The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
14
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sequence length |
60
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structure length |
60
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Chain Sequence |
HEQTHRAIFRFVPRHEDELELEVDDPLLVELQAEDYWYEAYNMRTGARGVFPAYYAIEVT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
A unique set of SH3-SH3 interactions controls IB1 homodimerization
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Signaling protein
|
| source organism |
Rattus norvegicus
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| molecule keywords |
C-jun-amino-terminal kinase interacting protein 1
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| total genus |
14
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| structure length |
60
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| sequence length |
60
|
| chains with identical sequence |
B, C, D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2006-01-16 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF14604 | SH3_9 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1UGV A; 1I0C A; 1PKS A; 2M51 A; 2JW4 A; 1WXB A; 1UTI A; 1GCQ C; 1UG1 A; 1ZUY A; 1UHF A; 2DL7 A; 1SRM A; 2DBK A; 5FWC A; 4OMQ A; 2KE9 A; 2GTJ A; 1UFF A; 2LZ6 B; 1VA7 A; 2L3Q A; 1VYU A; 2DA9 A; 1UEC A; 1ZLM A; 2FO0 A; 2J6K A; 2YSQ A; 3VS6 A; 2HCK A; 3EHQ A; 1Z9Z A; 1X27 A; 2A28 A; 5IHK A; 2ESW A; 1AWX A; 1Z9Q A; 1SHF A; 1T3L A; 1OPL A; 2EBP A; 3M0Q A; 1HJD A; 2AKK A; 2DM1 A; 4JZ3 A; 4CC7 A; 3VS1 A; 2O2O A; 4HVU A; 2DF6 A; 4AFS C; 1GFD A; 1QCF A; 1H8K A; 4CC3 A; 4J9H A; 3EG2 A; 1N5Z A; 4J9E A; 3EG3 A; 4J9D A; 5IXF A; 1H92 A; 1Y57 A; 1B3Q A; 1K0S A; 1NM7 A; 2CSQ A; 2F2V A; 2X3X D; 2YUQ A; 3VRZ A; 2ROT A; 2DLP A; 1WYX A; 2FPE A; 1WIE A; 2RN8 A; 1M3B A; 4WCI A; 2VWF A; 1G2B A; 2JXB A; 2KRO A; 2O88 A; 2EGC A; 4DEY A; 1Y0M A; 1ZUU A; 2LX7 A; 1X6G A; 2KT1 A; 1M27 C; 3KFV A; 3EG0 A; 2I0N A; 2CRE A; 1HD3 A; 2P4R A; 5HCK A; 2X3W D; 1QKX A; 2AK5 A; 3M0T A; 4LUE A; 3VS4 A; 1FMK A; 5GJV B; 3I5R A; 2CUD A; 2ED0 A; 1JXO A; 2D8H A; 2D0N A; 2RPN A; 1QWF A; 2M0Y A; 5I22 A; 2JM9 A; 2DL4 A; 2DL8 A; 1WA7 A; 2PZ1 A; 2EQI A; 4JPB W; 1WLP B; 5IXB A; 1AOJ A; 1TUC A; 1H3H A; 3VRY A; 1M3A A; 2OI3 A; 1GCQ A; 1M8M A; 1PRM C; 2RQU A; 1OEB A; 1YWP A; 4AFQ C; 1ZX6 A; 1WI7 A; 3I35 A; 1NLO C; 2KRM A; 2CH4 W; 1E6G A; 3H41 A; 2DRK A; 2HSP A; 5I11 A; 2LJ0 A; 2C0O A; 2KYB A; 1ZBJ A; 1AVZ C; 2CT3 A; 4RTY A; 3I9Q A; 4J9B A; 2A37 A; 1EFN A; 3RBB B; 1WX6 A; 3VS5 A; 5FWB A; 2O9S A; 4Z88 A; 3REA B; 2HBW A; 1K4U S; 1XOV A; 2MOX A; 3SEM A; 4LUD A; 5IHN A; 5IHI A; 4F14 A; 2LJ1 A; 2LP5 A; 2AKL A; 4A63 B; 2V1Q A; 2KYM A; 2NWM A; 4JJD A; 1BBZ A; 1ZUK A; 4HXJ A; 2YT6 A; 4F16 A; 4ORZ A; 1PWT A; 1X69 A; 4GBQ A; 1NYG A; 2L2P A; 2EGE A; 4RTZ A; 2KT8 A; 1K0X A; 2ED1 A; 1X2Q A; 1NYF A; 3A98 A; 2O9V A; 3FJ5 A; 2LQN A; 1LCK A; 2OJ2 A; 2NUZ A; 3PVQ A; 1NLP C; 3UF4 A; 2K6D A; 1X2K A; 1WXT A; 3M0U A; 2GBQ A; 2EW3 A; 3NGP A; 2EKH A; 2SRC A; 1RI9 A; 1UUE A; 3JV3 A; 1W6X A; 2JTE A; 3PVL A; 2VKN A; 1RUW A; 2ABL A; 3PE0 A; 1UE9 A; 2DL3 A; 3M0P A; 5EC7 A; 2RQR A; 1MUZ A; 2DYB A; 1YP5 A; 3TSZ A; 1BK2 A; 1BB9 A; 2IIM A; 2KXD A; 4LN2 A; 2DNU A; 2LJ3 A; 3SHW A; 2HEQ A; 1RLP C; 2JM8 A; 4LNP A; 2PTK A; 3EHR A; 1T0H A; 2KGT A; 1W1F A; 2V1R A; 3NPF A; 2EPD A; 3C0C A; 1PHT A; 1ABO A; 4RTT A; 2KBT A; 1VYV A; 2ENM A; 2FRW A; 1UDL A; 1UJY A; 2H8H A; 3ZL7 C; 1KJW A; 1OPK A; 1X43 A; 1VYT A; 2RMO A; 1AEY A; 2MCN A; 1AWW A; 2C0I A; 2LMJ A; 2BZX A; 1U5S A; 3M0S A; 1AWJ A; 5FW9 A; 2RNA A; 4K11 A; 3ULR B; 2GTO A; 4D8D A; 2DBM A; 2FRY A; 2GGR A; 5GJW B; 4CC2 A; 3CQT A; 2EYZ A; 1QLY A; 2KRS A; 2DE0 X; 1TUD A; 2O31 A; 2GNC A; 3R6N A; 1J3T A; 3H0H A; 3TSW A; 3LH5 A; 4Z89 A; 3REB B; 2KR3 A; 3NMZ C; 2G6F X; 2RF0 A; 2KEA A; 4JJB A; 4D8K A; 4X1V A; 2DVJ A; 4RTX A; 2BZ8 A; 2BTT A; 2CDT A; 4ZNX A; 1GRI A; 3NHN A; 3VS7 A; 2L3S A; 2JMA A; 2J7I A; 1M30 A; 1X6B A; 2RQV A; 2OAW A; 5L23 A; 1GBR A; 1WXU A; 2HDA A; 4J9F A; 1CKB A; 2YUN A; 2B86 A; 2PNI A; 4QT7 A; 1YWO A; 4IIM A; 2W0Z A; 2AZS A; 2C0T A; 3TVT A; 2W10 A; 2EVR A; 1E7O A; 2QDL A; 3VS2 A; 1AZE A; 1K76 A; 1JQQ A; 1CKA A; 4AG1 C; 1PKT A; 2JT4 A; 2K7A A; 4RTU A; 5IH2 A; 1S1N A; 4DEX A; 4AG2 C; 1MV3 A; 2L0A A; 4HVV A; 2YUO A; 1I1J A; 2KRN A; 1A0N B; 1K1Z A; 2J05 A; 2FG0 A; 2J6F A; 2AZV A; 2YUP A; 2FEI A; 4RUG A; 4J9C A; 4E6R A; 1ARK A; 1SHG A; 4HVW A; 1KSW A; 2JS2 A; 2D1X A; 3M0R A; 2DJQ A; 2K3B A; 1KIK A; 1AD5 A; 2DIL A; 1M3C A; 2SEM A; 1TG0 A; 1ZSG A; 2KXC A; 4F17 A; 1NG2 A; 2EGA A; 1FYN A; 4J9I A; 4JZ4 A; 4RTV A; 1E6H A; 1YCS B; 4GLM A; 4OMP A; 1MV0 B; 3EGU A; 2EYX A; 2CT4 A; 1V1C A; 3UA6 A; 1T0J A; 4Y92 A; 1CSK A; 2YDL A; 2J6O A; 3O5Z A; 3GBQ A; 2GQI A; 1HSQ A; 4HCK A; 1AZG B; 2KNB B; 2A08 A; 2JMC A; 4OMN A; 2K2M A; 4M4Z A; 2F2W A; 3I5S A; 1YN8 A; 4ESR A; 4FSS A; 1SRL A; 2FPD A; 4AFU C; 1JXM A; 4RTW A; 1BU1 A; 1WDX A; 1I07 A; 2J06 A; 2LCS A; 2VVK A; 2FPF A; 3VS3 A; 1U06 A; 2EYY A; 3H0I A; 4R0K A; 4EIK A; 1UHC A; 1NEB A; 2LQW A; 4AFZ C; 2JS0 A; 2DL5 A; 2K79 A; 2K9G A; 4JJC A; 1ABQ A; 1PNJ A; 5ECA A; 2ROL A; 1G83 A; 1OOT A; 2ECZ A; 1JU5 C; 2EYW A; 2CUB A; 2RQW A; 2DRM A; 1GBQ A; 1NEG A; 4CC4 B; 1JEG A; 1PRL C; 1B07 A; 2CSI A; 3IQL A; 4J9G A; 1YNZ A; 1QWE A; 1WFW A; 1AWO A; 2L3P A; 4LE9 A; 1QKW A; 1SEM A; 3QWY A; 2CH4 A; 1IO6 A; 1RLQ C; 1GFC A; 1K9A A; 2E5K A; 3UAT A; 1W70 A; 1U3O A; 1SPK A; 2DX1 A; 3VS0 A; 4IIO A; 1SSH A; 1T3S A; 3RNJ A; 2BZY A; 4Z8A A; 4OML A; 2RQT A; 2XMF A; 3U23 A; 3THK A; 2LNH B; 3UA7 A; 3EG1 A; 1GCP A; 3H0F A; 4OMO A; 4OMM A; 1JO8 A; 1UJ0 A; 3QWX X; 2F2X A; 2A36 A; 4KRT A; 1GL5 A; 2MIO A; 2DMO A; 2D8J A; 1KFZ A; 1OV3 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4O6J A; 2JW4 A; 4E7J A; 1N9R A; 1UTI A; 2WSE E; 4R55 A; 1FX7 A; 1RAI B; 1UFF A; 5FU6 B; 1TTH B; 3JCM P; 1D0Y A; 2RA2 A; 2DTO A; 2DA9 A; 2YSQ A; 3EHQ A; 1N9S A; 1X27 A; 2XDB A; 2IVW A; 1VQ6 A; 4BE1 A; 2A28 A; 1AWX A; 1EIF A; 1Z9Q A; 1T3L A; 4PJO E; 2LNV A; 1P92 A; 1HJD A; 4E2F B; 4PJO B; 1OI1 A; 4CC7 A; 2O2O A; 4HVU A; 1K9M U; 2LT4 A; 1QCF A; 4XQ3 A; 3JCM h; 4HT8 A; 2QI2 A; 5LJ5 f; 3L2W A; 3HHT B; 3BFM A; 1UGR B; 2XK0 A; 4B9X A; 2XD0 A; 1UB4 A; 4PKC C; 3CCS A; 4EMK B; 1Q86 C; 1FWZ A; 2X3X D; 5KCO A; 2ROT A; 2RN8 A; 1WYX A; 3CCE A; 3QHS A; 4F7U G; 3CXC P; 2RB6 A; 3GF5 A; 4FSX A; 1X6G A; 1KQS A; 2HQX A; 4PJO G; 4M7D F; 3P8H A; 4OP0 A; 5HCK A; 3P8B B; 2AK5 A; 1ZSZ A; 3VUB A; 3CCQ T; 4C0G A; 4MDX A; 2BE9 B; 5CKB A; 2CUD A; 3M54 A; 4KUD K; 3FRN A; 2H3E B; 4M78 G; 4M7A G; 1WA7 A; 1IGQ A; 2RHY A; 2VV5 A; 4JPB W; 4XU1 A; 1WGS A; 2LQ8 A; 5IXB A; 1AOJ A; 1H3H A; 1YI2 T; 1I4K 1; 2RQU A; 2EQJ A; 1YWP A; 1VQ8 T; 1IRX A; 4PK4 A; 2RM4 A; 2KRM A; 4M77 D; 4XTZ A; 1BCO A; 1LNX A; 1VQN T; 5I11 A; 4XAX B; 2WSC E; 2CP5 A; 2NUT A; 2A37 A; 5J39 A; 4Z88 A; 3X26 B; 2EJG A; 5I21 A; 2HBW A; 3QO3 A; 3RR6 A; 3HP9 A; 2E3H A; 3JCM J; 2MOX A; 3SEM A; 4E7L A; 3HKS A; 1RAH B; 3GLX A; 3JCM f; 3OW2 P; 4M77 C; 2A0F B; 1M90 R; 3CD6 A; 2CP7 A; 2AKL A; 5FRN A; 2HAX A; 4JJD A; 3EH1 A; 5KYU B; 3LWI A; 4HXJ A; 4TVR A; 4F16 A; 2X35 A; 1UGS B; 1C0M A; 2RHX A; 1NE8 A; 3TRE A; 2KT8 A; 3BE3 A; 3HFO A; 5CAI A; 1K0X A; 1NYF A; 3MCA B; 5GMK e; 3PVQ A; 2LQN A; 1LCK A; 2L8D A; 3CC7 Q; 5CR2 A; 3L2V A; 1HYO A; 2EW3 A; 4N4H A; 4A4K A; 3CMA Q; 1YHQ Q; 2RJC A; 3EG9 A; 2M9U A; 1RI9 A; 2SRC A; 1W6X A; 3ZBD A; 2X51 A; 5GAM e; 4M75 E; 3LH0 A; 2E12 A; 2DL3 A; 3M0P A; 4AMC A; 4M75 B; 1KHC A; 2VUB A; 1D3B A; 1BK2 A; 2AT1 B; 2JUF A; 2LJ3 A; 3CPF A; 9ATC B; 2FZC B; 1T0H A; 1W1F A; 1WJS A; 2V1R A; 3NPF A; 3C0C A; 1JJ2 P; 4RTT A; 3LGF A; 1VYV A; 1UJY A; 2H8H A; 4J83 A; 3ZL7 C; 1X43 A; 8AT1 B; 1VQ5 Q; 1D0X A; 2C0I A; 3M0S A; 1AWJ A; 4OGC A; 4GLK A; 1QQJ A; 4C5E A; 4K11 A; 2GTO A; 1YJN Q; 3TU4 K; 4D8D A; 1TUG B; 4J7F A; 4KH1 B; 4M7D G; 2CGH A; 2DBM A; 2HZY A; 2EYZ A; 2HD0 A; 4M77 F; 3R6N A; 4JRK A; 4OB3 B; 3CBP A; 4Z89 A; 2KR3 A; 2D9T A; 3CCV Q; 1D0Z A; 2PVD B; 4X1V A; 2ZCF B; 2QG9 B; 1N27 A; 3RUX A; 1OQK A; 4ZNX A; 1GRI A; 2KY9 A; 3CCJ Q; 3MPU B; 1N8R U; 2CZ7 B; 3RER A; 3RMQ A; 2DIG A; 2XDD A; 3RES A; 3C12 A; 1CKB A; 4M77 A; 2ATC B; 2L3R A; 1YWO A; 4C5I A; 3L1A A; 4LDX A; 2C0T A; 4Q5W A; 5GAM d; 3CXC S; 3E9F A; 5CKH A; 2QDL A; 4AG1 C; 1PKT A; 3EAE A; 1VQ9 T; 3RIR A; 2K7A A; 2O4X A; 3HRU A; 5GMK h; 5FU7 B; 2LVM A; 6AT1 B; 3JRZ A; 4MML A; 3G4S Q; 3TEE A; 2ZGW A; 3CBM A; 4HVV A; 3QDR B; 1YIT A; 1B34 A; 1K1Z A; 4NOY A; 5GAM h; 4PJL A; 3L42 A; 5GAN g; 2J6F A; 2VXF A; 5AT1 B; 1VQO T; 1SHG A; 2QTX A; 2JS2 A; 5CK9 A; 3L2R A; 3QDF A; 3EFO A; 2DVE A; 4XU2 A; 1WHK A; 2KXC A; 4IUP A; 1NG2 A; 2RI5 A; 2RJF A; 4J9I A; 1MMA A; 1YCS B; 3MO8 A; 1OX8 A; 1MV0 B; 1WPY A; 3EGU A; 1IHW A; 1V1C A; 2GCX A; 1K73 U; 4Y92 A; 4A4F A; 3G6E T; 1MGQ A; 3ME9 A; 3JCM W; 3GBQ A; 3OQ5 A; 4C92 E; 2QQ9 A; 2JMC A; 4C92 B; 2BUD A; 3SFM A; 2EQM A; 3CC7 A; 1GXI E; 1Q7Y U; 2Y4X A; 3OYD A; 1YJW A; 1M2V A; 4ESR A; 1RAB B; 4FSS A; 5CKE A; 1YHQ A; 2K3Y A; 2E64 A; 4PNO A; 5M9O A; 4MZM A; 3V7R A; 3SWN C; 1BU1 A; 2J06 A; 2Y4Y A; 3OW2 S; 2EWN A; 2YLC A; 2VVK A; 3HL8 A; 5GMK m; 1G8X A; 3OYF A; 1VQ7 Q; 1V29 B; 4EIK A; 2PU9 B; 1UHC A; 1NEB A; 3QG1 A; 3VKI A; 2PQW A; 2P84 A; 1M1K U; 3OBY A; 3JB9 J; 1VQL T; 2F1L A; 3VYH B; 1YJ9 Q; 1NJI R; 2EYW A; 2CUB A; 1GBQ A; 4J6Y A; 3MEW A; 3HSB A; 1MMD A; 2QGG A; 1K8A U; 2D6F A; 2COW A; 1BI3 A; 4E7H A; 1VQ5 A; 4KGZ B; 3CCM Q; 4M77 G; 1OZ2 A; 1OZ3 A; 4ZGJ B; 1QWE A; 5LL6 S; 1KQ1 A; 4XU0 A; 4LE9 A; 2EJ9 A; 3L2Q A; 5GAM f; 5I2S A; 5KH6 A; 4PJO D; 2QA4 A; 3MEA A; 1K9A A; 2RO0 A; 5FU6 C; 3CCV A; 3OA6 A; 3MKD A; 2M0O A; 4RKU E; 3G1J A; 5KYY B; 1MMG A; 1ZA1 B; 3LX7 A; 2QK0 A; 1SSH A; 2OTJ A; 1T3S A; 4AT1 B; 3OS0 A; 4XTX A; 1YIJ A; 3HRT A; 3U23 A; 3CCR T; 3E9G A; 3THK A; 5GAN 2; 4PJO C; 2ZPE B; 1TS9 A; 1YCY A; 3M55 A; 4PL6 A; 2LC4 A; 2X4X A; 1GL5 A; 1SKU B; 4E7K A; 3X28 B; 2WSF E; 2DMO A; 3OYN A; 4RMO A; 4ZTJ A; 2D8J A; 1OV3 A; 1UGV A; 2CP6 A; 2QDY B; 3P8D A; 4EMK C; 5GAN 4; 4PJM A; 5LJ3 j; 1VQ6 Q; 3I56 Q; 1SF9 A; 2DO3 A; 1UG1 A; 1VQP T; 1SRM A; 4OGE A; 2KE9 A; 1OU8 A; 2LZ6 B; 2L3Q A; 3SWN A; 3M58 A; 1QVG S; 1UEC A; 2FO0 A; 1KC8 R; 3JCM X; 1W2B P; 4QVD A; 2MK5 A; 3DLL A; 1XNI A; 1N6A A; 2ZAE A; 2YRD A; 4RCB A; 2ESW A; 3MP8 A; 1M90 C; 3CMA T; 3CCL T; 1SHF A; 4ZTF A; 4KT0 E; 3RKX A; 1KC8 U; 3HRS A; 2DM1 A; 3OYM A; 2DF6 A; 1OU9 A; 4E7Z A; 1H8K A; 4J9H A; 5KYX B; 1AT1 B; 3MP6 A; 4BDY A; 2LT1 A; 3UPU A; 2FPE A; 1KD1 R; 2XU8 A; 2VWF A; 3INZ A; 3FIF A; 2EGC A; 4PJO F; 5FRM A; 3CXC A; 1QVF P; 4KUL A; 1M27 C; 3KFV A; 5KYN A; 3EG0 A; 1YJN T; 2DER A; 1M9S A; 2EQU A; 2P4R A; 4PLL A; 1VQ7 A; 1PC0 A; 4LDU A; 3DKM A; 3E19 A; 3GOX A; 2X3W D; 1QKX A; 3FEO A; 4JDS A; 4LUE A; 2HKN A; 1YJ9 A; 1LPL A; 2LDM A; 2ED0 A; 5CQY A; 4PJO A; 2D8H A; 2RPN A; 3CCJ T; 4ZGE B; 2YRV A; 3CCM A; 1PSF A; 3M53 A; 1QWF A; 4IUQ A; 2JOY A; 2YXY A; 2PZ1 A; 5GAO p; 4MZP A; 3X20 B; 3C4S A; 1Q82 U; 1I8F A; 1WLP B; 5A0G A; 4M75 D; 4EMK A; 2RHU A; 1KK7 A; 2KAF A; 3JCM b; 3VRY A; 3PNW C; 1X01 A; 4NL3 A; 4C5G A; 4RCC A; 1WI7 A; 1NLO C; 2LCL A; 1Q81 U; 1E6G A; 5GAN j; 3H41 A; 2COY A; 2DRK A; 1MND A; 3CD6 Q; 2LJ0 A; 2WAC A; 3F70 A; 2KYB A; 4WF2 A; 4RTY A; 3CPW S; 3I9Q A; 2E4H A; 2QAZ A; 3G4S T; 4M75 C; 1EFN A; 1WX6 A; 1G3Y A; 3REA B; 3A8G B; 2AHJ B; 4J8O A; 4Y28 E; 2DKG A; 4A63 B; 3OW2 A; 3S6W A; 4XTU A; 2KYM A; 4OB2 B; 4DBF A; 2MMP A; 1ZUK A; 3H6Z A; 2X4W A; 4EPC A; 1UGP B; 3EFR A; 3KXT A; 1PWT A; 4ZN3 A; 1X69 A; 3CME T; 1K9M R; 4XK8 E; 3I56 A; 3FDR A; 2ED1 A; 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