The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
5
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sequence length |
74
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structure length |
74
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Chain Sequence |
MTRWVPTKREEKYGVAFYNYDARGADELSLQIGDTVHILETYEGWYRGYTLRKKSKKGIFPASYIHLKEAIVEG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Apoptosis
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| source organism |
Mus musculus
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| publication title |
Solution structure of the SH3 domain of DOCK180.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Dedicator of cytokinesis protein 1
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| total genus |
5
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| structure length |
74
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| sequence length |
74
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2012-11-08 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF14604 | SH3_9 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2HEQ A; 2GTJ A; 2HCK A; 2V1Q A; 2OI3 A; 1OPL A; 2J7I A; 4CC2 A; 4DEY A; 2JTE A; 2RQR A; 4AG1 C; 3C0C A; 3H0H A; 2EYX A; 1SRM A; 2C0O A; 1UDL A; 1M30 A; 1W1F A; 3CQT A; 2W10 A; 2DF6 A; 1X2K A; 3VS7 A; 3UA6 A; 2RMO A; 1BB9 A; 1T3S A; 4IIO A; 1UE9 A; 1JXO A; 2KEA A; 2M51 A; 1AZE A; 3NPF A; 2DM1 A; 4DEX A; 1UJ0 A; 2KR3 A; 1GL5 A; 2JMA A; 1ABQ A; 1A0N B; 2LJ0 A; 2LX7 A; 1WYX A; 4GBQ A; 2CUD A; 1LCK A; 1M3B A; 1BK2 A; 1ZSG A; 1YWO A; 2BTT A; 4QT7 A; 2LP5 A; 2YDL A; 4R0K A; 2CH4 W; 3O5Z A; 5FW9 A; 2EGE A; 3A98 A; 2RN8 A; 1ZUK A; 2ESW A; 3VRY A; 1JEG A; 3VS5 A; 2EGC A; 2MOX A; 2AK5 A; 2DJQ A; 1GCP A; 1VYV A; 2C0I A; 4HCK A; 2AKL A; 2GBQ A; 4CC3 A; 4OMP A; 5FWC A; 2YT6 A; 1ABO A; 2BZ8 A; 3H0F A; 2O9S A; 3RNJ A; 2SRC A; 2ED0 A; 2IIM A; 2DYB A; 2DL4 A; 1AD5 A; 2PZ1 A; 4EIK A; 4RTW A; 2GQI A; 4J9D A; 4J9I A; 2A36 A; 4J9G A; 1T0H A; 2EYZ A; 3EGU A; 5EC7 A; 3TSZ A; 3PVL A; 3THK A; 2K6D A; 4WCI A; 2ENM A; 4JZ3 A; 1YWP A; 2RF0 A; 1IO6 A; 1B07 A; 1OV3 A; 4ORZ A; 1JXM A; 1PWT A; 1YNZ A; 5IHN A; 4AFS C; 1NEB A; 2DNU A; 4HXJ A; 4AFZ C; 2F2X A; 2RQV A; 4J9B A; 1HD3 A; 1AVZ C; 2LCS A; 4RTU A; 2JM9 A; 1MV3 A; 1PKS A; 1PRM C; 5IXF A; 2O88 A; 2MIO A; 1KFZ A; 1S1N A; 1SEM A; 4F14 A; 1NYG A; 1Z9Z A; 2FRY A; 2K2M A; 2LJ1 A; 4J9H A; 2KRM A; 2LMJ A; 4JZ4 A; 4D8K A; 1K4U S; 2D8H A; 1X2Q A; 1WA7 A; 2JMC A; 2A28 A; 4JPB W; 1CKB A; 4A63 B; 1U3O A; 1QKX A; 2K79 A; 2DA9 A; 1SHG A; 3U23 A; 1OPK A; 1PHT A; 1RI9 A; 4F16 A; 4OMQ A; 1KJW A; 1SSH A; 4LUE A; 1Z9Q A; 2F2V A; 1NG2 A; 4Z88 A; 2LNH B; 1HSQ A; 2FPD A; 3UF4 A; 1AOJ A; 1QWE A; 1WDX A; 1BU1 A; 2O9V A; 2JS0 A; 1N5Z A; 1WX6 A; 1YCS B; 1J3T A; 1GFD A; 1UHC A; 1WXU A; 1GFC A; 1PKT A; 2GNC A; 3EHR A; 2O2O A; 1CSK A; 1U06 A; 2DIL A; 1WI7 A; 4KRT A; 2OJ2 A; 4J9F A; 2DRK A; 1GBQ A; 3GBQ A; 2PNI A; 2EW3 A; 2VKN A; 2DVJ A; 2EQI A; 1NEG A; 1ZUY A; 1T3L A; 2ROT A; 1UJY A; 1NYF A; 1K76 A; 1TUC A; 2GTO A; 1TG0 A; 3REB B; 2D1X A; 2EGA A; 3VS1 A; 1H8K A; 1OOT A; 1K1Z A; 2D0N A; 3M0S A; 2HSP A; 1NM7 A; 1AWW A; 3IQL A; 2KGT A; 2AKK A; 3ZL7 C; 1RUW A; 1K9A A; 2RPN A; 2DE0 X; 1WFW A; 2CSI A; 2DBK A; 3SEM A; 1ZUU A; 4OML A; 1WXB A; 2L2P A; 2ED1 A; 3M0P A; 4X1V A; 1ZLM A; 2I0N A; 1SPK A; 2EYY A; 1KIK A; 2G6F X; 1QKW A; 3I5R A; 3I35 A; 2H8H A; 1RLP C; 5I11 A; 2JS2 A; 1X6B A; 3LH5 A; 2KBT A; 4HVV A; 4OMN A; 4Y92 A; 2L0A A; 3VS6 A; 2EYW A; 2J6F A; 2KRO A; 3TSW A; 4K11 A; 1ZX6 A; 1PRL C; 1ZBJ A; 5IXB A; 3TVT A; 1V1C A; 2DL8 A; 1MUZ A; 2J06 A; 3QWY A; 4GLM A; 3VRZ A; 4RTY A; 2L3Q A; 2XMF A; 4OMO A; 1T0J A; 1I1J A; 1X43 A; 2DRM A; 2OAW A; 1G2B A; 4JJB A; 2D8J A; 2KXC A; 1QWF A; 2BZX A; 4LNP A; 3RBB B; 2HBW A; 4ZNX A; 3VS4 A; 5HCK A; 2EKH A; 1NLO C; 2CH4 A; 1Y0M A; 3H41 A; 1TUD A; 1AWJ A; 2A08 A; 2W0Z A; 3PE0 A; 5GJW B; 3VS0 A; 1CKA A; 1PNJ A; 2C0T A; 2DLP A; 1WIE A; 2LJ3 A; 3ULR B; 2VWF A; 2KRS A; 2DL7 A; 2SEM A; 3H0I A; 3EHQ A; 2V1R A; 2LQW A; 3VS2 A; 1EFN A; 2X3W D; 1U5S A; 1YN8 A; 1YP5 A; 2FPE A; 2KYB A; 1AZG B; 4FSS A; 2RQW A; 3I5S A; 2J6O A; 2KXD A; 1UGV A; 2NWM A; 2ROL A; 3NHN A; 4AFQ C; 4D8D A; 2CRE A; 1WXT A; 1M8M A; 5GJV B; 1JU5 C; 1ARK A; 1M27 C; 2KYM A; 4RTX A; 1I07 A; 1H3H A; 3UA7 A; 1X6G A; 2YUP A; 1B3Q A; 2O31 A; 2EVR A; 3EG0 A; 2VVK A; 2LQN A; 4F17 A; 2CDT A; 3EG1 A; 4CC4 B; 2CT3 A; 4OMM A; 2GGR A; 1M3A A; 1GRI A; 2J6K A; 5IH2 A; 5L23 A; 4CC7 A; 2L3P A; 3M0R A; 3M0U A; 2M0Y A; 2K3B A; 4HVU A; 1VYU A; 4AG2 C; 3M0T A; 1SRL A; 3FJ5 A; 3REA B; 1UFF A; 1QCF A; 1M3C A; 2HDA A; 3M0Q A; 2JT4 A; 1MV0 B; 1FMK A; 1VA7 A; 5I22 A; 2YUO A; 1FYN A; 4Z89 A; 2CSQ A; 3R6N A; 1KSW A; 4RUG A; 2MCN A; 1E7O A; 1W70 A; 4Z8A A; 1XOV A; 1E6H A; 5ECA A; 1JQQ A; 1G83 A; 1AWO A; 5IHK A; 1UEC A; 1JO8 A; 1OEB A; 3PVQ A; 1AEY A; 1AWX A; 1GCQ A; 1SHF A; 2ECZ A; 1RLQ C; 2KT1 A; 1Y57 A; 4JJD A; 2EPD A; 4IIM A; 2YUN A; 2A37 A; 2QDL A; 2EBP A; 2RQT A; 4LN2 A; 4J9C A; 1E6G A; 1QLY A; 1UHF A; 2FO0 A; 1GCQ C; 3KFV A; 4AFU C; 2NUZ A; 1GBR A; 2B86 A; 5IHI A; 2ABL A; 2FPF A; 1VYT A; 1BBZ A; 3UAT A; 2FRW A; 4E6R A; 3EG2 A; 3JV3 A; 2PTK A; 2P4R A; 2LZ6 B; 1W6X A; 2DMO A; 3I9Q A; 3NMZ C; 2YUQ A; 4JJC A; 4M4Z A; 4RTZ A; 2KE9 A; 2AZV A; 4RTV A; 1UUE A; 1I0C A; 1X69 A; 1K0S A; 1NLP C; 5FWB A; 2FG0 A; 3NGP A; 2FEI A; 2K7A A; 2E5K A; 2AZS A; 2JW4 A; 4ESR A; 2F2W A; 4LUD A; 1K0X A; 2DL3 A; 2JM8 A; 2K9G A; 2JXB A; 4LE9 A; 2CT4 A; 1HJD A; 4HVW A; 2L3S A; 3VS3 A; 2YSQ A; 4J9E A; 3SHW A; 1UG1 A; 2J05 A; 2KNB B; 2X3X D; 1WLP B; 2DBM A; 2BZY A; 2RNA A; 3QWX X; 2KT8 A; 3EG3 A; 1H92 A; 2CUB A; 2KRN A; 2RQU A; 2DX1 A; 1UTI A; 4RTT A; 2DL5 A; 1X27 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2HEQ A; 2HCK A; 2OI3 A; 4C5G A; 2LRQ A; 3C12 A; 2QEX Q; 5KYY A; 4JDS A; 4AG1 C; 3OS1 A; 2DD4 A; 2XD0 A; 4BI3 A; 2FYK A; 4XU0 A; 1SRM A; 2C0O A; 1QW1 A; 1YJ9 T; 1W2B A; 1M30 A; 2XDP A; 1Q7Y R; 1ZQ1 A; 1R77 A; 3M53 A; 2W10 A; 1G8X A; 2PUO B; 3T9N A; 4WTO B; 2RHY A; 3UA6 A; 2RMO A; 3CCU T; 5CR2 A; 2CP0 A; 2PVO B; 2FZK B; 3CCJ Q; 5FU6 B; 5CKD A; 1JXO A; 1K8A C; 2XHC A; 3SWN C; 1TSF A; 3ASK A; 2DM1 A; 4DBQ A; 2KR3 A; 3M59 A; 3JB9 I; 4PJO F; 2JMA A; 1ABQ A; 2LX7 A; 3R6O A; 1R0C B; 4GBQ A; 2O01 E; 1LCK A; 2YWW A; 4QT7 A; 2LP5 A; 2YDL A; 3E1S A; 5KYY B; 3O5Z A; 5FW9 A; 1KHC A; 1MMN A; 1BCM A; 3G71 Q; 1PSF A; 2MOX A; 4M7A F; 4OGC A; 3HL8 A; 4EMK C; 1K8A U; 2F5T X; 4M7D D; 3MP8 A; 8ATC B; 1Q82 U; 1QP3 A; 1WJQ A; 2RJC A; 2HL3 A; 3OB9 A; 4EIK A; 1KQ1 A; 3OYH A; 4RTW A; 5GAN e; 3EFO A; 2MPX C; 3G1J A; 2GQI A; 4J9I A; 2AHJ B; 3JB9 H; 1KQS S; 5EC7 A; 3PVL A; 4LD6 A; 1YWP A; 2MWP A; 1B7T A; 4ZTJ A; 4ORZ A; 1N27 A; 2CP7 A; 5LJ5 g; 1JXM A; 1NEB A; 4E2F B; 3WXM B; 1UEB A; 2DTO A; 1BKB A; 1AVZ C; 5KYU A; 3QSU A; 3JCM V; 3PTA A; 5FU7 B; 2JM9 A; 5D7U A; 1XQH A; 2O88 A; 1S1N A; 1NYG A; 2LJ1 A; 5FRM A; 2K5I A; 2NUP B; 2QGF B; 4BE1 A; 3A8L B; 1TUG B; 1CKB A; 2FZG B; 2X4Y A; 1U3O A; 5KYW A; 2K79 A; 2E12 A; 2DA9 A; 3U23 A; 1OPK A; 3CCE A; 3ME9 A; 5LJ5 f; 1YJ9 A; 2DO3 A; 2RJF A; 3CBO A; 4LXC A; 4XK8 E; 1M1K R; 2V26 A; 3JCM b; 2KK4 A; 1O75 A; 3UF4 A; 3CC7 Q; 1WHM A; 1AOJ A; 1WJS A; 4E7K A; 2JS0 A; 3CCU A; 1N5Z A; 2L5Q A; 1J3T A; 2VXE A; 5GAM j; 1S72 A; 1VQK Q; 4JRI A; 1VQN T; 3EHR A; 5AYF A; 3X24 B; 1U06 A; 1X27 A; 2DRK A; 2RHZ A; 2WSF E; 2VKN A; 2DVJ A; 4FT2 A; 5KYW B; 1C6V X; 3OBY A; 2ROT A; 1UJY A; 3CME T; 5J26 A; 1TG0 A; 3HRS A; 5GAO l; 3C95 A; 4C92 D; 1VQP T; 1YHQ A; 2CYZ B; 2FL7 A; 5D6Y A; 4C0Z A; 1VUB A; 2AKK A; 3GNG A; 2P84 A; 2D6F A; 1VQ9 A; 3QZ5 B; 4BE0 A; 1TXQ A; 3JAM E; 4OML A; 4B9W A; 2L2P A; 4HT8 A; 3M0P A; 3VU3 C; 1OU9 A; 2YLB A; 3OMC A; 2JTM A; 4P5N A; 1RAG B; 2R5A A; 3QKJ A; 4JRP A; 3JCM c; 1VIE A; 3TEE A; 3OW2 A; 5GAO n; 3UPU A; 1KC8 R; 3CCQ T; 3G7Z A; 1G3Y A; 2GF7 A; 2JS2 A; 1X6B A; 3EG9 A; 3LH5 A; 2C06 A; 1VQ7 T; 4Y28 E; 1TWB A; 4C92 A; 4K11 A; 2LX9 A; 2QYZ A; 4PL6 A; 2CZ0 B; 2CKK A; 2K2V A; 4PJL A; 3J81 E; 1K73 C; 3TU4 K; 4FL6 A; 3QWY A; 3VRZ A; 5CQX A; 4RTY A; 5C0M A; 4OMO A; 1T0J A; 1X43 A; 4M7A D; 4LNP A; 1U1S A; 1I81 A; 2ZPH B; 1XTD A; 2JNG A; 3V7R A; 3H6Z A; 1Q86 R; 2YLC A; 1TUD A; 2EQM A; 2W0Z A; 1CKA A; 1PNJ A; 3M54 A; 2QGG A; 1M1F A; 5GAN 4; 3ULR B; 1H64 1; 2P4T A; 2Y4Y A; 4QQD A; 1K73 U; 2VWF A; 1X01 A; 2V1R A; 3CCE Q; 2X3W D; 1U5S A; 1YN8 A; 1VQN A; 2FPE A; 1G3T A; 2L8D A; 3MP1 A; 2LDM A; 2RQW A; 4M77 B; 4M77 E; 1UGV A; 2NWM A; 2MYS A; 4AFQ C; 4D8D A; 5D6X A; 4RTX A; 3HP9 A; 1NJI U; 4C8Q F; 2R58 A; 4LDY A; 2O31 A; 3WVE B; 3EG0 A; 2KDS A; 3EG1 A; 3JCM W; 1UB4 A; 2GGR A; 3L2V A; 2HBP A; 1M3A A; 2R5M A; 5LJ3 h; 5IH2 A; 5L23 A; 1YIJ T; 5DY9 A; 2L3P A; 1VQL Q; 3M0R A; 3BDL A; 2K3B A; 2QEX T; 4HVU A; 3P8D A; 1KD1 R; 1YHQ Q; 1SRL A; 5CAI A; 3REA B; 1UFF A; 4J5Y A; 2D0Q B; 2DPP B; 2DXU A; 4MZT A; 1VQ9 Q; 4XAX B; 4A54 A; 5A0G A; 2RD1 A; 3LLR A; 2V8J A; 4A4E A; 4BDY A; 2MCN A; 4C92 G; 1E7O A; 2QQ9 A; 2COZ A; 4Z8A A; 2BUD A; 3EGX A; 3LGF A; 1AWO A; 1JO8 A; 1OUL A; 4M77 G; 5FRN A; 3HPW A; 3CC2 Q; 3JCM e; 4E7I A; 2QDL A; 2RQT A; 4MZM A; 2PU9 B; 1E6G A; 1Q81 R; 1ZA2 B; 1KQS P; 2FO0 A; 1GCQ C; 1WHL A; 3KFV A; 5HKC A; 1X75 C; 2D9T A; 5IHI A; 2ABL A; 3G71 T; 4V2S A; 5GAM e; 3FIF A; 3JCM g; 2JN0 A; 4BAC A; 4CI0 C; 2BE7 D; 4N4G A; 4J8O A; 2YUQ A; 4M4Z A; 2KE9 A; 3EGX B; 2NLU A; 1IB8 A; 4EMK B; 1K0S A; 1NLP C; 5GAM g; 1RAE B; 2DEQ A; 2FG0 A; 3PNW C; 2FEI A; 2MWO A; 2K7A A; 3OYB A; 1DJ7 B; 1K0X A; 2K9G A; 1MHN A; 2JXB A; 5FLX E; 2CT4 A; 4HT9 A; 1HJD A; 5A0L A; 5M9O A; 1KK7 A; 4IUR A; 2RB6 A; 3VS3 A; 2YSQ A; 4J9E A; 1UG1 A; 2XKO C; 4N0A C; 4ZGD B; 2KT8 A; 2RI5 A; 3BDU A; 4M7D C; 3EH2 A; 2F69 A; 2DXT A; 2E5Q A; 3PIP A; 1UGQ B; 2LC4 A; 3VJP A; 2JTF A; 3QG1 A; 4RTT A; 2VV5 A; 1YJN T; 2L89 A; 2RM4 A; 2QEX A; 2J7I A; 2P0Q A; 3GNF B; 2RQR A; 3AT1 B; 3DLL A; 3QHS A; 1VQ5 Q; 3JRZ A; 2KQW A; 3MET A; 4E7H A; 3MHX A; 5CIU A; 1UDL A; 4L59 A; 1W1F A; 3CQT A; 2QA4 Q; 2DAQ A; 4X34 A; 3CC7 T; 4A53 A; 2E1H A; 3RER A; 2DF6 A; 3D7S B; 4BY6 C; 2AT1 B; 3VS7 A; 3CCJ A; 1VQK T; 4ZTF A; 4C0G A; 1AZE A; 4UC4 A; 1RAF B; 2GQV A; 2BKD N; 4C8Q D; 4E47 A; 2LJ0 A; 2X51 A; 1WYX A; 3OS2 A; 3QJY A; 1BK2 A; 2BTT A; 1D3B B; 4R0K A; 2CH4 W; 4YTL A; 3X20 B; 2KMT A; 4GY5 A; 3VRY A; 2QQB A; 1JEG A; 3G71 A; 3PIO A; 4BDZ A; 3VS5 A; 5CQY A; 2EGC A; 3LGL A; 2AK5 A; 1K9M U; 1GCP A; 2A3L A; 3KBG A; 1JRI A; 2AKL A; 4HCK A; 3RKW A; 4AT1 B; 4OB2 B; 2VAS A; 3S3O A; 5KCH A; 2AIR B; 2A7Y A; 3RNJ A; 4FSX A; 1ACM B; 1OU8 A; 2OX7 A; 2IIM A; 2RO0 A; 2DYB A; 2PZ1 A; 1RAC B; 1JJ2 S; 2A36 A; 4J9G A; 4BI8 B; 4C8Q A; 1T0H A; 3THK A; 1WZO A; 4WCI A; 1VQ4 Q; 2HD0 A; 4JZ3 A; 3F70 A; 4X9C A; 1OV3 A; 1NPR A; 3OW2 P; 1PWT A; 1YNZ A; 4OGE A; 2DNU A; 5CKB A; 3MKD A; 2F2X A; 2ZPG B; 5GAN 8; 2RQV A; 4R56 A; 4JS4 A; 4J9B A; 1HD3 A; 4FYX B; 1M90 U; 1RAH B; 3DLM A; 2LCS A; 1MV3 A; 3VKI A; 4FYV B; 5GAO m; 4F14 A; 4PK4 A; 1Z9Z A; 2EQJ A; 4J9H A; 9ATC B; 3RUX A; 2PUK B; 4CRI A; 4JZ4 A; 1X2Q A; 1WA7 A; 2RI2 A; 2JMC A; 4JPB W; 5LJ5 d; 4A63 B; 5LJ3 j; 1QKX A; 3OYN A; 2VB6 A; 3OYJ A; 3SB2 A; 1M4Z A; 3OYF A; 1M2V A; 1SG5 A; 1N8R R; 4DQ2 A; 2QK0 A; 2HKN A; 4LUE A; 4PJO C; 2F2V A; 3CC7 A; 4Z88 A; 1HSQ A; 1YJW Q; 3BY7 A; 2KI7 A; 1BIA A; 1WDX A; 1WX6 A; 1VQK A; 4M77 F; 3CCE T; 3PT9 A; 1WXU A; 3FJP A; 1UGP B; 3CPF A; 2O2O A; 2ZGW A; 1VQM Q; 1WI7 A; 4R55 A; 3V8L A; 2MK5 A; 4N4I A; 2RJE A; 4M7A C; 4II1 A; 3QII A; 2EW3 A; 1PG5 B; 2YRV A; 1WJR A; 4M75 A; 2EQI A; 4C0F A; 1NEG A; 2E6Z A; 1ZUY A; 1S72 T; 1Q7Y C; 4LDW A; 3S3M A; 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