The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
6
|
sequence length |
70
|
structure length |
70
|
Chain Sequence |
GSSGSSGLEQYVVVSNYKKQENSELSLQAGEVVDVIEKNESGWWFVSTSEEQGWVPATYLEAQNSGPSSG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution structure of the first SH3 domain from human KIAA0418 protein
rcsb |
| molecule keywords |
SH3 and PX domain-containing protein 2A
|
| molecule tags |
Signaling protein
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
6
|
| structure length |
70
|
| sequence length |
70
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-02-28 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1MUZ A; 1OPK A; 2FG0 A; 2JS0 A; 1UUE A; 2KYB A; 2PNI A; 4AG1 C; 3EHR A; 4JJB A; 4RTU A; 2KT8 A; 1G83 A; 1QLY A; 2AZS A; 1UE9 A; 3H41 A; 2KRN A; 1RLQ C; 2JW4 A; 2YUP A; 2GTO A; 2OI3 A; 1SSH A; 2W10 A; 2VVK A; 2V1R A; 1AVZ C; 2DJQ A; 1VA7 A; 3H0H A; 3NHN A; 2RMO A; 1VYU A; 1YN8 A; 2ENM A; 2YUO A; 4J9D A; 2CUB A; 2DX1 A; 2GTJ A; 4D8D A; 3VS6 A; 2O31 A; 1H92 A; 2EYZ A; 1QKX A; 1WLP B; 3H0F A; 1AZG B; 3IQL A; 4KRT A; 4JZ4 A; 2CH4 W; 1WFW A; 2I0N A; 1NLP C; 2C0T A; 1K76 A; 1UJY A; 4J9E A; 1S1N A; 5I11 A; 1UHF A; 2EYW A; 1ZSG A; 1RUW A; 3M0S A; 4RTV A; 1T3S A; 2ABL A; 2E5K A; 3SEM A; 3THK A; 1K9A A; 1K1Z A; 4IIM A; 2LNH B; 1GCP A; 1U5S A; 3EG0 A; 3TSZ A; 3VS2 A; 2KRS A; 2V1Q A; 1RI9 A; 2M51 A; 2HEQ A; 3KFV A; 4HVU A; 1UG1 A; 2FPD A; 1AEY A; 2JS2 A; 1ZUY A; 1M3A A; 2RN8 A; 1ABQ A; 2IIM A; 2YSQ A; 2AZV A; 5IHN A; 3VS3 A; 1E7O A; 1KSW A; 1MV3 A; 1UDL A; 1QKW A; 1QWF A; 2KGT A; 1HD3 A; 2JXB A; 2KR3 A; 1NG2 A; 2L3P A; 1X2K A; 1YWO A; 2J6F A; 1NEG A; 2P4R A; 1WXT A; 4J9B A; 2F2V A; 1H3H A; 2C0I A; 1HSQ A; 1I07 A; 4J9C A; 1WYX A; 4DEY A; 5IXF A; 4K11 A; 3EHQ A; 1BK2 A; 2FEI A; 1BU1 A; 1FYN A; 3SHW A; 1PKS A; 4CC3 A; 3NMZ C; 1K0S A; 1TUD A; 2A08 A; 4RTW A; 4RUG A; 2YUQ A; 4CC7 A; 1SHG A; 1SRM A; 3R6N A; 1GCQ A; 2GNC A; 2O9V A; 1WXB A; 4CC2 A; 2BZX A; 4RTY A; 2RF0 A; 2EYX A; 3VRY A; 4AFU C; 1A0N B; 2BTT A; 2KRO A; 1JU5 C; 2J05 A; 2LZ6 B; 1X43 A; 1YCS B; 2PZ1 A; 1M3C A; 2DMO A; 2ED1 A; 4ZNX A; 2L3Q A; 4WCI A; 2OJ2 A; 2YDL A; 2LJ0 A; 2DL4 A; 1AD5 A; 4OMQ A; 1M27 C; 2C0O A; 5L23 A; 1VYV A; 2CSQ A; 1YWP A; 3QWY A; 5HCK A; 3EGU A; 3RNJ A; 1RLP C; 1ZLM A; 2KEA A; 1WXU A; 2EQI A; 2SEM A; 3VRZ A; 1SEM A; 1TG0 A; 2RQR A; 2A36 A; 1ZX6 A; 2ED0 A; 1X27 A; 2JTE A; 2RQT A; 1SHF A; 1Y57 A; 1AWX A; 4LUE A; 2OAW A; 2KBT A; 4CC4 B; 4RTT A; 2DE0 X; 2DF6 A; 1OOT A; 1WDX A; 1BBZ A; 4E6R A; 2X3X D; 3VS5 A; 2B86 A; 3TSW A; 4F14 A; 2LMJ A; 1KFZ A; 1NLO C; 2HCK A; 4Z8A A; 4D8K A; 1Y0M A; 4RTZ A; 2K79 A; 1SPK A; 1PWT A; 3I35 A; 4Y92 A; 1VYT A; 1JXM A; 2ROT A; 1U06 A; 2EGC A; 1KIK A; 1W6X A; 4AFQ C; 3EG3 A; 2RNA A; 2RQV A; 2CUD A; 2KT1 A; 2DRK A; 2K9G A; 1U3O A; 2JT4 A; 4AFZ C; 2LCS A; 1ZUU A; 2LQW A; 3JV3 A; 1ZUK A; 1T0J A; 2DYB A; 1HJD A; 3C0C A; 3H0I A; 2M0Y A; 4R0K A; 1N5Z A; 2J06 A; 4LN2 A; 1QWE A; 2D1X A; 3REB B; 4F17 A; 2RQU A; 1WA7 A; 3UF4 A; 2CRE A; 2G6F X; 5ECA A; 2QDL A; 2EW3 A; 2X3W D; 1ABO A; 2EKH A; 2HBW A; 2O9S A; 2F2W A; 2KXD A; 4HVV A; 2GQI A; 2CDT A; 2NWM A; 1TUC A; 2JMC A; 2AK5 A; 3QWX X; 2LJ1 A; 1ZBJ A; 2EGA A; 5IXB A; 1MV0 B; 4OML A; 5FWB A; 2DA9 A; 5IHK A; 1UFF A; 2MIO A; 3O5Z A; 2L0A A; 4RTX A; 2DL8 A; 3EG2 A; 2DLP A; 2EPD A; 3VS1 A; 2NUZ A; 4FSS A; 2EGE A; 2HDA A; 1M30 A; 1EFN A; 1AWO A; 4J9F A; 4GBQ A; 4A63 B; 1WIE A; 2BZ8 A; 5IHI A; 1K0X A; 1UJ0 A; 4HXJ A; 3M0Q A; 1AWJ A; 1YNZ A; 2DIL A; 2FO0 A; 2K2M A; 2FRY A; 2JM8 A; 4JPB W; 3LH5 A; 1PRM C; 1GFC A; 2O88 A; 3M0P A; 3M0R A; 1GBQ A; 3UA7 A; 1PNJ A; 1AWW A; 4Z89 A; 4IIO A; 2RQW A; 1GFD A; 1NEB A; 1I1J A; 2DNU A; 3I9Q A; 1B07 A; 4J9I A; 4JZ3 A; 5I22 A; 4EIK A; 4LE9 A; 1M8M A; 2CT3 A; 3FJ5 A; 2D0N A; 1OPL A; 1I0C A; 1Z9Z A; 1J3T A; 2A37 A; 2RPN A; 1GBR A; 1T3L A; 2ESW A; 4GLM A; 2D8H A; 1X2Q A; 1KJW A; 1W1F A; 4JJC A; 1WX6 A; 3EG1 A; 2MCN A; 5FWC A; 1FMK A; 1T0H A; 1CSK A; 2EVR A; 4J9H A; 1V1C A; 1JO8 A; 5GJW B; 3NPF A; 1Z9Q A; 1YP5 A; 2CT4 A; 2VWF A; 1ARK A; 2GGR A; 3M0T A; 4LUD A; 1OEB A; 4Z88 A; 1AOJ A; 1UHC A; 2LQN A; 4AFS C; 2DVJ A; 5FW9 A; 1GCQ C; 2VKN A; 2MOX A; 3M0U A; 1OV3 A; 2DRM A; 4HVW A; 4OMN A; 1JQQ A; 4JJD A; 3UAT A; 2FPF A; 3A98 A; 2GBQ A; 2YUN A; 5GJV B; 2JM9 A; 2JMA A; 2PTK A; 3REA B; 1QCF A; 4QT7 A; 3RBB B; 4OMO A; 2EYY A; 2CH4 A; 2DM1 A; 1SRL A; 2YT6 A; 2L3S A; 4X1V A; 2J6O A; 3CQT A; 3PE0 A; 1X69 A; 1LCK A; 2LJ3 A; 2L2P A; 4ORZ A; 1E6G A; 1UEC A; 1B3Q A; 3TVT A; 2J7I A; 1X6B A; 1UGV A; 5EC7 A; 2F2X A; 1UTI A; 2O2O A; 2DBM A; 2FPE A; 2CSI A; 3GBQ A; 1JEG A; 4OMP A; 1PHT A; 1CKA A; 3ZL7 C; 3VS0 A; 2DL5 A; 4OMM A; 1NM7 A; 3VS7 A; 2KXC A; 1G2B A; 2BZY A; 2AKL A; 2SRC A; 3NGP A; 1BB9 A; 3UA6 A; 4F16 A; 2EBP A; 1H8K A; 2K3B A; 2LP5 A; 2KNB B; 2A28 A; 3I5S A; 2AKK A; 2K6D A; 1X6G A; 1PKT A; 2W0Z A; 4DEX A; 2KYM A; 1GL5 A; 2D8J A; 2ROL A; 4HCK A; 1XOV A; 4AG2 C; 1IO6 A; 2H8H A; 2KRM A; 3PVQ A; 1GRI A; 3ULR B; 1M3B A; 3U23 A; 1NYG A; 3I5R A; 4M4Z A; 2ECZ A; 1W70 A; 1PRL C; 4ESR A; 2DBK A; 2HSP A; 5IH2 A; 2LX7 A; 1NYF A; 3PVL A; 2XMF A; 4J9G A; 1WI7 A; 1AZE A; 2K7A A; 2J6K A; 1CKB A; 2KE9 A; 4LNP A; 1JXO A; 1K4U S; 2FRW A; 1E6H A; 2DL7 A; 3VS4 A; 2DL3 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3LGL A; 1M8V A; 3CMA Q; 3EHR A; 4BE2 A; 1QLY A; 2AZS A; 1UE9 A; 2GCX A; 5KYN A; 4QQD A; 4HCZ A; 1YIT T; 3QJ6 A; 1W2B S; 2KRN A; 1JJ2 A; 2JW4 A; 4BI4 A; 3G4S A; 2YUP A; 4M7D C; 4M77 B; 3JCM e; 2PUK B; 1PG5 B; 2X4Y A; 1SSH A; 4XK8 E; 5M9O A; 1VQL A; 5L8R E; 1OYX A; 2V1R A; 1AVZ C; 2DIQ A; 3L2Q A; 1SSF A; 2YUO A; 4J9D A; 3A8H B; 4XU1 A; 3QDF A; 5KYX B; 1W2B P; 2GFU A; 2GTJ A; 2O31 A; 4FYY B; 1WLP B; 2DVE A; 2E3H A; 4JZ4 A; 2CH4 W; 1VQ8 T; 1KHC A; 2I0N A; 1OZ2 A; 4XTW A; 3VYG A; 1K8A R; 4J5Y A; 4QQG A; 1UJY A; 5LJ5 d; 4B6M A; 5I11 A; 3OYG A; 3G6E T; 3M0S A; 4RTV A; 1T3S A; 2ABL A; 3SB2 A; 2RB6 A; 3QKJ A; 4M75 F; 1VQP A; 3LH0 A; 4BE1 A; 3M56 A; 2CYZ B; 4M78 G; 4M77 G; 1FMV A; 2BE9 B; 4L6V 5; 4BI8 B; 4KH0 B; 3A8G B; 3CCL T; 2ZGW A; 2DZC A; 2YSQ A; 3CPW A; 2CP5 A; 1N9R A; 1M2O A; 2HL3 A; 3VS3 A; 4ATO A; 3G71 A; 1MV3 A; 5GAN 8; 1WJS A; 5DLQ E; 1NG2 A; 2B8A A; 1X2K A; 2V8K A; 2QQS A; 3BE3 A; 1RI0 A; 1HK9 A; 5IXF A; 1RAF B; 3JB9 I; 1B7T A; 1FX7 A; 3SHW A; 4CC3 A; 3NMZ C; 2E4H A; 2R5M A; 1M90 C; 4FT2 A; 1MNE A; 4ANJ A; 3CCE Q; 4RUG A; 1X01 A; 1SRM A; 2ZPF B; 8AT1 B; 1LPL A; 1GCQ A; 5KYU A; 2GNC A; 4QVC A; 2O9V A; 4TVR A; 4M7A C; 3JCM f; 2EYX A; 1A0N B; 2BTT A; 2KRO A; 2RHZ A; 1K9M R; 1X43 A; 1VQN T; 1YCS B; 3QSU A; 2ED1 A; 2QA4 T; 4ZNX A; 4WCI A; 4M7D B; 4C5H A; 3M54 A; 2HKQ B; 1QCN A; 5J3B A; 5HCK A; 3RNJ A; 1RLP C; 1ZLM A; 2KEA A; 1KQS P; 2EQI A; 4N4H A; 3VRZ A; 4OP0 A; 1MGQ A; 1QMC A; 3NTH A; 1YIJ A; 1VQM A; 1TG0 A; 4X34 A; 4IKF A; 1X27 A; 1R0B G; 2JTE A; 2KY9 A; 1JB0 E; 2OAW A; 3EG9 B; 5HK0 A; 4JLI A; 4RTT A; 2DE0 X; 2DF6 A; 1WDX A; 4FT4 A; 1BBZ A; 1KC8 C; 4PJO E; 2E64 A; 2JTF A; 1IRE B; 2HQH A; 2X9H A; 3ER0 A; 4XU2 A; 1AHJ B; 1VQ9 Q; 1FMW A; 5GMK m; 4BD3 A; 3GNG A; 3C95 A; 2QG9 B; 4RTZ A; 2K79 A; 3OYI A; 2O4X A; 2XKO C; 2EQU A; 5LJ5 e; 1NE8 A; 3I35 A; 4Y92 A; 1XTD A; 4M7D G; 4C92 B; 4QKU A; 3CMA A; 1PD1 A; 4R55 A; 2DD5 A; 2HSE B; 4IUU A; 2GFA A; 4C8Q E; 3EG3 A; 4CI0 C; 2ATC B; 2KT1 A; 2E5Q A; 1VQ7 Q; 2QEX T; 5LJ3 d; 2M16 A; 1NZ9 A; 3LW5 E; 4PJO A; 3JV3 A; 1ZUK A; 1VQ5 T; 5GAM d; 4XU3 A; 3KXT A; 1NBE B; 4FYW B; 5GMK l; 4C0Z A; 1JRI A; 4LXC A; 3H0I A; 3P8D A; 2M0Y A; 1D1B A; 2D1X A; 1PCX A; 2R5A A; 3NTK A; 2EW3 A; 2EKH A; 2XIC A; 2KXD A; 4HVV A; 3OYD A; 1TUC A; 2QGF B; 1YIT Q; 1ZBJ A; 1N9S A; 4C8Q A; 1G3W A; 2KMT A; 2L0A A; 3CCV A; 2DL8 A; 3JB9 H; 2NUZ A; 1Q82 C; 5GAN j; 3OB9 A; 1Y71 A; 4JRI A; 5GAN 5; 4BB7 A; 1YJN T; 2EYQ A; 3JAM E; 2G3R A; 5DLO A; 1ZA1 B; 2DIL A; 2F1L A; 4JPB W; 4PK4 A; 1VQ8 Q; 2CP0 A; 3OYY A; 2RHI A; 4DBH A; 1XQH A; 3PIO A; 4DBR A; 2RD1 A; 4FL6 A; 3G6E Q; 4HCB A; 1QVP A; 1AWW A; 2RQW A; 1NEB A; 1I1J A; 4J9I A; 1OI1 A; 1VQ4 T; 3INZ A; 1YI2 T; 4PJJ A; 1I0C A; 4E47 A; 4EMH A; 5HKC A; 4A54 A; 4BI3 A; 2A37 A; 2V8J A; 3JB9 G; 1N8R C; 2MAM A; 2MK5 A; 4RG8 A; 1TS9 A; 3EH2 A; 1QVF A; 2NUP B; 9ATC B; 3CCL Q; 2QQA A; 5LJ5 f; 3MEV A; 4M7A G; 1RAA B; 2MCN A; 3CD6 T; 3CCE A; 3MP8 A; 1JO8 A; 4IUP A; 1IRX A; 1O9S A; 2E1H A; 3NPF A; 4BDZ A; 2EIF A; 2GGR A; 2RHX A; 3EAE A; 3M0T A; 4J8O A; 1OEB A; 4OGC A; 1R8O B; 4AFS C; 1GCQ C; 1JBM A; 4ELY C; 2KVQ G; 2XD0 A; 3M59 A; 3AT1 B; 3N5B B; 1WZO A; 2JVV A; 3CBM A; 3A98 A; 2YRD A; 2M1H A; 2EQM A; 2QQR A; 3CEY A; 5DY9 A; 4C8Q F; 1I5O B; 2JMA A; 3DKM A; 1TH7 A; 4L59 A; 3REA B; 2OTJ T; 4F7U B; 3RBB B; 4QQ6 A; 2YT6 A; 4X1V A; 3LWI A; 4C0D B; 1BIB A; 3A8M B; 3LGF A; 2RM4 A; 4IUQ A; 1M1K R; 1X69 A; 1LCK A; 2EQK A; 3A1P A; 1OX9 A; 2L2P A; 5GAN 7; 4ORZ A; 5LJ3 e; 3VKI A; 3HP9 A; 1X6B A; 1VQN Q; 2F2X A; 5GAM e; 3PT9 A; 2CGH A; 2JJ9 A; 2O2O A; 2QA4 Q; 2FPE A; 4M77 F; 2RI3 A; 1CKA A; 1QW1 A; 1MHN A; 1VQ9 A; 2DL5 A; 2JZ2 A; 1Q7Y R; 3OW2 S; 3QJY A; 1RL2 A; 3FB9 A; 1G2B A; 2BZY A; 4XTY A; 3CCS T; 2AKL A; 2SRC A; 4C5E A; 2EQJ A; 4LDY A; 4F16 A; 1H8K A; 1OU8 A; 5FRO A; 2YHT A; 5IN1 A; 2QXF A; 1NJI R; 3DB4 A; 2MF2 A; 4FCY A; 1WHJ A; 2RJC A; 1PKT A; 2BE7 D; 1UB4 A; 2KYM A; 4F7U G; 2D8J A; 2ROL A; 1XOV A; 5J26 A; 4ZN3 A; 5CVI A; 2KRM A; 3LX7 A; 3U23 A; 1PC0 A; 3HFO A; 4JRP A; 1DJ7 B; 1PRL C; 5IH2 A; 2X51 A; 4JJN K; 1HXD A; 4KUL A; 2QGG A; 3DLL A; 2K7A A; 1H3Z A; 5CR2 A; 1JXO A; 4EDU A; 3J81 E; 1ZSZ A; 4ZTF A; 3EG9 A; 3I55 Q; 3CC2 A; 1M4Z A; 1UUE A; 2JS0 A; 1YIT A; 3E9G A; 1AT1 B; 3H41 A; 4X9C A; 3PTA A; 3JCM P; 3MO8 A; 3QXE B; 1D1A A; 1M1F A; 3CCU A; 2OI3 A; 2COW A; 1VQ5 Q; 3I56 T; 2W10 A; 2PVD B; 3QII A; 2VVK A; 4KGX B; 2A3L A; 1X6O A; 3H0H A; 2Y4Y A; 2RMO A; 4NL2 A; 2CS7 A; 4C92 A; 1VYU A; 2ENM A; 4OB0 B; 2CUB A; 4JS5 A; 3H6Z A; 5I2M A; 1D0Y A; 4JDS A; 2DKG A; 2RA2 A; 1OX8 A; 2ZPE B; 3CXC S; 1AZG B; 1M90 U; 5GAO l; 5LJ3 f; 2C0T A; 2VGM A; 3JCM c; 4J9E A; 5GAM f; 4BAC A; 2E5K A; 4IIM A; 3OYH A; 2LNH B; 2RO0 A; 1QVG S; 1U5S A; 2LDM A; 3TQ7 P; 3EG0 A; 2KRS A; 2VUB A; 4XQ3 A; 4M75 E; 1YJN Q; 2HEQ A; 3KFV A; 2DXC A; 5EG2 A; 4NL3 A; 4M7D F; 2WAC A; 3MJX A; 1M3A A; 3NTI A; 2QYZ A; 3MEW A; 3MET A; 5FU7 C; 2D9T A; 2P0Q A; 1VQ4 Q; 1HD3 A; 4A4G A; 2JXB A; 2KR3 A; 3FLG A; 1YI2 Q; 1WHH A; 4LD9 K; 2L3P A; 4E7Z A; 2J6F A; 2P4R A; 1WXT A; 4J9B A; 2F2V A; 1HYO A; 3SDZ A; 2C0I A; 1H3H A; 4M75 A; 3CCR T; 1N6A A; 1KC8 U; 3M55 A; 4J9C A; 3FJP A; 2AIR B; 2FEI A; 2F5T X; 1BU1 A; 3CD6 Q; 2XU8 A; 1Q81 C; 1PKS A; 5GAO n; 4VUB A; 1K0S A; 3NFC A; 3PIP A; 3JRZ A; 1RAH B; 1BKB A; 2QK0 A; 4N0A A; 2PVG B; 4C92 F; 3WVD B; 2VGN A; 1VUB A; 1FWZ A; 1ZHI A; 1VQN A; 2RF0 A; 4KGZ B; 4E7H A; 2L89 A; 2NUP A; 4AFU C; 3OQ5 A; 1B34 A; 1JU5 C; 2RH2 A; 2XDD A; 2FHD A; 1UGR B; 1YJ9 T; 3DLM A; 2MPX C; 3DB3 A; 2OTJ Q; 4OMQ A; 2C0O A; 5L23 A; 2A7Y A; 2M0O A; 4M78 B; 3EGU A; 1WXU A; 2SEM A; 2ZZD A; 4PJO D; 2K3X A; 1VQK Q; 3J7A F; 2BIV A; 1RAI B; 1ZX6 A; 4N4G A; 2K5I A; 5C6S A; 1Y57 A; 2DER A; 4V2S A; 3FC3 A; 2X4J A; 1EX4 A; 2B86 A; 1Q82 U; 3TSW A; 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