The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
5
|
sequence length |
80
|
structure length |
80
|
Chain Sequence |
GSSGSSGATSYMTCSAYQKVQDSEISFPAGVEVQVLEKQESGWWYVRFGELEGWAPSHYLVLDENEQPDPSGKESGPSSG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution structures of the SH3 domain of human KIAA0418
rcsb |
| molecule tags |
Signaling protein
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| molecule keywords |
SH3 and PX domain-containing protein 2A
|
| total genus |
5
|
| structure length |
80
|
| sequence length |
80
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-03-23 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2K79 A; 1KFZ A; 1AWX A; 2A36 A; 2JS2 A; 1BB9 A; 1HSQ A; 4D8K A; 2ECZ A; 2JM8 A; 2FRY A; 1W6X A; 2HSP A; 4J9B A; 2FG0 A; 2DL7 A; 2M0Y A; 2W0Z A; 2L2P A; 2BTT A; 4J9E A; 2OI3 A; 2D1X A; 1YNZ A; 2DRM A; 5HCK A; 3UA6 A; 5L23 A; 3NGP A; 1M3B A; 4LUD A; 2DF6 A; 4RTV A; 4OMP A; 2YUQ A; 2J05 A; 2JTE A; 2E5K A; 2KT8 A; 5IHK A; 1OPL A; 2LQN A; 4JZ4 A; 2KRS A; 2YSQ A; 4IIM A; 1UDL A; 4RTX A; 1WDX A; 5FW9 A; 5IHN A; 1RI9 A; 1Z9Z A; 2ESW A; 1UE9 A; 4RTZ A; 1I0C A; 1KJW A; 2PZ1 A; 4ESR A; 1JU5 C; 1WIE A; 1BBZ A; 4RUG A; 1SHG A; 4OMQ A; 3U23 A; 2AKK A; 4AG2 C; 1Y0M A; 4CC4 B; 1WA7 A; 1RLP C; 4Y92 A; 4ZNX A; 1HD3 A; 2D0N A; 2EYW A; 4JPB W; 4A63 B; 2A37 A; 4Z89 A; 3PVQ A; 2DLP A; 1E6G A; 4OMO A; 2ENM A; 2YUN A; 1UEC A; 1U06 A; 2GTO A; 1ZUY A; 2RQV A; 3M0T A; 1G83 A; 2O9V A; 2D8J A; 4HVV A; 3FJ5 A; 3UF4 A; 2F2X A; 3JV3 A; 1UTI A; 1I07 A; 4AG1 C; 2G6F X; 1YCS B; 1RLQ C; 2BZ8 A; 1T3S A; 1SHF A; 3R6N A; 4CC2 A; 1MV0 B; 5GJW B; 1WI7 A; 1ABQ A; 2C0O A; 3VS1 A; 1K1Z A; 2DM1 A; 1SRL A; 2DMO A; 2SRC A; 2CSQ A; 1Z9Q A; 1A0N B; 2DE0 X; 1LCK A; 4KRT A; 1B3Q A; 3VS0 A; 4R0K A; 3M0P A; 2CDT A; 1OEB A; 1GFC A; 1VYU A; 2V1R A; 5IXB A; 2L3P A; 3H0F A; 2KBT A; 4J9I A; 4RTW A; 1TG0 A; 2EW3 A; 2L3S A; 2M51 A; 4J9H A; 1QWF A; 2YUP A; 4WCI A; 2EKH A; 1K9A A; 1UUE A; 1X6G A; 2RF0 A; 3LH5 A; 4HVW A; 4AFS C; 1X2Q A; 2KRO A; 2CRE A; 2LJ0 A; 4JJC A; 2DBK A; 1K0X A; 1YP5 A; 2LX7 A; 3M0S A; 2XMF A; 2LJ3 A; 1G2B A; 2O9S A; 2JXB A; 3M0U A; 3REA B; 4J9G A; 1AWW A; 2HBW A; 2JW4 A; 2DA9 A; 1U3O A; 4AFZ C; 2DBM A; 3TSW A; 2DJQ A; 4X1V A; 4OML A; 1ZBJ A; 2ED0 A; 1VYV A; 4RTU A; 3ULR B; 1QKW A; 1H92 A; 4DEY A; 2ED1 A; 2W10 A; 1GBR A; 1QWE A; 2F2V A; 2H8H A; 2GBQ A; 1PHT A; 3EG3 A; 4J9D A; 4HXJ A; 1S1N A; 3CQT A; 4LE9 A; 1ABO A; 4F17 A; 1GL5 A; 2KE9 A; 2FPE A; 3O5Z A; 4IIO A; 1EFN A; 1WYX A; 2DL4 A; 2YT6 A; 2CH4 W; 2ABL A; 2KRM A; 2NWM A; 1WX6 A; 2VWF A; 2GNC A; 1GCQ C; 4J9C A; 1NYF A; 2CUD A; 2KR3 A; 1JEG A; 2X3X D; 1HJD A; 3H0I A; 1WXT A; 2MIO A; 2AZV A; 2KEA A; 4AFQ C; 1UHF A; 2GQI A; 1I1J A; 4JJB A; 3I9Q A; 3VRY A; 3GBQ A; 2FRW A; 1NLO C; 2KXC A; 2DYB A; 3EGU A; 3NPF A; 1WXU A; 2FO0 A; 1RUW A; 1VYT A; 3UA7 A; 4RTT A; 2AZS A; 4QT7 A; 3VS2 A; 3EHR A; 1NEG A; 2NUZ A; 2JM9 A; 2ROT A; 3NMZ C; 4F16 A; 2OAW A; 1YWP A; 2RMO A; 1ARK A; 1GFD A; 2LMJ A; 2EGC A; 3SEM A; 1SPK A; 3NHN A; 1B07 A; 4J9F A; 5GJV B; 2IIM A; 1W1F A; 1SEM A; 1AOJ A; 1ZUU A; 3VS4 A; 3A98 A; 1M3C A; 2JS0 A; 5I11 A; 2L0A A; 2DVJ A; 1ZUK A; 3KFV A; 1E6H A; 3M0R A; 1KSW A; 2CT4 A; 2KT1 A; 1WLP B; 4DEX A; 1PWT A; 2EYZ A; 4CC7 A; 2DL3 A; 2O88 A; 1U5S A; 1GBQ A; 2LZ6 B; 3QWX X; 1UFF A; 3VS7 A; 2B86 A; 2D8H A; 2L3Q A; 1ZX6 A; 2J7I A; 1AWO A; 1AZG B; 2J6O A; 2I0N A; 2KGT A; 2SEM A; 1PRM C; 2EGE A; 1JXM A; 1ZSG A; 2DX1 A; 2EGA A; 1CKB A; 4OMM A; 1E7O A; 2FEI A; 2YDL A; 2FPF A; 2DRK A; 2VVK A; 1UJ0 A; 4JZ3 A; 1K4U S; 3I5S A; 2CSI A; 1MUZ A; 3REB B; 3IQL A; 3TVT A; 2HCK A; 1NEB A; 1X6B A; 1K0S A; 2KYM A; 1AZE A; 2RPN A; 2KNB B; 1NLP C; 2OJ2 A; 2CT3 A; 1MV3 A; 3VS5 A; 4GLM A; 1AWJ A; 4HCK A; 1VA7 A; 1BU1 A; 1NYG A; 3PE0 A; 1CKA A; 1WFW A; 3TSZ A; 1X27 A; 1Y57 A; 3VS6 A; 1PRL C; 2BZY A; 2GTJ A; 2JT4 A; 3EG1 A; 1V1C A; 1K76 A; 1QLY A; 2HDA A; 1GRI A; 2LNH B; 3VS3 A; 1OPK A; 4RTY A; 2DNU A; 2RNA A; 2CH4 A; 5ECA A; 3RBB B; 4GBQ A; 1UG1 A; 2A08 A; 2MOX A; 2EQI A; 1X2K A; 4LUE A; 4AFU C; 2JMA A; 2AKL A; 2QDL A; 2LCS A; 4CC3 A; 1KIK A; 3VRZ A; 2DIL A; 3EG0 A; 4ORZ A; 2EYY A; 2KYB A; 1GCQ A; 1TUD A; 1PNJ A; 1T0J A; 1XOV A; 2LP5 A; 2O31 A; 1AD5 A; 1T0H A; 5IHI A; 1H8K A; 4F14 A; 2EPD A; 3PVL A; 2K2M A; 3I35 A; 2C0T A; 1N5Z A; 1QCF A; 1UJY A; 2J06 A; 3RNJ A; 1QKX A; 2DL5 A; 1JQQ A; 5FWB A; 1NM7 A; 3EHQ A; 5I22 A; 2PTK A; 4Z8A A; 3QWY A; 3ZL7 C; 4K11 A; 1YN8 A; 2RQR A; 3I5R A; 1FMK A; 3THK A; 1M8M A; 2ROL A; 2J6F A; 4EIK A; 2KXD A; 2A28 A; 1J3T A; 2GGR A; 1IO6 A; 4HVU A; 1ZLM A; 1OV3 A; 2J6K A; 2C0I A; 2DL8 A; 2LQW A; 1CSK A; 1SRM A; 2K7A A; 2RQW A; 4Z88 A; 2EBP A; 2O2O A; 4LN2 A; 1BK2 A; 2JMC A; 2F2W A; 2K9G A; 2K6D A; 3UAT A; 4JJD A; 5IH2 A; 3H0H A; 1AEY A; 2VKN A; 1WXB A; 1M3A A; 2RQU A; 2K3B A; 3M0Q A; 1NG2 A; 1UHC A; 4M4Z A; 2V1Q A; 5FWC A; 1AVZ C; 1JXO A; 2AK5 A; 1PKS A; 1W70 A; 1PKT A; 2EVR A; 1UGV A; 4OMN A; 3H41 A; 2BZX A; 2RN8 A; 2X3W D; 4FSS A; 3EG2 A; 1H3H A; 3SHW A; 4D8D A; 2P4R A; 4E6R A; 1JO8 A; 1M27 C; 1OOT A; 1T3L A; 1YWO A; 3C0C A; 5IXF A; 2FPD A; 2HEQ A; 1M30 A; 1FYN A; 1X43 A; 2EYX A; 4LNP A; 2LJ1 A; 1GCP A; 2YUO A; 2PNI A; 5EC7 A; 1X69 A; 1TUC A; 2MCN A; 2RQT A; 1SSH A; 2KRN A; 2CUB A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1VQ4 T; 1AWX A; 2A36 A; 2EIF A; 1HSQ A; 1SF9 A; 3P8H A; 2HKQ B; 2Y90 A; 5LJ5 e; 1JJ2 P; 2OI3 A; 2D1X A; 2X4W A; 5HCK A; 1NJI U; 1M3B A; 5GMK e; 2HKN A; 3L1A A; 4FU6 A; 2QEX T; 2RJC A; 1XTD A; 3QZ9 B; 4BD3 A; 2J05 A; 1OI1 A; 2LCL A; 3V8J A; 2LQN A; 3OS5 A; 4FIB A; 3CCL A; 4NS5 A; 5IHN A; 4PJO B; 2ESW A; 4RG2 A; 4HT9 A; 1UGS B; 5CCA A; 4ESR A; 1BI2 A; 2CP2 A; 4C92 C; 5GAN 4; 3LGL A; 3U23 A; 2YLB A; 4AG2 C; 1M2V A; 4CC4 B; 4Y92 A; 2WSF E; 1HD3 A; 2EYW A; 4D6W A; 4DOW A; 1UEB A; 1QVF P; 3M0T A; 1G83 A; 1KD1 U; 2D8J A; 4M7A C; 3AT1 B; 3C12 A; 1RLQ C; 2R57 A; 2ZPI B; 2DER A; 4E7H A; 3R6N A; 4CC2 A; 4PL6 A; 4HCB A; 5GJW B; 2EKO A; 2LQ8 A; 4LDW A; 4RKU E; 5FRM A; 4C8Q F; 1WI7 A; 4PJN A; 4JS4 A; 3UWN A; 3OBW A; 1VQP T; 1SRL A; 2DMO A; 2DO3 A; 2CSQ A; 4IUQ A; 1A0N B; 3RMS A; 3JB9 G; 5GAN e; 2LT4 A; 4EDU A; 3G4S A; 4R0K A; 2OX7 A; 4M7D E; 5FU6 C; 4M75 F; 1VYU A; 2EJG A; 1WQ7 A; 4FW1 A; 5GMK m; 2EW3 A; 3A1P A; 4LDY A; 2L3S A; 2MWO A; 2F69 A; 2E70 A; 4WF2 A; 1UUE A; 2K3Y A; 3EFR A; 3NTH A; 4FL6 A; 2LJ0 A; 2DKG A; 3SWN C; 4O6J A; 1YJN Q; 1QVG A; 3REA B; 2JXB A; 3LX7 A; 1VQ5 T; 2ZGW A; 2M1H A; 3QKJ A; 2DA9 A; 1PC0 A; 4X1V A; 4M78 F; 4BDZ A; 1VYV A; 3ULR B; 1IGU A; 1Q81 U; 1H92 A; 4DEY A; 4C0F A; 3G71 A; 3CCR T; 2FHD A; 1GBR A; 1VQN T; 2LRQ A; 4J6W A; 2H8H A; 2GBQ A; 4ATO A; 4JUV A; 2RH2 A; 4YTL A; 2QQS A; 4M7D D; 3CQT A; 1I8F A; 1ABO A; 1BCM A; 1YIJ T; 2FPE A; 3CCU T; 1UGP B; 1IB8 A; 2ABL A; 2LCC A; 5GAN 7; 3CME A; 5GMK i; 4OB1 B; 3CCR Q; 1NYF A; 2CUD A; 1HJD A; 3OSV A; 5LJ3 d; 2MIO A; 1Y7X A; 3JCM e; 1WQW A; 1UHF A; 2GQI A; 3FRN A; 3SD4 A; 1VQM A; 3I9Q A; 5HY6 A; 1NLO C; 3TQ7 P; 2DYB A; 3CMA T; 3EGU A; 4BI8 B; 3MEU A; 5FRO A; 4LD9 K; 3OW2 A; 1WXU A; 4OGC A; 1VYT A; 2OTJ T; 3V7C A; 4C92 B; 3EHR A; 2DYI A; 1NEG A; 1YHQ T; 3CCJ T; 4F16 A; 1M5Q 1; 4BE1 A; 3ZEH A; 1TS9 A; 2QA4 T; 1ARK A; 1GFD A; 2EGC A; 4RMO A; 1N27 A; 2DXB A; 4M7D C; 2KI7 A; 1O9S A; 1D1B A; 2L8D A; 1QVG P; 3OQ5 A; 3CC4 A; 1WHM A; 1AOJ A; 1ZUU A; 1IGQ A; 3BDU A; 5DY9 A; 4M7A B; 3QZ5 B; 1KK7 A; 3FC3 A; 2L0A A; 3G7Z A; 4BB7 A; 5GAN 3; 1ZUK A; 4C8Q E; 2RI5 A; 1WHJ A; 3BY7 A; 2HQX A; 2CT4 A; 4Y91 A; 5CAI A; 5KE2 A; 5D7U A; 3DLL A; 1FMV A; 2EYZ A; 4PJJ A; 2DL3 A; 4M75 E; 5KYX A; 1GBQ A; 3SB2 A; 2HAX A; 4C5I A; 2QK0 A; 4FW2 A; 4C0G A; 1ACM B; 2RJE A; 3CCS A; 5CKD A; 5FU6 B; 5LJ3 g; 4E7K A; 5KH6 A; 1KQ1 A; 3OYG A; 3L2Z A; 1AZG B; 3WVD B; 2EGE A; 2O4X A; 1LVK A; 1CKB A; 2CP5 A; 3JAM E; 3JCM V; 2DRK A; 3TCJ A; 2F1L A; 1K4U S; 5LJ5 g; 3LW5 E; 2MAM A; 5CIU A; 2CP3 A; 3TVT A; 2GF7 A; 2HCK A; 1VQO Q; 1M1G A; 2KYM A; 4KUI A; 2YXY A; 2RPN A; 2KNB B; 3JCM W; 4M78 E; 4DBQ A; 4V2S A; 2V26 A; 3CC2 A; 2P4T A; 1K73 C; 3OW2 P; 2A7Y A; 3J81 E; 1YJW A; 3OYM A; 2QQA A; 3TSZ A; 1WJR A; 3O8V A; 2BZY A; 2GTJ A; 1K8A C; 5GAN 8; 2XDB A; 1V1C A; 1QLY A; 2ATC B; 2V8J A; 4BI4 A; 1NPP A; 2NLU A; 3VS3 A; 5IT9 E; 2LTO A; 3QJ6 A; 2RNA A; 5ECA A; 4XU1 A; 1RAH B; 2A08 A; 2IVW A; 4OB2 B; 2EQI A; 2AT1 B; 2DTI A; 4GLK A; 4NOY A; 1G3T A; 2PU9 B; 4XTW A; 3QYH B; 2YHT A; 1MHN A; 4FM4 B; 5CQY A; 1GCQ A; 5AYF A; 1T0J A; 3QO3 A; 1EIF A; 1Q7Y C; 1T0H A; 2H3J A; 4LXC A; 1D0Z A; 5CKH A; 5LL6 S; 2EPD A; 1UJY A; 2FZG B; 1QKX A; 4PJO G; 3L2W A; 1NM7 A; 5GAM d; 5L8R E; 5I22 A; 2PQW A; 4LDU A; 3MJX A; 3QWY A; 3DLM A; 1RAF B; 1YN8 A; 3CXC A; 1FXX A; 1Q7Y R; 3GLX A; 4QQG A; 2VGN A; 4EIK A; 4C8Q C; 2GGR A; 4J5Y A; 5GAN g; 1S72 Q; 3GNG A; 3L2Q A; 1CSK A; 1SRM A; 2LVM A; 4Z88 A; 3OYB A; 1G3S A; 1BK2 A; 3JCM d; 2K9G A; 3CCE A; 4JLG A; 3H0H A; 3I56 A; 2DD4 A; 1WXB A; 4M7D B; 3OS1 A; 2E12 A; 1PKS A; 1W70 A; 2EVR A; 1RI0 A; 1UGV A; 4OMN A; 2DAQ A; 1WNL A; 2RN8 A; 4KUD K; 3EG2 A; 3QII A; 4E6R A; 1T3L A; 1YWO A; 2KK4 A; 3LH0 A; 1M30 A; 2QGF B; 5LJ3 f; 3EG9 A; 1X6O A; 2O4X B; 4LNP A; 4LD6 A; 3TU4 K; 4TVR A; 4BI3 A; 4M77 F; 1VQK A; 1VQ8 A; 3EAE A; 1SSH A; 2ZZD A; 2CKK A; 5LJ5 f; 3JCM J; 1KFZ A; 3UDC A; 1KD1 R; 2AHJ B; 3CCL T; 1W6X A; 3M4G A; 4J9B A; 2FG0 A; 2DL7 A; 2BTT A; 4J9E A; 3GP8 A; 2DRM A; 5L23 A; 5KYU B; 2KSS A; 4A4K A; 1I81 A; 2QI2 A; 4RTV A; 4A4G A; 4C0Z A; 5IHK A; 4ME7 A; 4PJO A; 1U1T A; 4JZ4 A; 2KRS A; 2YSQ A; 4IIM A; 1PG5 B; 3AHU A; 1WDX A; 3HFN A; 5FW9 A; 2E5Q A; 2GQV A; 1N8R R; 1YJ9 Q; 3CCM A; 1M1K C; 1BIA A; 2OAU A; 1UE9 A; 4RTZ A; 3D7S B; 1I0C A; 2B8A A; 1JU5 C; 1BBZ A; 3CBO A; 1BYM A; 4OMQ A; 2AKK A; 2ZCF B; 1WA7 A; 3URG A; 1RLP C; 4ZGE B; 4ZNX A; 2XG8 D; 2A37 A; 4FYY B; 2DLP A; 1E6G A; 3J80 E; 2X9H A; 2ENM A; 3JB9 J; 5HK3 A; 1UEC A; 1SKU B; 1ZUY A; 3JB9 F; 2O9V A; 4J6Y A; 1GXI E; 4FYX B; 2VGM A; 3V7S A; 2KAF A; 4XTV A; 2DEQ A; 3G4S T; 1TH7 A; 1I07 A; 4AG1 C; 1U8R A; 2ZAE A; 9ATC B; 3KUF A; 1UB4 A; 1SHF A; 2OTL Q; 1MV0 B; 3GOX A; 1M90 C; 5GAN f; 4J7F A; 4RCB A; 2C0O A; 1ABQ A; 2CZ1 B; 1K1Z A; 3CCQ A; 4C92 G; 2SRC A; 2RHZ A; 1VQ9 A; 4KRT A; 1B3Q A; 3M0P A; 5LJ5 j; 3CD6 Q; 2P0Q A; 2KBT A; 4J9I A; 2WSE E; 1M8V A; 2RK1 A; 1VQ7 A; 4F7U A; 3E9F A; 4J9H A; 2M51 A; 1RAB B; 2RO0 A; 2YUP A; 1VQL A; 3CEY A; 2L89 A; 1K73 U; 4M7A G; 4B9X A; 3G71 T; 3OYI A; 2JUF A; 3HHT B; 4PFO A; 2KRO A; 4BY6 C; 2K2V A; 1K0X A; 8ATC B; 1OZ3 A; 2JW4 A; 6AT1 B; 2XHC A; 3ZBD A; 2RHY A; 3TSW A; 2DJQ A; 4IKF A; 3HP9 A; 4OML A; 2ED0 A; 2JNG A; 5J39 A; 3JCM Q; 7AT1 B; 2ED1 A; 2W10 A; 3CME T; 4N0A A; 4M77 E; 1QWE A; 2HQH A; 4E7S A; 4ZTF A; 4HXJ A; 2HBP A; 2DTH A; 4A54 A; 4LE9 A; 1OU8 A; 5KE3 A; 4F17 A; 2F5T X; 2KE9 A; 2FL7 A; 3O5Z A; 3PMI A; 4IIO A; 1TUG B; 1VQM T; 1K9M R; 4A4H A; 2XK0 A; 5GAN 2; 1VQ4 Q; 2DL4 A; 4A4F A; 2CH4 W; 2KRM A; 1W4S A; 4E7I A; 3OYD A; 1WX6 A; 4JRQ A; 4J9C A; 1KQS P; 3G6E A; 3JCM X; 2M0O A; 2X3X D; 3BE3 A; 1H3Z A; 2QTX A; 5A0D A; 3FJP A; 2EQK A; 2QEX Q; 3RKY A; 3OYJ A; 3NTK A; 3UT1 A; 2X51 A; 2KXC A; 3CC7 A; 2ZPE B; 3FEO A; 3HL8 A; 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