The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
15
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sequence length |
66
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structure length |
66
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Chain Sequence |
KKSRLWVDRSGTFKVDAEFIGCAKGKIHLHKANGVKIAVAADKLSNEDLAYVEKITGFSLEKFKAN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structure of Sla1p homology domain 1 and interaction with the NPFxD endocytic internalization motif.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Endocytosis, protein binding
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| source organism |
Saccharomyces cerevisiae
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| molecule keywords |
Cytoskeleton assembly control protein SLA1
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| total genus |
15
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| structure length |
66
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| sequence length |
66
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2006-06-14 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 type barrels. |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2HBP A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2JTF A; 2HCK A; 2ECZ A; 3M4G A; 1FMK A; 1QP3 A; 1K0X A; 2X35 A; 1YIJ T; 3JCM g; 2SRC A; 1N8R C; 3OBY A; 1NPR A; 1OI1 A; 3ZFJ A; 3EH1 A; 2JS0 A; 3MP6 A; 3NHN A; 2RQU A; 4DBH A; 4MML A; 3E9F A; 4A4K A; 3CCJ A; 3G1J A; 2EQU A; 1B07 A; 2PNI A; 2LJ0 A; 4B9X A; 3BW1 A; 4M7A D; 4AFQ C; 1VQ9 Q; 4QQD A; 1WFW A; 4JLG A; 1YJW T; 4GLM A; 2P4T A; 4M7A B; 1KC8 R; 5LJ3 h; 4M7A F; 4EMK C; 3M59 A; 5CR2 A; 3L2R A; 3CPW P; 3S3N A; 3I9Q A; 5DY9 A; 3VS1 A; 5KYW B; 2O31 A; 2A0F B; 3MJX A; 4OGC A; 3VUZ A; 2DM1 A; 2M0O A; 1YI2 A; 3CCU Q; 4AFU C; 5HK3 A; 2DL3 A; 1SRM A; 1X43 A; 2FZG B; 1BKB A; 1TOV A; 3CCS T; 4JLI A; 1WHH A; 4KGZ B; 5IAY A; 4BDZ A; 3JB9 J; 4HCB A; 3JAM E; 1QP2 A; 3MO8 A; 2LJ1 A; 2EYZ A; 1TU0 B; 1BK2 A; 2RB6 A; 2OX7 A; 2KI7 A; 1Y71 A; 2PVG B; 4B9W A; 1O9S A; 3QJY A; 4HA8 A; 4EIK A; 3NTI A; 3A5Z B; 5GMK m; 3T9N A; 3I55 T; 2KXD A; 2VB6 A; 2E5Q A; 3RNJ A; 4KRT A; 3QWX X; 1IGQ A; 1WQ7 A; 3CC2 Q; 1B34 A; 2C0I A; 3FIF A; 2CSI A; 1YJN Q; 2XDP A; 2LC4 A; 1Y7X A; 2DIL A; 2L3R A; 4C5H A; 4GLK A; 1NYF A; 1O75 A; 2D0N A; 2MAM A; 3JSC A; 3EH2 A; 4PLL A; 2D8J A; 2JTE A; 4II1 A; 1LOJ A; 3CC4 T; 1OPK A; 3E19 A; 3I55 Q; 2EVR A; 4C8Q D; 1YJ9 Q; 1YHQ A; 2K57 A; 2EKH A; 4M77 E; 3OYL A; 1MMN A; 1PSE A; 1S72 T; 4C8Q B; 3MEU A; 3QZ9 B; 5LL6 S; 4M7D A; 2DBM A; 4DQ2 A; 2P0Q A; 3QDR B; 1WA7 A; 2Z0W A; 3QG1 A; 4E7H A; 4JRI A; 4R0K A; 1WHK A; 5GAN e; 3QYG B; 4R56 A; 4M78 E; 2EQI A; 1UDL A; 4J6X A; 5D6W A; 5GAO q; 4JS5 A; 2OAU A; 3OYN A; 1GBQ A; 2M02 A; 2DXT A; 3OYG A; 2RMO A; 4HKE A; 1G3Y A; 1MV3 A; 3CC4 Q; 2HNI A; 1YWO A; 2CH4 A; 1K9A A; 3NMZ C; 1ZSG A; 2DXC A; 2NUT B; 1G3T A; 2YUN A; 4IUP A; 3VUB A; 4QVD A; 1SHG A; 5GAM e; 3P8H A; 3A8G B; 5HY6 A; 3QII A; 4JUV A; 3OW2 S; 4DOV A; 4EMH A; 1UGS B; 4YTL A; 1ZSZ A; 2O9V A; 1XNI A; 2DER A; 4X9C A; 2AIR B; 4OB0 B; 2GTJ A; 2I2L A; 1AEY A; 4RTZ A; 2GF7 A; 1PWT A; 2F5K A; 4PFZ A; 1XJW B; 2RHY A; 4J6W A; 3CCR T; 1M2O A; 2M9U A; 4HXJ A; 1KQS P; 1M1F A; 2A7Y A; 3EAE A; 4JJD A; 2KYM A; 4XAX B; 4ZN3 A; 3DB3 A; 1VYT A; 2RM4 A; 5LJ5 d; 2FL7 A; 1U8R A; 1QW1 A; 4PJO E; 2CP3 A; 1X2Q A; 4MDW A; 4Z89 A; 2QA4 Q; 4AG2 C; 4KUD K; 4Y91 A; 2FHD A; 1W2B P; 4LDV A; 5J26 A; 3ZEH A; 1T3L A; 3QWY A; 2HMA A; 3OW2 A; 2J6F A; 4M7D C; 4MDX A; 4WCI A; 4C92 F; 4RG8 A; 3OS2 A; 4E7K A; 1UB4 A; 3CEY A; 4XU0 A; 2IIM A; 4F7U B; 1HK9 A; 1HXD A; 4F7U F; 1JEG A; 3VS3 A; 1M90 U; 5HKC A; 2FZK B; 2QDL A; 1KSW A; 2XMF A; 3C4S A; 3N5B B; 4FT2 A; 1UGR B; 2OAW A; 1M2V A; 2P0K A; 3GPL A; 1G2B A; 2ZPB B; 1JU5 C; 1RUW A; 2AT1 B; 2CP7 A; 3M56 A; 4MMK A; 3CCQ T; 1VQ4 A; 1K73 C; 2VUB A; 2LZ6 B; 2FEI A; 2HZY A; 3M0U A; 3VRY A; 3GNF B; 5FU6 B; 4DEX A; 3EG0 A; 1UFF A; 1ZSZ C; 4E7S A; 3H0I A; 4LE9 A; 4M4Z A; 3JCM b; 1G3S A; 2KXC A; 2BZX A; 2DTI A; 2RH2 A; 4PJM A; 1KJW A; 4XTW A; 1VQ9 A; 3MET A; 3UF4 A; 2QQA A; 1PD0 A; 4E7J A; 2HSP A; 4M7A E; 3CCQ Q; 3CCJ T; 1ZA2 B; 4BAC A; 3JB9 F; 2BE7 D; 1VIF A; 1IRE B; 5DLQ E; 1IRX A; 1XQH A; 3DKM A; 2LX9 A; 2HBP A; 5D6Y A; 2NUZ A; 3LLR A; 3BDL A; 2HL5 C; 3CCU A; 1P92 A; 1UEB A; 4PNO A; 4OML A; 1OEB A; 4XTZ A; 2E10 A; 1GRI A; 1WPY A; 1NZ9 A; 4PFO A; 4MZM A; 3V7C A; 1TTH B; 2EBP A; 4NL2 A; 1RL2 A; 3AT1 B; 3CCJ Q; 1OU9 A; 2DIQ A; 3QO3 A; 4XQ3 A; 3EG2 A; 1YI2 T; 4JDS A; 1KFZ A; 2XIC A; 4HCC A; 3OS1 A; 3CXC S; 2QYZ A; 1RAH B; 2M51 A; 4GBQ A; 3MEA A; 2BZY A; 1PCX A; 2O2O A; 5FU7 C; 2OJ2 A; 2FYK A; 3CC2 A; 3TVT A; 5C6S A; 1YJN A; 4KGX B; 4QVZ A; 2QI2 A; 2V8K A; 2PVD B; 5CKD A; 3PMT A; 4E47 A; 2EGC A; 1DJ7 B; 1WXU A; 2LJ3 A; 5GAN 7; 4BDY A; 4KGV B; 4PJO A; 1LJO A; 1VIE A; 2D9T A; 4M77 C; 3EGX B; 1PRL C; 1YJ9 A; 2YRD A; 5LJ5 e; 2DBK A; 3PFS A; 4XTV A; 2H3J A; 2AHJ B; 2WSF E; 3UWN A; 4PKC C; 2KBT A; 2MWP A; 3IQL A; 4BI8 B; 1Y96 A; 1EX4 A; 3L42 A; 3CXC A; 4OB1 B; 3JCM h; 2G6F X; 1YHQ T; 1T0J A; 3RBB B; 2A36 A; 1I0C A; 3JCM W; 5D7U A; 5KH6 A; 3VS4 A; 2K79 A; 2MYS A; 2VAS A; 3CC7 Q; 2HQX A; 3CC4 A; 2V8I A; 2LCC A; 3HRS A; 3O5Z A; 2HD0 A; 3RER A; 2RJF A; 1EZZ B; 3BE3 A; 2JM9 A; 4JRP A; 3E2U A; 3VS2 A; 3L2V A; 3M0T A; 2O4X B; 3HTR A; 3J7A F; 2EPD A; 1BBZ A; 4QQG A; 1H3Z A; 1ABO A; 2LT4 A; 4Q5W A; 4FYV B; 2OI3 A; 4M77 D; 1I07 A; 1X75 C; 1KD1 R; 1YBY A; 2EGA A; 1VQK A; 1AWW A; 3FJ5 A; 4LD9 K; 2F2V A; 2DO3 A; 3TSW A; 1R77 A; 5KE2 A; 2CUB A; 2E12 A; 5KYX B; 5M9O A; 4D6W A; 1M1K R; 2F2X A; 1D1A A; 4KBM B; 3VU3 C; 1OU8 A; 2DTO A; 4M7A A; 4M78 D; 1Q7Y U; 2HQH A; 3EHR A; 4FSX A; 4IUU A; 1RAC B; 4JZ3 A; 5GAN 6; 3NTH A; 3OSV A; 3PIP A; 2P84 A; 3DB4 A; 1RLP C; 2I0N A; 4M78 B; 5KYW A; 4PJO C; 3NTK A; 4M78 F; 4WTO B; 1FXX A; 5LJ3 d; 2QA4 A; 1WXT A; 1X01 A; 1Q82 U; 4X1V A; 3J80 E; 4BUG A; 2KR3 A; 2EKO A; 4MZP A; 2CP5 A; 3VS6 A; 4C92 E; 4PLI A; 1D3B B; 3CBP A; 3CQT A; 2RHI A; 2RN8 A; 1M9S A; 4M7D G; 5HCK A; 5LJ5 f; 3OYY A; 3URG A; 1Q7Y C; 2PUK B; 2PZ1 A; 2JN0 A; 4L6V 5; 2JW4 A; 2P4R A; 2L3Q A; 3ME9 A; 1FWZ A; 2YXY A; 8AT1 B; 3CCL A; 2E3I A; 1PC0 A; 2MCN A; 3TRE A; 5I11 A; 3OS0 A; 2DZ9 A; 1VQ6 Q; 1UGV A; 1MMG A; 2L89 A; 3PVL A; 5I21 A; 1Q82 C; 5AYF A; 1OX9 A; 2HKN A; 2L3S A; 1K8A R; 2AKK A; 1WJQ A; 3EGD A; 1BIB A; 4EMK A; 2XKO C; 4BE1 A; 1SEM A; 1I81 A; 3U23 A; 3JCM V; 3WXM B; 4HVW A; 3OYK A; 4M75 D; 4E7I A; 4E2F B; 1VQ4 T; 2R58 A; 2K6D A; 1N8R U; 5LJ5 g; 2Y90 A; 4M75 B; 4CRI A; 5GAN d; 4M75 F; 3OYH A; 4M7A C; 2K2M A; 3SEM A; 2DD4 A; 5D6X A; 1YIT Q; 4C8Q A; 1NJI R; 2FO0 A; 2MF2 A; 3WVE B; 3BDU A; 4IUR A; 8ATC B; 4QVC A; 2DNU A; 2F1L A; 4JJN K; 1ACM B; 1UJY A; 2H8H A; 4ATO A; 3LWI A; 3A8O B; 1VQ9 T; 2GFA A; 4P5N A; 5GAM d; 1VUB A; 1VQ4 Q; 2DYB A; 4N4I A; 2RQW A; 6AT1 B; 4ZTF A; 4C0F A; 3MHX A; 1QWE A; 2NUT A; 3A8M B; 2WSE E; 3EFR A; 2JMA A; 2R5M A; 1B3Q A; 4HCK A; 2DX1 A; 4X9D A; 3CCU T; 3HRT A; 1KK7 A; 4OMF B; 1JQQ A; 2K5L A; 2RQT A; 2HDA A; 5KE3 A; 2V8J A; 3S6W A; 2CYZ B; 2V1R A; 4JJC A; 4FL6 A; 5IHI A; 1SPK A; 1PRM C; 1F1B B; 2BIV A; 1PD1 A; 2CP6 A; 2EGE A; 5CK9 A; 1V76 A; 4E7Z A; 3NPF A; 2IVW A; 3OB9 A; 2ENM A; 5CKB A; 2D8H A; 1QVP A; 1LNX A; 4BE0 A; 1IHV A; 4BY6 B; 3RES A; 4DBR A; 1H8K A; 2C0T A; 3CC2 T; 1GFC A; 1YJN T; 3LW5 E; 3VS7 A; 4AMC A; 4OP0 A; 1AWO A; 2G3R A; 3OYA A; 4BD3 A; 4C8Q C; 1EIF A; 5LJ3 e; 3CPF A; 5FRN A; 1KG1 A; 4F7U A; 5HK0 A; 2VKN A; 1TXQ A; 4Z8A A; 3JB9 H; 3OW2 P; 1WJR A; 1YJ9 T; 1SG5 A; 4JJB A; 2LP5 A; 3EG1 A; 2K5I A; 3SB2 A; 1QWF A; 2OTJ Q; 4RTW A; 3X26 B; 1X6G A; 3CC7 A; 3DLL A; 1KHC A; 2OTL Q; 2AZS A; 3FRN A; 2AKL A; 2KRM A; 2JM8 A; 2EYQ A; 2E41 A; 3EFO B; 1M3C A; 1KHI A; 4FYW B; 2JOY A; 3M9Q A; 2BUD A; 5GJW B; 2LTO A; 4EDU A; 1ZUK A; 3M57 A; 3CCM Q; 2LT1 A; 1AZE A; 4RTT A; 2B8A A; 2F5T X; 3H6Z A; 4EMG A; 1U5S A; 4J83 A; 2DL8 A; 2PVO B; 1W70 A; 2J7I A; 3REB B; 1KQ1 A; 2QEX A; 1R0C B; 2XD0 A; 3LYI A; 1WXB A; 2K7A A; 3M0Q A; 4IIO A; 1VQK T; 4DBQ A; 3UA7 A; 3GBQ A; 1M3A A; 3JV3 A; 1QVF A; 3PE0 A; 2YSQ A; 1MGQ A; 5FWB A; 1VQN A; 3ASK A; 4UC4 A; 4PJO G; 2EYW A; 1ARK A; 2YWW A; 5L8R E; 2R57 A; 2RPN A; 3FJP A; 5GMK h; 4A4F A; 1Z9Z A; 1UG1 A; 1G83 A; 2KVQ G; 2RI5 A; 1KC8 C; 1UEC A; 5GAN 5; 3ULR B; 1M90 R; 1W4S A; 1LVK A; 5CVI A; 1W1F A; 4IKF A; 2QA4 T; 9ATC B; 1VQK Q; 1TUD A; 5LJ3 f; 2J6K A; 1Y07 A; 5CKE A; 4J9B A; 1Q86 R; 3ZBD A; 2MMP A; 1G8X A; 4PJJ A; 2KDS A; 4OMP A; 1VQ6 A; 2RD1 A; 4QW2 A; 1UGQ B; 5GAN 4; 3HKS A; 3QBY A; 2QQB A; 3JRZ A; 1GL5 A; 3H41 A; 5FU6 C; 3V8K A; 3CCL T; 1T3S A; 2COW A; 1JO8 A; 1SSH A; 1YFN A; 2VGM A; 3VS5 A; 1PNJ A; 2CUD A; 2PQW A; 4J8O A; 4C92 D; 1MNE A; 1Y0M A; 2ROL A; 1K73 U; 3INZ A; 3V7R A; 1QKX A; 4CI0 C; 1V1C A; 3EGX A; 2L3P A; 4M75 E; 1NLP C; 2GCX A; 4J9C A; 4C92 B; 4QT7 A; 2QXF A; 1BIA A; 1LCK A; 3RIR A; 5LJ3 g; 4RMO A; 1YIT A; 3GNG A; 3C95 A; 4M7A G; 2KT1 A; 2K4Y A; 4FYX B; 1WLP B; 2W10 A; 3VYG A; 1D1B A; 2DTH A; 1TH7 A; 4LUE A; 3CCL Q; 4B6M A; 1H92 A; 1PKT A; 4ESR A; 4VUB A; 1BYM A; 5IH2 A; 5GAN f; 3AHU A; 3CXC P; 4DEY A; 1Z9Q A; 2KAF A; 3JCM d; 1VQL A; 1M3B A; 3MEV A; 4F17 A; 2O4X A; 1GCP A; 1WHJ A; 4FW1 A; 3OYJ A; 4J7I A; 5GAM f; 3JCM Q; 1M1G A; 2BTT A; 2RI3 A; 1QVG S; 1U3O A; 1YWP A; 3QXE B; 3JB9 D; 1NE8 A; 3OMC A; 4C0D B; 3H9N A; 2E64 A; 4M77 A; 1IGU A; 1OOT A; 4ME7 A; 4FU6 A; 1HSQ A; 1ABQ A; 1UUE A; 3LGF A; 3L2W A; 2GQV A; 1Y57 A; 2FB7 A; 4LN2 A; 2DEU A; 1HYO A; 4RTX A; 5GAN g; 1TUC A; 2MWO A; 4M78 A; 1WGS A; 1OYX A; 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1VQN T; 3SDZ A; 3JCM e; 4F7U G; 4JRQ A; 2K5F A; 4E7L A; 4F04 B; 3VJP A; 3RDV A; 4HT9 A; 4ANJ A; 4JZ4 A; 2CT3 A; 2HAX A; 3I56 Q; 2PTK A; 1TUG B; 2QTV A; 1VQO A; 2QEX Q; 2RJE A; 3M4Y A; 1I4K 1; 5FLX E; 7AT1 B; 5GMK l; 2E4H A; 3DLM A; 1N5Z A; 2Y4Y A; 3E9G A; 2F69 A; 2KT8 A; 3M53 A; 5EG2 A; 5IN1 A; 3WVD B; 1SKU B; 5A0L A; 1N8R R; 1VQN Q; 1VQP A; 1G3W A; 1JJ2 A; 1VQ6 T; 2FVU A; 3V7S A; 5KYN A; 1W6X A; 1ZHI A; 2DXU A; 2EJG A; 1VQ8 Q; 4M75 C; 3CBO A; 1NM7 A; 2M16 A; 1MND A; 1QQJ A; 4NS5 A; 2CZ7 B; 4N4H A; 2GGR A; 2DA9 A; 4JS4 A; 3JCM J; 4PL6 A; 2VXF A; 4X34 A; 2VYT A; 5J3B A; 2DKG A; 4XTX A; 3L2Z A; 3S3O A; 3H0F A; 3GIB A; 1C0M A; 1D09 B; 2HEQ A; 2JNG A; 4LXC A; 1X69 A; 5I22 A; 2L2P A; 2XID A; 5GAO n; 4E6R A; 1YIT T; 2QGF B; 4XU2 A; 4DBF A; 2EQM A; 4ELZ C; 3CME A; 3MKD A; 4JPB W; 2EYX A; 2WAC A; 3H8Z A; 1BI1 A; 3EFO A; 4A4H A; 1N27 A; 2KEA A; 3SWN B; 3FC3 A; 2ZAE A; 2F2W A; 4FW2 A; 2KQW A; 2L0A A; 4PJL A; 1M1K U; 4ORZ A; 1VQL T; 4RCC A; 2K3X A; 2VC8 A; 1S1N A; 3A98 A; 3G71 T; 3JCM f; 2FG0 A; 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