The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
18
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sequence length |
96
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structure length |
96
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Chain Sequence |
EKKEQKEKEKKEQEIKKKFKLTGPIQVIHLAKACCDVKGGKNELSFKQGEQIEIIRITDNPEGKWLGRTARGSYGYIKTTAVEIDYDSLKLKKDLE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Redox-Regulated Conformational Changes in an SH3 Domain
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
FYN-binding protein
|
| molecule tags |
Signaling protein
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
18
|
| structure length |
96
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| sequence length |
96
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2006-04-28 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF07653 | SH3_2 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3R6N A; 4OMM A; 2JMA A; 1WA7 A; 4F17 A; 2K2M A; 2CH4 A; 2RNA A; 1AOJ A; 3ULR B; 5GJV B; 2AKK A; 2DIL A; 1JU5 C; 1TG0 A; 2RF0 A; 3PE0 A; 4IIO A; 1SHG A; 2KRM A; 2O9V A; 3LH5 A; 5FW9 A; 2EGC A; 1BB9 A; 4EIK A; 1NEB A; 3C0C A; 3JV3 A; 2D8H A; 5FWB A; 1NM7 A; 1QWE A; 2GGR A; 4RTW A; 5IHN A; 3UA7 A; 2KT8 A; 1TUC A; 4Z8A A; 1UG1 A; 2O2O A; 1GBQ A; 2M0Y A; 2W0Z A; 2EQI A; 1ZBJ A; 1X6B A; 4AG2 C; 1QKW A; 1AWW A; 1OOT A; 4RTU A; 3PVL A; 2D0N A; 3ZL7 C; 4ZNX A; 2ENM A; 1H3H A; 3EHR A; 1NG2 A; 1K4U S; 2X3W D; 1M3C A; 2YUQ A; 2I0N A; 1VA7 A; 2YT6 A; 2J06 A; 1JO8 A; 1Y57 A; 4AG1 C; 4ESR A; 2DLP A; 1KSW A; 3EG2 A; 3SEM A; 3UF4 A; 4RTT A; 1WXT A; 2DMO A; 2FG0 A; 1NYF A; 1ZLM A; 3M0Q A; 4K11 A; 2K6D A; 4RTV A; 3REB B; 3KFV A; 4IIM A; 2F2W A; 4LNP A; 2CT4 A; 2ROT A; 2KXD A; 1JQQ A; 4LN2 A; 2LP5 A; 1HD3 A; 1U06 A; 2YUP A; 5I22 A; 2OJ2 A; 5IH2 A; 2B86 A; 1V1C A; 2HEQ A; 3QWX X; 3O5Z A; 4M4Z A; 4R0K A; 1NEG A; 2C0T A; 1J3T A; 2GQI A; 2MOX A; 2YUO A; 2EGE A; 1I1J A; 4OMQ A; 4LUE A; 3VS5 A; 2JW4 A; 1UJY A; 2HCK A; 1PKS A; 2DNU A; 3NHN A; 2EGA A; 2EYZ A; 4D8D A; 2EVR A; 2D8J A; 2JS2 A; 3I9Q A; 1MV3 A; 2LQW A; 2FPE A; 2F2V A; 1T3S A; 2AKL A; 2DVJ A; 1CKB A; 1GFC A; 1UHC A; 1UUE A; 2KEA A; 5IHK A; 1RI9 A; 4DEX A; 2X3X D; 2C0I A; 5GJW B; 1X2Q A; 5IHI A; 2RPN A; 4QT7 A; 2L3Q A; 1SRM A; 2J6O A; 5L23 A; 3U23 A; 2LNH B; 2DF6 A; 2EBP A; 4HCK A; 1M8M A; 1MUZ A; 1SHF A; 1AD5 A; 5I11 A; 3NGP A; 1ZX6 A; 3M0T A; 1HJD A; 2LCS A; 1KIK A; 2DYB A; 1ZUK A; 5IXF A; 2ED1 A; 4LE9 A; 2SRC A; 4RTX A; 4JJD A; 2MIO A; 1UE9 A; 1X27 A; 2DL8 A; 2FRW A; 1X6G A; 2D1X A; 1Y0M A; 1ARK A; 4HVV A; 2KXC A; 3NMZ C; 3I5S A; 4JJC A; 2W10 A; 4RUG A; 1RLQ C; 2L2P A; 1M30 A; 2EKH A; 2KRN A; 2A28 A; 4D8K A; 1JXM A; 2DBK A; 1YWP A; 4AFU C; 2RQV A; 2HBW A; 3FJ5 A; 2YSQ A; 2ABL A; 1X43 A; 2KE9 A; 1OV3 A; 2OI3 A; 2ESW A; 1Z9Q A; 1PWT A; 2GBQ A; 2CSQ A; 2LX7 A; 2XMF A; 2A36 A; 2EYY A; 2LJ0 A; 1N5Z A; 2RQW A; 1ABQ A; 1BBZ A; 1G2B A; 1NLP C; 2L3P A; 3I35 A; 4DEY A; 1NLO C; 2EYW A; 3VS6 A; 1T3L A; 2KRO A; 1WYX A; 2DL3 A; 2CH4 W; 4JZ4 A; 1ZUY A; 2DL7 A; 3VRZ A; 1ABO A; 1CKA A; 2AK5 A; 3SHW A; 2IIM A; 1VYU A; 4KRT A; 3VS4 A; 4GLM A; 2PNI A; 1K1Z A; 2VWF A; 2M51 A; 4OMO A; 1PRM C; 3QWY A; 1UHF A; 1T0J A; 1X2K A; 2JM9 A; 4J9G A; 2KBT A; 2SEM A; 1YWO A; 1GFD A; 1U5S A; 2KNB B; 3M0P A; 2DRM A; 4JJB A; 4CC7 A; 4FSS A; 1I0C A; 4OMN A; 1JXO A; 2A08 A; 2LQN A; 2NUZ A; 4LUD A; 3VS7 A; 1K0S A; 2RMO A; 3M0R A; 1ZUU A; 2KT1 A; 4Z88 A; 4JZ3 A; 2JXB A; 3THK A; 1H8K A; 2L0A A; 1VYT A; 2VVK A; 3VS0 A; 2FPD A; 2GTO A; 4WCI A; 2DX1 A; 2H8H A; 2K9G A; 2CT3 A; 1KJW A; 1UTI A; 2MCN A; 1QWF A; 3H0F A; 1K9A A; 4A63 B; 1W1F A; 2J6K A; 3UAT A; 4J9D A; 1OPL A; 3VS2 A; 3EG3 A; 2K7A A; 3VRY A; 1GCP A; 2V1Q A; 2JMC A; 1UDL A; 2JM8 A; 1QCF A; 2BZ8 A; 1KFZ A; 2DL4 A; 2J7I A; 2CRE A; 1WDX A; 2GNC A; 2A37 A; 1M3A A; 3H41 A; 2C0O A; 2L3S A; 4J9F A; 5EC7 A; 2PTK A; 1AVZ C; 2QDL A; 1MV0 B; 5IXB A; 1K0X A; 3H0H A; 4X1V A; 2GTJ A; 1AEY A; 2BTT A; 1AWX A; 2EW3 A; 1UGV A; 1WXB A; 4Y92 A; 2KRS A; 2HSP A; 1U3O A; 2DM1 A; 4CC4 B; 2JTE A; 4OML A; 1A0N B; 1WLP B; 1SRL A; 2DBM A; 1QLY A; 1SPK A; 2CUB A; 1AWO A; 5FWC A; 3GBQ A; 2BZY A; 1M3B A; 1YNZ A; 1PHT A; 1BK2 A; 2DA9 A; 2FPF A; 2CDT A; 2ECZ A; 1GL5 A; 3EG1 A; 2LJ3 A; 2G6F X; 2J6F A; 2O9S A; 2DRK A; 2J05 A; 2DE0 X; 3RBB B; 3IQL A; 1WXU A; 4J9H A; 1AZG B; 4OMP A; 2RQR A; 2P4R A; 4J9C A; 4CC2 A; 1TUD A; 2RQU A; 1FYN A; 1GCQ C; 2EYX A; 4F14 A; 4ORZ A; 2K79 A; 4J9B A; 2PZ1 A; 1WX6 A; 2YUN A; 1GRI A; 1WIE A; 1SEM A; 3M0U A; 4AFQ C; 3EG0 A; 2LZ6 B; 2AZS A; 1SSH A; 4HXJ A; 4F16 A; 2EPD A; 1YN8 A; 3TVT A; 1PKT A; 2NWM A; 2KGT A; 5HCK A; 4E6R A; 1CSK A; 2AZV A; 2FRY A; 1WI7 A; 1NYG A; 2FEI A; 2BZX A; 3I5R A; 3A98 A; 1FMK A; 1RUW A; 4AFZ C; 1OPK A; 2O88 A; 2LMJ A; 2F2X A; 3TSZ A; 3UA6 A; 1IO6 A; 3EHQ A; 3VS3 A; 4GBQ A; 3REA B; 2KR3 A; 3NPF A; 2VKN A; 2ROL A; 1GBR A; 2HDA A; 2YDL A; 2LJ1 A; 1E6H A; 1H92 A; 3CQT A; 2OAW A; 2E5K A; 1EFN A; 2FO0 A; 1Z9Z A; 1PNJ A; 2JT4 A; 2CUD A; 3EGU A; 2CSI A; 3H0I A; 1T0H A; 2K3B A; 2O31 A; 4JPB W; 2V1R A; 4HVU A; 1UFF A; 2JS0 A; 4RTZ A; 1JEG A; 1G83 A; 3TSW A; 1RLP C; 1BU1 A; 4HVW A; 1GCQ A; 1W6X A; 1W70 A; 1AWJ A; 4RTY A; 1QKX A; 1YP5 A; 1E7O A; 1B07 A; 1LCK A; 3PVQ A; 1AZE A; 1OEB A; 1UEC A; 1E6G A; 4CC3 A; 1X69 A; 2DJQ A; 4J9E A; 1YCS B; 2ED0 A; 1B3Q A; 2RN8 A; 1HSQ A; 1PRL C; 1XOV A; 3RNJ A; 2KYM A; 3M0S A; 1K76 A; 5ECA A; 1I07 A; 2KYB A; 1M27 C; 1S1N A; 1VYV A; 1ZSG A; 3VS1 A; 4AFS C; 1WFW A; 2RQT A; 4Z89 A; 1UJ0 A; 4J9I A; 2DL5 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2NLU A; 4OMM A; 1MND A; 3CD6 A; 3OYJ A; 3HSB A; 3QXE B; 2FVU A; 3FIF A; 3D7S B; 3M58 A; 5LJ3 d; 2DIL A; 2E65 A; 1SHG A; 3ER0 A; 2MWO A; 2YXY A; 3V8K A; 2ZPH B; 1NEB A; 3UT1 A; 2CP2 A; 2DXB A; 3FJP A; 4X34 A; 2XHC A; 4C92 C; 3EGD A; 3MEA A; 5FWB A; 3EGX B; 1NM7 A; 1QWE A; 3CXC A; 1SSF A; 1UGS B; 3RKW A; 5GAN j; 3QII A; 1KG1 A; 2O2O A; 3HHT B; 2XG8 D; 2W0Z A; 1ZBJ A; 5KYW B; 1QVP A; 1AWW A; 2RHX A; 1M8V A; 4RTU A; 2X4J A; 3PVL A; 4XU1 A; 1NG2 A; 4FYY B; 2X3W D; 2YUQ A; 2L5Q A; 2VGM A; 1VA7 A; 3GNF B; 1TTH B; 4C8Q B; 1IHW A; 3SEM A; 3UF4 A; 1WXT A; 3QYG B; 1NYF A; 2PQW A; 4TVR A; 2K6D A; 4C0Z A; 3REB B; 4FT2 A; 4JLI A; 4J7I A; 4XAX B; 4IIM A; 3CCJ A; 3VUB A; 4LNP A; 3RUX A; 3OYI A; 1JQQ A; 4EMG A; 2E3H A; 2IVW A; 3QZ5 B; 2ZPI B; 2OJ2 A; 2NUP B; 2K2V A; 1V1C A; 4M4Z A; 3O5Z A; 4R0K A; 4GY5 A; 1QVG S; 2QAS A; 4WF2 A; 1Q82 R; 1J3T A; 2GQI A; 4FW2 A; 4A4F A; 1OQK A; 5LJ3 j; 2LX9 A; 2JW4 A; 1PKS A; 1YJN T; 2QDY B; 2EGA A; 3CXC P; 2EYZ A; 2L3R A; 2D8J A; 2P0K A; 1MV3 A; 2EWN A; 2LQW A; 2NUT A; 2O4X B; 2A7Y A; 1FX7 A; 1BKB A; 1T3S A; 2AKL A; 3CCS T; 4E7H A; 2B8A A; 1UUE A; 2MPX C; 2RB6 A; 1I81 A; 2KEA A; 3G7Z A; 5GAM d; 1X2Q A; 1C1A A; 2RPN A; 4NL2 A; 5GMK h; 1KHI A; 2OAU A; 5L8R E; 2COW A; 2EBP A; 2E6Z A; 2BUD A; 3M59 A; 5I11 A; 1ZX6 A; 3UPU A; 4E7K A; 3SWN C; 1HJD A; 2LVM A; 3CC7 Q; 2CKK A; 4M78 D; 5C0M A; 2ED1 A; 5D6Y A; 4LE9 A; 2SRC A; 4JLG A; 2E64 A; 2MIO A; 1Y07 A; 5IT9 E; 4C5H A; 1IGU A; 1ARK A; 4MDW A; 3L2U A; 3CPF A; 1MMA A; 1IHV A; 1RLQ C; 3NFC A; 4M77 C; 1M30 A; 3NTH A; 2VGN A; 3C95 A; 1FWZ A; 2VYT A; 2PUO B; 4AFU C; 4M7A E; 4IUQ A; 5FU7 B; 4BD3 A; 5CKD A; 1QQJ A; 5A2Q E; 1YI2 Q; 3HFO A; 4IUT A; 3S6W A; 1KK7 A; 1Y71 A; 2OI3 A; 1Z9Q A; 3QG1 A; 2GBQ A; 1N5Z A; 2DTO A; 4QKU A; 1VQP Q; 4BI4 A; 1T3L A; 1WYX A; 2CH4 W; 1ZUY A; 1VQ6 Q; 2YRC A; 3R6O A; 1CKA A; 4M75 D; 3SHW A; 2QK0 A; 2IIM A; 2YLB A; 3CCU A; 4GLM A; 2PNI A; 1K1Z A; 1YJ9 T; 4J7F A; 5IN1 A; 3EGD B; 5KE2 A; 1MMG A; 3FLG A; 3SDZ A; 3JCM W; 1YWO A; 5GAO q; 2KNB B; 2GQV A; 1O9S A; 2DD4 A; 3P8B B; 2A08 A; 3BE3 A; 3M5A A; 2DZC A; 3GF5 A; 4C8Q C; 4JZ3 A; 2DPP B; 1H8K A; 3FDR A; 1VYT A; 3JCM e; 4OF1 A; 3VS0 A; 2FPD A; 2YHT A; 3VU3 C; 2P84 A; 3NTI A; 1O75 A; 3JCM P; 1K73 C; 1EZZ B; 6AT1 B; 2DX1 A; 3N5B B; 4PFO A; 2CP3 A; 5GAN 3; 2F5K A; 1RAE B; 1M2V B; 4A63 B; 1X6O A; 3UAT A; 1OPL A; 3VRY A; 2V1Q A; 5GAN 4; 2D6F A; 4M7D F; 2FL7 A; 2JM8 A; 3X28 B; 1ZA1 B; 1KFZ A; 4FYW B; 3G6E T; 2J7I A; 1W2B P; 4JRK A; 3OS2 A; 4LDW A; 4PJO E; 5EC7 A; 4QW2 A; 2HD0 A; 4L5G A; 2H3E B; 2QDL A; 1PCX A; 2WSF E; 3H0H A; 2VAS A; 1VUB A; 4X1V A; 1VQL T; 3CC4 A; 1VQ8 T; 1WXB A; 1YCY A; 1WJR A; 1OU9 A; 5CQY A; 3URG A; 3QKJ A; 1U3O A; 2ZPB B; 4CC4 B; 3PGG A; 4OML A; 1D3B A; 1YJN Q; 1BCM A; 1QLY A; 5FWC A; 1AT1 B; 2BZY A; 2LDM A; 4C92 E; 1TS9 A; 1I5O B; 1BK2 A; 1RAG B; 4QQ6 A; 4F04 B; 3UWN A; 3CCS Q; 1GL5 A; 4EDU A; 3A8O B; 5CO7 A; 3TEE A; 4BUG A; 4M78 E; 3KXT A; 3RBB B; 2J05 A; 2DE0 X; 4OMF B; 1OZ2 A; 4PLL A; 4OMP A; 2P4R A; 4J9C A; 1K73 U; 1TUD A; 2X9H A; 4Q5W A; 1VQ9 A; 4J9B A; 1KC8 C; 2PZ1 A; 5I2S A; 2QQR A; 3CCL T; 1VQK A; 4YTL A; 4MDX A; 5FU7 C; 3EG0 A; 2NWM A; 1S72 A; 2CP0 A; 2ZPG B; 5FRO A; 3DB4 A; 3CCM T; 3SWN A; 3RKX A; 1U1T A; 2AZV A; 2FRY A; 4J83 A; 1Q7Y C; 3L2Q A; 1R0B G; 2BZX A; 3I5R A; 3A98 A; 3CC2 T; 5GAN 8; 4KGX B; 1OPK A; 2LQK A; 5GMK j; 4XTU A; 2O88 A; 2LMJ A; 3CCR T; 3UA6 A; 1QCO A; 4M75 E; 2DET A; 2P4T A; 5GAO n; 1K8A R; 4C5G A; 4GLK A; 1GBR A; 3A8M B; 3EH1 A; 3CBP A; 4QVZ A; 2D9T A; 4XTV A; 1G8X A; 1EFN A; 1ZHI A; 2A3L A; 1Z9Z A; 1PNJ A; 1D1C A; 2CSI A; 1QVF A; 2DJZ A; 2V1R A; 1UFF A; 2QQA A; 2RJF A; 3EAE A; 1WQW A; 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2DVE A; 2ROT A; 3OQ5 A; 4M75 F; 4LN2 A; 3H9N A; 2LP5 A; 1HD3 A; 1OX9 A; 7AT1 B; 1U06 A; 2HL3 A; 5IH2 A; 2B86 A; 3X24 B; 2E6N A; 1JJ2 P; 5KYN A; 1VQ7 Q; 2C0T A; 1M90 R; 2EKO A; 3E1S A; 5GAM h; 3SWN B; 3BDU A; 3GLX A; 3SD4 A; 1X01 A; 1HYO A; 3P8D A; 2BE9 B; 2F69 A; 1KQS A; 4PJO G; 4C0D C; 3RR6 A; 1KHC A; 2FPE A; 1YJW Q; 4ZGJ B; 3CCM Q; 1YIJ T; 1GFC A; 2VUB A; 5GAN e; 1G5V A; 1UHC A; 1D0Y A; 1RI9 A; 1YFN A; 3BY7 A; 5FLX E; 2XKO C; 2C0I A; 1M1K U; 2ZAE A; 5IHI A; 4BB7 A; 3KBG A; 1SRM A; 2H3J A; 4M7A D; 2J6O A; 1WJQ A; 2LNH B; 2C06 A; 1M8M A; 3CCR Q; 1VOM A; 3M54 A; 1MUZ A; 1SHF A; 3RMQ A; 3NGP A; 5LJ5 h; 1MGQ A; 4C92 G; 3OBW A; 2CP6 A; 1EIF A; 5IXF A; 2X4Y A; 2CZ6 B; 4RTX A; 4JJD A; 1UE9 A; 2DL8 A; 2FRW A; 1ZA2 B; 4M78 G; 4X9C A; 1UGR B; 1Y0M A; 1KD1 R; 3VKI A; 3OS5 A; 2DXT A; 2FZC B; 2L2P A; 2HQX A; 3CCE A; 3ME9 A; 1VIF A; 1JXM A; 4XU2 A; 4JS4 A; 4JRQ A; 1G3T A; 4DBR A; 1M9S A; 3OW2 A; 3X20 B; 2ABL A; 1X43 A; 1OV3 A; 5CKF A; 2ESW A; 3GNG A; 2EQJ A; 4C0F A; 2XMF A; 3QJ6 A; 3OYE A; 4ELZ C; 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