The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
14
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sequence length |
56
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structure length |
56
|
Chain Sequence |
STLFEALYDYEARTEDDLSFHKGEKFQILNSSEGDWWEVRSLTTGETGYIPSPYLA
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Transferase
|
| source organism |
Gallus gallus
|
| publication title |
Structure of an intermediate state in protein folding and aggregation.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Tyrosine-protein kinase Fyn
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| total genus |
14
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| structure length |
56
|
| sequence length |
56
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| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 2010-08-25 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3I5S A; 2EVR A; 1LCK A; 1MV0 B; 2LQN A; 2LJ1 A; 4RTW A; 2ECZ A; 2EGE A; 3VS0 A; 1WFW A; 2VKN A; 4AFU C; 5I22 A; 1B07 A; 3M0T A; 2CUD A; 4X1V A; 4AFQ C; 2JW4 A; 1OEB A; 4KRT A; 1NYG A; 4RTV A; 2ROL A; 4OML A; 5IHI A; 1CKB A; 2KNB B; 3NPF A; 1H3H A; 2KT8 A; 2D1X A; 1ZX6 A; 1G2B A; 3EG3 A; 2CUB A; 1GBR A; 2MOX A; 1SPK A; 1NM7 A; 1HJD A; 2BTT A; 3RBB B; 2EPD A; 1WDX A; 1NEB A; 3H0H A; 4IIM A; 1QLY A; 2C0I A; 4ORZ A; 3M0S A; 2KXD A; 4OMQ A; 2KXC A; 2DA9 A; 1WIE A; 1JXM A; 4M4Z A; 3RNJ A; 1SEM A; 2J7I A; 1X2Q A; 1WYX A; 2VWF A; 4CC4 B; 2JTE A; 4J9H A; 2RQV A; 1W6X A; 1QCF A; 2JS2 A; 2L3Q A; 1NLO C; 4LN2 A; 4WCI A; 2MCN A; 2YSQ A; 1GBQ A; 5IXF A; 2AKL A; 2KT1 A; 2CRE A; 4J9G A; 2KRO A; 2HSP A; 5GJV B; 1VYU A; 2X3W D; 1FYN A; 4HVW A; 1KJW A; 1I07 A; 4GLM A; 2BZY A; 4RTT A; 2AKK A; 3TSZ A; 2KBT A; 1MV3 A; 2YUP A; 3H41 A; 1PNJ A; 1K9A A; 1TUC A; 2LZ6 B; 4F17 A; 2KYB A; 2K9G A; 2YT6 A; 2OJ2 A; 4J9I A; 1V1C A; 5GJW B; 3REB B; 2GNC A; 1NLP C; 5IHK A; 2DL4 A; 2KRN A; 1UTI A; 1S1N A; 1SRL A; 2XMF A; 1BU1 A; 1YCS B; 1ZUY A; 2EYY A; 1RI9 A; 2RNA A; 2YUN A; 4F14 A; 2L3S A; 2DX1 A; 1FMK A; 1BK2 A; 2GBQ A; 3M0R A; 2LCS A; 4F16 A; 3EGU A; 1ARK A; 1X69 A; 2FG0 A; 4CC7 A; 2DYB A; 4JJB A; 5IXB A; 1KFZ A; 1M3A A; 2A08 A; 2OI3 A; 1GCQ C; 4R0K A; 1H8K A; 2GQI A; 3NHN A; 4FSS A; 2YUQ A; 2DL3 A; 1SHF A; 1U3O A; 1Y57 A; 3PVQ A; 2K79 A; 1WX6 A; 2EYX A; 1T3S A; 4GBQ A; 1UJ0 A; 2DF6 A; 1TG0 A; 4CC2 A; 2E5K A; 3I35 A; 1OPL A; 2RMO A; 1ZUU A; 4Z88 A; 2D8H A; 2B86 A; 2VVK A; 1M27 C; 1YWP A; 2ESW A; 1VYT A; 1KSW A; 2A37 A; 1ZBJ A; 1JQQ A; 2CSI A; 1WXT A; 1ZSG A; 1KIK A; 3M0P A; 4LE9 A; 3SEM A; 2K2M A; 4HXJ A; 5L23 A; 3I5R A; 1NEG A; 2DJQ A; 2J05 A; 3U23 A; 1AWW A; 2DM1 A; 3UA6 A; 1PRL C; 2LJ0 A; 1EFN A; 3NMZ C; 2D0N A; 1GCQ A; 4RTY A; 2HEQ A; 1UFF A; 2KE9 A; 4RTU A; 2I0N A; 3A98 A; 2BZ8 A; 1PWT A; 3VS3 A; 2KRM A; 2KRS A; 1PHT A; 2A36 A; 3VS7 A; 2O9V A; 4DEY A; 1UHF A; 3QWX X; 1A0N B; 2F2W A; 2JT4 A; 1AZE A; 4D8K A; 2KEA A; 1ABQ A; 1QKW A; 2DMO A; 1JU5 C; 3EHQ A; 1U5S A; 1WA7 A; 2RN8 A; 1M30 A; 2FEI A; 1YP5 A; 1VA7 A; 4RUG A; 1WLP B; 2DVJ A; 4CC3 A; 1GRI A; 2EKH A; 1OV3 A; 3GBQ A; 1I0C A; 4Y92 A; 2EGA A; 2GTJ A; 3I9Q A; 1PRM C; 4Z89 A; 2RQT A; 3PE0 A; 2ROT A; 2RF0 A; 2EYZ A; 2EYW A; 1AEY A; 2FPE A; 3EG1 A; 1UUE A; 1ABO A; 2J06 A; 3ZL7 C; 2EW3 A; 1WXB A; 1Z9Z A; 2YDL A; 1Y0M A; 2PNI A; 3VRY A; 3C0C A; 2SRC A; 4LUE A; 1VYV A; 2V1Q A; 1JEG A; 3JV3 A; 2L2P A; 4RTZ A; 5EC7 A; 1CKA A; 4LNP A; 1NYF A; 1K1Z A; 1OOT A; 1TUD A; 2DIL A; 3M0U A; 5ECA A; 2CT3 A; 1GCP A; 2G6F X; 5FWB A; 2W10 A; 4J9C A; 3VS2 A; 2P4R A; 1K4U S; 5IHN A; 1ZUK A; 3REA B; 4J9F A; 1UGV A; 1PKT A; 4JPB W; 4K11 A; 2F2V A; 2DRM A; 2JM8 A; 3EG2 A; 1AOJ A; 1BB9 A; 2RPN A; 2HDA A; 2DBM A; 1ZLM A; 2JMC A; 1X6G A; 2RQW A; 1AWJ A; 1M3C A; 1OPK A; 1RUW A; 2ED0 A; 2LX7 A; 4RTX A; 1Z9Q A; 2YUO A; 1WXU A; 3EG0 A; 1HD3 A; 1NG2 A; 2DL5 A; 2CH4 W; 2EQI A; 2FPF A; 2BZX A; 1T0J A; 4AFS C; 1YNZ A; 2K7A A; 3UF4 A; 3LH5 A; 2FRY A; 1HSQ A; 3SHW A; 3VS5 A; 2FO0 A; 2ENM A; 2W0Z A; 3H0F A; 1WI7 A; 2CH4 A; 1X43 A; 4J9B A; 3EHR A; 2J6K A; 1BBZ A; 1M3B A; 1SRM A; 1UG1 A; 4JJD A; 3TVT A; 1UDL A; 2AZS A; 1W70 A; 4AG2 C; 1W1F A; 4JZ3 A; 1T3L A; 2NUZ A; 4OMN A; 1YN8 A; 2JXB A; 3TSW A; 1GFD A; 1QKX A; 5HCK A; 2FPD A; 2M0Y A; 1UEC A; 4OMP A; 5I11 A; 1IO6 A; 5FW9 A; 1K0X A; 1M8M A; 4E6R A; 2JMA A; 2CDT A; 2O9S A; 1SSH A; 1T0H A; 2V1R A; 1E6G A; 1J3T A; 1E6H A; 2GTO A; 2QDL A; 4LUD A; 2LNH B; 2K3B A; 2HBW A; 3M0Q A; 2DRK A; 3PVL A; 1AZG B; 4HCK A; 2JM9 A; 4J9D A; 2FRW A; 1MUZ A; 3IQL A; 4HVU A; 4QT7 A; 1E7O A; 2DNU A; 2F2X A; 2SEM A; 1K76 A; 3ULR B; 2D8J A; 3UA7 A; 2DBK A; 2HCK A; 2EBP A; 4OMM A; 3CQT A; 2CT4 A; 2RQU A; 4OMO A; 2ABL A; 2C0T A; 1RLP C; 2AK5 A; 3VS4 A; 2DLP A; 2O88 A; 1JXO A; 4JZ4 A; 3FJ5 A; 4HVV A; 1AVZ C; 1RLQ C; 2LMJ A; 1U06 A; 1I1J A; 2LP5 A; 2O2O A; 3VRZ A; 2JS0 A; 4D8D A; 2X3X D; 1QWE A; 2EGC A; 2H8H A; 2K6D A; 4AFZ C; 1B3Q A; 2PTK A; 1X27 A; 2DE0 X; 4ESR A; 4IIO A; 4AG1 C; 1N5Z A; 2AZV A; 3QWY A; 4J9E A; 2DL7 A; 2GGR A; 4JJC A; 3O5Z A; 4A63 B; 2NWM A; 3R6N A; 2CSQ A; 1QWF A; 2OAW A; 2O31 A; 2RQR A; 2LJ3 A; 2L0A A; 5FWC A; 2MIO A; 2C0O A; 1SHG A; 1CSK A; 1JO8 A; 3NGP A; 1PKS A; 2DL8 A; 2A28 A; 2ED1 A; 2PZ1 A; 2M51 A; 1AD5 A; 1UHC A; 1G83 A; 2J6F A; 3VS6 A; 2LQW A; 1XOV A; 1UE9 A; 1GL5 A; 5IH2 A; 1H92 A; 4Z8A A; 2KYM A; 4EIK A; 1AWO A; 1AWX A; 4ZNX A; 2IIM A; 1X2K A; 3THK A; 1GFC A; 3KFV A; 1X6B A; 3UAT A; 3VS1 A; 4DEX A; 2J6O A; 2KR3 A; 1YWO A; 2KGT A; 2L3P A; 3H0I A; 1K0S A; 1UJY A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1VQO A; 3I5S A; 3X26 B; 1FMW A; 2LCL A; 1LCK A; 1MV0 B; 2LQN A; 1PG5 B; 3EGX B; 5LJ5 f; 2EQJ A; 1IZ6 A; 4ELZ C; 2KSS A; 3L2Q A; 2DPP B; 5FU6 B; 4D6W A; 4CI0 C; 1R0C B; 3CMA A; 5J3B A; 3EG9 B; 4OGE A; 2ROL A; 2RI2 A; 4C8Q D; 4QVC A; 1CKB A; 1H3H A; 2QQS A; 4C8Q A; 1RAE B; 3MEV A; 1G2B A; 2QEX A; 4C8Q G; 1FMV A; 1SPK A; 1TUG B; 2BTT A; 2VXF A; 1KG1 A; 2QAZ A; 1QVG A; 4IIM A; 3ASK A; 3MKD A; 3M0S A; 2RM4 A; 1JXM A; 1MMG A; 3QUI A; 2RHU A; 2J7I A; 2YLB A; 2GFA A; 1KC8 C; 3SWN A; 5DLO A; 3JB9 F; 1X01 A; 2JS2 A; 4DBH A; 5FLX E; 1VQ6 T; 3ZEH A; 4XTY A; 2CRE A; 4E7J A; 2QEX Q; 1RAG B; 2KRO A; 2HSP A; 4X34 A; 5CIU A; 3CD6 T; 1FYN A; 1VQN A; 1KJW A; 2BE9 B; 4XU1 A; 3JCM e; 2B8A A; 3TSZ A; 2KBT A; 3RUX A; 2AIR B; 4XTW A; 2JTF A; 3G7Z A; 1M9S A; 2KYB A; 1BI2 A; 2K9G A; 4J9I A; 1V1C A; 3EFO A; 3OW2 P; 3REB B; 1YHQ A; 1NPR A; 1V29 B; 4OF1 A; 3CCR T; 2DL4 A; 2JUF A; 3A8M B; 1SRL A; 1BU1 A; 1YCS B; 2KVQ G; 1RI9 A; 3QZ5 B; 1WNL A; 3LGL A; 3QKJ A; 1VOM A; 1VQP T; 2RHY A; 1VQN Q; 1FMK A; 1M2V A; 4QQG A; 3BY7 A; 2LCS A; 4F16 A; 1RAH B; 4CC7 A; 2DYB A; 3EFR A; 4PLL A; 4FW2 A; 2OTJ T; 1NJI C; 2X51 A; 1GCQ C; 4J83 A; 2GFU A; 1YHQ Q; 1B34 A; 1SHF A; 4MDW A; 4M75 D; 4C8Q B; 3A8H B; 4MZM A; 1AHJ B; 1WJQ A; 3VYH B; 2K79 A; 4M75 A; 2DF6 A; 2ZZD A; 1TG0 A; 1OYX A; 3OW2 S; 1OPL A; 4PLI A; 5GAM f; 1VQ5 T; 2H3E B; 2LT4 A; 4HCZ A; 1ZSZ A; 1VQ7 T; 1ZUU A; 1D09 B; 4FYW B; 5A0G A; 3UT1 A; 4FYV B; 3HPW A; 3JCM c; 3CBP A; 1VQ9 Q; 3CCJ T; 3MJX A; 1JQQ A; 2M0O A; 1JB0 E; 2XK0 A; 1WXT A; 4E2F B; 3MP1 A; 3SEM A; 1D1B A; 1W2B P; 4HXJ A; 2DJQ A; 4ZN1 A; 4E47 A; 1C0M A; 1JJ2 A; 4PNO A; 4M7A D; 5GAN 5; 1GXI E; 1TS9 A; 4M7A A; 2KE9 A; 1UFF A; 3OYB A; 2E10 A; 2I0N A; 4M7A G; 3A98 A; 2P0K A; 2CZ0 B; 2KRS A; 5FRO A; 1PHT A; 4Q5W A; 2O9V A; 2BKD N; 1AZE A; 3EFO B; 3EHQ A; 1WA7 A; 2DVJ A; 4CC3 A; 3J80 E; 2EKH A; 2QTX A; 3CXC P; 2EGA A; 2GF7 A; 2ZPF B; 2GTJ A; 5LJ5 e; 2H3J A; 3I9Q A; 1PD0 A; 1Y96 B; 2RQT A; 1MGQ A; 3GP8 A; 4C92 D; 3I56 T; 4NS5 A; 2EYQ A; 3G4S A; 3MEW A; 4WF2 A; 5CKH A; 3ZL7 C; 4C92 A; 2CKK A; 1W2B S; 5D6Y A; 7AT1 B; 5D6W A; 2SRC A; 1Q82 C; 3WVE B; 2A3L A; 1KC8 U; 5C0M A; 1YIJ A; 2L2P A; 1LJO A; 2OTL T; 1OOT A; 3Q1J A; 1TUD A; 2DER A; 3UWN A; 2G6F X; 5HK0 A; 2ZGW A; 1P92 A; 1IGQ A; 4JDS A; 5KE3 A; 2VUB A; 4J9F A; 2JM8 A; 4XQ3 A; 3G4S Q; 1ZSZ B; 5FU7 C; 4ZGD B; 1ZLM A; 2DK3 A; 3HRS A; 3FRN A; 1RUW A; 2FZG B; 1BIA A; 3M58 A; 2E41 A; 5KCO A; 1HYO A; 1Z9Q A; 3CCQ A; 2YUO A; 2BIV A; 3QYG B; 2QQR A; 1YIJ Q; 2XU8 A; 1HD3 A; 2VAS A; 2ZPG B; 2DL5 A; 4FIB A; 5KE2 A; 2EQI A; 4PJO D; 3RKY A; 3HRT A; 1MHN A; 4PJO A; 3RR6 A; 5GAM h; 2E12 A; 1SF9 A; 4PJO G; 2X4W A; 2CZ7 B; 2DZ9 A; 3VS5 A; 2W0Z A; 1K73 R; 3CCL Q; 3QJ6 A; 4X9C A; 3OQ5 A; 1VQM T; 1NJI U; 4J5Y A; 2G3R A; 2KQW A; 1BCO A; 4XK8 E; 3TVT A; 2QGG A; 2NUT A; 1W1F A; 1RAF B; 4KBM B; 4OMN A; 3QJY A; 5CKE A; 1YN8 A; 3TQ7 P; 1K9M U; 1VQO T; 5HCK A; 2FPD A; 5DM7 R; 4OMP A; 1IO6 A; 4QW2 A; 3LW5 E; 3TCJ A; 2KY9 A; 1QP2 A; 1C1A A; 4LD9 K; 5HKC A; 4M77 D; 5M9O A; 2CP6 A; 4M77 A; 3OYF A; 3QBY A; 3CMA T; 2JM9 A; 3QG1 A; 2FRW A; 2E64 A; 2K5L A; 4EMK C; 4M7D C; 3M4Y A; 2LC4 A; 2CP5 A; 4M78 D; 4DBF A; 1TXQ A; 2E5Q A; 3IQL A; 1IB8 A; 2YRD A; 1ZBX A; 2F5K A; 4M78 A; 1K8A C; 3UA7 A; 2DBK A; 3MO8 A; 3CQT A; 3OYJ A; 2ABL A; 2XD0 A; 2AK5 A; 3EH1 A; 5CQY A; 3C95 A; 4BY6 C; 4NL3 A; 3RKX A; 4IUP A; 3CCV Q; 3V7S A; 3CME A; 1NZ9 A; 4XU3 A; 3OY9 A; 4A4K A; 5LJ3 e; 2K6D A; 4AFZ C; 3V8K A; 1X27 A; 2NUP B; 4XTU A; 4IIO A; 3GPL A; 1VQN T; 2DL7 A; 1OU8 A; 2MMP A; 4JJC A; 4PJO B; 4HKE A; 3R6N A; 1KD1 C; 2OAW A; 4PKC C; 4FM4 B; 3O8V A; 3JB9 I; 5FWC A; 1SHG A; 3CC4 Q; 1HXD A; 2FHD A; 3CME Q; 1YJW Q; 2ZPH B; 1Q82 U; 3HP9 A; 2A0F B; 2NUT B; 3FC3 A; 4QQD A; 1Q86 R; 2QQA A; 2J6F A; 3VS6 A; 3E2U A; 1GL5 A; 3BFM A; 4Z8A A; 1AWO A; 4ZNX A; 2IIM A; 2ZCF B; 2XKO C; 3X24 B; 4NL2 A; 3FJP A; 5KYW B; 2RHI A; 3CC2 A; 4XAX B; 1YWO A; 4J6W A; 4AMC A; 1K0S A; 1N6A A; 1UJY A; 2RJE A; 2EVR A; 5IAY A; 2R58 A; 2F69 A; 4RTW A; 3CCS T; 5A0L A; 3S6W A; 2EGE A; 4QKU A; 2WAC A; 3JCM f; 1H64 1; 1ZA1 B; 1B07 A; 4PJL A; 4DBQ A; 3VYG A; 2JW4 A; 4KRT A; 1NYG A; 3G1J A; 5IHI A; 3ME9 A; 2KNB B; 5GAM j; 3CC2 Q; 4PJN A; 2QXF A; 4B9X A; 3EG3 A; 3JCM V; 1GBR A; 1I5L A; 4F7U G; 1PD1 A; 1M90 C; 1AT1 B; 2EPD A; 5I21 A; 4J8O A; 1JRI A; 2M1H A; 4ORZ A; 2KXD A; 3GLX A; 3M59 A; 3OSV A; 4OMQ A; 4KUI A; 1YCY A; 3FB9 A; 4R56 A; 3QYH B; 3RNJ A; 5FRM A; 1SEM A; 2DTI A; 1X2Q A; 1PCX A; 3MHX A; 1M2O A; 2RQV A; 2MI6 A; 1QCF A; 1NLO C; 3E1S A; 1QQJ A; 3M4G A; 2MCN A; 2YSQ A; 4BE0 A; 2KT1 A; 1YJ9 Q; 5GJV B; 1VQL A; 3DB4 A; 4C0D C; 2WSF E; 3L2U A; 1I07 A; 2DD4 A; 3OYE A; 3INZ A; 1K8A U; 3PMI A; 4RG2 A; 3CCM T; 3DLM A; 2DAQ A; 8ATC B; 2YT6 A; 1F1B B; 2K2V A; 2HQX A; 4MML A; 2GNC A; 3LX7 A; 2LNV A; 1NLP C; 2QQ9 A; 5GMK m; 4A53 A; 1UTI A; 1S1N A; 1I81 A; 1V76 A; 2XMF A; 1ZUY A; 4FL6 A; 4C0Z A; 2YUN A; 3MET A; 4F14 A; 4QVZ A; 2DX1 A; 1KHC A; 4J7I A; 2YLC A; 1X6O A; 1BK2 A; 3CCU Q; 4A4G A; 2DXC A; 2GBQ A; 3M0R A; 2LQ8 A; 2IVW A; 1ARK A; 1X69 A; 2FG0 A; 3ZFJ A; 5IXB A; 2HSE B; 1BYM A; 3C94 A; 2XG8 D; 2XI9 A; 1H8K A; 2DIQ A; 3NHN A; 2HZY A; 1LPL A; 2YUQ A; 2DL3 A; 3M5A A; 4A54 A; 3CCQ T; 1BKB A; 3LH0 A; 4F7U B; 4PFZ A; 1T3S A; 1UJ0 A; 2HL3 A; 1OQK A; 1WQ7 A; 3RES A; 2COZ A; 4FYY B; 2MAM A; 2RMO A; 3JCM P; 5CK9 A; 4Z88 A; 1UGS B; 2WSC E; 2D8H A; 2B86 A; 2VVK A; 3JCM h; 1M27 C; 4ZGJ B; 4BB7 A; 1VYT A; 2A37 A; 5CR2 A; 1OU9 A; 1ZBJ A; 2YXY A; 2A7Y A; 5LJ5 d; 1TOV A; 2K2M A; 2V8I A; 5GAO m; 5L23 A; 1G5V A; 1KQS S; 2DM1 A; 4JRQ A; 1PRL C; 1SG5 A; 1EFN A; 1GCQ A; 3HSB A; 3EAE A; 2HKN A; 3DKM A; 4PJM A; 2FZK B; 2KRM A; 5LJ5 g; 2A36 A; 4KGZ B; 3JCM J; 4DEY A; 1H3Z A; 2F2W A; 4O6J A; 3HFN A; 4C0G A; 1B7T A; 2DMO A; 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