The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
3
|
sequence length |
72
|
structure length |
72
|
Chain Sequence |
MVSRDQAHLGPKYVGLWDFKSRTDEELSFRAGDVFHVARKEEQWWWATLLDEAGGAVAQGYVPHNYLAERET
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
The solution structure of SH3 domain of PTK6
rcsb |
| molecule keywords |
Tyrosine-protein kinase 6
|
| molecule tags |
Transferase
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
3
|
| structure length |
72
|
| sequence length |
72
|
| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 2009-03-18 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 5IH2 A; 4AG1 C; 1M3A A; 2K79 A; 5FWC A; 2ECZ A; 1M27 C; 1QWF A; 2EBP A; 4Z8A A; 2DA9 A; 4DEX A; 3M0U A; 2KGT A; 1AVZ C; 1UEC A; 3EGU A; 4Z89 A; 2DL3 A; 2KRM A; 1T3L A; 1GFD A; 1ZUU A; 3M0P A; 1X6B A; 2KT1 A; 1TUD A; 2SEM A; 4JJB A; 2MCN A; 2A37 A; 2K2M A; 1UJ0 A; 3NPF A; 3EG0 A; 4RTT A; 4JZ3 A; 2RPN A; 2J6F A; 1UTI A; 3O5Z A; 2W0Z A; 1E7O A; 3FJ5 A; 2O2O A; 3NHN A; 1J3T A; 1K76 A; 4A63 B; 4RTY A; 1V1C A; 1SHF A; 1GL5 A; 2V1R A; 1HSQ A; 2BTT A; 1OOT A; 2VWF A; 4JZ4 A; 2YUO A; 2L0A A; 2W10 A; 2JTE A; 1YP5 A; 2CH4 W; 2ROT A; 1Z9Q A; 4KRT A; 2FRW A; 2DX1 A; 1Y57 A; 2M51 A; 4AG2 C; 1NEB A; 1B3Q A; 3UA7 A; 4RTX A; 4JPB W; 2AK5 A; 1ARK A; 4RTW A; 1ZX6 A; 4GLM A; 2HEQ A; 2OI3 A; 5IHK A; 4OMM A; 4R0K A; 3H41 A; 1ZLM A; 2SRC A; 1UFF A; 2O9V A; 2D1X A; 3EG2 A; 2FPE A; 2KRS A; 4OMN A; 2RN8 A; 1QLY A; 2KYB A; 4CC3 A; 1WFW A; 1X2K A; 1WDX A; 2HBW A; 1BU1 A; 2K3B A; 2RQR A; 4HXJ A; 4D8K A; 2KRO A; 5I11 A; 4AFU C; 1GBQ A; 1PNJ A; 2JM8 A; 2KNB B; 3KFV A; 3ZL7 C; 4D8D A; 4JJD A; 2CT4 A; 3VS4 A; 4CC2 A; 1AWJ A; 2CH4 A; 1YWO A; 2ESW A; 4HVW A; 4J9F A; 2DJQ A; 2DNU A; 2YT6 A; 1I07 A; 2M0Y A; 1AZE A; 2KE9 A; 3M0Q A; 2FRY A; 2RQU A; 2CRE A; 3VS6 A; 1TUC A; 1SSH A; 2HSP A; 1BB9 A; 3VS2 A; 3RNJ A; 1WX6 A; 2YUQ A; 1UHF A; 1X27 A; 2VVK A; 4J9D A; 1QKX A; 2AZV A; 2E5K A; 5HCK A; 1OPL A; 1UHC A; 1W6X A; 2ENM A; 5I22 A; 4OMP A; 2JS0 A; 2GBQ A; 1KFZ A; 2ABL A; 2FO0 A; 2JMA A; 1BK2 A; 1YN8 A; 3SEM A; 4IIM A; 3CQT A; 2HDA A; 2CUB A; 2JS2 A; 3LH5 A; 2EQI A; 3I9Q A; 2DIL A; 2JMC A; 3VS0 A; 2I0N A; 3VS5 A; 4J9G A; 1W70 A; 2DBM A; 2J7I A; 1PRM C; 2FEI A; 1TG0 A; 1WLP B; 2ROL A; 4J9E A; 1CKB A; 2LQN A; 4F16 A; 3UA6 A; 3THK A; 1K1Z A; 2JXB A; 3I5S A; 1N5Z A; 4JJC A; 1H92 A; 1YCS B; 2PTK A; 2AZS A; 1YWP A; 2FPF A; 4AFQ C; 1PKS A; 2CDT A; 2X3X D; 2MOX A; 2LNH B; 2J6O A; 2LX7 A; 1M8M A; 1FYN A; 2F2V A; 1K4U S; 2EGA A; 2DE0 X; 1KSW A; 4J9H A; 1E6G A; 4ESR A; 2L3P A; 2CUD A; 1VA7 A; 2EW3 A; 1UUE A; 1UGV A; 2LP5 A; 2EYW A; 4RTV A; 1M3C A; 1AZG B; 3U23 A; 3ULR B; 3EG3 A; 2V1Q A; 1KIK A; 1AD5 A; 1Y0M A; 4K11 A; 1E6H A; 5IHI A; 3VRY A; 4LN2 A; 1NLP C; 1QCF A; 5EC7 A; 3TSW A; 3H0F A; 2H8H A; 1OV3 A; 1X43 A; 3I35 A; 1MUZ A; 4IIO A; 1AWO A; 4E6R A; 2P4R A; 2PZ1 A; 2OAW A; 1WYX A; 1RI9 A; 1WA7 A; 2K9G A; 1HJD A; 1K0S A; 2CSI A; 2KRN A; 1GBR A; 1NLO C; 2KEA A; 2FPD A; 2RQT A; 1WIE A; 2EPD A; 1PHT A; 4EIK A; 1YNZ A; 1SEM A; 2XMF A; 3NGP A; 3EHQ A; 5GJW B; 1BBZ A; 1QKW A; 2DL5 A; 3VS3 A; 1AWW A; 1UJY A; 1UG1 A; 2LJ3 A; 1UDL A; 2ED0 A; 1RLQ C; 2EYZ A; 3RBB B; 1QWE A; 2J06 A; 2KT8 A; 2DF6 A; 1Z9Z A; 2DMO A; 2GNC A; 4HVV A; 1S1N A; 4OMQ A; 1M3B A; 2A36 A; 1WI7 A; 2LQW A; 2D0N A; 2GTJ A; 2YUP A; 3TVT A; 1JXO A; 4WCI A; 1JEG A; 5IHN A; 4F14 A; 2AKL A; 4J9B A; 1XOV A; 1K0X A; 3H0I A; 1U3O A; 4RTZ A; 1AWX A; 1OEB A; 4F17 A; 2EYX A; 1U06 A; 2KXC A; 1K9A A; 3TSZ A; 2D8H A; 2PNI A; 1WXB A; 2QDL A; 5ECA A; 1H3H A; 1NYG A; 1GCQ A; 1I0C A; 1MV0 B; 1JXM A; 2G6F X; 3JV3 A; 1EFN A; 2O31 A; 1GCP A; 1T3S A; 2O9S A; 4OMO A; 4HVU A; 2L3Q A; 2AKK A; 2DVJ A; 1I1J A; 2GQI A; 4ORZ A; 2KXD A; 1X69 A; 2DLP A; 2F2W A; 2JW4 A; 1HD3 A; 1SPK A; 1AOJ A; 1LCK A; 2C0I A; 2YDL A; 1AEY A; 2EYY A; 1WXT A; 3M0T A; 4J9C A; 4RTU A; 1X6G A; 2D8J A; 2YUN A; 2BZ8 A; 1ABQ A; 1B07 A; 4FSS A; 1G2B A; 3REB B; 1RUW A; 1UE9 A; 1SRM A; 2MIO A; 2RNA A; 2RQV A; 1M30 A; 3REA B; 1KJW A; 3M0R A; 2IIM A; 1NYF A; 1VYV A; 2EGC A; 1W1F A; 2A28 A; 4QT7 A; 3SHW A; 2CSQ A; 2YSQ A; 1ZUY A; 1X2Q A; 2DRM A; 3EHR A; 2LCS A; 2HCK A; 2K6D A; 1WXU A; 2DBK A; 1ZUK A; 2EKH A; 3EG1 A; 4J9I A; 1NG2 A; 2LZ6 B; 2RQW A; 1H8K A; 2B86 A; 3NMZ C; 3A98 A; 2DL7 A; 1GCQ C; 2RF0 A; 3QWX X; 1GFC A; 1JU5 C; 4AFS C; 4ZNX A; 2J6K A; 2L3S A; 2NUZ A; 3IQL A; 4AFZ C; 2C0T A; 1CKA A; 1NM7 A; 4LUD A; 2A08 A; 1ZBJ A; 4GBQ A; 4M4Z A; 2JM9 A; 4RUG A; 1SHG A; 1IO6 A; 2X3W D; 1JO8 A; 2GGR A; 1OPK A; 1PKT A; 4LNP A; 2EVR A; 2C0O A; 4X1V A; 3PVQ A; 1VYU A; 2ED1 A; 1A0N B; 2F2X A; 3PE0 A; 2L2P A; 1G83 A; 1PRL C; 2CT3 A; 3R6N A; 3GBQ A; 2EGE A; 1NEG A; 2OJ2 A; 1T0H A; 5FWB A; 2DL8 A; 1MV3 A; 4LE9 A; 2KBT A; 5GJV B; 3H0H A; 4CC4 B; 3C0C A; 4DEY A; 2DL4 A; 5FW9 A; 2LJ0 A; 1JQQ A; 4HCK A; 1T0J A; 4CC7 A; 3M0S A; 2DYB A; 2LMJ A; 2J05 A; 2KYM A; 2KR3 A; 1PWT A; 1SRL A; 1FMK A; 2GTO A; 4LUE A; 5L23 A; 4OML A; 5IXF A; 3VRZ A; 2O88 A; 1ABO A; 3I5R A; 2DM1 A; 2JT4 A; 2BZY A; 1CSK A; 3VS7 A; 3VS1 A; 2BZX A; 1U5S A; 2K7A A; 1GRI A; 1VYT A; 4Y92 A; 3UAT A; 2VKN A; 2LJ1 A; 2RMO A; 3UF4 A; 1ZSG A; 2FG0 A; 3PVL A; 1RLP C; 2NWM A; 3QWY A; 5IXB A; 4Z88 A; 2DRK A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2QG9 B; 5IH2 A; 1M3A A; 2K79 A; 4OB2 B; 1VQM A; 1UGP B; 3OYG A; 3H6Z A; 1M27 C; 4C8Q C; 4IUP A; 1KHI A; 2HBP A; 3RKW A; 2KRM A; 4JRP A; 1T3L A; 1TWB A; 4FW1 A; 4JS4 A; 1TUD A; 2DZ9 A; 4HT8 A; 4P5N A; 1QVG S; 3EG0 A; 2HKN A; 4HA8 A; 8ATC B; 3N5B B; 3O5Z A; 2DJZ A; 4ZTJ A; 3GLX A; 3FJ5 A; 4M75 E; 2O2O A; 5LJ5 e; 1J3T A; 2RD1 A; 1QVG P; 2FHD A; 1HSQ A; 1U1S A; 5AYF A; 2BTT A; 1OOT A; 2FYK A; 4PFZ A; 4C5I A; 1VQ8 T; 3CCJ Q; 8AT1 B; 2YUO A; 4A4E A; 1YP5 A; 2DYI A; 5LJ3 d; 2K3X A; 1Y96 A; 1W2B A; 1Y57 A; 2F5T X; 4XTW A; 4AG2 C; 1NEB A; 3OBY A; 3CMA A; 1B3Q A; 3I56 A; 4RTX A; 1WZO A; 3CCM Q; 2DXC A; 4JPB W; 5DLO A; 4KUD K; 1ARK A; 1ZX6 A; 1X75 C; 1NJI C; 1RAH B; 4O6J A; 2DZC A; 3JCM b; 3EGX A; 3LLR A; 2D9T A; 4R0K A; 3FC3 A; 2SRC A; 2QEX T; 4LDY A; 2O9V A; 3CC7 A; 1ZSZ A; 4BD3 A; 2ZZD A; 4BE1 A; 2NYS A; 4OMN A; 3P8D A; 1C1A A; 2LCL A; 2MAM A; 2F1L A; 1B34 A; 4M7A G; 1BU1 A; 4IUQ A; 2BIV A; 4AFU C; 3HRT A; 3NFC A; 3L42 A; 4Z02 A; 3V8L A; 1WHJ A; 1HYO A; 3QDR B; 2OTL A; 4E47 A; 4KH0 B; 5GMK e; 4BAC A; 1D0Y A; 2HMA A; 2X4J A; 5LJ5 d; 1YIT A; 1UGS B; 2Y4Y A; 2NUP A; 4BDZ A; 3M55 A; 1C0M A; 2RQU A; 3VS6 A; 3A8G B; 2HSP A; 3VS2 A; 2X51 A; 2DXB A; 2E70 A; 3QUI A; 1SF9 A; 1QKX A; 2AZV A; 2E5K A; 4M75 B; 3BDL A; 2LC4 A; 1RAC B; 1W6X A; 1YI2 Q; 2ENM A; 4JRI A; 5I22 A; 4IUV A; 4OMP A; 1YHQ T; 2GBQ A; 2FVU A; 2QA4 Q; 1BI2 A; 2ABL A; 2AHJ B; 3BW1 A; 4LDU A; 3CQT A; 2CUB A; 2JS2 A; 2EQI A; 3I9Q A; 2F69 A; 3EH1 A; 1PD1 A; 2H3E B; 2ZAE A; 4ELY C; 4M7D D; 2I0N A; 1VOM A; 4J9G A; 1W70 A; 1PRM C; 4JUV A; 2ROL A; 5CKE A; 2CP6 A; 2JZ2 A; 2QK0 A; 4C8Q G; 2AZS A; 1IGU A; 4II1 A; 5D6X A; 4B9X A; 2LX7 A; 3CXC A; 1LPL A; 1ZQ1 A; 2E3I A; 2RK1 A; 1TH7 A; 2F2V A; 2EGA A; 2ZPF B; 1KSW A; 2X9H A; 2QYZ A; 1WNL A; 2L3P A; 1K8A C; 1Q81 C; 5KYX B; 3CC4 A; 2LQK A; 1JJ2 P; 4IUT A; 3CC2 A; 3OSV A; 3JCM d; 1YHQ Q; 2V8J A; 4LDV A; 1AZG B; 4M75 F; 4NL2 A; 2VYT A; 4JRK A; 2YRC A; 1AT1 B; 3C95 A; 1W2B P; 5EC7 A; 2XI9 A; 3V7S A; 5GMK i; 1RI0 A; 1X43 A; 2ZPE B; 5FLX E; 5GAO l; 1AWO A; 2PZ1 A; 3L1A A; 3A8H B; 1RAG B; 2K9G A; 3VKI A; 1K0S A; 3P8H A; 3JCM V; 2CSI A; 4IUR A; 2RJE A; 2KEA A; 1VQ7 T; 5CCA A; 3OA6 A; 3OYJ A; 4FU6 A; 5GAM f; 3JB9 H; 2QTX A; 4N0A A; 1V76 A; 4MZM A; 1YFN A; 5CKH A; 5D6Y A; 1QWE A; 3EGD B; 2KT8 A; 3KXT A; 2GNC A; 3D7S B; 2A36 A; 3G7Z A; 1WI7 A; 2LQW A; 1VQ4 T; 4M77 C; 5GAO p; 1BIA A; 1Y71 A; 4MML A; 5IHN A; 3EH2 A; 4F14 A; 1N8R R; 2K5L A; 1XOV A; 4OGE A; 5FRN A; 1M90 R; 1AWX A; 4BI4 A; 4F17 A; 1U06 A; 3TSZ A; 2PNI A; 3M5A A; 1TSF A; 1WXB A; 3G6E A; 1H3H A; 2HL5 C; 1NYG A; 4RCB A; 1GCQ A; 1I0C A; 2G6F X; 1JXM A; 3JV3 A; 4JLI A; 2JOY A; 2YWW A; 4OMO A; 4D6W A; 4HVU A; 3I56 T; 1VQP A; 2AKK A; 3SB2 A; 2K57 A; 1M2O A; 3CCS T; 2IVW A; 2GQI A; 1X69 A; 2DLP A; 4M7A A; 2F2W A; 1SPK A; 3UPU A; 1AEY A; 2C0I A; 1S72 T; 1X6G A; 2YUN A; 2BZ8 A; 1PG5 B; 2HSE B; 1QQJ A; 4OF1 A; 1YJN Q; 3MKD A; 4FSS A; 4XU0 A; 4BE2 A; 2L3R A; 1UE9 A; 3REA B; 1M30 A; 2IIM A; 5GAM g; 2HQX A; 4QT7 A; 2YSQ A; 1X2Q A; 2PUK B; 2DRM A; 2DIQ A; 3SDZ A; 3EGD A; 1ACM B; 1ZUK A; 3NTK A; 3VJP A; 1UB4 A; 1NG2 A; 5FRM A; 1H3Z A; 2F5K A; 1M1K R; 1Q82 R; 1Y07 A; 3A98 A; 6AT1 B; 2DL7 A; 4C0D C; 1K73 U; 4KUL A; 1GFC A; 4KT0 E; 1EX4 A; 4C0F A; 4EMK A; 2RJD A; 3IQL A; 2RB6 A; 2C0T A; 3JRZ A; 4LUD A; 3CCS Q; 5GAN g; 5HK0 A; 4M4Z A; 3CCM A; 4RUG A; 3TRE A; 2X3W D; 2GGR A; 2X35 A; 2L89 A; 5GAN j; 4PJO F; 1S72 Q; 5LL6 S; 2VGM A; 2HZY A; 1JBM A; 1U1T A; 2WAC A; 2L2P A; 1PRL C; 4Y28 E; 3UT1 A; 5FWB A; 2DL8 A; 4C8Q A; 4JRQ A; 4C92 C; 3X20 B; 4CC7 A; 2GFU A; 3OW2 A; 2LMJ A; 2J05 A; 2DAQ A; 5L8R E; 2KYM A; 1VIE A; 1SG5 A; 4LUE A; 3I55 T; 5GAN 6; 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2K5I A; 2D1X A; 3ASK A; 1PM3 A; 5CKF A; 1VQL T; 2VC8 A; 4C5G A; 3CCE T; 4QKU A; 1FXX A; 4NS5 A; 1WFW A; 2RI5 A; 3CPW S; 1X2K A; 2HBW A; 2K3B A; 4PFP A; 3QBY A; 5I11 A; 2JUF A; 2QQ9 A; 1R0C B; 2P0Q A; 1KQS S; 1YIJ Q; 1M5Q 1; 1WQW A; 5CQY A; 3L2R A; 4ZTF A; 2KNB B; 3SFM A; 3CPW P; 2PU9 B; 3ZL7 C; 1VQN Q; 1K73 C; 2KK4 A; 4JJD A; 4F7U B; 3HP9 A; 2CT4 A; 1AWJ A; 2HL3 A; 2CP5 A; 3QPH A; 4HVW A; 5KYU A; 1KQS P; 4PFO A; 2M0Y A; 3OYK A; 3M0Q A; 4C92 G; 2FRY A; 4OB3 B; 5LJ3 e; 4C8Q D; 4KGV B; 3OS0 A; 1WHH A; 4A4G A; 3CCQ T; 2LX9 A; 2YUQ A; 2C06 A; 1VIF A; 2VVK A; 2H3J A; 2A7Y A; 2E65 A; 1ZSZ B; 1R0B G; 3KBG A; 1N6A A; 4R55 A; 4NOY A; 2FO0 A; 2JMA A; 1B34 B; 4FYY B; 2DFU A; 4IIM A; 1MMN A; 3G71 A; 2DIL A; 2E64 A; 1RAD B; 2NUT A; 3GP8 A; 2XDP A; 3X25 B; 2OTJ T; 4M78 C; 2J7I A; 2FEI A; 1VQO A; 4ZN1 A; 2LT4 A; 1TG0 A; 1KC8 U; 1N27 A; 1FX7 A; 1IRE B; 2FL7 A; 3DB4 A; 4L59 A; 1CKB A; 3E9G A; 2LQN A; 3ER0 A; 4XU2 A; 2ZGW A; 4E7Z A; 1WJR A; 3QO3 A; 2NUP B; 2LTO A; 3DLM A; 4PJO C; 1TU0 B; 3PIP A; 4F7U F; 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