The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
6
|
sequence length |
78
|
structure length |
78
|
Chain Sequence |
GSSGSSGDPPWAPRSYLEKVVAIYDYTKDKEDELSFQEGAIIYVIKKNDDGWYEGVMNGVTGLFPGNYVESISGPSSG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution structure of the SH3 domain of Abl interactor 2 (Abelson interactor 2)
rcsb |
| molecule keywords |
Abl interactor 2
|
| molecule tags |
Signaling protein
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
6
|
| structure length |
78
|
| sequence length |
78
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-02-14 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF14604 | SH3_9 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1M3A A; 4AFQ C; 1WA7 A; 1UHC A; 1KIK A; 1WXT A; 3LH5 A; 4OMN A; 1PHT A; 2OI3 A; 2BZY A; 3UF4 A; 2W0Z A; 2DA9 A; 4HXJ A; 1K0S A; 2CT3 A; 2IIM A; 1OPK A; 1I0C A; 3VS6 A; 2O31 A; 4HVV A; 1SRL A; 1I1J A; 1YN8 A; 5IHK A; 2ED0 A; 2FG0 A; 2OAW A; 1NLO C; 2LX7 A; 1AVZ C; 2VWF A; 2EYW A; 4JJB A; 3NHN A; 1WYX A; 1AOJ A; 2EYX A; 1K4U S; 1SRM A; 4AFS C; 2AKK A; 1KSW A; 2DBM A; 2HBW A; 1WDX A; 2O9S A; 2SEM A; 1M30 A; 1ZSG A; 1WX6 A; 2RQW A; 1FMK A; 2ABL A; 4J9D A; 1NYG A; 1GCQ A; 4RTW A; 2KRO A; 2CUD A; 1E6H A; 1IO6 A; 2AZS A; 2EKH A; 4D8D A; 4J9H A; 1JQQ A; 1TG0 A; 4DEY A; 1AZG B; 1A0N B; 4JZ3 A; 2RF0 A; 2BZ8 A; 1ARK A; 1G83 A; 2HCK A; 4JJC A; 1OOT A; 4Z89 A; 3M0S A; 2FRW A; 2LQW A; 3PVQ A; 1UJ0 A; 1VA7 A; 2EGC A; 4CC3 A; 1GBR A; 1ZBJ A; 1KFZ A; 1WFW A; 1K1Z A; 2F2W A; 1BB9 A; 2CH4 W; 3UA7 A; 3VRY A; 3VS7 A; 1T3L A; 1Y0M A; 3ULR B; 4EIK A; 2CRE A; 4WCI A; 1JEG A; 2EGA A; 3EG1 A; 2G6F X; 1UFF A; 2F2X A; 3JV3 A; 1X43 A; 1UTI A; 2KT1 A; 1T3S A; 2ROL A; 4RTX A; 1ZX6 A; 1YNZ A; 1YWP A; 1M3C A; 1NEB A; 5IH2 A; 5ECA A; 1QLY A; 2YDL A; 1V1C A; 2C0O A; 2MCN A; 1JXM A; 4A63 B; 5IXB A; 1RUW A; 3VS5 A; 1OV3 A; 1QWF A; 2YUQ A; 3NGP A; 4AFZ C; 3H41 A; 3A98 A; 4M4Z A; 1QKW A; 2EGE A; 2ROT A; 2D0N A; 2KYB A; 3I9Q A; 2KRS A; 2GQI A; 1X2Q A; 3I5S A; 5HCK A; 1UEC A; 1H92 A; 4JPB W; 1PRL C; 5FWC A; 2EQI A; 1SEM A; 2FRY A; 4DEX A; 2PTK A; 1M3B A; 1WXB A; 2LJ1 A; 2RQV A; 1RLQ C; 3EG3 A; 2KRN A; 1E7O A; 4OMQ A; 2D8J A; 3VS4 A; 1MV0 B; 1GFD A; 1X2K A; 2L2P A; 2NUZ A; 3REB B; 4AG2 C; 2DE0 X; 2DX1 A; 1K9A A; 2GGR A; 3VS2 A; 2OJ2 A; 3NPF A; 2FPF A; 2DMO A; 1S1N A; 2C0I A; 3RNJ A; 1T0J A; 4RTT A; 1GBQ A; 2D8H A; 3IQL A; 5GJV B; 1K76 A; 2X3W D; 3TSW A; 4CC7 A; 3VS3 A; 1M27 C; 2RQR A; 2ENM A; 2EW3 A; 2YSQ A; 2DL3 A; 1SSH A; 4GLM A; 5IHI A; 5FWB A; 3EGU A; 4F14 A; 3EHQ A; 2NWM A; 3EHR A; 1U3O A; 2KT8 A; 1PWT A; 4D8K A; 2VKN A; 1AWJ A; 1BBZ A; 2FEI A; 2L0A A; 4RTV A; 1YWO A; 5IHN A; 2DNU A; 2DF6 A; 1J3T A; 1GCP A; 2CSI A; 3M0P A; 2E5K A; 2A28 A; 2A36 A; 4J9C A; 1RLP C; 3ZL7 C; 1BK2 A; 2F2V A; 4LUE A; 4GBQ A; 3SEM A; 2CSQ A; 5FW9 A; 2RNA A; 1QWE A; 2EVR A; 1MUZ A; 2SRC A; 4IIO A; 1WIE A; 4X1V A; 3VRZ A; 1PKT A; 4QT7 A; 2RN8 A; 1VYU A; 3PE0 A; 5GJW B; 2PNI A; 2RQU A; 2LMJ A; 4OMO A; 2LNH B; 1AWX A; 2AZV A; 2JMC A; 4RTY A; 1Y57 A; 2H8H A; 2DL8 A; 1TUC A; 4HCK A; 1HSQ A; 3H0H A; 1W70 A; 2RQT A; 4FSS A; 1UUE A; 3NMZ C; 2KRM A; 1UJY A; 2C0T A; 3M0U A; 1ZUY A; 1JXO A; 4CC2 A; 3SHW A; 1UE9 A; 4HVW A; 2J6O A; 4OML A; 1BU1 A; 2A37 A; 1PKS A; 3CQT A; 4HVU A; 2JM9 A; 2W10 A; 4Y92 A; 4LN2 A; 3PVL A; 3M0Q A; 1VYT A; 2DLP A; 2KNB B; 4Z88 A; 1GRI A; 1I07 A; 1UDL A; 2DL5 A; 1AWW A; 1GL5 A; 2GTJ A; 1B3Q A; 1PNJ A; 3H0F A; 4J9E A; 3VS1 A; 4OMP A; 1X69 A; 1U5S A; 1ABQ A; 4RUG A; 2FPE A; 2JW4 A; 3H0I A; 1YP5 A; 3QWY A; 3VS0 A; 5IXF A; 2J06 A; 2L3P A; 4ZNX A; 2LQN A; 1WLP B; 2X3X D; 2RPN A; 3REA B; 5I22 A; 4R0K A; 2D1X A; 1Z9Z A; 2GNC A; 1GFC A; 1UG1 A; 5EC7 A; 1EFN A; 1X6B A; 1SHG A; 2DL4 A; 1JO8 A; 2YUP A; 2V1R A; 2EPD A; 1QKX A; 2QDL A; 3GBQ A; 4JZ4 A; 2HEQ A; 3M0T A; 1AWO A; 2EYZ A; 2KXC A; 1CSK A; 2KBT A; 1QCF A; 2DL7 A; 2KYM A; 1NYF A; 1OEB A; 2L3S A; 2MOX A; 2M0Y A; 3EG0 A; 4AFU C; 2GTO A; 2K9G A; 2AKL A; 2GBQ A; 2KR3 A; 2MIO A; 3EG2 A; 2K3B A; 1WXU A; 2XMF A; 2JM8 A; 2A08 A; 1AD5 A; 1Z9Q A; 2B86 A; 1H3H A; 1AEY A; 1WI7 A; 2JXB A; 2DRM A; 2DVJ A; 2PZ1 A; 1HJD A; 2P4R A; 1B07 A; 2J7I A; 4J9G A; 2KGT A; 2EBP A; 1ZLM A; 2JMA A; 4LE9 A; 2KE9 A; 2HSP A; 2LCS A; 2CH4 A; 4J9B A; 3KFV A; 2YT6 A; 2DM1 A; 1M8M A; 1CKA A; 1H8K A; 1N5Z A; 1T0H A; 4LUD A; 1KJW A; 1NG2 A; 1XOV A; 2BZX A; 3UAT A; 3UA6 A; 1W1F A; 4KRT A; 2KEA A; 2VVK A; 1X27 A; 2DRK A; 2LZ6 B; 2K7A A; 3U23 A; 2I0N A; 2ECZ A; 2L3Q A; 4CC4 B; 4F17 A; 2CDT A; 1U06 A; 1ZUK A; 4LNP A; 3I35 A; 2DBK A; 4J9F A; 4IIM A; 2JT4 A; 1LCK A; 1E6G A; 1VYV A; 2AK5 A; 4E6R A; 4ESR A; 2DJQ A; 2K79 A; 2K6D A; 2DIL A; 4AG1 C; 2FO0 A; 5L23 A; 4F16 A; 1HD3 A; 1UGV A; 2V1Q A; 2LP5 A; 2J6K A; 2M51 A; 2K2M A; 3RBB B; 1NM7 A; 2RMO A; 4K11 A; 4OMM A; 2JS2 A; 3THK A; 5I11 A; 1AZE A; 2O9V A; 3TVT A; 1X6G A; 2JS0 A; 2YUO A; 4Z8A A; 2KXD A; 1GCQ C; 1FYN A; 2ESW A; 1W6X A; 1NEG A; 1ZUU A; 2J6F A; 1G2B A; 2ED1 A; 3C0C A; 2EYY A; 3TSZ A; 3R6N A; 1SPK A; 3M0R A; 2CT4 A; 3FJ5 A; 1YCS B; 2LJ0 A; 4J9I A; 3QWX X; 1OPL A; 1PRM C; 1K0X A; 3I5R A; 2O2O A; 1TUD A; 2FPD A; 3O5Z A; 1NLP C; 2JTE A; 1ABO A; 4RTZ A; 4ORZ A; 1CKB A; 4RTU A; 4JJD A; 2DYB A; 1SHF A; 1RI9 A; 2BTT A; 1UHF A; 1MV3 A; 2O88 A; 1JU5 C; 2HDA A; 2LJ3 A; 2CUB A; 2YUN A; 2J05 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2OTJ A; 2DVE A; 1WXT A; 1N9R A; 5J39 A; 3CCL A; 4M75 E; 1ZHI A; 1KQ1 A; 3QYG B; 2VYT A; 5FLX E; 2DPP B; 3CCE T; 4N0A A; 3ZFJ A; 3G6E A; 3VS6 A; 5LL6 S; 2CP3 A; 4M7D C; 5IHK A; 2XDP A; 1AHJ B; 2K5L A; 4TVR A; 1AVZ C; 4M77 G; 2VWF A; 1RAG B; 2FYK A; 1I8F A; 1QVF A; 4MML A; 1PD0 A; 1WNL A; 4M7A E; 1M9S A; 2M0O A; 1YHQ A; 3CD6 A; 1W2B S; 3F70 A; 4PJO E; 2D9T A; 2VUB A; 4XU0 A; 1ZSG A; 2HQE A; 3CME Q; 1ZQ1 A; 2JN0 A; 3ER0 A; 4RTW A; 1E6H A; 2QQA A; 3V8K A; 3CCJ A; 2RHZ A; 1D3B B; 1D1B A; 4D8D A; 1HK9 A; 4N4H A; 1BYM A; 3WVE B; 2EKO A; 2P0P A; 1RAI B; 1G83 A; 1NPR A; 3JB9 G; 3CC2 T; 1OZ2 A; 2LQW A; 4PK4 A; 2F5K A; 1D1C A; 4OGE A; 2DER A; 3MET A; 4KGZ B; 2CH4 W; 5GMK j; 3OW2 P; 4BI8 B; 3HPW A; 5GAN 6; 1IHW A; 1R0B G; 2RI5 A; 3VKI A; 1T3L A; 1Y0M A; 2C06 A; 5GAN 8; 1VIF A; 2EGA A; 3EG1 A; 2G6F X; 1VQM Q; 3JCM c; 2RI2 A; 2X4W A; 3LH0 A; 1YNZ A; 3BDL A; 1YWP A; 2XKO C; 1G3S A; 3JCM d; 1V1C A; 3VS5 A; 4B9X A; 5KYY A; 4DBQ A; 5AT1 B; 4X9C A; 1VQ8 A; 5A2Q E; 3OYK A; 5GAN j; 4ZN3 A; 4MDW A; 5FU6 C; 2JUF A; 2EGE A; 2EYQ A; 2PUK B; 2LT4 A; 1YI2 T; 5HKC A; 2ZAE A; 2KRS A; 1D3B A; 3MJX A; 5FU7 B; 5CAI A; 1QCN A; 2L89 A; 1PRL C; 5FWC A; 3QZ9 B; 1WQ7 A; 2EQI A; 5I2S A; 2OTL A; 2FRY A; 4ZTJ A; 1N8R R; 4DEX A; 2K2V A; 2RQV A; 1RLQ C; 3CCU A; 2KRN A; 1E7O A; 1KC8 C; 1VQ5 A; 4XU2 A; 4PKC C; 3OYA A; 4A54 A; 2VAS A; 5EG2 A; 2NUT B; 2MPX C; 4AG2 C; 5I21 A; 3OS5 A; 3VS2 A; 2E70 A; 2FPF A; 1S1N A; 2RB6 A; 1K76 A; 3TSW A; 4ELY C; 5IN1 A; 1M1F A; 1Q86 U; 1F1B B; 1M27 C; 5CKD A; 2E64 A; 2EW3 A; 1UGQ B; 3EFS A; 1SSH A; 2HL3 A; 3GOX A; 4F14 A; 3EHQ A; 1RI0 A; 4M7D F; 2QDY B; 4M78 A; 2E4H A; 1BCO A; 1BBZ A; 4RTV A; 4B9W A; 1I81 A; 2KSS A; 2LQ8 A; 2PVG B; 2A36 A; 4J9C A; 2HQH A; 2RH2 A; 1XTD A; 1BK2 A; 1MMN A; 4FSX A; 5DM7 R; 4GBQ A; 2JTM A; 3MEV A; 4N4I A; 2CSQ A; 2HMA A; 2EWN A; 1KQS A; 2JNG A; 1QWE A; 1SF9 A; 1PKT A; 4QT7 A; 3LWH A; 3PE0 A; 3CME A; 3FRN A; 2RQU A; 2NUT A; 2LMJ A; 4OMO A; 4J7I A; 2LNH B; 4ZGE B; 2KK4 A; 2EIF A; 1VQN T; 3R6O A; 4KUI A; 2MAM A; 5A0D A; 1N8R C; 3OYD A; 3M4Y A; 4FSS A; 1K8A U; 5GAN 7; 4XTU A; 1TH7 A; 2KRM A; 4M75 B; 2C0T A; 3FLG A; 1ZUY A; 4GLK A; 3JCM J; 3SHW A; 3X28 B; 4OML A; 3CCQ T; 5FU7 C; 4Y92 A; 3BDU A; 3A8L B; 3RDV A; 4LDX A; 3M0Q A; 1OUL A; 1VYT A; 3CC2 Q; 3J81 E; 4C5G A; 2CP0 A; 3JCM g; 1YJ9 Q; 4FYV B; 4FW1 A; 4A4H A; 1VQM A; 1RAB B; 2DO3 A; 2GTJ A; 1MMG A; 3H0F A; 1X69 A; 1U5S A; 2P84 A; 4C0Z A; 1ABQ A; 2JW4 A; 4DBR A; 3H0I A; 4PJO B; 2MI6 A; 2OX7 A; 2J06 A; 4DBH A; 3VUB A; 1WLP B; 1QVG A; 2RPN A; 3JSC A; 2F5T X; 5I22 A; 2D1X A; 1M4Z A; 2GNC A; 1MHN A; 2L8D A; 1EFN A; 3OBY A; 1QP2 A; 3CXC S; 2DL4 A; 4QQD A; 4KUD K; 3PTA A; 2V1R A; 2EPD A; 2JJ9 A; 3CCM Q; 5LJ5 j; 1QKX A; 2CGH A; 2RK2 A; 1SKU B; 2KXC A; 4C8Q D; 4E7I A; 1K9M U; 1YFN A; 2Y90 A; 2DL7 A; 4M75 A; 1NJI U; 1Q86 R; 1NYF A; 5GAO p; 1YI2 Q; 1DJ7 B; 2R57 A; 4MDX A; 2DET A; 2M0Y A; 4AFU C; 1S72 T; 2E10 A; 3PT9 A; 3JAM E; 1VQK T; 2LC4 A; 2OAU A; 1WXU A; 2XMF A; 1VQ4 Q; 5GAM j; 3JB9 H; 3I56 Q; 3FC3 A; 2E6N A; 2DRM A; 4BUG A; 1HJD A; 4PJJ A; 2LCC A; 2PUO B; 3HTR A; 1LPL A; 1YIJ Q; 4M7A A; 2J7I A; 2AT1 B; 4M77 A; 3CCR Q; 2JMA A; 4XK8 E; 1QVF P; 2R58 A; 4LE9 A; 2JOY A; 3V8L A; 1TU0 B; 4J9B A; 4HT9 A; 2COY A; 4A4K A; 1OZ3 A; 2YT6 A; 3HL8 A; 1H8K A; 4A4F A; 4LUD A; 2I2L A; 1AT1 B; 1Y7X A; 2KEA A; 2L5Q A; 3CBM A; 4LDY A; 4BDY A; 4KBM B; 2QXF A; 2Y4Y A; 2DEQ A; 3URG A; 2I0N A; 2L3Q A; 1OU8 A; 2CDT A; 5D6Y A; 4J9F A; 1K8A R; 4RKU E; 1LCK A; 1VYV A; 4ESR A; 3G71 Q; 5IT9 E; 2K79 A; 2DIL A; 4JUV A; 4LD6 A; 4QW2 A; 4NL2 A; 4Q5W A; 4C92 B; 4PJO C; 1HD3 A; 1UGV A; 2V1Q A; 3BY7 A; 5HK0 A; 2J6K A; 3OMG A; 3QDR B; 2XG8 D; 1M8V A; 4WTO B; 2RMO A; 1AZE A; 2JS2 A; 4M78 F; 1WGS A; 1PD1 A; 1YCY A; 4QQG A; 1Q86 C; 4IKF A; 1X6G A; 2JS0 A; 3DB4 A; 3GLX A; 2YHT A; 1GCQ C; 2ESW A; 3MEW A; 1OU9 A; 5HK3 A; 3N5B B; 4EMK A; 2G3R A; 3CC2 A; 3WVD B; 1G8X A; 1PRM C; 1NBE B; 1YJ9 A; 1K0X A; 2PU9 B; 2CP2 A; 3HRT A; 1TUD A; 1QW1 A; 3LW5 E; 4VUB A; 3LYI A; 4ORZ A; 3E9G A; 1XJW B; 4XU1 A; 1VQ7 T; 4JJN K; 4FW2 A; 1JB0 E; 2XDB A; 1K9M R; 4OB3 B; 3OYJ A; 1WJR A; 2JTF A; 1JU5 C; 3PFS A; 2LJ3 A; 2YRD A; 2M1H A; 1I5L A; 1NJI R; 2E65 A; 1Q7Y U; 4EDU A; 3CPW S; 4OMN A; 3JB9 D; 4HXJ A; 1K0S A; 2CT3 A; 2IIM A; 2DTH A; 1YIT Q; 2H3E B; 3CCM A; 4XTV A; 4M78 G; 3FB9 A; 1Y96 A; 3JB9 I; 1VUB A; 3GNF B; 4GY5 A; 3JCM b; 1K8A C; 2FG0 A; 2OAW A; 3BW1 A; 2EYW A; 4JJB A; 1YI2 A; 3SD4 A; 1AOJ A; 3H6Z A; 3MO8 A; 1PCX A; 2EYX A; 4BI4 A; 2DKG A; 1EZZ B; 4JS5 A; 2V8J A; 4AFS C; 2AKK A; 2DBM A; 1WDX A; 3OY9 A; 2HKN A; 1PSF A; 1VQ4 A; 1RAA B; 1YJW T; 2SEM A; 3JCM Q; 1M30 A; 3I56 A; 2RQW A; 1KC8 U; 4J9D A; 1RL2 A; 5LJ3 d; 1PM3 A; 1S72 Q; 1OX8 A; 1YIJ A; 4X9D A; 2MMP A; 2QQ9 A; 3CCR A; 1LVK A; 4C92 C; 2EKH A; 1VQL T; 1JQQ A; 5A0L A; 1ARK A; 2BZ8 A; 5CQX A; 2QTX A; 1KQS P; 1TS9 A; 1ZSZ B; 3QZ5 B; 1UJ0 A; 3MP6 A; 4M75 F; 1WFW A; 3CC7 Q; 2BE9 B; 3S6W A; 3HP9 A; 1QVG S; 3VS7 A; 2O4X B; 1NE8 A; 4EIK A; 4C8Q E; 2CRE A; 2EQK A; 4WCI A; 1FWZ A; 2QQB A; 4A4E A; 3PMI A; 4PJN A; 3MP1 A; 1IGU A; 2F2X A; 3JV3 A; 1NJI C; 1UTI A; 1HYO A; 4F04 B; 1ZX6 A; 2DTI A; 3JRZ A; 4M7A F; 1QCO A; 3G71 A; 4EMH A; 5IH2 A; 4JRQ A; 1FMW A; 1KG1 A; 1H3Z A; 2C0O A; 4A63 B; 4PJO F; 1QWF A; 2EQU A; 3NGP A; 4AFZ C; 4M7D A; 3H41 A; 3CMA Q; 5GAO l; 2COZ A; 2ROT A; 5GAO q; 2KYB A; 2XIC A; 1WHK A; 3A8H B; 4EMG A; 1X2Q A; 5HCK A; 5KYW B; 4BD3 A; 1UEC A; 2KY9 A; 3I55 T; 2XU8 A; 1D09 B; 2FZK B; 3HRS A; 3EFR A; 4M75 G; 1M3B A; 2LJ1 A; 1OYX A; 5FU6 B; 2D8J A; 3M56 A; 1Y07 A; 2ZPB B; 3V8J A; 1X2K A; 2L2P A; 3LGL A; 4KH1 B; 4OVA A; 1MND A; 3ASK A; 5GAN d; 3JCM f; 2X4X A; 3X24 B; 1MMD A; 1WQW A; 3NPF A; 2QK0 A; 2DZ9 A; 1T0J A; 2M9U A; 3OW2 S; 2D8H A; 5GJV B; 2X3W D; 4M7A G; 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