The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
7
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sequence length |
73
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structure length |
73
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Chain Sequence |
SMDSRTKSKDYCKVIFPYEAQNDDELTIKEGDIVTLINKDCIDVGWWEGELNGRRGVFPDNFVKLLPPDFEKE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Signaling protein
|
| source organism |
Homo sapiens
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| publication title |
Solution structure of the Sh3-C domain of Cin85
rcsb |
| molecule keywords |
SH3 domain-containing kinase-binding protein 1
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| total genus |
7
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| structure length |
73
|
| sequence length |
73
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2008-10-10 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF14604 | SH3_9 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4AFZ C; 3QWX X; 1HJD A; 2EYX A; 1AWO A; 2LP5 A; 1WA7 A; 1Y57 A; 2O9S A; 3C0C A; 1VYV A; 2CSI A; 3PVQ A; 2EKH A; 2O9V A; 3KFV A; 1PRL C; 4DEY A; 2PZ1 A; 5FWB A; 1E6G A; 2DRK A; 1UDL A; 1UE9 A; 2DIL A; 1YP5 A; 2FO0 A; 2AKK A; 2LCS A; 3VS6 A; 2J6F A; 2DF6 A; 3H0F A; 3R6N A; 4HVW A; 1GBR A; 1MV3 A; 2EPD A; 1UHC A; 1X2Q A; 3REB B; 1QWF A; 4OMN A; 1M3A A; 1AEY A; 3VRY A; 2LQN A; 2GQI A; 2RF0 A; 2KRS A; 1WXU A; 2OJ2 A; 2D8J A; 4F14 A; 1X6B A; 3M0S A; 1CSK A; 1LCK A; 4LUE A; 2B86 A; 2PTK A; 4LUD A; 2VWF A; 2EVR A; 4RTV A; 1K1Z A; 1T0H A; 1B3Q A; 2DL5 A; 1RUW A; 4DEX A; 4A63 B; 2C0I A; 2O88 A; 1QKW A; 4HCK A; 3VS1 A; 1NM7 A; 4D8K A; 1NYG A; 4JJB A; 1TUD A; 1OOT A; 1AOJ A; 1TG0 A; 3VS3 A; 2KNB B; 2KXC A; 2D0N A; 2RQR A; 1TUC A; 1SRL A; 3IQL A; 2K3B A; 2EQI A; 1NG2 A; 2J05 A; 1Z9Z A; 2D8H A; 2LNH B; 1N5Z A; 1E6H A; 1PRM C; 2G6F X; 2YSQ A; 1T3S A; 2ABL A; 2DL4 A; 1W6X A; 2J06 A; 2DL3 A; 3M0T A; 1JQQ A; 2FRW A; 4AG1 C; 2EGE A; 2HDA A; 2K2M A; 1MV0 B; 3M0R A; 4Z8A A; 4AG2 C; 2OAW A; 2EGC A; 1VYT A; 1ZSG A; 3PVL A; 3UF4 A; 2L3S A; 4J9B A; 3FJ5 A; 2BZ8 A; 1ABQ A; 2KGT A; 1X2K A; 4JJC A; 3UA7 A; 2J7I A; 5FWC A; 2A08 A; 2X3X D; 3EHR A; 4ORZ A; 1U5S A; 4E6R A; 1Y0M A; 4OMQ A; 4Z89 A; 2AK5 A; 1PNJ A; 4J9E A; 5IHK A; 3SHW A; 2CUB A; 1AWW A; 2JW4 A; 4CC7 A; 4IIM A; 5IH2 A; 4Z88 A; 1OPK A; 1NEB A; 2P4R A; 2JS2 A; 4AFS C; 1UTI A; 2ECZ A; 1NYF A; 1AD5 A; 1WYX A; 1MUZ A; 5HCK A; 1NEG A; 2HCK A; 4M4Z A; 2DRM A; 1GFD A; 2JMA A; 1QLY A; 3EG0 A; 2FG0 A; 1GFC A; 4JZ4 A; 1A0N B; 1WXT A; 5I22 A; 2QDL A; 1UUE A; 2LZ6 B; 4AFQ C; 1AVZ C; 1SRM A; 3EHQ A; 3LH5 A; 1WI7 A; 1ZUK A; 4J9I A; 2JTE A; 5ECA A; 2H8H A; 3NMZ C; 3I35 A; 3TVT A; 1UJ0 A; 2CH4 A; 2DBM A; 3M0U A; 1GCQ C; 2JM9 A; 1GCP A; 1CKA A; 1ZBJ A; 2A37 A; 2BTT A; 3I5S A; 2L2P A; 2OI3 A; 4LN2 A; 1YN8 A; 1JXM A; 4F17 A; 4J9C A; 4J9F A; 1ARK A; 2L3P A; 1M3B A; 2KXD A; 1E7O A; 2EYW A; 2JM8 A; 4RTZ A; 2VKN A; 1SEM A; 2YUP A; 1CKB A; 2AZV A; 2XMF A; 5IHI A; 2RN8 A; 1RLQ C; 1ABO A; 4J9D A; 2KYM A; 2NWM A; 1HD3 A; 1PKT A; 2ROL A; 4RTX A; 1M27 C; 1OEB A; 2DBK A; 4RTU A; 4RTY A; 1BBZ A; 2FPD A; 4CC3 A; 4ZNX A; 4OMM A; 1WX6 A; 1YCS B; 2CUD A; 1GBQ A; 3TSZ A; 4F16 A; 2LJ0 A; 1BB9 A; 1KJW A; 1XOV A; 2EYZ A; 2F2X A; 2DA9 A; 2EBP A; 1K9A A; 1ZUY A; 2JT4 A; 1SPK A; 4GBQ A; 1H92 A; 2KRN A; 1WLP B; 2HSP A; 4QT7 A; 1BU1 A; 1QCF A; 3NPF A; 2ED1 A; 2X3W D; 2AKL A; 2EYY A; 2BZX A; 3ZL7 C; 2O2O A; 2SEM A; 3ULR B; 2YDL A; 1AWX A; 3PE0 A; 2JXB A; 2K9G A; 1YWP A; 4HVV A; 3RNJ A; 2DL8 A; 3EG2 A; 1H8K A; 4R0K A; 1ZX6 A; 3H41 A; 1RLP C; 2CDT A; 3VS0 A; 2MCN A; 3THK A; 2RNA A; 1X27 A; 2VVK A; 5FW9 A; 2PNI A; 2LX7 A; 1YWO A; 2ESW A; 2YUO A; 5GJV B; 1UGV A; 1PWT A; 2BZY A; 1K0X A; 1UEC A; 3VRZ A; 2CT3 A; 1GRI A; 4K11 A; 3EGU A; 2AZS A; 2ED0 A; 2DYB A; 4LNP A; 1NLP C; 4AFU C; 1UHF A; 2F2W A; 1X6G A; 3A98 A; 1G2B A; 1IO6 A; 2KT1 A; 3TSW A; 4JPB W; 1QWE A; 2D1X A; 1OV3 A; 3UA6 A; 4EIK A; 4LE9 A; 4CC4 B; 1NLO C; 1J3T A; 2KRO A; 2V1R A; 2K6D A; 2KEA A; 4J9H A; 2CRE A; 1W70 A; 5I11 A; 2FPE A; 1JXO A; 2KYB A; 1WXB A; 4RTT A; 1YNZ A; 2NUZ A; 1K0S A; 1S1N A; 2DX1 A; 2YUQ A; 1PKS A; 1EFN A; 2HEQ A; 1B07 A; 2A36 A; 1VA7 A; 3I5R A; 4Y92 A; 2DNU A; 4RUG A; 2HBW A; 3QWY A; 1OPL A; 2W0Z A; 2SRC A; 4FSS A; 1AZG B; 1X69 A; 2K7A A; 2ENM A; 1M30 A; 3U23 A; 3RBB B; 4HXJ A; 3NHN A; 1PHT A; 1WFW A; 2GNC A; 2W10 A; 1JO8 A; 4IIO A; 3VS5 A; 2KT8 A; 2EW3 A; 3M0Q A; 2C0T A; 2GBQ A; 1KIK A; 2DMO A; 1WDX A; 2E5K A; 1FMK A; 3CQT A; 3H0I A; 1T3L A; 2LMJ A; 1V1C A; 1K76 A; 2RQT A; 1FYN A; 3M0P A; 2RMO A; 4CC2 A; 4ESR A; 5IXB A; 1M8M A; 2J6K A; 2EGA A; 4J9G A; 3NGP A; 2DM1 A; 2A28 A; 2GGR A; 2L3Q A; 2RQU A; 1UJY A; 2LQW A; 4OMP A; 1KSW A; 4OML A; 1I0C A; 3VS2 A; 2MOX A; 2DE0 X; 2CT4 A; 1M3C A; 3JV3 A; 1I1J A; 1ZUU A; 2I0N A; 2RQV A; 1HSQ A; 2FPF A; 2DVJ A; 1WIE A; 2KRM A; 2RPN A; 2MIO A; 1K4U S; 4JZ3 A; 2LJ1 A; 3UAT A; 3EG3 A; 4RTW A; 2CSQ A; 2GTO A; 4D8D A; 2FRY A; 3VS4 A; 2F2V A; 3SEM A; 1AWJ A; 2K79 A; 3H0H A; 1G83 A; 2L0A A; 1AZE A; 1U06 A; 2KE9 A; 1SSH A; 1SHF A; 4JJD A; 1SHG A; 3O5Z A; 1W1F A; 2V1Q A; 1GL5 A; 2FEI A; 2M0Y A; 2O31 A; 3GBQ A; 1VYU A; 3EG1 A; 3VS7 A; 3I9Q A; 2J6O A; 1U3O A; 1QKX A; 2ROT A; 1BK2 A; 2IIM A; 5IHN A; 2CH4 W; 5GJW B; 1RI9 A; 2JS0 A; 2KBT A; 1UFF A; 2JMC A; 1GCQ A; 2KR3 A; 5IXF A; 2DL7 A; 2M51 A; 1KFZ A; 5EC7 A; 2GTJ A; 4WCI A; 2YUN A; 2RQW A; 2YT6 A; 1X43 A; 1Z9Q A; 4X1V A; 2C0O A; 2LJ3 A; 4OMO A; 2DLP A; 1JEG A; 1H3H A; 1UG1 A; 4KRT A; 2DJQ A; 1JU5 C; 1ZLM A; 3REA B; 4HVU A; 1I07 A; 4GLM A; 1T0J A; 5L23 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2EQM A; 2EYX A; 3JB9 H; 1JJ2 P; 2LP5 A; 4PJO G; 4ZGJ B; 1R77 A; 2O9S A; 3GIB A; 1VQP Q; 4XAX B; 4BE1 A; 2EKH A; 4C92 E; 1XJW B; 2GFU A; 5CCA A; 3WXM B; 2MI6 A; 2H3J A; 5KYU A; 1VQ6 A; 2JZ2 A; 1V76 A; 1YP5 A; 5GAO l; 3R6N A; 4M77 G; 1GBR A; 4ATO A; 4ZN1 A; 4OMN A; 5FU6 B; 4M7D G; 1QMC A; 2LQN A; 2RHU A; 2RF0 A; 4M78 D; 1LNX A; 4IUP A; 1YI2 A; 3FRN A; 4FCY A; 4LD9 K; 4FW2 A; 2GF7 A; 4RCC A; 2X4Y A; 2EJ9 A; 8ATC B; 5LJ5 h; 1VQ4 Q; 4ZTJ A; 2QQS A; 1KD1 R; 2E1H A; 3C4S A; 1RUW A; 1YFN A; 1IGQ A; 4R55 A; 1VQ8 A; 1NM7 A; 2A3L A; 4D8K A; 2CZ6 B; 4JJB A; 1TUD A; 1OOT A; 1AOJ A; 1W2B S; 3VS3 A; 1QVG A; 4P5N A; 3URG A; 4DQ2 A; 3IQL A; 4PJO D; 3CCQ T; 2LQ8 A; 1Z9Z A; 2DD5 A; 2ZAE A; 3HPW A; 4N4H A; 3MEU A; 2VXE A; 5GAN 7; 2X35 A; 5GMK h; 2G6F X; 3OS5 A; 3MHX A; 4L6V 5; 1JQQ A; 1Q82 C; 1RL2 A; 2FRW A; 2HNI A; 4M75 D; 3Q1J A; 2CP3 A; 4C8Q B; 4M77 D; 3I56 T; 1VQL Q; 2OAW A; 3M53 A; 4KGV B; 1VQ5 T; 4M7D D; 3RKW A; 3JCM W; 4JLG A; 3L2R A; 3EHR A; 3CD6 A; 3G4S Q; 3OYN A; 1Y0M A; 3NFC A; 2JJ9 A; 3N5B B; 3CXC S; 1MGQ A; 2AK5 A; 4JRI A; 4J9E A; 1VQ6 T; 1VQO Q; 3FC3 A; 3A8M B; 4XK8 E; 3OYC A; 4Z88 A; 4C0F A; 1NEB A; 2MYS A; 2Y4X A; 4AFS C; 2ECZ A; 2HCK A; 4QW2 A; 1GFD A; 1U1T A; 3EG0 A; 4JZ4 A; 3A8O B; 3BDL A; 1U1S A; 1VQ9 Q; 4BI8 B; 2AIR B; 1PD1 A; 2LNV A; 2M0O A; 2QDL A; 1UUE A; 4KH1 B; 3EFS A; 3RMS A; 4DBQ A; 2JTF A; 1WI7 A; 2RHI A; 1VIE A; 3X20 B; 2EYQ A; 1KHI A; 4E7Z A; 1ZUK A; 3JCM e; 1UJ0 A; 4JS5 A; 2HQH A; 4XQ3 A; 2LRQ A; 1CKA A; 1JJ2 A; 2A37 A; 4NL2 A; 4MMK A; 3I5S A; 3BFM A; 4B9X A; 2L2P A; 5IN1 A; 4LN2 A; 2RB6 A; 4C92 F; 4HT9 A; 1Y96 A; 2EYW A; 1QCO A; 4MML A; 1FWZ A; 2YRC A; 5IHI A; 2AZV A; 3LGL A; 2AT1 B; 2RN8 A; 1RLQ C; 4DOV A; 5A0L A; 5D6W A; 2E4H A; 2M9U A; 2KYM A; 2HSE B; 2NWM A; 2K5L A; 1MMD A; 1M27 C; 4ELZ C; 1OEB A; 2PU9 B; 3CPW A; 4BDY A; 3JB9 J; 1R8O B; 3MJX A; 1WX6 A; 3TSZ A; 2MPX C; 1NE8 A; 2LJ0 A; 5FLX E; 1BYM A; 3KUF A; 2DD4 A; 3OSS C; 2DA9 A; 4KUL A; 1WHL A; 1B34 A; 4MZM A; 3JB9 F; 1H92 A; 5LJ5 f; 2KRN A; 2EQU A; 4OB0 B; 2K4Y A; 3CBM A; 3CD6 T; 2HZY A; 3SWN C; 2PUK B; 4XTU A; 2DXB A; 4JUV A; 4L59 A; 3LW5 E; 2BZX A; 4E7S A; 4DBF A; 1YIT A; 3EGX A; 1NBE B; 1TTH B; 2QA4 A; 2RM4 A; 3OSV A; 3LX7 A; 1G8X A; 4JRK A; 2MF2 A; 4C5I A; 3PMI A; 5KE2 A; 3SD4 A; 4M78 C; 2DL8 A; 1O75 A; 4R0K A; 5M9O A; 3CBO A; 3H41 A; 1K8A U; 2CP0 A; 3VS0 A; 2OTJ T; 2XDD A; 2JN0 A; 4PJL A; 2PNI A; 1VQK Q; 3FEO A; 2LTO A; 3JB9 I; 4Y91 A; 5GJV B; 2EJF A; 2HD0 A; 1M2V A; 4KUD K; 1GRI A; 4K11 A; 3FLG A; 3CCU T; 3M4Y A; 1W2B P; 2L5Q A; 3TQ7 P; 4PJO C; 2DXT A; 4LNP A; 4AFU C; 3CCL Q; 1X6G A; 5J39 A; 1G2B A; 4A54 A; 2DEQ A; 5DLQ E; 1QVG S; 2F69 A; 1QWE A; 1KD1 C; 1NLO C; 1OUL A; 1J3T A; 2V1R A; 2CRE A; 5I11 A; 2KYB A; 1WXB A; 4RTT A; 1YNZ A; 2NUZ A; 4EMK B; 3INZ A; 2EAY A; 1K0S A; 4M77 C; 1S1N A; 3A5Z B; 1VA7 A; 4Y92 A; 2ZPH B; 4M7D C; 4J6Y A; 2GFA A; 5KYN A; 2SRC A; 1AZG B; 1M30 A; 3MO8 A; 4L5G A; 4M78 E; 3VJP A; 3KXT A; 2IVW A; 3A1P A; 4M7A G; 3VS5 A; 5HK3 A; 4D6W A; 3CXC P; 2QEX A; 1VQM A; 2L89 A; 4PFZ A; 3QJY A; 1WDX A; 2E5K A; 1FMK A; 1WQ7 A; 3OYK A; 2HL3 A; 2G3R A; 1YIT T; 3EH2 A; 3JCM g; 4DBR A; 1RAE B; 4CC2 A; 2J6K A; 4GLK A; 3OYE A; 4J7I A; 2DM1 A; 3VKI A; 1RAG B; 2A28 A; 2ZPF B; 1ZA2 B; 1ZA1 B; 2DTO A; 3S3N A; 3C94 A; 4PJO E; 1I0C A; 3CC7 T; 2MOX A; 2PVD B; 3CEY A; 3QYH B; 1PSE A; 1TUG B; 5GAN e; 4NS5 A; 2CGH A; 2QGF B; 2RHY A; 1C1A A; 1Q95 G; 4Y28 E; 2FPF A; 1S72 A; 2RPN A; 3JCM d; 4LDU A; 1D0X A; 4J8O A; 1VQP A; 4M77 E; 3JCM Q; 3EGD B; 5CKD A; 1JJ2 S; 5CQX A; 2F2V A; 4A4K A; 2PVG B; 4M7D E; 3DB4 A; 1K8A C; 2JUF A; 3SB2 A; 2KE9 A; 1SHF A; 4J6W A; 4JJD A; 1LJO A; 3EFO B; 4F04 B; 1GL5 A; 1M9S A; 5LJ3 h; 4PFP A; 3X28 B; 3VS7 A; 3OY9 A; 1U3O A; 2MMP A; 1UGP B; 2IIM A; 5GJW B; 3CPW S; 1N6A A; 1UFF A; 5C6S A; 1D0Z A; 1GCQ A; 1X75 C; 2ZPE B; 1TWB A; 2M51 A; 2YUN A; 3JCM J; 3OBW A; 2DTI A; 5GAO q; 1VQ4 A; 4BUG A; 1Z9Q A; 2LT1 A; 5KYY B; 2QEX T; 1VQM T; 2LJ3 A; 2DLP A; 1JEG A; 1UG1 A; 5KYW B; 4KRT A; 4LDV A; 4DOW A; 1JU5 C; 2X4J A; 4C8Q G; 3V7C A; 1N8R U; 3OS1 A; 3G7Z A; 3QWX X; 3RER A; 1HJD A; 1AWO A; 1WA7 A; 1Q86 R; 4X9D A; 3PVQ A; 3V7R A; 5DLO A; 2RJE A; 2D9T A; 2O9V A; 1WHG A; 4XU3 A; 2PZ1 A; 2XDP A; 1VIF A; 1TU0 B; 1WQW A; 1E6G A; 2DRK A; 3I55 Q; 3CMA Q; 4HCC A; 1QVP A; 1G3Y A; 1KQ1 A; 1UE9 A; 4QVC A; 2FO0 A; 4FU6 A; 2AKK A; 2LCS A; 2J6F A; 2DF6 A; 3H0F A; 1W4S A; 1S72 T; 1VQL A; 1VUB A; 2JNG A; 2QK0 A; 1AEY A; 2FHD A; 5IAY A; 1Y71 A; 3V8L A; 1G5V A; 3G4S A; 2XID A; 4C92 A; 3OB9 A; 1SF9 A; 2OJ2 A; 3RKX A; 2D8J A; 1M8V A; 4F14 A; 3H6Z A; 3M0S A; 1QVG P; 1LCK A; 4LUE A; 4O5V A; 2JVV A; 2B86 A; 2PTK A; 3OMG A; 1BI2 A; 4LUD A; 5FRM A; 2VWF A; 4TVR A; 1VQO A; 3OYD A; 4RTV A; 1M90 R; 1M1K R; 3G71 Q; 2O88 A; 5FRN A; 1RAB B; 4C8Q D; 1TG0 A; 2FZK B; 4FYV B; 5CAI A; 4Z02 A; 3V8K A; 1OQK A; 2EQI A; 1VQ9 A; 3A8G B; 1BIA A; 2NUP A; 2QDY B; 4LDY A; 4QVZ A; 1VQ4 T; 2O4X A; 2DVE A; 2J06 A; 2DL3 A; 3NTK A; 5GAN g; 1JBM A; 1XQH A; 2EGE A; 2HDA A; 5GMK l; 3NTI A; 4M75 F; 1ACM B; 4AG2 C; 2E70 A; 5C0M A; 3V7S A; 1Q86 U; 1VYT A; 4QQ6 A; 2L3S A; 4J9B A; 3FJ5 A; 4F7U F; 1YJN Q; 2O4X B; 1X2K A; 3UA7 A; 4LDX A; 1H3Z A; 2VC8 A; 5FWC A; 2X3X D; 4ORZ A; 4E6R A; 4WTO B; 4M7A B; 4IUV A; 1PNJ A; 4OB2 B; 2HL5 C; 2FYK A; 5IHK A; 1YHQ Q; 1AWW A; 1KHC A; 2JW4 A; 1PM3 A; 5GAN d; 3EG9 A; 5IH2 A; 2A7Y A; 4EMH A; 5LJ5 e; 4PJM A; 1VQL T; 2JS2 A; 4XTW A; 1NJI R; 1WYX A; 1MUZ A; 1YJW Q; 1WHK A; 2XI9 A; 1ZSZ C; 4MZP A; 5GAN f; 1GFC A; 3G4S T; 1A0N B; 2DIQ A; 5GAN 8; 2V8J A; 1WNL A; 4M7A C; 2JTM A; 1Y7X A; 1AVZ C; 1SRM A; 1M90 U; 1M1K U; 1JRI A; 3LH5 A; 1VQO T; 1N9S A; 2Y4Y A; 4B6M A; 3MP8 A; 5ECA A; 2JTE A; 2H8H A; 5GMK e; 5GAM h; 1MMA A; 2JM9 A; 2VGM A; 1RAD B; 3CPW P; 3UDC A; 1YN8 A; 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