The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
7
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sequence length |
77
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structure length |
77
|
Chain Sequence |
GAMGPREVTMKKGDILTLLNSTNKDWWKVEVNDRQGFVPAAYVKKLDSGTGKELVLALYDYQESGDNAPSYSPPPPP
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
The high-resolution NMR structure of a single-chain chimeric protein mimicking a SH3-peptide complex
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Spectrin alpha chain, brain and P41 peptide chimera
|
| molecule tags |
Signaling protein
|
| source organism |
Gallus gallus
|
| total genus |
7
|
| structure length |
77
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| sequence length |
77
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2006-11-02 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1SSH A; 1OPL A; 2YUN A; 4RTX A; 1I07 A; 2AKK A; 1AEY A; 2DL3 A; 1EFN A; 4EIK A; 1YP5 A; 2B86 A; 2LZ6 B; 2FRW A; 5ECA A; 3THK A; 3VS4 A; 1X6G A; 1S1N A; 2GGR A; 2OI3 A; 3I9Q A; 2KR3 A; 4IIM A; 1UFF A; 2K9G A; 4RTZ A; 1X27 A; 2FPE A; 1JXM A; 4HXJ A; 5IH2 A; 4D8K A; 2KYB A; 4LE9 A; 1WFW A; 1Z9Z A; 2W0Z A; 3RBB B; 4J9G A; 4AFS C; 2KT1 A; 5IHI A; 2LQN A; 2LCS A; 3UA7 A; 1X69 A; 1QKX A; 4F17 A; 3VS2 A; 1YNZ A; 4HVU A; 1PRM C; 4J9C A; 2CH4 A; 5FW9 A; 1HSQ A; 2HBW A; 2GTJ A; 1AVZ C; 2C0O A; 4A63 B; 1AD5 A; 2NWM A; 4J9H A; 3NHN A; 2HEQ A; 4F16 A; 2YDL A; 1ABO A; 1ZBJ A; 3NGP A; 1A0N B; 3VS5 A; 2J6K A; 2DM1 A; 2CUD A; 2CT4 A; 2LJ3 A; 2RNA A; 1W70 A; 1WXU A; 2C0I A; 1NM7 A; 2DX1 A; 4J9E A; 2DE0 X; 2J6F A; 1K0X A; 3LH5 A; 2GQI A; 1UJY A; 2EKH A; 2DF6 A; 4RTV A; 4LNP A; 1VA7 A; 2K7A A; 2NUZ A; 2K6D A; 2C0T A; 2JS2 A; 2V1R A; 1QWE A; 1UE9 A; 2V1Q A; 2DL4 A; 1B07 A; 3NPF A; 2LMJ A; 2D8J A; 1QKW A; 1H92 A; 2CDT A; 2KEA A; 4OMN A; 3I5R A; 5IHN A; 4JZ4 A; 4IIO A; 2A36 A; 4JZ3 A; 3TVT A; 1OV3 A; 1YWP A; 4AFZ C; 3M0Q A; 3M0S A; 1AWJ A; 1LCK A; 2EBP A; 3EG3 A; 2ENM A; 3U23 A; 2O2O A; 2L3S A; 1Z9Q A; 2A08 A; 2BTT A; 3M0R A; 2JMA A; 1NLP C; 5I22 A; 4CC7 A; 2EYY A; 4JJB A; 3A98 A; 2JTE A; 1CKB A; 2CSI A; 1I0C A; 4Z89 A; 1WA7 A; 1FMK A; 1ARK A; 1UGV A; 3EHQ A; 1GRI A; 2JM9 A; 2XMF A; 1MV3 A; 2H8H A; 1NEG A; 2BZX A; 2EQI A; 3GBQ A; 2DRM A; 2KT8 A; 4DEX A; 4JJC A; 1GL5 A; 4AFU C; 3I35 A; 1NEB A; 5GJW B; 1GBQ A; 2F2V A; 1VYT A; 5IXB A; 2L2P A; 2EGC A; 2EYZ A; 1OOT A; 1G83 A; 2FRY A; 1QLY A; 4FSS A; 1WXT A; 2VWF A; 1PHT A; 1BBZ A; 4D8D A; 2PTK A; 5I11 A; 4OMQ A; 4LN2 A; 3TSW A; 2EGE A; 1WDX A; 2RQT A; 2AK5 A; 5FWB A; 1MUZ A; 2BZ8 A; 2F2W A; 2KXC A; 4E6R A; 2MCN A; 1IO6 A; 2EPD A; 2ED0 A; 2PZ1 A; 2YUP A; 1UUE A; 2AKL A; 1B3Q A; 4JPB W; 1JEG A; 1SEM A; 2I0N A; 2RQW A; 3ZL7 C; 2PNI A; 3JV3 A; 2DJQ A; 1UDL A; 3VS6 A; 1NLO C; 5FWC A; 2O9V A; 2O88 A; 2KYM A; 4ORZ A; 3UA6 A; 1G2B A; 1ZLM A; 3QWX X; 1ZUK A; 2L3Q A; 1UTI A; 2D8H A; 2EYW A; 4AFQ C; 2G6F X; 2KRO A; 1WXB A; 2GTO A; 3REA B; 1X43 A; 2CT3 A; 1GFD A; 4KRT A; 1M30 A; 1K76 A; 4OMO A; 2LJ0 A; 1PKS A; 2O31 A; 1CSK A; 2E5K A; 1AZE A; 5EC7 A; 2ROL A; 1I1J A; 2RN8 A; 1GCQ A; 2DIL A; 2J05 A; 5IHK A; 2K79 A; 2ABL A; 2M0Y A; 1W6X A; 2KBT A; 1UHF A; 3O5Z A; 4RUG A; 1VYV A; 2CRE A; 1M27 C; 2ESW A; 1SHG A; 2EGA A; 4WCI A; 1QCF A; 4Z8A A; 1M3A A; 1U3O A; 1UG1 A; 4OMP A; 2DA9 A; 3H41 A; 3REB B; 2LNH B; 4HCK A; 1T3S A; 1WI7 A; 1M3C A; 1ZUU A; 2HCK A; 2RF0 A; 2VKN A; 2DL7 A; 2OJ2 A; 3EG0 A; 3UAT A; 1V1C A; 4LUD A; 3VS7 A; 1YWO A; 2FG0 A; 1TUD A; 1UJ0 A; 2CSQ A; 2GBQ A; 3PVL A; 2W10 A; 2L3P A; 2JMC A; 2JM8 A; 4X1V A; 1ZX6 A; 2RQR A; 2KRN A; 3H0H A; 4CC4 B; 1HD3 A; 3ULR B; 4CC3 A; 1PRL C; 1BU1 A; 2KE9 A; 4OMM A; 1NYG A; 2ECZ A; 1NYF A; 4ZNX A; 2M51 A; 4HVW A; 1AOJ A; 2KNB B; 2ED1 A; 4AG2 C; 1UHC A; 4M4Z A; 2VVK A; 2K3B A; 1WLP B; 2DNU A; 1JQQ A; 1QWF A; 1Y57 A; 2FO0 A; 2EYX A; 3I5S A; 4F14 A; 1M3B A; 3M0U A; 2EVR A; 1JXO A; 1ZSG A; 3QWY A; 1H8K A; 2DLP A; 3PVQ A; 4K11 A; 1SRM A; 1RLQ C; 1KIK A; 1VYU A; 2L0A A; 2RPN A; 2KRM A; 1GCQ C; 1H3H A; 2DRK A; 3VS0 A; 2DVJ A; 3VS1 A; 2F2X A; 2EW3 A; 4J9I A; 1AWX A; 5L23 A; 2FEI A; 1SRL A; 1GCP A; 2JW4 A; 1RI9 A; 1X2K A; 4R0K A; 2QDL A; 1BK2 A; 1U06 A; 1HJD A; 2X3W D; 2O9S A; 1CKA A; 2DBK A; 5HCK A; 4RTY A; 3RNJ A; 2JXB A; 2DBM A; 1SHF A; 1UEC A; 1AWO A; 2JS0 A; 2J6O A; 1GFC A; 4CC2 A; 2YUO A; 2RQV A; 3IQL A; 2D1X A; 1KSW A; 2KGT A; 2LX7 A; 1WYX A; 4RTU A; 1E6H A; 2A37 A; 3SEM A; 3UF4 A; 5IXF A; 2K2M A; 1W1F A; 1Y0M A; 3KFV A; 4RTW A; 1X6B A; 1XOV A; 3FJ5 A; 3SHW A; 2AZS A; 3C0C A; 2MOX A; 2FPF A; 2MIO A; 1PWT A; 2DL8 A; 1PNJ A; 1AWW A; 1JO8 A; 1YCS B; 3EG2 A; 2P4R A; 2ROT A; 4LUE A; 2KRS A; 4J9D A; 4DEY A; 2LQW A; 2LJ1 A; 3EHR A; 1ZUY A; 1YN8 A; 4JJD A; 2OAW A; 2YSQ A; 1K0S A; 2KXD A; 1N5Z A; 4QT7 A; 1SPK A; 1KFZ A; 4J9F A; 4Y92 A; 1WIE A; 2DYB A; 2SEM A; 1T0J A; 1GBR A; 2HDA A; 3R6N A; 2GNC A; 2DMO A; 2FPD A; 1E7O A; 1X2Q A; 4ESR A; 1K9A A; 3M0P A; 3H0F A; 4GBQ A; 1K4U S; 1RUW A; 1WX6 A; 3EG1 A; 1OPK A; 1KJW A; 2AZV A; 1ABQ A; 1FYN A; 4OML A; 1E6G A; 2A28 A; 4HVV A; 1BB9 A; 1OEB A; 4GLM A; 1AZG B; 1NG2 A; 3CQT A; 1U5S A; 2HSP A; 2RMO A; 2D0N A; 2YT6 A; 2LP5 A; 4J9B A; 4RTT A; 3VS3 A; 2RQU A; 1RLP C; 2CUB A; 1T0H A; 1TUC A; 2X3X D; 1MV0 B; 2IIM A; 3NMZ C; 5GJV B; 3H0I A; 1JU5 C; 3VRZ A; 1PKT A; 1K1Z A; 2YUQ A; 2SRC A; 3M0T A; 2J06 A; 1TG0 A; 2BZY A; 2CH4 W; 3VRY A; 3EGU A; 3TSZ A; 1T3L A; 2JT4 A; 3PE0 A; 1M8M A; 4AG1 C; 2DL5 A; 2J7I A; 4Z88 A; 1J3T A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3L2W A; 2YUN A; 4RTX A; 3E2U A; 3FIF A; 1I07 A; 3E1S A; 2H3E B; 5CQX A; 3M4G A; 1X6G A; 3RDV A; 2OI3 A; 3I9Q A; 2K9G A; 4B9W A; 3V8J A; 1JXM A; 4C0D C; 5J3B A; 3CBO A; 4HXJ A; 4KUL A; 1W2B A; 3G71 T; 2DYI A; 3OW2 A; 4M75 B; 2BIV A; 2KYB A; 4OB2 B; 4LE9 A; 3CCQ Q; 2W0Z A; 4J9G A; 3P8B B; 5CIU A; 3G6E Q; 4C8Q E; 1YFN A; 1YNZ A; 2WSE E; 4XU1 A; 1Q81 R; 4JRI A; 1AVZ C; 1WHH A; 4A4K A; 2PQW A; 1AD5 A; 2NWM A; 1K73 U; 3NHN A; 2YDL A; 2DPP B; 1A0N B; 3SWN C; 4PJO B; 2RNA A; 1W70 A; 4EMG A; 4XU2 A; 4J9E A; 4C92 C; 2DE0 X; 1C6V X; 2QA4 Q; 5KYW B; 3AT1 B; 3QG1 A; 2NUZ A; 2K7A A; 1TSF A; 1BCO A; 1QWE A; 2V1Q A; 4FIB A; 1PD1 A; 1BKB A; 4OMF B; 2D8J A; 1QKW A; 2K5I A; 2O4X A; 1H92 A; 3A1P A; 2CDT A; 4OMN A; 4ZN1 A; 4AFZ C; 4JZ3 A; 1OV3 A; 4C8Q G; 3CXC P; 2RHI A; 1VQN A; 3GIB A; 2JTF A; 3CXC S; 1AHJ B; 1FXX A; 4O6J A; 2PVG B; 2BTT A; 4WTO B; 2WAC A; 2CSI A; 2MK5 A; 4J6X A; 2E4H A; 1FMK A; 3RMS A; 2MI6 A; 1NJI U; 4VUB A; 1IRE B; 5HK0 A; 4QQD A; 1RAG B; 2FZC B; 1GRI A; 1MV3 A; 2KT8 A; 1B34 B; 4JJC A; 2PVO B; 4AFU C; 4C8Q F; 5LJ5 f; 2X35 A; 5L8R E; 5GJW B; 5LJ5 g; 2RJD A; 1ZA1 B; 2JZ2 A; 4C5E A; 4R56 A; 1FMW A; 4IUU A; 1TXQ A; 4IUP A; 4M7A C; 3G7Z A; 2LTO A; 1QLY A; 4WF2 A; 1K8A U; 2VWF A; 4D8D A; 4KT0 E; 1G3Y A; 3QJY A; 4LN2 A; 2EGE A; 4M78 A; 5FU6 C; 5FWB A; 5J26 A; 1FMV A; 3PIP A; 1VQ7 A; 1VQO Q; 2CZ1 B; 1QCO A; 4DBF A; 5KCO A; 2ED0 A; 4F04 B; 2YUP A; 1WZO A; 4OB0 B; 3TQ7 P; 4E7J A; 1PG5 B; 2DFU A; 1QP2 A; 2RK2 A; 2COW A; 2DJQ A; 3VS6 A; 5GAN 4; 2L5Q A; 1VQK A; 4C5I A; 1N8R U; 2KYM A; 1VIF A; 1VQ9 A; 2K57 A; 3GF5 A; 2CP5 A; 2M16 A; 1QCN A; 4ELZ C; 3I55 A; 3OYC A; 1KHC A; 1Q81 C; 3REA B; 1GFD A; 2OTJ A; 3CCL A; 2F1L A; 1PKS A; 1ZSZ B; 3EFO A; 4GY5 A; 1W2B P; 3OW2 P; 1W2B S; 3OW2 S; 3CCJ A; 2RN8 A; 3JCM V; 2F69 A; 1UHF A; 1VYV A; 1TWB A; 1TTH B; 4E2F B; 4OGC A; 1QCF A; 1M3A A; 1XJW B; 3D7S B; 1BCM A; 2M1H A; 1UG1 A; 3PFS A; 1M90 R; 3CCM T; 2RI2 A; 1LNX A; 2YRC A; 4HCK A; 4XTX A; 1WI7 A; 4RCC A; 1M3C A; 3BFM A; 1ZUU A; 4KGZ B; 3CCM Q; 2HCK A; 2RF0 A; 5LJ3 j; 3CC4 Q; 3CCS T; 3VS7 A; 3CCE A; 1UJ0 A; 3CMA T; 3QYH B; 2HL3 A; 2JMC A; 2JM8 A; 4PFZ A; 1IHV A; 1YI2 A; 2RQR A; 1YJW Q; 3LW5 E; 3H0H A; 3I56 Q; 3JCM b; 2KE9 A; 1Q7Y U; 4PFP A; 3A5Z B; 4ZNX A; 2M51 A; 1R77 A; 4HVW A; 3OS2 A; 4AG2 C; 4M4Z A; 4OF1 A; 4BDY A; 2ZZD A; 5M9O A; 3QJ6 A; 3JCM d; 1X75 C; 4FM4 B; 3I5S A; 1YIT A; 1O9S A; 2XIC A; 2HQE A; 3M0U A; 2WSF E; 2EVR A; 3QWY A; 1SRM A; 3V7C A; 4PLI A; 4Y91 A; 1KC8 R; 1OU8 A; 2BKD N; 3CD6 Q; 2E6Z A; 2LVM A; 3S3N A; 4RG8 A; 2B8A A; 2VXF A; 3LLR A; 4O5V A; 2X51 A; 2VXE A; 5GAN 6; 1PM3 A; 2QQ9 A; 4M78 B; 2G3R A; 1X2K A; 3L2R A; 4R0K A; 4MML A; 1OX9 A; 1D1C A; 4M77 G; 1KG1 A; 3EH1 A; 1U06 A; 2KY9 A; 3BW1 A; 2P84 A; 4PKC C; 4RTY A; 2VB6 A; 3CC7 A; 1I81 A; 4BE0 A; 1K9M U; 1G3W A; 1M9S A; 3V8K A; 2J6O A; 4DBQ A; 1MNE A; 2PUK B; 2X4W A; 4FSX A; 4PFO A; 3EFS A; 4J5Y A; 2YUO A; 4ZGJ B; 2RQV A; 2PVD B; 1QVF P; 4RTU A; 2Y4X A; 2COZ A; 2LQ8 A; 2DIG A; 1QVF S; 1QQJ A; 4M77 F; 4NL2 A; 4DBR A; 5KCH A; 3UF4 A; 3KFV A; 4MZT A; 4M7A D; 3M57 A; 3HSB A; 3C0C A; 2MOX A; 1JJ2 A; 4PJM A; 5CR2 A; 1M1K R; 4FYV B; 5FLX E; 5C6S A; 1PNJ A; 1VIE A; 2P4R A; 2ROT A; 3L42 A; 3FRN A; 4LUE A; 2P0K A; 1YHQ A; 2LJ1 A; 4MDX A; 1YN8 A; 2KXD A; 1M90 C; 1KHI A; 4QT7 A; 4QKU A; 1KQ1 A; 1SPK A; 3SDZ A; 4AMC A; 2K5F A; 2QQS A; 2QTV A; 2SEM A; 1VQN T; 4RCB A; 2HDA A; 3DKM A; 1N9S A; 2CP2 A; 1QVG A; 2JVV A; 1K9A A; 2AT1 B; 5C0M A; 1RUW A; 1WGS A; 1VQ5 A; 2ZPB B; 2IVW A; 1ABQ A; 2MWO A; 4OML A; 1E6G A; 3VUB A; 1VQM T; 1D1B A; 2RMO A; 4A4E A; 3SWN A; 3X26 B; 3JCM f; 2EJ9 A; 1BI3 A; 3JCM g; 2FVU A; 1T0H A; 4CI0 C; 4LDU A; 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3A8G B; 1YJW A; 1JJ2 P; 3I5R A; 4JZ4 A; 1JJ2 S; 3M0Q A; 2PUO B; 2EBP A; 3EG3 A; 2HZY A; 3U23 A; 2O2O A; 2A08 A; 3M0R A; 3CCE Q; 1NLP C; 5I22 A; 2DEQ A; 2JTE A; 1I0C A; 1YI2 Q; 3CCU Q; 3LWI A; 1UGV A; 2OX7 A; 3NFC A; 3RR6 A; 5KYU B; 1WHL A; 2H8H A; 3E9F A; 2HAX A; 3H6Z A; 3OYI A; 1TH7 A; 1GBQ A; 4M77 D; 1VYT A; 5IXB A; 2ZPE B; 4N0A A; 1QVG P; 2DO3 A; 1YIT Q; 1QVG S; 3FC3 A; 1ZA2 B; 1LOJ A; 1VQP A; 3HRU A; 1WXT A; 4F7U B; 1BBZ A; 1WQW A; 3JCM X; 2PTK A; 3NTH A; 1KD1 C; 3G4S Q; 1Q82 C; 1Y71 A; 2AK5 A; 3OYF A; 2M9U A; 5GAN j; 2F2W A; 3M55 A; 2XG8 D; 1D3B B; 2I2L A; 2KXC A; 4J6W A; 1EX4 A; 2MCN A; 4C92 G; 3MEV A; 1WNL A; 2XU8 A; 2EPD A; 3CPF A; 2PZ1 A; 3GPL A; 3UWN A; 3CEY A; 1UUE A; 2AKL A; 3OYG A; 1JEG A; 3M59 A; 4XAX B; 3CCQ T; 1I5L A; 3G6E T; 2JJ9 A; 4KUI A; 4M7A E; 4LDW A; 1NLO C; 5FWC A; 3CC7 Q; 4XTY A; 2DD5 A; 5FU7 B; 3JB9 I; 5LJ3 h; 3NTK A; 2D8H A; 5HKC A; 3URG A; 2EYW A; 2EIF A; 5DLQ E; 4C92 F; 4FW2 A; 2KRO A; 1WXB A; 5KYY B; 2DK3 A; 1X43 A; 2E5Q A; 2CT3 A; 1Q81 U; 1D0Y A; 1PC0 A; 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