The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
9
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sequence length |
64
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structure length |
64
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Chain Sequence |
GSPEETLVIALYDYQTNDPQELALRCDEEYYLLDSSEIHWWRVQDKNGHEGYAPSSYLVEKSPN
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
NMR structure note: murine Itk SH3 domain
rcsb |
| molecule tags |
Transferase
|
| source organism |
Mus musculus
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| molecule keywords |
Tyrosine-protein kinase ITK/TSK
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| total genus |
9
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| structure length |
64
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| sequence length |
64
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| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 2007-12-08 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3H0F A; 1NG2 A; 2O2O A; 4AFZ C; 1H3H A; 1W6X A; 2ECZ A; 1GBR A; 2X3X D; 1AZG B; 1B3Q A; 1U5S A; 2M51 A; 2J06 A; 4RTV A; 2CT3 A; 1UGV A; 2VWF A; 2AKL A; 3JV3 A; 2ESW A; 1BB9 A; 2EYX A; 2LJ3 A; 2EQI A; 2CRE A; 2A28 A; 1BBZ A; 5I11 A; 1X2Q A; 1G83 A; 2KE9 A; 2GQI A; 4J9H A; 2RPN A; 2KRO A; 2KEA A; 2CT4 A; 1PRM C; 2C0O A; 1JQQ A; 2CUD A; 2DRM A; 2VKN A; 1J3T A; 1SSH A; 4F16 A; 1XOV A; 4LN2 A; 4Y92 A; 2DM1 A; 3EHQ A; 3I9Q A; 1JU5 C; 1K9A A; 1UUE A; 1WX6 A; 5IH2 A; 5EC7 A; 4LUE A; 1UJ0 A; 2DBK A; 1A0N B; 3EG0 A; 3REA B; 2JS2 A; 2KRN A; 1AVZ C; 1YNZ A; 2EVR A; 1MV0 B; 2BZ8 A; 1WXU A; 1E6H A; 2KRS A; 1WI7 A; 2V1Q A; 2W10 A; 1WXT A; 2HEQ A; 4JZ3 A; 3R6N A; 3VS3 A; 1VA7 A; 1T0H A; 2IIM A; 3ULR B; 1SRL A; 5IXF A; 1KFZ A; 5IHK A; 2K9G A; 1GBQ A; 1GCP A; 4CC4 B; 2XMF A; 2FO0 A; 2JW4 A; 1ABO A; 1E6G A; 2J6K A; 2LQW A; 1K0S A; 2F2V A; 4CC7 A; 1WIE A; 2LZ6 B; 4JJC A; 1X2K A; 2LP5 A; 1VYU A; 2OJ2 A; 3UA7 A; 5IHN A; 1NEG A; 1U3O A; 3NPF A; 4CC2 A; 4R0K A; 1JEG A; 2RQT A; 4OMQ A; 5FWC A; 1QWE A; 4HXJ A; 2HBW A; 2QDL A; 2CDT A; 2D0N A; 1T3L A; 2L2P A; 1CSK A; 2LX7 A; 2ED1 A; 2YT6 A; 4RTX A; 1X43 A; 2O88 A; 1OOT A; 2O31 A; 2EKH A; 4E6R A; 3CQT A; 1EFN A; 2ROT A; 1UFF A; 3A98 A; 1FYN A; 1LCK A; 1M3A A; 1UTI A; 2FG0 A; 2FRY A; 2DMO A; 2DLP A; 5ECA A; 2ENM A; 2DRK A; 3RNJ A; 1G2B A; 2DIL A; 3EG3 A; 3H0H A; 3I35 A; 1NEB A; 2L3P A; 2F2X A; 4LUD A; 1AWJ A; 1PWT A; 2L3Q A; 2BZY A; 1WA7 A; 2LJ1 A; 1B07 A; 1SEM A; 1M27 C; 2DE0 X; 2OI3 A; 1ZUU A; 4DEY A; 2EGA A; 2KT8 A; 2GBQ A; 2CSQ A; 2RMO A; 2OAW A; 1JXM A; 1UJY A; 2BTT A; 1GL5 A; 1K1Z A; 3VRZ A; 1AWO A; 3EGU A; 2DL5 A; 2ABL A; 2KYB A; 4AFS C; 2D8J A; 1UDL A; 2BZX A; 2YUO A; 3RBB B; 4ESR A; 3VS7 A; 4AG1 C; 4OML A; 4RTU A; 4RTY A; 4F17 A; 3I5R A; 2RQW A; 2X3W D; 4JJD A; 2EYW A; 1BK2 A; 3VS2 A; 2DF6 A; 2JS0 A; 2YUN A; 2KXC A; 2PZ1 A; 3REB B; 3SHW A; 3QWX X; 2J05 A; 5FWB A; 2G6F X; 4RTZ A; 5IXB A; 3UF4 A; 1IO6 A; 3M0U A; 3VS6 A; 2ED0 A; 1QWF A; 1WFW A; 2EYZ A; 1I07 A; 4GBQ A; 4Z88 A; 1GRI A; 2K79 A; 5GJV B; 1AOJ A; 3O5Z A; 2C0T A; 2RF0 A; 2JT4 A; 2DL4 A; 1M3B A; 2KBT A; 2DBM A; 4HVU A; 3PVL A; 4OMN A; 1H92 A; 1NYG A; 3UAT A; 3VS0 A; 1ZLM A; 1QLY A; 2LCS A; 1AWX A; 1JO8 A; 1M8M A; 1SPK A; 4M4Z A; 2KR3 A; 2L0A A; 2DA9 A; 1X6G A; 2PTK A; 2LQN A; 1I0C A; 2A37 A; 3H0I A; 2CSI A; 1OPL A; 2EPD A; 1NM7 A; 1M3C A; 2EBP A; 4HVW A; 2HCK A; 1UG1 A; 1KIK A; 1AD5 A; 2DNU A; 1MV3 A; 3TVT A; 1UHF A; 1AEY A; 3THK A; 3I5S A; 1X6B A; 2L3S A; 2VVK A; 4IIO A; 3VS4 A; 5L23 A; 2J6O A; 2JM9 A; 1HD3 A; 2CUB A; 3U23 A; 4X1V A; 2H8H A; 3H41 A; 2RQU A; 2SEM A; 3UA6 A; 2D8H A; 1T0J A; 1WYX A; 2LJ0 A; 1CKB A; 1K76 A; 3M0R A; 2DYB A; 2B86 A; 2DJQ A; 1GCQ A; 1ARK A; 2EGC A; 4RTT A; 1YN8 A; 3QWY A; 4OMP A; 2W0Z A; 1WXB A; 4AFU C; 1E7O A; 1MUZ A; 1M30 A; 4EIK A; 2O9V A; 2DX1 A; 5HCK A; 2MCN A; 1RLP C; 1X69 A; 1K0X A; 2E5K A; 3EG2 A; 4WCI A; 1NYF A; 1UHC A; 1JXO A; 2YDL A; 2EYY A; 2YSQ A; 3SEM A; 3FJ5 A; 4LNP A; 2DL3 A; 3C0C A; 1BU1 A; 1AWW A; 1YP5 A; 4F14 A; 2KNB B; 2P4R A; 1ZBJ A; 2D1X A; 2DVJ A; 2JTE A; 2EGE A; 4J9E A; 4AFQ C; 2EW3 A; 2MIO A; 2RQR A; 1PHT A; 1GFC A; 3M0S A; 2YUQ A; 1QCF A; 2KYM A; 3VRY A; 1Z9Q A; 1ZSG A; 2YUP A; 4J9D A; 4JZ4 A; 1ZUK A; 2GTO A; 2V1R A; 2JM8 A; 3NGP A; 4OMM A; 1RLQ C; 3M0Q A; 2K2M A; 1N5Z A; 4A63 B; 1HSQ A; 1Y0M A; 2PNI A; 3M0P A; 4GLM A; 3TSW A; 4J9G A; 2RQV A; 1HJD A; 4D8K A; 4RUG A; 1VYV A; 2A08 A; 4KRT A; 2GNC A; 2K6D A; 2ROL A; 2C0I A; 1YWP A; 3PVQ A; 2FPF A; 4CC3 A; 2DL7 A; 1H8K A; 4DEX A; 4ZNX A; 3GBQ A; 2KT1 A; 2FEI A; 2FPD A; 2RNA A; 2SRC A; 3M0T A; 2GGR A; 3LH5 A; 1TUC A; 2RN8 A; 4RTW A; 2JMA A; 1OV3 A; 2FRW A; 1S1N A; 1CKA A; 3IQL A; 1W70 A; 4Z8A A; 2CH4 W; 1TG0 A; 5I22 A; 1PRL C; 1PKS A; 2GTJ A; 1U06 A; 2NUZ A; 1QKX A; 1ZUY A; 2AKK A; 3KFV A; 3VS5 A; 1GFD A; 2I0N A; 2J6F A; 1RUW A; 1QKW A; 3EG1 A; 1FMK A; 1WDX A; 2M0Y A; 4D8D A; 1GCQ C; 1Y57 A; 2DL8 A; 1ZX6 A; 1V1C A; 1YWO A; 1X27 A; 3NMZ C; 1TUD A; 2HSP A; 1ABQ A; 2K7A A; 4HVV A; 2LNH B; 4JPB W; 1SHF A; 1W1F A; 4K11 A; 3TSZ A; 1KSW A; 1SHG A; 2NWM A; 4LE9 A; 3PE0 A; 2AZV A; 4J9I A; 2KXD A; 4ORZ A; 1NLO C; 2CH4 A; 4J9B A; 2O9S A; 4HCK A; 4J9F A; 1UE9 A; 2AK5 A; 1I1J A; 1Z9Z A; 1YCS B; 4QT7 A; 2FPE A; 4AG2 C; 2AZS A; 1VYT A; 1T3S A; 3EHR A; 5GJW B; 1KJW A; 2KGT A; 3VS1 A; 4IIM A; 2HDA A; 1AZE A; 2JXB A; 3NHN A; 1PKT A; 2F2W A; 3ZL7 C; 1WLP B; 2A36 A; 4JJB A; 1PNJ A; 1RI9 A; 2K3B A; 4FSS A; 4J9C A; 2J7I A; 1K4U S; 4Z89 A; 5IHI A; 4OMO A; 2MOX A; 2LMJ A; 1OPK A; 1SRM A; 1NLP C; 5FW9 A; 1UEC A; 1OEB A; 2KRM A; 2JMC A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4C5E A; 2O2O A; 3M54 A; 4FYW B; 2HL5 C; 3PMT A; 1W6X A; 4LXC A; 2ZCF B; 3ME9 A; 4XU3 A; 3EAE A; 3CCM A; 1AZG B; 4E7I A; 1K8A R; 3LX7 A; 3E2U A; 1K73 R; 4KH0 B; 4M75 G; 5CO7 A; 3JB9 G; 5DY9 A; 4DBQ A; 4FM4 B; 1S72 T; 4XTW A; 3G71 Q; 4RCB A; 2AKL A; 2VXF A; 4TVR A; 4QVD A; 3RMS A; 3CC2 T; 2RHU A; 1XQH A; 2A28 A; 5CQX A; 1X2Q A; 3H9N A; 1G83 A; 1JJ2 P; 2GQI A; 3F70 A; 4J9H A; 3I56 A; 5M9O A; 4XQ3 A; 2X35 A; 2PUK B; 2CUD A; 4J83 A; 5LJ3 e; 3A8M B; 2GF7 A; 3QYH B; 1RAE B; 4DBH A; 3CCJ T; 1WX6 A; 5IH2 A; 3QII A; 5EC7 A; 3GNF B; 2DBK A; 2EQU A; 1M1G A; 2M9U A; 2JS2 A; 2KRN A; 1WXU A; 5D6Y A; 4YTL A; 4C92 G; 1WI7 A; 3ASK A; 1M2V A; 4BUG A; 4IUT A; 4FCY A; 1D09 B; 4C5G A; 1T0H A; 3ULR B; 1VQ4 T; 5DLQ E; 2PVG B; 2YLB A; 1KFZ A; 2CP0 A; 2JUF A; 3MP6 A; 1E6G A; 1K0S A; 4KGZ B; 1PCX A; 1W2B A; 3PMI A; 2ZPG B; 2EJ9 A; 1X2K A; 3CCS A; 1X6O A; 3OB9 A; 2HL3 A; 1W2B S; 1VYU A; 2OJ2 A; 3UA7 A; 3L2R A; 1YJ9 A; 3NPF A; 4CC2 A; 3CC7 A; 3AHU A; 2MI6 A; 2EAY A; 4OMQ A; 5FWC A; 4RG8 A; 4HXJ A; 2RJD A; 3TQ7 P; 2L2P A; 2LX7 A; 4RTX A; 1OUL A; 2O31 A; 2EJG A; 1MND A; 3VYH B; 2RJC A; 1LNX A; 4BI4 A; 5GAM h; 4E47 A; 1I5O B; 2LVM A; 2FRY A; 4FYY B; 4FT4 A; 1IB8 A; 4PLL A; 2DRK A; 4IUV A; 4M7A D; 1TOV A; 3DB3 A; 2K5I A; 2F2X A; 2L3Q A; 1OX9 A; 4HT8 A; 4X34 A; 2DXT A; 2P0P A; 2MK5 A; 2HKQ B; 4C8Q E; 2LQ8 A; 3JRZ A; 3HRS A; 2RMO A; 2HNI A; 1RAD B; 1P92 A; 1D3B A; 1UJY A; 2HMA A; 1K1Z A; 1AWO A; 3HHT B; 3EGU A; 4C8Q A; 1FWZ A; 2ABL A; 2DL5 A; 2YHT A; 4AFS C; 1UDL A; 2BUD A; 2BZX A; 4ELZ C; 1Y71 A; 2Y4Y A; 5GMK j; 4JS5 A; 1VQO Q; 5DLO A; 3MP8 A; 4JJD A; 3SWN B; 2HD0 A; 3VS2 A; 3M57 A; 2YUN A; 3G71 T; 1Q86 C; 2RH2 A; 2LRQ A; 2E3H A; 2QDY B; 1WHM A; 2X4X A; 3M4G A; 1IO6 A; 2QTX A; 2D9T A; 1WFW A; 4JRK A; 1KQS A; 2CP2 A; 2QAZ A; 1Q7Y U; 1UGS B; 4Z88 A; 5KYN A; 2K5L A; 1KQS S; 3CCR Q; 3G1J A; 2HQX A; 3J81 E; 3A8G B; 3G4S T; 3A8L B; 2JT4 A; 4A54 A; 3CXC A; 4NS5 A; 3QDF A; 2DBM A; 1K9M U; 3PVL A; 2KSS A; 4DOV A; 1MHN A; 5FRO A; 2LTO A; 4ZGE B; 5L8R E; 8AT1 B; 4NL3 A; 3P8H A; 3H0I A; 2CSI A; 2E10 A; 4XU1 A; 3SWN C; 2QA4 T; 1YIT T; 4HVW A; 1KIK A; 1LVK A; 2XD0 A; 1AEY A; 2A7Y A; 1YIJ T; 4ATO A; 4MML A; 1W2B P; 3CCQ Q; 1YI2 Q; 5CIU A; 4A4H A; 1N8R R; 2GQV A; 3CD6 A; 2J6O A; 1QQJ A; 1NPR A; 4Z02 A; 2H8H A; 4ZN1 A; 5LJ3 g; 3RKY A; 5GAN h; 1WYX A; 1CKB A; 4PJO E; 3QBY A; 2B86 A; 1V29 B; 3A8O B; 1M2V B; 4E7Z A; 1ARK A; 1YN8 A; 1WXB A; 4M77 E; 4FW1 A; 4PJO A; 2K4Y A; 4GY5 A; 3N5B B; 5J39 A; 3OSS C; 4LD9 K; 3BFM A; 1IRE B; 1VQN A; 3OMC A; 5KYW A; 1X69 A; 1VQ9 T; 3EG2 A; 4M77 A; 2K3Y A; 1WHK A; 2WSE E; 2DK3 A; 2YDL A; 2M02 A; 3SEM A; 3FJ5 A; 3Q1J A; 4LNP A; 4M7D E; 1VQ8 Q; 2X51 A; 2CP6 A; 2RI2 A; 1ZBJ A; 3FDR A; 2RK1 A; 2DVJ A; 3CCM T; 3HP9 A; 4M7D A; 1PHT A; 5LJ3 j; 1QCF A; 2KYM A; 3VRY A; 4OB3 B; 4F7U E; 4M7A C; 3NGP A; 1S72 A; 4E2F B; 2K2M A; 4MDX A; 4XAX B; 2DER A; 4F7U A; 2R5A A; 4GLM A; 4FIB A; 3CC2 A; 1G3S A; 4D8K A; 1VYV A; 2A08 A; 4J7I A; 1WJQ A; 2K6D A; 2RA2 A; 3I56 T; 3ER0 A; 1XNI A; 3OSV A; 2ZPH B; 1H8K A; 4A4G A; 4V2S A; 4DEX A; 3GBQ A; 3M0T A; 4ANJ A; 2GGR A; 3LH5 A; 1BCM A; 1D3B B; 2MAM A; 1KQS P; 4RTW A; 3OYG A; 4C8Q B; 1CKA A; 4JRI A; 4M77 D; 1D0Z A; 4LDU A; 1HK9 A; 1PRL C; 3RKX A; 4KBM B; 4JDS A; 2JN0 A; 4JUV A; 3HPW A; 5KH6 A; 4KGX B; 3OS1 A; 2I0N A; 2J6F A; 4J7F A; 4M7D D; 2K3X A; 1JBM A; 1QKW A; 3EG1 A; 2YWW A; 3T9N A; 5IAY A; 5GAN e; 4ZGD B; 4FU6 A; 3CCS T; 1I4K 1; 1X27 A; 3CBM A; 4B6M A; 2JZ2 A; 2HSP A; 2K7A A; 1OQK A; 2DAQ A; 2F5K A; 2YXY A; 1WHG A; 1YJ9 T; 2E6Z A; 3CBP A; 3CC7 T; 3EFO A; 4R56 A; 3TU4 K; 2XDD A; 3MET A; 1TTH B; 1Y96 A; 1YI2 T; 2AZV A; 1UGP B; 5I21 A; 2ZPE B; 3E9G A; 3JAM E; 1Z9Z A; 2FPE A; 1TUG B; 4HT9 A; 2JXB A; 1RAB B; 4LDY A; 2IG0 A; 5AYF A; 3FB9 A; 3ZBD A; 4M78 E; 1RI9 A; 1VQL Q; 4Z89 A; 4P5N A; 1Q86 R; 4PNO A; 1Q81 C; 3L1A A; 5GAO r; 1MMN A; 4M75 D; 4M78 A; 1OPK A; 1M5Q 1; 1OI1 A; 2ZPB B; 4FYV B; 4II1 A; 2MMP A; 3CMA Q; 4BY6 C; 3E9F A; 4KH1 B; 4LDV A; 5KCO A; 1H3H A; 1GBR A; 2QYZ A; 4XTU A; 1OZ3 A; 1LPL A; 1SSF A; 2OTL Q; 4N0A A; 2QG9 B; 2NYS A; 2E6N A; 3I55 Q; 2DFU A; 2ZPI B; 4PJN A; 2VC8 A; 4PJO B; 3JCM J; 3G71 A; 2CP3 A; 1JJ2 A; 1VQ6 Q; 2FL7 A; 5KYW B; 1JJ2 S; 3JB9 I; 4M77 B; 1U1S A; 2CRE A; 1BBZ A; 4PFZ A; 2BE9 B; 3RKW A; 5LJ3 f; 3A5Z B; 2KRO A; 2KEA A; 1IGQ A; 2C0O A; 4C92 D; 3LLR A; 1XOV A; 4LN2 A; 3O8V A; 4Y92 A; 4M7D B; 3JCM Q; 3EHQ A; 2M16 A; 1RAI B; 3HRU A; 1UUE A; 1RAA B; 2E12 A; 3QKJ A; 1BKB A; 2XU8 A; 2QQA A; 3EG0 A; 4BE2 A; 2RD1 A; 2RI5 A; 4M78 D; 1AVZ C; 2EVR A; 2BZ8 A; 1E6H A; 3JCM P; 2E4H A; 1BYM A; 3KUF A; 3M55 A; 4F7U B; 3HKS A; 3LWH A; 1WXT A; 4DOW A; 2HEQ A; 1VA7 A; 7AT1 B; 2RHX A; 2K9G A; 1GBQ A; 2FVU A; 1GCP A; 4JJN K; 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