The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
10
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sequence length |
60
|
structure length |
60
|
Chain Sequence |
MDQPCCRGLYDFEPENQGELGFKEGDIITLTNQIDENWYEGMIHGESGFFPINYVEVIVP
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structural Basis for the Binding Specificities of Huntingtin Proline-Rich Region with SH3 and WW Domains
rcsb |
| molecule keywords |
SH3-containing GRB2-like protein 3
|
| molecule tags |
Signaling protein
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
10
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| structure length |
60
|
| sequence length |
60
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-11-02 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF07653 | SH3_2 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1WDX A; 2LP5 A; 2O9V A; 3VS4 A; 2ROT A; 4DEY A; 5FW9 A; 1XOV A; 2CRE A; 2EYX A; 3EG0 A; 1ARK A; 1HD3 A; 1PHT A; 1VYV A; 2J6K A; 1B07 A; 1NYF A; 2DRK A; 2L3Q A; 3UF4 A; 1AD5 A; 1RLQ C; 1RI9 A; 2DE0 X; 2CSI A; 2MOX A; 1AWO A; 3M0S A; 5IXF A; 4J9C A; 1U5S A; 3VS1 A; 2EPD A; 2FPF A; 1VYT A; 5ECA A; 1CKA A; 2F2X A; 3M0P A; 1KSW A; 2OAW A; 2C0O A; 2DM1 A; 1BB9 A; 2O88 A; 1T3S A; 2FEI A; 2D1X A; 2HDA A; 2SEM A; 1W1F A; 4A63 B; 2BZY A; 1PNJ A; 2EKH A; 2DX1 A; 1ZUY A; 4J9D A; 4J9F A; 1G2B A; 1LCK A; 2YUP A; 1VYU A; 2A28 A; 3QWX X; 1JEG A; 2O31 A; 2VKN A; 1ZX6 A; 3NMZ C; 4CC7 A; 5IHK A; 1Y57 A; 2W10 A; 1ABQ A; 1AWX A; 1BU1 A; 1TUD A; 1UFF A; 2DA9 A; 4Z8A A; 3TSZ A; 3RBB B; 2DBK A; 1UTI A; 2LZ6 B; 2GNC A; 2KBT A; 1OEB A; 2A08 A; 1M3A A; 1HJD A; 4HVV A; 4AFS C; 5GJV B; 1X43 A; 2DMO A; 2OI3 A; 2JMA A; 2RQR A; 2DL4 A; 2YT6 A; 2HEQ A; 1QKX A; 3NPF A; 1M3C A; 1BK2 A; 1NLP C; 1N5Z A; 4ORZ A; 4X1V A; 1JXM A; 2CH4 W; 2L3S A; 4K11 A; 2CUB A; 1UHC A; 1ZLM A; 4HVU A; 2KE9 A; 2EGA A; 2V1R A; 1KIK A; 3LH5 A; 2YUO A; 3VS0 A; 5EC7 A; 4WCI A; 1WXU A; 3RNJ A; 3PVL A; 1EFN A; 2AK5 A; 2RNA A; 1ZBJ A; 2O9S A; 2F2V A; 4HCK A; 3I35 A; 2GQI A; 2K2M A; 3A98 A; 1T0J A; 2FPD A; 2KRN A; 2AZS A; 2RQW A; 3M0R A; 2K9G A; 1OPK A; 4CC4 B; 4OMQ A; 1PRM C; 2M0Y A; 3EHR A; 3UA7 A; 2LQN A; 4F16 A; 3VRY A; 2C0T A; 3M0T A; 4OMO A; 1QWF A; 2CSQ A; 1E7O A; 2RMO A; 2FG0 A; 4R0K A; 2FRY A; 2SRC A; 2IIM A; 5GJW B; 4LE9 A; 2JS2 A; 1RLP C; 1UHF A; 5L23 A; 4AG1 C; 1WXB A; 1QWE A; 3H0F A; 1T3L A; 1NEG A; 2PNI A; 1WX6 A; 1JO8 A; 2K7A A; 2RF0 A; 1UG1 A; 4JJD A; 2JS0 A; 3EG2 A; 1GBR A; 3ULR B; 2ESW A; 4AFQ C; 5IH2 A; 2D8H A; 1NLO C; 3I9Q A; 4Y92 A; 1YP5 A; 4AFU C; 1CKB A; 1WA7 A; 1X27 A; 4J9G A; 2EYY A; 1I07 A; 5FWC A; 4JJB A; 1H3H A; 1ABO A; 2F2W A; 1RUW A; 3ZL7 C; 2KEA A; 2GBQ A; 3EGU A; 3O5Z A; 3VS3 A; 4F17 A; 1AZG B; 1E6H A; 1JU5 C; 1W70 A; 1UJ0 A; 2EYW A; 2MIO A; 1UEC A; 3PVQ A; 2DYB A; 3IQL A; 1JXO A; 2JXB A; 2A37 A; 1MV3 A; 3CQT A; 3QWY A; 1M3B A; 1GBQ A; 2KNB B; 2EGC A; 4ESR A; 4EIK A; 1Z9Z A; 1AWJ A; 2VVK A; 3NGP A; 1WYX A; 2EGE A; 2KR3 A; 2I0N A; 2GTO A; 2O2O A; 2A36 A; 2X3X D; 3I5S A; 4IIO A; 2DL3 A; 2DBM A; 2G6F X; 2PTK A; 1U06 A; 1SSH A; 3PE0 A; 1CSK A; 3JV3 A; 1S1N A; 1B3Q A; 4OML A; 2AKK A; 2OJ2 A; 4J9I A; 1E6G A; 1TG0 A; 2K3B A; 2MCN A; 3TVT A; 2RN8 A; 1UDL A; 1M30 A; 2KYM A; 1WXT A; 1WI7 A; 2KXD A; 2QDL A; 2HSP A; 2ROL A; 4LNP A; 4RTX A; 2J6F A; 2HBW A; 1ZSG A; 2RQV A; 4OMN A; 4JJC A; 1AWW A; 2EVR A; 3VS5 A; 4LN2 A; 4LUE A; 1KJW A; 4GLM A; 2J06 A; 1VA7 A; 1IO6 A; 2DLP A; 2LX7 A; 2FPE A; 1SRL A; 3FJ5 A; 2CT3 A; 2GTJ A; 2K79 A; 2CDT A; 4CC2 A; 1WIE A; 2D8J A; 2KRS A; 2B86 A; 1QCF A; 1G83 A; 1T0H A; 2BZ8 A; 3NHN A; 2LCS A; 3REB B; 1PWT A; 1YWP A; 2EBP A; 2K6D A; 1K4U S; 4RTT A; 1AZE A; 2L2P A; 2HCK A; 1SEM A; 4J9H A; 1X69 A; 2FO0 A; 3M0U A; 2H8H A; 5IHN A; 1YCS B; 1OPL A; 2JM8 A; 2EQI A; 4RTZ A; 1UGV A; 2CH4 A; 1ZUU A; 2KGT A; 1AVZ C; 2DL7 A; 4D8D A; 1MUZ A; 2P4R A; 3REA B; 2X3W D; 1U3O A; 1W6X A; 2D0N A; 2DL5 A; 5I22 A; 4CC3 A; 3I5R A; 3M0Q A; 1X2Q A; 2AKL A; 1UJY A; 1YWO A; 1TUC A; 1K0S A; 1I1J A; 4JZ4 A; 1GCQ A; 4GBQ A; 2M51 A; 1SHF A; 2ED1 A; 2L3P A; 1SRM A; 2ENM A; 1X6B A; 2NUZ A; 4IIM A; 1KFZ A; 1SPK A; 2DNU A; 3EG3 A; 1PRL C; 4DEX A; 2KXC A; 1H8K A; 1QLY A; 2CT4 A; 2BTT A; 4Z88 A; 2JMC A; 4HXJ A; 4RTV A; 2AZV A; 2DF6 A; 2LJ1 A; 1NYG A; 2RQT A; 2ECZ A; 2J05 A; 2BZX A; 2KYB A; 1HSQ A; 1FYN A; 2J6O A; 2EYZ A; 3SHW A; 2JTE A; 4RUG A; 4D8K A; 1GL5 A; 2LQW A; 2YDL A; 1M27 C; 4QT7 A; 4RTU A; 1M8M A; 1NM7 A; 1OOT A; 2GGR A; 3VS7 A; 1PKS A; 2YSQ A; 4AG2 C; 1K0X A; 3KFV A; 3H0H A; 4KRT A; 2VWF A; 1YN8 A; 2RPN A; 4ZNX A; 3C0C A; 2E5K A; 1NEB A; 3SEM A; 2XMF A; 1X6G A; 3H41 A; 3VS6 A; 1V1C A; 2L0A A; 1JQQ A; 1AOJ A; 1FMK A; 5HCK A; 4JZ3 A; 2DVJ A; 5IXB A; 2DIL A; 1GCP A; 2W0Z A; 2C0I A; 2YUN A; 1AEY A; 1Z9Q A; 1GCQ C; 2ED0 A; 4RTY A; 3GBQ A; 2DL8 A; 4JPB W; 1BBZ A; 4J9E A; 1YNZ A; 4OMP A; 1K1Z A; 5I11 A; 1K9A A; 3EG1 A; 2JT4 A; 2KRO A; 1GFD A; 4F14 A; 4OMM A; 4LUD A; 1A0N B; 2DRM A; 1X2K A; 3UAT A; 2RQU A; 1PKT A; 2LJ0 A; 1K76 A; 4HVW A; 4M4Z A; 1MV0 B; 2JM9 A; 4J9B A; 2LNH B; 2ABL A; 3H0I A; 1OV3 A; 1WLP B; 5IHI A; 1UUE A; 2KT1 A; 4AFZ C; 4RTW A; 3TSW A; 2V1Q A; 5FWB A; 1I0C A; 1Y0M A; 1QKW A; 1ZUK A; 2KRM A; 3VS2 A; 1NG2 A; 3VRZ A; 4E6R A; 1GRI A; 1UE9 A; 3THK A; 3U23 A; 1WFW A; 3UA6 A; 2JW4 A; 2J7I A; 1H92 A; 2YUQ A; 1SHG A; 3R6N A; 2LJ3 A; 2KT8 A; 4FSS A; 1GFC A; 2NWM A; 2PZ1 A; 2EW3 A; 2CUD A; 2DJQ A; 2FRW A; 2LMJ A; 1J3T A; 4Z89 A; 3EHQ A; #chains in the Genus database with same CATH topology 5KYW A; 1WDX A; 4N4G A; 3SFM A; 3VS4 A; 5KYW B; 3A8L B; 3A8G B; 4ATO A; 1XOV A; 1ARK A; 1HD3 A; 1PHT A; 4CI0 C; 3CPW S; 1OZ3 A; 4PJO D; 1WHJ A; 4PJO E; 2E1H A; 1TUG B; 3DKM A; 2BKD N; 1VQN T; 4LDW A; 1AWO A; 3RER A; 1M8V A; 3M0S A; 3JCM V; 5IXF A; 3CC2 T; 1U5S A; 4PJO G; 1KD1 U; 2EPD A; 2L3R A; 1K73 C; 1IGQ A; 2MWO A; 2FEI A; 2HDA A; 3VU3 C; 2SEM A; 4M7A C; 2BZY A; 2DX1 A; 2DIG A; 3CXC S; 3BFM A; 4OB2 B; 2A28 A; 2XG8 D; 2E10 A; 2VKN A; 3NMZ C; 4HKE A; 4J6Y A; 2HKN A; 1VQ4 A; 1FWZ A; 1BU1 A; 1AWX A; 1UFF A; 4PFP A; 1LOJ A; 2LZ6 B; 1VUB A; 1M90 R; 2E6Z A; 2R5A A; 1OEB A; 2QTX A; 3UWN A; 3QSU A; 3FLG A; 3EAE A; 4JS4 A; 3MJX A; 3X26 B; 2RQR A; 2ZZD A; 3JCM J; 3P8B B; 5FU7 C; 1PM3 A; 2OAU A; 5GAN 4; 1FX7 A; 3M56 A; 4X1V A; 1JXM A; 2LT4 A; 2L3S A; 4K11 A; 4IKF A; 3HRT A; 1OU8 A; 1MHN A; 3G6E A; 2JZ2 A; 3OS2 A; 1G3W A; 3LH0 A; 4DBF A; 3A1P A; 4NS5 A; 2YUO A; 4KH0 B; 2DPP B; 3CPF A; 4A4H A; 1WXU A; 3PVL A; 2DD4 A; 3URG A; 2AK5 A; 2RNA A; 2F2V A; 4KUL A; 3L2W A; 3G71 Q; 3PIO A; 2FPD A; 3PMI A; 2RQW A; 3M0R A; 3RMQ A; 4CC4 B; 3JCM e; 2WSE E; 2M0Y A; 3UA7 A; 3RR6 A; 4F16 A; 5GAN 5; 5KE3 A; 4OMO A; 4PNO A; 4PJO C; 1QVG A; 5GJW B; 2FRY A; 2IIM A; 4LE9 A; 1YJN Q; 4EDU A; 3CCL T; 3GLX A; 1NEG A; 4IUQ A; 2CZ7 B; 4A4K A; 2QA4 T; 3PTA A; 1WX6 A; 1BIB A; 4JJD A; 3ULR B; 5IH2 A; 1JJ2 A; 2D8H A; 4IUR A; 4M75 D; 5GAM e; 1RAA B; 4Y92 A; 5CVI A; 3UPU A; 1CKB A; 3QZ9 B; 2XDB A; 2MI6 A; 5FWC A; 3GP8 A; 1Y71 A; 2XI9 A; 3CME T; 1RUW A; 3ZL7 C; 2KEA A; 3EGU A; 3O5Z A; 1TWB A; 5KYN A; 2K5F A; 3QJY A; 3BDU A; 1VQ6 A; 4QVD A; 2VGM A; 1W70 A; 1NZ9 A; 1SG5 A; 1UJ0 A; 2EYW A; 2JUF A; 1UEC A; 2PUK B; 1RAG B; 2YWW A; 1JXO A; 3CQT A; 3QWY A; 4PLI A; 3SB2 A; 1W2B S; 2FHD A; 3CXC A; 2BIV A; 4RCB A; 3QDR B; 2EJG A; 4Z02 A; 3J80 E; 2A36 A; 4LDU A; 3E9G A; 1RAI B; 4E7J A; 4ZN1 A; 2G6F X; 3JCM W; 4CRI A; 4OVA A; 1Y7X A; 4O5V A; 2ATC B; 1QCN A; 1KC8 U; 2PUO B; 3C4S A; 2PVG B; 2GF7 A; 3OYH A; 4QQD A; 1YBY A; 5A0G A; 1DJ7 B; 4N4I A; 2RN8 A; 3CCJ T; 3HFN A; 1WI7 A; 4DA4 A; 2DYI A; 1QMC A; 2HSP A; 2AIR B; 4P5N A; 2VGN A; 5M9O A; 3EH1 A; 2HBW A; 4XTZ A; 4A53 A; 9ATC B; 2LCC A; 3RMS A; 4JJC A; 3JAM E; 3CCS A; 1AWW A; 2EVR A; 4LN2 A; 2RA2 A; 1KJW A; 1VA7 A; 4M7D G; 2DLP A; 5GAM j; 2FPE A; 1SRL A; 3RKX A; 1NPP A; 2CDT A; 5KYX A; 3KUF A; 3CCE A; 5KYX B; 2GFU A; 2EIF A; 2BZ8 A; 4ME7 A; 2LCS A; 5FRM A; 4LDX A; 1YWP A; 2EBP A; 1VQ9 A; 1SF9 A; 1I4K 1; 3V7R A; 3M57 A; 3NTK A; 1YJW A; 3JB9 H; 3PGG A; 2FO0 A; 2DEQ A; 2H8H A; 4RTZ A; 1I5L A; 1TTH B; 3QHS A; 3ZFJ A; 1AVZ C; 1VQ8 A; 2X4Y A; 1C6V X; 2X3W D; 2Y90 A; 3JB9 D; 1BCO A; 5LJ5 f; 4NL3 A; 2DL5 A; 4J7I A; 5I22 A; 2RHU A; 2VYT A; 1YHQ T; 1BI1 A; 4HCZ A; 1X2Q A; 2AKL A; 1UJY A; 1O75 A; 1YWO A; 2M51 A; 4MZT A; 2ED1 A; 3JB9 G; 1AHJ B; 3J81 E; 2XID A; 2XK0 A; 1S72 A; 3QPH A; 4N0A A; 2IG0 A; 1KFZ A; 1RL2 A; 2M9U A; 2CT4 A; 2QQ9 A; 3JCM g; 4Z88 A; 5C6S A; 4HXJ A; 4C8Q A; 5CR2 A; 1K73 R; 4FT4 A; 1BCM A; 4C8Q B; 3OW2 A; 3V7S A; 1HSQ A; 2A3L A; 1FYN A; 4XQ3 A; 1VQ5 T; 2EYZ A; 2CP3 A; 4D8K A; 1K8A R; 4DOW A; 4RTU A; 5FLX E; 3M4G A; 2YRV A; 2QYZ A; 2YSQ A; 4PLL A; 3QZ5 B; 3C0C A; 5IAY A; 3JB9 I; 2E5K A; 4M7D C; 4J83 A; 5KCH A; 3C95 A; 5GAM g; 2FYK A; 1V1C A; 2L0A A; 5I2M A; 2F69 A; 2HSE B; 3QG1 A; 5IXB A; 1HXD A; 5LJ3 f; 1BBZ A; 2O4X A; 1WJS A; 3OYF A; 1QP2 A; 2O4X B; 3VV0 A; 3NTI A; 4J5Y A; 1Q95 G; 3MPU B; 2JT4 A; 3GOX A; 1GFD A; 4L59 A; 1BIA A; 4F14 A; 3PMT A; 3ER0 A; 1PKT A; 3E2U A; 3X20 B; 2JM9 A; 2EQK A; 1R8O B; 3D7S B; 4M77 A; 2LNH B; 4M77 B; 2VXF A; 1OV3 A; 1UUE A; 2QQS A; 4GY5 A; 1G8X A; 2LVM A; 2CP5 A; 2QA4 Q; 2YLB A; 5FWB A; 2Y4X A; 1KQS A; 4LDY A; 4XU1 A; 1GRI A; 4BD3 A; 3THK A; 1VIF A; 5HKC A; 1YI2 T; 2P0K A; 1B7T A; 2JW4 A; 1WGS A; 4BE2 A; 3AT1 B; 3CME Q; 2CUD A; 2DJQ A; 5GAN e; 3G71 A; 3SWN C; 2LMJ A; 1GXI E; 2RK2 A; 4A54 A; 4KGZ B; 3EHQ A; 2HL3 A; 1KG1 A; 3OBW A; 3Q1J A; 4LD9 K; 2EYX A; 4PKC C; 1NYF A; 4DBH A; 2HBP A; 1AD5 A; 3UF4 A; 1K9M C; 1YJN A; 3L2V A; 3VKI A; 1D1B A; 3CMA T; 3M58 A; 1G3S A; 2KDS A; 3TEE A; 4M77 F; 5ECA A; 1CKA A; 3M0P A; 3OMC A; 2PVO B; 1T3S A; 3OMG A; 4FYW B; 2D1X A; 2EKH A; 2RHX A; 4J9D A; 3JCM h; 2YUP A; 3VUZ A; 1K9M U; 4C5E A; 1JEG A; 2O31 A; 1ZX6 A; 2M02 A; 3GNG A; 2QAS A; 4MZP A; 4C0D B; 3FC3 A; 1MMG A; 5CKD A; 4BAC A; 1ZBX A; 5KYU A; 4BE1 A; 2VXE A; 1RAD B; 3OYJ A; 1UTI A; 5KYU B; 1LPL A; 2GNC A; 3OYC A; 5GJV B; 5GAM h; 1YIJ Q; 1UGR B; 5FRN A; 5CKF A; 2PU9 B; 2HEQ A; 1QKX A; 2LX9 A; 2QDY B; 5GAN 2; 5J26 A; 1BK2 A; 1NLP C; 1NPR A; 4LD6 A; 1KQ1 A; 3KXT A; 1UHC A; 4M78 D; 1ZLM A; 4M78 E; 4HVU A; 3E9F A; 4FW1 A; 5DM7 R; 5GAN j; 1SSF A; 1X75 C; 3QUI A; 2EGA A; 2LC4 A; 1KIK A; 3PIP A; 3VS0 A; 4M78 G; 4WCI A; 2QXF A; 4DBQ A; 1ZHI A; 2M16 A; 1ZBJ A; 2O9S A; 5DLO A; 5GAN 7; 3C94 A; 2JTF A; 4L5G A; 2B8A A; 5GAN 8; 2QTV A; 2KRN A; 1PCX A; 2FL7 A; 3G4S T; 1OPK A; 1XJW B; 1QVG S; 1VQM T; 1TXQ A; 2LQN A; 1YHQ Q; 1D1C A; 3VRY A; 3HPW A; 2L5Q A; 2DZC A; 3CCV T; 2C0T A; 2QK0 A; 1E7O A; 2VV5 A; 4C8Q D; 2FG0 A; 3CCM Q; 2RHY A; 5L8R E; 2SRC A; 4C8Q E; 3UT1 A; 3QKJ A; 4IUP A; 4KUD K; 5KH6 A; 2MYS A; 2E65 A; 4M75 F; 1JJ2 S; 3JCM X; 3RES A; 2QAZ A; 4X9C A; 4AG1 C; 4E47 A; 1WXB A; 1QWE A; 3H0F A; 1T3L A; 3V8L A; 1HK9 A; 4ZGD B; 3CC7 Q; 1JO8 A; 4C8Q G; 3PT9 A; 4AFQ C; 2DJZ A; 1YP5 A; 4AFU C; 4J6X A; 4C92 A; 1VQ5 Q; 1WA7 A; 4BY6 B; 4C92 B; 4MDW A; 4WF2 A; 4HA8 A; 4JJB A; 3BE3 A; 2GFA A; 3M53 A; 2HZY A; 2GBQ A; 2XD0 A; 4F17 A; 1Q81 C; 5LJ5 d; 1E6H A; 1JU5 C; 1WHG A; 1Q7Y C; 4B9X A; 1K8A C; 2YRC A; 1H64 1; 2DYB A; 3OYI A; 3IQL A; 2HAX A; 1MV3 A; 4QQ6 A; 1UGP B; 2ZPI B; 5I2S A; 1JBM A; 4VUB A; 3CCR T; 2IPO B; 4C5I A; 4ESR A; 4EIK A; 2CP6 A; 2VVK A; 1K73 U; 3QII A; 4X9D A; 5GAN g; 1WYX A; 2EGE A; 1QVF S; 2I0N A; 1M1G A; 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