The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
5
|
sequence length |
73
|
structure length |
73
|
Chain Sequence |
GSSGSSGFCGRARVHTDFTPSPYDTDSLKLKKGDIIDIISKPPMGTWMGLLNNKVGTFKFIYVDVLSSGPSSG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution structure of the SH3 domain from human SAM and SH3 domain containing protein 1
rcsb |
| molecule keywords |
SAM and SH3 domain-containing protein 1
|
| molecule tags |
Cell adhesion
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
5
|
| structure length |
73
|
| sequence length |
73
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-02-09 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF07653 | SH3_2 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4OMP A; 1AZE A; 3QWX X; 3NHN A; 2FPF A; 1WXB A; 2J6O A; 1KFZ A; 1K0S A; 1QWE A; 2W10 A; 2XMF A; 3EHQ A; 2NUZ A; 2DVJ A; 2DL7 A; 3VS2 A; 1Y0M A; 1UJ0 A; 4AFS C; 1JQQ A; 2JXB A; 3EG1 A; 4CC3 A; 1HJD A; 1I07 A; 1T3S A; 2MIO A; 1VYU A; 2L2P A; 2AKK A; 1A0N B; 1PRM C; 2ED1 A; 2BZX A; 5IHN A; 2DM1 A; 1OV3 A; 1I0C A; 2YSQ A; 1T0H A; 2J6K A; 3REA B; 1LCK A; 1JXM A; 1WX6 A; 4DEX A; 3IQL A; 2DF6 A; 2LJ3 A; 2EQI A; 2W0Z A; 2F2W A; 3VS6 A; 1AEY A; 1GFD A; 3EGU A; 2EPD A; 2KT8 A; 2KXD A; 1YWO A; 4LNP A; 2EYX A; 2BTT A; 1WLP B; 2IIM A; 3PVQ A; 3TVT A; 1K4U S; 4WCI A; 2J6F A; 4J9G A; 1Y57 A; 2AZS A; 5ECA A; 1FMK A; 2CUD A; 2EW3 A; 2FG0 A; 5FWC A; 1KIK A; 2CH4 A; 3H0H A; 1BK2 A; 2KRS A; 1MUZ A; 1M3B A; 1AWW A; 3PVL A; 2MOX A; 2EYY A; 4AFQ C; 3ULR B; 2V1Q A; 1ABO A; 2DL4 A; 1OPK A; 2K7A A; 2KXC A; 1SPK A; 2K3B A; 3NMZ C; 2E5K A; 4OML A; 1WXU A; 4JZ3 A; 5I22 A; 1XOV A; 2LJ1 A; 4GLM A; 4A63 B; 3UA7 A; 2KBT A; 4J9H A; 2LQN A; 2PNI A; 2J7I A; 4CC7 A; 1YN8 A; 2GNC A; 4RTW A; 4LUE A; 1OPL A; 2K9G A; 2AZV A; 1Z9Z A; 1H3H A; 5IHI A; 2ECZ A; 1X27 A; 4DEY A; 1PRL C; 4FSS A; 4CC2 A; 2DRM A; 1X43 A; 2LNH B; 5HCK A; 4AFZ C; 3QWY A; 3EG0 A; 4CC4 B; 3M0U A; 4J9D A; 2OJ2 A; 1PKS A; 1RLQ C; 4JJD A; 2LP5 A; 4HVU A; 1VYT A; 1UEC A; 4LE9 A; 1AWO A; 1CKA A; 2DBM A; 1UHF A; 2CRE A; 1ZUY A; 4D8D A; 3UAT A; 1NLP C; 1K0X A; 2DMO A; 2D8H A; 1SSH A; 3ZL7 C; 2O88 A; 1FYN A; 4RTZ A; 1G83 A; 1AD5 A; 1V1C A; 1T3L A; 4RTT A; 3VS5 A; 1PKT A; 3SEM A; 5IHK A; 1SHF A; 1U3O A; 1ZUU A; 3RBB B; 3NPF A; 1BU1 A; 1X6B A; 1WA7 A; 2C0O A; 1GCP A; 1B3Q A; 2DA9 A; 2RQR A; 3FJ5 A; 2MCN A; 2JS2 A; 2I0N A; 1VYV A; 1VA7 A; 3O5Z A; 3REB B; 2A28 A; 1AZG B; 2JM9 A; 2QDL A; 2YUN A; 4IIO A; 3EG3 A; 1X6G A; 2SRC A; 1ZUK A; 1WFW A; 3PE0 A; 5GJV B; 1JEG A; 2OI3 A; 1QKW A; 1W70 A; 2LQW A; 2KE9 A; 2CT3 A; 1ZLM A; 4OMN A; 2JM8 A; 1K1Z A; 2A37 A; 3RNJ A; 1T0J A; 3M0Q A; 4AG1 C; 1WYX A; 3I5R A; 3VS3 A; 2OAW A; 4OMQ A; 1YNZ A; 1UHC A; 2EGC A; 2RF0 A; 2J06 A; 1NEG A; 3CQT A; 2B86 A; 1NYF A; 3GBQ A; 1X2K A; 1YCS B; 1QLY A; 1TUC A; 4J9C A; 4AFU C; 3VS1 A; 1AWX A; 3I35 A; 2D1X A; 4LUD A; 2LX7 A; 5IH2 A; 2YUQ A; 4E6R A; 1H92 A; 2KEA A; 2JS0 A; 2LZ6 B; 1K76 A; 1U5S A; 3I9Q A; 2EBP A; 1S1N A; 2ED0 A; 1SEM A; 2DYB A; 1JXO A; 2EKH A; 1RLP C; 1UTI A; 2CDT A; 4RTU A; 2F2X A; 1PNJ A; 2DX1 A; 1GFC A; 2GTO A; 2D0N A; 1CSK A; 1YWP A; 2DBK A; 1EFN A; 1N5Z A; 2BZ8 A; 2M0Y A; 2DL5 A; 3H41 A; 2GTJ A; 2D8J A; 4X1V A; 5GJW B; 4RTV A; 1MV3 A; 1ABQ A; 2RNA A; 1GCQ C; 3H0F A; 4AG2 C; 1QWF A; 2JT4 A; 4RUG A; 1ZSG A; 2ABL A; 3H0I A; 1Z9Q A; 4Y92 A; 1UE9 A; 2V1R A; 1UGV A; 2X3W D; 2HDA A; 3C0C A; 2FO0 A; 3EHR A; 1RUW A; 2C0I A; 1OEB A; 2EGE A; 5I11 A; 2K79 A; 2JW4 A; 2KNB B; 4RTY A; 3VS7 A; 2CUB A; 2YDL A; 2CSQ A; 1E6G A; 1BBZ A; 4ZNX A; 2FRW A; 4JJB A; 1JO8 A; 1HD3 A; 3M0T A; 4ESR A; 2A08 A; 4J9F A; 2VWF A; 4QT7 A; 4J9E A; 1AOJ A; 4LN2 A; 1CKB A; 1HSQ A; 1M8M A; 2FEI A; 2HCK A; 2O9V A; 2PTK A; 5IXF A; 2L3P A; 2SEM A; 2L3Q A; 2ENM A; 2HSP A; 2HBW A; 2DNU A; 2LCS A; 4OMM A; 3THK A; 3VS4 A; 1M3C A; 4HVW A; 4KRT A; 1M27 C; 2RQT A; 2DJQ A; 2BZY A; 2CT4 A; 2J05 A; 1MV0 B; 2EYW A; 4GBQ A; 1GRI A; 2LJ0 A; 1QKX A; 2O2O A; 3U23 A; 2RQV A; 2JMC A; 1NM7 A; 2KRM A; 5FW9 A; 1RI9 A; 1GL5 A; 3VRY A; 1UUE A; 1AVZ C; 2CH4 W; 3VS0 A; 2AKL A; 1GBR A; 2FPD A; 1B07 A; 2HEQ A; 3UF4 A; 3VRZ A; 4HXJ A; 1UJY A; 1ZBJ A; 4OMO A; 1I1J A; 1WIE A; 4RTX A; 2VKN A; 2G6F X; 2L3S A; 3I5S A; 1E7O A; 3LH5 A; 1AWJ A; 1G2B A; 2L0A A; 2CSI A; 1IO6 A; 1SHG A; 1U06 A; 2RQW A; 2X3X D; 2F2V A; 4R0K A; 2EYZ A; 1UFF A; 2DLP A; 2AK5 A; 2JTE A; 1M3A A; 4HCK A; 3R6N A; 1TG0 A; 2K6D A; 2RMO A; 1QCF A; 1K9A A; 1OOT A; 1WI7 A; 4F14 A; 2KT1 A; 4F17 A; 1E6H A; 2KYM A; 2O9S A; 1YP5 A; 3UA6 A; 2O31 A; 2DL8 A; 2KGT A; 3M0R A; 3TSZ A; 1NLO C; 2VVK A; 2A36 A; 2ROT A; 4K11 A; 4IIM A; 1GCQ A; 5L23 A; 1H8K A; 2LMJ A; 1M30 A; 4Z89 A; 2DL3 A; 2DIL A; 2KYB A; 3KFV A; 1ARK A; 4J9I A; 1NYG A; 1KSW A; 1SRM A; 3A98 A; 2DE0 X; 2EVR A; 1GBQ A; 1NEB A; 3M0S A; 4JPB W; 1X2Q A; 1BB9 A; 2PZ1 A; 4HVV A; 1TUD A; 4J9B A; 4JZ4 A; 5FWB A; 2KR3 A; 2FRY A; 1PHT A; 2ESW A; 1NG2 A; 2FPE A; 2M51 A; 3JV3 A; 2RPN A; 3SHW A; 1UDL A; 2RN8 A; 2JMA A; 2KRN A; 4Z88 A; 2H8H A; 2GQI A; 2C0T A; 1UG1 A; 2YT6 A; 3NGP A; 1WDX A; 2GBQ A; 2GGR A; 2KRO A; 4ORZ A; 1WXT A; 2K2M A; 1J3T A; 3EG2 A; 4EIK A; 4D8K A; 1W1F A; 1ZX6 A; 2P4R A; 1SRL A; 2NWM A; 3M0P A; 1PWT A; 2RQU A; 2EGA A; 2YUP A; 5IXB A; 4JJC A; 4F16 A; 2ROL A; 4M4Z A; 1JU5 C; 2DRK A; 2YUO A; 5EC7 A; 3TSW A; 1KJW A; 1W6X A; 4Z8A A; 1X69 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2RB6 A; 4OMP A; 2BIV A; 3NTI A; 3BY7 A; 1KQ1 A; 2FPF A; 1WXB A; 4E7J A; 1UB4 A; 4XTX A; 2J6O A; 1WHJ A; 4IUQ A; 1K0S A; 3HTR A; 1Q86 R; 2W10 A; 3EFR A; 1KQ2 A; 2E1H A; 3EH2 A; 4DOV A; 2DAQ A; 3CD6 A; 1JB0 E; 2F5K A; 1JQQ A; 3EG1 A; 4AFS C; 2RHX A; 3Q1J A; 4EMK A; 2A3L A; 1VYU A; 3M4G A; 4FM4 B; 2CP6 A; 1PRM C; 3JCM h; 3L2Q A; 1U1T A; 4Y28 E; 2YSQ A; 3DLL A; 1LCK A; 4XK8 E; 1G3W A; 1QVG S; 2L5Q A; 4DEX A; 3IQL A; 4LDY A; 2NYS A; 1YIJ A; 1BKB A; 2YRD A; 4BI8 B; 3CCU A; 1VQ7 T; 2MAM A; 4LNP A; 4KUI A; 1WLP B; 3TVT A; 1K4U S; 4J9G A; 1Y57 A; 1TUG B; 3JB9 G; 4ZN3 A; 1H64 1; 4LD9 K; 2CH4 A; 3MEU A; 1BK2 A; 1MUZ A; 2EQU A; 1N8R U; 3FB9 A; 1RI0 A; 3PVL A; 4AFQ C; 3OB9 A; 4BE0 A; 2EFI A; 4BE2 A; 2DTH A; 1YFN A; 2OTL A; 3WXM B; 4M7D D; 4OML A; 2XIC A; 3RUX A; 4FIB A; 5I22 A; 2QGG A; 1ZA1 B; 3FC3 A; 2LQN A; 2DO3 A; 3CEY A; 4ELZ C; 2J7I A; 2M0O A; 4CC7 A; 1VQM T; 1YN8 A; 5GAN e; 2R58 A; 4LUE A; 5GAN 6; 4IUU A; 1PC0 A; 2RO0 A; 1NJI R; 8AT1 B; 5IHI A; 4C0G A; 3J7A F; 3P8H A; 1N8R R; 1OI1 A; 3HRT A; 5HCK A; 4ZTF A; 3G71 Q; 1OX8 A; 3A8G B; 4J9D A; 4C8Q A; 1K9M U; 1UEC A; 1AWO A; 2DBM A; 4C5I A; 2CRE A; 1Q86 C; 3MP6 A; 4D8D A; 3CXC P; 4QQ6 A; 3RER A; 2QQR A; 1NLP C; 1Y07 A; 2DMO A; 2D8H A; 3CMA Q; 4R56 A; 1VQ7 A; 5GAN 4; 1FYN A; 3LGL A; 2YRC A; 1V1C A; 1T3L A; 3URG A; 2RJE A; 1YJN Q; 2LTO A; 1ZUU A; 3LWI A; 4M77 D; 1D09 B; 5LJ3 e; 4E2F B; 1X6B A; 3CCQ T; 1GCP A; 4M7D E; 3JCM W; 1B3Q A; 3L2W A; 2I0N A; 3JCM X; 3PNW C; 3REB B; 2JM9 A; 2QDL A; 1YI2 Q; 1O9S A; 2I2L A; 1N9R A; 1JEG A; 2OI3 A; 4JJN K; 3LLR A; 1QKW A; 1W70 A; 1C0M A; 3JCM d; 3WVD B; 1BCM A; 5HKC A; 3CCJ T; 3OS1 A; 4ZN1 A; 3RNJ A; 1T0J A; 2DEQ A; 3MJX A; 4AG1 C; 4EMH A; 1BYM A; 1VQM A; 4JRP A; 3V8J A; 2F5T X; 1ZSZ A; 3OYJ A; 2EGC A; 1NEG A; 2AIR B; 2EJ9 A; 4M75 F; 1YCS B; 3DLM A; 2LNV A; 4HKE A; 5GAM j; 1TUC A; 3OMC A; 1FMV A; 4AFU C; 3CCV T; 3M54 A; 1AHJ B; 4J5Y A; 2KQW A; 3VU3 C; 1R77 A; 2D1X A; 3OYG A; 1KG1 A; 4VUB A; 2YUQ A; 5FU6 B; 1H92 A; 2XDD A; 1NJI C; 2Z0W A; 2H3J A; 2JS0 A; 1U5S A; 3CCR T; 1LVK A; 3MO8 A; 2EBP A; 1VQK T; 4A4G A; 3EAE A; 1R0B G; 4F7U E; 4M77 E; 2WSE E; 2ZAE A; 2MF2 A; 1YHQ Q; 3M55 A; 4M77 C; 1SSF A; 4E7H A; 3BE3 A; 3CXC A; 2GTO A; 1I5O B; 2BZ8 A; 2DL5 A; 2GTJ A; 1RAH B; 3CCQ A; 2P0P A; 4DOW A; 3CC2 Q; 1PSE A; 2X4Y A; 4XQ3 A; 2QYZ A; 1YIT T; 2FZK B; 3H0I A; 2OTJ Q; 2YLB A; 4WF2 A; 1Z9Q A; 3JB9 J; 3M9Q A; 4ZTJ A; 1UGV A; 2FO0 A; 1VQO Q; 2CYZ B; 2HQH A; 3CPW P; 3CBP A; 1LNX A; 4QVZ A; 4M7A F; 1RAE B; 1QQJ A; 2JW4 A; 2OX7 A; 3CCJ A; 1VIE A; 2DER A; 3CD6 Q; 4QQD A; 2DIG A; 2XDP A; 3KUF A; 3L1A A; 1BI0 A; 1VQL T; 1JO8 A; 3EFO B; 1B34 A; 1KC8 R; 2KMT A; 4ESR A; 2VXE A; 3QBY A; 2X35 A; 1VQ6 A; 2VWF A; 4QT7 A; 4J9E A; 4NOY A; 1CKB A; 1M8M A; 5DLO A; 2HBP A; 3G4S T; 2WAC A; 3CCV A; 3ASK A; 4C92 D; 3CCU Q; 2ENM A; 1PD0 A; 2HSE B; 1QCN A; 3VUZ A; 3V8L A; 4OGE A; 3CCR A; 1M27 C; 2AHJ B; 4IUV A; 1VQK A; 3SFM A; 1IZ6 A; 1D0Y A; 4YTL A; 1UGQ B; 3CCM T; 1WQ7 A; 2DXB A; 2EYW A; 1X01 A; 2QQB A; 3CCL T; 3JB9 F; 2O2O A; 3HRS A; 2RQV A; 3FRN A; 2KRM A; 5GAN h; 3VRY A; 2OTL Q; 1UUE A; 1WJS A; 3VS0 A; 2AKL A; 1GBR A; 4L6V 5; 5CAI A; 3QZ5 B; 3V8K A; 3L2V A; 1YIT A; 2M16 A; 4GY5 A; 2QQS A; 1I1J A; 2L8D A; 2M1H A; 3I5S A; 4HCC A; 3LH5 A; 3RKY A; 3X25 B; 1AWJ A; 2L0A A; 1U8R A; 2RQW A; 3ME9 A; 2MI6 A; 2X3X D; 2F1L A; 1ZBX A; 1M1F A; 5GAO m; 1UFF A; 2DLP A; 2AK5 A; 3M53 A; 4OP0 A; 2XG8 D; 3MEW A; 4BB7 A; 2ZPB B; 2FHD A; 3G1J A; 3CCS T; 2RMO A; 4ME7 A; 4O6J A; 1VQL A; 1ZSZ B; 4XTZ A; 5D7U A; 4FL6 A; 3JRZ A; 4M77 A; 1E6H A; 2KYM A; 2E41 A; 2O9S A; 4C92 E; 4F17 A; 4JS4 A; 1ZHI A; 2FYK A; 5LJ3 h; 3FJP A; 4C92 C; 3M0R A; 2LX9 A; 3TSZ A; 3G4S A; 1BI3 A; 4RCC A; 3GPL A; 1VQ9 T; 2WSC E; 8ATC B; 3OY9 A; 1M30 A; 4J7I A; 3QYH B; 1VQ7 Q; 2HAX A; 1VQ8 T; 1KC8 C; 1NYG A; 5GAM h; 1W2B S; 3VJP A; 2DE0 X; 1IB8 A; 3CCM A; 4NS5 A; 2VV5 A; 4HVV A; 4KGX B; 1TUD A; 3C94 A; 3PTA A; 1OYX A; 2QDY B; 2ESW A; 1RAF B; 1V76 A; 2RPN A; 2QQ9 A; 4B9W A; 1LJO A; 2JMA A; 5FU7 B; 2KRN A; 4Z88 A; 1G3S A; 2GQI A; 2C0T A; 2EKO A; 4PJO D; 2GGR A; 4IKF A; 5CIU A; 4KH0 B; 3V7C A; 3OYM A; 1Y7X A; 1WHK A; 2NWM A; 4C5E A; 3NFC A; 1X6O A; 2YUP A; 1KD1 C; 4M78 G; 3LW5 E; 1EZZ B; 5LJ5 e; 1VQM Q; 1JU5 C; 3TSW A; 1KJW A; 4J9F A; 1X69 A; 1Y96 B; 4D6W A; 3QWX X; 6AT1 B; 4DBQ A; 3P8D A; 3CCS A; 1KFZ A; 3S3O A; 3TCJ A; 3OYN A; 3EHQ A; 3EGX B; 4DQ2 A; 4IUT A; 2DL7 A; 1UJ0 A; 4M78 C; 2JXB A; 1HJD A; 4CC3 A; 1I8F A; 1WQW A; 1T3S A; 1EX4 A; 3MHX A; 3OW2 P; 2ED1 A; 5GAN d; 5IHN A; 1OV3 A; 4ZGD B; 1I0C A; 1VQ9 A; 2J6K A; 4JDS A; 2COZ A; 1VQ8 A; 1IXD A; 2W0Z A; 4FYW B; 2K3Y A; 4OVA A; 1AEY A; 3EGU A; 1WHM A; 3QPH A; 3JCM f; 3FLG A; 2M9U A; 3CCQ Q; 4DBF A; 2RHY A; 2GF7 A; 4M75 D; 2IIM A; 1TOV A; 3E9F A; 4PJO E; 1RAC B; 4ZGE B; 4A4H A; 5J3B A; 4PJO C; 4II1 A; 1FMK A; 2CUD A; 2CKK A; 1QCO A; 2XID A; 5FWC A; 5CKF A; 3H0H A; 2HMA A; 4R55 A; 1M3B A; 3ZFJ A; 1AWW A; 2D0Q B; 3PFS A; 4A53 A; 4FYX B; 4C92 A; 3CCJ Q; 2EQM A; 2KXC A; 5LJ3 d; 2XK0 A; 5I21 A; 3NMZ C; 3QJ6 A; 1RAI B; 2XKO C; 3MP1 A; 2DZ9 A; 4C8Q G; 2LJ1 A; 2VGM A; 5I2M A; 1O75 A; 4A63 B; 2RH2 A; 1BI1 A; 4J9H A; 5GMK j; 2PNI A; 1VQ6 Q; 3EH1 A; 5GAM d; 2AT1 B; 2DET A; 5AYF A; 2CP2 A; 3FIF A; 2HL3 A; 3CCV Q; 2ECZ A; 5DLQ E; 4DEY A; 3L42 A; 5LL6 S; 4FSS A; 2F69 A; 2DRM A; 3UPU A; 1Q86 U; 2LNH B; 4EPC A; 3EG0 A; 1JJ2 P; 4M7A D; 3CCR Q; 1PKS A; 3G7Z A; 1VQK Q; 1IHV A; 2DXT A; 3BDU A; 2B8A A; 4LE9 A; 1M9S A; 4PFO A; 4RCB A; 2IPO B; 1ZUY A; 4M75 E; 5KE3 A; 3E2U A; 2EJG A; 1TS9 A; 3OYY A; 3CC7 T; 1IRX A; 2CS7 A; 1G8X A; 5KYX A; 1M2O A; 1SSH A; 1Q7Y R; 5KYU B; 2X9H A; 2QA4 T; 3GF5 A; 3VS5 A; 5IHK A; 1SHF A; 1U3O A; 4N4G A; 3RBB B; 3J81 E; 4LDW A; 2P4T A; 1QP3 A; 3FJ5 A; 5GAO r; 2CP0 A; 3O5Z A; 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