The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
25
|
sequence length |
83
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structure length |
83
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Chain Sequence |
DPKPKFQEGERVLCFHGPLLYEAKCVKVAIKDKQVKYFIHYSGWNKNWDEWVPESRVLKYVDTNLQKQRELQKANQEQYAEGK
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structure of human MRG15 chromo domain and its binding to Lys36-methylated histone H3.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
MORF-related gene 15 isoform 1
|
| molecule tags |
Gene regulation
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
25
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| structure length |
83
|
| sequence length |
83
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| chains with identical sequence |
B, C, D, E, F
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-11-26 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 type barrels. |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4E7J A; 3P8H A; 4IUV A; 5C6S A; 3UWN A; 4E7I A; 3OYJ A; 4BAC A; 3H8Z A; 4QQ6 A; 2E5Q A; 2LTO A; 4IUR A; 3MP8 A; 2YRV A; 2IG0 A; 3L2V A; 4ZTF A; 3LH0 A; 3MP1 A; 4NS5 A; 4A4H A; 4ZTJ A; 3OYE A; 3LX7 A; 4N4H A; 3QKJ A; 4IUP A; 1N27 A; 3MEW A; 2PQW A; 2JZ2 A; 3H6Z A; 3FC3 A; 3C4S A; 1OZ2 A; 3OYK A; 5C0M A; 4QVZ A; 4BDY A; 2CKK A; 2RJF A; 4QQG A; 2HQX A; 3FLG A; 1H3Z A; 3OYF A; 5D6Y A; 1KHC A; 2G3R A; 2RHU A; 3QII A; 3S3M A; 4E7K A; 3OYC A; 4X34 A; 5IN1 A; 2WAC A; 3OYB A; 2D9T A; 2M16 A; 4A4F A; 4N4I A; 3S3O A; 3OB9 A; 4PLL A; 3UT1 A; 3OMC A; 4B9W A; 3MEA A; 3MET A; 2JTF A; 4BD3 A; 2DAQ A; 4FL6 A; 4EDU A; 3LLR A; 2HQE A; 3OYM A; 4A4G A; 3Q1J A; 3DLM A; 4PL6 A; 3OYA A; 2L8D A; 2M0O A; 5FRO A; 1WGS A; 4BE2 A; 2FHD A; 3M9Q A; 3OA6 A; 2E6N A; 4B9X A; 2K3X A; 3BDL A; 3O8V A; 4Z02 A; 2RI3 A; 5CIU A; 3PNW C; 2K3Y A; 2R58 A; 3KUF A; 2L3R A; 1RI0 A; 3ASK A; 2EQU A; 3NTK A; 4N4G A; 1WJS A; 5KCH A; 1XNI A; 2GFU A; 3L2Q A; 3NTH A; 2R5M A; 2RJD A; 2DIG A; 2EQM A; 4A4E A; 3FEO A; 3MEU A; 3PFS A; 5KE3 A; 2LRQ A; 2MWP A; 3L2W A; 3QBY A; 2BKD N; 5KE2 A; 3L2U A; 4BE0 A; 1OI1 A; 2XK0 A; 1WJR A; 2EFI A; 4PLI A; 1MHN A; 2L89 A; 2X4W A; 4BE1 A; 2LCC A; 3F70 A; 4C5H A; 4HCZ A; 1SSF A; 3LGL A; 4C5G A; 3MO8 A; 2B8A A; 3MEV A; 3DB4 A; 4RG2 A; 5J39 A; 4L59 A; 2LVM A; 3EAE A; 4Q5W A; 3OS1 A; 3OYI A; 3S3N A; 4QQD A; 2P0K A; 2MWO A; 2BUD A; 4E7H A; 2EKO A; 2DIQ A; 3GOX A; 1G5V A; 3OYD A; 2EQJ A; 3L42 A; 4UC4 A; 3S6W A; 3FDR A; 3LGF A; 2VYT A; 3E9G A; 3E9F A; 4IUQ A; 1OZ3 A; 2R5A A; 4II1 A; 2RI5 A; 5J26 A; 3ZEH A; 3LYI A; 4IUT A; 5KCO A; 2LDM A; 3OS2 A; 2RHY A; 3OQ5 A; 2X4Y A; 3OYG A; 3ME9 A; 3OY9 A; 4IKF A; 4C5E A; 2RO0 A; 3CEY A; 3PMT A; 4C5I A; 5IAY A; 5KH6 A; 2NLU A; 2XDP A; 3OMG A; 4OVA A; 4FU6 A; 3OS0 A; 3L2R A; 2RI2 A; 3P8D A; 2X4X A; 2BIV A; 3PMI A; 5M9O A; 2GFA A; 4GY5 A; 5FRN A; 4LD6 A; 5FRM A; 4IUU A; 3MP6 A; 2RJC A; 2RHX A; 4QW2 A; 5D6X A; 1OYX A; 2RHI A; 3DB3 A; 2M1H A; 2EQK A; 1WJQ A; 3NTI A; 4BDZ A; 2F5K A; 3OYN A; 3OYL A; 4E7L A; 3QJ6 A; 3OYH A; 2QQS A; 2O4X A; 2R57 A; 2RJE A; 5D6W A; 3SD4 A; 2RHZ A; 2X35 A; 2O4X B; 2GF7 A; 4CRI A; 2QQR A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4IIO A; 3QWY A; 5C6S A; 3H8Z A; 1GXI E; 5D7U A; 5GAO l; 4M7D D; 4FT2 A; 2QDY B; 3OYE A; 2VXF A; 1ZSG A; 3HP9 A; 1AVZ C; 5AYF A; 2RD1 A; 1SF9 A; 1G3T A; 2KNB B; 3A5Z B; 2XD0 A; 2QTX A; 3OMC A; 3ZL7 C; 2PTK A; 2OTJ A; 2QEX A; 2HKQ B; 1BI1 A; 1Y0M A; 2ABL A; 2F2X A; 2JMC A; 4BI4 A; 1D1A A; 4XTV A; 5IHK A; 1NLP C; 1ZBJ A; 2L3R A; 1XNI A; 2DIG A; 2FPF A; 2DPP B; 3EHQ A; 4JJC A; 3CPF A; 4M7D F; 1NLO C; 2MOX A; 3JB9 G; 2EFI A; 4JS5 A; 1JEG A; 3TCJ A; 3MO8 A; 3RIR A; 3CCR T; 1F1B B; 3DB4 A; 5J39 A; 4KH1 B; 5HK0 A; 4Z88 A; 1X75 C; 1IRE B; 1QLY A; 2QAZ A; 2CT3 A; 2VYT A; 4EMK A; 3MKD A; 2YT6 A; 3LYI A; 4IUT A; 1UG1 A; 1KIK A; 3J80 E; 2K4Y A; 4PFZ A; 3EGX A; 4L5G A; 3QPH A; 3RKW A; 4M75 G; 3WXM B; 3ME9 A; 4MZM A; 4HKE A; 5IAY A; 3OS0 A; 1H8K A; 1ZUU A; 1VA7 A; 4XU0 A; 3ZBD A; 5GAN 8; 2DF6 A; 2KXC A; 3MP6 A; 3V8L A; 3GNG A; 4RTV A; 5KYN A; 2NWM A; 3SDZ A; 2GQI A; 2A36 A; 1WXU A; 2D6F A; 4PJO C; 1WA7 A; 3SWN B; 4M7A A; 3V8J A; 4AG2 C; 4RMO A; 3PIO A; 3UWN A; 3OYJ A; 1K9M C; 2PU9 B; 1WHJ A; 1PNJ A; 3ER0 A; 1VQP A; 3VS6 A; 2O01 E; 4BUG A; 4EIK A; 2DMO A; 3AT1 B; 2KYB A; 3DLL A; 4PJO D; 4RTU A; 1YIT A; 2RA2 A; 3HTR A; 1TUG B; 2DZC A; 2OTJ T; 2FRW A; 1ZQ1 A; 2W0Z A; 4FYW B; 1SEM A; 1TS9 A; 4MZP A; 4WF2 A; 4PJN A; 1SSH A; 2DTI A; 3N5B B; 3LLR A; 1MV3 A; 1BIB A; 2EJG A; 3M58 A; 2L8D A; 2M0O A; 3INZ A; 4OMM A; 4HCC A; 5GAN 3; 3VYH B; 2HDA A; 4Z02 A; 4F14 A; 2C0O A; 2DRK A; 1X27 A; 3CC2 Q; 5IH2 A; 3NTH A; 4F7U B; 2NUT B; 1KSW A; 2KY9 A; 4J9B A; 2CS7 A; 4A54 A; 1WIE A; 2BKD N; 2HZY A; 2L89 A; 3EFO A; 1VQK T; 3MCA B; 4PJO F; 3EAE A; 3KXT A; 1YHQ A; 2YSQ A; 4J6X A; 5LJ3 e; 2DNU A; 2DKG A; 3CD6 T; 2QTV A; 2JXB A; 3GOX A; 1MUZ A; 1TWB A; 2LCL A; 3HSB A; 1VQ4 A; 2E3H A; 2V26 A; 4C8Q G; 2QQB A; 3QUI A; 3NMZ C; 4C5I A; 5LJ3 g; 1VQ9 T; 2P84 A; 2F69 A; 2Y4Y A; 1X01 A; 2HSE B; 2GQV A; 2FZC B; 1UE9 A; 3A98 A; 3CCE T; 1BI3 A; 5KYY A; 2V8I A; 3V8K A; 3BDU A; 3LH5 A; 4RTW A; 2GF7 A; 3EG9 A; 2D0Q B; 2CUD A; 2LT4 A; 4E7J A; 1R0B G; 5LJ3 d; 3EG1 A; 2HD0 A; 2IG0 A; 4ZN3 A; 1YIT T; 1YIJ Q; 1Q81 U; 3MHX A; 3FC3 A; 2CP6 A; 5FU6 B; 1YJ9 A; 4TVR A; 5I2M A; 2PNI A; 3I55 T; 1M1K R; 1V76 A; 1GCQ C; 2A37 A; 3S3M A; 1JRI A; 2D9T A; 2OAU A; 2YLC A; 3G71 Q; 4JPB W; 4J83 A; 1N8R R; 1YP5 A; 3JCM e; 1VQL Q; 2LZ6 B; 1LJO A; 1TG0 A; 3V7R A; 4C0D B; 1NYF A; 4XTY A; 4M4Z A; 3CCQ Q; 4R56 A; 1D0X A; 4A4E A; 2BZY A; 2VGM A; 3RES A; 4VUB A; 1PSF A; 1IRX A; 3CCJ T; 3JCM g; 3CMA T; 2DL4 A; 5DLQ E; 1CKA A; 3UDC A; 2LQW A; 4O5V A; 2RQR A; 4C0Z A; 2FRY A; 3M0S A; 4M78 E; 1G3W A; 1G5V A; 3JCM Q; 4C92 F; 4JRI A; 4ZGE B; 4M77 B; 1QCO A; 2JOY A; 3S6W A; 4J9D A; 4Z89 A; 5LJ3 j; 2RQU A; 2ZPH B; 2C06 A; 1Y07 A; 2CZ7 B; 5GAN e; 2H8H A; 1MV0 B; 4MDX A; 3M55 A; 2QQ9 A; 3EH2 A; 3JCM J; 4IKF A; 3CEY A; 2JTM A; 4FU6 A; 2FYK A; 1BI0 A; 5AT1 B; 3CME A; 1B34 A; 4DEX A; 1RAD B; 1RI9 A; 5GAN g; 2SEM A; 1I1J A; 4E7L A; 1MND A; 1N6A A; 1Q81 R; 2O4X B; 3RBB B; 4AFQ C; 2ZPB B; 1H64 1; 1D09 B; 2DEQ A; 3FJ5 A; 1G2B A; 3JCM W; 3MP8 A; 4Y91 A; 1K4U S; 4ZTF A; 1YJ9 T; 1G8X A; 3MP1 A; 2DK3 A; 2ZPI B; 2RK1 A; 3LX7 A; 2AKK A; 1N27 A; 3CCU A; 3CC4 T; 2VGN A; 5GAN d; 2EYQ A; 3TSW A; 4BDY A; 2OTL Q; 1OV3 A; 1CSK A; 3C0C A; 6AT1 B; 4PJM A; 1MMD A; 1YNZ A; 3OBW A; 2LJ3 A; 4OF1 A; 3G4S T; 1ZUY A; 3M0R A; 4B9W A; 1ZLM A; 2K9G A; 3E19 A; 1C6V X; 1B07 A; 1IHW A; 1WGS A; 3TEE A; 2L3S A; 3M9Q A; 4B9X A; 4FW2 A; 4A53 A; 2HBP A; 3VRY A; 1JU5 C; 2JS0 A; 2KE9 A; 1K0X A; 1RI0 A; 5GAO q; 2F1L A; 2V8J A; 3SWN C; 2CRE A; 3CC7 Q; 4BY6 B; 3JCM c; 2OJ2 A; 2OAW A; 1I4K 1; 2RH2 A; 3PT9 A; 1GL5 A; 4NL2 A; 1OEB A; 3NHN A; 4CC4 B; 4HCZ A; 2K7A A; 3QYH B; 4MZT A; 5DM7 R; 2DBM A; 5FU7 B; 3OYI A; 2P0K A; 4J8O A; 3BFM A; 5GAM h; 5LL6 S; 1PHT A; 3CCM A; 2EYY A; 1RAI B; 3QWX X; 1KC8 C; 1XJW B; 1IZ6 A; 3RMS A; 4MMK A; 2COZ A; 5FLX E; 2K57 A; 2AT1 B; 2K6D A; 3CME T; 2JNG A; 4OMO A; 5LJ5 e; 1JXO A; 3FB9 A; 4QT7 A; 3I56 A; 1M2O A; 3M57 A; 2AZS A; 2CSI A; 1RAB B; 2RJC A; 2RHX A; 1Q7Y R; 1FXX A; 2CSQ A; 1AWO A; 1O9S A; 1OYX A; 4EMH A; 1W1F A; 1NM7 A; 2FPD A; 2EJF A; 3TRE A; 4RUG A; 4M75 B; 5LJ5 g; 4JZ3 A; 3RKX A; 4IUR A; 3HL8 A; 3RR6 A; 1K9M R; 2X9H A; 2DEU A; 4JJD A; 2E64 A; 2PZ1 A; 1UJY A; 2IVW A; 4J9H A; 3GP8 A; 2H3E B; 1VQ7 Q; 1M3B A; 3OYF A; 1TUC A; 2E4H A; 4XTW A; 4AT1 B; 4LUD A; 1YI2 Q; 8ATC B; 4E7K A; 3VKI A; 5LJ5 d; 1HSQ A; 3OYB A; 1OQK A; 2YUQ A; 4DA4 A; 4BD3 A; 3SB2 A; 2X51 A; 2FG0 A; 1QVP A; 4EPC A; 5KYU A; 4AFS C; 2O9V A; 4HVW A; 2RF0 A; 1BB9 A; 1PG5 B; 2KT1 A; 2LMJ A; 5IHI A; 3O8V A; 2RI3 A; 3CCS T; 3ZFJ A; 3QZ5 B; 4HT9 A; 2ECZ A; 3NTK A; 5KCH A; 2KYM A; 4M7D A; 2HNI A; 1YJW Q; 5KYX B; 4EMK B; 5KE3 A; 4F7U F; 2KRN A; 3FJP A; 1KD1 R; 2YRD A; 2EWN A; 1W2B S; 4WCI A; 4M7A E; 2VWF A; 1N8R C; 4GLK A; 5FU6 C; 2QA4 T; 4QQD A; 1KQ1 A; 2A28 A; 1LPL A; 1UDL A; 3H0I A; 2DXT A; 3TQ7 P; 2QGF B; 2XDD A; 3OW2 A; 5J26 A; 5KCO A; 2EGC A; 2A3L A; 5EG2 A; 3CXC S; 1ZHI A; 1U1S A; 5GAN 4; 4NOY A; 4PJL A; 2RO0 A; 4C0D C; 1JJ2 A; 3VS0 A; 3L2R A; 1WQ7 A; 3M0T A; 3X25 B; 2YWW A; 3VS4 A; 5LJ5 j; 2KRO A; 2DL3 A; 4C92 E; 2XIC A; 2MI6 A; 3HPW A; 5CKB A; 1U06 A; 5FWB A; 5IXB A; 2RHZ A; 1UUE A; 4N4H A; 3RUX A; 4C8Q B; 2RNA A; 4AG1 C; 2EYW A; 1QCN A; 1TSF A; 3REA B; 4DEY A; 2E70 A; 2YRV A; 1RUW A; 1D3B B; 1UGR B; 4K11 A; 5CK9 A; 2HQH A; 3CCV Q; 2FZG B; 4M77 C; 1IB8 A; 3HRU A; 2P0Q A; 1VIE A; 2Y90 A; 2RQW A; 3UA7 A; 2HQX A; 1H3Z A; 4RTY A; 1VQ8 Q; 1N9S A; 2DVE A; 5HK3 A; 1G83 A; 3MET A; 2MYS A; 5GAN 7; 2DAQ A; 4JJB A; 4M77 D; 3CBO A; 3OYM A; 1JBM A; 2QYZ A; 1K73 R; 4PKC C; 1S72 Q; 2HAX A; 4FYX B; 3GLX A; 4FSX A; 4ELZ C; 3ASK A; 2EQU A; 2GFU A; 3G6E A; 2KQW A; 2XHC A; 2GNC A; 2RJD A; 2F2W A; 4M78 D; 2CP7 A; 1G3S A; 4A63 B; 4PJO A; 1OI1 A; 1D1C A; 4FIB A; 4OB2 B; 1J3T A; 3P8B B; 3X28 B; 4AFU C; 1O75 A; 5GAO m; 4CC3 A; 1GRI A; 2E5K A; 1UHC A; 2ESW A; 5CVI A; 1HK9 A; 3V7S A; 2DBK A; 4QKU A; 2EQJ A; 3QYG B; 3V7C A; 1WHH A; 1X6B A; 2RQT A; 4KT0 E; 3LGF A; 2VKN A; 3E9F A; 4M77 F; 4II1 A; 2DZ9 A; 7AT1 B; 2G6F X; 4D6W A; 3UAT A; 1I81 A; 3CCR Q; 3JSC A; 3X24 B; 3CQT A; 5CCA A; 3M0U A; 4BY6 C; 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3HKS A; 3I5S A; 1VQN Q; 2RMO A; 2DO3 A; 1RAE B; 2DLP A; 3KBG A; 3L2V A; 3DKM A; 4J9C A; 4M75 F; 2P4T A; 9ATC B; 1ZA1 B; 2KDS A; 1ZSZ A; 4ESR A; 3M4G A; 1IGU A; 1VQ9 Q; 4C92 G; 2K2M A; 4P5N A; 1TXQ A; 4RTX A; 1KQS S; 4QQG A; 4KGV B; 2LQN A; 3GIB A; 3CCE Q; 4X34 A; 1VQP T; 2HSP A; 4MML A; 3HFO A; 2ROT A; 2XMF A; 1M27 C; 2P0P A; 5CKH A; 1YJN Q; 4KRT A; 2QQA A; 1YN8 A; 4BE2 A; 1OU9 A; 2EVR A; 1FMK A; 3FIF A; 2JVV A; 2VVK A; 3QDR B; 4N4G A; 5I21 A; 4C8Q C; 1WJS A; 4CC2 A; 2R5M A; 4QVD A; 1T3S A; 4J6W A; 2E3I A; 1FYN A; 3D7S B; 2LRQ A; 1E7O A; 3VU3 C; 3TU4 K; 3I55 Q; 1RLP C; 1U1T A; 2LCC A; 3CBP A; 1SSF A; 5GMK h; 2F5T X; 3CPW S; 1K73 C; 1QVF S; 5A2Q E; 4C8Q D; 4PNO A; 2GTJ A; 3A8O B; 2YXY A; 2YRC A; 1VYU A; 2OTL A; 2HL3 A; 1M2V B; 1JB0 E; 1BK2 A; 3SEM A; 3ZEH A; 1JQQ A; 1YHQ T; 3OQ5 A; 1LNX A; 3KFV A; 3UF4 A; 2OX7 A; 4C5E A; 2D1X A; 2X3W D; 1OX8 A; 1SPK A; 1I5L A; 3CCJ Q; 4OVA A; 3CMA Q; 2X4J A; 4OB3 B; 2PUK B; 2E10 A; 2BTT A; 3C94 A; 3RDV A; 5GAN h; 3JAM E; 2QDL A; 5GAN 2; 1WX6 A; 2BZ8 A; 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