The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
14
|
sequence length |
60
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structure length |
60
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Chain Sequence |
HEQTHRAIFRFVPRHEDELELEVDDPLLVELQAEDYWYEAYNMRTGARGVFPAYYAIEVT
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
A unique set of SH3-SH3 interactions controls IB1 homodimerization
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Signaling protein
|
| source organism |
Rattus norvegicus
|
| molecule keywords |
C-jun-amino-terminal kinase interacting protein 1
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| total genus |
14
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| structure length |
60
|
| sequence length |
60
|
| chains with identical sequence |
B, C, D
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2006-01-16 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF14604 | SH3_9 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2X3X D; 4LUD A; 2KRN A; 1U3O A; 2MCN A; 1M27 C; 4AG2 C; 4J9F A; 1K0X A; 2AZV A; 4JZ3 A; 4HCK A; 1NEB A; 3RNJ A; 1UJ0 A; 2FG0 A; 5IHI A; 3C0C A; 1SRL A; 2JM9 A; 2L0A A; 3SEM A; 2DE0 X; 2YSQ A; 1NLO C; 2RF0 A; 4JZ4 A; 3M0U A; 2M0Y A; 4CC3 A; 4K11 A; 4RTY A; 5IXF A; 4ESR A; 1FMK A; 2DX1 A; 1GFC A; 1NEG A; 1QLY A; 2KEA A; 2AKK A; 2DRK A; 2L3P A; 1OOT A; 2JTE A; 3EHQ A; 1WIE A; 2CDT A; 4RTW A; 1M3C A; 1RI9 A; 4R0K A; 2RQW A; 1HD3 A; 1ZUU A; 2IIM A; 4Y92 A; 2W10 A; 2DL4 A; 4LN2 A; 2KBT A; 3M0P A; 1SHF A; 2EQI A; 2O2O A; 4Z88 A; 3VS7 A; 4OML A; 3VS6 A; 2ABL A; 4FSS A; 2RPN A; 1VYU A; 1I07 A; 3JV3 A; 1M3A A; 2JMC A; 2RQT A; 1E6H A; 3R6N A; 1PKS A; 3M0R A; 3ULR B; 2OJ2 A; 1GRI A; 2G6F X; 2NUZ A; 4CC2 A; 2FPE A; 1AZG B; 1IO6 A; 3U23 A; 1JU5 C; 1ZBJ A; 2K2M A; 1YP5 A; 2GGR A; 2ED0 A; 1K1Z A; 4JJC A; 2XMF A; 3RBB B; 4F16 A; 2O88 A; 4F17 A; 4E6R A; 1SSH A; 1T0H A; 1WLP B; 2EPD A; 2FRY A; 4Z89 A; 2OI3 A; 2EGC A; 5I22 A; 1S1N A; 2A37 A; 2J05 A; 3H0I A; 1B3Q A; 2A08 A; 2CT4 A; 3I5R A; 1YNZ A; 1KIK A; 2D1X A; 1ZSG A; 2AKL A; 1CKA A; 1GCP A; 1I0C A; 2K9G A; 2I0N A; 2P4R A; 3GBQ A; 1JXO A; 1UEC A; 3CQT A; 3REB B; 1PHT A; 2LJ3 A; 4JPB W; 1KFZ A; 2FPD A; 2HCK A; 1UGV A; 3I5S A; 1AVZ C; 4F14 A; 1TUC A; 1RLQ C; 2JT4 A; 2JS2 A; 3REA B; 1K0S A; 1E6G A; 2DL3 A; 2J6F A; 4J9B A; 3VS4 A; 1HJD A; 1YWP A; 2J6O A; 1UTI A; 3THK A; 4DEY A; 1WI7 A; 4IIO A; 3VS1 A; 1Y57 A; 3FJ5 A; 3EG3 A; 3PE0 A; 2LJ1 A; 2PZ1 A; 2J6K A; 5IHN A; 2EW3 A; 2KE9 A; 2C0O A; 2EYW A; 5IHK A; 1W1F A; 4OMO A; 1H92 A; 2DF6 A; 5I11 A; 4J9H A; 2CRE A; 3VS0 A; 2CSI A; 2LJ0 A; 2DL7 A; 1QWF A; 5FWC A; 1UJY A; 4HXJ A; 4KRT A; 5L23 A; 2CT3 A; 2RQR A; 2RN8 A; 4LNP A; 2D0N A; 4X1V A; 2DNU A; 2RQV A; 1GL5 A; 1ABO A; 1QKX A; 4AFU C; 3PVQ A; 2O9V A; 2VKN A; 2JS0 A; 2A36 A; 3LH5 A; 4HVU A; 2K3B A; 2HDA A; 2CH4 W; 1PRM C; 2AK5 A; 3IQL A; 2KXD A; 1ZUY A; 2QDL A; 1PWT A; 1BK2 A; 3QWX X; 1AEY A; 1RLP C; 2LMJ A; 1VA7 A; 2LCS A; 1AOJ A; 4AG1 C; 3TSZ A; 4ZNX A; 3ZL7 C; 1OEB A; 2C0I A; 1PKT A; 1G2B A; 4M4Z A; 5IH2 A; 1X27 A; 2B86 A; 4RTX A; 2FO0 A; 2KNB B; 4OMM A; 5GJV B; 4J9C A; 2J7I A; 4GLM A; 1UDL A; 2DL5 A; 2VVK A; 1UFF A; 2DBK A; 5HCK A; 1M3B A; 3A98 A; 2L3S A; 4WCI A; 3M0T A; 2JM8 A; 2CUD A; 2BZY A; 3VS3 A; 1K9A A; 2FPF A; 4AFS C; 2RQU A; 2GTO A; 2KR3 A; 1UG1 A; 1I1J A; 1MV3 A; 1WDX A; 1WX6 A; 2KYB A; 1YCS B; 4CC4 B; 2O9S A; 1BB9 A; 1GBQ A; 1ZUK A; 2EBP A; 1W6X A; 4AFQ C; 3H0F A; 1YN8 A; 1BBZ A; 3VS5 A; 4JJD A; 1OV3 A; 3UA7 A; 1V1C A; 1WA7 A; 4J9G A; 5ECA A; 2BZ8 A; 2EVR A; 3H0H A; 2DL8 A; 1QCF A; 2GTJ A; 1LCK A; 2OAW A; 2JXB A; 2F2X A; 2MOX A; 2ECZ A; 1AZE A; 2EGA A; 3VS2 A; 2D8J A; 2DIL A; 1X2K A; 4EIK A; 4J9D A; 1UE9 A; 4OMQ A; 1E7O A; 1SEM A; 2ROT A; 2PTK A; 4A63 B; 1PRL C; 2DRM A; 4RUG A; 3VRY A; 2DJQ A; 4J9I A; 1NYF A; 2LZ6 B; 2AZS A; 1X69 A; 1AWW A; 1U06 A; 3NHN A; 4QT7 A; 1AWJ A; 2KT8 A; 1K4U S; 1SPK A; 1GCQ A; 4RTZ A; 2YT6 A; 3EG1 A; 1AD5 A; 2KRS A; 2M51 A; 1ZX6 A; 4IIM A; 1A0N B; 2X3W D; 1JO8 A; 3QWY A; 3NMZ C; 1WFW A; 1NYG A; 5GJW B; 1GFD A; 2HSP A; 3I9Q A; 1T3S A; 2A28 A; 2FEI A; 1VYV A; 1FYN A; 3NPF A; 2YUN A; 2W0Z A; 1MV0 B; 3TSW A; 1SRM A; 1G83 A; 4Z8A A; 4LE9 A; 2SRC A; 5IXB A; 1ARK A; 1M8M A; 1WXT A; 2ENM A; 4OMP A; 2YUP A; 4D8D A; 4LUE A; 1SHG A; 2F2W A; 2ROL A; 2LQN A; 1K76 A; 1GBR A; 3VRZ A; 2BZX A; 2YUQ A; 4DEX A; 2YUO A; 2DVJ A; 4OMN A; 2RNA A; 2E5K A; 2JMA A; 2BTT A; 1YWO A; 1WYX A; 1AWO A; 1TG0 A; 4HVV A; 4ORZ A; 2NWM A; 1TUD A; 5EC7 A; 4D8K A; 1CSK A; 2EGE A; 2SEM A; 3O5Z A; 2K79 A; 1VYT A; 2KGT A; 1NG2 A; 1CKB A; 4RTV A; 4AFZ C; 4CC7 A; 2K6D A; 2GBQ A; 1W70 A; 1J3T A; 1JXM A; 2EKH A; 2CUB A; 1GCQ C; 1B07 A; 1Z9Q A; 2DYB A; 1H8K A; 1NLP C; 4J9E A; 2LQW A; 3H41 A; 4RTT A; 3NGP A; 1OPL A; 1U5S A; 2D8H A; 1ABQ A; 3EHR A; 3M0Q A; 2KRO A; 2CH4 A; 2EYY A; 3EGU A; 1XOV A; 1N5Z A; 1UHC A; 2DM1 A; 2EYX A; 4JJB A; 3EG0 A; 1X6B A; 2JW4 A; 3KFV A; 1X6G A; 2ED1 A; 4HVW A; 1X2Q A; 1UHF A; 2KYM A; 1X43 A; 3UAT A; 3TVT A; 1T0J A; 2VWF A; 2HEQ A; 1EFN A; 3M0S A; 2KXC A; 2DA9 A; 2ESW A; 1H3H A; 2V1R A; 1PNJ A; 4RTU A; 2LX7 A; 2KRM A; 1KJW A; 3SHW A; 3I35 A; 5FW9 A; 2CSQ A; 2LNH B; 5FWB A; 3UA6 A; 2V1Q A; 2K7A A; 1NM7 A; 2PNI A; 1JQQ A; 2KT1 A; 2RMO A; 1Y0M A; 3PVL A; 1MUZ A; 1T3L A; 1OPK A; 1M30 A; 2DBM A; 1RUW A; 4GBQ A; 2FRW A; 2H8H A; 2YDL A; 1BU1 A; 1QKW A; 2C0T A; 3UF4 A; 2EYZ A; 1HSQ A; 2J06 A; 2MIO A; 2O31 A; 3EG2 A; 2GQI A; 2L2P A; 1Z9Z A; 1WXU A; 2F2V A; 2DMO A; 1JEG A; 1KSW A; 2GNC A; 1ZLM A; 2HBW A; 1QWE A; 2L3Q A; 1AWX A; 2DLP A; 2LP5 A; 1WXB A; 1UUE A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2DTI A; 3OW2 S; 1U3O A; 2MCN A; 3ZEH A; 2JTF A; 1RAI B; 1NEB A; 3RNJ A; 4YTL A; 4BY6 C; 2KSS A; 2L0A A; 1MGQ A; 1PCX A; 1VOM A; 1Q81 R; 2HSE B; 5HKC A; 2CZ0 B; 1FMK A; 1U1T A; 1GFC A; 1NEG A; 2KEA A; 2JN0 A; 4FYY B; 2COY A; 1RAD B; 3OMG A; 4E47 A; 4M7D B; 3GF5 A; 1ZHI A; 2O4X B; 5GAO l; 2IIM A; 4C8Q G; 5KYN A; 2BKD N; 4RCB A; 2KBT A; 1SHF A; 4QQ6 A; 4Z88 A; 3VS6 A; 3E19 A; 2DXT A; 3QHS A; 4M77 D; 4HCC A; 4M7D A; 2O4X A; 2JMC A; 1E6H A; 2VGM A; 1EX4 A; 3ULR B; 3RKW A; 4FT2 A; 3M55 A; 5LJ5 h; 1GRI A; 4PNO A; 1LNX A; 1IO6 A; 1JU5 C; 1AHJ B; 1K1Z A; 4OMF B; 2KDS A; 1IGU A; 1VIF A; 4E6R A; 4M78 B; 2RHI A; 1N8R R; 1S72 T; 1T0H A; 4FSX A; 3BY7 A; 4XTW A; 4N0A A; 2V8I A; 3RIR A; 2FRY A; 1FX7 A; 3BDU A; 3OBW A; 3RUX A; 4Z89 A; 2NUP B; 1S1N A; 4J6W A; 2P0Q A; 4BE0 A; 4M78 A; 3I55 Q; 2CT4 A; 3JB9 H; 2LTO A; 2D1X A; 3SDZ A; 2F5T X; 2X4Y A; 1MMA A; 1I0C A; 2I0N A; 3GBQ A; 2FZK B; 3CQT A; 2NUP A; 2FPD A; 4XTU A; 2QXF A; 2JT4 A; 1K0S A; 1PD0 A; 4QQG A; 2J6F A; 3OYB A; 3HKS A; 4D6W A; 4IKF A; 4A4K A; 2QYZ A; 4ZGJ B; 3G7Z A; 3OY9 A; 3HRT A; 3PGG A; 3RMQ A; 1VQ5 Q; 1PM3 A; 2FL7 A; 3MP8 A; 1V76 A; 4XU0 A; 1LVK A; 3PIP A; 5I11 A; 3OS5 A; 2QTV A; 4PJO E; 1PSE A; 4XTZ A; 4IUP A; 5LJ3 g; 2EQK A; 3OSS C; 1RAF B; 4CI0 C; 3CC4 Q; 1QKX A; 3CCS T; 2O9V A; 2VKN A; 1B34 B; 1RI0 A; 3LH5 A; 4EPC A; 8ATC B; 2CH4 W; 3SD4 A; 3G4S A; 4PJO D; 3KUF A; 3IQL A; 1YJN T; 1ZUY A; 1M1K R; 3P8B B; 2YHT A; 1JJ2 S; 4FIB A; 2DAQ A; 1B34 A; 4BI8 B; 1VA7 A; 3CCE A; 2EJG A; 1IB8 A; 1AOJ A; 2YXY A; 4OVA A; 4ZNX A; 3ZL7 C; 2ZPG B; 1PKT A; 1G2B A; 3CCU A; 1OZ2 A; 2B86 A; 4RTX A; 4OMM A; 3CCL T; 4J9C A; 1VQ7 A; 1YJW Q; 4X34 A; 1WQ7 A; 1JB0 E; 2EKO A; 3DB3 A; 4DBH A; 2JNG A; 1K9A A; 3OS1 A; 4QW2 A; 1Q82 U; 2RQU A; 1WHM A; 3G1J A; 1YJ9 Q; 2KR3 A; 2CYZ B; 5LL6 S; 4M7A E; 4M77 F; 3QO3 A; 1W6X A; 4AFQ C; 1VQK T; 2OTL T; 4HKE A; 5GAM g; 2ZPB B; 3VKI A; 3G6E Q; 1V1C A; 1D1C A; 4J9G A; 5GAN f; 3H6Z A; 5ECA A; 1C0M A; 2BZ8 A; 5CR2 A; 4M7A D; 3H0H A; 1VQ4 Q; 1QCF A; 2GTJ A; 4KUL A; 4HCZ A; 2JXB A; 3OYN A; 2MOX A; 1NJI U; 3A8H B; 4FYW B; 1KC8 U; 3PTA A; 2DIL A; 3CCR A; 2BE9 B; 3C4S A; 4J9D A; 4O6J A; 2JUF A; 1JRI A; 2RH2 A; 1SF9 A; 5KYU B; 2ROT A; 2ZZD A; 1NBE B; 4J9I A; 1ZA2 B; 4M7D G; 2LCC A; 3G71 T; 3NHN A; 1QVF P; 1AWJ A; 2KT8 A; 4IUQ A; 1GCQ A; 5KYU A; 5A2Q E; 2YT6 A; 3EG1 A; 3EG9 B; 5GMK e; 3I55 A; 4JS5 A; 5LJ5 j; 2KRS A; 1ZX6 A; 3V7R A; 1NPP A; 5FRM A; 5GAO q; 2CP7 A; 2ATC B; 3M59 A; 2FEI A; 4PLI A; 1ZSZ C; 1FYN A; 3EG9 A; 4OP0 A; 2W0Z A; 4M77 C; 4KT0 E; 3CCV Q; 4M78 G; 3QDF A; 4Z8A A; 2OX7 A; 3OYG A; 3OYK A; 4LDY A; 1M8M A; 1WXT A; 4OMP A; 7AT1 B; 1VQO T; 1ARK A; 2IG0 A; 4D8D A; 3A5Z B; 4PL6 A; 1VQ5 A; 4LD6 A; 1QP3 A; 1GBR A; 3VRZ A; 1VQL Q; 2EAY A; 1KD1 U; 4DEX A; 3TEE A; 1BCM A; 2JMA A; 3M4Y A; 2MMP A; 2XID A; 4HVV A; 4ORZ A; 4PJO F; 4D8K A; 1QVP A; 2P0K A; 1YBY A; 2XI9 A; 1CSK A; 3CC4 A; 2EGE A; 4X9D A; 2FVU A; 2KY9 A; 1PSF A; 3EFR A; 2L8D A; 2RA2 A; 2FZC B; 2QA4 T; 5CKD A; 1CKB A; 1VQ9 T; 4AFZ C; 5LJ5 d; 2DD5 A; 1C1A A; 1JXM A; 2EKH A; 2CUB A; 1Q86 U; 3F70 A; 3FLG A; 4RG2 A; 2DYB A; 1BI3 A; 2I2L A; 2D6F A; 2LQW A; 2RI2 A; 1X01 A; 2QQ9 A; 3JCM V; 4RTT A; 1VQN T; 1OPL A; 3OYJ A; 1YJW A; 3M0Q A; 2KRO A; 4M75 G; 4JRI A; 2KAF A; 3L2V A; 1IXD A; 4A4H A; 1H3Z A; 3EGU A; 2DET A; 1XOV A; 1QQJ A; 1N5Z A; 1WQW A; 1UHC A; 2EYX A; 1KQS S; 3URG A; 4RCC A; 4OB0 B; 2HKN A; 2GQV A; 2RO0 A; 1K9M C; 1X2Q A; 3RER A; 1VQM Q; 1IRE B; 1YJ9 A; 4F04 B; 3TVT A; 2VWF A; 2HEQ A; 3EH1 A; 3Q1J A; 4PJO C; 2V1R A; 1PNJ A; 4M7A F; 3A8G B; 5FWB A; 3G6E A; 3S3O A; 2K7A A; 1KK7 A; 4C8Q B; 1TU0 B; 1JQQ A; 4L59 A; 1VQ4 A; 2RMO A; 5GAO m; 3L2Z A; 1VQP A; 1T3L A; 5GAN h; 3OW2 P; 3LX7 A; 4BDY A; 4C8Q A; 4F7U B; 5D7U A; 2DZC A; 3NTI A; 5AT1 B; 4HA8 A; 1Y71 A; 1HSQ A; 2BUD A; 3EG2 A; 5GAN 4; 3D7S B; 2DEU A; 3OB9 A; 4AMC A; 4F7U A; 2F2V A; 3OYY A; 2DFU A; 2DMO A; 2E5Q A; 4BAC A; 1QWE A; 2L3Q A; 2DLP A; 1MMN A; 1D3B B; 4LUD A; 2QEX T; 4HCK A; 1WJR A; 2X4W A; 1KQ2 A; 4KBM B; 3C0C A; 1SRL A; 2RJD A; 2LDM A; 2DXU A; 2Y90 A; 3MKD A; 3TCJ A; 2RF0 A; 3CBO A; 1KQS A; 1D3B A; 2M0Y A; 3CC7 Q; 4RTY A; 5IXF A; 4M7A C; 3CCU T; 5FU7 C; 3CCJ A; 1Q81 U; 2L3P A; 1OOT A; 2E70 A; 2HBP A; 1ZBX A; 4RTW A; 2CDT A; 1M3C A; 4R0K A; 1OI1 A; 3OSV A; 2RB6 A; 2DXB A; 5KCO A; 2DK3 A; 2XK0 A; 1WZO A; 1NE8 A; 3M0P A; 2XIC A; 4ME7 A; 3JCM c; 4OML A; 4KGV B; 1RAC B; 4FSS A; 2RI5 A; 2JTM A; 3JV3 A; 2RQT A; 3R6N A; 3M0R A; 2OJ2 A; 2OTJ Q; 4EMH A; 4FU6 A; 4CC2 A; 2M9U A; 4DBR A; 3U23 A; 1K8A R; 1ZBJ A; 1YP5 A; 4OF1 A; 5FU6 C; 3CCM Q; 2GGR A; 3ME9 A; 1G5V A; 2B8A A; 4DOV A; 3M56 A; 3TRE A; 3QJ6 A; 2KK4 A; 2OI3 A; 1QVF A; 2VXE A; 3PMT A; 1ZA1 B; 5C6S A; 2XDD A; 1N8R U; 4N4G A; 2XKO C; 3H0I A; 2KQW A; 1YIJ Q; 1YNZ A; 4RKU E; 1X6O A; 1CKA A; 3EGX B; 4WTO B; 3JAM E; 2K9G A; 2AT1 B; 3N5B B; 1JXO A; 1UEC A; 1PHT A; 2LJ3 A; 4EMK C; 1UGV A; 4HT9 A; 4CRI A; 1TUC A; 3RMS A; 2JS2 A; 3EGX A; 1YWP A; 3G4S Q; 4BB7 A; 4HCB A; 5KYX B; 1VQM A; 1WI7 A; 1IGQ A; 3DLM A; 3VS1 A; 4C0Z A; 3EG3 A; 3PE0 A; 2LJ1 A; 2HL3 A; 1Y96 B; 2PZ1 A; 3I55 T; 2ZCF B; 3PNW C; 1JJ2 P; 2C0O A; 2EYW A; 3L1A A; 2LT1 A; 4XQ3 A; 3CCE Q; 3SWN B; 1B7T A; 1H92 A; 2DF6 A; 5KYX A; 4J9H A; 1N6A A; 2ZAE A; 1XJW B; 2D9T A; 3VS0 A; 1XTD A; 3LWI A; 2QG9 B; 1Y96 A; 4BD3 A; 1VQ8 T; 5L23 A; 1D0X A; 5KH6 A; 5DY9 A; 1OX9 A; 2CT3 A; 2RQR A; 4LNP A; 1M2O A; 1YIT Q; 1C6V X; 2D0N A; 4X1V A; 2DNU A; 3SWN A; 1VQ7 Q; 1GL5 A; 1ABO A; 1LPL A; 2K3B A; 2HDA A; 2JVV A; 1PRM C; 2VB6 A; 1VQ5 T; 2VV5 A; 2LVM A; 2EIF A; 3CC2 T; 2DPP B; 4ZN1 A; 4A54 A; 4B9W A; 3QZ9 B; 2QDL A; 1PWT A; 3QWX X; 4E7S A; 4C0D C; 1AEY A; 4Y91 A; 1RLP C; 2LMJ A; 3RDV A; 2VC8 A; 1WHK A; 5FRO A; 2EWN A; 3A8M B; 2XU8 A; 1D0Z A; 3CEY A; 3NTK A; 4J7I A; 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