The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
14
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sequence length |
62
|
structure length |
62
|
Chain Sequence |
GSEQTHRAIFRFVPRHEDELELEVDDPLLVELQAEDYWYEAYNMRTGARGVFPAYYAIEVTK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
A unique set of SH3-SH3 interactions controls IB1 homodimerization
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
C-jun-amino-terminal kinase interacting protein 1
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| molecule tags |
Signaling protein
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| source organism |
Rattus norvegicus
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| total genus |
14
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| structure length |
62
|
| sequence length |
62
|
| chains with identical sequence |
B, C, D, E, F, G, H
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2006-01-16 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF14604 | SH3_9 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2GTJ A; 2OI3 A; 1EFN A; 1ZSG A; 2M0Y A; 2DMO A; 3RBB B; 1YWO A; 4AFS C; 1AZG B; 3TVT A; 2KT1 A; 1CKB A; 3VS7 A; 1GFD A; 2JMC A; 2DM1 A; 1PHT A; 2DF6 A; 3A98 A; 1S1N A; 2LNH B; 4Z88 A; 3REA B; 5ECA A; 3M0Q A; 2VVK A; 2A08 A; 2RN8 A; 1KIK A; 2CSI A; 2DX1 A; 2HEQ A; 2O9S A; 5IHN A; 1NYF A; 2DL5 A; 1X69 A; 1NLO C; 3SHW A; 2JXB A; 2LCS A; 1RI9 A; 1TUC A; 2RQR A; 2ABL A; 2GNC A; 1OOT A; 1ZUY A; 2DBK A; 2JW4 A; 1K0S A; 1NLP C; 4J9G A; 2D8H A; 2DL3 A; 2PNI A; 4OML A; 1HD3 A; 1GRI A; 2RQU A; 1H8K A; 1OEB A; 1XOV A; 2ED1 A; 4AFQ C; 4F14 A; 2V1R A; 2FPF A; 2AZV A; 2AKL A; 2L0A A; 2CUB A; 3EGU A; 3NGP A; 2DA9 A; 2MOX A; 2O2O A; 3IQL A; 1Y57 A; 1YP5 A; 3RNJ A; 1T0J A; 3GBQ A; 1PRL C; 5IXF A; 3REB B; 3PVL A; 1X2K A; 3KFV A; 3SEM A; 4OMM A; 2X3W D; 1WDX A; 1IO6 A; 2JS2 A; 4HXJ A; 1UDL A; 4RTZ A; 1NG2 A; 4D8K A; 2D0N A; 2W10 A; 2DVJ A; 1NYG A; 1QLY A; 1VYV A; 2J6O A; 1X6G A; 2EPD A; 5IXB A; 4ESR A; 2FRW A; 1T0H A; 1VA7 A; 1GL5 A; 2K9G A; 1HSQ A; 2KRO A; 3O5Z A; 5FWC A; 2KRN A; 4D8D A; 2H8H A; 1WXU A; 3VS0 A; 2P4R A; 3EG0 A; 1PNJ A; 4LUE A; 2JM8 A; 3EG3 A; 4JJB A; 4RTX A; 3CQT A; 3EG2 A; 3U23 A; 4M4Z A; 2DL7 A; 2KXD A; 3TSZ A; 2XMF A; 1GFC A; 2NWM A; 1OV3 A; 2KXC A; 3NMZ C; 1E6G A; 4LN2 A; 2F2W A; 1AD5 A; 2LJ0 A; 1RUW A; 3VRZ A; 2LQN A; 3QWY A; 4OMP A; 1OPK A; 2EBP A; 1UE9 A; 2KT8 A; 2YSQ A; 5EC7 A; 3H0H A; 4LUD A; 1GCQ C; 2ROL A; 1PKS A; 1I1J A; 1M27 C; 2LJ1 A; 2CRE A; 3ULR B; 1QWE A; 2C0I A; 1JEG A; 1M3B A; 2DL8 A; 2KRM A; 4QT7 A; 4IIO A; 2A36 A; 2FPD A; 2KR3 A; 3PVQ A; 1ABQ A; 4OMN A; 1PKT A; 1E6H A; 4ZNX A; 1K76 A; 1TG0 A; 2ENM A; 2NUZ A; 1AOJ A; 1ZUU A; 2CUD A; 1I07 A; 1SRM A; 4CC4 B; 2A28 A; 2RQT A; 1U06 A; 2O31 A; 2BTT A; 1B07 A; 1K0X A; 4OMQ A; 4CC7 A; 1QCF A; 2LQW A; 1WXT A; 2JTE A; 4J9C A; 2EGE A; 2FRY A; 3I9Q A; 1AWJ A; 5L23 A; 2LP5 A; 2DJQ A; 2EVR A; 2CSQ A; 1LCK A; 2DRM A; 2PTK A; 1UEC A; 1SPK A; 2BZX A; 2CT3 A; 2KYM A; 4AG1 C; 1G83 A; 1WA7 A; 1RLP C; 1UFF A; 3THK A; 1ARK A; 1W70 A; 5I11 A; 4DEX A; 2FPE A; 1KSW A; 1UJY A; 3PE0 A; 4Z89 A; 2RF0 A; 1I0C A; 1RLQ C; 4IIM A; 3UA7 A; 2EGA A; 4ORZ A; 1WX6 A; 1K4U S; 3UAT A; 1GBQ A; 2KRS A; 2AKK A; 2BZY A; 2EYW A; 2J06 A; 2DBM A; 2DNU A; 1NM7 A; 4HVV A; 5GJV B; 2D8J A; 3NHN A; 2DL4 A; 2B86 A; 5IH2 A; 2C0O A; 1GBR A; 2J6F A; 2VWF A; 2AK5 A; 1HJD A; 1A0N B; 1JQQ A; 2LMJ A; 4JPB W; 2C0T A; 1TUD A; 2FG0 A; 1YN8 A; 3LH5 A; 1N5Z A; 2YUQ A; 4FSS A; 2HCK A; 1Z9Z A; 1Y0M A; 2EYZ A; 2YDL A; 1YNZ A; 1GCP A; 1MV0 B; 3I35 A; 2MCN A; 2DIL A; 4CC2 A; 2CT4 A; 2K7A A; 5I22 A; 4HCK A; 1Z9Q A; 4KRT A; 2YUP A; 2RMO A; 2JM9 A; 1UG1 A; 2GGR A; 4Z8A A; 2HDA A; 3VS4 A; 2J6K A; 2EKH A; 2KE9 A; 2PZ1 A; 1AWW A; 1W1F A; 1ZX6 A; 4RTU A; 5HCK A; 4DEY A; 2K3B A; 1AZE A; 3H0F A; 1JXM A; 1UUE A; 1ABO A; 1WLP B; 4LE9 A; 2F2X A; 3VS3 A; 1UJ0 A; 3JV3 A; 1KFZ A; 2JMA A; 1G2B A; 1SRL A; 4AG2 C; 1U5S A; 2YUO A; 4RTY A; 1JO8 A; 1ZLM A; 1T3S A; 2YT6 A; 4J9F A; 4AFZ C; 2SEM A; 1WI7 A; 2QDL A; 2ED0 A; 1W6X A; 1AVZ C; 1UGV A; 4HVU A; 1QKW A; 2EYX A; 1X27 A; 2X3X D; 4K11 A; 1UTI A; 3UA6 A; 1QWF A; 2J7I A; 1OPL A; 2KNB B; 1FYN A; 1J3T A; 2RQW A; 2D1X A; 2EGC A; 1M30 A; 1MUZ A; 2K6D A; 1M3A A; 4GLM A; 1JU5 C; 3VS6 A; 4E6R A; 2KYB A; 4J9H A; 3M0T A; 1CKA A; 2K2M A; 2EQI A; 2YUN A; 1VYU A; 2AZS A; 2G6F X; 2RQV A; 1WXB A; 1YWP A; 4RUG A; 1SHG A; 4R0K A; 4Y92 A; 2ECZ A; 3M0R A; 1X43 A; 1M8M A; 1ZUK A; 2ESW A; 4X1V A; 1ZBJ A; 1H92 A; 2CH4 W; 1X6B A; 2A37 A; 2F2V A; 2V1Q A; 2LX7 A; 2BZ8 A; 3EHQ A; 2W0Z A; 5FW9 A; 3VS5 A; 1SEM A; 2DYB A; 3H41 A; 1E7O A; 2ROT A; 4RTT A; 3M0S A; 2EYY A; 4HVW A; 2CH4 A; 1X2Q A; 2GTO A; 2HSP A; 2JT4 A; 1GCQ A; 2J05 A; 2HBW A; 4J9B A; 1PWT A; 3R6N A; 1WYX A; 3EHR A; 1QKX A; 2E5K A; 3M0U A; 1NEB A; 4OMO A; 1JXO A; 4J9D A; 1WIE A; 2O88 A; 4LNP A; 1M3C A; 2FO0 A; 2L2P A; 2OAW A; 1VYT A; 3EG1 A; 4JZ4 A; 2LJ3 A; 2DLP A; 3I5S A; 3VS2 A; 4RTV A; 3I5R A; 2M51 A; 1V1C A; 1CSK A; 1H3H A; 2KBT A; 1AEY A; 4JJD A; 1U3O A; 1BB9 A; 4J9I A; 2L3Q A; 3VS1 A; 2I0N A; 2O9V A; 3NPF A; 5GJW B; 1UHF A; 4AFU C; 1K9A A; 2K79 A; 2MIO A; 2FEI A; 1WFW A; 2DRK A; 1KJW A; 2L3P A; 2KEA A; 4F17 A; 3M0P A; 3VRY A; 1NEG A; 3C0C A; 1B3Q A; 1SHF A; 2RPN A; 2VKN A; 3UF4 A; 2IIM A; 1YCS B; 3QWX X; 5IHI A; 2EW3 A; 4GBQ A; 5IHK A; 1MV3 A; 1BBZ A; 1K1Z A; 3TSW A; 3FJ5 A; 1BU1 A; 2RNA A; 1FMK A; 2L3S A; 3H0I A; 4CC3 A; 1PRM C; 4RTW A; 2JS0 A; 1AWX A; 2KGT A; 2LZ6 B; 4F16 A; 1AWO A; 2OJ2 A; 1T3L A; 1UHC A; 4WCI A; 5FWB A; 4JZ3 A; 2SRC A; 1BK2 A; 2DE0 X; 4A63 B; 1SSH A; 4J9E A; 4JJC A; 2CDT A; 2GBQ A; 4EIK A; 2GQI A; 3ZL7 C; #chains in the Genus database with same CATH topology 2GTJ A; 5D7U A; 4KBM B; 4AFS C; 2X35 A; 4XTX A; 1AZG B; 5LL6 S; 3TVT A; 1CKB A; 4M77 A; 4WF2 A; 1QP3 A; 3CXC P; 3REA B; 1BI2 A; 2L5Q A; 1VQO A; 2RO0 A; 2O9S A; 2RJF A; 2DL5 A; 4E7Z A; 1NLO C; 3SHW A; 2HL3 A; 2KY9 A; 2B8A A; 4M7A G; 3CME Q; 1RI9 A; 2RQR A; 2JW4 A; 2PVG B; 3F70 A; 4J9G A; 4C0F A; 1Q82 U; 4OB0 B; 4AFQ C; 2HD0 A; 2GFU A; 1D0X A; 2V1R A; 1IGU A; 2PVO B; 1YIT A; 4M7D A; 3GNG A; 5FU6 C; 1RAB B; 4HT8 A; 1I8F A; 3QHS A; 2NUT A; 4BY6 C; 3OYK A; 2DA9 A; 3IQL A; 3OYH A; 4M78 E; 3LWI A; 5IXF A; 3REB B; 2L3R A; 3OSS C; 3BE3 A; 1VQ8 A; 4M77 B; 3HP9 A; 4M75 A; 4OGE A; 4PK4 A; 1UDL A; 4RTZ A; 5LJ3 e; 5LJ3 f; 1NG2 A; 1WHG A; 2D0N A; 2W10 A; 1NYG A; 2QQA A; 1Q82 C; 2XIC A; 4JS4 A; 2FRW A; 2D9T A; 1VA7 A; 1XNI A; 3P8H A; 2K9G A; 3G4S T; 1MNE A; 4BB7 A; 4VUB A; 3QPH A; 1WXU A; 2P4R A; 1YJN A; 4II1 A; 3VJP A; 4LUE A; 2DL7 A; 3CCJ A; 3M58 A; 2KDS A; 3RKY A; 2XMF A; 1GFC A; 3JRZ A; 2PUO B; 2ZPG B; 4HCC A; 4RCC A; 4M7D B; 1JB0 E; 1I81 A; 1RUW A; 2NUT B; 3VRZ A; 4CI0 C; 1U1T A; 2RI3 A; 2YSQ A; 1M90 U; 1ZSZ A; 2DYI A; 2ZAE A; 4LUD A; 1K8A U; 1PKS A; 4M75 B; 3ULR B; 1OQK A; 1WZO A; 1YI2 A; 1VQM Q; 1KD1 U; 5KYX B; 1QWE A; 1HXD A; 3EAE A; 2OTJ T; 2EFI A; 2A36 A; 2KR3 A; 2O4X A; 2QTX A; 3PVQ A; 1KQS P; 1QVF A; 3OW2 S; 3OYC A; 4PJL A; 3CC4 A; 1VQL T; 3UDC A; 4ZNX A; 1TG0 A; 3G71 Q; 2NUZ A; 2DZC A; 3V7C A; 2RQT A; 3MP8 A; 2VB6 A; 3X26 B; 2BTT A; 1NZ9 A; 5CCA A; 4OMQ A; 4CC7 A; 4BE1 A; 1OZ2 A; 1WXT A; 4KT0 E; 8AT1 B; 5L23 A; 3HHT B; 2MAM A; 2DJQ A; 2PTK A; 3GP8 A; 1SPK A; 2EWN A; 2P4T A; 5GAO p; 1ZSZ B; 2RJE A; 3QXE B; 4C8Q E; 4AG1 C; 1VQ9 T; 3THK A; 1N27 A; 3FC3 A; 5CVI A; 2D6F A; 3CCR T; 1VQ5 Q; 3QYH B; 2FVU A; 3PGG A; 5GAN 3; 4FSX A; 3VV0 A; 4PFO A; 1RL2 A; 4MMK A; 2M0O A; 1R77 A; 2KAF A; 2R5M A; 2O4X B; 2DBM A; 4HVV A; 2DL4 A; 1GBR A; 4FW1 A; 2J6F A; 3CPF A; 4ELY C; 1RAA B; 1PC0 A; 2LCC A; 3OYD A; 4AMC A; 1A0N B; 2OTJ A; 1TXQ A; 1OX9 A; 2C0T A; 4PLI A; 3VUZ A; 2FG0 A; 4E7I A; 4ATO A; 4BE0 A; 3L2Q A; 1G8X A; 2FL7 A; 4FSS A; 1VQL A; 3OYA A; 2CP7 A; 2YDL A; 1GCP A; 4CC2 A; 2XDD A; 3UWN A; 1P92 A; 2X4W A; 1Y71 A; 3E9G A; 4M77 C; 3RMQ A; 2GGR A; 3CCL T; 2Z0W A; 1PSE A; 1VQ4 A; 1VQ6 Q; 2P0Q A; 1KC8 R; 5GAN e; 1ZX6 A; 2CP5 A; 1WJS A; 5GAO n; 5GAN f; 2DK3 A; 1S72 T; 1UUE A; 1G3W A; 4B9X A; 3JSC A; 4FYW B; 3CCR A; 1NJI U; 4C92 E; 1U5S A; 3M4G A; 1JO8 A; 1ZLM A; 2YT6 A; 4J9F A; 5J39 A; 1LJO A; 2COZ A; 1W4S A; 1X27 A; 1UTI A; 3CMA A; 1OPL A; 3A8H B; 1SKU B; 2KI7 A; 2QQB A; 3M53 A; 3X20 B; 4M7D C; 2E41 A; 4JRP A; 1Q81 C; 4XU2 A; 2D1X A; 1YCY A; 3ZBD A; 4B9W A; 4ZGD B; 1M30 A; 1FXX A; 3V7R A; 3JB9 I; 1JU5 C; 3HRU A; 4E6R A; 3E9F A; 3OYL A; 1YIJ Q; 1G3T A; 4M75 C; 2K3Y A; 1D1A A; 3J7A F; 3I56 T; 3CPW P; 3OMG A; 4P5N A; 5CR2 A; 2YUN A; 1VOM A; 3EG9 B; 1VYU A; 1Q86 R; 5FRM A; 5GAN 8; 1YWP A; 1SHG A; 4J83 A; 2LQK A; 1Q7Y R; 1JJ2 S; 1MMN A; 2ECZ A; 2QDY B; 3OYI A; 1M8M A; 1ZUK A; 1ZBJ A; 2QAZ A; 3A5Z B; 3CBP A; 1IXD A; 2ZPF B; 2F2V A; 2RK1 A; 4M77 G; 3GOX A; 3NFC A; 3PMT A; 2CZ6 B; 4A4E A; 3H41 A; 1Q95 G; 4KUL A; 1HYO A; 2GTO A; 5KYY B; 4HCB A; 5FU7 B; 1QP2 A; 3CCV T; 1TS9 A; 3SWN A; 2HMA A; 1FX7 A; 3EHR A; 1ZSZ C; 3WVE B; 3D7S B; 2GF7 A; 3MET A; 2M02 A; 4MML A; 1JXO A; 2QA4 T; 1VQP Q; 2FO0 A; 2WSE E; 3VKI A; 2OAW A; 4ME7 A; 1YJW T; 3LYI A; 2LJ3 A; 3I5S A; 3VS2 A; 3I5R A; 1YFN A; 2QGG A; 4M7D G; 2KBT A; 4JJD A; 1U3O A; 1BKB A; 1O75 A; 4OB2 B; 5CK9 A; 4OB3 B; 2CP3 A; 2I0N A; 5GJW B; 2YLC A; 4UC4 A; 1IHW A; 2MIO A; 1NBE B; 1WFW A; 2CZ7 B; 4PL6 A; 2XU8 A; 2L3P A; 3M0P A; 1XJW B; 3VRY A; 4DBF A; 5LJ3 j; 3C0C A; 3SWN B; 2KVQ G; 3G7Z A; 4JS5 A; 2FHD A; 2VKN A; 5GAN h; 4MDX A; 3UF4 A; 4J7F A; 3RKX A; 1GXI E; 3QWX X; 1Y07 A; 2AT1 B; 1M9S A; 3OBY A; 2YRC A; 1ZQ1 A; 4A4F A; 1TTH B; 5GAM e; 2LT4 A; 5GAM f; 1BBZ A; 3TSW A; 3CCE T; 2GFA A; 2JTM A; 1BU1 A; 4M77 D; 2L3S A; 2QEX A; 4FW2 A; 2QK0 A; 4DOW A; 2KSS A; 3SDZ A; 2JS0 A; 4BDZ A; 4IUT A; 3L2Z A; 2EQK A; 5GAO m; 3EFS A; 2HQH A; 1VQ7 A; 1UHC A; 5A2Q E; 4J6X A; 4JZ3 A; 2SRC A; 1B7T A; 1M1K R; 4C92 B; 3JB9 J; 1SSH A; 4J9E A; 4JJC A; 1IHV A; 3OS1 A; 1PD1 A; 2XKO C; 4F7U E; 2RB6 A; 1YJW A; 1OYX A; 1K73 R; 1IB8 A; 2OTL T; 3QJY A; 5KE2 A; 1MND A; 2M0Y A; 4RG2 A; 4XU0 A; 5J26 A; 2KT1 A; 3VS7 A; 3A8M B; 1GFD A; 2K5F A; 2DM1 A; 1PHT A; 3EGD A; 4M7D D; 1I5L A; 1QCO A; 3M0Q A; 2VVK A; 3V8L A; 2RN8 A; 3JAM E; 1KIK A; 9ATC B; 2CSI A; 2DX1 A; 2HEQ A; 5IHN A; 2X51 A; 1NPP A; 2JXB A; 2LCS A; 1D1C A; 4M75 D; 2ABL A; 2GNC A; 1K0S A; 3V7S A; 2JUF A; 3BFM A; 2PNI A; 5GAN 4; 3I55 A; 1NJI R; 1IRX A; 2FZC B; 1HD3 A; 2RQU A; 3L42 A; 1XOV A; 2ED1 A; 4F14 A; 4TVR A; 3CCM T; 2CP0 A; 2AZV A; 4R55 A; 2AKL A; 1OI1 A; 2MOX A; 1YHQ T; 3CCU Q; 1KG1 A; 2QYZ A; 3HL8 A; 3FEO A; 4BI3 A; 4JDS A; 3CXC A; 3R6O A; 1YBY A; 1AHJ B; 2E3H A; 2DTH A; 3SEM A; 3CD6 A; 2QI2 A; 4HXJ A; 2XG8 D; 5FU7 C; 3EGD B; 1QW1 A; 1NE8 A; 4D8K A; 2K2V A; 4IUU A; 3WXM B; 5I2M A; 4R56 A; 4ESR A; 2YRV A; 2OTL A; 5GAN 7; 1HSQ A; 2DD5 A; 5FWC A; 1R0B G; 3EFO B; 3EG0 A; 4C5E A; 1N6A A; 5CKE A; 1N8R R; 1RAC B; 2NWM A; 4IUQ A; 4PJO E; 3A1P A; 1OV3 A; 2LRQ A; 3CC7 Q; 4LN2 A; 5GMK l; 4M77 F; 2LTO A; 2LJ0 A; 1SSF A; 2LQN A; 1KQ1 A; 4OMP A; 2VGN A; 4PNO A; 5KYU A; 1QVG S; 2KT8 A; 1RAF B; 5EC7 A; 5GAM h; 1I1J A; 4PFZ A; 3SWN C; 3CCM A; 5GAN j; 6AT1 B; 1JEG A; 2EQJ A; 5HK3 A; 1M3B A; 2DL8 A; 2KRM A; 4IIO A; 2E64 A; 2X4X A; 4GY5 A; 1YIT Q; 1G5V A; 4V2S A; 4XAX B; 1X6O A; 2XID A; 4HCZ A; 1AOJ A; 4M7D F; 1VQN A; 3SD4 A; 2RM4 A; 1KHI A; 3FRN A; 3MP1 A; 2RHU A; 1RI0 A; 2BKD N; 1KC8 U; 2JNG A; 1C6V X; 1QCF A; 2LQW A; 4J9C A; 2EGE A; 2BIV A; 4C92 C; 3G6E A; 3I9Q A; 1AWJ A; 4OF1 A; 4M75 F; 3CME T; 2V8K A; 5KYU B; 4BDY A; 1U1S A; 2QTV A; 2LC4 A; 2BZX A; 2CT3 A; 3NTI A; 4Q5W A; 1RLP C; 2G3R A; 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