The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
7
|
sequence length |
71
|
structure length |
71
|
Chain Sequence |
GSSGSSGEEKYVTVQPYTSQSKDEIGFEKGVTVEVIRKNLEGWWYIRYLGKEGWAPASYLKKAKDSGPSSG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution structure of RSGI RUH-061, a SH3 domain from human
rcsb |
| molecule keywords |
SH3 multiple domains 1
|
| molecule tags |
Structural genomics, structural protein
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
7
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| structure length |
71
|
| sequence length |
71
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2006-04-26 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2PTK A; 1B07 A; 2IIM A; 2LQN A; 1Y57 A; 2RQR A; 4JPB W; 1WYX A; 2O9V A; 1UTI A; 2BZY A; 2D0N A; 2ROT A; 1GBQ A; 1E7O A; 5L23 A; 2G6F X; 2AZV A; 2KT1 A; 1WFW A; 1E6H A; 2NUZ A; 1OPK A; 2A08 A; 1ARK A; 2KXD A; 2X3W D; 4RUG A; 1SPK A; 2B86 A; 1PKT A; 2EBP A; 2RQT A; 2AKL A; 4AFS C; 1OEB A; 1Z9Z A; 1ZBJ A; 4RTT A; 5GJV B; 2CUB A; 2ENM A; 1X27 A; 1MV0 B; 1MV3 A; 3M0P A; 4CC4 B; 2M51 A; 2K79 A; 2ABL A; 1J3T A; 3EHR A; 2BZ8 A; 2LMJ A; 4F16 A; 2AK5 A; 4F14 A; 4OMN A; 1BB9 A; 5IHK A; 2JT4 A; 4J9I A; 5FW9 A; 1GFD A; 4WCI A; 2F2X A; 4JZ4 A; 2O2O A; 4OML A; 1W6X A; 2DJQ A; 2JS2 A; 2KRN A; 1CKA A; 2JM9 A; 1X6G A; 3VS5 A; 1NLO C; 4GLM A; 2DL4 A; 3EG0 A; 3M0U A; 1ZLM A; 2EYY A; 4F17 A; 1U06 A; 1M3A A; 2A28 A; 1X2K A; 4DEY A; 3GBQ A; 2EPD A; 2MIO A; 3VS7 A; 1SHG A; 2BTT A; 2DRM A; 3SHW A; 1WA7 A; 3H0H A; 2RN8 A; 3EG3 A; 1QKW A; 2FPE A; 2KXC A; 2DX1 A; 2JMC A; 1BK2 A; 1I07 A; 1GL5 A; 1ZX6 A; 2A36 A; 5IXB A; 2EYW A; 4J9C A; 4KRT A; 4OMO A; 1AZE A; 2EGA A; 1M8M A; 2LJ1 A; 2O9S A; 2KE9 A; 2M0Y A; 4HCK A; 1CKB A; 1VYV A; 3UA6 A; 2FPD A; 4ESR A; 4HVU A; 1PRL C; 1RLQ C; 1OV3 A; 2C0T A; 4CC7 A; 1AVZ C; 1UEC A; 1NEG A; 4HVV A; 3TSZ A; 2OAW A; 1PHT A; 1QWF A; 1WIE A; 1KSW A; 1OPL A; 1Z9Q A; 2BZX A; 4CC2 A; 3JV3 A; 2RQU A; 2PZ1 A; 2GTO A; 4LN2 A; 1PWT A; 2LNH B; 1G83 A; 2RQW A; 1HSQ A; 2KRO A; 1BU1 A; 2K9G A; 1NG2 A; 2DRK A; 2L3S A; 2RNA A; 4JJD A; 5FWB A; 2FRW A; 5ECA A; 1W1F A; 1FYN A; 4LE9 A; 1K4U S; 1PNJ A; 2C0O A; 2CSQ A; 1E6G A; 4ZNX A; 1UJ0 A; 2J6F A; 3UA7 A; 4RTY A; 5HCK A; 2FPF A; 3VS1 A; 1IO6 A; 1WI7 A; 2EYX A; 2VVK A; 1M3C A; 1JXO A; 4OMM A; 4LUE A; 3THK A; 3NPF A; 1N5Z A; 2FRY A; 1QWE A; 2RQV A; 1H3H A; 3M0T A; 1M3B A; 3REA B; 2EW3 A; 2XMF A; 1QKX A; 4J9F A; 1ZUK A; 1K9A A; 2O31 A; 4AG2 C; 4Y92 A; 2JMA A; 1JQQ A; 2LCS A; 4D8D A; 1OOT A; 4AFZ C; 1T0H A; 2L3Q A; 2DE0 X; 3PVL A; 1GRI A; 4RTW A; 1K0S A; 2CDT A; 3VS0 A; 4LUD A; 1AD5 A; 2FEI A; 1TUC A; 2CH4 W; 1AWX A; 2CUD A; 4JJC A; 1YWP A; 1TG0 A; 2GBQ A; 4E6R A; 1RLP C; 4J9H A; 2K2M A; 2HCK A; 1PRM C; 1BBZ A; 5I22 A; 2EGE A; 1I0C A; 3EG2 A; 4LNP A; 1KJW A; 1YNZ A; 3EG1 A; 3RBB B; 1TUD A; 2GQI A; 2HDA A; 2EVR A; 2HEQ A; 2CRE A; 1ZUU A; 2DM1 A; 5IHN A; 2V1Q A; 4IIM A; 3UF4 A; 2VWF A; 3TSW A; 3I5R A; 1ZUY A; 2SEM A; 2ED1 A; 2KYM A; 1U3O A; 1EFN A; 1X43 A; 2CT3 A; 4ORZ A; 2RF0 A; 4IIO A; 2KEA A; 1RI9 A; 3M0Q A; 2CH4 A; 2KR3 A; 3UAT A; 5GJW B; 4RTU A; 2YSQ A; 3I35 A; 2JXB A; 2HBW A; 2PNI A; 1UG1 A; 4J9B A; 2W10 A; 2K6D A; 2YDL A; 4RTX A; 4EIK A; 1M27 C; 3I9Q A; 1JO8 A; 4HVW A; 2J05 A; 2KT8 A; 3VRY A; 1YWO A; 4JZ3 A; 1LCK A; 1Y0M A; 3O5Z A; 2DL5 A; 4RTV A; 3VS2 A; 5IH2 A; 2KRM A; 3PVQ A; 1K1Z A; 2GNC A; 2EQI A; 2QDL A; 2O88 A; 2KBT A; 3PE0 A; 3LH5 A; 2L2P A; 4CC3 A; 2OJ2 A; 3RNJ A; 2J6K A; 1M30 A; 1HD3 A; 4HXJ A; 2DF6 A; 2KGT A; 2GTJ A; 2J06 A; 3VS4 A; 1VA7 A; 1CSK A; 1SSH A; 1U5S A; 4DEX A; 2FG0 A; 2RMO A; 1YN8 A; 2EGC A; 4X1V A; 2DA9 A; 1ABO A; 3REB B; 1UDL A; 3SEM A; 1RUW A; 1NEB A; 2EYZ A; 5FWC A; 2F2V A; 2ED0 A; 2NWM A; 1UHC A; 1S1N A; 2X3X D; 1NLP C; 4AFU C; 1WXU A; 2DIL A; 2OI3 A; 1FMK A; 2JTE A; 5EC7 A; 1GCQ A; 3EGU A; 1GCQ C; 1H8K A; 2FO0 A; 2D8J A; 2LJ3 A; 1JEG A; 3EHQ A; 2VKN A; 2JS0 A; 3ZL7 C; 3CQT A; 5I11 A; 3R6N A; 4J9E A; 2MCN A; 4J9D A; 1A0N B; 3A98 A; 3NGP A; 1ZSG A; 1NYF A; 2A37 A; 2C0I A; 4J9G A; 2D1X A; 3H0I A; 4Z8A A; 3IQL A; 3QWY A; 1X69 A; 2ESW A; 1AOJ A; 2AZS A; 1VYT A; 3TVT A; 1X2Q A; 4JJB A; 3U23 A; 2I0N A; 3NMZ C; 2LJ0 A; 4FSS A; 4K11 A; 1HJD A; 2P4R A; 1ABQ A; 2H8H A; 4R0K A; 1KFZ A; 2MOX A; 2HSP A; 3ULR B; 1T3S A; 2J7I A; 1JXM A; 2DBK A; 2KRS A; 1WXT A; 2YUN A; 4M4Z A; 1WX6 A; 2D8H A; 1WXB A; 3FJ5 A; 3NHN A; 4OMQ A; 2F2W A; 4GBQ A; 1KIK A; 2YT6 A; 1WDX A; 4Z88 A; 1SRM A; 1UFF A; 1YCS B; 1AWO A; 1X6B A; 1UGV A; 2DVJ A; 2JM8 A; 2ROL A; 2W0Z A; 2SRC A; 2YUP A; 2V1R A; 2YUQ A; 2DNU A; 1I1J A; 2DMO A; 2DBM A; 2YUO A; 2K3B A; 1H92 A; 1XOV A; 2LZ6 B; 3QWX X; 1YP5 A; 2KYB A; 3VS3 A; 2LX7 A; 2CT4 A; 1GCP A; 1JU5 C; 1AEY A; 2ECZ A; 1QCF A; 3M0S A; 1QLY A; 2DL7 A; 2LP5 A; 1K76 A; 2DL3 A; 4Z89 A; 2DLP A; 1T3L A; 4RTZ A; 1UJY A; 1AWW A; 1B3Q A; 2RPN A; 2AKK A; 1MUZ A; 1GFC A; 5IXF A; 2L0A A; 1T0J A; 2K7A A; 2E5K A; 4QT7 A; 2DYB A; 4AFQ C; 1WLP B; 1K0X A; 2J6O A; 3VS6 A; 2LQW A; 3KFV A; 3I5S A; 4A63 B; 2L3P A; 4OMP A; 3M0R A; 1VYU A; 2EKH A; 1GBR A; 4AG1 C; 4D8K A; 2KNB B; 1W70 A; 1G2B A; 1SRL A; 1AWJ A; 1UE9 A; 3H0F A; 1AZG B; 1NM7 A; 3C0C A; 1V1C A; 1NYG A; 1SEM A; 1SHF A; 3H41 A; 2JW4 A; 3VRZ A; 2CSI A; 2DL8 A; 1UUE A; 5IHI A; 1UHF A; 2GGR A; 1PKS A; #chains in the Genus database with same CATH topology 5GAM e; 2PTK A; 1IRX A; 2VXF A; 1S72 T; 2LQN A; 1Y57 A; 4JPB W; 3LW5 E; 2HL3 A; 1VQ7 Q; 4IUP A; 2ROT A; 2QG9 B; 3G71 A; 3OYB A; 1WFW A; 1OPK A; 2COZ A; 2EQJ A; 4L6V 5; 4RUG A; 1SPK A; 3JB9 J; 5CCA A; 4E7I A; 2EBP A; 2Z0W A; 2E64 A; 3TQ7 P; 2RQT A; 2F5T X; 4AFS C; 1UGP B; 4KGV B; 3CXC P; 2F5K A; 3H6Z A; 4M7A G; 1ZBJ A; 4RTT A; 5GJV B; 4M7A C; 3GNF B; 1MV3 A; 3M0P A; 4EMG A; 3MPU B; 3A8M B; 1YIJ Q; 2ABL A; 4E47 A; 4FSX A; 4DA4 A; 3HP9 A; 4M77 D; 1PM3 A; 4OMN A; 1WHL A; 3SFM A; 3V7C A; 5KCO A; 4OB0 B; 4M77 E; 5FW9 A; 4X34 A; 3FIF A; 1RAH B; 4WCI A; 2QA4 T; 2O2O A; 4OML A; 2OTJ A; 1W6X A; 2DJQ A; 2JM9 A; 3M57 A; 4LD9 K; 1P92 A; 5LJ5 d; 3G6E Q; 1NLO C; 1K9M R; 2DL4 A; 5D6X A; 3KXT A; 3M0U A; 1VQ8 A; 3M58 A; 1ZLM A; 4F17 A; 2E3I A; 5IN1 A; 2A28 A; 3JCM J; 2E70 A; 4JRQ A; 2MWP A; 3ER0 A; 1M2V B; 2EPD A; 4RCC A; 2KMT A; 2PVO B; 1WHG A; 2VV5 A; 1SHG A; 2X4J A; 3M4Y A; 4AMC A; 1I07 A; 4KGZ B; 1ZX6 A; 4ZGJ B; 5CIU A; 1M9S A; 2X51 A; 4DBF A; 3BDU A; 4E7S A; 3SDZ A; 1M8M A; 2KI7 A; 3I55 A; 2X35 A; 2O9S A; 1M4Z A; 3OA6 A; 2DER A; 1VYV A; 5GAN 8; 3X28 B; 4FYW B; 1RAB B; 3CCE Q; 2HQE A; 4OGE A; 3V7R A; 1FMW A; 5EG2 A; 5GAO m; 3CC7 A; 2ZAE A; 2JOY A; 3VYH B; 1ZSZ B; 2OAW A; 3OW2 A; 3MHX A; 3JRZ A; 1KSW A; 3BW1 A; 2X9H A; 3MO8 A; 2BZX A; 2RQU A; 1IHW A; 2XU8 A; 4LN2 A; 4ZTJ A; 1M1F A; 2EYQ A; 1HSQ A; 1OZ3 A; 3RKW A; 8ATC B; 1BU1 A; 1NG2 A; 2DRK A; 2GF7 A; 2KVQ G; 3G71 Q; 1VQO A; 2RI3 A; 1WHK A; 1E6G A; 2YWW A; 4MZM A; 5CQY A; 3C12 A; 3UA7 A; 3WVE B; 4RTY A; 3CCQ T; 3LX7 A; 5HCK A; 2FPF A; 3INZ A; 4PLL A; 1YJN A; 1YJ9 Q; 1JXO A; 2FZK B; 4LUE A; 3THK A; 4J7F A; 3JCM b; 5GAM g; 5LJ3 j; 5HK0 A; 2O31 A; 3CCV T; 2YRV A; 4Y92 A; 3HHT B; 3RES A; 1OOT A; 4AFZ C; 1MMG A; 4E7K A; 3NTI A; 1SSF A; 1D3B A; 1K0S A; 2LVM A; 3VS0 A; 4FT2 A; 1AD5 A; 2NUP A; 1WNL A; 1TUC A; 4JJC A; 1AWX A; 2FVU A; 2OTJ Q; 1ZQ1 A; 1N8R R; 2RJC A; 4M7D D; 4PNO A; 1I5L A; 4M7D E; 2HCK A; 1PRM C; 1I0C A; 3EG2 A; 3P8D A; 4XAX B; 3JCM X; 3HFN A; 1Y96 B; 1GXI E; 2LT4 A; 1YJW A; 1VQ5 T; 4JRP A; 1PSE A; 3KUF A; 2WSF E; 3RBB B; 4KH1 B; 2NUT A; 2LRQ A; 3JB9 G; 4A53 A; 4IIM A; 2DFU A; 2FL7 A; 2VWF A; 1LOJ A; 2VYT A; 1YIT Q; 4FL6 A; 1EFN A; 3CME T; 4ORZ A; 2XDP A; 3I55 Q; 5GMK j; 1OX9 A; 1VQ4 T; 2XID A; 1RI9 A; 3MP6 A; 3UAT A; 2HAX A; 1KC8 R; 1H3Z A; 5GAN 5; 3I56 A; 5GMK i; 4HCC A; 2PNI A; 1UG1 A; 3D7S B; 3CC7 Q; 4M7A D; 4OVA A; 4EIK A; 1WHJ A; 4M7A E; 4ANJ A; 2M1H A; 3RMQ A; 3VRY A; 1Y0M A; 3OYN A; 3O5Z A; 2DL5 A; 4RTV A; 1MHN A; 3OSS C; 1VQO Q; 3CBP A; 2IVW A; 2GNC A; 2EQI A; 2V8K A; 3QJY A; 3JB9 I; 3RKY A; 4KUI A; 2MMP A; 3JCM d; 4M75 G; 7AT1 B; 3LH5 A; 4BE1 A; 1QCN A; 1RAF B; 4M75 C; 2QGG A; 4C8Q B; 1M30 A; 3M9Q A; 1M1K C; 1FX7 A; 2DD4 A; 3LLR A; 2KGT A; 1YJN Q; 1LNX A; 1VQK T; 2GTJ A; 2EJG A; 2MWO A; 2YHT A; 4PJM A; 3VS4 A; 5KYU B; 2KAF A; 1ABO A; 2DZ9 A; 4Y28 E; 2EIF A; 1NEB A; 1RAI B; 2PUK B; 4XTW A; 3CCL T; 4M78 B; 3HSB A; 2P4T A; 2ATC B; 4AFU C; 4J5Y A; 3E9F A; 3EGU A; 1GCQ C; 2D8J A; 5CKH A; 3JAM E; 2VKN A; 2JS0 A; 1Q7Y R; 3R6N A; 2DD5 A; 4J9D A; 3A98 A; 3NGP A; 1ZSG A; 1ZA2 B; 3FB9 A; 2GQV A; 4DQ2 A; 1TSF A; 3FJP A; 3GF5 A; 3CCR A; 2C0I A; 4PFZ A; 2OTL A; 1YJW Q; 1BI0 A; 4Z8A A; 4DBH A; 3P8B B; 2WSC E; 1VYT A; 2DEQ A; 1W2B P; 4JJB A; 3U23 A; 2I0N A; 4JLI A; 4R56 A; 3EG9 A; 4LDX A; 3G4S Q; 4K11 A; 1K8A U; 1ABQ A; 2HSP A; 2XIC A; 1JJ2 P; 1D09 B; 4C0F A; 2J7I A; 1JXM A; 1NJI R; 2JNG A; 5GAN d; 1WXB A; 2Y4Y A; 3I56 Q; 1KIK A; 1WDX A; 1UFF A; 2KQW A; 2E3H A; 2QQA A; 2DVJ A; 2W0Z A; 1PC0 A; 2YUP A; 3CXC S; 3EH1 A; 4JS4 A; 4PJO C; 2DNU A; 3PIP A; 1EZZ B; 2KYB A; 3DLM A; 3FRN A; 4PL6 A; 1JU5 C; 3GP8 A; 3HRS A; 1NPP A; 3CCS T; 2DL3 A; 1TU0 B; 3M59 A; 3CC2 A; 2DLP A; 1TXQ A; 3JCM h; 1O9S A; 3QKJ A; 1UJY A; 1B3Q A; 1YHQ T; 2QYZ A; 3H8Z A; 1MUZ A; 1GFC A; 2L0A A; 4MDX A; 4FW1 A; 2J6O A; 3VS6 A; 3A8H B; 3I5S A; 3JB9 D; 2EKH A; 1GBR A; 1VQ7 T; 2JTF A; 3MKD A; 1AZG B; 1D1A A; 2RK2 A; 1F1B B; 4BI8 B; 1NYG A; 5FRM A; 3MP1 A; 4C92 G; 3VRZ A; 1ZHI A; 2QTV A; 4D6W A; 4M77 B; 3JCM e; 3CPF A; 5A2Q E; 5GAN f; 1PKS A; 2EQM A; 5LJ3 g; 2IIM A; 3CCR Q; 1KHI A; 2LX9 A; 1VQM Q; 2DJZ A; 1ACM B; 4JRK A; 2BZY A; 2D0N A; 1VQL Q; 2G6F X; 2AZV A; 4QVD A; 1YIJ T; 1K9M C; 5D6W A; 1SG5 A; 2A08 A; 2FB7 A; 2B86 A; 4C92 F; 2QQR A; 3BE3 A; 2DTO A; 5CK9 A; 1SKU B; 4RCB A; 1M90 R; 4KUL A; 3SD4 A; 2VUB A; 4F7U G; 4M75 D; 1O75 A; 4M75 E; 5GAM j; 1M8V A; 2ENM A; 4C5E A; 1X27 A; 1MV0 B; 2AHJ B; 5GAO p; 3QYH B; 4CC4 B; 1RAD B; 2K79 A; 2EKO A; 1UB4 A; 1J3T A; 2DO3 A; 3EFO B; 3EHR A; 2BZ8 A; 2LMJ A; 4F16 A; 3VV0 A; 5HKC A; 1BB9 A; 3RR6 A; 2O4X A; 3HKS A; 1GFD A; 2OAU A; 2F2X A; 1IHV A; 3CPW S; 4GY5 A; 5M9O A; 5CKE A; 2CP3 A; 2K5I A; 4F7U F; 2X4W A; 2EYY A; 3MP8 A; 1M3A A; 4FU6 A; 4ZN1 A; 4DEY A; 3CC2 Q; 1TTH B; 2R58 A; 4FYY B; 5GAM f; 3UT1 A; 1JB0 E; 2DPP B; 3SHW A; 2CP2 A; 2RN8 A; 1HXD A; 3RMS A; 3CCE T; 4QW2 A; 4MML A; 4C0Z A; 1G3S A; 2FPE A; 1Q86 U; 2HNI A; 1LJO A; 2KXC A; 1BK2 A; 1MGQ A; 2A36 A; 4EMK B; 5IXB A; 4J9C A; 3CBO A; 1MND A; 2AT1 B; 1Q82 U; 2VC8 A; 3UWN A; 1CKB A; 5GAO n; 3G71 T; 1WQ7 A; 4HVU A; 1WHM A; 2VB6 A; 1NEG A; 2RI5 A; 3FC3 A; 4PKC C; 3EGX A; 1XNI A; 5GAO r; 3PNW C; 1WIE A; 1YBY A; 2ZPF B; 2D9T A; 1LPL A; 1UGR B; 3TU4 K; 4CC2 A; 2DKG A; 2PZ1 A; 1Q81 C; 4M7D B; 4C92 A; 2DTH A; 2RQW A; 1G83 A; 1YJ9 T; 4PJO D; 2CZ0 B; 2JVV A; 4PJO E; 2FRW A; 5ECA A; 1R0C B; 1FYN A; 1PNJ A; 1U1T A; 2K57 A; 2C0O A; 2CSQ A; 1UJ0 A; 3X25 B; 2V8I A; 1Q95 G; 1VQN A; 3MEU A; 3L2W A; 3M55 A; 2OTJ T; 4XTU A; 1IO6 A; 2VVK A; 1YI2 Q; 1PSF A; 1QWE A; 3VUZ A; 3M0T A; 1M3B A; 3REA B; 1QMC A; 4IUR A; 1QVG S; 3CD6 T; 4J9F A; 1ZUK A; 1VUB A; 1QVF S; 2RK1 A; 2JMA A; 1JQQ A; 2LCS A; 4D8D A; 4F7U A; 3RDV A; 1T0H A; 2L3Q A; 2DE0 X; 1K73 R; 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