The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
10
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sequence length |
67
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structure length |
67
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Chain Sequence |
GSHMKKQKVKTIFPHTAGSNKTLLSFAQGDVITLLIPEEKDGWLYGEHDVSKARGWFPSSYTKLLEE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Protein binding
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| publication title |
Recognition of tandem PxxP motifs as a unique Src homology 3-binding mode triggers pathogen-driven actin assembly
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Brain-specific angiogenesis inhibitor 1-associated protein 2
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| total genus |
10
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| structure length |
67
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| sequence length |
67
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-04-30 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF14604 | SH3_9 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1AWO A; 3M0P A; 1GRI A; 1M3B A; 3M0S A; 4J9C A; 2DL3 A; 1G83 A; 2KRO A; 3ULR B; 4LUD A; 2HSP A; 3M0T A; 4R0K A; 2H8H A; 5I11 A; 2NWM A; 2D1X A; 2KXD A; 1FMK A; 2KRS A; 4HCK A; 2FPF A; 3REB B; 1ZUU A; 3U23 A; 1UG1 A; 2DMO A; 1AWX A; 3EG0 A; 2YDL A; 1AOJ A; 4D8D A; 4RTY A; 2JS2 A; 3UA6 A; 2JTE A; 3I35 A; 4OMQ A; 2DL5 A; 1W6X A; 1K9A A; 1OOT A; 2QDL A; 1OEB A; 3R6N A; 2CT4 A; 1NYF A; 1QWF A; 1JXM A; 1S1N A; 3THK A; 2PNI A; 2ROT A; 3H0H A; 1UJY A; 2RN8 A; 2JM9 A; 2GGR A; 4D8K A; 2DYB A; 2GBQ A; 1KIK A; 1X27 A; 1BU1 A; 1HSQ A; 1SHF A; 1VYV A; 1MUZ A; 2RPN A; 2YUN A; 2EYY A; 2MIO A; 2DL4 A; 3UA7 A; 1PRL C; 2DF6 A; 3VRZ A; 1WYX A; 1Y57 A; 2PTK A; 3PE0 A; 3TSW A; 1UHF A; 4J9I A; 2L3S A; 2DJQ A; 2FEI A; 1YNZ A; 5FW9 A; 2AZS A; 2A37 A; 1OPK A; 2LJ0 A; 4JJB A; 3NHN A; 2KRM A; 1NM7 A; 2F2W A; 1PKS A; 2L3P A; 4CC7 A; 2EYX A; 2EW3 A; 2KYM A; 5IH2 A; 1AZG B; 1JQQ A; 1QKW A; 2GTO A; 2FRW A; 1NEB A; 2EQI A; 1ZSG A; 2RMO A; 3LH5 A; 1W70 A; 4ZNX A; 2O9V A; 4HVV A; 3H0I A; 1RLQ C; 4FSS A; 2DRM A; 1SHG A; 1Z9Z A; 2HEQ A; 1PRM C; 2JMA A; 2EPD A; 2J05 A; 1PNJ A; 2YSQ A; 1WDX A; 2CDT A; 1RLP C; 1GCP A; 2D0N A; 2K6D A; 1QWE A; 3PVL A; 1BK2 A; 2VWF A; 3PVQ A; 4RTV A; 2CH4 A; 4OML A; 2K7A A; 1NLP C; 1SRM A; 1W1F A; 2VKN A; 1QLY A; 3KFV A; 1CSK A; 1WXB A; 3REA B; 4Y92 A; 2C0I A; 2OI3 A; 1UFF A; 3VS3 A; 1X6G A; 1AVZ C; 1A0N B; 5GJW B; 3UAT A; 2EGA A; 2JW4 A; 1SEM A; 2CT3 A; 2W10 A; 2GTJ A; 2LQN A; 1M8M A; 3TSZ A; 2O2O A; 4RTT A; 2A36 A; 1HJD A; 4OMN A; 1WXT A; 2RQW A; 1JXO A; 3NMZ C; 1OV3 A; 1BBZ A; 3GBQ A; 1E6H A; 3RBB B; 4M4Z A; 1T0J A; 1GL5 A; 2KYB A; 2L0A A; 1JU5 C; 3EG1 A; 5FWC A; 1PKT A; 2KE9 A; 1T3S A; 2FO0 A; 2YUQ A; 2HCK A; 2AZV A; 2K9G A; 2BZX A; 1M3A A; 2RF0 A; 3UF4 A; 3I5S A; 2A08 A; 2CUD A; 1V1C A; 4QT7 A; 4A63 B; 2RQU A; 2DM1 A; 2KRN A; 2FPE A; 4GBQ A; 2EBP A; 4LE9 A; 2YUP A; 1ARK A; 4DEX A; 3H41 A; 4F14 A; 1K76 A; 1N5Z A; 1K1Z A; 2F2X A; 2FG0 A; 4RTZ A; 1B3Q A; 1GBQ A; 2GNC A; 2X3W D; 4GLM A; 4JPB W; 1I0C A; 2J06 A; 4J9E A; 4AFU C; 2RQV A; 3C0C A; 2JXB A; 4K11 A; 1QCF A; 4Z8A A; 2FRY A; 2DX1 A; 5L23 A; 1WXU A; 5EC7 A; 2OJ2 A; 1UE9 A; 1WIE A; 4LUE A; 1IO6 A; 5IHN A; 3M0Q A; 3TVT A; 2K79 A; 2C0O A; 4HVU A; 1AWJ A; 5FWB A; 2DVJ A; 3SEM A; 1SSH A; 4AFS C; 4J9G A; 1VYU A; 2MCN A; 2EVR A; 1RI9 A; 2KR3 A; 1FYN A; 4CC2 A; 4IIM A; 2JMC A; 1YWP A; 1ZLM A; 5IHK A; 4J9D A; 2DL7 A; 2D8J A; 1YN8 A; 2JS0 A; 2CH4 W; 4J9F A; 1U5S A; 1MV0 B; 2M0Y A; 1M3C A; 2B86 A; 2RNA A; 4F16 A; 2ROL A; 2IIM A; 2L2P A; 2DLP A; 1CKA A; 4HVW A; 4AFQ C; 2LJ3 A; 4AFZ C; 2LZ6 B; 3H0F A; 2EKH A; 2L3Q A; 2M51 A; 2DNU A; 2V1R A; 2JT4 A; 2LNH B; 1H92 A; 2AKK A; 4AG1 C; 3VS2 A; 1K0X A; 2ENM A; 1M30 A; 3I5R A; 3FJ5 A; 1GFD A; 2EGE A; 4CC4 B; 2GQI A; 1ZUY A; 2LJ1 A; 2ECZ A; 2KEA A; 4OMM A; 1GBR A; 1WFW A; 5I22 A; 3M0U A; 1NYG A; 1XOV A; 2FPD A; 3VS6 A; 2G6F X; 4LN2 A; 4RTU A; 1U06 A; 1X2K A; 2OAW A; 1VYT A; 1B07 A; 5ECA A; 2LX7 A; 1GFC A; 1YCS B; 2W0Z A; 1KFZ A; 1G2B A; 1JO8 A; 2J6O A; 4DEY A; 2XMF A; 1AEY A; 2BZY A; 2CUB A; 2KBT A; 1NG2 A; 3VS4 A; 3EG2 A; 4ORZ A; 1E7O A; 2LQW A; 2D8H A; 2PZ1 A; 3I9Q A; 1H3H A; 1KSW A; 2DBK A; 3IQL A; 2J7I A; 1GCQ A; 2DL8 A; 2K2M A; 4OMP A; 2X3X D; 3QWX X; 1CKB A; 2V1Q A; 1WA7 A; 1ZUK A; 4JJC A; 3ZL7 C; 2VVK A; 1TG0 A; 2AK5 A; 1WLP B; 2AKL A; 1M27 C; 4ESR A; 2DRK A; 1TUD A; 3VS7 A; 1E6G A; 2BTT A; 1UDL A; 4JZ4 A; 2C0T A; 1Y0M A; 3CQT A; 1QKX A; 2YT6 A; 2K3B A; 2KT1 A; 4F17 A; 4J9H A; 2CSQ A; 2DA9 A; 1PWT A; 4RUG A; 4Z88 A; 2SEM A; 1AWW A; 1NLO C; 4JJD A; 1SRL A; 5IXF A; 1ABO A; 3EG3 A; 4LNP A; 2LCS A; 1PHT A; 1K0S A; 2CSI A; 2P4R A; 3O5Z A; 1J3T A; 1NEG A; 4RTX A; 4OMO A; 1T3L A; 3RNJ A; 1Z9Q A; 1SPK A; 3VS1 A; 1X2Q A; 3EHQ A; 1OPL A; 2I0N A; 2SRC A; 1BB9 A; 3VRY A; 4J9B A; 2EYZ A; 1RUW A; 4Z89 A; 2MOX A; 2RQT A; 1TUC A; 2J6F A; 4WCI A; 1UEC A; 2E5K A; 1HD3 A; 2DIL A; 1U3O A; 3JV3 A; 1GCQ C; 1X6B A; 4AG2 C; 1UGV A; 3QWY A; 4E6R A; 2KXC A; 4RTW A; 2A28 A; 3EHR A; 1UTI A; 1UHC A; 1I1J A; 2KNB B; 3SHW A; 2YUO A; 3A98 A; 2HBW A; 1UUE A; 1KJW A; 2KGT A; 1MV3 A; 2ABL A; 5GJV B; 1H8K A; 1WI7 A; 2LP5 A; 1AD5 A; 2EGC A; 1X43 A; 2O88 A; 2ESW A; 4HXJ A; 1VA7 A; 1JEG A; 1YP5 A; 2LMJ A; 4CC3 A; 4IIO A; 4JZ3 A; 2ED1 A; 2RQR A; 2KT8 A; 4X1V A; 2HDA A; 3VS0 A; 2DE0 X; 1AZE A; 5HCK A; 1UJ0 A; 1WX6 A; 3M0R A; 3EGU A; 2O31 A; 2EYW A; 2O9S A; 4EIK A; 3VS5 A; 3NPF A; 2F2V A; 3NGP A; 2BZ8 A; 1EFN A; 1ZX6 A; 5IXB A; 1I07 A; 2NUZ A; 2JM8 A; 1YWO A; 4KRT A; 1ZBJ A; 1K4U S; 1X69 A; 2J6K A; 1LCK A; 1T0H A; 2CRE A; 1ABQ A; 5IHI A; 2DBM A; 2ED0 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3M0P A; 3M0S A; 1MMD A; 1VQP A; 1JJ2 A; 4LUD A; 3M0T A; 1V29 B; 1G3S A; 2CGH A; 3MET A; 2D1X A; 2KXD A; 1OU8 A; 5I21 A; 3MP8 A; 4KH1 B; 3CEY A; 2RHZ A; 3U23 A; 1AWX A; 2X4X A; 1D1B A; 2JTE A; 4OMQ A; 1VQK T; 4J83 A; 4E47 A; 3DKM A; 3BW1 A; 1OQK A; 3S3O A; 1OEB A; 2K2V A; 2YRD A; 2P4T A; 4E7Z A; 4FW1 A; 5CQY A; 3V8L A; 4PJO B; 2NUP A; 2I2L A; 5J39 A; 4A4F A; 2KI7 A; 2ROT A; 1UJY A; 2RN8 A; 1B7T A; 3CCR A; 3QDF A; 5GAN e; 4D8K A; 2DYB A; 2GBQ A; 2MK5 A; 1RAF B; 2RJC A; 2ZPE B; 5GAM j; 4GY5 A; 1SHF A; 2A3L A; 3QDR B; 3EAE A; 1JJ2 S; 1KC8 R; 2DVE A; 4JS5 A; 4IKF A; 1Y57 A; 4JRI A; 1MMA A; 1M2V A; 5GAN 8; 3TSW A; 2D0Q B; 3M54 A; 5KE2 A; 2DJQ A; 1YNZ A; 5GAO m; 1MNE A; 3RKY A; 1TU0 B; 3OS1 A; 2NUT B; 2LJ0 A; 4EMG A; 1M9S A; 4LDY A; 1PKS A; 2JJ9 A; 4PJJ A; 3L2W A; 8ATC B; 4F7U F; 2DEU A; 1D3B A; 2YWW A; 3G1J A; 5CK9 A; 4XTX A; 3G71 A; 2COW A; 5IH2 A; 3A8O B; 1PG5 B; 1QKW A; 2B8A A; 3LH5 A; 1W70 A; 2O9V A; 2QTX A; 3HL8 A; 3V7C A; 1M4Z A; 4F04 B; 1W2B S; 4M7D F; 4KUD K; 2HEQ A; 2JMA A; 4M78 D; 1UGP B; 3EFO B; 2HQX A; 4PKC C; 2LQK A; 1KD1 R; 1WDX A; 1RLP C; 2BKD N; 1KQS P; 1QWE A; 3A5Z B; 2VWF A; 1W1F A; 4M75 B; 1QLY A; 2H3E B; 1D0Y A; 3QSU A; 1WXB A; 4X34 A; 2OI3 A; 1ZSZ C; 3DLL A; 4C8Q F; 3S6W A; 2JW4 A; 2LVM A; 1Q7Y R; 4ZGE B; 3MEU A; 2LTO A; 2PUO B; 1V76 A; 1N8R R; 1U1T A; 2RI5 A; 1HJD A; 1YJ9 T; 2MPX C; 3WVD B; 3OB9 A; 1OV3 A; 2FZK B; 1VQL T; 1BBZ A; 1YI2 A; 3GBQ A; 1E6H A; 3GNG A; 3CCM Q; 3OS2 A; 8AT1 B; 4M4Z A; 2KYB A; 1PKT A; 4E2F B; 1T3S A; 1VQ9 T; 2YUQ A; 1VQ8 Q; 2OTJ Q; 2BZX A; 1M3A A; 3NTI A; 2X4Y A; 2A08 A; 1VQK A; 4A63 B; 4DBF A; 2RM4 A; 2ZPG B; 3S3M A; 2F2X A; 1TSF A; 1Q86 R; 3OYH A; 3GF5 A; 1B3Q A; 1GBQ A; 4PFZ A; 2GNC A; 3JB9 J; 4GLM A; 2J06 A; 4AFU C; 2RQV A; 3CD6 A; 2KY9 A; 3HRS A; 4Z8A A; 1VQ7 T; 4O5V A; 3S3N A; 4ME7 A; 4OF1 A; 5GMK m; 2DXT A; 1UE9 A; 5IHN A; 4JS4 A; 1D0Z A; 1QMC A; 2C0O A; 4JDS A; 3J80 E; 5IN1 A; 4AMC A; 2O4X B; 3M55 A; 2VC8 A; 3G4S Q; 3EFR A; 1YBY A; 2D8J A; 1K9M U; 4Z02 A; 2K5F A; 4M78 B; 1F1B B; 2QK0 A; 4XK8 E; 2CP5 A; 2CH4 W; 3CCM T; 1IXD A; 1MV0 B; 1BI2 A; 2DK3 A; 2IIM A; 2GQV A; 4AFQ C; 2LJ3 A; 4AFZ C; 1I81 A; 2E1H A; 2OTJ T; 4EMK A; 4PK4 A; 4LD6 A; 2LNH B; 2AKK A; 1OX9 A; 3JCM P; 2ENM A; 3E1S A; 1M30 A; 3FJ5 A; 1WPY A; 1GFD A; 3HKS A; 3JSC A; 1S72 T; 4BI8 B; 3OYN A; 1NJI U; 1UGS B; 2QGG A; 1K73 R; 3EH1 A; 3P8H A; 1M2O A; 3CC4 Q; 2ECZ A; 2KEA A; 1JB0 E; 2X35 A; 5I22 A; 3ZBD A; 1NYG A; 3BFM A; 4RG8 A; 1TXQ A; 3BDL A; 3MCA B; 2XID A; 3ER0 A; 2K4Y A; 5ECA A; 2DD4 A; 4F7U G; 1GFC A; 2W0Z A; 1G2B A; 2BIV A; 4MMK A; 1W4S A; 2OX7 A; 3JCM h; 1PD0 A; 5A0G A; 2KBT A; 4F7U A; 5J3B A; 1NG2 A; 5D7U A; 1RAC B; 4FYY B; 2XDD A; 4JJN K; 2R57 A; 3E9G A; 1AHJ B; 3PMT A; 2DBK A; 4BUG A; 5GAO r; 3JCM c; 3IQL A; 2Y4X A; 4ZGJ B; 1Q81 U; 2DL8 A; 2K2M A; 1O9S A; 4PLI A; 2EQK A; 1ZUK A; 1M5Q 1; 3QUI A; 3SWN A; 1M27 C; 4OB2 B; 1LJO A; 2DRK A; 1SF9 A; 2BTT A; 3CCV Q; 1N9R A; 1IRE B; 5AT1 B; 1XTD A; 3CQT A; 2K3B A; 2CZ0 B; 2KT1 A; 5KYN A; 5CIU A; 1YHQ T; 4JLG A; 3LYI A; 2ZPI B; 4RUG A; 5GAN 3; 2SEM A; 4XTV A; 3CCU Q; 5GAM d; 4C8Q G; 4BE0 A; 2CYZ B; 5IXF A; 3A1P A; 2FB7 A; 1C0M A; 4M77 G; 1VQ4 T; 2CP0 A; 2CSI A; 2P4R A; 4C8Q A; 1NEG A; 1T3L A; 1N6A A; 3RNJ A; 4ZTJ A; 2XKO C; 1P92 A; 1SPK A; 1FXX A; 4M77 A; 5EG2 A; 2I0N A; 4UC4 A; 1HK9 A; 4PJO F; 1OX8 A; 7AT1 B; 2SRC A; 3NTK A; 4C0Z A; 4Z89 A; 2MOX A; 4XU1 A; 4WCI A; 1QVG S; 1YFN A; 3JCM e; 5GAN f; 4IUQ A; 1GCQ C; 1X6B A; 2CZ6 B; 3QWY A; 1KHI A; 3GPL A; 9ATC B; 4BY6 C; 4A54 A; 1I1J A; 5CO7 A; 1QQJ A; 2AT1 B; 3CCM A; 4FT4 A; 3A98 A; 2HBW A; 1MV3 A; 2ABL A; 2VGN A; 5GJV B; 1H8K A; 3EGX A; 2HL5 C; 2CP7 A; 4C0G A; 2OTJ A; 4X9C A; 2O88 A; 2DKG A; 3CCV T; 1JJ2 P; 2XIC A; 4HXJ A; 2QGF B; 2ZPF B; 1S72 A; 5CKE A; 4C8Q E; 5CCA A; 3SD4 A; 2RI3 A; 2EKO A; 1VOM A; 2HDA A; 4M77 E; 2P0P A; 5HCK A; 4DBR A; 3NGP A; 1NZ9 A; 3RR6 A; 5GAN g; 2NUZ A; 2JM8 A; 2DAQ A; 1D09 B; 1X69 A; 2JUF A; 1OUL A; 3ZFJ A; 2QI2 A; 1LCK A; 2FZC B; 4OB3 B; 4XTW A; 1YJW T; 4M7A B; 3EGD B; 1AWO A; 1G83 A; 2KRO A; 3ULR B; 2HSP A; 4M75 F; 1QVP A; 3G6E Q; 3WXM B; 2DYI A; 3GIB A; 3G4S A; 3CCE Q; 4FYV B; 1UG1 A; 3EG0 A; 4L6V 5; 1WJS A; 4RTY A; 2RHU A; 3LX7 A; 2LQ8 A; 4KGV B; 1Y71 A; 2QDY B; 2QDL A; 3QII A; 3BDU A; 1QWF A; 3CCJ T; 3FDR A; 1SKU B; 1WHM A; 1JBM A; 1JXM A; 1S1N A; 1QW1 A; 5GMK j; 4A4E A; 2PNI A; 2HL3 A; 3L2V A; 1NPR A; 2DIQ A; 1BKB A; 2KQW A; 2GGR A; 3HFN A; 2E3I A; 1HSQ A; 3CC4 A; 1M1K C; 1VYV A; 1QCN A; 1LNX A; 2RPN A; 2YUN A; 2MIO A; 2DL4 A; 4KH0 B; 3L2R A; 1UHF A; 4RG2 A; 1TTH B; 1ZSZ A; 3CC2 Q; 3CXC S; 4XTU A; 4M7D C; 4JJB A; 2KRM A; 1NM7 A; 1M90 U; 4CC7 A; 2L3P A; 2CP2 A; 4KGZ B; 1N9S A; 5KYY A; 4XU2 A; 3CBP A; 3CCE T; 2XDB A; 3RER A; 2EQI A; 2DD5 A; 1VQ6 T; 2E65 A; 3FRN A; 4V2S A; 3H0I A; 1RLQ C; 2DRM A; 1BIA A; 3VYG A; 3CCV A; 2H3J A; 2EPD A; 3X28 B; 5LJ3 g; 1PNJ A; 2YSQ A; 2CDT A; 2Y90 A; 1GCP A; 4MML A; 4DBQ A; 1WZO A; 1XQH A; 4OML A; 4C92 D; 1NLP C; 3CCU A; 4BAC A; 1SRM A; 1H3Z A; 3RIR A; 4PJM A; 2HBP A; 3VS3 A; 2CP3 A; 2RHY A; 4HCC A; 1NE8 A; 1K73 C; 1KC8 U; 3X25 B; 3VJP A; 2FYK A; 1QCO A; 1RAG B; 4JRK A; 5D6X A; 2G3R A; 4MZT A; 1PD1 A; 1FWZ A; 1YJW A; 4RTT A; 1X01 A; 3URG A; 1YI2 T; 3CC2 T; 2E70 A; 3L2Z A; 4M7A C; 1BI3 A; 5FRO A; 4EMH A; 5CKD A; 5CR2 A; 1ACM B; 2ZPH B; 4R56 A; 4P5N A; 1G3W A; 1BCM A; 2BE9 B; 3CCL Q; 1K8A C; 3PNW C; 4C92 G; 4LXC A; 4LDX A; 5FWC A; 2KE9 A; 1R77 A; 2HCK A; 3UF4 A; 1G5V A; 1I8F A; 4XU0 A; 4C92 A; 4QT7 A; 2A0F B; 1KQ1 A; 2KRN A; 3N5B B; 2EBP A; 3CCJ A; 3NFC A; 3L42 A; 1ARK A; 1IRX A; 2XI9 A; 1KD1 U; 3X24 B; 1K76 A; 1W2B A; 1VQM Q; 2DTO A; 2FG0 A; 4RTZ A; 5KYW A; 4HA8 A; 2LT4 A; 2DPP B; 3CD6 T; 2P84 A; 4JPB W; 2EJ9 A; 4J9E A; 3EFO A; 2LCC A; 2E12 A; 4CI0 C; 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