The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
9
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sequence length |
59
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structure length |
59
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Chain Sequence |
STLFEALYDYEARTEDDLSFHKGEKFQILNSSEGDWWEVRSLTTGETGYIPSPYLAPVD
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structure of an intermediate state in protein folding and aggregation.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Tyrosine-protein kinase Fyn
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| molecule tags |
Transferase
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| source organism |
Gallus gallus
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| total genus |
9
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| structure length |
59
|
| sequence length |
59
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| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 2012-02-06 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2CRE A; 2HBW A; 5IH2 A; 2RNA A; 2LQN A; 5IXF A; 3VRY A; 2HDA A; 2KGT A; 2DYB A; 2O88 A; 1A0N B; 2OAW A; 2V1R A; 3M0R A; 2O9V A; 1S1N A; 5ECA A; 2RMO A; 2EGE A; 2LNH B; 1AZG B; 1GBQ A; 1JXM A; 4RUG A; 2F2W A; 2KT1 A; 1V1C A; 2I0N A; 3VS7 A; 1SRL A; 2YSQ A; 2NUZ A; 3UF4 A; 5L23 A; 2H8H A; 1T3S A; 2VKN A; 4LUE A; 1JEG A; 1QWF A; 2LP5 A; 1PRL C; 1YCS B; 4Z88 A; 5IHN A; 2XMF A; 3EG3 A; 1YN8 A; 4CC7 A; 2LJ0 A; 1FYN A; 4Z8A A; 2M51 A; 1I1J A; 3M0S A; 4X1V A; 2AZS A; 1GRI A; 4WCI A; 2J05 A; 4J9H A; 2ED0 A; 4Y92 A; 2FEI A; 3M0U A; 1GBR A; 1YWO A; 3LH5 A; 2DJQ A; 1HD3 A; 2MCN A; 2FRW A; 1YP5 A; 1U5S A; 2D0N A; 1QKW A; 4DEY A; 1ABQ A; 1KFZ A; 3H41 A; 2K7A A; 2J6O A; 2X3X D; 1WFW A; 3M0T A; 3A98 A; 4AFZ C; 1GCQ C; 4IIO A; 2FPD A; 3EHR A; 2B86 A; 4F17 A; 2A37 A; 2EVR A; 1QKX A; 1RLQ C; 4J9C A; 2GGR A; 3M0P A; 1UG1 A; 1X6B A; 2KT8 A; 2JXB A; 1WYX A; 3CQT A; 1UGV A; 2KE9 A; 2O31 A; 1OV3 A; 1JO8 A; 1GFC A; 2DLP A; 2DIL A; 2DE0 X; 2D8J A; 2RN8 A; 4OMQ A; 2KRS A; 1YNZ A; 2KNB B; 2D1X A; 2VVK A; 2ESW A; 2J06 A; 3H0F A; 1H3H A; 1B3Q A; 2EGC A; 2RQU A; 1BK2 A; 1AWW A; 2KRN A; 4RTY A; 1AD5 A; 1UFF A; 2JS2 A; 1J3T A; 1AWX A; 1GFD A; 2RQT A; 3QWY A; 3KFV A; 2AKL A; 2GTJ A; 2GNC A; 1G2B A; 1WXB A; 1NLP C; 4E6R A; 1NEB A; 1KSW A; 2L2P A; 1X2K A; 1Z9Z A; 2DBM A; 1Y0M A; 1U3O A; 1WI7 A; 2EYW A; 2NWM A; 1LCK A; 1FMK A; 1VA7 A; 2L3S A; 3SHW A; 3I5R A; 1SSH A; 4ESR A; 2L3P A; 4RTU A; 3VS2 A; 4F14 A; 2CUD A; 1UHC A; 4ORZ A; 3I9Q A; 4OMP A; 2F2X A; 2HSP A; 1SPK A; 1B07 A; 2OJ2 A; 4CC3 A; 1U06 A; 1QLY A; 2BZX A; 1MUZ A; 2LCS A; 2YT6 A; 5FWB A; 1K0S A; 2EQI A; 3C0C A; 4J9E A; 2FRY A; 1X27 A; 2D8H A; 2FG0 A; 2JW4 A; 4HVW A; 2L0A A; 5I11 A; 3THK A; 2LJ3 A; 5IXB A; 2DX1 A; 4AFU C; 1OEB A; 1UTI A; 2EW3 A; 3EGU A; 3O5Z A; 2M0Y A; 1X43 A; 1SEM A; 1MV3 A; 1ZBJ A; 1PNJ A; 1M3B A; 1NLO C; 2GQI A; 1ARK A; 2CT3 A; 2K3B A; 1T0J A; 2ROL A; 2JTE A; 2RQV A; 2CSI A; 1JU5 C; 2AZV A; 3ULR B; 1E7O A; 1AVZ C; 1ABO A; 2G6F X; 3VS6 A; 3I35 A; 4DEX A; 2HEQ A; 2MOX A; 3VRZ A; 4J9D A; 1JXO A; 1NYG A; 1PRM C; 3REB B; 2LX7 A; 3UA6 A; 4OMO A; 3SEM A; 1ZLM A; 2YUP A; 1X2Q A; 4ZNX A; 3UAT A; 1WLP B; 1OPL A; 3GBQ A; 4Z89 A; 3TSW A; 4RTZ A; 1K76 A; 1X6G A; 5GJV B; 2K79 A; 1ZSG A; 3PVQ A; 4AG2 C; 2CH4 W; 2EYY A; 2EYX A; 2OI3 A; 1UJ0 A; 4GLM A; 2DRK A; 2KYM A; 5IHI A; 2DL5 A; 1HSQ A; 2ABL A; 2CT4 A; 1GL5 A; 3IQL A; 1ZUU A; 4JJC A; 4HVU A; 3VS5 A; 4OML A; 3NHN A; 2SRC A; 2HCK A; 2DM1 A; 1XOV A; 3VS4 A; 1IO6 A; 2RQR A; 1AOJ A; 5FWC A; 3U23 A; 1UJY A; 2DNU A; 4LE9 A; 4D8K A; 2O9S A; 1PKS A; 1WDX A; 1BB9 A; 4LN2 A; 2PNI A; 3ZL7 C; 1RI9 A; 2GBQ A; 4JPB W; 1SRM A; 1UDL A; 1NG2 A; 5HCK A; 4RTV A; 5FW9 A; 1Z9Q A; 1VYT A; 2C0I A; 1WX6 A; 3JV3 A; 1KIK A; 1SHG A; 1E6H A; 1TUC A; 2CDT A; 4K11 A; 4AFS C; 2EBP A; 3NPF A; 2DL7 A; 1RUW A; 1K9A A; 4JJD A; 1AWO A; 1PHT A; 2ENM A; 2JMC A; 1WXU A; 3PVL A; 2CUB A; 4LUD A; 3EHQ A; 3NMZ C; 1M30 A; 1YWP A; 2PTK A; 2YUO A; 4M4Z A; 2JS0 A; 2F2V A; 1AWJ A; 2ECZ A; 2JM8 A; 2KR3 A; 4HCK A; 4RTT A; 2KYB A; 2LMJ A; 2EPD A; 2LQW A; 1W70 A; 2DL3 A; 4CC2 A; 1I0C A; 4OMM A; 2JT4 A; 1M3C A; 3TVT A; 2RPN A; 2W0Z A; 5EC7 A; 5IHK A; 1K4U S; 2C0O A; 2DVJ A; 3PE0 A; 2KBT A; 2BTT A; 1CKA A; 2YDL A; 3H0H A; 4JJB A; 4IIM A; 4AFQ C; 2DL4 A; 2DMO A; 2EGA A; 1GCP A; 1I07 A; 4HXJ A; 4J9I A; 4J9B A; 2V1Q A; 1W6X A; 2DRM A; 2KXC A; 1Y57 A; 1N5Z A; 2P4R A; 2A28 A; 2L3Q A; 2AKK A; 2PZ1 A; 2LZ6 B; 4KRT A; 4J9F A; 2ED1 A; 2CSQ A; 2JM9 A; 1H92 A; 1UHF A; 4JZ3 A; 3VS1 A; 2J6F A; 4QT7 A; 2RF0 A; 3H0I A; 2KRO A; 2IIM A; 2C0T A; 1ZUY A; 1NEG A; 4F16 A; 2LJ1 A; 1RLP C; 2J6K A; 3TSZ A; 4D8D A; 1PWT A; 1UE9 A; 1BU1 A; 3I5S A; 1PKT A; 1NM7 A; 4RTW A; 4R0K A; 2A36 A; 3UA7 A; 1OPK A; 2RQW A; 1KJW A; 1QCF A; 1JQQ A; 4A63 B; 4RTX A; 1WIE A; 1UEC A; 1T3L A; 3EG1 A; 2VWF A; 1CKB A; 2J7I A; 1BBZ A; 1NYF A; 3M0Q A; 3VS0 A; 2BZY A; 4HVV A; 2K2M A; 1M27 C; 1K1Z A; 4J9G A; 3QWX X; 2FO0 A; 2YUQ A; 1UUE A; 1H8K A; 2DL8 A; 4EIK A; 1W1F A; 3NGP A; 2DBK A; 1VYU A; 2BZ8 A; 1X69 A; 2QDL A; 5GJW B; 1T0H A; 2GTO A; 2O2O A; 2K9G A; 2FPF A; 3EG0 A; 3REA B; 1AEY A; 1K0X A; 3RBB B; 3EG2 A; 1MV0 B; 2E5K A; 2DA9 A; 2KXD A; 4CC4 B; 4OMN A; 2AK5 A; 2A08 A; 1QWE A; 4GBQ A; 2ROT A; 2W10 A; 4LNP A; 2JMA A; 1ZX6 A; 1G83 A; 1E6G A; 2YUN A; 1CSK A; 2DF6 A; 1OOT A; 1TUD A; 2EKH A; 1HJD A; 2K6D A; 1SHF A; 2X3W D; 1AZE A; 1VYV A; 1EFN A; 2FPE A; 3RNJ A; 1ZUK A; 2KEA A; 4JZ4 A; 3R6N A; 2SEM A; 4AG1 C; 1GCQ A; 2CH4 A; 1M8M A; 2MIO A; 5I22 A; 3VS3 A; 3FJ5 A; 1WA7 A; 1TG0 A; 2EYZ A; 4FSS A; 1WXT A; 1M3A A; 2KRM A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2CRE A; 2RNA A; 4NL3 A; 3A5Z B; 3E9F A; 3JCM d; 3VRY A; 2PVD B; 2EYQ A; 2QAS A; 2O88 A; 2X4J A; 1M8V A; 1LJO A; 5ECA A; 4M77 A; 2LNH B; 1JXM A; 3VJP A; 3OW2 S; 4RUG A; 1V1C A; 1WHJ A; 3CCM A; 2YSQ A; 2CP6 A; 3GNF B; 4X9C A; 1KHC A; 3L42 A; 4LUE A; 1G5V A; 1QWF A; 1YHQ T; 2LP5 A; 1QVG A; 4Z88 A; 2YWW A; 4OB1 B; 3JCM g; 2EKO A; 2KK4 A; 2DXC A; 1VQ9 T; 2XMF A; 3CCS A; 2RK1 A; 1YN8 A; 4CC7 A; 2DD4 A; 2AZS A; 5CKE A; 5D6Y A; 3FB9 A; 3URG A; 4M7A E; 3CCE Q; 4PJO A; 1GBR A; 1YWO A; 2QEX A; 1S72 Q; 2FZC B; 4M78 C; 4C0D B; 3RKY A; 3VUZ A; 4BE0 A; 1U5S A; 2QQ9 A; 3UT1 A; 1R77 A; 1VQ6 A; 4DEY A; 1OZ3 A; 4RG8 A; 2J6O A; 4AFZ C; 2FPD A; 4F7U F; 3QXE B; 4F17 A; 3KUF A; 1RLQ C; 4J9C A; 2GGR A; 2XI9 A; 4KGX B; 4ZTJ A; 5GMK l; 1OV3 A; 1JO8 A; 1GFC A; 2DLP A; 2DYI A; 2QGG A; 1VQK A; 1PCX A; 2DIL A; 4EMK A; 4M7D F; 2HL5 C; 3V7C A; 3NTI A; 3QDR B; 4BY6 C; 2KNB B; 2D1X A; 3G4S T; 1TS9 A; 3CC7 T; 1VQM Q; 3I56 Q; 3SFM A; 2ESW A; 5A0G A; 2DO3 A; 3QG1 A; 4UC4 A; 2LRQ A; 2EGC A; 2RQU A; 1BK2 A; 1AWW A; 1JJ2 S; 3ZEH A; 1YJ9 T; 1AD5 A; 1UFF A; 1AWX A; 3EFO A; 3QWY A; 3KFV A; 2AKL A; 4PLL A; 1G2B A; 3HTR A; 2E10 A; 1D3B B; 3F70 A; 4KGZ B; 1Z9Z A; 1U3O A; 1NJI C; 5GAO n; 2NWM A; 1FMK A; 3SDZ A; 3I5R A; 4RTU A; 3VS2 A; 2QA4 T; 1RI0 A; 4ORZ A; 3CCQ T; 1VQ7 A; 2F2X A; 3OYA A; 4XAX B; 2AIR B; 2EAY A; 1FWZ A; 4CC3 A; 1VQ4 A; 3LYI A; 3QZ5 B; 2NUT A; 3CMA T; 4M77 F; 2ZPG B; 4M77 D; 3C0C A; 3QO3 A; 2HAX A; 1X27 A; 3L2Z A; 3LLR A; 4C8Q A; 2E1H A; 2A3L A; 3RUX A; 2B8A A; 2E3I A; 2L0A A; 5CO7 A; 1M90 C; 4PK4 A; 3CD6 T; 5I11 A; 4BE1 A; 2DX1 A; 2I2L A; 2IVW A; 2EW3 A; 4C0Z A; 1WHH A; 3C94 A; 4PJL A; 3HFO A; 1M9S A; 4BE2 A; 4FYY B; 4M7D C; 2GQI A; 4KUL A; 4N4H A; 2CT3 A; 2QXF A; 5FRO A; 5HY6 A; 4PJO D; 2JTE A; 2CSI A; 4JRP A; 2XHC A; 1I5O B; 2F5T X; 2RHZ A; 1S72 A; 2YHT A; 3VRZ A; 4J9D A; 1NYG A; 2PUO B; 3S3O A; 3REB B; 4C92 A; 2LX7 A; 3UA6 A; 4OMO A; 2HKQ B; 1M1K R; 2EFI A; 4FYV B; 2MYS A; 1WLP B; 2JOY A; 2X4W A; 4DOW A; 2K79 A; 1ZSG A; 3PVQ A; 3BW1 A; 2CH4 W; 2EYY A; 3M59 A; 5A0L A; 2JJ9 A; 5IN1 A; 2LT1 A; 2OTL T; 3JCM J; 1HSQ A; 3M9Q A; 1ZUU A; 1M1G A; 2VAS A; 3NHN A; 2HCK A; 4FM4 B; 1XOV A; 5HK0 A; 4A4H A; 3EG9 A; 5KYW B; 2NUP A; 4LE9 A; 2O9S A; 4KUD K; 1WDX A; 5GAN 2; 2YLC A; 1BB9 A; 2QQS A; 3SB2 A; 3OW2 A; 2PNI A; 4MDW A; 1V76 A; 2GBQ A; 5GAO l; 1UDL A; 1NG2 A; 3CCR T; 1HXD A; 1N27 A; 5FU6 C; 4ZGJ B; 1C6V X; 1RL2 A; 3L2Q A; 1Y7X A; 2DL7 A; 3ZFJ A; 3GP8 A; 2RHU A; 1XTD A; 4L5G A; 2VXE A; 5D6X A; 1WGS A; 4A4G A; 4C0F A; 1WZO A; 2CUB A; 3T9N A; 1W2B S; 4OGC A; 1WNL A; 3MEV A; 1M30 A; 2ZPI B; 3BDL A; 2FL7 A; 2KY9 A; 2F2V A; 1AWJ A; 4HCK A; 3OYH A; 3CPW S; 3CD6 Q; 3M56 A; 1KQS P; 1YHQ A; 2RI5 A; 3HRU A; 3BFM A; 3TU4 K; 4M7A C; 4C8Q F; 4ZGE B; 4C8Q D; 3LWH A; 4V2S A; 1PC0 A; 2CGH A; 2FZK B; 1CKA A; 3H0H A; 2XKO C; 4FL6 A; 4J9I A; 2CZ7 B; 1BIA A; 2EIF A; 1VQ5 Q; 1TXQ A; 2XK0 A; 2GF7 A; 5IT9 E; 1BI0 A; 1N5Z A; 2DTO A; 1VQL Q; 3PIP A; 3PTA A; 3L1A A; 2AKK A; 4JLG A; 4KRT A; 4BI4 A; 1UGS B; 1JJ2 A; 3V8K A; 4C92 D; 2JN0 A; 1YIT Q; 1RAD B; 1H92 A; 3GOX A; 1UHF A; 2AHJ B; 1N9S A; 1D09 B; 1ACM B; 1RAI B; 1TTH B; 2C0T A; 1P92 A; 1ZUY A; 3EH2 A; 4HKE A; 4PFP A; 2J6K A; 3TSZ A; 1UE9 A; 3G4S A; 2DEQ A; 3CC7 A; 1JRI A; 3QII A; 4RTW A; 4R0K A; 2EWN A; 4DBQ A; 3OYB A; 3L2W A; 3JB9 F; 2M9U A; 3JB9 D; 4HCB A; 1QCF A; 5KH6 A; 3I55 T; 1YJ9 A; 1Y07 A; 2M1H A; 4KH1 B; 1VIE A; 4ANJ A; 5GAN e; 2K2M A; 5I2S A; 4FYW B; 5GMK e; 2FO0 A; 4E47 A; 5GAN h; 2GCX A; 2LTO A; 5D7U A; 3BDU A; 5GMK h; 1VYU A; 2BZ8 A; 1X69 A; 2QA4 A; 1MMA A; 2CKK A; 4ELZ C; 3CCQ A; 2FPF A; 3PMI A; 3CCU T; 2EQM A; 3OYM A; 3RBB B; 4FCY A; 4RMO A; 2E5K A; 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3CPW A; 2QGF B; 1ABQ A; 3H41 A; 3CCR A; 5CQY A; 2K7A A; 5LJ3 g; 3D7S B; 3M0T A; 5GMK j; 3HSB A; 3OS0 A; 1YI2 T; 2JNG A; 4IIO A; 2BKD N; 3PT9 A; 1WQW A; 1QKX A; 5LL6 S; 1RAH B; 3NTK A; 1KG1 A; 3M0P A; 1VQN T; 4IUU A; 1UG1 A; 1X6B A; 2JXB A; 1WYX A; 3CQT A; 2KE9 A; 3MHX A; 1MMN A; 2DE0 X; 5LJ5 f; 2D8J A; 2RN8 A; 3QHS A; 3R6O A; 1QVG P; 1VIF A; 1OU8 A; 4C5I A; 2DXB A; 4M7D A; 2VVK A; 4B6M A; 1M4Z A; 2K3Y A; 1Y96 B; 2J06 A; 1F1B B; 4M78 F; 4M78 D; 4RTY A; 1J3T A; 2RQT A; 3QZ9 B; 2GTJ A; 2ZPF B; 1WXB A; 1RAF B; 4L59 A; 4C0D C; 2DBM A; 1UEB A; 3JCM e; 1Y0M A; 3EGD A; 2EYW A; 1ZA2 B; 1VA7 A; 4A4F A; 2DZ9 A; 3SHW A; 5GAM f; 1QVF S; 1D1C A; 1VQ7 Q; 1B34 B; 3EH1 A; 5LJ3 f; 2LVM A; 1K8A R; 2HSP A; 1SPK A; 1VQ4 Q; 4WTO B; 2Y4Y A; 2D0Q B; 2BZX A; 4E7K A; 1Q86 U; 1MUZ A; 5GAN 8; 2E3H A; 1KC8 U; 4DBF A; 2VGN A; 4MDX A; 3QJY A; 2E12 A; 2BUD A; 1MNE A; 4KT0 E; 1RAC B; 2DD5 A; 1FMW A; 2FG0 A; 4PLI A; 2V8K A; 1KD1 U; 5CIU A; 4EMG A; 2LJ3 A; 1VQO Q; 3OYY A; 1C1A A; 3G71 Q; 3G6E T; 3EGU A; 1IHV A; 1X43 A; 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