The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
6
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sequence length |
68
|
structure length |
68
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Chain Sequence |
GPLGSGALKWVLCNYDFQARNSSELSVKQRDVLEVLDDSRKWWKVRDPAGQEGYVPYNILTPYPAAAS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structural basis of PxxDY motif recognition in SH3 binding.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Eps8-like protein 1
|
| molecule tags |
Signaling protein
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
6
|
| structure length |
68
|
| sequence length |
68
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2008-04-02 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2KRS A; 2DA9 A; 2F2W A; 1XOV A; 2KBT A; 2JS2 A; 3M0U A; 2RQU A; 5IHN A; 2ROT A; 2C0O A; 1KFZ A; 2FEI A; 1YWP A; 2A36 A; 1WFW A; 1SHF A; 3A98 A; 2VWF A; 2GBQ A; 5FWB A; 4LE9 A; 3VS3 A; 2F2V A; 4GBQ A; 2YUO A; 1UE9 A; 1FMK A; 4RTT A; 1ZBJ A; 1UFF A; 4DEY A; 3UA7 A; 1M3A A; 1BU1 A; 1H92 A; 3H41 A; 1M3C A; 1NLP C; 1WXT A; 1ABO A; 2EYW A; 2L3Q A; 1QCF A; 3SEM A; 2D1X A; 3EHR A; 2W0Z A; 1AD5 A; 2EBP A; 1QWF A; 1U5S A; 5FW9 A; 4OMO A; 4ORZ A; 4LNP A; 2KYB A; 1JQQ A; 1B3Q A; 1TG0 A; 1LCK A; 1Z9Z A; 2GTJ A; 1OOT A; 3LH5 A; 4J9G A; 1GBR A; 2DMO A; 2LJ1 A; 2GQI A; 2AK5 A; 2LNH B; 1JXM A; 2KE9 A; 3U23 A; 1K1Z A; 1UGV A; 2MCN A; 2RMO A; 2ECZ A; 2KRM A; 2YUP A; 2CSQ A; 2J6K A; 2K6D A; 5L23 A; 1N5Z A; 4J9F A; 1CKB A; 4HVW A; 3VS1 A; 1B07 A; 4FSS A; 3I9Q A; 1VYV A; 1K76 A; 1NEB A; 4AFZ C; 2V1Q A; 1VA7 A; 1S1N A; 4E6R A; 1NEG A; 1UJY A; 2KYM A; 1PHT A; 2ROL A; 1K0S A; 2J6F A; 2DL4 A; 2JM8 A; 2DF6 A; 4RTZ A; 3TSZ A; 2HCK A; 3VS4 A; 3H0H A; 4F16 A; 2O2O A; 4RTX A; 1YCS B; 1SPK A; 1AWJ A; 2K3B A; 2RN8 A; 2P4R A; 3C0C A; 1W70 A; 2I0N A; 2J7I A; 2CT3 A; 4J9B A; 1U3O A; 2JXB A; 5ECA A; 2DRK A; 1OV3 A; 1T3L A; 4Y92 A; 3REB B; 2DLP A; 2DJQ A; 1WDX A; 2O9S A; 2BZY A; 3H0I A; 3M0R A; 2AZV A; 1WA7 A; 2CH4 W; 4WCI A; 1SRL A; 3SHW A; 1BBZ A; 1SSH A; 2MIO A; 4J9E A; 4RTW A; 3VRZ A; 2EVR A; 2D8J A; 1WX6 A; 4RTY A; 1ZUY A; 3ULR B; 2JM9 A; 1UG1 A; 2DBK A; 1CKA A; 1NG2 A; 2KEA A; 1GCQ C; 2RQR A; 3EG1 A; 3FJ5 A; 5GJW B; 2SEM A; 4ESR A; 2VKN A; 1NYG A; 1J3T A; 2KXD A; 3UF4 A; 2AZS A; 3O5Z A; 1AWW A; 1BB9 A; 3VS6 A; 2K2M A; 1YN8 A; 2HSP A; 4Z8A A; 1AOJ A; 1PKT A; 3QWX X; 3RBB B; 2JMC A; 1WXB A; 1WXU A; 2CRE A; 2DBM A; 2ENM A; 1I07 A; 2J6O A; 1Z9Q A; 2FRW A; 2EYY A; 1OPK A; 1X2K A; 1GBQ A; 1T0H A; 3NPF A; 1UHC A; 4AFS C; 1YNZ A; 2J06 A; 1AZG B; 1GCP A; 1E6G A; 4AG2 C; 1FYN A; 1ZX6 A; 4RTU A; 3I5S A; 4JZ4 A; 1HSQ A; 2IIM A; 1W6X A; 1NYF A; 4Z88 A; 2LJ3 A; 1X2Q A; 4OMQ A; 3EG3 A; 3VS7 A; 1M8M A; 2L3S A; 2FPF A; 2KT8 A; 2XMF A; 1UJ0 A; 1T0J A; 1W1F A; 5I11 A; 1WYX A; 1AVZ C; 1RLQ C; 1E6H A; 4CC7 A; 1ARK A; 5I22 A; 3PE0 A; 1MUZ A; 4OMP A; 4GLM A; 4IIO A; 4JJB A; 1QKW A; 2PTK A; 4JPB W; 2RNA A; 1A0N B; 3VS0 A; 4RTV A; 5IHI A; 2DX1 A; 2EGA A; 2KR3 A; 3I5R A; 4JJD A; 2V1R A; 4R0K A; 1YP5 A; 4F17 A; 1YWO A; 3IQL A; 2J05 A; 1QLY A; 3EG2 A; 2FG0 A; 3EG0 A; 3NGP A; 3M0Q A; 4LUD A; 4IIM A; 2G6F X; 2JS0 A; 1U06 A; 2RQT A; 2KNB B; 1NLO C; 2JMA A; 2DL8 A; 1UEC A; 4RUG A; 3TVT A; 2YUN A; 2LQW A; 1X43 A; 3I35 A; 1Y57 A; 1X69 A; 2PZ1 A; 4J9I A; 1Y0M A; 1K9A A; 2RQW A; 1PRL C; 2PNI A; 2CH4 A; 2YUQ A; 1K0X A; 1VYT A; 1ZLM A; 2C0I A; 2CDT A; 2RF0 A; 1X6G A; 2DIL A; 5IXF A; 2RQV A; 2H8H A; 1HD3 A; 3H0F A; 1AWO A; 2CUD A; 1MV0 B; 4HXJ A; 2X3X D; 2MOX A; 2A08 A; 1JO8 A; 1WI7 A; 2DVJ A; 4J9H A; 2DM1 A; 2ED0 A; 3TSW A; 2DL3 A; 1TUD A; 1SRM A; 1M27 C; 2HBW A; 3PVQ A; 4J9C A; 2F2X A; 3REA B; 1ZUK A; 1GCQ A; 2FPE A; 4ZNX A; 2D0N A; 3VS5 A; 3EGU A; 1PKS A; 2EYZ A; 4Z89 A; 2C0T A; 3NHN A; 1IO6 A; 1QKX A; 2DYB A; 4X1V A; 4AFQ C; 1WIE A; 1G2B A; 4LN2 A; 3JV3 A; 2X3W D; 4D8K A; 2GTO A; 2RPN A; 5IXB A; 1NM7 A; 5EC7 A; 5IHK A; 1AZE A; 2KRO A; 2KRN A; 1M3B A; 2NWM A; 5HCK A; 2M0Y A; 4CC2 A; 2DE0 X; 1GL5 A; 1OPL A; 1BK2 A; 2JTE A; 1WLP B; 2FO0 A; 4AG1 C; 1CSK A; 2W10 A; 3EHQ A; 4F14 A; 5IH2 A; 4KRT A; 5FWC A; 2AKK A; 1H3H A; 2DL5 A; 2JW4 A; 1I1J A; 1X27 A; 2ABL A; 1G83 A; 2A37 A; 2HDA A; 2LQN A; 1UDL A; 2GNC A; 2KGT A; 1SHG A; 2SRC A; 2EYX A; 4LUE A; 1V1C A; 4EIK A; 1H8K A; 2B86 A; 2M51 A; 2OI3 A; 2EQI A; 3NMZ C; 3CQT A; 1MV3 A; 3ZL7 C; 4D8D A; 1JEG A; 2OAW A; 2O31 A; 2YSQ A; 4J9D A; 2L0A A; 4OML A; 1ZUU A; 2LCS A; 1T3S A; 2FPD A; 3VS2 A; 1KJW A; 2BZX A; 4HVV A; 3THK A; 2KXC A; 1HJD A; 1JXO A; 4K11 A; 2EGE A; 4OMN A; 4HVU A; 3R6N A; 1RLP C; 3M0P A; 2LZ6 B; 2OJ2 A; 1PWT A; 2DL7 A; 1EFN A; 1TUC A; 3KFV A; 2GGR A; 4HCK A; 2ED1 A; 2O9V A; 2ESW A; 2EPD A; 3RNJ A; 2K7A A; 1AWX A; 2EKH A; 2LJ0 A; 2EGC A; 1UTI A; 1SEM A; 2CT4 A; 1M30 A; 3UAT A; 4DEX A; 2NUZ A; 2YDL A; 1I0C A; 1RUW A; 2HEQ A; 4OMM A; 4CC3 A; 1QWE A; 1GFC A; 2JT4 A; 2LMJ A; 2CUB A; 2K9G A; 3M0T A; 4QT7 A; 1RI9 A; 2O88 A; 3M0S A; 2D8H A; 2K79 A; 2LP5 A; 2EW3 A; 2A28 A; 2E5K A; 1GFD A; 2AKL A; 1AEY A; 2KT1 A; 4CC4 B; 2QDL A; 1E7O A; 2DRM A; 2YT6 A; 3UA6 A; 1VYU A; 2VVK A; 4M4Z A; 1UUE A; 3QWY A; 1KSW A; 2BZ8 A; 2FRY A; 1OEB A; 1PNJ A; 1ZSG A; 2DNU A; 5GJV B; 4A63 B; 1JU5 C; 1K4U S; 2BTT A; 2LX7 A; 4AFU C; 4JJC A; 1ABQ A; 4JZ3 A; 3GBQ A; 1GRI A; 1PRM C; 1UHF A; 3PVL A; 1KIK A; 2L3P A; 2CSI A; 2L2P A; 1X6B A; 3VRY A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2CP6 A; 2DA9 A; 4OB1 B; 1I5L A; 5GMK e; 2RQU A; 4C0D C; 4QQD A; 2VGM A; 2ZPI B; 4TVR A; 4A4G A; 5LJ3 j; 1IHV A; 1Y7X A; 2DEQ A; 3QKJ A; 1SHF A; 3A98 A; 1ZHI A; 2VWF A; 4M75 D; 1IZ6 A; 5D6W A; 1NBE B; 4LE9 A; 1WQW A; 4IUP A; 3CPW P; 4RTT A; 2HL3 A; 1UFF A; 3UT1 A; 4B6M A; 3H41 A; 3OYF A; 1N8R C; 3E19 A; 1NLP C; 2CP2 A; 3DB3 A; 4E47 A; 3ZEH A; 1S72 T; 2RJD A; 2C06 A; 2ZPG B; 1UGP B; 1NJI U; 1QWF A; 5FW9 A; 4BI8 B; 3H6Z A; 3VV0 A; 3PGG A; 4ORZ A; 3M9Q A; 4KGX B; 1JQQ A; 4BDZ A; 4DBH A; 2GTJ A; 1Z9Z A; 1N8R R; 1D09 B; 3CC4 A; 3QSU A; 2LJ1 A; 4J7I A; 2AK5 A; 2DJZ A; 1Q86 U; 1FX7 A; 1JXM A; 4FM4 B; 2JZ2 A; 4MML A; 4J6X A; 1KQS S; 3G6E Q; 3HL8 A; 5CVI A; 3VS1 A; 2F69 A; 1BIB A; 4M77 G; 1PD0 A; 4AFZ C; 3CCR T; 1N27 A; 1M5Q 1; 4E6R A; 3MP1 A; 4MZT A; 2KYM A; 2J6F A; 4M77 A; 2DL4 A; 3CCL T; 1B34 A; 4BDY A; 4DA4 A; 3CEY A; 1OUL A; 5A0D A; 1VIF A; 4M7A C; 3UDC A; 1YFN A; 2O2O A; 2HAX A; 3FC3 A; 8ATC B; 1BIA A; 3G71 A; 1IHW A; 1WHM A; 1VQO T; 4L6V 5; 2I0N A; 1NPR A; 2XG8 D; 4J9B A; 1DJ7 B; 1W4S A; 1WDX A; 3A8L B; 2LX9 A; 3M56 A; 2ZGW A; 1WA7 A; 5LL6 S; 2E6N A; 3OYG A; 1BBZ A; 2MIO A; 3OYJ A; 3TCJ A; 4J9E A; 3HRU A; 4RTW A; 3CCS T; 2EQJ A; 2EVR A; 1Y96 A; 2DPP B; 1WX6 A; 1ZUY A; 1VQ5 T; 2D9T A; 2ZZD A; 3CCJ T; 2KVQ G; 4KT0 E; 3CCE Q; 4Q5W A; 3CPF A; 3JCM c; 3L2Z A; 3S6W A; 2X4Y A; 2PUK B; 2EJF A; 3I56 Q; 1J3T A; 2KXD A; 9ATC B; 2AZS A; 2JTF A; 1VQP A; 2E1H A; 3VS6 A; 1G3S A; 2QI2 A; 2R5M A; 4DOW A; 3MEW A; 1VUB A; 2CRE A; 2EKO A; 2ENM A; 1I07 A; 2HNI A; 2J6O A; 1Z9Q A; 4XTY A; 1T0H A; 4C92 F; 5C6S A; 2RJC A; 1YNZ A; 1VQ7 A; 1TSF A; 4C5H A; 4C0Z A; 4QW2 A; 5KCO A; 1W6X A; 1OQK A; 3JCM h; 2PUO B; 3WVE B; 1X2Q A; 3A5Z B; 5HK0 A; 2ZPE B; 3RUX A; 3HFN A; 1R0C B; 5GAN 4; 3PT9 A; 1KC8 U; 2KY9 A; 2F1L A; 1WHL A; 3JCM e; 2CP5 A; 1X01 A; 3CC7 Q; 4QQG A; 4PJO F; 1LVK A; 5FU6 C; 1UEB A; 3SD4 A; 4OP0 A; 4C5E A; 4JDS A; 1XQH A; 2FYK A; 4JPB W; 4C0D B; 1VQP Q; 1VQN T; 3BE3 A; 1VQ8 A; 4RTV A; 4O5V A; 5KYU B; 2KR3 A; 1TUG B; 4LD9 K; 1QVG S; 3EFS A; 4M7A G; 4M7D C; 4E7I A; 1WHJ A; 1YIJ A; 2RI5 A; 4ANJ A; 1WHH A; 2E41 A; 4M7A A; 2K3Y A; 2MMP A; 2DL8 A; 2RHY A; 3CME A; 1VQ9 A; 2XIC A; 2QXF A; 1LNX A; 1RAH B; 1YIT A; 2LQW A; 1X43 A; 1Y57 A; 2KMT A; 3KUF A; 1VQK Q; 3OYH A; 1MMG A; 2QDY B; 2E6Z A; 1K0X A; 3P8D A; 2RF0 A; 1RAE B; 2QTV A; 3EGD B; 5LJ3 d; 5GMK l; 1GXI E; 2X3X D; 4ZTJ A; 3CCQ Q; 2RD1 A; 4L5G A; 3DLL A; 2DVJ A; 1K9M R; 2DM1 A; 1YCY A; 4E7H A; 1OX9 A; 1TUD A; 1VQM T; 2VC8 A; 2VGN A; 3REA B; 1VQ8 Q; 2LVM A; 4MMK A; 3EGX A; 5GAN h; 3LYI A; 4ZNX A; 5CKD A; 4WF2 A; 1PCX A; 4Z89 A; 2EYZ A; 2QEX T; 3NHN A; 1IO6 A; 4AFQ C; 3CMA Q; 3CPW A; 3CD6 Q; 3HTR A; 1NJI C; 4D8K A; 4LDY A; 3QJ6 A; 1RAA B; 2PU9 B; 4XTW A; 3LW5 E; 5M9O A; 1Q86 C; 2NWM A; 3WXM B; 5HCK A; 4PJN A; 4BE2 A; 4CC2 A; 2DE0 X; 1NJI R; 1OPL A; 2JTE A; 2OAU A; 4AG1 C; 2FZK B; 3J7A F; 4IUT A; 4C92 B; 3DB4 A; 4F14 A; 1QVF S; 1Q86 R; 5FWC A; 3M4Y A; 4X9C A; 1H3H A; 2DL5 A; 1Q95 G; 3OS2 A; 1X27 A; 3FIF A; 1QVG P; 1G83 A; 2K5F A; 2LQN A; 2PVG B; 1UDL A; 1SHG A; 2SRC A; 2QQ9 A; 3EH2 A; 4PJO E; 1JEG A; 2OAW A; 2O31 A; 4LDW A; 2FZG B; 2RI2 A; 4OML A; 3L2U A; 1ZUU A; 3VS2 A; 2JVV A; 4BI3 A; 2LDM A; 2XI9 A; 1HJD A; 3N5B B; 1BI3 A; 4M7D G; 3JCM V; 1JXO A; 4MZM A; 2X4J A; 3V8K A; 2ZCF B; 4M7D A; 2DL7 A; 2GGR A; 7AT1 B; 4HCK A; 2CP3 A; 5KE3 A; 2YLC A; 1YJ9 Q; 4XAX B; 1ZBX A; 4HKE A; 3DLM A; 2QQB A; 2OTJ T; 3FJP A; 2FZC B; 1M1G A; 4DEX A; 3GNF B; 2NUP A; 2M9U A; 2HEQ A; 2LQK A; 2CYZ B; 2DKG A; 2LNV A; 2MK5 A; 3OYY A; 1P92 A; 2RO0 A; 5DLO A; 4GLK A; 3BDU A; 1F1B B; 3M0T A; 1RI9 A; 5LJ5 h; 4M78 F; 3M0S A; 2EW3 A; 3BDL A; 2A28 A; 3E9F A; 3OMC A; 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4IUR A; 1UGQ B; 1RI0 A; 1AWJ A; 3C0C A; 3X26 B; 2O4X A; 2YRC A; 4FIB A; 1SKU B; 4M78 E; 5HKC A; 5D6Y A; 3OYB A; 4MDX A; 1M2V B; 2HBP A; 3LH0 A; 2EJG A; 5DM7 R; 4Y91 A; 2JXB A; 5ECA A; 2DRK A; 4DBR A; 1T3L A; 1EZZ B; 2FB7 A; 2EQK A; 4M78 B; 1M90 U; 4ATO A; 4XU1 A; 2QQS A; 4PLL A; 1SRL A; 4M77 F; 5EG2 A; 3X25 B; 5A0L A; 3VRZ A; 3G4S A; 2D8J A; 2XKO C; 2RHU A; 2Y90 A; 5GAN g; 3V7R A; 3MP6 A; 2JM9 A; 1VQ4 Q; 3RIR A; 1UG1 A; 1CKA A; 3QII A; 3A8M B; 2KEA A; 3R6O A; 2SEM A; 4KH1 B; 1QVG A; 1K9M U; 2O4X B; 3URG A; 2NYS A; 3GOX A; 4Z8A A; 3CCE T; 1AOJ A; 1PKT A; 3QWX X; 3RBB B; 4PK4 A; 1WXU A; 3I56 T; 3VKI A; 4VUB A; 2FRW A; 1X2K A; 1UHC A; 5GAN f; 5CIU A; 4FW1 A; 3PIP A; 2OTL T; 1E6G A; 2E3I A; 2B8A A; 2L5Q A; 4AG2 C; 3BY7 A; 1FYN A; 2QA4 A; 1ZX6 A; 4BE1 A; 4EDU A; 4JS4 A; 2IIM A; 2CKK A; 5KH6 A; 3G7Z A; 3OYD A; 4OMQ A; 3EG3 A; 1HK9 A; 1QMC A; 3MEA A; 3C95 A; 1T0J A; 2KSS A; 1IB8 A; 3S3O A; 3L2V A; 3CC2 Q; 2M16 A; 1MMA A; 2LT4 A; 4WTO B; 1ZQ1 A; 2P0K A; 4C8Q G; 3TEE A; 2DXB A; 1ARK A; 1FMV A; 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