The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
57
|
structure length |
57
|
Chain Sequence |
ATFGMGDRVRKKSGAAWQGQIVGWYCTNLTPEGYAVESEAHPGSVQIYPVAALERIN
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal Structure of a Type II Dihydrofolate Reductase Catalytic Ternary Complex
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Dihydrofolate reductase type 2
|
| molecule tags |
Oxidoreductase
|
| source organism |
Escherichia coli
|
| total genus |
11
|
| structure length |
57
|
| sequence length |
57
|
| ec nomenclature |
ec
1.5.1.3: Dihydrofolate reductase. |
| pdb deposition date | 2007-10-05 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 type barrels. |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2P4T A; 2RK2 A; 2VV5 A; 1VIF A; 3SFM A; 2RH2 A; 3T9N A; 2RK1 A; 2OAU A; 3UDC A; 2GQV A; 1VIE A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4LXC A; 2WSC E; 3L2Z A; 3V8J A; 3JCM J; 3G71 Q; 2XDB A; 4QQG A; 2PVO B; 4R0K A; 1QVG P; 2LQK A; 3CME Q; 3UDC A; 1OPK A; 1KG1 A; 2JM8 A; 1YIT T; 2ATC B; 4JRK A; 2DXC A; 2EYX A; 2AHJ B; 1QVG A; 2HCK A; 3CCV A; 2EPD A; 2G3R A; 2M0Y A; 2EQU A; 2RHI A; 1Q86 R; 4OML A; 4F04 B; 2ENM A; 2A3L A; 1KC8 U; 3H8Z A; 2COY A; 2PVD B; 2M1H A; 1NLP C; 2A7Y A; 4PLI A; 4XU0 A; 3OW2 P; 1KC8 C; 3RBB B; 1UGS B; 2E4H A; 1M4Z A; 2PVG B; 1Q7Y U; 3OW2 A; 2XD0 A; 3MP6 A; 1Q7Y C; 1MV0 B; 4QQ6 A; 2C0I A; 5FU6 B; 3TCJ A; 1KQS P; 1CKA A; 2QEX A; 2L3S A; 3QXE B; 3FRN A; 2QXF A; 2KGT A; 4HVV A; 4M7D C; 4E6R A; 3QO3 A; 1KQS A; 1SSF A; 2HNI A; 3M4G A; 2RJD A; 3R6N A; 2DER A; 4FW2 A; 4RTW A; 2DXT A; 2BIV A; 4UC4 A; 1X2Q A; 2VV5 A; 2RHU A; 1VQ9 Q; 1FWZ A; 2HMA A; 4F7U B; 1AD5 A; 3CMA A; 1RAA B; 1E6H A; 3EHR A; 4L59 A; 3VKI A; 1Z9Q A; 2X4W A; 2LT4 A; 1KD1 U; 3NMZ C; 1ZA1 B; 3M59 A; 4FYW B; 1KD1 C; 1X2K A; 1JRI A; 1NJI R; 1GCP A; 4GBQ A; 2ZGW A; 2CH4 W; 2JW4 A; 2J6F A; 3QWY A; 4RMO A; 1K0S A; 2SRC A; 2HD0 A; 1R0C B; 3VS4 A; 2YUQ A; 3NTK A; 2E10 A; 1M30 A; 5LJ3 e; 1M3A A; 2B8A A; 2OTJ T; 1A0N B; 5KYW B; 3P8H A; 2L3R A; 2YT6 A; 2VKN A; 2KDS A; 4X9C A; 4M78 D; 3HKS A; 3HFN A; 3VYG A; 3CC4 Q; 2HEQ A; 1HJD A; 2JNG A; 3EFR A; 2ZAE A; 1VIF A; 3KBG A; 1VQO A; 2KEA A; 4HA8 A; 1VQ8 Q; 4IUV A; 2YRD A; 1G3Y A; 2M0O A; 2K57 A; 5GAN f; 4PJO D; 2K5I A; 1YJW A; 2D9T A; 3I55 T; 2HDA A; 1WFW A; 2F2V A; 3C4S A; 4F7U A; 1D0Y A; 2A37 A; 2G6F X; 4X9D A; 3UA7 A; 1H3H A; 3MPU B; 3DLL A; 2EAY A; 4J9E A; 4PLL A; 1VQK T; 2D0Q B; 1QVF P; 1I07 A; 1M2V B; 1M8M A; 3ZFJ A; 1OUL A; 5GAN 6; 1QVF A; 3DKM A; 3SWN B; 2VC8 A; 1K4U S; 4XU3 A; 4F17 A; 3L2R A; 3REB B; 1NEG A; 4EMG A; 5IXF A; 3BW1 A; 1WJQ A; 1MUZ A; 2YDL A; 1B34 B; 5FW9 A; 1KHC A; 3EGX A; 1N8R U; 3OYM A; 1T3S A; 1N8R C; 5I2M A; 5KCO A; 4C0D B; 3C94 A; 2VVK A; 4AFQ C; 3G4S Q; 3V7C A; 4J8O A; 3VS5 A; 2DL3 A; 3CXC S; 3M0Q A; 1JO8 A; 3X25 B; 4FCY A; 2KQW A; 2O2O A; 3PFS A; 3CPW S; 3QKJ A; 1W6X A; 2JS2 A; 2RF0 A; 4LUE A; 2EQK A; 4LDU A; 1NZ9 A; 3LH0 A; 2P4R A; 1KQ2 A; 2A0F B; 3MET A; 3G1J A; 4JRQ A; 1UGR B; 2JS0 A; 4DBH A; 5C6S A; 3CCM A; 4E7H A; 1UUE A; 4BUG A; 2QEX T; 2E5K A; 1Y96 A; 4BE0 A; 1QQJ A; 5M9O A; 4N0A A; 1X43 A; 2F5K A; 2HBW A; 4M77 A; 3MKD A; 3CCL T; 4FYX B; 3OYE A; 2PNI A; 2K2V A; 1JQQ A; 3MJX A; 1U3O A; 2DE0 X; 4RUG A; 2I0N A; 3OMC A; 3ULR B; 1N5Z A; 4KGV B; 1XJW B; 3SWN A; 3UT1 A; 2PUO B; 2F5T X; 3QSU A; 3CC2 A; 2VB6 A; 2HQX A; 5A0L A; 1JBM A; 1Q86 C; 1RI9 A; 2V8K A; 3WXM B; 3QYG B; 1NG2 A; 2CUB A; 1I4K 1; 3QJY A; 3TSZ A; 1SG5 A; 2CP2 A; 4KH0 B; 1QCO A; 1TH7 A; 1TXQ A; 3OYH A; 4IUU A; 3UAT A; 4A63 B; 2FHD A; 1AWX A; 5GMK i; 2M51 A; 3GF5 A; 4A4G A; 1VYU A; 3S3M A; 4J9D A; 2NLU A; 2GQI A; 5GAN 4; 4NS5 A; 4L5G A; 3LWH A; 3CCU Q; 2OTL A; 4PJN A; 3AHU A; 1XNI A; 4BDY A; 5FWB A; 2AZS A; 3EG1 A; 1H3Z A; 2K4Y A; 3I5S A; 3PGG A; 3WVE B; 2X3X D; 1Q95 G; 3CCJ T; 3OYG A; 1I81 A; 2RA2 A; 4HT9 A; 4OB1 B; 3EG9 B; 4M77 E; 1WHM A; 1ZBX A; 1VQL A; 3TU4 K; 5I2S A; 1UB4 A; 4ZGE B; 2CDT A; 5LJ3 f; 3E1S A; 4OGE A; 4C8Q B; 1PSE A; 3QBY A; 3M0S A; 4JDS A; 5GAM h; 1WHJ A; 2FEI A; 3EG2 A; 5KE2 A; 3OYD A; 3JCM e; 3QUI A; 3V8K A; 3M4Y A; 3CPW P; 1M90 U; 2CP5 A; 3VS1 A; 1M90 C; 1ABO A; 2QGG A; 3G7Z A; 3M0R A; 4EPC A; 5IHK A; 5GAN j; 4M77 G; 2CKK A; 2YHT A; 2FZG B; 2RMO A; 1AVZ C; 2KR3 A; 4HCC A; 2LP5 A; 5GAO m; 2GGR A; 3MP8 A; 3BY7 A; 3F70 A; 2XKO C; 3OQ5 A; 1K73 U; 1I5L A; 1I0C A; 3A8O B; 1K73 C; 1WZO A; 4KT0 E; 3JB9 D; 4M7A B; 3JCM b; 4ATO A; 4M77 F; 4ME7 A; 4J7F A; 5CAI A; 2QAS A; 5CKB A; 2Z0W A; 3VRZ A; 2E3I A; 5J3B A; 3LH5 A; 2DL8 A; 1W70 A; 3L2U A; 3CCM T; 1BI0 A; 3VUB A; 2EW3 A; 1RAE B; 3C12 A; 3QDR B; 4N4I A; 2EJG A; 1X6O A; 1K8A U; 4JPB W; 1WQ7 A; 1K8A C; 2O9S A; 3C95 A; 5GMK l; 2XDP A; 2DET A; 4XQ3 A; 2V8I A; 2NUT A; 2OTJ Q; 1D0Z A; 4OF1 A; 4JJC A; 3A5Z B; 2K6D A; 4J6X A; 1KSW A; 1VQ7 T; 4XAX B; 1ZA2 B; 4A4K A; 3HSB A; 2GTO A; 2K3B A; 4KUL A; 5CVI A; 2KT1 A; 2CP6 A; 1SKU B; 4XTW A; 4ANJ A; 1YI2 A; 1E6G A; 5IN1 A; 3UWN A; 4OGC A; 3FDR A; 2CZ6 B; 2EVR A; 3JAM E; 3EGD A; 1BYM A; 2A28 A; 2LNV A; 1XQH A; 2VGM A; 3IQL A; 4A4E A; 1AT1 B; 3SB2 A; 1QWF A; 1K9M U; 4M78 A; 1UGV A; 3EFS A; 3RES A; 3MCA B; 1R77 A; 3JCM X; 4M77 C; 4M7A A; 3CCR A; 3TQ7 P; 1V76 A; 1I8F A; 4J9B A; 4OVA A; 1ZHI A; 4RTZ A; 4LDV A; 1H92 A; 2XU8 A; 4V2S A; 1SRL A; 3CCQ Q; 4DEX A; 4IUP A; 3HRU A; 2P0Q A; 4PJO A; 2F2W A; 2DFU A; 2KI7 A; 3G6E A; 4C0Z A; 3OW2 S; 4PKC C; 1GCQ A; 3FIF A; 4FSX A; 3OY9 A; 1PRL C; 1GL5 A; 1VQL T; 3CBO A; 2JTE A; 2EQM A; 2Y90 A; 3ZL7 C; 3TRE A; 4OMO A; 2JTF A; 4E7J A; 2CP3 A; 4JRI A; 2RHY A; 4RTT A; 1FYN A; 2E65 A; 5HKC A; 2FYK A; 3H9N A; 1VYV A; 1G3W A; 3DLM A; 3LW5 E; 5KYX B; 1WA7 A; 4GLM A; 2LJ1 A; 4AG2 C; 2PQW A; 3PMT A; 2FRY A; 2CP0 A; 1NYG A; 2K3X A; 4B9X A; 5LJ3 j; 5FRM A; 4M7D G; 3MP1 A; 1RAG B; 3GIB A; 4IUT A; 1W2B P; 4IKF A; 3NTI A; 4JZ3 A; 1D0X A; 1W2B A; 1QP3 A; 4QQD A; 2ECZ A; 3TSW A; 4M78 E; 2RNA A; 3L42 A; 1BI3 A; 2HQE A; 3X24 B; 2FB7 A; 1M3B A; 2DYI A; 1VQP T; 2W0Z A; 2X35 A; 1PCX A; 4OB2 B; 3JCM h; 1BU1 A; 1PRM C; 1OX8 A; 2DRM A; 4E7I A; 1NM7 A; 1VQN Q; 1H8K A; 2EYY A; 4PJO E; 4TVR A; 1FMK A; 2DBM A; 3RDV A; 3OYA A; 5DM7 R; 2HKQ B; 2RQU A; 1UGQ B; 5HCK A; 2EGA A; 1D1A A; 2RQR A; 3JCM P; 2LRQ A; 2EYZ A; 1IGQ A; 4M78 G; 2CP7 A; 4QKU A; 2RJC A; 2DRK A; 4J9F A; 4ELZ C; 4FM4 B; 1SSH A; 2LMJ A; 1JEG A; 2XID A; 2JJ9 A; 2LQN A; 3I5R A; 3CC7 T; 9ATC B; 1ZSZ B; 2HL5 C; 3E9F A; 5CKE A; 5KYX A; 1YIJ T; 1J3T A; 3PTA A; 2K79 A; 1VQM A; 3P8B B; 1I1J A; 1WHH A; 2KK4 A; 3CCQ A; 3KFV A; 3SFM A; 3UF4 A; 1NYF A; 3ZEH A; 3C0C A; 1PD1 A; 5GJV B; 1PSF A; 2J6O A; 2E70 A; 1YI2 T; 2DXU A; 8ATC B; 4M78 F; 3KUF A; 4HXJ A; 1QVF S; 3CCJ Q; 2RQV A; 3NPF A; 3MHX A; 3M53 A; 5IH2 A; 1PWT A; 5GAN g; 4FT4 A; 4EMK B; 3VU3 C; 2LDM A; 2AT1 B; 4XTX A; 3CEY A; 3OA6 A; 1MMG A; 3X20 B; 2EFI A; 2OAU A; 4PJO F; 1N27 A; 4E7K A; 4JLI A; 4JJN K; 2P0P A; 2D0N A; 3CCR T; 3J80 E; 3E2U A; 4IIO A; 1WGS A; 3BDU A; 4C8Q D; 3CQT A; 4FYV B; 4QVD A; 2HSP A; 1YJ9 Q; 2I2L A; 1D3B B; 4HCK A; 2KAF A; 1Q82 U; 3CCE T; 4CI0 C; 3CD6 A; 3G6E T; 2K3Y A; 1VQ5 T; 1Q82 C; 1VQ6 T; 3PVQ A; 1ZQ1 A; 1Q81 R; 5A0D A; 3RR6 A; 3THK A; 1ZSZ A; 2JTM A; 2DTH A; 3M9Q A; 4XU1 A; 1EX4 A; 1IGU A; 1VQN A; 1X6G A; 5ECA A; 4PFO A; 2RN8 A; 5GAN d; 2COZ A; 1JB0 E; 4M78 C; 1X75 C; 2C0T A; 1X01 A; 4RTV A; 5D7U A; 1G3T A; 1WQW A; 2O4X B; 5GAM e; 3OS5 A; 1YWO A; 1RAC B; 4JUV A; 1PM3 A; 2FZC B; 4B6M A; 3I56 Q; 2L5Q A; 4PFZ A; 2QQS A; 3OS1 A; 3NGP A; 4M75 B; 1VQ4 A; 4DQ2 A; 1PKS A; 1M1K U; 4M7A D; 4PJO C; 3QZ5 B; 2QA4 T; 2X4Y A; 1M1K C; 3Q1J A; 3VS2 A; 2JOY A; 1RAD B; 1GCQ C; 3G71 A; 1U8R A; 2J06 A; 4Y28 E; 3CME A; 3PNW C; 2VGN A; 2LZ6 B; 2DD5 A; 1ZLM A; 1YHQ Q; 4C5H A; 1QMC A; 1ZUK A; 2VYT A; 3N5B B; 1VQ7 Q; 4BI4 A; 4FT2 A; 2COW A; 2NUZ A; 1YJN T; 2DXB A; 2DLP A; 3BDL A; 2ZCF B; 1HK9 A; 4D8D A; 1KK7 A; 2RPN A; 2FO0 A; 2MYS A; 4BY6 C; 2XHC A; 2GTJ A; 3JB9 I; 1BIA A; 2JVV A; 2X9H A; 1ARK A; 2QYZ A; 2ESW A; 5GAN 3; 2MI6 A; 2X51 A; 1WX6 A; 1K1Z A; 5GMK j; 5CKH A; 4XTY A; 2QI2 A; 5IT9 E; 3VJP A; 4XTZ A; 1U1T A; 2V1Q A; 4MZM A; 1VQM T; 2ED0 A; 2HZY A; 4WTO B; 1S72 Q; 2HSE B; 1YJ9 A; 1VQ9 A; 5KYW A; 1AEY A; 1LPL A; 2ZPF B; 4XK8 E; 2Y4Y A; 1RL2 A; 3CCV T; 2RD1 A; 1LJO A; 3EAE A; 8AT1 B; 5CK9 A; 5FU7 B; 4E2F B; 1RAF B; 3RMQ A; 1ZX6 A; 2HQH A; 3A8L B; 4Y91 A; 2GFU A; 3PMI A; 4BI3 A; 2SEM A; 1ZUY A; 4DEY A; 5LJ3 g; 1CSK A; 3OBY A; 3EFO B; 1LNX A; 4C92 B; 2M9U A; 3FB9 A; 2DD4 A; 5CKD A; 2DYB A; 2DAQ A; 2KBT A; 2CGH A; 2MWP A; 4F7U E; 2QGF B; 3M0P A; 2R58 A; 1U1S A; 1Y7X A; 2J6K A; 4FL6 A; 3S3O A; 1QWE A; 1ZSG A; 4JLG A; 3I56 A; 1M2V A; 3CCS Q; 2LCC A; 2X4X A; 3CMA T; 3GBQ A; 1M2O A; 3CC4 A; 2H8H A; 4AFS C; 2MPX C; 5GAN 5; 4CC3 A; 3M5A A; 1Q86 U; 1AHJ B; 2QTV A; 1VQ8 A; 3JB9 G; 2QTX A; 1G8X A; 1B34 A; 1FMW A; 4JJD A; 1YHQ A; 2KVQ G; 4F7U G; 1D09 B; 2QAZ A; 1VQP Q; 2V8J A; 2ROL A; 2DMO A; 3EG0 A; 1OV3 A; 5LJ3 d; 2KE9 A; 3OYB A; 4LD9 K; 3PE0 A; 4QVC A; 2NYS A; 3GPL A; 4Y92 A; 5DLQ E; 3JB9 F; 3OYI A; 1JJ2 A; 1OU9 A; 1G83 A; 1K0X A; 3PIO A; 2FPE A; 2CZ1 B; 1RAB B; 4F7U F; 1VQO T; 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3P8D A; 3CCU A; 1ZUU A; 3JCM W; 1Q7Y R; 3QJ6 A; 3CC4 T; 3JRZ A; 1JXM A; 3CC2 T; 1TU0 B; 2BZX A; 2RB6 A; 3EGU A; 2QA4 Q; 3RER A; 4HCZ A; 2QK0 A; 1T0H A; 2LX9 A; 5CR2 A; 4HCB A; 2KYM A; 4ZTF A; 2DEU A; 1IXD A; 2W10 A; 4J9I A; 5KE3 A; 5CKF A; 2KMT A; 3HTR A; 3TEE A; 4J9G A; 4M75 D; 4PL6 A; 3I55 Q; 2RK2 A; 4KH1 B; 2LQ8 A; 4R55 A; 2VXE A; 1KD1 R; 4GLK A; 3X28 B; 2Y4X A; 4ZTJ A; 4N0A C; 1YJN Q; 1NEB A; 2DJQ A; 2PTK A; 4OMQ A; 1LCK A; 3LX7 A; 2JMC A; 2OTL T; 2CUD A; 2EQJ A; 3A8G B; 1VQK Q; 4F16 A; 3RIR A; 1UGP B; 4XTU A; 3OS0 A; 1IHW A; 3M56 A; 2RH2 A; 2RQT A; 4II1 A; 3SWN C; 1UJY A; 2EGC A; 4C8Q E; 5L23 A; 1RI0 A; 4ORZ A; 2C0O A; 2BZY A; 2RM4 A; 4A4F A; 1NPR A; 1IZ6 A; 3JCM V; 1TUC A; 3FJP A; 1Y57 A; 1WIE A; 3HP9 A; 1M3C A; 2DA9 A; 4RTU A; 2F2X A; 3NHN A; 4LDY A; 5KYY B; 4KRT A; 2IG0 A; 4C0D C; 2LC4 A; 1UHF A; 2DTO A; 3M57 A; 3CCV Q; 4E7L A; 2AKL A; 4ZGJ B; 3JCM d; 4AMC A; 4O6J A; 2ZPH B; 1OI1 A; 1C1A A; 2EYW A; 5GAN 7; 5GMK m; 1HYO A; 2DIQ A; 2E41 A; 5GAM j; 1YP5 A; 2RI2 A; 4LN2 A; 4AT1 B; 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