The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
15
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sequence length |
67
|
structure length |
67
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Chain Sequence |
GIDPFTGEAIAKFNFNGDTQVEMSFRKGERITLLRQVDENWYEGRIPGTSRQGIFPITYVDVIKRPL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Paxillin and ponsin interact in nascent costameres of muscle cells
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Ponsin
|
| molecule tags |
Signaling protein
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
15
|
| structure length |
67
|
| sequence length |
67
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2006-12-14 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1YWP A; 2KRN A; 1WA7 A; 2LQN A; 2CSQ A; 1QLY A; 2F2V A; 2CUD A; 4R0K A; 2GGR A; 1J3T A; 3ZL7 C; 1T0J A; 2CSI A; 2I0N A; 4CC7 A; 2LNH B; 3EG1 A; 1UTI A; 3U23 A; 2K79 A; 4ORZ A; 2HSP A; 1M27 C; 1KFZ A; 2L3P A; 2LQW A; 2B86 A; 1ZUY A; 3VS6 A; 1G2B A; 4CC4 B; 2DLP A; 2GQI A; 4WCI A; 1VYU A; 4OMQ A; 3EG0 A; 2OJ2 A; 1E6H A; 1T0H A; 2PZ1 A; 2DL7 A; 1QKX A; 1QWE A; 2RQV A; 2YDL A; 3FJ5 A; 2VWF A; 2O2O A; 1OV3 A; 2RMO A; 4LNP A; 3UF4 A; 2DF6 A; 1I0C A; 1OOT A; 1NEB A; 2YUQ A; 2ED0 A; 4E6R A; 2LP5 A; 3QWX X; 4AG1 C; 1RI9 A; 2SEM A; 1AVZ C; 1SHG A; 1FYN A; 2FRY A; 2GBQ A; 2ED1 A; 2EGE A; 3EHR A; 3I5S A; 2DVJ A; 4ZNX A; 3TSW A; 1PNJ A; 1CSK A; 2ECZ A; 2BZY A; 2FPF A; 1YCS B; 3R6N A; 1JO8 A; 1WX6 A; 1BU1 A; 2RN8 A; 1SEM A; 2L2P A; 1NLO C; 1HD3 A; 1M3C A; 5IHI A; 1JQQ A; 2KBT A; 1AWX A; 1WYX A; 2NUZ A; 4Y92 A; 5IHK A; 1H3H A; 2LZ6 B; 2KNB B; 1NM7 A; 1T3S A; 2VVK A; 2KRO A; 2A36 A; 1OEB A; 4J9F A; 2ABL A; 1K0X A; 1X6G A; 2DNU A; 4IIM A; 1ZSG A; 2HBW A; 3H0F A; 1U06 A; 1ABQ A; 2AZV A; 3NMZ C; 2RQU A; 1KIK A; 1SHF A; 4CC3 A; 4LUE A; 3SHW A; 4D8K A; 4Z88 A; 1RLQ C; 3GBQ A; 2D8J A; 5EC7 A; 4J9G A; 2EGA A; 2L3Q A; 4EIK A; 1JXO A; 4CC2 A; 4AFU C; 1K9A A; 1PRM C; 2O88 A; 1U5S A; 3REA B; 3IQL A; 2O31 A; 2CDT A; 2ROT A; 4AFS C; 4J9C A; 1AWW A; 4F16 A; 2NWM A; 1PKT A; 2EBP A; 1GBQ A; 2C0I A; 3EG2 A; 2OI3 A; 2DX1 A; 2J06 A; 2VKN A; 4AFQ C; 3THK A; 1VA7 A; 1GCQ C; 3TVT A; 1X69 A; 4RTZ A; 4GLM A; 3KFV A; 5FW9 A; 2GTO A; 2KT8 A; 3M0P A; 4FSS A; 1UEC A; 3EHQ A; 2BTT A; 2KYB A; 2KRM A; 3I35 A; 2MOX A; 1YWO A; 1NYF A; 1V1C A; 2YSQ A; 1KJW A; 4HCK A; 3UA7 A; 1OPL A; 4J9I A; 2KE9 A; 1LCK A; 4HVU A; 1H92 A; 4LE9 A; 2DRK A; 3VS7 A; 1Y0M A; 5GJV B; 2HDA A; 3SEM A; 2A28 A; 4RTW A; 2KR3 A; 1Z9Z A; 2V1R A; 2RPN A; 2K6D A; 5IHN A; 2JXB A; 1YNZ A; 1BK2 A; 1MV3 A; 2J6O A; 4Z8A A; 2KYM A; 2C0T A; 1M8M A; 2LCS A; 1NYG A; 2GNC A; 4Z89 A; 2DBM A; 1OPK A; 2KEA A; 2LJ1 A; 2EQI A; 1YP5 A; 3M0T A; 1SSH A; 2O9S A; 2K3B A; 3C0C A; 1PKS A; 1TG0 A; 1E6G A; 1W70 A; 1WI7 A; 2JM8 A; 4RTV A; 4JJD A; 1ABO A; 2AK5 A; 2DL3 A; 1WLP B; 2FPE A; 1GBR A; 2FPD A; 2JM9 A; 1YN8 A; 5FWC A; 3PVQ A; 1ZX6 A; 1UJ0 A; 1JU5 C; 1X43 A; 4F14 A; 1SRM A; 1K76 A; 2DBK A; 2AKK A; 1B07 A; 2EYZ A; 4DEY A; 1RUW A; 2LJ3 A; 2EKH A; 2HCK A; 1ARK A; 2RQW A; 2L3S A; 1PRL C; 1UG1 A; 2A08 A; 2JT4 A; 4J9H A; 2CRE A; 2JS2 A; 2V1Q A; 1WIE A; 1S1N A; 3M0Q A; 3VS0 A; 1UHC A; 3I9Q A; 1NG2 A; 4AFZ C; 2GTJ A; 2AKL A; 1TUD A; 5GJW B; 1WXU A; 1GCP A; 1W6X A; 2JMC A; 2J6F A; 3I5R A; 5FWB A; 2RQT A; 1BBZ A; 2DIL A; 2DYB A; 2A37 A; 1M3A A; 3M0U A; 2BZ8 A; 4OMO A; 1VYV A; 4KRT A; 2FRW A; 2EGC A; 2J7I A; 2KXD A; 1QWF A; 5ECA A; 1GFD A; 3REB B; 2KXC A; 1GCQ A; 1IO6 A; 3M0S A; 2OAW A; 1HSQ A; 2PTK A; 4RTT A; 1PHT A; 2DMO A; 2O9V A; 2HEQ A; 3JV3 A; 1I07 A; 3RBB B; 2J6K A; 1G83 A; 4JZ4 A; 2G6F X; 1W1F A; 4J9E A; 3VS2 A; 3PE0 A; 4OMP A; 2DM1 A; 4JJC A; 1CKB A; 2C0O A; 1U3O A; 2D0N A; 2EYW A; 1WFW A; 1N5Z A; 2EPD A; 1UE9 A; 2DJQ A; 2KRS A; 2YT6 A; 1CKA A; 1QKW A; 2FEI A; 3EG3 A; 3ULR B; 2AZS A; 1BB9 A; 2QDL A; 3VS3 A; 1AWO A; 5HCK A; 2D1X A; 5IXB A; 1K1Z A; 4HVW A; 2XMF A; 2ROL A; 1ZUU A; 1MV0 B; 2DL4 A; 1MUZ A; 1WDX A; 1UJY A; 2CH4 W; 1K4U S; 4DEX A; 4LUD A; 2W10 A; 1TUC A; 2DE0 X; 2ENM A; 1E7O A; 1QCF A; 1WXT A; 2DA9 A; 2H8H A; 2LMJ A; 2D8H A; 1M30 A; 1PWT A; 1B3Q A; 4D8D A; 1HJD A; 1XOV A; 4RTX A; 2E5K A; 4J9D A; 3LH5 A; 1KSW A; 4OML A; 1I1J A; 1UUE A; 1K0S A; 5IH2 A; 1UHF A; 2FO0 A; 1ZBJ A; 2SRC A; 3UA6 A; 3A98 A; 3RNJ A; 1AD5 A; 1AEY A; 2JTE A; 2MIO A; 3VS4 A; 2ESW A; 4RTU A; 3TSZ A; 1AOJ A; 2CT4 A; 2YUO A; 1AWJ A; 3H0H A; 1T3L A; 1JEG A; 2K7A A; 4J9B A; 2LJ0 A; 1X6B A; 3VS1 A; 2YUN A; 2CUB A; 1SPK A; 2RNA A; 4X1V A; 1H8K A; 2CT3 A; 1X2K A; 3VRZ A; 2CH4 A; 1GL5 A; 2JW4 A; 2LX7 A; 1UFF A; 2EVR A; 1GFC A; 2BZX A; 1M3B A; 2K9G A; 3NHN A; 3O5Z A; 2KT1 A; 4RUG A; 3M0R A; 4JJB A; 1ZUK A; 2FG0 A; 2DL8 A; 2PNI A; 4RTY A; 2RQR A; 1NLP C; 3NGP A; 5L23 A; 1AZE A; 2RF0 A; 3UAT A; 2YUP A; 1VYT A; 1UDL A; 3VS5 A; 5I22 A; 2P4R A; 4QT7 A; 3NPF A; 2DL5 A; 4JZ3 A; 1X2Q A; 3EGU A; 2MCN A; 2F2W A; 1GRI A; 2IIM A; 5IXF A; 2W0Z A; 4GBQ A; 3VRY A; 4K11 A; 1Z9Q A; 2EW3 A; 4JPB W; 1FMK A; 4ESR A; 2EYY A; 4AG2 C; 1AZG B; 2J05 A; 1ZLM A; 3PVL A; 2K2M A; 2F2X A; 1JXM A; 3H41 A; 1Y57 A; 4OMN A; 1RLP C; 4HXJ A; 2JMA A; 2JS0 A; 3H0I A; 2X3X D; 4IIO A; 4F17 A; 3QWY A; 4M4Z A; 4OMM A; 3CQT A; 2X3W D; 1NEG A; 1X27 A; 1A0N B; 2DRM A; 2EYX A; 2L0A A; 2M51 A; 4LN2 A; 1SRL A; 4A63 B; 2KGT A; 4HVV A; 1EFN A; 1UGV A; 2M0Y A; 5I11 A; 1WXB A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2X4W A; 3NTI A; 3OYE A; 1YWP A; 3HPW A; 5GMK e; 3PIO A; 1WA7 A; 3RES A; 2CSQ A; 3LW5 E; 1IB8 A; 1J3T A; 3QSU A; 3ER0 A; 2CSI A; 4J7F A; 5HK3 A; 5CQX A; 4DBF A; 2LNH B; 3EG1 A; 2K5L A; 1KFZ A; 3OYG A; 4F7U F; 4OMQ A; 4HCB A; 3CPW A; 4CRI A; 2YXY A; 1OI1 A; 4M75 C; 2OJ2 A; 3MJX A; 1E6H A; 2E10 A; 1T0H A; 2D0Q B; 3LGL A; 4C0F A; 3QZ5 B; 2VWF A; 3H6Z A; 2O2O A; 3I56 A; 1I0C A; 1YJN T; 3E9G A; 1HYO A; 1NEB A; 2YUQ A; 2ED0 A; 5LJ3 d; 1U8R A; 3F70 A; 2R5A A; 2XDD A; 5GAN j; 3X26 B; 5GAN f; 5GMK j; 5CQY A; 5GAO p; 3UWN A; 8ATC B; 3URG A; 3ZFJ A; 2GFU A; 1N8R U; 4M7D E; 2ECZ A; 5GAO q; 1XQH A; 2BZY A; 1VQN T; 1QCO A; 3G71 T; 3HHT B; 1YCS B; 3R6N A; 3CME Q; 4L5G A; 1HD3 A; 1M3C A; 1TS9 A; 1JQQ A; 2KSS A; 2IG0 A; 3CCV Q; 1VQM A; 4PJO E; 1AWX A; 1YI2 T; 2NUZ A; 5KYN A; 3DB3 A; 3CCQ Q; 4N4H A; 2E1H A; 4A54 A; 4YTL A; 1I5O B; 1PSF A; 2MAM A; 1S72 A; 3MEW A; 4J9F A; 4M7D D; 1K0X A; 1X6G A; 2AIR B; 2QI2 A; 2DNU A; 3QJY A; 2HKN A; 2RI2 A; 2HBW A; 1YIJ Q; 1JJ2 S; 1PC0 A; 4PJO D; 5CIU A; 1KIK A; 3V7S A; 4C5I A; 1SHF A; 2Y4Y A; 1V29 B; 2YHT A; 1M8V A; 4AMC A; 2H3E B; 3FRN A; 3JCM X; 4N0A C; 3CC7 Q; 5A0G A; 3QHS A; 4AFU C; 1K9A A; 2DEQ A; 4BE2 A; 3SD4 A; 2CDT A; 2PVG B; 4AFS C; 1Q81 C; 5LL6 S; 4M77 E; 3M59 A; 5CVI A; 1QVG P; 3EG2 A; 2OI3 A; 4BB7 A; 3CC4 A; 2VKN A; 4AFQ C; 2MWP A; 2DZ9 A; 4J7I A; 1F1B B; 3RMS A; 4ZTF A; 5AYF A; 4XK8 E; 2OAU A; 4EDU A; 3HFO A; 3OYN A; 3X25 B; 1UEC A; 1MND A; 2MOX A; 4FYX B; 4M75 A; 2ZPF B; 3ME9 A; 4M77 D; 1YJ9 Q; 3JCM h; 2E4H A; 1V1C A; 4XAX B; 1KJW A; 3E9F A; 1ACM B; 3UA7 A; 3JAM E; 5CKD A; 2FB7 A; 3P8H A; 3CXC S; 4J9I A; 2K3X A; 1WHG A; 4C5E A; 1XTD A; 2KMT A; 1IGU A; 4XTW A; 1ZA2 B; 3EGD A; 1VQ5 T; 3GNF B; 1TUG B; 1VQ6 T; 3S3M A; 1BK2 A; 4HA8 A; 1MV3 A; 2J6O A; 5GMK l; 2KYM A; 2IVW A; 4JRK A; 2FL7 A; 1JJ2 A; 4C92 A; 2V8J A; 1SSH A; 3CC2 Q; 1TG0 A; 5GAM h; 1WI7 A; 2JM8 A; 1Q82 R; 2JJ9 A; 4KGV B; 1ABO A; 2AK5 A; 1I8F A; 2DL3 A; 1WLP B; 2FPE A; 1OU9 A; 1YN8 A; 3PNW C; 1SF9 A; 5DLO A; 2O4X B; 1M1K U; 3LWI A; 2P4T A; 3PVQ A; 2EFI A; 1UJ0 A; 3MHX A; 1N27 A; 2E12 A; 3KXT A; 1X75 C; 1RUW A; 4OP0 A; 2EKH A; 1ARK A; 2RQW A; 1PRL C; 2CRE A; 4PLL A; 2GTJ A; 3JCM c; 5IT9 E; 1TUD A; 4M75 G; 1YIT T; 1WXU A; 3LWH A; 4M7A B; 2A0F B; 2J6F A; 2RH2 A; 2LQ8 A; 2DIL A; 2R57 A; 1MNE A; 3HRS A; 3T9N A; 1VQL Q; 4DBQ A; 2OTJ Q; 2CKK A; 4F7U A; 2M0O A; 5KYX B; 3VU3 C; 2EGC A; 5ECA A; 1GFD A; 1QWF A; 2DXU A; 3REB B; 2NUP B; 1WQ7 A; 1YJN A; 3CBP A; 1VQ9 Q; 1D0Z A; 4XTX A; 3GLX A; 3EH2 A; 1K8A C; 1QVF A; 3JV3 A; 3RBB B; 2QDY B; 1IRX A; 2VAS A; 4WTO B; 3H8Z A; 2QG9 B; 2J6K A; 1G83 A; 4C92 G; 1YJW T; 3EG9 B; 3PE0 A; 4OMP A; 3WVD B; 4MDX A; 2D0N A; 3CCM T; 2EAY A; 1UE9 A; 2EPD A; 3I55 T; 1H3Z A; 2FEI A; 5LJ3 e; 3EG3 A; 3G71 A; 3ULR B; 1VIE A; 2RK1 A; 1OYX A; 2D1X A; 4OB0 B; 3EAE A; 1ZSZ B; 3RKW A; 1K1Z A; 4HVW A; 4X9D A; 3GNG A; 2ROL A; 3PTA A; 1VQP Q; 3RR6 A; 2DL4 A; 4A4K A; 3HKS A; 3DLM A; 3OA6 A; 2EQU A; 4DEX A; 4LUD A; 2W10 A; 2QEX T; 3CCS T; 5LJ3 g; 1IZ6 A; 1ZQ1 A; 1E7O A; 2M02 A; 2ZGW A; 5GAN 2; 3JB9 G; 6AT1 B; 2DA9 A; 4F7U G; 5M9O A; 2E5K A; 3OYB A; 3J80 E; 3CCE A; 2YRD A; 4OML A; 1Q81 U; 3SWN C; 5GMK m; 1Q7Y C; 5LJ3 j; 3P8D A; 3V8J A; 2MMP A; 2A3L A; 3OYL A; 1ZBJ A; 2L5Q A; 3EFO B; 2LVM A; 4M7D F; 1AD5 A; 4IUR A; 2AHJ B; 3MCA B; 1KC8 R; 4CI0 C; 1AOJ A; 2YUO A; 5D6Y A; 2KI7 A; 2QAS A; 1T3L A; 2DTO A; 1C1A A; 4J9B A; 5HKC A; 3D7S B; 3VS1 A; 1BIA A; 2YUN A; 2CUB A; 3VUZ A; 1TXQ A; 3CCR Q; 1SPK A; 1BCO A; 1RAF B; 3FB9 A; 2JTF A; 3MP8 A; 3CPF A; 3DLL A; 1GL5 A; 3C4S A; 3NFC A; 2EVR A; 3O5Z A; 1WHL A; 2KT1 A; 3FEO A; 3M0R A; 2ZCF B; 4JJB A; 3CCL T; 2ZPE B; 1VQ5 A; 2KAF A; 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1RI9 A; 4HCC A; 2F69 A; 1SHG A; 3M55 A; 1FYN A; 5CKF A; 2WAC A; 1TOV A; 2PQW A; 2K5I A; 1FWZ A; 5DLQ E; 4M77 C; 5LJ5 h; 2ED1 A; 3EHR A; 1N8R R; 3TEE A; 4XTY A; 3CCU Q; 4M75 F; 1YI2 Q; 4J6Y A; 2QEX A; 1KQS P; 1SEM A; 2L2P A; 2GCX A; 2DZC A; 5KYW A; 4NL2 A; 3LH0 A; 1G3T A; 3N5B B; 4IUP A; 4A4G A; 4II1 A; 2LZ6 B; 4ZTJ A; 2HZY A; 3M54 A; 2ABL A; 4OB3 B; 3QYH B; 1Q7Y U; 5CKE A; 4UC4 A; 4ELY C; 3EFR A; 4MZM A; 4CC3 A; 3SHW A; 2EGA A; 1VQ4 Q; 4PLI A; 4PFO A; 4O5V A; 2M9U A; 1OX9 A; 4M7D A; 3IQL A; 1D1A A; 1RAI B; 2K57 A; 2QTV A; 3C95 A; 1V76 A; 4J9C A; 1W2B A; 4FT2 A; 4F16 A; 3J7A F; 2EBP A; 4PJO A; 1GBQ A; 2DX1 A; 1IHW A; 1GCQ C; 4RTZ A; 4GLM A; 4JDS A; 4QVZ A; 2DTI A; 2HL3 A; 2PVO B; 5FW9 A; 2KT8 A; 3M0P A; 3CCL A; 5FLX E; 1YWO A; 3A1P A; 4PFZ A; 2YSQ A; 2MWO A; 3BDU A; 3CPW P; 2VXF A; 3JB9 F; 2JVV A; 3G6E T; 1EIF A; 4OMF B; 2CP5 A; 3RIR A; 4LD9 K; 1MGQ A; 1H92 A; 4LE9 A; 2DRK A; 1Y0M A; 1FXX A; 2OX7 A; 2FZK B; 3BFM A; 3OYI A; 2K6D A; 2QQ9 A; 1VQL A; 1MMD A; 2LCS A; 4M77 A; 5KYY B; 3OYF A; 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