The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
5
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sequence length |
75
|
structure length |
75
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Chain Sequence |
GSSGSSGKIMIAALDYDPGDGQMGGQGKGRLALRAGDVVMVYGPMDDQGFYYGELGGHRGLVPAHLLDHMSLHGH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution structure of the third SH3 domain from human KIAA1666 protein
rcsb |
| molecule keywords |
Uncharacterized protein KIAA1666
|
| molecule tags |
Structural genomics, unknown function
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
5
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| structure length |
75
|
| sequence length |
75
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-02-28 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF07653 | SH3_2 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4ZNX A; 1RI9 A; 1E7O A; 2EYZ A; 1SRM A; 2E5K A; 2DLP A; 4OMP A; 3UA6 A; 2DL4 A; 4RTU A; 2W10 A; 2KYB A; 1VA7 A; 2V1Q A; 2RQT A; 1LCK A; 2A28 A; 2JM8 A; 1V1C A; 2BTT A; 1A0N B; 1X2Q A; 1QKX A; 1UUE A; 1Y0M A; 3ZL7 C; 2RQU A; 1WX6 A; 2RNA A; 2YT6 A; 3NHN A; 1GBQ A; 3TSW A; 1WXB A; 1QLY A; 2C0T A; 1KIK A; 3I5S A; 2O9S A; 1SRL A; 1K0S A; 1WLP B; 3VS0 A; 4OML A; 2JMC A; 1S1N A; 4D8K A; 2LJ3 A; 1WA7 A; 2BZX A; 1ZUU A; 2D1X A; 2KRO A; 2DA9 A; 2JTE A; 2RQW A; 1W70 A; 2YUO A; 1BK2 A; 2RN8 A; 5FW9 A; 3ULR B; 3QWY A; 2KT8 A; 2DM1 A; 4LUD A; 2KRN A; 2DE0 X; 4Y92 A; 2DBK A; 2K9G A; 1UEC A; 1Z9Z A; 2K7A A; 2L3S A; 4JJB A; 2EYY A; 2CSI A; 2CUB A; 2DNU A; 3VS1 A; 2DBM A; 1RLQ C; 2ROL A; 2ECZ A; 2LP5 A; 2EPD A; 1E6G A; 1PNJ A; 3EHQ A; 3EG3 A; 3VS7 A; 1K4U S; 1AD5 A; 2CSQ A; 1AOJ A; 2LZ6 B; 1SEM A; 3H0I A; 2L2P A; 1UHF A; 2JS2 A; 2AKL A; 1GFC A; 1GRI A; 1UGV A; 3EGU A; 1KJW A; 2K2M A; 2OJ2 A; 4ESR A; 5GJV B; 2FPE A; 2PNI A; 4AFU C; 2AK5 A; 1Y57 A; 1VYT A; 2KRM A; 4LUE A; 1NG2 A; 1Z9Q A; 2QDL A; 2HDA A; 2KXD A; 2LCS A; 2SRC A; 2LJ0 A; 2YUN A; 3EG1 A; 3UAT A; 1ZUK A; 2RQR A; 4J9C A; 2V1R A; 4LN2 A; 1GBR A; 2GGR A; 4HVV A; 1K9A A; 1H92 A; 1WI7 A; 2DL5 A; 3I5R A; 1M3B A; 2XMF A; 4EIK A; 5IHN A; 2PZ1 A; 1SPK A; 2NUZ A; 2CDT A; 1W6X A; 1J3T A; 1X6B A; 1B3Q A; 2LX7 A; 1QCF A; 1WIE A; 4HVW A; 4RUG A; 3TSZ A; 4IIO A; 2HBW A; 1VYU A; 2GTO A; 1HSQ A; 1ZSG A; 4RTX A; 4DEX A; 2YDL A; 3I35 A; 4J9D A; 5ECA A; 1ZLM A; 2JM9 A; 4JJC A; 2D8H A; 2O88 A; 1AEY A; 2VVK A; 3H41 A; 1OPL A; 1JQQ A; 2HSP A; 2D8J A; 1BBZ A; 2HCK A; 1K1Z A; 1QWF A; 2FRY A; 1XOV A; 2LJ1 A; 2EYW A; 4F14 A; 1X69 A; 4QT7 A; 4A63 B; 2F2W A; 3O5Z A; 1ARK A; 2F2X A; 1UFF A; 1SHF A; 2J05 A; 3NMZ C; 2A37 A; 3M0S A; 4F16 A; 1H8K A; 2J6O A; 4OMM A; 1TG0 A; 1M3A A; 4GBQ A; 4CC2 A; 2I0N A; 2GQI A; 1GCQ A; 1YN8 A; 2L0A A; 1PHT A; 2LMJ A; 2JXB A; 2W0Z A; 2FPD A; 2DL8 A; 1FYN A; 4AFZ C; 5L23 A; 3RBB B; 2EGE A; 1QWE A; 2LNH B; 2M51 A; 1TUD A; 1AWW A; 3EG0 A; 2AKK A; 2L3Q A; 1JU5 C; 3A98 A; 1T0H A; 3GBQ A; 2FRW A; 3CQT A; 3LH5 A; 1ZUY A; 2CH4 A; 1U3O A; 4JZ4 A; 3M0P A; 4KRT A; 2AZV A; 1WYX A; 1WXU A; 2J6F A; 1KFZ A; 1OEB A; 3TVT A; 2KNB B; 3VS5 A; 4K11 A; 3VS3 A; 1NLO C; 3R6N A; 1YNZ A; 1NYG A; 2O9V A; 4LE9 A; 3VS2 A; 2EBP A; 1SSH A; 5EC7 A; 1G83 A; 1EFN A; 1UJ0 A; 1K0X A; 2YUP A; 1OOT A; 2CRE A; 2B86 A; 3UF4 A; 4X1V A; 2DVJ A; 1GL5 A; 3M0U A; 5FWC A; 4E6R A; 2DMO A; 2DX1 A; 1PKT A; 2EGA A; 4JJD A; 2MIO A; 3PE0 A; 1PWT A; 1AZG B; 1MV3 A; 1AWJ A; 2X3W D; 1N5Z A; 1ZBJ A; 3PVL A; 4Z89 A; 2KEA A; 1T0J A; 3H0F A; 3EHR A; 1MV0 B; 3VS4 A; 4ORZ A; 5IHK A; 1UE9 A; 3U23 A; 1GFD A; 1BU1 A; 1WXT A; 1YCS B; 3KFV A; 2DIL A; 2VWF A; 4RTT A; 4RTY A; 1UHC A; 1TUC A; 2KBT A; 4Z88 A; 3SHW A; 1I07 A; 5I22 A; 1JXM A; 4HVU A; 2FEI A; 4J9I A; 1U5S A; 3I9Q A; 1RUW A; 1AWX A; 4HXJ A; 1UG1 A; 1JEG A; 2G6F X; 1X43 A; 4FSS A; 2J06 A; 1M8M A; 1U06 A; 3THK A; 2RMO A; 3IQL A; 2FPF A; 3M0R A; 2EQI A; 2RPN A; 4CC3 A; 4CC4 B; 1UDL A; 2DL3 A; 4WCI A; 4J9B A; 1M27 C; 1X2K A; 2EYX A; 5IH2 A; 5FWB A; 2BZ8 A; 2DRK A; 2EKH A; 1M3C A; 4F17 A; 2KXC A; 5IHI A; 4J9H A; 2KE9 A; 4DEY A; 1JO8 A; 2ROT A; 3C0C A; 4J9E A; 2M0Y A; 1YP5 A; 2GBQ A; 3EG2 A; 3REA B; 2JT4 A; 3FJ5 A; 3NGP A; 1E6H A; 2CT4 A; 3JV3 A; 4RTW A; 1W1F A; 4OMQ A; 3NPF A; 2KGT A; 2DJQ A; 3M0Q A; 4OMO A; 1PRL C; 1X27 A; 2CUD A; 4AG1 C; 2KRS A; 1YWO A; 1WDX A; 4Z8A A; 2ED1 A; 1YWP A; 2IIM A; 1NYF A; 1PRM C; 1UJY A; 1KSW A; 2D0N A; 2YUQ A; 2H8H A; 4HCK A; 4AG2 C; 2OI3 A; 2KT1 A; 2FO0 A; 2AZS A; 1BB9 A; 1ABO A; 1GCP A; 2A08 A; 2GNC A; 2YSQ A; 4RTZ A; 2KYM A; 1X6G A; 2CH4 W; 4LNP A; 1UTI A; 4JZ3 A; 1G2B A; 2JMA A; 1B07 A; 1VYV A; 2O31 A; 3SEM A; 2K6D A; 4CC7 A; 2ED0 A; 2J6K A; 1AVZ C; 4M4Z A; 1NEG A; 3RNJ A; 2MCN A; 5IXB A; 4OMN A; 1GCQ C; 1NM7 A; 3UA7 A; 1IO6 A; 2OAW A; 3M0T A; 1AZE A; 2K79 A; 1NLP C; 2X3X D; 2VKN A; 1OPK A; 2C0I A; 5I11 A; 4AFQ C; 2DL7 A; 1HD3 A; 3QWX X; 4J9F A; 2RF0 A; 5IXF A; 2J7I A; 1OV3 A; 1FMK A; 1M30 A; 4AFS C; 1ZX6 A; 1HJD A; 2O2O A; 3PVQ A; 1T3S A; 2FG0 A; 3REB B; 2ESW A; 1NEB A; 3VRY A; 1CKB A; 2EW3 A; 1MUZ A; 2A36 A; 1CKA A; 1PKS A; 2F2V A; 2DRM A; 2EGC A; 1I0C A; 1JXO A; 3H0H A; 2ABL A; 2HEQ A; 2EVR A; 2JW4 A; 4IIM A; 5HCK A; 1AWO A; 2JS0 A; 1SHG A; 1QKW A; 2SEM A; 2LQW A; 5GJW B; 1ABQ A; 2L3P A; 1WFW A; 4J9G A; 4JPB W; 1RLP C; 4D8D A; 2ENM A; 2P4R A; 4GLM A; 1I1J A; 1T3L A; 2GTJ A; 2DYB A; 2LQN A; 3VRZ A; 4RTV A; 1K76 A; 2KR3 A; 1CSK A; 4R0K A; 3VS6 A; 2CT3 A; 1H3H A; 2BZY A; 2DF6 A; 2NWM A; 2K3B A; 2MOX A; 2C0O A; 2RQV A; 2PTK A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4ZNX A; 1RI9 A; 2EJG A; 2ZPG B; 1OX8 A; 2DLP A; 3UA6 A; 2W10 A; 3CBP A; 1VA7 A; 3H8Z A; 1D0X A; 2A28 A; 2F5T X; 1V1C A; 2BTT A; 4DQ2 A; 2RI5 A; 3V7C A; 3EFS A; 2X4X A; 3CD6 Q; 4XTY A; 2G3R A; 3NFC A; 1I5O B; 2YT6 A; 2XKO C; 1QLY A; 4R55 A; 1KIK A; 3E19 A; 3DB3 A; 2L3R A; 4Y91 A; 5KCO A; 1M90 R; 3L2V A; 4M78 E; 1WLP B; 3OW2 S; 6AT1 B; 4EMH A; 3J80 E; 4RKU E; 2RQW A; 2YUO A; 1WHM A; 2DK3 A; 2EQU A; 1K9M C; 4DOW A; 1Q7Y C; 2KT8 A; 4PKC C; 3OYI A; 4LUD A; 5GAM f; 4BDZ A; 2COW A; 2KRN A; 3OW2 P; 4LXC A; 4XU3 A; 1WHG A; 2K9G A; 2K7A A; 3CCU Q; 2L3S A; 2DAQ A; 4JJB A; 4PJO F; 3OS1 A; 2A7Y A; 4ME7 A; 2E12 A; 2LP5 A; 3CCR T; 3EG9 A; 1VQ7 A; 3UWN A; 2VC8 A; 1R0C B; 4XQ3 A; 2RO0 A; 4EDU A; 1VQ5 A; 2KMT A; 4QQ6 A; 2E65 A; 2QXF A; 2XID A; 3MEU A; 5GAN f; 2MMP A; 2XD0 A; 4MDX A; 2L2P A; 3SFM A; 2XDP A; 4C0G A; 1GFC A; 1MNE A; 3EGU A; 2COZ A; 4KT0 E; 2OJ2 A; 4VUB A; 5AT1 B; 3CXC A; 2P4T A; 2FPE A; 2V8K A; 2DER A; 2IVW A; 3ER0 A; 3QBY A; 4J7F A; 4IUP A; 1QP3 A; 4LUE A; 1NG2 A; 2ZPI B; 2QDL A; 2LJ0 A; 3EG1 A; 3M4Y A; 3QJY A; 1ZSZ C; 1ZUK A; 2RQR A; 3M54 A; 4E7J A; 2GGR A; 1K9M R; 4HVV A; 1PCX A; 4EMK C; 1JB0 E; 2RI2 A; 3DKM A; 1Q7Y R; 4EIK A; 3G6E T; 4FL6 A; 2CDT A; 2M0O A; 1K73 C; 1KD1 C; 1J3T A; 4F7U A; 2DFU A; 3JB9 I; 1NJI C; 2DO3 A; 4RUG A; 2GFA A; 4GLK A; 4IIO A; 2HBW A; 3DLM A; 3M53 A; 4M75 D; 1N27 A; 1G8X A; 2YDL A; 3I35 A; 4L6V 5; 1WPY A; 4ZN1 A; 1AEY A; 2CGH A; 3MCA B; 2HBP A; 1JQQ A; 5GAN 6; 3JCM f; 5KYN A; 3CCR A; 1K1Z A; 4ZGD B; 2X35 A; 2NUP A; 4PFO A; 1XJW B; 3VKI A; 1X69 A; 1VQ7 Q; 3JB9 H; 3O5Z A; 1UFF A; 3J7A F; 2E6N A; 2HQX A; 1VQ5 Q; 4C8Q E; 2J05 A; 4E7L A; 2J6O A; 2DKG A; 3ZEH A; 1FXX A; 2I0N A; 2GQI A; 4NS5 A; 1KG1 A; 4RCB A; 2JXB A; 1I8F A; 4PJO G; 2M9U A; 1U8R A; 2RHY A; 2HL5 C; 1K73 R; 1I4K 1; 1JU5 C; 3FIF A; 1T0H A; 1SKU B; 3CMA Q; 2FRW A; 4PJO B; 3LH5 A; 2M02 A; 1NJI R; 2ATC B; 2AZV A; 3E9G A; 1WYX A; 1O9S A; 3SD4 A; 1KFZ A; 1BI1 A; 5CAI A; 3OYG A; 2ZAE A; 1NYG A; 2WSF E; 2ZPH B; 3CEY A; 3A5Z B; 4EMG A; 3VS2 A; 3QYH B; 3QZ9 B; 3MP6 A; 2QTX A; 2QQB A; 2OTJ T; 3V8J A; 2F5K A; 3M0U A; 4KGV B; 2DX1 A; 1TU0 B; 3HRT A; 1SSF A; 1VQ8 T; 4M77 A; 3VJP A; 4JJD A; 2BUD A; 1MV3 A; 3EFO B; 2X3W D; 1N5Z A; 1ZBJ A; 4XTZ A; 2LC4 A; 3PVL A; 3EGX B; 4Z89 A; 4QVD A; 2QEX Q; 4BB7 A; 1N8R R; 2KEA A; 5CCA A; 2AIR B; 3EHR A; 1IHV A; 3VS4 A; 3PFS A; 3ZFJ A; 4XU1 A; 5GAN d; 4M7A B; 5IHK A; 3VV0 A; 5GAM g; 4JS5 A; 4HCC A; 3LW5 E; 2DIL A; 1K8A C; 1NZ9 A; 5FRO A; 1MMA A; 3OS5 A; 4X9C A; 1C1A A; 4Z02 A; 2K3X A; 4J9I A; 1U5S A; 5GAN 8; 1M1K R; 1HYO A; 4M7D A; 3THK A; 2CP2 A; 3A8G B; 2FPF A; 2CP0 A; 3X28 B; 4II1 A; 1R8O B; 2VXE A; 3EGD B; 3JB9 J; 2DL3 A; 5A2Q E; 1M5Q 1; 1X2K A; 2WSE E; 3FDR A; 2OTJ A; 3CPF A; 5IH2 A; 2D6F A; 4OB1 B; 5FWB A; 5AYF A; 5LJ5 e; 1M3C A; 2EYQ A; 2PVO B; 5IHI A; 2RD1 A; 4DEY A; 2QG9 B; 2M0Y A; 5GAN 4; 5CKD A; 3RIR A; 1VQ8 A; 3CC2 T; 2CT4 A; 1VQL A; 3V7S A; 4RTW A; 4OMQ A; 3NPF A; 5CIU A; 3NTI A; 3KBG A; 3JCM d; 3M0Q A; 2FYK A; 4PFZ A; 5EG2 A; 1WDX A; 2YUQ A; 4M7A E; 1NPP A; 2CZ1 B; 4HCK A; 5LJ5 h; 1K8A R; 2KT1 A; 2FB7 A; 2AZS A; 4Q5W A; 1BB9 A; 1ABO A; 5A0L A; 2GNC A; 2KYM A; 4LNP A; 1PSE A; 1DJ7 B; 1B07 A; 4ZTF A; 1D0Y A; 3QO3 A; 4E7S A; 4HCB A; 3P8D A; 4CC7 A; 4EMK A; 3JCM g; 5D6X A; 4M78 D; 1NEG A; 1D09 B; 3OYN A; 5GAO p; 4OMN A; 2DD5 A; 3UA7 A; 2D9T A; 5KH6 A; 1AZE A; 2X3X D; 2K57 A; 3OYH A; 3CCV Q; 4AFQ C; 3LX7 A; 3VUB A; 1HD3 A; 4M75 E; 2RK1 A; 1TH7 A; 4AFS C; 1HJD A; 3PVQ A; 1T3S A; 2KVQ G; 2KK4 A; 1RL2 A; 3R6O A; 2AHJ B; 3TU4 K; 2EW3 A; 3CCL T; 2OTJ Q; 2A36 A; 3ME9 A; 1CKA A; 3JCM b; 1PKS A; 3CC7 T; 3DLL A; 2DRM A; 2EGC A; 2L8D A; 3EG9 B; 2HEQ A; 2EVR A; 2JW4 A; 2RJD A; 1YIT T; 2OX7 A; 3CC2 A; 1QKW A; 3OBY A; 3GPL A; 2LQW A; 1ABQ A; 2WAC A; 2L3P A; 2XI9 A; 3PGG A; 4J9G A; 5GMK i; 1VQ8 Q; 4D8D A; 2PUK B; 2XK0 A; 1VQL Q; 2ENM A; 1IGU A; 3LWI A; 3S3M A; 2JVV A; 4BI4 A; 4RTV A; 4EPC A; 5FRN A; 2YRC A; 2CT3 A; 1H3H A; 1WHH A; 4M77 F; 2EQM A; 4C5G A; 2RQV A; 2PTK A; 2EJF A; 4OMP A; 1Q86 R; 4HT8 A; 1ACM B; 1FX7 A; 1X2Q A; 2ZCF B; 1QKX A; 4KH1 B; 2NLU A; 1YI2 A; 3WVE B; 1YJW Q; 3ZL7 C; 3NTK A; 2RQU A; 1WHJ A; 1MMD A; 2JNG A; 3P8B B; 2YRD A; 4F7U B; 3A8L B; 3MHX A; 1GBQ A; 2VXF A; 3TSW A; 1WXB A; 4QKU A; 1VQK Q; 3H6Z A; 4E7I A; 3I5S A; 5LJ3 d; 2O9S A; 1K0S A; 4O5V A; 2YXY A; 2BKD N; 2JMC A; 2NYS A; 2LJ3 A; 2DJZ A; 1WJR A; 1WA7 A; 1GXI E; 1B34 A; 2KRO A; 3CCL A; 1W70 A; 1BK2 A; 3S6W A; 4ZTJ A; 3CC7 A; 3QWY A; 2DM1 A; 3X24 B; 1KC8 C; 1YIT A; 4IUV A; 4M7D F; 1FMW A; 2NUP B; 2K5F A; 2C06 A; 1UEC A; 1Z9Z A; 4BE2 A; 1RAG B; 4C8Q D; 2EYY A; 4C5I A; 2CSI A; 2DNU A; 3CC2 Q; 3VS1 A; 2DBM A; 1RLQ C; 4OGC A; 3OA6 A; 3RMS A; 2DEQ A; 4BY6 C; 1ZA2 B; 1FMV A; 3EHQ A; 2X4J A; 3FC3 A; 4PJM A; 1VQO Q; 1TWB A; 2CSQ A; 2WSC E; 5CR2 A; 2LZ6 B; 2R57 A; 1UB4 A; 5I2S A; 4OB2 B; 4PLL A; 3H0I A; 2K4Y A; 1VQ6 T; 1UHF A; 2JS2 A; 3UDC A; 5J3B A; 1C0M A; 1GRI A; 2X9H A; 4ESR A; 4AFU C; 5IT9 E; 4OP0 A; 2AK5 A; 2BE9 B; 3JB9 F; 1SF9 A; 2LCS A; 3E1S A; 2YUN A; 1OX9 A; 4X34 A; 3UAT A; 1YI2 Q; 2OTL T; 1WHL A; 3MKD A; 2V1R A; 4LN2 A; 4IUQ A; 1H92 A; 3CCE Q; 4E7K A; 3VUZ A; 2XMF A; 3HL8 A; 3Q1J A; 2PZ1 A; 1SPK A; 1KC8 R; 3X26 B; 4M77 G; 2ZZD A; 5LJ3 j; 3PIO A; 2DEU A; 1X6B A; 2V8J A; 2CZ6 B; 4JDS A; 5LJ5 f; 4C0D B; 3CCL Q; 2DIQ A; 1VYU A; 4M77 B; 2RHZ A; 5FLX E; 3CC7 Q; 4FT2 A; 2EWN A; 4J9D A; 3A8O B; 1ZLM A; 3OQ5 A; 3OYA A; 2LT1 A; 1YIT Q; 1RAI B; 2HSP A; 3WVD B; 2D8J A; 2CS7 A; 4AMC A; 1W2B S; 1QWF A; 1KHI A; 2CP3 A; 3G4S A; 5DM7 R; 5GAO q; 1QCN A; 3PMI A; 4QT7 A; 4A63 B; 5KYW A; 2F2W A; 4OGE A; 2M1H A; 1AHJ B; 4YTL A; 3NMZ C; 4PJO D; 5C0M A; 5GMK j; 1VQ6 A; 4OMM A; 3CC4 T; 1W2B P; 1W4S A; 4M7D G; 4J6X A; 2L0A A; 1PHT A; 2CP6 A; 2RJF A; 3S3O A; 4M7D C; 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