The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
10
|
sequence length |
60
|
structure length |
60
|
Chain Sequence |
MDQPCCRGLYDFEPENQGELGFKEGDIITLTNQIDENWYEGMIHGESGFFPINYVEVIVP
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structural Basis for the Binding Specificities of Huntingtin Proline-Rich Region with SH3 and WW Domains
rcsb |
| molecule keywords |
SH3-containing GRB2-like protein 3
|
| molecule tags |
Signaling protein
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
10
|
| structure length |
60
|
| sequence length |
60
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-11-02 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF07653 | SH3_2 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1ZSG A; 5GJW B; 1NYF A; 2A36 A; 2C0I A; 5ECA A; 2F2X A; 3EG1 A; 2JM8 A; 3H0I A; 2AKL A; 1Z9Z A; 1H92 A; 1QKX A; 3U23 A; 1Y0M A; 4GLM A; 4JJC A; 1M3A A; 1UJ0 A; 1JXM A; 1W6X A; 2DL4 A; 3THK A; 4J9D A; 1ZLM A; 2AKK A; 2YT6 A; 3M0R A; 1K0X A; 2HDA A; 3VRY A; 4QT7 A; 4JJB A; 2KT8 A; 2RMO A; 1CKB A; 2VKN A; 2JMC A; 2K79 A; 4CC7 A; 1M30 A; 2LZ6 B; 1HJD A; 4LNP A; 1PWT A; 1M3C A; 2YSQ A; 3QWY A; 1YP5 A; 4CC4 B; 2K6D A; 2LX7 A; 1U5S A; 5I22 A; 1RLQ C; 2BZX A; 1WFW A; 2YUO A; 1WX6 A; 2DJQ A; 2AK5 A; 3VS0 A; 4X1V A; 5IHK A; 1SPK A; 1I1J A; 2J6F A; 2BZY A; 2FO0 A; 4AG2 C; 1GFC A; 1WIE A; 2FG0 A; 1UG1 A; 3GBQ A; 2DM1 A; 4A63 B; 4EIK A; 2KE9 A; 1H8K A; 3TSZ A; 1AZG B; 2JS0 A; 2JW4 A; 2J6O A; 1G83 A; 1AWJ A; 5EC7 A; 1YN8 A; 1QCF A; 2EW3 A; 4RTY A; 2DL5 A; 2EGE A; 1VYV A; 1G2B A; 1UHC A; 2YUP A; 3NPF A; 1PHT A; 1QKW A; 2EYW A; 4WCI A; 2LMJ A; 1Z9Q A; 1WLP B; 3JV3 A; 1JU5 C; 2ABL A; 1JQQ A; 4HVW A; 1QWF A; 3UA6 A; 2LJ1 A; 3I35 A; 2MIO A; 1U3O A; 2KYM A; 2M51 A; 3IQL A; 2L3P A; 2RQR A; 4ORZ A; 4Y92 A; 1BB9 A; 1AOJ A; 2EQI A; 3R6N A; 2A28 A; 1SSH A; 1U06 A; 3VS7 A; 3VS1 A; 1AZE A; 3M0T A; 2KBT A; 1BK2 A; 3EG0 A; 1E7O A; 2D0N A; 2DL8 A; 2EGC A; 2FEI A; 1WA7 A; 1W70 A; 1XOV A; 2FRY A; 2DA9 A; 1E6G A; 2JXB A; 2ROT A; 2FPF A; 2K9G A; 1OPL A; 1RLP C; 2O9V A; 4Z88 A; 2A37 A; 4GBQ A; 2EYY A; 4HVV A; 1KIK A; 2CH4 A; 3A98 A; 1VYT A; 1YCS B; 2SEM A; 1CSK A; 1KJW A; 1YWO A; 2FPD A; 2RN8 A; 2PTK A; 1M27 C; 2CH4 W; 4OMN A; 1T3S A; 1AD5 A; 1OV3 A; 1QLY A; 2KT1 A; 4AFU C; 1AVZ C; 1K9A A; 5IXB A; 5IHN A; 2MOX A; 2DE0 X; 4RTX A; 1SRL A; 2OAW A; 4E6R A; 1UGV A; 2O9S A; 3EHR A; 4RTT A; 1SHF A; 1AWX A; 3REA B; 3EG3 A; 1LCK A; 1AWO A; 3H0H A; 2CUD A; 4RUG A; 3ULR B; 1PKT A; 3M0P A; 4M4Z A; 3M0U A; 1K76 A; 2YDL A; 1X2Q A; 2W0Z A; 5HCK A; 1PKS A; 1X69 A; 2YUN A; 4J9B A; 2RQV A; 2DRM A; 1AWW A; 5L23 A; 2RQW A; 1ABQ A; 2I0N A; 3PVQ A; 4AFZ C; 1WDX A; 3ZL7 C; 1H3H A; 4OML A; 2DL7 A; 1GCQ C; 2DLP A; 1AEY A; 3PE0 A; 2KR3 A; 2ROL A; 1NM7 A; 4K11 A; 2O2O A; 1BBZ A; 1NG2 A; 2KYB A; 3QWX X; 1SHG A; 4AG1 C; 4J9F A; 4HCK A; 3EGU A; 2LQN A; 1SEM A; 3H0F A; 2NWM A; 1X6B A; 3VS6 A; 4Z8A A; 1Y57 A; 2LJ0 A; 2AZV A; 2DIL A; 1T0H A; 1MUZ A; 4D8D A; 1UTI A; 1ZBJ A; 2W10 A; 2DX1 A; 4J9I A; 4RTV A; 3SHW A; 5IHI A; 1K0S A; 2DNU A; 4OMO A; 3NGP A; 3LH5 A; 4RTW A; 1T3L A; 2C0T A; 2XMF A; 4LUD A; 2X3X D; 4F17 A; 1FMK A; 1ZUY A; 2DBK A; 4HXJ A; 2EVR A; 3NMZ C; 3H41 A; 1BU1 A; 1ARK A; 1GL5 A; 1K4U S; 2KXD A; 3REB B; 1ZUU A; 1MV0 B; 1GBQ A; 2HCK A; 2CUB A; 1GCQ A; 1UUE A; 1YWP A; 4J9E A; 1M8M A; 1M3B A; 2GQI A; 2DBM A; 2RF0 A; 4LUE A; 4IIO A; 2PZ1 A; 2L3S A; 4AFQ C; 1RUW A; 2CRE A; 2F2V A; 2GBQ A; 4KRT A; 1JEG A; 1UDL A; 1VA7 A; 1EFN A; 1KSW A; 2F2W A; 2E5K A; 3SEM A; 1KFZ A; 3RNJ A; 3UF4 A; 2EKH A; 4LE9 A; 1N5Z A; 1UJY A; 4RTZ A; 2CSI A; 1NLO C; 2G6F X; 1UEC A; 4JZ4 A; 1WXT A; 3EG2 A; 2C0O A; 2V1Q A; 5FWB A; 2A08 A; 2KXC A; 1PNJ A; 5FWC A; 2KRO A; 4Z89 A; 3VS5 A; 2DL3 A; 4J9C A; 2V1R A; 1K1Z A; 2YUQ A; 3VRZ A; 2FRW A; 2LQW A; 1PRL C; 3EHQ A; 1HD3 A; 3NHN A; 4AFS C; 4LN2 A; 2JMA A; 1QWE A; 1NEG A; 1V1C A; 2J6K A; 1W1F A; 2J7I A; 2CT3 A; 2EBP A; 3VS4 A; 2JT4 A; 2MCN A; 1NYG A; 3O5Z A; 2L2P A; 4ZNX A; 2ED0 A; 1WYX A; 1J3T A; 1MV3 A; 2PNI A; 4HVU A; 3UA7 A; 3I5R A; 1VYU A; 4ESR A; 1JO8 A; 2LJ3 A; 4DEY A; 2LP5 A; 3KFV A; 2D1X A; 4CC3 A; 1ABO A; 1TUC A; 1X43 A; 2IIM A; 2K2M A; 2HBW A; 3C0C A; 2J06 A; 5I11 A; 1UHF A; 4R0K A; 1JXO A; 1IO6 A; 1GFD A; 3PVL A; 2M0Y A; 3VS2 A; 1GRI A; 2GGR A; 4OMQ A; 2JS2 A; 2KRS A; 2HEQ A; 4JJD A; 1A0N B; 1OOT A; 2GTO A; 2JM9 A; 2RPN A; 1RI9 A; 2B86 A; 1I07 A; 3RBB B; 1GCP A; 1T0J A; 2EPD A; 3TSW A; 1OEB A; 4DEX A; 3FJ5 A; 1X2K A; 4J9H A; 4J9G A; 5IH2 A; 3UAT A; 2ESW A; 2BTT A; 2KEA A; 3M0Q A; 1X6G A; 2RNA A; 2RQU A; 2J05 A; 2L3Q A; 2DYB A; 2EYZ A; 4OMP A; 1I0C A; 2CT4 A; 2ECZ A; 1TUD A; 4JZ3 A; 4OMM A; 4D8K A; 2CDT A; 4F14 A; 5FW9 A; 1S1N A; 2O31 A; 1B07 A; 2OJ2 A; 2QDL A; 1B3Q A; 3I9Q A; 2JTE A; 3M0S A; 1WI7 A; 2H8H A; 1UE9 A; 4IIM A; 1ZUK A; 4RTU A; 2DMO A; 1HSQ A; 2RQT A; 4FSS A; 2AZS A; 3CQT A; 2DRK A; 1X27 A; 1UFF A; 2P4R A; 1E6H A; 2LCS A; 2OI3 A; 2NUZ A; 2DF6 A; 2ENM A; 4JPB W; 2GTJ A; 2K3B A; 1NEB A; 2EYX A; 2SRC A; 5IXF A; 3TVT A; 2ED1 A; 2KNB B; 2DVJ A; 4CC2 A; 1ZX6 A; 2L0A A; 2VWF A; 1SRM A; 1NLP C; 2K7A A; 1WXB A; 2LNH B; 3I5S A; 1TG0 A; 2KRM A; 1PRM C; 2D8H A; 4F16 A; 2CSQ A; 1CKA A; 2BZ8 A; 2FPE A; 1WXU A; 2EGA A; 1FYN A; 2O88 A; 2VVK A; 2KRN A; 3VS3 A; 1OPK A; 2D8J A; 2HSP A; 5GJV B; 1YNZ A; 1GBR A; 2GNC A; 2X3W D; 2KGT A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1ZSG A; 5GJW B; 1OX8 A; 4M75 D; 3M4Y A; 4F7U A; 3EG1 A; 5GAO n; 1VIE A; 1H92 A; 1RAB B; 3U23 A; 1Y0M A; 4BAC A; 2MAM A; 4BI3 A; 4JJC A; 1JXM A; 2L3R A; 4XTV A; 4BY6 C; 4XTW A; 2EJG A; 3X24 B; 2HDA A; 1O75 A; 3X20 B; 3RKY A; 3G7Z A; 5CKB A; 4EMK A; 3OW2 S; 3HHT B; 1K9M U; 1M30 A; 4JUV A; 3MCA B; 5GAN e; 1BYM A; 1TS9 A; 1PWT A; 4M7A A; 3MP6 A; 3OA6 A; 1M3C A; 2YSQ A; 4Y91 A; 3QWY A; 1PG5 B; 2K6D A; 3OMC A; 4KBM B; 2HL3 A; 3WXM B; 4DBQ A; 3CPW A; 3G71 Q; 2EQJ A; 2BZX A; 4N4I A; 3SD4 A; 5GAN h; 3CD6 T; 1VQ4 Q; 3ER0 A; 3OBY A; 4X1V A; 1SPK A; 2FVU A; 1VQM T; 4RMO A; 3KBG A; 3HRT A; 4AG2 C; 4IUV A; 1GFC A; 1WIE A; 3GBQ A; 4M75 B; 1WHK A; 3C4S A; 3CCS A; 2RJD A; 4PK4 A; 2KE9 A; 1H8K A; 2JS0 A; 2J6O A; 4LDV A; 4C8Q G; 2EW3 A; 4X9D A; 4HCZ A; 4XU0 A; 3CCJ A; 1VIF A; 4C92 F; 3CCV A; 1G2B A; 3UDC A; 1PHT A; 4A53 A; 5GMK i; 1D1A A; 3CC7 A; 1Z9Q A; 2FB7 A; 5GAN f; 2ABL A; 1QWF A; 5I2M A; 3INZ A; 2LJ1 A; 3V7S A; 3I35 A; 1BI2 A; 1ZA1 B; 2M51 A; 2QQ9 A; 1BB9 A; 2FZG B; 3CC2 A; 6AT1 B; 3LWI A; 3PIP A; 1AZE A; 3M0T A; 2KBT A; 2I2L A; 2D0N A; 1UB4 A; 1IHV A; 3A1P A; 1VQ5 A; 2CP5 A; 1WA7 A; 4J6Y A; 1XOV A; 2CKK A; 2JXB A; 2JUF A; 4FIB A; 5GMK l; 4JRK A; 4J8O A; 1OPL A; 1RLP C; 2RI5 A; 2Z0W A; 4GBQ A; 4J7I A; 2CZ7 B; 1PD1 A; 5KYN A; 1YHQ A; 1KIK A; 2CH4 A; 1SKU B; 1JJ2 A; 3OYD A; 4FYV B; 3TQ7 P; 2NUP A; 1WQW A; 1X75 C; 2GQV A; 3HFN A; 4XQ3 A; 1K73 C; 2PTK A; 1T3S A; 2HQH A; 4BDZ A; 3GOX A; 4AFU C; 3EG9 B; 1Y96 A; 4LD6 A; 1KC8 R; 3JB9 I; 2XI9 A; 3EHR A; 3MPU B; 2OTL Q; 3REA B; 2XKO C; 2X9H A; 1OYX A; 2P0Q A; 1LCK A; 2VUB A; 3H0H A; 2CUD A; 4PJO B; 2RH2 A; 3M0U A; 4C8Q D; 2PUK B; 5HCK A; 1PKS A; 1X69 A; 1Q81 R; 2RQV A; 3RKX A; 3R6O A; 5J39 A; 3EFO B; 1AWW A; 4M77 D; 1ABQ A; 3LW5 E; 3PVQ A; 2F1L A; 2LT1 A; 1W4S A; 1QVF S; 1VQ8 A; 4KUL A; 4JRP A; 4FW2 A; 2QGG A; 5KE3 A; 4M7D C; 4AG1 C; 4HT8 A; 4J9F A; 3EGU A; 3OYJ A; 1VQO T; 3OYE A; 1SEM A; 2P4T A; 4Z8A A; 2LJ0 A; 2AZV A; 4HKE A; 5GMK m; 1Q86 R; 4C92 C; 3EGD A; 1TOV A; 4BD3 A; 4A4F A; 2LRQ A; 2PU9 B; 3OS5 A; 3FLG A; 1M1G A; 2DER A; 1NJI R; 1WJQ A; 2BIV A; 4LUD A; 2VC8 A; 2DJZ A; 2X3X D; 2AT1 B; 1FMK A; 3LWH A; 1ARK A; 3OYM A; 3NMZ C; 1BU1 A; 2OTJ Q; 4M77 B; 1K4U S; 3G6E Q; 3REB B; 2VV5 A; 2HD0 A; 1ZUU A; 1MV0 B; 4MZM A; 1ZA2 B; 5AYF A; 5A0G A; 4ANJ A; 2X35 A; 3M59 A; 3O8V A; 1HK9 A; 1Y71 A; 1YWP A; 4J9E A; 3MJX A; 2QQS A; 3TEE A; 2F69 A; 4IIO A; 1B7T A; 4AFQ C; 1RUW A; 4C0D C; 2GBQ A; 4XTZ A; 1JEG A; 1VA7 A; 2BE9 B; 4EMK C; 5GAN j; 3SWN A; 3ZBD A; 2LCC A; 2NYS A; 3LLR A; 3JCM f; 4M7A C; 1VQL T; 4D6W A; 1KFZ A; 4LE9 A; 2A0F B; 3CCS T; 3EFR A; 4N4H A; 1FMV A; 4JZ4 A; 5D6Y A; 2C0O A; 3CCV T; 1M2V A; 1DJ7 B; 1VQ7 A; 1YJW Q; 3JCM c; 4BI8 B; 4LDY A; 1JB0 E; 2V1R A; 3CMA A; 4BI4 A; 2COZ A; 1IRX A; 1V1C A; 1KQS S; 2J7I A; 4B9W A; 1I8F A; 3O5Z A; 2L2P A; 2ED0 A; 3CC2 T; 1J3T A; 1WJR A; 2QEX T; 1VYU A; 1LNX A; 2MI6 A; 1JO8 A; 4DEY A; 2M16 A; 1VUB A; 1Q7Y U; 4PNO A; 2MPX C; 4NOY A; 5GAN 2; 1X43 A; 2IIM A; 2EIF A; 5I11 A; 3CD6 Q; 1JXO A; 5GAN g; 3MEU A; 1VQM Q; 4DA4 A; 2PUO B; 4MDW A; 3JB9 J; 1PCX A; 1ZHI A; 1SF9 A; 2GTO A; 2RPN A; 1RI9 A; 4E7K A; 3NTI A; 1BCO A; 4DEX A; 3FJ5 A; 4LD9 K; 3FIF A; 4J9H A; 2DTH A; 4E7H A; 4BB7 A; 3JCM b; 2K4Y A; 1W2B P; 1R0B G; 2J05 A; 5DLQ E; 3OYH A; 2EYZ A; 1G5V A; 4DBF A; 4BE1 A; 1KHC A; 1OQK A; 4PJM A; 3HFO A; 2OJ2 A; 3I9Q A; 5KYY B; 2E6Z A; 2H8H A; 4IIM A; 1ZUK A; 4J5Y A; 3CEY A; 4FSS A; 1B34 B; 1EZZ B; 2AZS A; 2LC4 A; 4M75 E; 1WPY A; 1X27 A; 2P84 A; 5LJ3 d; 4C5I A; 2IPO B; 1N9R A; 1VQ8 T; 5DLO A; 1YJN A; 1ZSZ C; 2GTJ A; 2RJE A; 5FRM A; 2EYX A; 2LX9 A; 3CC4 T; 2SRC A; 4J6X A; 1R77 A; 3PTA A; 3TVT A; 1KG1 A; 1N8R U; 1VQ6 Q; 1MND A; 2ED1 A; 1UGP B; 4JLG A; 4PFZ A; 4CC2 A; 3QKJ A; 4M75 A; 1D0Z A; 4XU2 A; 3HL8 A; 2LNH B; 3I5S A; 1TG0 A; 3QZ5 B; 3TRE A; 2D8H A; 2CSQ A; 5KYW B; 1CKA A; 1WXU A; 3PNW C; 1VQ9 A; 4J83 A; 1RAC B; 3I56 Q; 3TU4 K; 1KC8 C; 1MMD A; 3HTR A; 2VYT A; 1M5Q 1; 1YNZ A; 3JB9 H; 5A0L A; 2X3W D; 4RG8 A; 3NFC A; 3EGD B; 2A36 A; 1OX9 A; 5ECA A; 3OQ5 A; 4EPC A; 1MMA A; 5GAO l; 1Z9Z A; 4E7I A; 2VB6 A; 2GFA A; 4OVA A; 1M90 U; 1UJ0 A; 1Q81 C; 4M78 G; 4J9D A; 9ATC B; 4QT7 A; 2XDP A; 4JJB A; 4LDX A; 1O9S A; 2RMO A; 1CKB A; 2VKN A; 2V8K A; 2LZ6 B; 3G4S T; 1X6O A; 4M78 F; 2HKQ B; 2LX7 A; 5I22 A; 5D6X A; 3RKW A; 2HMA A; 3L2R A; 4LDW A; 2E3H A; 1PSE A; 2DXC A; 5IHK A; 2DVE A; 1F1B B; 1VQO Q; 2HL5 C; 4MZP A; 3CCR A; 2EQK A; 3EH1 A; 4FYY B; 1R8O B; 2FO0 A; 3QSU A; 4X34 A; 2FG0 A; 3A8H B; 3CBP A; 3EG9 A; 3SB2 A; 4A63 B; 3CCL T; 1G8X A; 3RUX A; 1KD1 R; 1NJI C; 1VOM A; 3TSZ A; 1AZG B; 5EC7 A; 1G83 A; 2ZCF B; 2DPP B; 4NL2 A; 2DL5 A; 1YJ9 A; 2EGE A; 1YI2 A; 2YUP A; 4XAX B; 3ZEH A; 4PJO A; 3JCM J; 2KSS A; 3MHX A; 2R5A A; 3G1J A; 1S72 A; 1NE8 A; 5CVI A; 2RK1 A; 3JV3 A; 3HRS A; 4DQ2 A; 3EFO A; 3UA6 A; 4NL3 A; 2KDS A; 5GAM d; 4IKF A; 2HQX A; 4PFO A; 2L3P A; 2RQR A; 1K8A U; 1BI1 A; 3CPF A; 3R6N A; 4PLL A; 3S3O A; 1TU0 B; 4QVC A; 1U06 A; 3EG0 A; 5CK9 A; 2EGC A; 2FEI A; 1WHH A; 2K5L A; 3OS0 A; 1W70 A; 3QDR B; 1VQL Q; 5GAO p; 4C8Q E; 4R55 A; 1WZO A; 5GAN 6; 1V76 A; 3VKI A; 2A37 A; 2E41 A; 1VQN A; 4M77 E; 4HVV A; 3FDR A; 3A98 A; 1YIJ A; 2QXF A; 1Q82 U; 1FXX A; 2KY9 A; 3FEO A; 4PJN A; 1UEB A; 4E2F B; 2R58 A; 1CSK A; 1PSF A; 1XNI A; 3MP1 A; 2XDD A; 4B6M A; 1AD5 A; 3BDL A; 2L89 A; 1N6A A; 3I55 T; 3CCE A; 1OV3 A; 1QLY A; 1OU9 A; 4C8Q A; 4GLK A; 5A2Q E; 2YXY A; 1W2B A; 2MOX A; 2DE0 X; 4M77 A; 3OYG A; 3RMQ A; 5FU6 C; 3CBO A; 4XTU A; 1WJS A; 4E6R A; 3JB9 G; 2E1H A; 4RTT A; 4N0A C; 4JLI A; 1AWO A; 4RUG A; 2CGH A; 3M53 A; 3OSS C; 5D6W A; 1PKT A; 4M78 C; 2QEX Q; 4M4Z A; 3HKS A; 1YCY A; 3VUZ A; 2V8J A; 2W0Z A; 2DXU A; 2EFI A; 3JB9 F; 1EIF A; 2RQW A; 2I0N A; 4ZN3 A; 4AFZ C; 2DD4 A; 1VQP T; 3ZL7 C; 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