The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
7
|
sequence length |
69
|
structure length |
69
|
Chain Sequence |
GSSGSSGRTVKALYDYKAKRSDELTFCRGALIHNVSKEPGGWWKGDYGTRIQQYFPSNYVEDISGPSSG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution structure of the SH3 domain from Phospholipase C, gamma 2
rcsb |
| molecule keywords |
Phospholipase C, gamma 2
|
| molecule tags |
Immune system, hydrolase
|
| source organism |
Mus musculus
|
| total genus |
7
|
| structure length |
69
|
| sequence length |
69
|
| ec nomenclature |
ec
3.1.4.11: Phosphoinositide phospholipase C. |
| pdb deposition date | 2007-03-30 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2GNC A; 3KFV A; 2DJQ A; 1SSH A; 2JMA A; 4Z8A A; 2DLP A; 1IO6 A; 2H8H A; 2DVJ A; 2C0T A; 2KRO A; 2J06 A; 2ABL A; 4M4Z A; 2EGC A; 2LCS A; 3H0I A; 3M0R A; 2DL7 A; 3QWY A; 1GL5 A; 2DX1 A; 1XOV A; 2OAW A; 3EG1 A; 4X1V A; 5IHN A; 3VS0 A; 3H41 A; 2EYW A; 1H8K A; 2SEM A; 2GTJ A; 1PRL C; 3VRY A; 2A08 A; 4RTX A; 2DRM A; 2V1Q A; 4K11 A; 2V1R A; 4JZ4 A; 3I9Q A; 2O2O A; 2RQT A; 2RF0 A; 4CC3 A; 2LJ3 A; 2DMO A; 2AKK A; 1AWJ A; 2D8J A; 2K9G A; 4JJB A; 2JMC A; 2RQU A; 3UA7 A; 4KRT A; 3VS6 A; 4EIK A; 2LJ1 A; 2RQW A; 1PWT A; 1YWP A; 1K9A A; 3M0Q A; 2AK5 A; 1NEG A; 1NYG A; 2VKN A; 3QWX X; 4J9C A; 1U06 A; 4OMO A; 1U5S A; 1NLP C; 2EYY A; 2BZX A; 1YCS B; 2KRN A; 1WA7 A; 2RQV A; 2DRK A; 3EHR A; 2J6O A; 1YNZ A; 4HCK A; 4OMM A; 2JM9 A; 1BB9 A; 4IIM A; 3EG2 A; 1AOJ A; 4CC4 B; 2DF6 A; 4D8K A; 4GLM A; 1QWF A; 1T3L A; 3ZL7 C; 2ESW A; 2O31 A; 1AZE A; 5HCK A; 4F17 A; 1W6X A; 1ABQ A; 4HVU A; 1GFD A; 2FRW A; 1SRM A; 2LQW A; 1H3H A; 2D8H A; 1WX6 A; 3FJ5 A; 1QKX A; 2K6D A; 2RPN A; 2JW4 A; 1S1N A; 5IXB A; 2F2W A; 1K1Z A; 2GTO A; 3ULR B; 2FRY A; 5L23 A; 2X3W D; 1KJW A; 4QT7 A; 4RTU A; 2EPD A; 1JU5 C; 2K79 A; 2M51 A; 3TSZ A; 2NUZ A; 3R6N A; 3VS3 A; 3VS5 A; 1GBR A; 1K76 A; 2FO0 A; 1CKA A; 2HSP A; 1AZG B; 2DM1 A; 2K7A A; 1UTI A; 3NMZ C; 2EQI A; 2IIM A; 2LMJ A; 2KXD A; 1ARK A; 1GCQ A; 5GJW B; 1GCP A; 1PHT A; 2DBM A; 2CDT A; 2EYZ A; 3I5R A; 2KR3 A; 1OPL A; 3TVT A; 2EGE A; 4HVV A; 2BZ8 A; 2OI3 A; 3UA6 A; 1I07 A; 4F14 A; 1CKB A; 2BZY A; 2LX7 A; 1AWX A; 2K3B A; 1ZUK A; 1M3A A; 4OMQ A; 1AVZ C; 2J7I A; 2LZ6 B; 5IH2 A; 2RN8 A; 2EVR A; 1M3B A; 3GBQ A; 2CRE A; 1UHF A; 3VS2 A; 2EYX A; 2OJ2 A; 1BU1 A; 1I0C A; 2LP5 A; 2EKH A; 1UUE A; 2X3X D; 2YSQ A; 2DNU A; 4JPB W; 2AZV A; 1B07 A; 3I35 A; 4OML A; 1OPK A; 2YUN A; 2KRM A; 2O88 A; 2BTT A; 1Z9Q A; 1OOT A; 1KFZ A; 4RUG A; 2YUP A; 1GCQ C; 4A63 B; 1Z9Z A; 2CSQ A; 1ZUU A; 2FPD A; 1J3T A; 1Y0M A; 1X2Q A; 1M8M A; 1NM7 A; 4CC2 A; 1I1J A; 1MV3 A; 4OMN A; 2CH4 A; 2AKL A; 1WIE A; 2KNB B; 1UJ0 A; 2YUO A; 1GRI A; 1RLP C; 1PKT A; 1G2B A; 2J6K A; 4AFU C; 2SRC A; 1YP5 A; 1X6B A; 4JZ3 A; 4R0K A; 3EHQ A; 2CUB A; 2KEA A; 1GFC A; 1SEM A; 3EGU A; 1WXT A; 3PE0 A; 1ABO A; 2JT4 A; 1VYU A; 2DA9 A; 3I5S A; 4RTZ A; 3SEM A; 4D8D A; 1TUC A; 3REA B; 2DL4 A; 2J6F A; 5IXF A; 4JJC A; 1KSW A; 1H92 A; 3IQL A; 2KT1 A; 2ED1 A; 4AG2 C; 4RTW A; 5IHK A; 1UEC A; 2O9V A; 1AWO A; 4F16 A; 4IIO A; 1BK2 A; 1RUW A; 1G83 A; 2FPE A; 2ROT A; 1TG0 A; 2PTK A; 1NEB A; 1X69 A; 4J9G A; 1HSQ A; 4Y92 A; 4FSS A; 2A28 A; 2CSI A; 3NGP A; 2JS0 A; 4J9H A; 1U3O A; 2L3P A; 2ROL A; 1UE9 A; 4RTV A; 1ZUY A; 1Y57 A; 2KRS A; 2JM8 A; 2L3Q A; 1T0H A; 1W70 A; 1N5Z A; 5I22 A; 3PVL A; 4E6R A; 3REB B; 1QLY A; 3VS7 A; 2DBK A; 2CUD A; 1A0N B; 2HBW A; 1HJD A; 4LN2 A; 1M27 C; 1E7O A; 1SHF A; 4HXJ A; 4CC7 A; 1PKS A; 1K0X A; 1AEY A; 2MOX A; 1KIK A; 4ESR A; 1LCK A; 1WXB A; 2RQR A; 2HEQ A; 1X2K A; 1UHC A; 1AD5 A; 1RI9 A; 1BBZ A; 4LUE A; 2HCK A; 5EC7 A; 3VS1 A; 1MV0 B; 1JXM A; 1T0J A; 4Z88 A; 3PVQ A; 4AFQ C; 4GBQ A; 1OEB A; 2A36 A; 2KYM A; 4J9F A; 1SPK A; 2C0I A; 1WLP B; 3RBB B; 2GGR A; 3A98 A; 4HVW A; 2LNH B; 2NWM A; 3THK A; 1ZBJ A; 2YDL A; 5I11 A; 2M0Y A; 3SHW A; 1CSK A; 3H0F A; 1MUZ A; 2MIO A; 1PNJ A; 1WXU A; 2P4R A; 2B86 A; 1M30 A; 1ZSG A; 1WYX A; 1JEG A; 4WCI A; 3M0U A; 4LUD A; 1M3C A; 5FWC A; 1ZX6 A; 3CQT A; 3UAT A; 3UF4 A; 2L3S A; 1AWW A; 1YWO A; 1ZLM A; 2F2V A; 2XMF A; 3H0H A; 2VWF A; 5IHI A; 4AFS C; 2J05 A; 1NG2 A; 2EW3 A; 1K0S A; 1FYN A; 1UJY A; 2L0A A; 1JQQ A; 2VVK A; 2GBQ A; 2ED0 A; 1UGV A; 1FMK A; 2G6F X; 1WDX A; 1V1C A; 2DE0 X; 2EBP A; 1T3S A; 2YUQ A; 3RNJ A; 2JXB A; 3VRZ A; 1WFW A; 2KBT A; 1EFN A; 2E5K A; 2O9S A; 1OV3 A; 1QKW A; 4J9E A; 2F2X A; 2EGA A; 3NHN A; 4JJD A; 2D1X A; 2GQI A; 2KYB A; 2L2P A; 1UFF A; 1JO8 A; 2W10 A; 1SHG A; 4J9D A; 3TSW A; 3EG0 A; 2LQN A; 2MCN A; 2LJ0 A; 2FEI A; 1NLO C; 2D0N A; 2DL8 A; 2HDA A; 1VA7 A; 2C0O A; 2PNI A; 2CT3 A; 1X6G A; 3JV3 A; 2A37 A; 4Z89 A; 3M0P A; 1UDL A; 2KGT A; 4DEX A; 2CT4 A; 4AFZ C; 4RTY A; 1RLQ C; 1YN8 A; 1TUD A; 3O5Z A; 4J9B A; 4J9I A; 1X43 A; 1E6G A; 2DYB A; 3NPF A; 2YT6 A; 1HD3 A; 2DIL A; 2ENM A; 3LH5 A; 4ORZ A; 2PZ1 A; 1QWE A; 1JXO A; 1WI7 A; 4AG1 C; 2RNA A; 3M0T A; 3EG3 A; 2ECZ A; 2JS2 A; 1GBQ A; 2KE9 A; 1PRM C; 2W0Z A; 1W1F A; 4RTT A; 2JTE A; 1X27 A; 1VYV A; 1NYF A; 2I0N A; 2FG0 A; 1K4U S; 2DL5 A; 1QCF A; 2CH4 W; 2K2M A; 3VS4 A; 4DEY A; 5ECA A; 2DL3 A; 2FPF A; 4LE9 A; 4OMP A; 2QDL A; 2KXC A; 4LNP A; 1SRL A; 1VYT A; 4ZNX A; 3M0S A; 2KT8 A; 3C0C A; 1UG1 A; 5FW9 A; 2AZS A; 1B3Q A; 3U23 A; 2RMO A; 5FWB A; 5GJV B; 1E6H A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3KFV A; 3S6W A; 4XK8 E; 3QII A; 3OYH A; 2DLP A; 3G4S T; 2DPP B; 3KXT A; 2H8H A; 5I2M A; 2DVJ A; 2C0T A; 2CZ6 B; 2KRO A; 3SWN A; 4FT2 A; 2DK3 A; 1NPR A; 1OQK A; 2EGC A; 3A8O B; 2LQK A; 1VQ4 A; 3M0R A; 3JCM g; 5GAN d; 2DL7 A; 3OBW A; 5FLX E; 3JB9 H; 2GFA A; 1YBY A; 3E19 A; 4ZGD B; 1VQO Q; 4X1V A; 3VS0 A; 3MO8 A; 1NZ9 A; 2A08 A; 4RTX A; 1UGP B; 4C8Q D; 3OYM A; 2DRM A; 2JVV A; 1YI2 Q; 3I9Q A; 3JCM f; 2RF0 A; 2CP0 A; 4OVA A; 3CCV Q; 3DLL A; 2YLC A; 5GAM f; 1V29 B; 3HP9 A; 3CC7 A; 1VQ4 T; 2HL3 A; 4GY5 A; 1KQS P; 2WSC E; 1PWT A; 1YWP A; 3SWN C; 4JS5 A; 1Y7X A; 2AK5 A; 1JB0 E; 2HQH A; 4M78 G; 1VQ5 Q; 5D7U A; 4O6J A; 5GMK j; 2VKN A; 3NTH A; 4HT8 A; 3OYE A; 2D9T A; 1W2B P; 4OMO A; 3JCM e; 5FRN A; 2EYY A; 3C95 A; 3J80 E; 4AMC A; 4C92 G; 2LQ8 A; 3EHR A; 4MMK A; 2GQV A; 1QMC A; 3CC7 T; 1NE8 A; 4OMM A; 4IIM A; 1AOJ A; 3EH1 A; 3RUX A; 4D8K A; 1BI0 A; 3QZ9 B; 3JCM c; 2K5F A; 4JRQ A; 1PG5 B; 3CCL A; 1T3L A; 4IUR A; 2RI5 A; 1Q82 C; 1AZE A; 5HCK A; 4F17 A; 1ABQ A; 4HVU A; 1K9M C; 1SRM A; 2LQW A; 1H3H A; 4IUQ A; 1N8R C; 2EQK A; 2K6D A; 4IUU A; 1S1N A; 1D1B A; 2F2W A; 3D7S B; 3PIP A; 2QGG A; 1WZO A; 2ZZD A; 1BI2 A; 1M9S A; 2AT1 B; 2K79 A; 4OB0 B; 1YJ9 A; 2RD1 A; 5GMK e; 3CCL T; 1K76 A; 2FO0 A; 2HSP A; 2DM1 A; 1RAG B; 1VIF A; 1ACM B; 2JOY A; 4HKE A; 3L2R A; 1O9S A; 4DBR A; 1Q7Y U; 2DBM A; 4XAX B; 3QHS A; 1MMG A; 1LVK A; 3UA6 A; 2E3I A; 3I56 A; 3PMI A; 2DTO A; 3MPU B; 4MDW A; 4F14 A; 2LX7 A; 1K73 U; 3CCU A; 3CXC P; 1ZUK A; 1M3A A; 1YJ9 T; 2J7I A; 3OB9 A; 2RHI A; 2CRE A; 3DKM A; 1LPL A; 2VC8 A; 1VQ6 Q; 2CZ7 B; 4M7D D; 1OYX A; 3BY7 A; 2AZV A; 3I35 A; 4OML A; 4FM4 B; 1OPK A; 3LH0 A; 1MMD A; 4EMK B; 1Z9Q A; 3JRZ A; 1OOT A; 3CCJ A; 3I56 T; 2JTM A; 4A63 B; 2CSQ A; 2GF7 A; 3CCU T; 1Y0M A; 1LOJ A; 1NM7 A; 3SWN B; 4M77 A; 2CYZ B; 3JCM J; 2RI3 A; 4OMN A; 1QVF A; 1WIE A; 1BI1 A; 1HXD A; 2YUO A; 1PKT A; 4Z02 A; 2QXF A; 3UWN A; 1WHL A; 4QVD A; 1X6B A; 2VAS A; 4JZ3 A; 4B6M A; 3PE0 A; 5CCA A; 2DA9 A; 3SEM A; 2ZPG B; 1SSF A; 1YIJ Q; 1I81 A; 3FC3 A; 3CCJ T; 2KQW A; 2IPO B; 5IXF A; 2HBP A; 1PCX A; 4QVZ A; 1H92 A; 2C06 A; 3C12 A; 2KT1 A; 3HL8 A; 4BDZ A; 1WHJ A; 4FYV B; 1VQL Q; 1VQN A; 2O9V A; 1AWO A; 1Q95 G; 1WNL A; 1VQM A; 1G83 A; 1R0C B; 3GNF B; 4M77 C; 2PTK A; 3WVD B; 4Y92 A; 5FRO A; 2CP7 A; 2A28 A; 3S3M A; 1XTD A; 2JS0 A; 3QUI A; 3FJP A; 1Q81 U; 1TH7 A; 2E12 A; 2MWO A; 4A4E A; 3JCM b; 1VQ5 A; 3GIB A; 1W70 A; 3M54 A; 5CVI A; 3I55 T; 1YCY A; 2MK5 A; 4LD6 A; 4IUV A; 1IGQ A; 2EJ9 A; 4NS5 A; 2YRV A; 4J6W A; 4JJN K; 1VQN T; 3P8H A; 1VQM T; 2HZY A; 3BW1 A; 1VQ7 Q; 1E7O A; 1Q7Y R; 2K2V A; 1N27 A; 5CK9 A; 3EAE A; 2QAZ A; 4PJJ A; 2RHU A; 4ESR A; 2YWW A; 2EIF A; 1LCK A; 1VQ5 T; 1K73 R; 2HEQ A; 1X2K A; 3QPH A; 1MV0 B; 5CKF A; 2BUD A; 4PNO A; 3PVQ A; 1GXI E; 4J9F A; 5LJ3 d; 1SPK A; 2RK2 A; 2GGR A; 4HVW A; 2DD4 A; 2LNH B; 2NWM A; 3TCJ A; 3A8G B; 1PC0 A; 2HAX A; 5I11 A; 1VIE A; 3N5B B; 1MUZ A; 2XKO C; 1PNJ A; 3EG9 A; 2B86 A; 1WYX A; 3EGX A; 4WCI A; 3J81 E; 1W4S A; 4A4K A; 2JJ9 A; 2L3S A; 5LJ5 h; 3EFR A; 4QKU A; 4CI0 C; 2RM4 A; 5LJ5 d; 4AFS C; 3GNG A; 5A0G A; 1NG2 A; 2EW3 A; 2QI2 A; 3OS0 A; 1FYN A; 2L0A A; 4M78 F; 4M77 E; 2ED0 A; 1UGV A; 1RL2 A; 4E47 A; 2ZPB B; 2DXC A; 4FT4 A; 2HSE B; 1EX4 A; 4XU1 A; 2FZC B; 1QKW A; 4J9E A; 4C92 F; 1MHN A; 2D1X A; 1VQ6 A; 3HFN A; 1RAE B; 3MEV A; 3NTI A; 3CCE A; 3G6E Q; 3EG0 A; 2ZGW A; 2OTL Q; 4J6X A; 2LJ0 A; 2KSS A; 4MML A; 2MWP A; 2L3R A; 4OP0 A; 4B9W A; 5KYN A; 3OW2 A; 1WPY A; 4MZM A; 1UDL A; 1KQ2 A; 1EIF A; 2KGT A; 4DEX A; 4NL3 A; 4J7F A; 4M77 B; 4RTY A; 1QVF S; 4J9B A; 1VUB A; 3JCM P; 1E6G A; 1Q81 R; 4XTV A; 4PJO D; 1FWZ A; 5LL6 S; 1HD3 A; 1ZSZ A; 2HL5 C; 2KMT A; 3CCR A; 1VQ6 T; 2MAM A; 2DXB A; 3CCE T; 1WI7 A; 4FL6 A; 1Q82 U; 5HK0 A; 3H9N A; 3EG3 A; 2JS2 A; 3H8Z A; 2W0Z A; 3ER0 A; 1W1F A; 1N6A A; 2LCL A; 4RCC A; 2OX7 A; 1VYV A; 1NYF A; 1Q7Y C; 4PK4 A; 2FG0 A; 2X4J A; 4PFP A; 3VS4 A; 1G3W A; 4LE9 A; 1IRX A; 1M1K R; 3CME A; 1VQ8 Q; 3VUB A; 2NYS A; 2KXC A; 4LNP A; 4F7U B; 2V8J A; 3P8B B; 3M0S A; 2KT8 A; 1Y96 A; 5FW9 A; 3CCR T; 3JB9 D; 3LX7 A; 2YT6 A; 4M7A D; 2QEX Q; 2RI2 A; 3CD6 A; 1IO6 A; 1ZSZ C; 4R55 A; 4FYX B; 5GAO l; 1VQK A; 2V8I A; 2LCS A; 1D3B A; 2MF2 A; 3H0I A; 3A8L B; 1D0Z A; 3ZEH A; 3L2V A; 3M5A A; 1GL5 A; 2H3E B; 2QDY B; 3CME T; 2Y90 A; 2VB6 A; 2OAW A; 2RK1 A; 4ZTF A; 1Y71 A; 2QA4 A; 2GTJ A; 2M9U A; 1EZZ B; 1IHV A; 5M9O A; 1VQ7 A; 2V1R A; 1OX9 A; 1S72 Q; 2K5L A; 4CC3 A; 3CD6 T; 2LJ3 A; 5HKC A; 1PD1 A; 4KH0 B; 3OYN A; 1VQK T; 1AWJ A; 3OMC A; 2Y4X A; 2VYT A; 2K9G A; 4JJB A; 2JMC A; 3VS6 A; 3LW5 E; 1VOM A; 2I2L A; 1TOV A; 2ATC B; 4ELY C; 5I21 A; 4GLK A; 1RAA B; 2QA4 T; 4PFO A; 3QWX X; 3QZ5 B; 1XQH A; 2DXU A; 2PUO B; 3QJ6 A; 1VQ7 T; 3EG9 B; 5A0D A; 2FVU A; 5KE3 A; 1XNI A; 3SDZ A; 1WA7 A; 2RQV A; 3EGX B; 1FMW A; 2XG8 D; 1Q81 C; 3BE3 A; 2JM9 A; 1BB9 A; 3EG2 A; 4GLM A; 2XDB A; 3L2Z A; 3ZL7 C; 2ESW A; 2O31 A; 4YTL A; 2WAC A; 5DM7 R; 1GFD A; 3JCM V; 1Q82 R; 2D8H A; 5CKD A; 2K3Y A; 1D0X A; 2COZ A; 1WX6 A; 3M59 A; 3HRU A; 1K9M R; 5GAN 8; 1MND A; 2GTO A; 1N8R R; 4M77 D; 4M75 G; 3CC2 A; 4BI3 A; 2FRY A; 5L23 A; 1I5O B; 4QT7 A; 4RTU A; 3X20 B; 3QBY A; 3JCM h; 2CP2 A; 2M51 A; 4C0F A; 2KK4 A; 3TSZ A; 2NUZ A; 3MEU A; 1PM3 A; 1PSF A; 1CKA A; 2E10 A; 1YJW Q; 2K7A A; 3V7S A; 3A5Z B; 2CZ0 B; 2QQA A; 2KDS A; 4F7U G; 2KXD A; 5GMK i; 5IN1 A; 5J3B A; 1GCQ A; 3HTR A; 4L59 A; 4M7D B; 1ZSZ B; 3I5R A; 2KR3 A; 3CC2 T; 2X4X A; 4FU6 A; 3TVT A; 2EGE A; 3OQ5 A; 4HVV A; 1OU9 A; 2BZ8 A; 2NUT A; 4II1 A; 2DFU A; 4C8Q G; 5GAM j; 1MNE A; 1CKB A; 2PVG B; 1AWX A; 2QYZ A; 3QDF A; 2RA2 A; 3OYC A; 2DVE A; 1AVZ C; 4C5I A; 5GAM g; 2LZ6 B; 3BDL A; 5IH2 A; 2YRD A; 4BDY A; 2RN8 A; 3JB9 I; 3GBQ A; 1UHF A; 2DZC A; 2XK0 A; 3URG A; 1QVG S; 1IXD A; 1DJ7 B; 2LP5 A; 5GMK h; 5KCO A; 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