The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
14
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sequence length |
64
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structure length |
64
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Chain Sequence |
GAMGAKEYCRTLFPYTGTNEDELTFREGEIIHLISKETGEAGWWKGELNGKEGVFPDNFAVQIS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
The high resolution NMR structure of the third SH3 domain of CD2AP.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Signaling protein
|
| source organism |
Mus musculus
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| molecule keywords |
CD2-associated protein
|
| total genus |
14
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| structure length |
64
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| sequence length |
64
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-07-28 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1UJY A; 2H8H A; 2J05 A; 5I11 A; 3M0T A; 1UHC A; 2ABL A; 1BBZ A; 1NYF A; 1YNZ A; 2L3S A; 1J3T A; 2KNB B; 3I9Q A; 4LNP A; 4IIO A; 1M8M A; 1ZBJ A; 2RN8 A; 2JMC A; 1WIE A; 4HCK A; 1RI9 A; 1YWP A; 3ULR B; 1K9A A; 1E6H A; 4CC4 B; 5HCK A; 3UAT A; 2C0T A; 1GRI A; 4RTY A; 2BZY A; 3VS2 A; 2W10 A; 2JS2 A; 4AFQ C; 2DYB A; 3EG2 A; 1SRM A; 3EG0 A; 1WYX A; 4J9I A; 4JJD A; 1E7O A; 1WDX A; 2D8H A; 4CC2 A; 1BK2 A; 3A98 A; 1WI7 A; 1TG0 A; 4KRT A; 2JW4 A; 2B86 A; 1H8K A; 1SHG A; 2F2W A; 3EG3 A; 2O9V A; 3TSZ A; 4JZ3 A; 1X6B A; 1XOV A; 2FPD A; 1WFW A; 2LZ6 B; 2CUB A; 5IHN A; 1PNJ A; 2L3Q A; 3NPF A; 2AK5 A; 4CC3 A; 1WXT A; 4HVW A; 3NMZ C; 1AVZ C; 1X43 A; 4F16 A; 2K3B A; 1QWF A; 2K2M A; 1NEB A; 3H0H A; 4X1V A; 4DEX A; 2VKN A; 4GBQ A; 2KYM A; 1QLY A; 4HXJ A; 4A63 B; 2RQW A; 2V1R A; 1M30 A; 4ORZ A; 3M0Q A; 4JPB W; 4WCI A; 1MV0 B; 2MCN A; 3REB B; 5GJW B; 2YUQ A; 1S1N A; 2M0Y A; 4LUD A; 4LN2 A; 2DL3 A; 1FYN A; 1UE9 A; 2KT1 A; 2EGC A; 2GBQ A; 5FWB A; 2ED0 A; 1X27 A; 2LX7 A; 2J6K A; 2DRM A; 2LP5 A; 1ZUY A; 2EPD A; 3UA6 A; 1GBR A; 2KRM A; 2ED1 A; 5IH2 A; 2DL4 A; 1YN8 A; 2EYY A; 1MUZ A; 4RTT A; 4EIK A; 4JJB A; 3VS6 A; 2KRO A; 1Z9Z A; 3I5S A; 4LUE A; 1RLQ C; 2CT3 A; 2DIL A; 4OML A; 1YWO A; 2JT4 A; 4QT7 A; 2CRE A; 4AFS C; 1PRL C; 3VS5 A; 1H3H A; 1M27 C; 1KFZ A; 1WX6 A; 1U5S A; 2K9G A; 4Z89 A; 3H0I A; 1OV3 A; 2JM8 A; 2LJ3 A; 1EFN A; 1AWO A; 1UG1 A; 3KFV A; 2C0I A; 1QCF A; 1HSQ A; 1QKX A; 4FSS A; 2E5K A; 2LNH B; 2ECZ A; 1KJW A; 2D1X A; 1ARK A; 1AWX A; 1PWT A; 2AKL A; 1W1F A; 1GFD A; 1JXO A; 3M0U A; 2CDT A; 1GL5 A; 2EGE A; 2O2O A; 1Y57 A; 2KT8 A; 2YUP A; 4HVV A; 2JXB A; 1BU1 A; 1GCQ A; 4LE9 A; 2PNI A; 2SRC A; 3JV3 A; 2EYZ A; 3VS4 A; 2D8J A; 1X2Q A; 2PZ1 A; 3I5R A; 1WXB A; 2M51 A; 1CKB A; 5IXF A; 4ZNX A; 2RPN A; 2KBT A; 1E6G A; 2DL5 A; 2I0N A; 2LMJ A; 1JU5 C; 4J9H A; 2KEA A; 5EC7 A; 3UF4 A; 2J06 A; 1U06 A; 4JJC A; 2KGT A; 2GNC A; 4AFU C; 5IXB A; 2HDA A; 3SEM A; 2FPE A; 2EQI A; 2AZV A; 2DX1 A; 1OPK A; 4D8D A; 2DL8 A; 2V1Q A; 2DJQ A; 3REA B; 4F17 A; 2DBK A; 2KRS A; 1B07 A; 1X69 A; 1U3O A; 1I1J A; 2MOX A; 2LQW A; 1AZE A; 4E6R A; 1AWJ A; 2CSI A; 1VYU A; 2YUO A; 3THK A; 3EG1 A; 2HEQ A; 1ABQ A; 2CSQ A; 2SEM A; 1QKW A; 2A36 A; 3EHQ A; 2EW3 A; 2JMA A; 1Z9Q A; 1VA7 A; 4M4Z A; 2D0N A; 2IIM A; 4IIM A; 2YUN A; 1MV3 A; 1GFC A; 3RBB B; 1HJD A; 2CH4 A; 3M0S A; 2G6F X; 3CQT A; 4RTV A; 2K6D A; 3C0C A; 1TUC A; 2DF6 A; 2AKK A; 2EVR A; 4J9E A; 2CH4 W; 3UA7 A; 1KIK A; 4OMN A; 2W0Z A; 1NLO C; 1K4U S; 2F2V A; 1AD5 A; 2EGA A; 2GGR A; 1GCQ C; 3EGU A; 3U23 A; 2JTE A; 1UJ0 A; 4AFZ C; 2JM9 A; 2X3W D; 2VVK A; 2YDL A; 2J6O A; 2YT6 A; 1NM7 A; 1X2K A; 2VWF A; 1YCS B; 2FEI A; 1JEG A; 4J9G A; 4HVU A; 4DEY A; 2KR3 A; 1UDL A; 4RTX A; 1NYG A; 2YSQ A; 2L3P A; 3H0F A; 1IO6 A; 2O88 A; 1W6X A; 2FRY A; 2KRN A; 1G2B A; 4D8K A; 5I22 A; 1K0S A; 3PE0 A; 1AEY A; 1TUD A; 2RMO A; 1T0J A; 2J7I A; 4RTU A; 3FJ5 A; 1PKS A; 2FPF A; 4CC7 A; 2JS0 A; 2O9S A; 5L23 A; 1PRM C; 1UHF A; 4Z8A A; 3PVL A; 3VRY A; 1I07 A; 1NEG A; 3NHN A; 2GQI A; 2CT4 A; 3M0P A; 2C0O A; 4J9F A; 2DVJ A; 1M3B A; 1VYT A; 1PKT A; 2DLP A; 2X3X D; 2LCS A; 1KSW A; 1AWW A; 1SRL A; 4JZ4 A; 1I0C A; 2BZ8 A; 2DL7 A; 1ZSG A; 1UTI A; 1UGV A; 3R6N A; 1AZG B; 3M0R A; 2L2P A; 4Y92 A; 2RQT A; 2RQU A; 2DBM A; 2ROL A; 1T0H A; 3VS1 A; 1CKA A; 4OMM A; 1NLP C; 2HSP A; 1ZX6 A; 4J9C A; 4F14 A; 1SPK A; 2EYX A; 2DE0 X; 1NG2 A; 1GBQ A; 3EHR A; 1AOJ A; 2KXC A; 4K11 A; 1VYV A; 4GLM A; 1OEB A; 3PVQ A; 2F2X A; 2L0A A; 1ZUK A; 2HCK A; 4OMP A; 1WXU A; 2DM1 A; 3QWY A; 1RLP C; 2KXD A; 1UFF A; 2RNA A; 2LQN A; 1QWE A; 4OMQ A; 4RTW A; 1X6G A; 2DRK A; 1G83 A; 1WA7 A; 3VS7 A; 1A0N B; 3VRZ A; 2GTO A; 1LCK A; 2K79 A; 3LH5 A; 3ZL7 C; 1SHF A; 2QDL A; 4R0K A; 3RNJ A; 1GCP A; 2P4R A; 3VS3 A; 3O5Z A; 2EKH A; 2KYB A; 1K0X A; 2FG0 A; 2ROT A; 4ESR A; 5ECA A; 1V1C A; 2A28 A; 2ESW A; 2AZS A; 4J9B A; 2CUD A; 4OMO A; 1K76 A; 4RTZ A; 1WLP B; 1JO8 A; 3GBQ A; 3QWX X; 4Z88 A; 3VS0 A; 3SHW A; 2NUZ A; 3IQL A; 1B3Q A; 1UUE A; 5FW9 A; 1OPL A; 4AG1 C; 2K7A A; 2OI3 A; 2HBW A; 1Y0M A; 3TSW A; 1K1Z A; 2RQV A; 2XMF A; 1N5Z A; 5GJV B; 2MIO A; 1H92 A; 2J6F A; 2DMO A; 2DA9 A; 1T3L A; 2LJ0 A; 3I35 A; 3NGP A; 2EBP A; 2FRW A; 1T3S A; 5IHK A; 2BZX A; 1ZUU A; 2RF0 A; 1JXM A; 1SSH A; 2NWM A; 3TVT A; 1W70 A; 2ENM A; 1HD3 A; 2DNU A; 3H41 A; 1M3A A; 2O31 A; 5IHI A; 1ABO A; 1M3C A; 2FO0 A; 1UEC A; 2A08 A; 2KE9 A; 1CSK A; 2GTJ A; 1OOT A; 4J9D A; 2OJ2 A; 2RQR A; 1JQQ A; 2OAW A; 5FWC A; 1FMK A; 1PHT A; 4AG2 C; 1SEM A; 2EYW A; 2PTK A; 2A37 A; 4RUG A; 1ZLM A; 1BB9 A; 2BTT A; 1RUW A; 1YP5 A; 2LJ1 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1UJY A; 1ZSZ A; 2H8H A; 5I2S A; 1YNZ A; 3CCR A; 3JCM P; 2L3S A; 1K8A C; 4LNP A; 4M7A B; 2RN8 A; 2XKO C; 2JMC A; 3OMC A; 4LDX A; 3MP6 A; 1WIE A; 4HCK A; 1YWP A; 3ULR B; 1TWB A; 1E6H A; 4CC4 B; 1U8R A; 4DBF A; 2DJZ A; 1HYO A; 5CQY A; 3VS2 A; 2W10 A; 3OS0 A; 2KAF A; 4F7U B; 3EG0 A; 1WYX A; 4JJD A; 1WDX A; 2D8H A; 4CC2 A; 2YRD A; 3QDF A; 2MMP A; 4MZM A; 3JCM X; 5LL6 S; 5GAO r; 3CC7 A; 1WHG A; 2F2W A; 4E7J A; 2DTI A; 4C0D B; 2RK1 A; 2LZ6 B; 3CC4 Q; 1KK7 A; 3BDU A; 5GMK h; 5LJ5 d; 3NMZ C; 8AT1 B; 4F16 A; 2CP6 A; 3X24 B; 5DM7 R; 2X35 A; 4DEX A; 2LQK A; 2RQW A; 1VQK A; 2GQV A; 4D6W A; 1V29 B; 4JPB W; 2MCN A; 4RG8 A; 2CP7 A; 2RI2 A; 1Q82 C; 2P84 A; 4A4K A; 3CCE A; 3CBO A; 3GPL A; 2RO0 A; 2M0Y A; 3OYA A; 4LUD A; 1KD1 U; 2KT1 A; 2EGC A; 2HNI A; 3GNF B; 3DLM A; 1ZA2 B; 2QXF A; 1YIT Q; 1W4S A; 1OUL A; 1WNL A; 2DRM A; 3OYL A; 2VAS A; 1TU0 B; 5L8R E; 4FIB A; 1Q7Y C; 3EGD B; 1VQO A; 2RI3 A; 1MUZ A; 3VV0 A; 5GAN 2; 4EIK A; 2ZCF B; 4Q5W A; 1RLQ C; 2DIL A; 1YWO A; 4XU2 A; 3T9N A; 4M7A G; 1YHQ A; 1M2V B; 5IN1 A; 4C8Q E; 2Y4Y A; 4E7L A; 3VS5 A; 1UGS B; 5M9O A; 1WX6 A; 3CC7 T; 3NTH A; 4C92 C; 2LNH B; 3JCM W; 3TRE A; 2CYZ B; 1KJW A; 3CCV Q; 4C8Q D; 4M7A A; 1I5L A; 5HY6 A; 1N9R A; 4F7U G; 3JCM b; 3SDZ A; 2CDT A; 4DOW A; 1GL5 A; 3HL8 A; 4ZTF A; 1NJI U; 1D09 B; 3G4S A; 3V7S A; 4HCZ A; 4IUR A; 5HK3 A; 4E7K A; 4BDY A; 1KC8 U; 2HQH A; 3CCM T; 4LE9 A; 1WHM A; 3JV3 A; 2EYZ A; 4E7I A; 1M2O A; 3VS4 A; 1X2Q A; 4F7U A; 3PNW C; 4WTO B; 1CKB A; 4ZNX A; 4FCY A; 2DL5 A; 4OP0 A; 4NL3 A; 2VB6 A; 1UB4 A; 4J9H A; 2KEA A; 1YCY A; 1Y07 A; 2KGT A; 2DEQ A; 3SEM A; 5J26 A; 3R6O A; 3GP8 A; 1D1B A; 1MMG A; 1VQN Q; 2HAX A; 1I1J A; 1P92 A; 4ZGE B; 5KE2 A; 2LRQ A; 1QKW A; 2A36 A; 4N4G A; 1KQS S; 1Z9Q A; 3HRS A; 4ZN1 A; 1U1T A; 1MV3 A; 1GFC A; 2EQM A; 2LNV A; 2LCL A; 4RMO A; 1LVK A; 2QA4 A; 1TUC A; 2K57 A; 1M1K U; 4OMN A; 1YJN A; 3TQ7 P; 5LJ3 g; 2JTE A; 4C5H A; 3VJP A; 3I56 A; 2QAZ A; 4QQG A; 2DTO A; 3HFO A; 1QMC A; 3CD6 A; 2A3L A; 2JM9 A; 1S72 Q; 3LGF A; 4HKE A; 3OYM A; 1IGQ A; 3EGD A; 3G4S T; 2JTM A; 1X2K A; 3LX7 A; 2VWF A; 1G3Y A; 3MJX A; 2MPX C; 4B6M A; 1RAG B; 1JEG A; 1D0Z A; 4F04 B; 4J9G A; 4HVU A; 2H3J A; 4C5I A; 4M78 F; 4NOY A; 1M2V A; 1G2B A; 4D8K A; 2YRC A; 3PE0 A; 2RMO A; 3GIB A; 2J7I A; 2K2V A; 1PKS A; 5A0D A; 2FPF A; 2JJ9 A; 2O9S A; 4YTL A; 3CME A; 3GOX A; 2XG8 D; 2QG9 B; 3DB4 A; 3CCU A; 5GAO p; 4MDX A; 3OYC A; 1UEB A; 1TSF A; 2DVJ A; 1VYT A; 3SFM A; 2DLP A; 5DLQ E; 1D0X A; 4PKC C; 1KSW A; 3RIR A; 2RJC A; 1AWW A; 1NPR A; 1SRL A; 3J7A F; 1PC0 A; 2BZ8 A; 3R6N A; 2JVV A; 3M0R A; 1VQM Q; 5J39 A; 1AHJ B; 2DKG A; 2BE7 D; 2RQU A; 5GAN e; 2MWO A; 3HRU A; 4M7D B; 1T0H A; 2FZC B; 1SG5 A; 2P0Q A; 3HP9 A; 1NLP C; 5GAN j; 1SKU B; 2QA4 T; 3CCR Q; 3CCS T; 2R5M A; 2XD0 A; 4PJM A; 2X4J A; 1JJ2 A; 2HSP A; 3QBY A; 1SPK A; 5AT1 B; 1KQS A; 4OB1 B; 3QDR B; 2DE0 X; 4LD9 K; 1NG2 A; 1BI2 A; 4K11 A; 1OEB A; 3FDR A; 1KHC A; 1ZUK A; 2D9T A; 3A1P A; 3M57 A; 4M77 E; 2M02 A; 2FZK B; 2XDD A; 1QWE A; 4OMQ A; 1RAC B; 4E47 A; 1X6G A; 2DRK A; 1WPY A; 3M58 A; 3VS7 A; 1PSE A; 2QDY B; 3ZL7 C; 4M77 D; 3CC7 Q; 4L6V 5; 1K73 U; 3O5Z A; 3CME T; 2FG0 A; 2QAS A; 3A8G B; 2EQU A; 4N4I A; 3MEW A; 1MNE A; 2AZS A; 2CUD A; 3CCU T; 1QCO A; 1WLP B; 2VGN A; 4RTZ A; 4Z88 A; 2WSF E; 2RHU A; 3IQL A; 1PD0 A; 5A2Q E; 4BAC A; 1ZA1 B; 2RHI A; 2E5Q A; 1TS9 A; 1IHW A; 2RQV A; 2PVD B; 5FU6 C; 1H92 A; 1VQK Q; 5KYU B; 2DMO A; 1Q7Y R; 1MMN A; 3NGP A; 2FRW A; 3AT1 B; 4JRP A; 1JXM A; 2F5T X; 3CCE Q; 3BE3 A; 5IHI A; 3M54 A; 3OY9 A; 3JB9 J; 2HL5 C; 2MI6 A; 1I81 A; 2OTJ A; 1Q81 U; 4J9D A; 4N0A C; 1RAE B; 2ZPG B; 1XQH A; 2EFI A; 1Y96 B; 1IHV A; 3JCM g; 1NZ9 A; 1M1K C; 4ZGD B; 1ZLM A; 2X51 A; 3RMQ A; 1VQO Q; 4DBQ A; 3JRZ A; 2LJ1 A; 4LDU A; 2EJF A; 2J05 A; 1IRX A; 2ABL A; 1NYF A; 5FRN A; 5HKC A; 2EYQ A; 4Y28 E; 1YHQ Q; 1IGU A; 1EZZ B; 3FLG A; 3BFM A; 4ME7 A; 4M7D A; 2Y90 A; 1BKB A; 4C8Q F; 2E70 A; 3C94 A; 3QZ5 B; 4KGZ B; 5GMK l; 1KG1 A; 2NUP B; 4M78 C; 4BD3 A; 5HCK A; 3S3M A; 2C0T A; 1GRI A; 4KT0 E; 4JS5 A; 2RHY A; 1VQ9 A; 3OYE A; 4EMK B; 1UGQ B; 2DYB A; 2CP2 A; 1Q95 G; 5GMK m; 1SRM A; 2XIC A; 3L2Q A; 1YBY A; 4FT2 A; 3G4S Q; 1BK2 A; 3A98 A; 3DLL A; 4EPC A; 5GAN d; 1WHJ A; 1TG0 A; 3ZEH A; 1BCM A; 1H8K A; 2QTX A; 2RK2 A; 3RMS A; 1R0B G; 2O9V A; 3M5A A; 1X6B A; 1JJ2 P; 1KQ2 A; 3RER A; 2DER A; 2RJF A; 3RKX A; 1KQS P; 4MML A; 1BIB A; 3EFO B; 3NPF A; 2OTJ T; 4CC3 A; 3CCL Q; 1BCO A; 2K3B A; 3QG1 A; 1NBE B; 3H0H A; 3HTR A; 4X1V A; 2FL7 A; 2VKN A; 4GBQ A; 4J5Y A; 1QLY A; 2HBP A; 2V1R A; 4DBH A; 4JUV A; 2DTH A; 4XTW A; 5LJ5 g; 4OB2 B; 1MV0 B; 3OYJ A; 3C95 A; 2DXB A; 2XI9 A; 2YUQ A; 3OW2 A; 5KYU A; 2E6N A; 4A54 A; 3OYG A; 1RAF B; 1FYN A; 1OU8 A; 1UE9 A; 3JSC A; 2M1H A; 1W2B S; 2QA4 Q; 1XNI A; 3EAE A; 1WZO A; 4PJJ A; 5DLO A; 1BIA A; 2MF2 A; 2KRM A; 2E4H A; 1M90 U; 1IRE B; 5IH2 A; 1YJN Q; 3CEY A; 1F1B B; 1BI1 A; 1VQ9 T; 1YN8 A; 2B8A A; 3I56 Q; 5CKF A; 3CD6 Q; 5GAN 4; 3VS6 A; 1Y96 A; 3J81 E; 1Z9Z A; 4LUE A; 2PQW A; 4ELZ C; 1KHI A; 4AFS C; 1OZ2 A; 4A4G A; 3MEA A; 4A4H A; 1UG1 A; 3RKW A; 1G5V A; 2C0I A; 1QCF A; 1QKX A; 4M7A E; 2ECZ A; 2G3R A; 1QP2 A; 1WJQ A; 3OB9 A; 4FT4 A; 3P8H A; 5CKE A; 3A8M B; 1YJ9 T; 1GFD A; 2EJG A; 3M0U A; 4M7A D; 3CCU Q; 1Y57 A; 2NUP A; 5LJ3 h; 1TH7 A; 4J6W A; 3L1A A; 1FMW A; 2PNI A; 1Q81 C; 2R58 A; 1QW1 A; 2DD4 A; 1WGS A; 4EMK A; 4KUI A; 2D8J A; 3GNG A; 1VQL T; 1X01 A; 1PM3 A; 2M51 A; 4EDU A; 5IXF A; 3RDV A; 2KBT A; 1E6G A; 1K9M R; 2IVW A; 1RAH B; 1JU5 C; 1OZ3 A; 3UF4 A; 3OBW A; 2J06 A; 1U06 A; 2E65 A; 2I2L A; 3KBG A; 4NL2 A; 2QYZ A; 5KYY B; 3L2W A; 4BB7 A; 2DIQ A; 1VQP T; 2DFU A; 4ATO A; 5GAO q; 4XTV A; 2MWP A; 3L2V A; 3EFO A; 1AZE A; 2AIR B; 4FYY B; 1Q86 C; 1PG5 B; 1FXX A; 3BY7 A; 2BUD A; 4N0A A; 3CXC S; 2CSI A; 4C8Q C; 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