The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
14
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sequence length |
64
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structure length |
64
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Chain Sequence |
GAMGAKEYCRTLFPYTGTNEDELTFREGEIIHLISKETGEAGWWKGELNGKEGVFPDNFAVQIS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Signaling protein
|
| source organism |
Mus musculus
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| publication title |
The high resolution NMR structure of the third SH3 domain of CD2AP.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
CD2-associated protein
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| total genus |
14
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| structure length |
64
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| sequence length |
64
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-07-28 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2ROL A; 2DIL A; 2P4R A; 3TSW A; 4KRT A; 2I0N A; 3REA B; 3VS0 A; 2OI3 A; 4X1V A; 2EW3 A; 3UAT A; 3ULR B; 2KRO A; 2F2W A; 2AZV A; 1VA7 A; 2DLP A; 1PHT A; 1PKT A; 1X69 A; 1M27 C; 2RQT A; 1ABQ A; 1UHC A; 4DEY A; 4AG1 C; 3VS4 A; 3THK A; 1E7O A; 4ESR A; 1FMK A; 2FO0 A; 3EG3 A; 3O5Z A; 3PE0 A; 4CC7 A; 2EGA A; 2GQI A; 3EG1 A; 2V1Q A; 4JJB A; 2HBW A; 1A0N B; 2GTJ A; 2CRE A; 1X2K A; 2RQR A; 3EG2 A; 1V1C A; 1CSK A; 2DF6 A; 4OMO A; 3UA7 A; 2ROT A; 4J9F A; 2BZX A; 4RTV A; 1Y57 A; 1ZLM A; 2EYX A; 2KT8 A; 1K76 A; 2JTE A; 4F16 A; 2NWM A; 2OAW A; 1CKA A; 1H3H A; 2EQI A; 3VRY A; 2YT6 A; 3VS1 A; 1B07 A; 5ECA A; 4LUD A; 2L3P A; 1ZBJ A; 1G2B A; 2DE0 X; 1BU1 A; 3TVT A; 2DX1 A; 1UGV A; 1UDL A; 1B3Q A; 1WIE A; 1AZE A; 1SEM A; 2X3W D; 3ZL7 C; 5IHN A; 1U3O A; 2ENM A; 1I0C A; 2K3B A; 2LJ1 A; 2LJ0 A; 2RQU A; 1YCS B; 1JO8 A; 1MUZ A; 1Z9Z A; 4LUE A; 1K0X A; 1KIK A; 1ABO A; 1MV3 A; 3VS6 A; 5EC7 A; 4JZ4 A; 4EIK A; 1HD3 A; 4IIM A; 2O9S A; 3RNJ A; 2SEM A; 2K6D A; 4LNP A; 1AWX A; 2KYB A; 2JW4 A; 2VVK A; 4LN2 A; 1JU5 C; 1WDX A; 4OMN A; 3H0H A; 4AFZ C; 2HEQ A; 2KE9 A; 1M3C A; 1NLO C; 2CSQ A; 1GBQ A; 1WYX A; 2KYM A; 1WA7 A; 2DA9 A; 2DL3 A; 5HCK A; 2AKL A; 4AG2 C; 2QDL A; 3H41 A; 1M30 A; 1NLP C; 1KJW A; 1M3A A; 1AVZ C; 2ESW A; 4ORZ A; 2AKK A; 1XOV A; 3VS2 A; 1X43 A; 1X6G A; 1WI7 A; 1Y0M A; 4K11 A; 2LCS A; 1QKW A; 2EGE A; 4F17 A; 2LJ3 A; 2DL4 A; 1E6H A; 1TUD A; 2CH4 A; 3EG0 A; 1AWW A; 2AK5 A; 2C0O A; 3UF4 A; 5L23 A; 3NMZ C; 1PNJ A; 2JMA A; 2FRW A; 1VYU A; 3EHR A; 1J3T A; 4RTY A; 2A37 A; 4QT7 A; 1SRM A; 1K1Z A; 5GJV B; 5IHK A; 2JXB A; 3VRZ A; 2D1X A; 1QKX A; 1T0H A; 2F2V A; 4J9G A; 2CT3 A; 1UJ0 A; 2DBM A; 1PKS A; 1QCF A; 1SSH A; 2CT4 A; 4GLM A; 2LQW A; 5FWB A; 1PRM C; 2EGC A; 2CSI A; 2ED1 A; 2CDT A; 1NM7 A; 2D8J A; 4AFQ C; 2XMF A; 3QWX X; 2O88 A; 2KR3 A; 2KXD A; 3I5R A; 4JZ3 A; 2RN8 A; 3SHW A; 2A08 A; 1GFC A; 1TUC A; 2B86 A; 4JJC A; 1NG2 A; 2KRS A; 2MOX A; 2BZ8 A; 5GJW B; 1WX6 A; 5I22 A; 2PTK A; 2RF0 A; 4AFS C; 2LNH B; 3NHN A; 5IXB A; 1NYF A; 4GBQ A; 2JS2 A; 1GBR A; 1GCP A; 2YSQ A; 1WFW A; 2BTT A; 1I07 A; 3M0T A; 2FEI A; 2DMO A; 2KRM A; 1VYT A; 2VKN A; 2W0Z A; 3I5S A; 2GNC A; 2L3Q A; 1LCK A; 1YNZ A; 1U5S A; 3UA6 A; 2DRM A; 4HVW A; 4Z89 A; 2J6F A; 1UUE A; 2FPE A; 2LQN A; 2A36 A; 1IO6 A; 2GBQ A; 2D8H A; 2J06 A; 1WLP B; 2H8H A; 2J7I A; 2FPF A; 2PNI A; 1YWP A; 2J05 A; 2YUO A; 4CC2 A; 2HCK A; 2KGT A; 2DVJ A; 2YUQ A; 1AD5 A; 2DJQ A; 4HCK A; 1GCQ A; 1AZG B; 2BZY A; 3H0I A; 3CQT A; 1UFF A; 2KRN A; 1HSQ A; 2KEA A; 4OMP A; 2EYW A; 4FSS A; 1RLP C; 1NYG A; 1S1N A; 1WXU A; 2CUD A; 3PVQ A; 1X27 A; 2KBT A; 1AEY A; 1NEG A; 2MCN A; 1BB9 A; 2LZ6 B; 4D8K A; 1SPK A; 1E6G A; 2M51 A; 3C0C A; 1I1J A; 1U06 A; 2RNA A; 2C0I A; 2OJ2 A; 1ZSG A; 3GBQ A; 4DEX A; 1X6B A; 4J9B A; 2SRC A; 4A63 B; 2LMJ A; 1GCQ C; 1K0S A; 1TG0 A; 1W6X A; 2KT1 A; 2X3X D; 1Z9Q A; 4JPB W; 1ZUK A; 1SRL A; 2EYY A; 2AZS A; 3QWY A; 1OOT A; 4Y92 A; 1UJY A; 3VS3 A; 3PVL A; 2O31 A; 2JMC A; 2J6O A; 1EFN A; 4RUG A; 2VWF A; 4RTU A; 1QLY A; 4HVV A; 2E5K A; 4OML A; 1K4U S; 1GL5 A; 1RUW A; 1OPK A; 1H8K A; 2DNU A; 2DBK A; 1M8M A; 1N5Z A; 1NEB A; 1ZUY A; 2JT4 A; 1OEB A; 1ARK A; 1OPL A; 4Z8A A; 2RMO A; 4J9I A; 4RTW A; 3M0Q A; 1KSW A; 5IHI A; 2J6K A; 1M3B A; 1MV0 B; 3I35 A; 1PWT A; 1UEC A; 1QWF A; 2IIM A; 2DRK A; 1CKB A; 2JM8 A; 2K7A A; 4CC3 A; 2JM9 A; 3SEM A; 1OV3 A; 1G83 A; 1GFD A; 1ZUU A; 2V1R A; 1T3S A; 2NUZ A; 1H92 A; 2FG0 A; 2FRY A; 2W10 A; 4R0K A; 3M0U A; 1AWO A; 3VS7 A; 3M0S A; 4HXJ A; 2RQW A; 5IH2 A; 2ED0 A; 1JEG A; 2EYZ A; 2DL7 A; 1HJD A; 4Z88 A; 3VS5 A; 2ABL A; 4D8D A; 1X2Q A; 2RPN A; 1GRI A; 2L3S A; 3NGP A; 2FPD A; 2CH4 W; 3REB B; 1W1F A; 1UHF A; 1FYN A; 2GGR A; 2YUN A; 2ECZ A; 1KFZ A; 3NPF A; 2YDL A; 3H0F A; 1YWO A; 2GTO A; 2JS0 A; 2K79 A; 4M4Z A; 2EKH A; 1YP5 A; 2C0T A; 2RQV A; 1K9A A; 1SHG A; 2O2O A; 4LE9 A; 3U23 A; 3EHQ A; 2F2X A; 4AFU C; 3A98 A; 3M0R A; 1WXT A; 2DL5 A; 4J9D A; 2KNB B; 4RTX A; 1W70 A; 2EPD A; 1UE9 A; 4ZNX A; 3KFV A; 1UG1 A; 5IXF A; 2PZ1 A; 2EBP A; 1JQQ A; 2LP5 A; 3R6N A; 4F14 A; 2KXC A; 4WCI A; 3TSZ A; 1WXB A; 1BK2 A; 4OMM A; 3IQL A; 1AOJ A; 5I11 A; 1BBZ A; 2EVR A; 2L2P A; 1JXM A; 3M0P A; 3I9Q A; 2K2M A; 3RBB B; 2M0Y A; 1PRL C; 1RI9 A; 2DL8 A; 2CUB A; 2HSP A; 1JXO A; 2LX7 A; 1RLQ C; 2DYB A; 2G6F X; 3LH5 A; 4IIO A; 2K9G A; 2O9V A; 4HVU A; 1VYV A; 2L0A A; 3JV3 A; 1T3L A; 2D0N A; 1SHF A; 2YUP A; 3FJ5 A; 1ZX6 A; 1QWE A; 2A28 A; 2MIO A; 3EGU A; 1T0J A; 1YN8 A; 5FWC A; 4CC4 B; 4JJD A; 4OMQ A; 4J9C A; 4E6R A; 1AWJ A; 1UTI A; 4J9E A; 4RTT A; 2DM1 A; 2HDA A; 5FW9 A; 4RTZ A; 4J9H A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3CCQ T; 2RJC A; 5GAM d; 5CKE A; 2I0N A; 3OSV A; 3QDR B; 3VS0 A; 2OI3 A; 2ZPB B; 1QVF P; 2AZV A; 5CVI A; 2HQE A; 2K57 A; 3FC3 A; 2DLP A; 4A53 A; 1D1A A; 4E7H A; 1OX8 A; 1X69 A; 1UHC A; 4DEY A; 4AG1 C; 3VS4 A; 2ZGW A; 5CKF A; 3THK A; 1E7O A; 4ESR A; 1FMK A; 2FO0 A; 3O5Z A; 2GQI A; 3EG1 A; 4C8Q F; 3OY9 A; 4RG8 A; 3HSB A; 4BI4 A; 1WJQ A; 2XK0 A; 3EG2 A; 4V2S A; 1YJN Q; 3QXE B; 1S72 A; 2ROT A; 3GNG A; 2QQR A; 3RKY A; 4RTV A; 2ZPH B; 2YLC A; 2KT8 A; 1K76 A; 2JTE A; 4HT8 A; 3CXC A; 4F16 A; 2NWM A; 2OAW A; 3CCE A; 5LJ5 d; 1CKA A; 5I2M A; 3RKW A; 2RI5 A; 3VS1 A; 4C8Q G; 1TH7 A; 4F7U B; 2QGG A; 5ECA A; 4LUD A; 4KUL A; 1G3Y A; 3UPU A; 2PU9 B; 2P0Q A; 4KBM B; 4M7D G; 4C92 A; 1YIT A; 4ZGE B; 2X3W D; 4LD6 A; 3JB9 D; 3LWH A; 1K73 R; 1N9S A; 1OYX A; 1JO8 A; 1MUZ A; 2PUK B; 1K0X A; 3GP8 A; 4XU1 A; 1ZSZ C; 1VIE A; 2YLB A; 4XTW A; 4IIM A; 3S3O A; 3HP9 A; 4BAC A; 3HKS A; 3WXM B; 1OU8 A; 3RNJ A; 4F04 B; 2QEX T; 1VQ5 A; 4C8Q C; 2KYB A; 4BI3 A; 2JW4 A; 5CKD A; 3BY7 A; 2HBP A; 3X25 B; 1JU5 C; 2EJF A; 5DLQ E; 3E9F A; 3G1J A; 2CSQ A; 3VKI A; 1GBQ A; 1WYX A; 2KYM A; 4P5N A; 5HCK A; 1VQO T; 1KJW A; 5GAN j; 2ESW A; 4OB2 B; 1KD1 C; 1G5V A; 1NJI U; 1XOV A; 4O6J A; 3OYH A; 4IUU A; 1X6G A; 1ACM B; 4L59 A; 4B6M A; 2EGE A; 3DLM A; 2L3R A; 2LJ3 A; 2VGN A; 1UGS B; 2R5M A; 2CH4 A; 1Q82 U; 3EG0 A; 3UF4 A; 1IHW A; 1EZZ B; 2AIR B; 5GAM f; 2AT1 B; 2JMA A; 3HRS A; 1YI2 Q; 1VQ7 A; 5GAN 6; 3QHS A; 4JRI A; 1J3T A; 2A37 A; 5GAN 8; 1YJN A; 5IHK A; 4F7U E; 2EIF A; 1M90 R; 3VRZ A; 2K3Y A; 4C0G A; 1T0H A; 1LPL A; 1EX4 A; 4QVZ A; 5LJ3 h; 2DBM A; 3EAE A; 4D6W A; 1VQ8 Q; 1SSH A; 2CT4 A; 2XG8 D; 2P84 A; 2KMT A; 2CDT A; 2XMF A; 3S3N A; 4JZ3 A; 1QVF A; 1TUC A; 1NG2 A; 5GAO q; 2BZ8 A; 1RAH B; 2CP5 A; 3PGG A; 2RF0 A; 1G3S A; 3ME9 A; 4DBH A; 4JJN K; 5IXB A; 5LJ5 f; 1GBR A; 3M53 A; 4QQG A; 2BTT A; 4M75 B; 2VKN A; 2DTO A; 4C8Q A; 3I5S A; 2L3Q A; 1LCK A; 2RH2 A; 1U5S A; 3UA6 A; 4XU0 A; 2DRM A; 5GAN e; 4Z89 A; 2FZK B; 1UUE A; 4DQ2 A; 2RJF A; 3CCS Q; 1IO6 A; 1VQM T; 1JRI A; 4EMH A; 2CP0 A; 4L5G A; 3X28 B; 1VQN T; 4M77 A; 2H8H A; 4M7D A; 5FU6 B; 3VYH B; 4M7A D; 3CMA T; 2HCK A; 2XU8 A; 1RAF B; 2DVJ A; 2YUQ A; 4PJO A; 4OB3 B; 3UDC A; 1VQK Q; 1Q7Y C; 1AD5 A; 4QQ6 A; 5KYN A; 4HCK A; 1FMW A; 1VQ6 A; 1QW1 A; 1LNX A; 3CCJ A; 2XID A; 1K9M U; 4C0D B; 2BZY A; 4XU2 A; 1N27 A; 4MDX A; 4EMK A; 5KCH A; 1NYG A; 1S1N A; 3CME Q; 2OTL A; 3E1S A; 1G3T A; 2ZPG B; 1NEG A; 3L2Z A; 2DEQ A; 3GF5 A; 1I4K 1; 2M51 A; 1U06 A; 1YI2 A; 1YHQ Q; 2OJ2 A; 1ZSG A; 4XTY A; 4DEX A; 4J9B A; 1VIF A; 4J8O A; 3RUX A; 2BKD N; 1NBE B; 4PNO A; 2R5A A; 2X3X D; 1U1T A; 1KHI A; 2EYY A; 4PFZ A; 2RHY A; 2DEU A; 1PD1 A; 3QWY A; 2E3H A; 3CC7 Q; 1VQ8 A; 1M4Z A; 3PVL A; 2EFI A; 3J81 E; 2DER A; 3LGL A; 3M58 A; 4FYY B; 1KHC A; 4Q5W A; 2E5Q A; 1MMD A; 1QLY A; 1WHH A; 1XJW B; 4M75 E; 4OML A; 3M59 A; 2RI3 A; 1H8K A; 1PSE A; 2DBK A; 1M8V A; 1B34 A; 3SWN A; 3V7R A; 5A2Q E; 1KQ2 A; 1ZUY A; 2JT4 A; 2DXC A; 2DO3 A; 1MND A; 4Z8A A; 4FW1 A; 1TU0 B; 4RTW A; 3I56 Q; 2QQA A; 5IHI A; 1HXD A; 1WGS A; 3I35 A; 3OQ5 A; 5IN1 A; 1QWF A; 5DM7 R; 4BDZ A; 2HD0 A; 8ATC B; 1G83 A; 3CCS A; 3CPW S; 4HKE A; 2W10 A; 3LX7 A; 4FL6 A; 4R0K A; 1YIJ A; 2E12 A; 3VJP A; 3VS7 A; 5EG2 A; 3M0S A; 5GAN 7; 2ED0 A; 5CIU A; 3JCM X; 5LJ3 g; 2K5F A; 2RPN A; 2DVE A; 3BDL A; 4DBF A; 2CH4 W; 2K5I A; 4PJM A; 4RCB A; 2GGR A; 3NPF A; 3G4S Q; 5KYX A; 2JTM A; 1Q86 U; 3GIB A; 2NYS A; 2K79 A; 2VB6 A; 2JUF A; 1C0M A; 4FYW B; 2Y4Y A; 3P8B B; 1K9A A; 2AHJ B; 1D3B B; 2QAZ A; 2O2O A; 4FU6 A; 3EHQ A; 2F2X A; 1VQ4 Q; 1N6A A; 4JRP A; 1RAD B; 2CP3 A; 2V8K A; 4EMG A; 2E41 A; 2E6N A; 4J83 A; 1YJ9 A; 2FL7 A; 4LD9 K; 3FIF A; 2X9H A; 1JB0 E; 8AT1 B; 2P4T A; 1WHL A; 1EIF A; 3PIO A; 1BK2 A; 3CC7 A; 3S6W A; 1MMA A; 1AOJ A; 5KYW B; 1KK7 A; 1NJI C; 4WF2 A; 3M0P A; 5GMK j; 1KG1 A; 2DYI A; 1R77 A; 2DL8 A; 3EFR A; 4HCZ A; 2CUB A; 4IIO A; 1Q82 C; 2K9G A; 1Y71 A; 3CCM T; 2O9V A; 4M78 G; 1IRE B; 1VYV A; 1LOJ A; 1K73 U; 3JCM h; 2O4X B; 3I56 A; 2YUP A; 1QWE A; 2A28 A; 4CC4 B; 3CCR A; 1QVF S; 4C92 E; 2E4H A; 1UTI A; 5AYF A; 4J9E A; 4RTT A; 2DM1 A; 3FRN A; 2HDA A; 2K3X A; 5FW9 A; 4J9H A; 2M02 A; 5GAO l; 1IXD A; 2P4R A; 5L8R E; 4MZM A; 3TQ7 P; 3CD6 Q; 1ZSZ B; 2F2W A; 2MPX C; 1Q95 G; 4N4I A; 2BE9 B; 3PNW C; 3CCU T; 4ZTF A; 3C4S A; 1D0Z A; 4C8Q B; 1M27 C; 1ABQ A; 3H8Z A; 1XTD A; 2VV5 A; 3G71 Q; 4RMO A; 3EG3 A; 3KBG A; 1K9M R; 1NPR A; 4JJB A; 4IUV A; 1TWB A; 2RQR A; 1V1C A; 2HNI A; 2MWP A; 3HFN A; 2HSE B; 2DF6 A; 1V76 A; 2GCX A; 4J9F A; 2BZX A; 1UGQ B; 2BE7 D; 2EYX A; 4BY6 C; 3CPW P; 4OB1 B; 1VQ4 A; 4LDV A; 2QA4 Q; 2EQI A; 4J6X A; 1D1C A; 2E64 A; 1M90 U; 1G2B A; 3OYD A; 3OYY A; 2DE0 X; 2LCL A; 3TVT A; 1S72 Q; 2DX1 A; 1WHK A; 1UDL A; 5GAM j; 5GAO m; 2HKN A; 3OYA A; 1UB4 A; 1SEM A; 2EQM A; 3OYN A; 4XAX B; 3ZL7 C; 3OS5 A; 3SB2 A; 2ENM A; 1I0C A; 2K3B A; 2LJ1 A; 3TEE A; 1BIA A; 1YCS B; 4LUE A; 3RDV A; 4QW2 A; 2EJG A; 4L6V 5; 1MV3 A; 3VS6 A; 2L89 A; 1C1A A; 4J7F A; 3JCM b; 1N8R R; 5FRN A; 2DAQ A; 1H64 1; 1LJO A; 1OZ3 A; 3CBM A; 2K6D A; 2QK0 A; 1YIT Q; 1UGR B; 2OTJ A; 1SSF A; 3RKX A; 4OMN A; 4B9W A; 2P0P A; 3PT9 A; 2JNG A; 3KUF A; 1M3C A; 1VQP Q; 2DL3 A; 2DA9 A; 2JZ2 A; 4AG2 C; 3UT1 A; 1KQS P; 4C8Q E; 1M30 A; 2QAS A; 1QP3 A; 1AVZ C; 4M78 A; 2LNV A; 3G6E Q; 1VQ5 Q; 4KH1 B; 4R56 A; 2XDB A; 1WI7 A; 2P0K A; 1QKW A; 3M4Y A; 4M7D E; 1MNE A; 1TUD A; 5HY6 A; 1R0B G; 3G71 A; 5L23 A; 2RK1 A; 4XTU A; 3JSC A; 3I55 A; 4JLI A; 1D1B A; 1RAE B; 2FRW A; 1YJW T; 2D6F A; 4RTY A; 5LJ5 h; 4QT7 A; 1SRM A; 5FU7 C; 5GAM e; 5CCA A; 2MMP A; 3E2U A; 1RAI B; 1Q86 R; 1QKX A; 3JCM g; 4JS5 A; 4J9G A; 2QTX A; 3X26 B; 2QA4 A; 2X4Y A; 3LGF A; 4XQ3 A; 4AFQ C; 2ED1 A; 1VQ7 Q; 3QWX X; 2KXD A; 3I5R A; 2A08 A; 4BDY A; 1GFC A; 3VYG A; 2B86 A; 4M77 F; 1IGU A; 4AFS C; 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