The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
15
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sequence length |
66
|
structure length |
66
|
Chain Sequence |
KKSRLWVDRSGTFKVDAEFIGCAKGKIHLHKANGVKIAVAADKLSNEDLAYVEKITGFSLEKFKAN
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structure of Sla1p homology domain 1 and interaction with the NPFxD endocytic internalization motif.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Endocytosis, protein binding
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| source organism |
Saccharomyces cerevisiae
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| molecule keywords |
Cytoskeleton assembly control protein SLA1
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| total genus |
15
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| structure length |
66
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| sequence length |
66
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2006-06-14 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 type barrels. |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2HBP A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3ZBD A; 4C8Q F; 2DL3 A; 4M77 A; 4QKU A; 1B34 B; 1BB9 A; 2RQR A; 3CCM Q; 2EQM A; 3QKJ A; 1QCF A; 4C5H A; 5A0L A; 2LC4 A; 3I55 Q; 1JU5 C; 2KK4 A; 2PVO B; 4D8D A; 4IIM A; 4RCB A; 4C0D B; 2ED0 A; 2H3E B; 3NGP A; 5A0G A; 1OPK A; 3MP6 A; 5DLQ E; 3QSU A; 2FZC B; 4O6J A; 1ZA1 B; 1NBE B; 2XG8 D; 3LW5 E; 2GGR A; 2J06 A; 2J6K A; 2EYW A; 3PVL A; 2DTO A; 1YBY A; 2G6F X; 4A4H A; 3T9N A; 1WDX A; 1N27 A; 3NMZ C; 1ZQ1 A; 4XTU A; 1ACM B; 2XU8 A; 4IUR A; 1VA7 A; 4LDY A; 3UA6 A; 4OB0 B; 1UEB A; 2RD1 A; 5KE2 A; 1LPL A; 4M78 F; 4C92 C; 2EYZ A; 5HCK A; 1R77 A; 1W4S A; 3BY7 A; 4Z88 A; 2AHJ B; 5IHK A; 1Y96 A; 3PE0 A; 1YWP A; 4J9G A; 4F14 A; 4IUQ A; 1DJ7 B; 2M0O A; 1OU9 A; 3HSB A; 1M1F A; 4DQ2 A; 4D6W A; 3CCJ A; 4J9C A; 5GAM j; 3ER0 A; 1K4U S; 2H3J A; 3VS0 A; 1H8K A; 4OMN A; 4J7I A; 4J83 A; 3LLR A; 3OYI A; 2CP2 A; 1VQ9 A; 3X20 B; 4PFZ A; 1G8X A; 4M75 C; 4KUI A; 4M75 E; 4A4K A; 4HKE A; 1X6O A; 3QII A; 4KUL A; 1RI9 A; 2JTF A; 1Q82 C; 3SD4 A; 2KR3 A; 3QWY A; 1Q82 U; 1JO8 A; 5GMK i; 4C92 B; 1NPR A; 4JPB W; 2F2W A; 5LJ5 e; 5EC7 A; 5LJ5 d; 1W1F A; 4NOY A; 1GFD A; 4E7I A; 1K1Z A; 1BI0 A; 1LNX A; 5CAI A; 4C0G A; 4F7U E; 1SF9 A; 2YRC A; 2DXU A; 4XTV A; 1KD1 C; 5LJ3 h; 3G4S A; 2DRK A; 2MF2 A; 2NUZ A; 1VQ5 Q; 3J81 E; 1AD5 A; 1X01 A; 4NL3 A; 4RTW A; 2X3W D; 3I56 T; 1OX9 A; 4KGX B; 1H92 A; 5DM7 R; 3QJY A; 3D7S B; 4F16 A; 3M0U A; 2O01 E; 3CMA T; 5CKE A; 4X1V A; 1GCQ C; 4EIK A; 2E70 A; 4M75 B; 1BCO A; 4L59 A; 2KRN A; 4AFS C; 2K79 A; 3FJP A; 5IHN A; 1P92 A; 4PJO F; 4FCY A; 2FVU A; 3VUB A; 2FL7 A; 4OGC A; 2XDD A; 2JVV A; 2DTH A; 2RQV A; 3M9Q A; 4J6Y A; 2IG0 A; 3PIO A; 2F2V A; 1R0C B; 1YJ9 A; 4Y91 A; 2EAY A; 1GCP A; 3MEU A; 1WQW A; 2YLC A; 3SWN C; 2C06 A; 3LH0 A; 3I5R A; 3KBG A; 3S3M A; 4OB3 B; 3HP9 A; 1X69 A; 2V8I A; 4M7D A; 3CME Q; 2A3L A; 2P4T A; 4FSS A; 5GJV B; 4D8K A; 1YWO A; 1M5Q 1; 1ZLM A; 2DF6 A; 3GP8 A; 4KH0 B; 3VRZ A; 5KCH A; 4A53 A; 1M90 R; 3RKY A; 4J5Y A; 3EHQ A; 4FW2 A; 2K3B A; 5I11 A; 2K9G A; 1TH7 A; 5GAN h; 9ATC B; 2X4X A; 3HL8 A; 4C0F A; 1QKW A; 2MAM A; 5FWB A; 2ABL A; 3M4Y A; 1OEB A; 4C8Q E; 3P8D A; 1D3B A; 5KYY B; 3SWN B; 5CR2 A; 4R56 A; 4ZGE B; 1T0H A; 1Z9Q A; 4FYW B; 1GXI E; 1Q7Y C; 2XMF A; 4IIO A; 2CZ7 B; 4WTO B; 2LJ0 A; 2FO0 A; 1JJ2 A; 1B07 A; 2V8K A; 2BKD N; 2GTO A; 3MCA B; 4J9H A; 2D1X A; 3VS3 A; 2KNB B; 3RMS A; 3PMI A; 1BI2 A; 1WHK A; 3M0R A; 4DA4 A; 2E3I A; 4NL2 A; 2YT6 A; 2OTL Q; 1VQP T; 2E5K A; 1X27 A; 2QK0 A; 3O5Z A; 2LX7 A; 1SRL A; 1YIT A; 2EFI A; 1VQL T; 8ATC B; 2IIM A; 5FU7 C; 5FRO A; 2ECZ A; 2FRY A; 4KUD K; 3M4G A; 1RLQ C; 2PVG B; 1YJW Q; 4J9F A; 3G6E A; 2M1H A; 2X35 A; 1A0N B; 2L8D A; 4M78 C; 4M78 E; 4OMQ A; 1NEG A; 4UC4 A; 2HL5 C; 2LCC A; 4M4Z A; 3CCS A; 1Y57 A; 2KI7 A; 2DD4 A; 3EFO A; 2GFU A; 4PK4 A; 2IVW A; 3OYJ A; 1IXD A; 2JTM A; 3GIB A; 3C0C A; 4C5G A; 4RTX A; 3NFC A; 1BIB A; 3PNW C; 2HKQ B; 2HSE B; 2CKK A; 1IHW A; 3G71 A; 4LE9 A; 2E10 A; 1UFF A; 1QMC A; 5KYU B; 2W10 A; 3OBW A; 2J6F A; 1GRI A; 4J9I A; 2L3P A; 5FU7 B; 4M77 G; 2KY9 A; 5CKH A; 1U1S A; 3MEV A; 4HVU A; 2KRS A; 3EH1 A; 2EKH A; 3CCV Q; 2F69 A; 3FB9 A; 4QQ6 A; 4M78 B; 1Q81 R; 1VYV A; 1XQH A; 2E6N A; 3VKI A; 2L2P A; 1UGV A; 2CS7 A; 2E65 A; 4FIB A; 3JCM f; 3UPU A; 1E7O A; 4GY5 A; 4C92 A; 1ARK A; 3CCQ Q; 2V26 A; 2VXE A; 2L3Q A; 1AZE A; 5HK0 A; 2RNA A; 1RLP C; 4BD3 A; 2M16 A; 1BIA A; 1AHJ B; 2ZCF B; 3DLM A; 5FWC A; 2DX1 A; 1VQM A; 3CCE Q; 1VIF A; 1UGS B; 1QVG A; 4FSX A; 1WHL A; 4GBQ A; 1YHQ Q; 1SSF A; 2ED1 A; 1B3Q A; 5LJ5 g; 2HBW A; 5DY9 A; 1ZUK A; 2XDP A; 2LT4 A; 2XIC A; 2YUO A; 2CZ1 B; 4PJO C; 2YRD A; 4PJO E; 1M1K R; 3BFM A; 2EJG A; 2G3R A; 3TCJ A; 2LQ8 A; 3M0T A; 4JJD A; 4HCZ A; 1Q81 C; 3VRY A; 4HCB A; 2P4R A; 5A0D A; 5CIU A; 2CZ0 B; 2KYM A; 1Q81 U; 3CCJ T; 3RER A; 2RI2 A; 5GMK h; 3LYI A; 4FT4 A; 2DL8 A; 3FRN A; 1QP2 A; 2O2O A; 1OQK A; 3PTA A; 3CC2 A; 2H8H A; 1R0B G; 1VUB A; 3PFS A; 4Z02 A; 3MET A; 2CP0 A; 5I21 A; 1W2B P; 2AKL A; 1WGS A; 5A2Q E; 1M8V A; 4TVR A; 2OTJ A; 1LJO A; 1RAD B; 1E6H A; 2KT8 A; 1VQO Q; 2RPN A; 1GCQ A; 3NTH A; 4PJO B; 1JJ2 S; 1S1N A; 1K76 A; 3L2U A; 1M1K C; 3PVQ A; 3G4S T; 4A4F A; 2JXB A; 1RL2 A; 1OU8 A; 5AYF A; 1QKX A; 1M1K U; 3E1S A; 1FYN A; 3EG9 B; 4DOW A; 2QQ9 A; 2KEA A; 3OMG A; 2QQR A; 2DO3 A; 4ZGD B; 3OW2 A; 1M4Z A; 3OMC A; 3P8B B; 2HQE A; 2KAF A; 2PUK B; 3OS1 A; 1Y7X A; 1I5L A; 4R0K A; 1HXD A; 5LJ3 j; 2JM8 A; 3M56 A; 5GAN f; 1H64 1; 3M54 A; 3OSS C; 3SWN A; 2YXY A; 3CD6 A; 2LNV A; 3VU3 C; 3HPW A; 1K0X A; 1F1B B; 2LX9 A; 1I07 A; 2DEQ A; 3A5Z B; 5HKC A; 2EYQ A; 2LMJ A; 1S72 A; 5CKF A; 3OYM A; 2LTO A; 1YJW T; 3EGU A; 1R8O B; 3I56 Q; 1K8A R; 3CC4 A; 4Z89 A; 1G3S A; 3OQ5 A; 1I1J A; 2ZGW A; 4QW2 A; 2LCS A; 2D0N A; 1XJW B; 4RTV A; 4M7A C; 1MV3 A; 4XTW A; 2CP5 A; 1O9S A; 2MIO A; 3E19 A; 2DK3 A; 2FHD A; 4CC2 A; 3RKX A; 1I5O B; 3CC7 A; 2JUF A; 5I2M A; 4BE2 A; 3MP8 A; 4PJM A; 2O9S A; 2KXC A; 2KRO A; 1WYX A; 1SRM A; 1UGR B; 1PKT A; 1ZBX A; 4M7D G; 3UF4 A; 2O4X B; 1HSQ A; 1OPL A; 2HAX A; 2CH4 W; 4MDW A; 2K57 A; 3CCV T; 4LXC A; 4BDZ A; 5GAM f; 1U8R A; 2QQS A; 3GNF B; 1YFN A; 3A8G B; 4EPC A; 1NE8 A; 1UUE A; 1K8A U; 2NUP B; 5IXF A; 3CCQ T; 2X4Y A; 4F04 B; 3S6W A; 3V8K A; 2DL7 A; 2MYS A; 4IUP A; 3M55 A; 4M7A B; 4PNO A; 3VV0 A; 4FU6 A; 4JRI A; 1X75 C; 1HYO A; 1AOJ A; 2P0P A; 3QZ5 B; 1I0C A; 5GAN j; 3CCE T; 1QVG S; 4XTX A; 1UB4 A; 2ATC B; 2JM9 A; 3JCM V; 1YHQ T; 2Y4Y A; 5KYU A; 3O8V A; 1WHM A; 3KUF A; 3AT1 B; 3A8L B; 4R55 A; 3BW1 A; 1VQ4 Q; 4CRI A; 2QEX A; 1HJD A; 2R5M A; 3ZFJ A; 1ABQ A; 4AFZ C; 3E9F A; 1NPP A; 1OYX A; 1WJR A; 4C92 D; 1VOM A; 3OSV A; 4X9D A; 3HRT A; 3H0F A; 1YI2 A; 3CPW P; 1M2V B; 3E9G A; 2EWN A; 4HXJ A; 3JB9 H; 4M77 F; 2LDM A; 4E2F B; 3FC3 A; 1G5V A; 4FYX B; 4RTU A; 2RM4 A; 4AG2 C; 5I22 A; 5KYX B; 1YIT T; 3MP1 A; 2QQB A; 1TG0 A; 3CCR A; 2DZ9 A; 3HFN A; 2XHC A; 2C0I A; 2WAC A; 4LDV A; 1K9M R; 1EX4 A; 1QP3 A; 3OBY A; 2R57 A; 5LJ5 h; 1YNZ A; 2O9V A; 2PVD B; 3J7A F; 1G3W A; 2DVE A; 2K4Y A; 2F2X A; 1VQP Q; 2DJZ A; 1NYG A; 5GAN 8; 4MZM A; 2LJ3 A; 1Q86 R; 2JNG A; 5GAO p; 1VQO T; 2PQW A; 2RI5 A; 5CO7 A; 1VQL Q; 1TUG B; 1WI7 A; 4HVW A; 4PJJ A; 2GBQ A; 5J39 A; 5GAN 5; 1IRE B; 2LCL A; 4QVC A; 2Y4X A; 3CCL Q; 3G71 T; 1X6B A; 2K2V A; 3OW2 S; 2QG9 B; 2RHZ A; 5GAN 3; 4LDW A; 3V7R A; 2DIQ A; 4JS4 A; 1N6A A; 3M59 A; 4Z8A A; 2HEQ A; 5L8R E; 4JJC A; 4LNP A; 2CGH A; 3OS2 A; 1BCM A; 1W6X A; 3L2Q A; 2FPF A; 1PHT A; 1JXM A; 1N9S A; 1K9M U; 2K3X A; 3M53 A; 1AWW A; 1FXX A; 1XNI A; 1V76 A; 3A8H B; 3VJP A; 1LCK A; 3QDR B; 2J05 A; 3VS5 A; 5C6S A; 4HCC A; 3E2U A; 4J7F A; 5GAO n; 1VQ6 A; 3L2Z A; 1UHF A; 1MGQ A; 1Q86 U; 1VQM T; 4C92 G; 2BZY A; 3EG9 A; 1EFN A; 4XAX B; 1U06 A; 1PRM C; 3LX7 A; 2DM1 A; 3HFO A; 4K11 A; 1KIK A; 4PJN A; 3MKD A; 1C1A A; 2RF0 A; 1MMG A; 4PJL A; 2L5Q A; 3QDF A; 2EPD A; 5KH6 A; 2X51 A; 3JCM P; 2KBT A; 2AT1 B; 1MUZ A; 1U1T A; 2QAS A; 4RKU E; 2DXB A; 4Y92 A; 2Y90 A; 2EGC A; 3M0P A; 2EBP A; 1YI2 Q; 3JCM d; 3JCM e; 5J26 A; 4F7U B; 5CK9 A; 2RO0 A; 2YUN A; 4E6R A; 2NUT B; 2LVM A; 4OB2 B; 1OZ3 A; 1IGU A; 3CCR Q; 2D8J A; 3CC2 T; 2ZPE B; 2QA4 A; 2HKN A; 2PUO B; 3JB9 D; 4AFQ C; 2XDB A; 1D1C A; 3G1J A; 2DD5 A; 2RHU A; 3U23 A; 4LDU A; 2K3Y A; 1MMD A; 2FPD A; 4A63 B; 5GMK j; 2OTJ T; 1FMV A; 2FB7 A; 1KFZ A; 5CKB A; 2E3H A; 3CCJ Q; 2HD0 A; 2GQI A; 2VGM A; 4J9D A; 1SPK A; 2MK5 A; 4MZP A; 4X34 A; 2KRM A; 4GLM A; 1JJ2 P; 1YIJ A; 1VQK A; 2VV5 A; 2LP5 A; 4A54 A; 2HNI A; 1VQ9 Q; 4ZNX A; 4EDU A; 5I2S A; 2AZV A; 2HZY A; 3C94 A; 3H0I A; 4ME7 A; 5CQX A; 1VQ4 T; 1J3T A; 3UT1 A; 3I35 A; 4C8Q C; 3DB3 A; 4WCI A; 3OYB A; 1NEB A; 2SEM A; 4AT1 B; 4E7J A; 3S3N A; 2EQJ A; 4M7D F; 1PNJ A; 2NUP A; 2X4J A; 1B34 A; 4ATO A; 1ZSG A; 3CD6 T; 1KC8 R; 4M7A A; 1WQ7 A; 4A4G A; 3G4S Q; 3A8M B; 1T0J A; 2LZ6 B; 3RES A; 1D1B A; 4ZN3 A; 4OMF B; 4QVZ A; 1M90 C; 3QYH B; 2M51 A; 2DE0 X; 2LNH B; 1M90 U; 1AEY A; 1N5Z A; 4C0Z A; 2BTT A; 2FG0 A; 4IUU A; 2DFU A; 5IAY A; 2V8J A; 6AT1 B; 5IT9 E; 3TVT A; 2AK5 A; 2MI6 A; 1D0Z A; 2M9U A; 4M77 C; 4JRQ A; 4M77 E; 4Y28 E; 4OF1 A; 4C8Q B; 3OS5 A; 3JCM W; 3I5S A; 2MWP A; 3QG1 A; 3MPU B; 3SEM A; 5GAN d; 5GAN e; 3ZEH A; 1VQN A; 3JB9 G; 3QUI A; 3OY9 A; 2V1R A; 3CCL T; 1ABO A; 1QVP A; 4BUG A; 2LJ1 A; 1VQ7 A; 2DZC A; 2RH2 A; 2DRM A; 2EYY A; 5J3B A; 1YJ9 Q; 3TQ7 P; 3NHN A; 3HHT B; 5CCA A; 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2IPO B; 3TSZ A; 1VQ9 T; 1IHV A; 3HRS A; 1NJI U; 3M57 A; 1KJW A; 3OYK A; 3G6E Q; 4KRT A; 2JOY A; 3OW2 P; 1PRL C; 2PZ1 A; 4ANJ A; 3JCM g; 2M0Y A; 3CCS Q; 3H8Z A; 1M8M A; 3H41 A; 3VS2 A; 2JT4 A; 1ZUY A; 3LWI A; 2FYK A; 2JS2 A; 1KQ1 A; 4BI8 B; 2CSI A; 3CCM A; 3L1A A; 4DBQ A; 5C0M A; 3GF5 A; 5GAN 2; 2ENM A; 3I55 A; 4B6M A; 3G71 Q; 1NLO C; 1IO6 A; 1M3A A; 2KYB A; 3VYG A; 3PIP A; 1Y07 A; 2DAQ A; 4MML A; 3RMQ A; 2RK2 A; 3JAM E; 3FEO A; 3EGX B; 4OB1 B; 1PSF A; 2XK0 A; 4DBF A; 2GQV A; 2DXT A; 4M7D C; 4M7D E; 1BYM A; 3JRZ A; 3OYL A; 5KYY A; 1ZSZ C; 4BAC A; 3GBQ A; 5HK3 A; 2R5A A; 3EG2 A; 3QHS A; 3LWH A; 4M7A D; 2YWW A; 4JLG A; 1YJN Q; 2GTJ A; 1W2B A; 1YN8 A; 4JRP A; 3JB9 I; 4DEX A; 1YCS B; 2COZ A; 1WXB A; 4GLK A; 4Q5W A; 4LD9 K; 2M02 A; 2X4W A; 4J6X A; 1VIE A; 1SHG A; 3H6Z A; 4BY6 C; 1VQM Q; 2JW4 A; 1YJ9 T; 4OMM A; 4ELZ C; 3VUZ A; 4BE0 A; 1X2Q A; 4J6W A; 1QVF A; 2DBM A; 3EG1 A; 4JUV A; 2QA4 T; 3EG3 A; 1MMA A; 2E6Z A; 3OA6 A; 3QJ6 A; 5CQY A; 3I9Q A; 4RCC A; 2V1Q A; 5GAO m; 4XQ3 A; 3SB2 A; 2HMA A; 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