The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
12
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sequence length |
62
|
structure length |
62
|
Chain Sequence |
AGPVWTAVFDYEAAGDEELTLRRGDRVQVLSQDCAVSGDEGWWTGQLPSGRVGVFPSNYVAP
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
The crystal structure of human Mixed lineage kinase MAP3K10 SH3 domain.
rcsb |
| molecule tags |
Transferase
|
| source organism |
Homo sapiens
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| molecule keywords |
Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 10
|
| total genus |
12
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| structure length |
62
|
| sequence length |
62
|
| chains with identical sequence |
B, C, D
|
| ec nomenclature |
ec
2.7.11.25: Mitogen-activated protein kinase kinase kinase. |
| pdb deposition date | 2007-09-27 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF14604 | SH3_9 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2AZV A; 1UG1 A; 1WA7 A; 2O31 A; 1SEM A; 5ECA A; 2CRE A; 1G83 A; 3NMZ C; 3UF4 A; 1JU5 C; 2L3S A; 2B86 A; 4ZNX A; 1I07 A; 5IH2 A; 1I1J A; 2J6K A; 4RTZ A; 4JZ4 A; 3I9Q A; 4D8K A; 2A36 A; 3QWY A; 1OPL A; 3M0U A; 2VVK A; 1U06 A; 4IIO A; 1NEG A; 3VS7 A; 2NUZ A; 1GCQ C; 1VYV A; 2F2W A; 2JXB A; 1Z9Z A; 2BTT A; 1AD5 A; 3IQL A; 1X6G A; 2CH4 W; 2V1Q A; 4Z8A A; 1VYT A; 1NLP C; 1YN8 A; 2GNC A; 4OML A; 1BBZ A; 1UGV A; 4CC3 A; 1M27 C; 2EYX A; 5I11 A; 5IXF A; 1K1Z A; 3KFV A; 3EG1 A; 5I22 A; 1ABQ A; 1PWT A; 1ZBJ A; 2DRM A; 1UEC A; 3VS4 A; 2DJQ A; 1MV0 B; 2L2P A; 2MOX A; 1RI9 A; 2JM9 A; 2OI3 A; 1ZSG A; 3EHQ A; 2RMO A; 2DYB A; 1Z9Q A; 2LJ0 A; 1FMK A; 2M0Y A; 1X2K A; 4J9D A; 2DNU A; 4HXJ A; 4AG2 C; 1WI7 A; 4Z89 A; 3EGU A; 4GLM A; 2EPD A; 1B3Q A; 3RNJ A; 1T3S A; 3REB B; 2K9G A; 1JXM A; 3TSZ A; 3UA6 A; 1M3C A; 1UJ0 A; 2KR3 A; 2K3B A; 2EW3 A; 4AFS C; 2RQR A; 4E6R A; 2PTK A; 2F2X A; 1OEB A; 2EYZ A; 1EFN A; 3THK A; 1TUD A; 4F14 A; 4CC2 A; 2L3P A; 4LUD A; 2KRN A; 2J05 A; 1NEB A; 3R6N A; 2FRW A; 2QDL A; 2ABL A; 2HBW A; 4DEX A; 2H8H A; 3M0R A; 1JXO A; 2JM8 A; 2ED1 A; 1QCF A; 1ZUK A; 2DM1 A; 1TG0 A; 1LCK A; 1A0N B; 1CKA A; 2DBK A; 1GBR A; 4FSS A; 2ECZ A; 1QWE A; 2DBM A; 3EG2 A; 2HDA A; 3NGP A; 2MIO A; 1WFW A; 1UTI A; 2D8J A; 1BB9 A; 1ZX6 A; 5HCK A; 1N5Z A; 3VS0 A; 3VS6 A; 1GFD A; 2YSQ A; 2RNA A; 1PRM C; 4JJB A; 3REA B; 3RBB B; 2FG0 A; 2L0A A; 4JZ3 A; 1WYX A; 4RTY A; 4RTU A; 1QKW A; 1ZUY A; 2YT6 A; 2W0Z A; 5FWC A; 2HEQ A; 2PZ1 A; 2O88 A; 2EGA A; 4EIK A; 2CUB A; 2NWM A; 4OMN A; 1YWO A; 1GRI A; 2LNH B; 2GTO A; 1X69 A; 1UJY A; 3VRZ A; 1K4U S; 2LMJ A; 3H0H A; 2X3X D; 2FPF A; 4J9F A; 1E6G A; 2JS2 A; 2EGE A; 1RLQ C; 1SSH A; 4RUG A; 1PKT A; 2EBP A; 2LZ6 B; 2W10 A; 1VA7 A; 2KRO A; 4QT7 A; 1FYN A; 1NM7 A; 3UA7 A; 5GJW B; 1M3A A; 3O5Z A; 3GBQ A; 2LX7 A; 2O9S A; 1X43 A; 2CUD A; 2D0N A; 4A63 B; 3M0P A; 2DA9 A; 1NLO C; 2GQI A; 2KYM A; 2KBT A; 2C0T A; 1HSQ A; 2XMF A; 1H92 A; 1W1F A; 2ENM A; 1TUC A; 2C0I A; 1NYF A; 2JW4 A; 4RTX A; 4F16 A; 2DL5 A; 1CKB A; 4LNP A; 2KE9 A; 1B07 A; 1AWJ A; 4R0K A; 2M51 A; 4CC4 B; 3I35 A; 2DL3 A; 1HJD A; 1G2B A; 2GBQ A; 1BU1 A; 1H8K A; 3M0T A; 2CT4 A; 2LJ3 A; 2J06 A; 4Y92 A; 4HVU A; 2FEI A; 2ESW A; 1YWP A; 5L23 A; 1AZE A; 4OMP A; 3M0S A; 2DRK A; 4J9C A; 2JMA A; 4ESR A; 2ED0 A; 4LN2 A; 3PVQ A; 1AZG B; 2P4R A; 1Y0M A; 1WXT A; 1AEY A; 2DL4 A; 1AWW A; 1M8M A; 1T0H A; 1ARK A; 3EG3 A; 1WX6 A; 1WXB A; 1UHC A; 4X1V A; 3EG0 A; 4J9E A; 1SRM A; 1PNJ A; 1V1C A; 2KGT A; 2ROL A; 1NYG A; 2SEM A; 1X27 A; 2EYW A; 1XOV A; 1UUE A; 3UAT A; 2EVR A; 2RF0 A; 1J3T A; 1CSK A; 2DMO A; 1AWX A; 1AOJ A; 1BK2 A; 1ABO A; 3TSW A; 2FPE A; 2KEA A; 2YUN A; 1WDX A; 2LQW A; 1RLP C; 1QLY A; 1WLP B; 3A98 A; 1JO8 A; 2YDL A; 2K2M A; 2A08 A; 4OMO A; 1PKS A; 5IHI A; 4J9B A; 4JJC A; 3C0C A; 2LJ1 A; 2O2O A; 2KRS A; 2RQW A; 2DL7 A; 3H41 A; 3M0Q A; 2JT4 A; 1NG2 A; 1X2Q A; 2E5K A; 2CSQ A; 3H0F A; 4JPB W; 2LP5 A; 4OMM A; 2AK5 A; 2OAW A; 3U23 A; 1QWF A; 2DL8 A; 2J6F A; 1ZLM A; 1UE9 A; 1ZUU A; 2O9V A; 1UFF A; 1T0J A; 2FPD A; 5FW9 A; 1VYU A; 2MCN A; 1GL5 A; 2J7I A; 2JS0 A; 1K76 A; 1GCQ A; 2J6O A; 1UHF A; 2YUO A; 1K0X A; 1X6B A; 4RTV A; 2LCS A; 4HVV A; 2BZX A; 1GBQ A; 1S1N A; 3QWX X; 5EC7 A; 3ULR B; 1SHG A; 1YP5 A; 1OOT A; 1U3O A; 2BZ8 A; 4KRT A; 2SRC A; 3ZL7 C; 1H3H A; 2K79 A; 1T3L A; 1SRL A; 3FJ5 A; 3VS3 A; 2D8H A; 2I0N A; 1OPK A; 2DF6 A; 2FO0 A; 2KYB A; 1KSW A; 1QKX A; 3VS5 A; 5IXB A; 3PVL A; 1K0S A; 2ROT A; 4F17 A; 1M30 A; 2RQV A; 2AKK A; 2FRY A; 2RQT A; 4DEY A; 1I0C A; 4AG1 C; 4J9G A; 3NPF A; 1M3B A; 4CC7 A; 2KNB B; 1KIK A; 3H0I A; 1Y57 A; 1GFC A; 2LQN A; 4HVW A; 2JMC A; 1PRL C; 2KT1 A; 2KT8 A; 1UDL A; 1YNZ A; 2GTJ A; 2IIM A; 4M4Z A; 2VWF A; 1KFZ A; 3EHR A; 2X3W D; 1HD3 A; 2RPN A; 2DE0 X; 1AVZ C; 3LH5 A; 1JQQ A; 2YUP A; 2KXD A; 5GJV B; 2A37 A; 1AWO A; 2VKN A; 1YCS B; 2A28 A; 3JV3 A; 2EKH A; 2HCK A; 4GBQ A; 3VS1 A; 2CT3 A; 3PE0 A; 3SEM A; 2DIL A; 1SPK A; 3I5R A; 3TVT A; 4Z88 A; 4J9H A; 4WCI A; 3SHW A; 2F2V A; 1E6H A; 2RQU A; 2PNI A; 5IHK A; 4LUE A; 4D8D A; 2JTE A; 2EQI A; 4J9I A; 2D1X A; 2K6D A; 3CQT A; 4HCK A; 1SHF A; 1U5S A; 2DX1 A; 2CH4 A; 2GGR A; 5FWB A; 4IIM A; 1RUW A; 2CSI A; 3VS2 A; 2C0O A; 2HSP A; 2DLP A; 2OJ2 A; 2EGC A; 1W70 A; 2L3Q A; 1IO6 A; 1KJW A; 2CDT A; 3NHN A; 2AKL A; 4RTT A; 2G6F X; 1WXU A; 2KXC A; 4K11 A; 1MV3 A; 4AFZ C; 1JEG A; 1GCP A; 4JJD A; 1K9A A; 1W6X A; 1E7O A; 1OV3 A; 4RTW A; 2AZS A; 2YUQ A; 2KRM A; 1MUZ A; 4AFQ C; 2K7A A; 2EYY A; 2BZY A; 2V1R A; 3I5S A; 5IHN A; 1PHT A; 2RN8 A; 4OMQ A; 4AFU C; 4ORZ A; 4LE9 A; 3VRY A; 1WIE A; 2DVJ A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3QYG B; 1EZZ B; 4BI8 B; 2AZV A; 1UG1 A; 1JU5 C; 3OS1 A; 1MNE A; 2B86 A; 3PT9 A; 1K9M C; 2E41 A; 2M9U A; 2XU8 A; 4XU0 A; 4RTZ A; 4M78 D; 4OP0 A; 4J8O A; 4DBH A; 4D8K A; 2A36 A; 2Y90 A; 4IIO A; 1FWZ A; 1GCQ C; 1BKB A; 3LLR A; 2JOY A; 4XTY A; 2YXY A; 1BYM A; 4IUR A; 2CH4 W; 2V1Q A; 1OQK A; 2QTX A; 1S72 A; 2LNV A; 3EGX A; 3N5B B; 4BAC A; 4OML A; 1UGV A; 3P8D A; 4XTZ A; 2RHU A; 1SF9 A; 4C8Q C; 5I11 A; 1K1Z A; 2K2V A; 2DRM A; 1ZBJ A; 3OMC A; 3OYY A; 1TTH B; 4FT4 A; 2DJQ A; 5KCO A; 1Q82 U; 3HFN A; 4J7F A; 1ZSG A; 1FMK A; 2GCX A; 2QEX T; 3LX7 A; 3CXC A; 2XDB A; 5J39 A; 1X2K A; 4PJO A; 5GAO p; 1VQ6 T; 1WI7 A; 4Z89 A; 2CZ7 B; 2EPD A; 3FC3 A; 2V8K A; 1K8A R; 1F1B B; 1VQP T; 2K57 A; 2HNI A; 2EW3 A; 4AFS C; 2FZK B; 2H3E B; 3NTI A; 3G6E A; 2RQR A; 1G8X A; 8ATC B; 3V7R A; 3THK A; 5J26 A; 4F14 A; 1M1F A; 2HQX A; 5LJ5 d; 2FRW A; 3MEW A; 4DBR A; 5I2M A; 5CAI A; 1Q81 R; 4IUV A; 2MI6 A; 2HBW A; 4F7U G; 2HL5 C; 3M0R A; 3AHU A; 3G4S T; 2MWO A; 1JXO A; 2ED1 A; 1IRE B; 1HXD A; 3FEO A; 2DM1 A; 5FRO A; 1TG0 A; 2PU9 B; 1GBR A; 2A3L A; 3PIO A; 2COW A; 5KYX A; 2HDA A; 2MIO A; 2DEQ A; 1WFW A; 1D1C A; 1UTI A; 1BB9 A; 2WAC A; 3RDV A; 1N5Z A; 4TVR A; 3VS6 A; 1GFD A; 2YSQ A; 4JJB A; 2E1H A; 1VQ9 A; 1VQ8 A; 3CCE A; 2L0A A; 3JB9 F; 3ME9 A; 4M77 F; 4ATO A; 3QO3 A; 2X35 A; 3BFM A; 5FWC A; 4M7A G; 4C5H A; 3VUZ A; 2LNH B; 3OW2 A; 3G6E Q; 3SWN A; 3SDZ A; 1K4U S; 1QP2 A; 5EG2 A; 2EQK A; 3H0H A; 1WJR A; 1X75 C; 4GLK A; 2X4X A; 4M7A D; 4PJO B; 3JSC A; 4J9F A; 1KHC A; 4LDX A; 2D0Q B; 4M7D C; 4KGV B; 2JJ9 A; 4M75 G; 1OX8 A; 3CC7 T; 4RUG A; 2DZC A; 4JLI A; 1UB4 A; 1U1T A; 2EBP A; 4LDW A; 4C5E A; 2LZ6 B; 1VA7 A; 3VJP A; 4FSX A; 3QYH B; 5GJW B; 3O5Z A; 2HSE B; 2BIV A; 2QG9 B; 4ANJ A; 1RAD B; 4FM4 B; 5GMK l; 2PVO B; 2CUD A; 1TU0 B; 2HMA A; 4A63 B; 2KYM A; 3OYM A; 1D1B A; 2BE7 D; 1X01 A; 1NZ9 A; 1HSQ A; 1VQ9 Q; 1VQ8 Q; 4Q5W A; 1H92 A; 1BIB A; 1W1F A; 1N9R A; 2LDM A; 4X9D A; 3KUF A; 3L2V A; 3LH0 A; 3PMI A; 3S3O A; 4RTX A; 4F16 A; 3L2R A; 4EMG A; 2KE9 A; 3OYN A; 1QVG S; 2DET A; 1U8R A; 3OYF A; 2WSC E; 1YJW T; 3I35 A; 2DL3 A; 1HJD A; 1G2B A; 3RES A; 3J7A F; 3NTK A; 3M0T A; 3C12 A; 1YHQ T; 4WTO B; 2LJ3 A; 3HFO A; 1I5L A; 4Y92 A; 3QUI A; 1VQO A; 4JS4 A; 1ZBX A; 4C0G A; 3L2Q A; 3X26 B; 3H8Z A; 1AZE A; 2DRK A; 1NJI U; 3H9N A; 1AZG B; 2IVW A; 2P4T A; 3GNG A; 4L6V 5; 1MND A; 1WXT A; 4QQG A; 5GAM h; 3QG1 A; 2OTL A; 1M8M A; 3A5Z B; 1EX4 A; 1WX6 A; 4VUB A; 3JCM J; 2OX7 A; 4B9X A; 1YJ9 T; 3MEA A; 1KD1 R; 3EG0 A; 4J9E A; 1SRM A; 1PNJ A; 2ROL A; 1BI1 A; 3RER A; 1D09 B; 4JRQ A; 2DMO A; 2ZPH B; 5LJ3 j; 1RL2 A; 2XIC A; 3QZ9 B; 2VXF A; 2QXF A; 1YI2 T; 2DPP B; 1RLP C; 1WLP B; 3A98 A; 1JO8 A; 2JN0 A; 2VYT A; 5IHI A; 1PKS A; 3CPW P; 3UDC A; 5LJ3 e; 3VV0 A; 3M54 A; 1VQO Q; 2FYK A; 2O2O A; 2PVD B; 2DO3 A; 2PVG B; 3OS0 A; 1ZUU A; 4HT8 A; 2JS0 A; 1K76 A; 5CK9 A; 2J6O A; 1UHF A; 2RJD A; 2F5K A; 2BZX A; 3PMT A; 3GLX A; 1S1N A; 9ATC B; 1IXD A; 1SHG A; 3OYJ A; 1KC8 C; 1YP5 A; 4M78 A; 2XDP A; 3CCE T; 4OB2 B; 4C92 G; 1IHW A; 4EMH A; 3QBY A; 2SRC A; 3ZL7 C; 1QVP A; 1SRL A; 1D0X A; 2FL7 A; 1VOM A; 3CD6 T; 4C92 D; 1N6A A; 8AT1 B; 3G1J A; 2XD0 A; 2LX9 A; 1UGR B; 2RJC A; 2M02 A; 2RQV A; 2AKK A; 1SKU B; 3SFM A; 1I0C A; 3QII A; 4HT9 A; 5AT1 B; 4V2S A; 1NBE B; 4J9G A; 4CC7 A; 1M3B A; 4UC4 A; 2KNB B; 4M77 D; 1RAI B; 2DXC A; 2CP0 A; 3TCJ A; 5LJ5 h; 4HVW A; 1K9M U; 3P8B B; 3EH1 A; 3QKJ A; 1RAE B; 1PRL C; 1UDL A; 1UGS B; 4PJO G; 3CCU A; 2X3W D; 2DE0 X; 3SD4 A; 3JV3 A; 2EKH A; 1KD1 C; 3VS1 A; 2K3Y A; 3G71 T; 2DIL A; 1C6V X; 4J9H A; 4M7D F; 1JJ2 A; 1VQ5 T; 4WCI A; 4JJN K; 1VQM A; 1YIT Q; 2DJZ A; 3OSS C; 5IHK A; 4LUE A; 4D8D A; 1BI3 A; 1FXX A; 2MMP A; 2EQI A; 4O6J A; 2XID A; 5LJ3 g; 3CCS A; 3JCM V; 4KT0 E; 1AT1 B; 3VS2 A; 2LRQ A; 4MDX A; 2X4Y A; 1RAF B; 4M78 B; 2DLP A; 1R0C B; 1IO6 A; 1WNL A; 2HZY A; 2DXB A; 2V8J A; 5DLO A; 2AKL A; 4RTT A; 4OB3 B; 4K11 A; 5D6X A; 4BB7 A; 2ZCF B; 1Q86 R; 3TEE A; 3CCU Q; 3MHX A; 4PK4 A; 3MJX A; 3CCM A; 3I56 A; 1E7O A; 1TOV A; 4PJN A; 1LOJ A; 1OV3 A; 4RTW A; 2AZS A; 2KI7 A; 2KMT A; 2PQW A; 1WHK A; 1O9S A; 3JAM E; 3RUX A; 2KK4 A; 4AFQ C; 3ZFJ A; 2AHJ B; 3QDF A; 3VRY A; 1VQN T; 3CCR A; 1MGQ A; 3PTA A; 2DVJ A; 1C1A A; 4M7A A; 3HSB A; 4A53 A; 4IUQ A; 2AIR B; 3FJP A; 1XTD A; 1M1K R; 4C8Q G; 3R6O A; 3TU4 K; 1SEM A; 4MZM A; 1LNX A; 2CYZ B; 4ZNX A; 3GOX A; 1QW1 A; 1KQS P; 5IH2 A; 3MPU B; 3CCQ T; 2M0O A; 1VQ4 A; 1PCX A; 3I9Q A; 2XKO C; 5GAN 6; 1FMW A; 4C8Q D; 3M0U A; 2VVK A; 4M75 A; 2NUZ A; 4EDU A; 1YIJ T; 4J7I A; 5KYY A; 3IQL A; 2V8I A; 1XQH A; 3CME T; 2E12 A; 1W2B A; 1M2O A; 2MK5 A; 2FHD A; 1BBZ A; 4PL6 A; 4CC3 A; 2X4W A; 3OYB A; 1OU8 A; 2E6Z A; 4OB1 B; 4C0D C; 4KUL A; 3CCR Q; 1UEC A; 2EFI A; 3MET A; 4PNO A; 3JCM c; 2MOX A; 4PFP A; 4XTU A; 1M90 C; 4M77 C; 2EJ9 A; 3HRS A; 3EHQ A; 2DAQ A; 1BI0 A; 1VQK A; 3S3N A; 1Z9Q A; 2M0Y A; 2HKQ B; 4BY6 B; 5HY6 A; 4J9D A; 3CPF A; 2YRD A; 4XU2 A; 5I2S A; 1Y7X A; 1VQ4 Q; 3EGU A; 4GLM A; 1B3Q A; 3EGD A; 4F7U F; 2GFU A; 3RNJ A; 4JUV A; 3REB B; 3HRU A; 3TSZ A; 2NYS A; 1QCN A; 3O8V A; 3LW5 E; 1WJQ A; 4M7A B; 2E65 A; 2K3B A; 3JRZ A; 1Q7Y R; 4E6R A; 2PTK A; 2EYZ A; 1K8A U; 2RHY A; 4IUU A; 3OS2 A; 2L3P A; 4LUD A; 1NEB A; 1I8F A; 1D0Y A; 3R6N A; 4BI4 A; 2QDL A; 2ABL A; 3FIF A; 4DOV A; 3I55 A; 1VQM T; 5HK0 A; 2F69 A; 3BE3 A; 2JM8 A; 5GAM f; 1QCF A; 6AT1 B; 5KYY B; 2DTO A; 1LCK A; 3HL8 A; 3CC2 A; 4FSS A; 2EQU A; 3OYK A; 5GMK m; 1QVG A; 4FCY A; 3ZEH A; 4RCC A; 3NGP A; 1K73 C; 5HCK A; 4ZGE B; 4CI0 C; 1ZQ1 A; 2RNA A; 2JNG A; 1PRM C; 3REA B; 4EMK A; 2QA4 T; 4JZ3 A; 4M7D D; 3PFS A; 4RTU A; 2CGH A; 1BCM A; 2NUP A; 2HEQ A; 3JCM e; 1JRI A; 1OUL A; 2AT1 B; 2COZ A; 4OMN A; 2KDS A; 1TXQ A; 1GRI A; 5GAO r; 3WVD B; 4N0A C; 4E2F B; 4QVC A; 1N8R R; 2LMJ A; 2EQJ A; 1UGP B; 3CPW S; 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