZY A; 2JVV A; 4KBM B; 4PFO A; 4RG8 A; 1N27 A; 5GAO q; 2P4T A; 2KEA A; 4IIO A; 4BI8 B; 4JS4 A; 4YTL A; 3MJX A; 4F17 A; 4DBR A; 2JTM A; 2FPF A; 4HVW A; 3SDZ A; 4XTW A; 1OYX A; 1PSF A; 1QMC A; 2PVD B; 5LJ3 d; 3CC7 A; 2K7A A; 3PE0 A; 3OYM A; 2DNU A; 4HT8 A; 2KQW A; 3NTH A; 5A0D A; 1KD1 R; 2DLP A; 1M2O A; 1WJQ A; 2DXB A; 5GAN e; 4GLM A; 2XDD A; 4X1V A; 1HK9 A; 1SRM A; 5J39 A; 2CUD A; 3HRS A; 3CCQ Q; 4BY6 C; 1KHC A; 2COW A; 4J6Y A; 5GAM d; 1UUE A; 1LVK A; 3JCM J; 1T3L A; 2ESW A; 3PGG A; 1EX4 A; 3ZFJ A; 2IG0 A; 1B07 A; 2X35 A; 3GIB A; 3M0U A; 4A4F A; 3VS0 A; 2KE9 A; 3TCJ A; 3MCA B; 4PJO F; 1M1K R; 3L1A A; 2D6F A; 2RQU A; 5KYW B; 5D6W A; 5GAN j; 2FB7 A; 2C0O A; 2CUB A; 3PMI A; 1NYG A; 3L2R A; 2L89 A; 1D0Z A; 1ZQ1 A; 2WSF E; 2RPN A; 1FX7 A; 1YIJ Q; 4AFZ C; 1G3T A; 1VIE A; 1B34 B; 3FLG A; 2RQV A; 1D0Y A; 2JZ2 A; 1BI3 A; 3CCM Q; 1ZA1 B; 1B3Q A; 2AZS A; 1TS9 A; 2DL5 A; 3CME A; 3H41 A; 1I4K 1; 2JJ9 A; 2LNH B; 3CC4 A; 2KSS A; 1M5Q 1; 4C0G A; 3CCV T; 3P8D A; 1AT1 B; 1BYM A; 2EQJ A; 5A0G A; 3MEW A; 2EWN A; 3BFM A; 3CCS T; 1K1Z A; 2G3R A; 3HPW A; 1Y7X A; 1SSH A; 3OQ5 A; 1VQP Q; 3PFS A; 1M90 U; 1H3Z A; 4X9D A; 2HBP A; 1OZ3 A; 1OI1 A; 2BTT A; 4X9C A; 2QK0 A; 3UA6 A; 4D8D A; 1SSF A; 3J81 E; 1ZUY A; 2O31 A; 1D3B A; 2LCS A; 5GAM e; 2VGM A; 1PWT A; 4JDS A; 2AZV A; 5I2M A; 2ROT A; 4V2S A; 4M78 G; 4E7L A; 1S72 A; 2L3S A; 4J6W A; 2XMF A; 4NL2 A; 1PD0 A; 2HNI A; 1X6B A; 2DF6 A; 3G1J A; 1G3S A; 4DBH A; 3CCJ T; 4XTV A; 3QXE B; 3REB B; 2DD5 A; 3CBO A; 4FT4 A; 2KRM A; 1H3H A; 4FCY A; 2HMA A; 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