The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
13
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sequence length |
67
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structure length |
67
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Chain Sequence |
GIDPFTGEAIAKFNFNGDTQVEMSFRKGERITLLRQVDENWYEGRIPGTSRQGIFPITYVDVIKRPL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Second SH3 domain of ponsin solved from powder diffraction
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Ponsin
|
| molecule tags |
Signaling protein
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
13
|
| structure length |
67
|
| sequence length |
67
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2006-11-30 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1NYF A; 1Z9Q A; 2DA9 A; 2DBM A; 1OOT A; 1VYV A; 1B07 A; 1H8K A; 2F2V A; 5GJW B; 2O9S A; 3KFV A; 5IHN A; 2GNC A; 4JZ3 A; 1Y0M A; 2KXC A; 2EVR A; 1MUZ A; 2KYM A; 1W70 A; 4RTX A; 3M0P A; 1RI9 A; 1K1Z A; 3C0C A; 5HCK A; 1AWJ A; 4HVU A; 1LCK A; 2D8H A; 4JZ4 A; 2KRM A; 3TSW A; 1GBQ A; 2KXD A; 1M30 A; 2ABL A; 4F16 A; 4ESR A; 3NGP A; 1SHG A; 1GL5 A; 3RBB B; 1SSH A; 1I07 A; 1VA7 A; 5FW9 A; 5IHI A; 1EFN A; 1AWX A; 2EW3 A; 4JJC A; 2YT6 A; 1E7O A; 1M8M A; 2D8J A; 2KT1 A; 2LP5 A; 5IXB A; 1Z9Z A; 3M0T A; 3I35 A; 4CC3 A; 2DF6 A; 1UJY A; 2ROT A; 1NEB A; 1WXU A; 2AZV A; 1GCQ A; 3VRY A; 4HXJ A; 1NG2 A; 4OMN A; 2DM1 A; 4JJD A; 4RTZ A; 2EQI A; 1B3Q A; 2CRE A; 3TVT A; 3M0Q A; 3VS5 A; 3VS1 A; 1BU1 A; 1W6X A; 3H0H A; 4OMP A; 1UHC A; 2DX1 A; 3SHW A; 2K9G A; 2DJQ A; 4M4Z A; 2YDL A; 1V1C A; 1BB9 A; 2EGC A; 1ZBJ A; 2EYZ A; 2RNA A; 1I0C A; 2K2M A; 1WXT A; 2GTO A; 1ZSG A; 1SHF A; 1UTI A; 1JEG A; 3I5S A; 2SEM A; 4F14 A; 1TUC A; 2H8H A; 1PWT A; 3EG2 A; 1X69 A; 2SRC A; 1WLP B; 2KBT A; 3REA B; 1G83 A; 2KEA A; 3PVQ A; 4Z88 A; 3VS6 A; 2EYX A; 1CKA A; 4LUD A; 1UDL A; 2CUB A; 3QWY A; 4F17 A; 1X27 A; 3EG0 A; 1ZUU A; 1GFC A; 1HD3 A; 2XMF A; 4J9C A; 1X2Q A; 3LH5 A; 2KRO A; 2W10 A; 2BTT A; 1T3S A; 2KT8 A; 2VKN A; 3M0S A; 1AWO A; 4J9E A; 1N5Z A; 2BZX A; 1RLQ C; 1PHT A; 2LJ0 A; 2LJ1 A; 1QLY A; 4GBQ A; 4J9G A; 1TUD A; 1YCS B; 1H92 A; 2HCK A; 3VS3 A; 1XOV A; 4RUG A; 1GRI A; 2ED0 A; 1AOJ A; 2CH4 W; 2CSQ A; 1KIK A; 1JO8 A; 1E6G A; 1GCQ C; 2E5K A; 1BK2 A; 1AEY A; 1ABQ A; 1H3H A; 2C0T A; 2KYB A; 2RF0 A; 2IIM A; 1W1F A; 4RTU A; 1WXB A; 2GBQ A; 1WX6 A; 1PNJ A; 4WCI A; 2JW4 A; 2YUP A; 3UA7 A; 2L2P A; 1QWE A; 3H0F A; 1FYN A; 4OML A; 1AZE A; 2J06 A; 2DNU A; 1SEM A; 3UAT A; 2DL4 A; 2O31 A; 3CQT A; 5FWB A; 3NMZ C; 2X3X D; 5GJV B; 4OMQ A; 1AWW A; 3FJ5 A; 2CH4 A; 5FWC A; 2D1X A; 2YSQ A; 2ED1 A; 2J6F A; 4KRT A; 2EBP A; 2VWF A; 1NLP C; 1ARK A; 1GCP A; 2BZ8 A; 1UJ0 A; 2YUO A; 4AFZ C; 1G2B A; 2JTE A; 2FO0 A; 2CT3 A; 1M3A A; 2A28 A; 1ABO A; 1OPK A; 1WIE A; 1K0S A; 4IIM A; 4J9B A; 4Y92 A; 2RQR A; 2HEQ A; 1VYT A; 3TSZ A; 2QDL A; 2FPD A; 5IH2 A; 4AG1 C; 2OJ2 A; 4K11 A; 1IO6 A; 1BBZ A; 1K76 A; 2L3S A; 1GFD A; 3GBQ A; 1JU5 C; 4D8D A; 1K0X A; 4EIK A; 2DL3 A; 2EGA A; 4LN2 A; 2KRN A; 3A98 A; 2DRM A; 2LQN A; 1K4U S; 2FPE A; 2CT4 A; 4LUE A; 1YNZ A; 4CC4 B; 4DEX A; 1YWP A; 3H41 A; 2EYW A; 2JM8 A; 2DVJ A; 2LCS A; 1KSW A; 1MV0 B; 1RLP C; 2V1Q A; 1AZG B; 2A37 A; 3I9Q A; 3VS2 A; 2DBK A; 1WDX A; 2DE0 X; 2O9V A; 4X1V A; 1T0J A; 2JS2 A; 2F2X A; 3RNJ A; 2KE9 A; 2FG0 A; 1CKB A; 2LMJ A; 4Z8A A; 2PNI A; 4D8K A; 1X43 A; 2JXB A; 2RQT A; 2A36 A; 5ECA A; 3UF4 A; 1ZX6 A; 1UE9 A; 2GGR A; 2HBW A; 3SEM A; 3EGU A; 1OV3 A; 1OPL A; 3R6N A; 2JS0 A; 4R0K A; 2P4R A; 2EKH A; 2EYY A; 1FMK A; 3QWX X; 1PRM C; 2RPN A; 1T3L A; 5EC7 A; 3U23 A; 2ESW A; 2L0A A; 2MIO A; 4ZNX A; 2YUN A; 2LNH B; 1M27 C; 1U3O A; 4JPB W; 1KFZ A; 1UEC A; 2D0N A; 2ECZ A; 2X3W D; 4HVW A; 2C0O A; 1M3C A; 2K3B A; 1WYX A; 2RMO A; 2LJ3 A; 2ROL A; 2NWM A; 1ZUY A; 4J9I A; 2DL7 A; 4AFQ C; 1SRM A; 3ULR B; 1T0H A; 4ORZ A; 2J6O A; 1ZUK A; 2CDT A; 2JM9 A; 2W0Z A; 1UHF A; 1AVZ C; 1OEB A; 2G6F X; 1S1N A; 2FPF A; 2DYB A; 2GTJ A; 3PE0 A; 1JQQ A; 2BZY A; 3THK A; 1E6H A; 4RTT A; 2J05 A; 1MV3 A; 1YN8 A; 4CC7 A; 4OMO A; 3NPF A; 3VS4 A; 1YP5 A; 2YUQ A; 2J6K A; 5I22 A; 2AKK A; 1M3B A; 2I0N A; 2AKL A; 4OMM A; 2K7A A; 1JXM A; 2C0I A; 3I5R A; 4IIO A; 1KJW A; 1UGV A; 2EPD A; 1QCF A; 2FEI A; 4AG2 C; 2AZS A; 2JMC A; 1NEG A; 1K9A A; 2O88 A; 2K6D A; 1U06 A; 2DIL A; 2F2W A; 4JJB A; 1VYU A; 1WFW A; 3EG3 A; 1PRL C; 4J9D A; 4QT7 A; 2DRK A; 2L3P A; 2JT4 A; 1NM7 A; 1HSQ A; 3JV3 A; 4DEY A; 2DLP A; 2M51 A; 3IQL A; 4LNP A; 1J3T A; 4AFS C; 4J9F A; 2MCN A; 3VRZ A; 1CSK A; 1SPK A; 1TG0 A; 1X2K A; 4RTY A; 4J9H A; 3NHN A; 4GLM A; 5IXF A; 1AD5 A; 3VS7 A; 1SRL A; 1QKX A; 2GQI A; 3O5Z A; 2RQU A; 3PVL A; 1NLO C; 1QKW A; 2O2O A; 3VS0 A; 4A63 B; 1X6G A; 2DMO A; 4E6R A; 1PKT A; 3EHQ A; 4FSS A; 1WA7 A; 2KR3 A; 2OAW A; 2K79 A; 4AFU C; 3EHR A; 2OI3 A; 2B86 A; 4Z89 A; 1UG1 A; 4HCK A; 1RUW A; 1I1J A; 1PKS A; 2LZ6 B; 2V1R A; 2KGT A; 4CC2 A; 5L23 A; 4LE9 A; 2CSI A; 2FRY A; 3M0U A; 3UA6 A; 2RN8 A; 1UUE A; 2KRS A; 3H0I A; 1Y57 A; 2HSP A; 2EGE A; 2HDA A; 2JMA A; 2DL5 A; 2NUZ A; 3REB B; 2LQW A; 2VVK A; 2DL8 A; 3M0R A; 2FRW A; 1A0N B; 2J7I A; 1YWO A; 2A08 A; 1U5S A; 2CUD A; 2KNB B; 2M0Y A; 2LX7 A; 2PTK A; 2RQV A; 1X6B A; 2RQW A; 2L3Q A; 5IHK A; 4RTV A; 2ENM A; 2MOX A; 3EG1 A; 5I11 A; 1ZLM A; 1NYG A; 1HJD A; 1QWF A; 1JXO A; 4RTW A; 4HVV A; 1UFF A; 3ZL7 C; 1WI7 A; 1GBR A; 2PZ1 A; 2AK5 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1OX9 A; 3NTK A; 3CCJ A; 1YHQ T; 1ZSZ B; 1SF9 A; 4MMK A; 2JZ2 A; 5KYW A; 1FX7 A; 1VQ8 A; 3QKJ A; 1H8K A; 3JB9 G; 2F2V A; 5GJW B; 3MPU B; 3FC3 A; 2LC4 A; 3CCM T; 4M75 G; 4C0Z A; 3MET A; 2EVR A; 1VOM A; 1PSE A; 1YI2 Q; 1KQ2 A; 4XAX B; 1LCK A; 3VYH B; 4JZ4 A; 3CME A; 2VAS A; 4M78 B; 2KXD A; 1M30 A; 4O5V A; 3GOX A; 1K73 C; 1GL5 A; 3RBB B; 1LNX A; 2M02 A; 3CCL A; 4JJC A; 2YLC A; 2PUK B; 2YT6 A; 5D6Y A; 2D8J A; 1RI0 A; 3I35 A; 4F04 B; 1K8A R; 3CD6 A; 4F7U A; 3J81 E; 4F7U F; 1LOJ A; 3X25 B; 1OU8 A; 1WXU A; 2AZV A; 2K5L A; 2VXF A; 2VYT A; 3VRY A; 4HXJ A; 1NG2 A; 2A3L A; 4OMN A; 2CRE A; 4QQG A; 3M0Q A; 4RCB A; 2K5F A; 3JB9 J; 3NTH A; 4OMP A; 1HXD A; 2K9G A; 3E9F A; 5GAM d; 2VUB A; 4A4G A; 2V8J A; 4M4Z A; 1U8R A; 1G8X A; 4XU2 A; 1YI2 T; 1YIT T; 2EGC A; 1ZBJ A; 2MMP A; 4LDX A; 3EH2 A; 2RM4 A; 2YLB A; 4JUV A; 2GTO A; 2JOY A; 1ZSG A; 1UTI A; 1JEG A; 2DEQ A; 4F14 A; 1TUC A; 2MF2 A; 2Y4Y A; 1Q86 C; 3V8L A; 1M2V A; 1UGQ B; 2L3R A; 1WLP B; 4A4F A; 3CXC S; 1FWZ A; 1QVG S; 3X24 B; 3CCS Q; 1UDL A; 3QWY A; 4N4I A; 4IUR A; 4FYW B; 3SB2 A; 1M90 U; 2DD5 A; 1ZUU A; 1XQH A; 3EFO B; 1HD3 A; 4J9C A; 1K73 R; 4M77 B; 5DY9 A; 4J9E A; 3OSV A; 2X4J A; 3M4G A; 3SFM A; 1RLQ C; 4GBQ A; 4C5E A; 1TUD A; 2RJF A; 1TU0 B; 2Y90 A; 3DLM A; 4R55 A; 1KIK A; 1ZHI A; 4B6M A; 1BKB A; 1ABQ A; 2GF7 A; 1YJW A; 2IIM A; 3WVD B; 3CC2 T; 4RTU A; 4CRI A; 4EDU A; 3QII A; 1KHC A; 1WXB A; 4LDY A; 5LJ3 e; 1PNJ A; 2JW4 A; 4ZGE B; 2HBP A; 3H0F A; 5GAM f; 3QUI A; 1Q82 U; 1AZE A; 2DNU A; 2O31 A; 3CQT A; 4C92 A; 3L1A A; 3RDV A; 3OY9 A; 4M7D C; 2X3X D; 1AWW A; 4OMQ A; 3QHS A; 4BI3 A; 4BE2 A; 2D1X A; 4M7A C; 4KRT A; 2QEX A; 4M7D D; 1AEY A; 1ARK A; 1GCP A; 1MMG A; 1VQP A; 2FO0 A; 3A8O B; 4M7A D; 1OPK A; 5GMK j; 1VQ9 Q; 4IIM A; 5FU6 B; 1BIB A; 4Y92 A; 1Y07 A; 1KQS S; 1RAD B; 3VU3 C; 2FZK B; 3BDL A; 1WZO A; 2QDL A; 3GF5 A; 1M9S A; 1YFN A; 2A0F B; 1VIF A; 1WHG A; 2EQM A; 1K9M R; 1TOV A; 1VQO Q; 3GNF B; 3ZBD A; 3GBQ A; 3JCM Q; 4KGV B; 5HY6 A; 3CPW P; 2RH2 A; 2QA4 Q; 3A98 A; 3GPL A; 2ZGW A; 2KVQ G; 2CT4 A; 3M5A A; 3CXC P; 4FM4 B; 2EYW A; 5CK9 A; 4N4G A; 3WVE B; 2LCS A; 1AZG B; 3UT1 A; 3VS2 A; 2DBK A; 1RAA B; 3KUF A; 1I4K 1; 1VUB A; 1ZA1 B; 1W2B S; 4KH0 B; 4WF2 A; 1JRI A; 5GAM h; 1ZSZ A; 2FG0 A; 1X43 A; 5CO7 A; 2CP5 A; 2DET A; 4JLI A; 4PL6 A; 3HPW A; 4M7D G; 4YTL A; 3SEM A; 2K57 A; 5KYN A; 4FL6 A; 5A2Q E; 2IG0 A; 4M7A G; 4A53 A; 2E70 A; 3AT1 B; 1PC0 A; 1OPL A; 5A0G A; 1NBE B; 2JS0 A; 2P4R A; 5I2M A; 2L5Q A; 3CC4 T; 2EYY A; 2E6N A; 2XIC A; 3QWX X; 2RPN A; 1T3L A; 1VIE A; 2MIO A; 4M78 F; 2LNH B; 4ZN1 A; 5CIU A; 2OTL T; 4JPB W; 4PJJ A; 5GAM j; 1EX4 A; 2ECZ A; 1KD1 C; 1M3C A; 1R0C B; 2L89 A; 2ROL A; 2DL7 A; 2QTX A; 3GP8 A; 1KQS P; 1OQK A; 1ZUK A; 2DXU A; 2OAU A; 2ZPG B; 3MEW A; 3MJX A; 1UHF A; 2FPF A; 3OYK A; 2DYB A; 1Q7Y U; 2GTJ A; 5CKB A; 2HSE B; 3CMA A; 2BZY A; 3THK A; 2JUF A; 3JCM g; 2M9U A; 2FB7 A; 4CC7 A; 2DTH A; 2XI9 A; 5FRM A; 4BD3 A; 1YP5 A; 4ZGD B; 1Q82 C; 3CC7 T; 2I0N A; 2COZ A; 2K7A A; 1JXM A; 3FB9 A; 5KYW B; 2C0I A; 2LX9 A; 5J26 A; 4JRK A; 1MMD A; 3EFS A; 2RJD A; 2FEI A; 2JMC A; 1U06 A; 1WHH A; 1PD1 A; 5HKC A; 1ZA2 B; 4J9D A; 3G4S T; 4QT7 A; 1W2B P; 2RHY A; 2FVU A; 4QVC A; 4ZTJ A; 1HSQ A; 4DEY A; 2DLP A; 4C8Q B; 3CCS A; 1J3T A; 4AFS C; 4J9F A; 3RMQ A; 2MCN A; 4PJO C; 1SPK A; 1TG0 A; 3OMC A; 4FT4 A; 4RTY A; 4J9H A; 4PJO D; 3EFO A; 3BW1 A; 1WHM A; 2F69 A; 2ATC B; 4M77 A; 2HKN A; 1K8A U; 3PVL A; 1KD1 R; 1QKW A; 5LJ3 d; 3OSS C; 2DFU A; 4XTY A; 2CS7 A; 4AMC A; 1X6G A; 4E6R A; 1LVK A; 3EHQ A; 2KR3 A; 4AFU C; 3EHR A; 2OI3 A; 2B86 A; 1MMA A; 1WHK A; 1WJR A; 3HTR A; 3MP1 A; 2PU9 B; 4HCK A; 1KC8 R; 2CP6 A; 1RUW A; 2V1R A; 5FRO A; 3EGX A; 4BY6 C; 4CC2 A; 5L23 A; 4LE9 A; 2FRY A; 1X01 A; 4J6W A; 4NL2 A; 3S3M A; 2RN8 A; 4ME7 A; 1KQ1 A; 1Y57 A; 2DPP B; 2BUD A; 2V8K A; 4LDU A; 1VQ7 A; 2LQW A; 3T9N A; 3OA6 A; 4C0G A; 3RKW A; 3RR6 A; 2P84 A; 1VQ5 T; 2A08 A; 2CUD A; 1O9S A; 1WNL A; 2LX7 A; 1X6B A; 1RL2 A; 3SDZ A; 5IHK A; 1QCO A; 4PLI A; 5I2S A; 3JAM E; 3EG1 A; 4E7S A; 1HJD A; 5KCO A; 2M1H A; 3ZL7 C; 1WI7 A; 1YIJ T; 1VQ9 A; 4OB2 B; 1D0Z A; 1NYF A; 4IUU A; 1Z9Q A; 2DA9 A; 5A0D A; 1LJO A; 4M7D E; 1OOT A; 4FYY B; 2R5A A; 4M7A E; 3A8G B; 3L2U A; 2K5I A; 2RJE A; 1QCN A; 1VQO A; 1K73 U; 5D6X A; 1VQ4 Q; 1MGQ A; 1FMW A; 2NLU A; 2JTM A; 3BDU A; 3V7R A; 2QA4 A; 4IUP A; 4RTX A; 4QVZ A; 3CCU T; 2XK0 A; 1M8V A; 4GLK A; 3QDR B; 3VKI A; 1WHL A; 3BFM A; 5GAN 3; 3CCL T; 2VGM A; 4A4H A; 3P8H A; 1RAB B; 1BI3 A; 2P0Q A; 4PLL A; 1VQL T; 2RI5 A; 2C06 A; 1R8O B; 3CD6 T; 1SHG A; 1G5V A; 1Q7Y C; 1SSH A; 1VA7 A; 5FW9 A; 5IHI A; 1AWX A; 3CCE T; 3BY7 A; 1N8R R; 1M8M A; 2LP5 A; 4E47 A; 5IXB A; 1Z9Z A; 4C92 B; 2ROT A; 1NJI R; 4E7H A; 1GCQ A; 2LDM A; 3URG A; 4E7J A; 4M75 C; 1YHQ Q; 1JB0 E; 5C6S A; 3OS1 A; 4OGC A; 3TU4 K; 1BI1 A; 3VS5 A; 3E9G A; 2OTJ A; 1IHV A; 4M75 D; 2KSS A; 4HCB A; 1P92 A; 2V8I A; 2DTI A; 1ACM B; 3M54 A; 3CCM Q; 1D0X A; 2WAC A; 5KYX A; 3SHW A; 2YRC A; 2E10 A; 2DJQ A; 2X35 A; 2EYQ A; 5CQY A; 1OZ3 A; 1K9M U; 1BB9 A; 4OB3 B; 2E3I A; 3OYC A; 2QQS A; 3LLR A; 1I0C A; 4EMK C; 2GQV A; 4KUL A; 5GAO q; 1S72 T; 1N27 A; 1PWT A; 2EWN A; 1B7T A; 3EFR A; 3S3O A; 2KBT A; 5CKD A; 1IXD A; 3M53 A; 2VV5 A; 3VS6 A; 3QZ5 B; 4Z88 A; 4LUD A; 1CKA A; 5HK0 A; 1M1G A; 2EQK A; 2A7Y A; 4F17 A; 2BE7 D; 3EG0 A; 2ZPI B; 2DZC A; 4TVR A; 3C95 A; 3PT9 A; 1X2Q A; 3RES A; 2W10 A; 3M59 A; 4FW1 A; 4EMG A; 1PHT A; 4J9G A; 1QLY A; 1H92 A; 3VS3 A; 4RUG A; 2MYS A; 2ED0 A; 3CBM A; 3E2U A; 1AOJ A; 2CH4 W; 1JO8 A; 1TTH B; 2QGG A; 3LW5 E; 1VQN T; 1BK2 A; 1H3H A; 2E65 A; 1IZ6 A; 2CP3 A; 3O8V A; 2GBQ A; 3G71 A; 2HL5 C; 8ATC B; 2YUP A; 5CVI A; 2QI2 A; 3JCM X; 1QWE A; 3OYG A; 3CCV T; 2F5K A; 4DBQ A; 3I55 Q; 1YIT Q; 3M56 A; 2DL4 A; 1JBM A; 5FWB A; 3FJ5 A; 4C8Q A; 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