The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
15
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sequence length |
62
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structure length |
62
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Chain Sequence |
GSEQTHRAIFRFVPRHEDELELEVDDPLLVELQAEDYWYEAYNMRTGARGVFPAYYAIEVTK
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Signaling protein
|
| source organism |
Rattus norvegicus
|
| publication title |
A unique set of SH3-SH3 interactions controls IB1 homodimerization
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
C-jun-amino-terminal kinase interacting protein 1
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| total genus |
15
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| structure length |
62
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| sequence length |
62
|
| chains with identical sequence |
B, C, D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2006-01-16 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF14604 | SH3_9 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4CC7 A; 2KXC A; 2M51 A; 3VRY A; 1PHT A; 1GBQ A; 2K2M A; 3UF4 A; 4D8K A; 2V1R A; 2DM1 A; 1SPK A; 2DRM A; 4ESR A; 1T3S A; 1ABQ A; 2L3S A; 2V1Q A; 1GFD A; 1OEB A; 1AD5 A; 1WXB A; 2YUQ A; 3EG0 A; 2KEA A; 4LE9 A; 2JXB A; 2H8H A; 2LJ1 A; 1NG2 A; 2J6K A; 2G6F X; 4ORZ A; 2F2X A; 1Y57 A; 2RQT A; 2RNA A; 4LUE A; 5IH2 A; 4RTW A; 2RF0 A; 4ZNX A; 1X2Q A; 3EG1 A; 5EC7 A; 1YWP A; 2A37 A; 1SHG A; 1U3O A; 1UDL A; 2O2O A; 1JO8 A; 1WA7 A; 1M3A A; 2HEQ A; 2VVK A; 4QT7 A; 4F14 A; 2DX1 A; 2SEM A; 1WYX A; 1M3C A; 1AZE A; 2EGA A; 3VS7 A; 1UHC A; 2EBP A; 4FSS A; 1AVZ C; 5I22 A; 2X3W D; 1NYG A; 3M0S A; 1M3B A; 1UE9 A; 2LMJ A; 2L2P A; 2KYM A; 3IQL A; 3M0R A; 3PVL A; 1BBZ A; 2DYB A; 1HD3 A; 1SRL A; 2L3P A; 3EHQ A; 3UA6 A; 3VS4 A; 4KRT A; 1GRI A; 2KNB B; 2LX7 A; 1GFC A; 1NLP C; 1X6B A; 1JEG A; 1W6X A; 1OPK A; 4CC2 A; 4D8D A; 2W0Z A; 1ZUU A; 1LCK A; 3NHN A; 2YSQ A; 4Y92 A; 1VYT A; 2D8J A; 2NWM A; 1VYV A; 1AWW A; 3RNJ A; 1T0J A; 1Z9Z A; 2RQU A; 3TSW A; 2O88 A; 4GBQ A; 1SSH A; 1WDX A; 2J06 A; 2W10 A; 1PNJ A; 1VA7 A; 1NEB A; 1UUE A; 3EG3 A; 3O5Z A; 4AG1 C; 3M0U A; 3GBQ A; 1RUW A; 2AKL A; 1RLQ C; 1JXM A; 2KR3 A; 2LJ3 A; 5IHK A; 2YDL A; 4JJC A; 2K9G A; 2C0T A; 1WLP B; 2CT3 A; 1S1N A; 3M0P A; 1QCF A; 2MOX A; 1GBR A; 4JJB A; 4F17 A; 3VS2 A; 1X2K A; 2MIO A; 1G2B A; 1VYU A; 4IIM A; 4AFZ C; 1V1C A; 2NUZ A; 4Z89 A; 2EYX A; 1YWO A; 4RUG A; 4DEY A; 1HJD A; 4M4Z A; 3H0F A; 2DVJ A; 4AFQ C; 1BB9 A; 2OAW A; 4LN2 A; 3SHW A; 2E5K A; 2LQW A; 1N5Z A; 2K79 A; 4HVU A; 2BZ8 A; 2LP5 A; 2YT6 A; 2J6O A; 3VS5 A; 1M8M A; 1WXT A; 4AFS C; 2M0Y A; 4JJD A; 4J9I A; 1ZBJ A; 2O9S A; 2J6F A; 2LZ6 B; 2F2W A; 2DNU A; 2L0A A; 4RTY A; 3I35 A; 2P4R A; 3A98 A; 3NGP A; 2GTJ A; 2D8H A; 3REA B; 2HCK A; 4AFU C; 1NLO C; 1NYF A; 1CKB A; 3I9Q A; 4HCK A; 5GJV B; 1JU5 C; 2ESW A; 3REB B; 1K0S A; 1CSK A; 2DBM A; 2GTO A; 2DMO A; 3H0I A; 1JQQ A; 2O9V A; 5I11 A; 2QDL A; 3I5R A; 2KRO A; 3NPF A; 4AG2 C; 2EVR A; 1H92 A; 2MCN A; 1TUD A; 1YP5 A; 1SHF A; 1K4U S; 3UAT A; 2B86 A; 1EFN A; 2I0N A; 1MUZ A; 2D1X A; 2K7A A; 1YN8 A; 2ED0 A; 4WCI A; 4IIO A; 1K76 A; 1M27 C; 1YNZ A; 4OMO A; 1ZUY A; 2C0I A; 2ECZ A; 1RI9 A; 5ECA A; 1NM7 A; 1UG1 A; 1IO6 A; 2X3X D; 1OPL A; 2J05 A; 2OJ2 A; 1XOV A; 2K6D A; 3R6N A; 1SEM A; 2CH4 W; 1KFZ A; 3EG2 A; 1PWT A; 1GL5 A; 1QKX A; 4Z88 A; 1Y0M A; 4J9H A; 3TSZ A; 1OV3 A; 4RTT A; 3NMZ C; 2FRY A; 2AK5 A; 2CRE A; 2DL7 A; 1SRM A; 2RN8 A; 2DE0 X; 4OMQ A; 2RQW A; 1H8K A; 3LH5 A; 2FEI A; 2EYW A; 4A63 B; 2EPD A; 4DEX A; 1AWX A; 2YUO A; 2A08 A; 3VS6 A; 2FPF A; 1OOT A; 1ZSG A; 4Z8A A; 1NEG A; 4RTX A; 1KIK A; 2CSI A; 2YUP A; 1JXO A; 3EGU A; 2YUN A; 2KRS A; 4F16 A; 4HVW A; 4J9D A; 1AOJ A; 1GCQ C; 2KE9 A; 1WXU A; 1UTI A; 2DJQ A; 2PTK A; 2JT4 A; 3JV3 A; 1MV0 B; 5GJW B; 4CC4 B; 4R0K A; 1UJ0 A; 2XMF A; 3QWY A; 2LJ0 A; 3I5S A; 5IHN A; 2FO0 A; 2O31 A; 1BU1 A; 1H3H A; 3PE0 A; 4LNP A; 4HXJ A; 1CKA A; 1KJW A; 4K11 A; 1K1Z A; 4OML A; 3EHR A; 1ZUK A; 5FWB A; 2LQN A; 2FPE A; 2HSP A; 2JW4 A; 4JZ3 A; 2BZY A; 1GCQ A; 2CSQ A; 2CDT A; 5FWC A; 1QLY A; 4JPB W; 1E6H A; 4J9F A; 2KRN A; 1PRM C; 4EIK A; 5L23 A; 1HSQ A; 4OMP A; 2KRM A; 4OMN A; 3CQT A; 3C0C A; 1B3Q A; 1E6G A; 4J9C A; 2IIM A; 3VS3 A; 2EKH A; 3TVT A; 4RTV A; 2AZV A; 1U06 A; 3M0Q A; 1W1F A; 5HCK A; 2VWF A; 2CUD A; 2ROL A; 5IXF A; 2SRC A; 1E7O A; 2DLP A; 2DL8 A; 1T3L A; 3SEM A; 2KGT A; 1X43 A; 1X6G A; 2CUB A; 2EYZ A; 3VS0 A; 5FW9 A; 2OI3 A; 3U23 A; 1AWO A; 2RPN A; 1I0C A; 1T0H A; 2KT1 A; 2VKN A; 4RTU A; 1ZX6 A; 1U5S A; 3VRZ A; 1UGV A; 1WFW A; 1QWE A; 2J7I A; 2DL5 A; 1PRL C; 1ABO A; 4LUD A; 2DA9 A; 2LCS A; 2RQV A; 5IXB A; 4CC3 A; 2CH4 A; 2ROT A; 1B07 A; 1TG0 A; 1MV3 A; 1ARK A; 2EGC A; 2FPD A; 1AZG B; 2KYB A; 2EW3 A; 1UEC A; 1K0X A; 2EQI A; 1X69 A; 3QWX X; 2C0O A; 2HDA A; 2PZ1 A; 2JMA A; 2GQI A; 2CT4 A; 2JM8 A; 1I07 A; 3M0T A; 4E6R A; 1FMK A; 4J9G A; 2AKK A; 2GGR A; 2A36 A; 1A0N B; 2PNI A; 4J9B A; 1W70 A; 2KBT A; 3THK A; 2BTT A; 4X1V A; 3ULR B; 4GLM A; 2JS0 A; 4HVV A; 1TUC A; 3H41 A; 1Z9Q A; 1UHF A; 1PKT A; 1UFF A; 5IHI A; 1WX6 A; 3KFV A; 2ENM A; 3H0H A; 2JMC A; 3FJ5 A; 1AWJ A; 2A28 A; 1FYN A; 2RMO A; 4JZ4 A; 4J9E A; 2EYY A; 2JTE A; 2FRW A; 3UA7 A; 2DIL A; 2DL3 A; 2FG0 A; 2L3Q A; 3RBB B; 1I1J A; 2RQR A; 1RLP C; 1WI7 A; 1QWF A; 2LNH B; 1QKW A; 2ED1 A; 2KXD A; 2K3B A; 1GCP A; 4OMM A; 2D0N A; 3VS1 A; 1PKS A; 1KSW A; 4RTZ A; 2F2V A; 1BK2 A; 1M30 A; 1K9A A; 2BZX A; 2DF6 A; 1YCS B; 2EGE A; 3PVQ A; 1X27 A; 2KT8 A; 2HBW A; 2DRK A; 1G83 A; 2ABL A; 1WIE A; 1UJY A; 2DBK A; 2JM9 A; 1J3T A; 2DL4 A; 1AEY A; 2AZS A; 3ZL7 C; 2GNC A; 2JS2 A; 1ZLM A; 2GBQ A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2KXC A; 4LDX A; 1TH7 A; 4GLK A; 3CPW S; 2RB6 A; 1GBQ A; 4D8K A; 1IB8 A; 5GAM f; 2YRV A; 4ESR A; 3JCM Q; 3RIR A; 1GFD A; 4E2F B; 1AD5 A; 1WXB A; 2KEA A; 1C0M A; 2JXB A; 1RAH B; 2PVG B; 2H8H A; 2DO3 A; 3RES A; 2J6K A; 3MP1 A; 4LXC A; 2F2X A; 2WSE E; 1Y57 A; 4QQD A; 3OYB A; 5IH2 A; 4LUE A; 4M75 D; 1NPP A; 3MP8 A; 4ZNX A; 3MO8 A; 4C92 F; 1X2Q A; 4J6Y A; 3EG1 A; 5CKF A; 3L2V A; 3JCM e; 1BI0 A; 1UDL A; 1ZHI A; 3CPW P; 2YLC A; 4F14 A; 3GPL A; 3CXC S; 2MWO A; 1BCM A; 4XU0 A; 1WHJ A; 1KC8 R; 1AZE A; 2QEX Q; 1UHC A; 5I22 A; 2X3W D; 5CCA A; 1KQ2 A; 1SF9 A; 2KYM A; 2BUD A; 3TEE A; 2RHX A; 2L3P A; 3UA6 A; 2QEX T; 1G8X A; 1NLP C; 4JS5 A; 4P5N A; 1S72 Q; 1KD1 R; 3TU4 K; 4RG2 A; 3G4S Q; 1KHI A; 3JCM b; 4M7A B; 2W0Z A; 1WZO A; 2ZPB B; 1NZ9 A; 1LCK A; 1TS9 A; 4HCC A; 4Y92 A; 3CXC P; 1VYT A; 1S72 T; 2PU9 B; 4PNO A; 3RNJ A; 2RH2 A; 4E7J A; 2QXF A; 1Z9Z A; 1NJI R; 1WQ7 A; 4LDU A; 1IHV A; 1GXI E; 4GBQ A; 5GAO l; 3BDU A; 2W10 A; 2QGF B; 3WVE B; 4AG1 C; 4PJO C; 4FT2 A; 3JB9 G; 2AKL A; 1JJ2 S; 1RLQ C; 2XG8 D; 2KR3 A; 1D3B B; 3LWH A; 2YDL A; 2K9G A; 4OP0 A; 2C0T A; 3M0P A; 2MOX A; 1GBR A; 3CMA A; 3WVD B; 4JJB A; 3VS2 A; 2FZK B; 1X2K A; 2MAM A; 2MIO A; 3C12 A; 2VYT A; 4Z89 A; 3JCM c; 3JCM d; 3ZEH A; 3NTI A; 3NTK A; 2XHC A; 1X01 A; 2RI5 A; 3JCM W; 4DEY A; 4PFO A; 2DFU A; 4M4Z A; 4KUL A; 1FX7 A; 2MYS A; 5I2S A; 3EGX B; 4AFQ C; 1BB9 A; 3J81 E; 3SHW A; 1K8A U; 5FU6 B; 4PJO A; 1JJ2 P; 3FLG A; 4PLL A; 3M55 A; 4TVR A; 1M1K U; 4PJL A; 5KYN A; 2LP5 A; 3EG9 B; 1JBM A; 1M8M A; 2QK0 A; 2M0Y A; 4JJD A; 2CZ6 B; 2O9S A; 2J6F A; 2F2W A; 3PIO A; 3OYM A; 4OF1 A; 4PJO G; 3NGP A; 1W2B A; 2GTJ A; 5I2M A; 3REA B; 1TU0 B; 4AFU C; 1NLO C; 2CZ7 B; 3CCJ Q; 1NYF A; 1CKB A; 5FU7 B; 3I9Q A; 1ZBX A; 2HMA A; 3CC7 A; 2RA2 A; 3REB B; 2LQ8 A; 2CP7 A; 2O9V A; 1BI2 A; 4OGC A; 4AG2 C; 1WHM A; 2MCN A; 1SHF A; 2DK3 A; 1WHG A; 4HA8 A; 1EFN A; 4IUQ A; 1WHL A; 3L2W A; 1NBE B; 3F70 A; 4IUT A; 2D1X A; 3M4G A; 4A4K A; 3A8G B; 2ED0 A; 5AYF A; 4BD3 A; 1MMA A; 1K76 A; 4M77 D; 2C0I A; 1UGS B; 2ECZ A; 2Y4X A; 1RI9 A; 4M7A C; 1NM7 A; 2J05 A; 4ANJ A; 3WXM B; 2DTH A; 3DB4 A; 3QBY A; 1RAC B; 1RAI B; 3R6N A; 1RAD B; 2QAS A; 1PWT A; 4E7S A; 4FYW B; 4Z88 A; 4C8Q D; 1Y0M A; 1XTD A; 1VQ9 A; 4XU2 A; 5IT9 E; 1BYM A; 1I4K 1; 2FB7 A; 4R55 A; 4JUV A; 4Y91 A; 4IUP A; 2DE0 X; 2LQK A; 3KBG A; 2NLU A; 4ZGD B; 3LH5 A; 5GAO r; 1G3W A; 4M7A A; 2YUO A; 2DTO A; 4PJJ A; 3R6O A; 4PK4 A; 2E64 A; 3RR6 A; 4C92 A; 1AOJ A; 2E5Q A; 2M02 A; 3HL8 A; 1UTI A; 4A4E A; 4IKF A; 1RAB B; 4ATO A; 4M7A G; 2GQV A; 2LVM A; 2JT4 A; 2JTF A; 4CC4 B; 5CQX A; 5FU6 C; 1QP2 A; 5GAN 2; 1QVP A; 3OMG A; 5FRO A; 5GMK e; 1BU1 A; 4BE1 A; 1B34 B; 2RM4 A; 4M75 E; 1CKA A; 2K3X A; 4KGV B; 2JTM A; 2COW A; 3CD6 T; 3EFS A; 4C92 D; 2CSQ A; 1IRE B; 2CS7 A; 3E9F A; 1WHK A; 3QXE B; 5FU7 C; 2IVW A; 5HY6 A; 1M8V A; 3CMA Q; 1M1G A; 5LJ3 f; 3EGX A; 2E65 A; 3C0C A; 1B3Q A; 2JJ9 A; 4J9C A; 5CAI A; 1EX4 A; 1OI1 A; 2ATC B; 4RTV A; 3CCL Q; 1MGQ A; 2AZV A; 1U06 A; 2EJG A; 3LYI A; 4X9D A; 3EG9 A; 1ZSZ B; 3CCM A; 3CMA T; 2VWF A; 1VQ8 T; 4KBM B; 3OYG A; 2BE7 D; 2X4W A; 1E7O A; 3OS2 A; 3SEM A; 3OW2 S; 1X43 A; 1X6G A; 1KQ1 A; 5DLO A; 2XIC A; 3CCV T; 4XQ3 A; 1NJI U; 3M53 A; 1OZ3 A; 3M57 A; 4JLG A; 4RTU A; 5D7U A; 2QI2 A; 1H64 1; 3SWN B; 4DBH A; 2OTL A; 1QWE A; 4OB0 B; 3CEY A; 2DL5 A; 1PRL C; 5IAY A; 2IPO B; 4PFZ A; 3H6Z A; 7AT1 B; 2RQV A; 1M4Z A; 4CC3 A; 4HT9 A; 1TG0 A; 2WSF E; 3CC7 Q; 2KQW A; 2EW3 A; 1YIJ Q; 2DXU A; 3OW2 P; 4BI4 A; 2A7Y A; 1VQK A; 1TOV A; 2HL5 C; 3SFM A; 2A3L A; 1M90 C; 2PZ1 A; 2CP2 A; 1HYO A; 2GQI A; 3RUX A; 2JM8 A; 3V7S A; 3JCM h; 1D0Y A; 5C0M A; 3CC7 T; 2GGR A; 3O8V A; 3VUB A; 2MK5 A; 4J7I A; 3G71 A; 1TUC A; 1SSF A; 1PSF A; 3OYY A; 4JDS A; 3VKI A; 1UHF A; 1O75 A; 3KFV A; 2EWN A; 3INZ A; 3H0H A; 3E9G A; 3JCM f; 4DA4 A; 1K9M C; 2FRW A; 3RMQ A; 2RQR A; 3OMC A; 4N0A A; 1QWF A; 2LNH B; 1VQ9 Q; 4OB3 B; 4A4F A; 2DEQ A; 2GFU A; 2DEU A; 4A53 A; 3VS1 A; 2X4X A; 2CGH A; 1PKS A; 1BK2 A; 1RAE B; 1OU9 A; 4XAX B; 1PM3 A; 2ZGW A; 1VQ9 T; 1I8F A; 3BW1 A; 3SDZ A; 1U1S A; 1X27 A; 2HNI A; 2KT8 A; 4J8O A; 4JRQ A; 5KH6 A; 4PJO E; 2DJZ A; 2CZ1 B; 2DRK A; 2ABL A; 1WIE A; 1UJY A; 3OYN A; 1J3T A; 3CCR T; 3EFO B; 3C95 A; 4XTX A; 3JB9 F; 3HFO A; 3VYH B; 4EMK B; 3OYH A; 4HCB A; 2M51 A; 1ZSZ C; 3G1J A; 4XK8 E; 1B34 A; 2RHI A; 2V1R A; 1LNX A; 4M77 E; 5A0D A; 2DM1 A; 1SPK A; 2V1Q A; 1O9S A; 2YUQ A; 3EG0 A; 1Q81 U; 5FRN A; 3OYK A; 4J7F A; 4UC4 A; 3M56 A; 2OTJ Q; 4FCY A; 3SWN C; 1VQN T; 1Y96 A; 3LH0 A; 3HP9 A; 3PMI A; 4MDX A; 1SHG A; 1U3O A; 2O2O A; 1M3A A; 5I21 A; 2VVK A; 2DPP B; 4QT7 A; 1ZSZ A; 2DX1 A; 3PMT A; 2EQM A; 2PVO B; 2EGA A; 2M16 A; 3A8H B; 2EBP A; 4PJO F; 4J6W A; 3OYJ A; 1M3B A; 4PKC C; 3IQL A; 3M0R A; 1BBZ A; 4IUR A; 3CCM Q; 1HD3 A; 2XD0 A; 2Y90 A; 1X6B A; 1JEG A; 1W6X A; 3HFN A; 4ZTF A; 3VJP A; 1LVK A; 4EPC A; 4CC2 A; 1W4S A; 2L5Q A; 3CCM T; 4M78 B; 3CCE Q; 2ZCF B; 1BIB A; 4BY6 B; 3NHN A; 3OA6 A; 1K73 U; 2JN0 A; 4L6V 5; 2D8J A; 1VYV A; 2HZY A; 4HT8 A; 5M9O A; 1IGQ A; 2DAQ A; 1T0J A; 5KCH A; 4M7A E; 1D1A A; 1SSH A; 1PNJ A; 1FWZ A; 1UUE A; 3O5Z A; 1D09 B; 5GAN g; 3M0U A; 2OTL T; 3GBQ A; 1RUW A; 4F7U B; 5KE3 A; 4C92 E; 5IHK A; 2LJ3 A; 2NUT A; 4BB7 A; 5KYX B; 3ER0 A; 1VQK Q; 4JJC A; 2LTO A; 2EYQ A; 3UDC A; 5CQY A; 2YRC A; 4IIM A; 2XK0 A; 2RHY A; 2E3H A; 3ASK A; 4N4I A; 2GF7 A; 3G71 Q; 5GAN 3; 1AT1 B; 1YWO A; 2IG0 A; 1MMG A; 4EMK C; 3AT1 B; 5LJ5 e; 2KSS A; 2OAW A; 4LN2 A; 5GAN e; 2PUK B; 3G71 T; 4X9C A; 1N5Z A; 4J5Y A; 1M90 R; 4ZTJ A; 1SKU B; 2XDD A; 4GY5 A; 3OYF A; 2BZ8 A; 2YLB A; 3CME A; 2J6O A; 4RCB A; 2V8K A; 5GAO q; 1YCY A; 2HBP A; 2X35 A; 3GLX A; 4C5H A; 4M7A F; 4ELZ C; 3I35 A; 1Q86 R; 2DIQ A; 4M7D A; 1OU8 A; 1R8O B; 1QP3 A; 2QDY B; 2VXE A; 5GMK h; 3OYL A; 4DOW A; 4PJN A; 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