The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
59
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structure length |
59
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Chain Sequence |
APWATAEYDYDAAEDNELTFVENDKIINIEFVDDDWWLGELEKDGSKGLFPSNYVSLGN
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structures of invisible, excited protein states by relaxation dispersion NMR spectroscopy
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Actin-binding protein
|
| molecule tags |
Structural protein
|
| source organism |
Saccharomyces cerevisiae
|
| total genus |
11
|
| structure length |
59
|
| sequence length |
59
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2008-04-30 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3KFV A; 4RTV A; 3I5R A; 2EYX A; 1PRL C; 1RLP C; 1B07 A; 1UG1 A; 1Y57 A; 2K9G A; 4CC7 A; 1BK2 A; 1ARK A; 1CKB A; 1ZLM A; 1AOJ A; 2V1R A; 1VYU A; 4JPB W; 3VS5 A; 3M0P A; 2JTE A; 2LQN A; 4RTT A; 2KRS A; 2O9S A; 3EG2 A; 1NLO C; 3NGP A; 1JXM A; 5GJV B; 2O88 A; 4J9B A; 1NYF A; 3VRZ A; 2DL8 A; 3PE0 A; 1AWX A; 1WI7 A; 3UF4 A; 1FMK A; 1W6X A; 2OJ2 A; 4HXJ A; 2BZ8 A; 3TVT A; 4DEX A; 2O9V A; 1U5S A; 3R6N A; 1YN8 A; 1U06 A; 1WDX A; 2J05 A; 2FO0 A; 5IXB A; 3I35 A; 3M0R A; 4M4Z A; 2DVJ A; 3IQL A; 2JT4 A; 1B3Q A; 3RBB B; 2FPD A; 3THK A; 2DE0 X; 2DBK A; 4J9E A; 4F17 A; 1JO8 A; 2KT8 A; 3H0F A; 2VVK A; 4JZ4 A; 1ZSG A; 2B86 A; 1MUZ A; 1Z9Z A; 2L0A A; 3QWX X; 2DX1 A; 2GQI A; 4RTZ A; 4RTW A; 1UE9 A; 4K11 A; 2DL7 A; 1JU5 C; 3VS2 A; 1H3H A; 2RQR A; 4LNP A; 2FPF A; 2RPN A; 1X2Q A; 3EG3 A; 1TUC A; 2KRM A; 3NMZ C; 3FJ5 A; 2DIL A; 2I0N A; 1H92 A; 4OML A; 2DYB A; 2O31 A; 2DRK A; 2P4R A; 2KRN A; 2K3B A; 4ESR A; 1VYT A; 2RMO A; 2HSP A; 3LH5 A; 1JQQ A; 4J9D A; 3VRY A; 1KIK A; 2LQW A; 4GBQ A; 1WFW A; 5IH2 A; 4JJC A; 2OAW A; 5IHI A; 4AG2 C; 2LJ1 A; 4OMO A; 2YUO A; 1MV0 B; 1GFC A; 2FEI A; 1G2B A; 4AFS C; 4RUG A; 1S1N A; 3TSZ A; 3UAT A; 1SHF A; 1UHF A; 2LJ3 A; 1M3A A; 2L3P A; 3EHQ A; 1X2K A; 1TUD A; 2O2O A; 1ZBJ A; 5FWC A; 2HBW A; 3REA B; 2CRE A; 1WX6 A; 2DF6 A; 3I5S A; 2RF0 A; 2KT1 A; 2AZS A; 4KRT A; 1PHT A; 1KSW A; 4LN2 A; 2W0Z A; 2W10 A; 3RNJ A; 1ABO A; 1GCQ A; 1AWO A; 3JV3 A; 2G6F X; 2DM1 A; 1WIE A; 4RTU A; 4Z89 A; 1WLP B; 1H8K A; 1U3O A; 5ECA A; 2RQW A; 3M0U A; 2X3X D; 1ZUK A; 1WXB A; 4AG1 C; 1E6G A; 2EW3 A; 2CUD A; 3VS7 A; 4CC2 A; 2L3S A; 2JS0 A; 3VS4 A; 4AFU C; 1RUW A; 1X27 A; 2QDL A; 1V1C A; 5I11 A; 1SSH A; 2DL5 A; 2J6F A; 1BB9 A; 1QCF A; 4D8D A; 2KYM A; 4IIO A; 2YT6 A; 2HDA A; 1SEM A; 3QWY A; 1NEB A; 2D1X A; 2LZ6 B; 4OMP A; 1T0J A; 1GFD A; 2BTT A; 5IXF A; 2CH4 A; 2K79 A; 1PKS A; 1OEB A; 3NHN A; 2KRO A; 1GBQ A; 2YUN A; 4EIK A; 1NLP C; 2A37 A; 2RNA A; 1M30 A; 2KGT A; 4F14 A; 1UJ0 A; 1AZE A; 4CC4 B; 1T3L A; 2LMJ A; 1X6G A; 2NUZ A; 4J9I A; 1SRL A; 4A63 B; 2JXB A; 4JZ3 A; 2C0T A; 1AZG B; 2J06 A; 1UTI A; 1UHC A; 2K6D A; 2SRC A; 2YUQ A; 2SEM A; 5I22 A; 4AFZ C; 2RQV A; 5FWB A; 1SRM A; 2EGE A; 2CUB A; 4OMN A; 1NG2 A; 3CQT A; 3H41 A; 4J9F A; 2MIO A; 1AWJ A; 4LUD A; 2JMC A; 1T3S A; 2J6K A; 3ULR B; 1YCS B; 1M8M A; 2J6O A; 4RTY A; 2KEA A; 1GRI A; 2D0N A; 2YUP A; 1SHG A; 2AZV A; 4DEY A; 1SPK A; 1K9A A; 1K0S A; 1I07 A; 1I1J A; 1YWO A; 1W70 A; 4GLM A; 4J9G A; 3PVQ A; 2YDL A; 2VKN A; 1QKW A; 2BZY A; 2EVR A; 2JM8 A; 1UDL A; 1QKX A; 2RQT A; 2HCK A; 2EGC A; 1HSQ A; 4J9H A; 4AFQ C; 2DBM A; 2NWM A; 1GL5 A; 2AKK A; 2FG0 A; 2LCS A; 1X43 A; 1NYG A; 3I9Q A; 1ZX6 A; 2GNC A; 1PRM C; 4HVV A; 2V1Q A; 3VS3 A; 2ED0 A; 5IHK A; 1OV3 A; 2CT3 A; 4IIM A; 3M0T A; 2HEQ A; 1RI9 A; 2JMA A; 1JEG A; 2RN8 A; 2ABL A; 4JJB A; 4J9C A; 1ZUY A; 1RLQ C; 3EG1 A; 4ORZ A; 1Z9Q A; 1PNJ A; 1LCK A; 1UJY A; 1WXT A; 4CC3 A; 2X3W D; 3SHW A; 3UA7 A; 5GJW B; 4Z88 A; 1M3B A; 2ESW A; 2GGR A; 2KXC A; 4F16 A; 2GTO A; 3O5Z A; 1OPK A; 4Y92 A; 2KR3 A; 2IIM A; 4R0K A; 1WXU A; 2ROT A; 2XMF A; 4OMQ A; 1QWF A; 2ECZ A; 1ABQ A; 2A28 A; 1QLY A; 3H0H A; 2DLP A; 1J3T A; 2ED1 A; 3U23 A; 5HCK A; 4RTX A; 2LX7 A; 2MOX A; 2KNB B; 1X69 A; 1OPL A; 2RQU A; 1GCP A; 2KYB A; 1A0N B; 1K1Z A; 1NM7 A; 2GBQ A; 2KBT A; 2EPD A; 1W1F A; 2JM9 A; 2M51 A; 1VA7 A; 1G83 A; 5IHN A; 3GBQ A; 4D8K A; 1MV3 A; 1M27 C; 2PNI A; 5FW9 A; 2EGA A; 2KXD A; 1AEY A; 1WYX A; 2CH4 W; 2AKL A; 2YSQ A; 1I0C A; 2JS2 A; 1ZUU A; 3VS6 A; 3UA6 A; 1EFN A; 1PKT A; 2EKH A; 1CKA A; 2C0I A; 3SEM A; 2DL4 A; 2DRM A; 2DNU A; 2JW4 A; 4JJD A; 1YP5 A; 1UEC A; 1UGV A; 2MCN A; 2ROL A; 2L3Q A; 1KJW A; 4FSS A; 4HCK A; 2M0Y A; 2LNH B; 2VWF A; 3TSW A; 1X6B A; 2FRY A; 2A36 A; 2A08 A; 3H0I A; 4WCI A; 4LUE A; 2EQI A; 2J7I A; 2LJ0 A; 1BU1 A; 1IO6 A; 1AWW A; 3VS0 A; 2D8J A; 4HVW A; 1E6H A; 2OI3 A; 2FRW A; 2H8H A; 2ENM A; 1YWP A; 2DL3 A; 2KE9 A; 5EC7 A; 1VYV A; 2L2P A; 2K2M A; 2CSI A; 2PZ1 A; 1K4U S; 1K0X A; 2EBP A; 1AVZ C; 2EYW A; 2EYY A; 2LP5 A; 1KFZ A; 1OOT A; 3C0C A; 1TG0 A; 2DA9 A; 3M0S A; 2C0O A; 1Y0M A; 2DMO A; 3REB B; 3ZL7 C; 1NEG A; 4HVU A; 3EG0 A; 1WA7 A; 2F2X A; 5L23 A; 2E5K A; 2F2V A; 1T0H A; 2CT4 A; 1BBZ A; 2CSQ A; 4X1V A; 1AD5 A; 1HD3 A; 2CDT A; 1HJD A; 2PTK A; 1K76 A; 3PVL A; 4ZNX A; 1M3C A; 1PWT A; 2K7A A; 3EHR A; 1UUE A; 1GCQ C; 2F2W A; 2GTJ A; 3EGU A; 4LE9 A; 4Z8A A; 4E6R A; 4QT7 A; 1E7O A; 3A98 A; 1JXO A; 4OMM A; 2AK5 A; 3NPF A; 2BZX A; 1FYN A; 2DJQ A; 1XOV A; 1UFF A; 1GBR A; 1QWE A; 1N5Z A; 1CSK A; 2D8H A; 2FPE A; 3VS1 A; 3M0Q A; 1YNZ A; 2EYZ A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3KFV A; 4LDX A; 3PGG A; 4BY6 C; 3BY7 A; 5LJ3 g; 1RLP C; 2G3R A; 4KBM B; 4C92 F; 2K9G A; 1M4Z A; 3CC4 A; 3BDL A; 2EYQ A; 3TQ7 P; 1VYU A; 3A8L B; 2ZPB B; 1Q7Y U; 3JCM J; 2ZPH B; 4C5H A; 4PJN A; 1IHV A; 2ZZD A; 1VQP T; 3CCV Q; 4M7D E; 3CCU T; 3HHT B; 3CCQ T; 1KQS S; 1JXM A; 1BI1 A; 1Q82 R; 3VRZ A; 2DL8 A; 5KYY A; 3GP8 A; 2E3H A; 1M1K C; 2VGM A; 1VIF A; 2K5F A; 3NTI A; 1LNX A; 3EG9 A; 2O9V A; 1QVF A; 4C8Q D; 3R6N A; 4C0G A; 4M75 E; 1KQ1 A; 3M0R A; 4M4Z A; 4QKU A; 4A4F A; 2HD0 A; 2JT4 A; 2QG9 B; 1YJ9 T; 2KT8 A; 1FXX A; 5CKF A; 3NTK A; 3RR6 A; 1BYM A; 4QW2 A; 1U8R A; 1Z9Z A; 2L0A A; 5IT9 E; 3TU4 K; 2FVU A; 3CD6 Q; 3OBW A; 1UE9 A; 5GAM f; 1M90 U; 3VJP A; 1X2Q A; 1M2O A; 3JCM c; 4P5N A; 3OYJ A; 3MEV A; 4OML A; 4IKF A; 2DYB A; 3OYE A; 2O31 A; 2DRK A; 3JB9 I; 4QQG A; 2GCX A; 3QG1 A; 2R57 A; 2RMO A; 4J9D A; 3ME9 A; 3QJ6 A; 5IH2 A; 4AG2 C; 3JCM h; 3OMC A; 4FIB A; 2P4T A; 1G2B A; 4KH1 B; 5A2Q E; 4A4E A; 5C6S A; 3G6E Q; 4C92 G; 2NYS A; 3VV0 A; 3UAT A; 4IUT A; 3M56 A; 2QYZ A; 4J5Y A; 1M3A A; 2L3P A; 1ZSZ B; 5FWC A; 3TCJ A; 2LTO A; 4C8Q E; 2DF6 A; 4CI0 C; 1OI1 A; 2DEQ A; 1EX4 A; 2AZS A; 1AHJ B; 4LN2 A; 1KSW A; 3QO3 A; 4KUL A; 1JJ2 A; 3L1A A; 3JCM Q; 2X4X A; 1WHL A; 4F7U E; 1C1A A; 1ABO A; 3QBY A; 2YLC A; 3OB9 A; 4ANJ A; 2DM1 A; 2QGF B; 3CCE T; 4C92 B; 1IRX A; 1H8K A; 5IN1 A; 3GPL A; 3A5Z B; 4KUI A; 3X24 B; 1VQ9 A; 2CKK A; 1K9M C; 2L3S A; 4AFU C; 4MDX A; 1C0M A; 2QGG A; 2RB6 A; 4UC4 A; 4AMC A; 4X34 A; 5I11 A; 3CME A; 1SSH A; 4FU6 A; 3JCM b; 1QCF A; 4M75 C; 3LW5 E; 3CCV T; 3LH0 A; 2LCC A; 3E9G A; 2LZ6 B; 1SG5 A; 4HT9 A; 3JSC A; 2DZC A; 3NHN A; 1IGQ A; 1PKS A; 1GBQ A; 1NLP C; 2RNA A; 3CME T; 2KGT A; 4CC4 B; 4F04 B; 2NUZ A; 5IAY A; 3T9N A; 4OGE A; 1FX7 A; 3OYD A; 1BKB A; 2YUQ A; 2SEM A; 5I22 A; 5FU6 B; 4AFZ C; 2RQV A; 5FWB A; 1SRM A; 4OMN A; 3QII A; 4CRI A; 3OMG A; 4J9F A; 1Y07 A; 1Q86 U; 3CD6 T; 2J6K A; 1VOM A; 1M8M A; 1K73 U; 1NJI U; 2HSE B; 2DVE A; 4EPC A; 1ZSZ A; 4YTL A; 5A0D A; 3UPU A; 1WQ7 A; 3VU3 C; 1VQ6 Q; 1YIT A; 4XTW A; 4EMG A; 4DBR A; 4MMK A; 2PVG B; 1Q7Y R; 2VUB A; 3PVQ A; 2VKN A; 2WSE E; 1Q82 C; 3VKI A; 1QKX A; 2CYZ B; 3KUF A; 3QUI A; 4C92 A; 4AFQ C; 2NWM A; 1JBM A; 2FG0 A; 4C8Q C; 2JZ2 A; 2LCS A; 1F1B B; 1GL5 A; 1X43 A; 1MHN A; 4C0D B; 1NYG A; 2RHZ A; 2PVD B; 2GNC A; 1PD1 A; 3HRS A; 4EMH A; 2OTJ Q; 3G6E T; 2V1Q A; 2ZPE B; 2IPO B; 3VS3 A; 5LJ3 f; 2FYK A; 2QEX Q; 2HEQ A; 3CC7 Q; 3HFN A; 4ATO A; 1EIF A; 1UB4 A; 4CC3 A; 3RER A; 3VYH B; 5GJW B; 4Z88 A; 4GLK A; 3EFR A; 4F16 A; 1XTD A; 3O5Z A; 4KGV B; 5I21 A; 2LVM A; 1I81 A; 1RAB B; 4FW2 A; 4HCZ A; 4B9X A; 3VUZ A; 2IIM A; 4R0K A; 1WXU A; 3MP1 A; 4O5V A; 1M90 R; 2ZPI B; 2B8A A; 3HP9 A; 1JJ2 P; 2ROT A; 3G71 Q; 1ABQ A; 4OF1 A; 3HRU A; 2RJC A; 3AT1 B; 1J3T A; 2ED1 A; 1YCY A; 4M78 D; 4RTX A; 4AT1 B; 1BCM A; 1MND A; 2E1H A; 4DOV A; 6AT1 B; 1YHQ Q; 4DBH A; 5CKB A; 2VGN A; 2P0Q A; 3MPU B; 3A8O B; 3OBY A; 1N9R A; 5CR2 A; 2RHX A; 1A0N B; 1U1T A; 1IB8 A; 3PIP A; 3HFO A; 2EPD A; 1BI2 A; 2IVW A; 2DD4 A; 2M51 A; 3X26 B; 4M77 E; 5GAO n; 1UGP B; 1G83 A; 2M1H A; 3JCM g; 4D8K A; 4PJL A; 1WHK A; 1YI2 Q; 4PJO F; 2KXD A; 1S72 A; 2EQM A; 1YJW A; 2AKL A; 3GF5 A; 4BUG A; 5GAN 8; 5D6Y A; 3FLG A; 3RDV A; 4JLI A; 2DK3 A; 4IUU A; 1KQS P; 3HPW A; 3PNW C; 1VUB A; 4DBF A; 3SEM A; 3JB9 J; 2JW4 A; 4JJD A; 2LQK A; 2QDY B; 4FT2 A; 3ZEH A; 1WJS A; 2MCN A; 4M7A D; 4FYW B; 2ZCF B; 4QVC A; 2L3Q A; 5LJ3 h; 5GAM e; 3ASK A; 1WPY A; 4HCK A; 4FW1 A; 2M0Y A; 4N0A A; 4OB0 B; 4A53 A; 2LNH B; 2A7Y A; 3S3O A; 2A08 A; 3H0I A; 2EQI A; 3OSS C; 3MEW A; 1QP2 A; 2DKG A; 1VQ6 T; 3QHS A; 1E6H A; 4R55 A; 2OI3 A; 2M0O A; 2EJG A; 1NPR A; 2KE9 A; 5EC7 A; 2CSI A; 3QJY A; 4M78 E; 3CCS Q; 2EBP A; 4QVD A; 3BDU A; 1KFZ A; 4X9C A; 4LD6 A; 1TG0 A; 2DA9 A; 3M0S A; 3REB B; 4HA8 A; 5GAN j; 5GAM g; 3CCR A; 1NEG A; 8ATC B; 2F2X A; 3TEE A; 3OS0 A; 4PL6 A; 3RKX A; 5LJ5 j; 2OTJ T; 1M2V B; 4LXC A; 5KYU B; 1VQL Q; 3MCA B; 2K2V A; 4PLI A; 2PTK A; 1VQ4 Q; 2HKQ B; 2QEX T; 2R58 A; 1M3C A; 3V8L A; 3M4G A; 4PFZ A; 2L3R A; 2E5Q A; 2COW A; 2GTJ A; 4E6R A; 1OUL A; 2DXT A; 2EAY A; 4HKE A; 1NBE B; 3CPF A; 4KT0 E; 1GBR A; 2V26 A; 1OYX A; 1K73 R; 4PK4 A; 2DZ9 A; 1VQO A; 3JAM E; 1YNZ A; 4M7A E; 2KSS A; 2X4Y A; 3G71 T; 4RTV A; 3FJP A; 2ZAE A; 3CCJ A; 1Q7Y C; 1X6O A; 4FSX A; 2XI9 A; 1B07 A; 1QCN A; 1UG1 A; 1WJR A; 5EG2 A; 1VQP Q; 1QVF S; 2CP5 A; 1AOJ A; 2V1R A; 2L8D A; 2DIG A; 2KVQ G; 2JJ9 A; 2BE9 B; 3M0P A; 2JTE A; 2LT1 A; 2LQN A; 2FB7 A; 2COZ A; 2JOY A; 2KRS A; 4PJO B; 1MMA A; 3EG2 A; 3NGP A; 4J9B A; 1AWX A; 1WI7 A; 1VQO T; 2YXY A; 5DM7 R; 4E2F B; 4C0F A; 2MI6 A; 4HXJ A; 2BZ8 A; 3CC4 Q; 5KYW B; 3I55 A; 1BI0 A; 2BUD A; 2YHT A; 2E12 A; 2O4X B; 1WDX A; 2QA4 A; 2MWO A; 3JCM d; 2DE0 X; 2DBK A; 4ELY C; 4BY6 B; 1TOV A; 3VYG A; 2HZY A; 4NL3 A; 4JZ4 A; 3OYH A; 3RMS A; 3OYI A; 4N4H A; 1M90 C; 3LYI A; 1SSF A; 2FZK B; 2DX1 A; 2P84 A; 4EMK C; 1K8A U; 1M2V A; 4FYX B; 3BFM A; 4M78 C; 5KYU A; 2QAS A; 4FYV B; 2RQR A; 4M7D D; 4LNP A; 2RPN A; 3QKJ A; 3EG3 A; 1TUC A; 3FJ5 A; 1YJN A; 4M75 F; 2I0N A; 4ZGJ B; 3F70 A; 2P4R A; 1JQQ A; 1KIK A; 4GBQ A; 5IHI A; 4BE2 A; 3CCS T; 3M57 A; 1WQW A; 2HQE A; 3DLM A; 2YUO A; 3QXE B; 2XID A; 2AT1 B; 4AFS C; 4RUG A; 1TTH B; 4D6W A; 2CS7 A; 5GAM d; 2O2O A; 1R0B G; 4L6V 5; 1VQ4 T; 1I8F A; 1G8X A; 3M53 A; 4M7A C; 4PJJ A; 4PJO A; 1TU0 B; 1X01 A; 4HCB A; 2W0Z A; 2KY9 A; 1VQM A; 1GCQ A; 4FYY B; 1Y96 B; 2G6F X; 1WIE A; 5KYW A; 3FIF A; 3M0U A; 2X3X D; 1Y7X A; 1ZUK A; 2O4X A; 1OU9 A; 4AG1 C; 2EJ9 A; 4CC2 A; 1X27 A; 1JRI A; 2PVO B; 2QDL A; 1LPL A; 1D0Y A; 4Y91 A; 4C8Q F; 5CKD A; 1OU8 A; 2KYM A; 1VQ9 Q; 1FWZ A; 2DFU A; 2P0P A; 2BKD N; 1VQN A; 3GOX A; 2RHU A; 1NEB A; 2RH2 A; 3JCM X; 3OS1 A; 1WZO A; 3I56 A; 1T0J A; 3E9F A; 5DLQ E; 5I2S A; 3CME Q; 4J6X A; 5IXF A; 3CC4 T; 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