The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
7
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sequence length |
64
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structure length |
64
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Chain Sequence |
GSMGTAGKWVLCNYDFQARNSSELSVKQRDVLEVLDDSRKWWKVRDPAGQEGYVPYNILTPYPG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structural basis of PxxDY motif recognition in SH3 binding
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Epidermal growth factor receptor kinase substrate 8-like pro
|
| molecule tags |
Splicing/signaling protein
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
7
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| structure length |
64
|
| sequence length |
64
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2008-04-02 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1HJD A; 2C0T A; 4GLM A; 5I11 A; 1EFN A; 3VS4 A; 3H0I A; 3VS1 A; 1UG1 A; 1U3O A; 2VVK A; 1BK2 A; 1GFC A; 4JZ4 A; 4AFZ C; 2J6O A; 1E6H A; 4JPB W; 2CRE A; 3IQL A; 1N5Z A; 1CSK A; 4JJB A; 3RNJ A; 1Y57 A; 2BTT A; 1AWO A; 1UE9 A; 1WIE A; 2CH4 W; 4CC2 A; 2O88 A; 4FSS A; 1GBR A; 2E5K A; 1KJW A; 3VS3 A; 1PNJ A; 2RQT A; 2NWM A; 4R0K A; 4AFS C; 5I22 A; 2JT4 A; 2ED0 A; 2EGC A; 1GCP A; 4Z88 A; 2QDL A; 2B86 A; 4D8K A; 2JM8 A; 3VS0 A; 1NEG A; 4RTT A; 2CT4 A; 3ZL7 C; 1QWE A; 1RUW A; 2KT1 A; 1M27 C; 2EW3 A; 3M0S A; 4HVW A; 2CH4 A; 1AD5 A; 3H41 A; 3JV3 A; 2D0N A; 4RTU A; 2W0Z A; 2O31 A; 1MV3 A; 1JU5 C; 1AOJ A; 1PHT A; 2CT3 A; 1B3Q A; 2KYM A; 1QKX A; 1YNZ A; 1K76 A; 1GRI A; 1PRM C; 2W10 A; 1UTI A; 4ESR A; 3M0U A; 1AWW A; 1TG0 A; 2EYZ A; 2KXD A; 2EYX A; 4ZNX A; 2JM9 A; 3UF4 A; 2RQW A; 2OAW A; 2J6K A; 2L3P A; 2K79 A; 1JEG A; 2H8H A; 1SRL A; 1AZE A; 1GFD A; 5IHN A; 1Z9Z A; 2YT6 A; 2GBQ A; 2K6D A; 2YSQ A; 3NMZ C; 2ECZ A; 4HVU A; 1AWX A; 4J9C A; 3REB B; 2C0O A; 1VYT A; 2O9S A; 1M3A A; 2JW4 A; 2J05 A; 1H3H A; 1K0S A; 4RTX A; 3EHQ A; 1QLY A; 5FW9 A; 4F14 A; 2DL3 A; 4J9D A; 2G6F X; 3EHR A; 2DRM A; 2K7A A; 2AK5 A; 1BU1 A; 1SEM A; 1AZG B; 2EYY A; 3H0F A; 1KFZ A; 5GJV B; 1W6X A; 2F2W A; 2RQV A; 2DLP A; 1SPK A; 2KT8 A; 1X2K A; 2RF0 A; 2LX7 A; 1E7O A; 1QWF A; 2EQI A; 3H0H A; 4LUE A; 2X3X D; 3VS7 A; 1PKS A; 2DBM A; 2J06 A; 1YN8 A; 4RTZ A; 3VS5 A; 1UHC A; 4CC7 A; 4DEX A; 1YCS B; 2LP5 A; 4AG2 C; 2AKK A; 1NYG A; 4E6R A; 1YWP A; 3I9Q A; 3M0T A; 2JS0 A; 2GTO A; 2EGE A; 1ZBJ A; 2FO0 A; 2YDL A; 2HBW A; 4OMQ A; 4OMO A; 2C0I A; 1E6G A; 2OJ2 A; 5FWB A; 1TUC A; 1QKW A; 3ULR B; 2KRM A; 2O9V A; 2F2V A; 4GBQ A; 2VWF A; 1AEY A; 2I0N A; 4ORZ A; 2YUO A; 4OMP A; 2A08 A; 2KNB B; 1W70 A; 1B07 A; 2FPE A; 2CSQ A; 4JJD A; 4LUD A; 1VYU A; 4AFU C; 2DL4 A; 4WCI A; 2EGA A; 5FWC A; 1WA7 A; 2DBK A; 1HSQ A; 3UAT A; 2PZ1 A; 1NYF A; 2KEA A; 1J3T A; 3CQT A; 4J9B A; 2LNH B; 2DE0 X; 2LQN A; 1T0H A; 2KBT A; 2KRO A; 4LE9 A; 3EG0 A; 2L2P A; 3M0R A; 2A36 A; 3M0Q A; 3VS2 A; 2ED1 A; 1Z9Q A; 3PE0 A; 5EC7 A; 3EG3 A; 2MCN A; 2JS2 A; 1ZUK A; 2LQW A; 2V1Q A; 2CUB A; 1WFW A; 2DIL A; 1SRM A; 2M51 A; 2XMF A; 2L3S A; 2LJ3 A; 3C0C A; 3KFV A; 2HCK A; 4LN2 A; 5ECA A; 3VS6 A; 1GCQ C; 4K11 A; 2V1R A; 1S1N A; 3VRZ A; 3EG2 A; 4F16 A; 1VA7 A; 1V1C A; 1K4U S; 2ESW A; 1PKT A; 2LZ6 B; 1WI7 A; 1NG2 A; 2DRK A; 2DMO A; 2FG0 A; 2RN8 A; 4D8D A; 1T3S A; 2JXB A; 2D1X A; 4AFQ C; 1KIK A; 4AG1 C; 2AKL A; 2L3Q A; 1UGV A; 1YP5 A; 1K0X A; 1GBQ A; 1M3B A; 2DA9 A; 2OI3 A; 1JXM A; 2CUD A; 1G83 A; 1JO8 A; 1ZUU A; 1SSH A; 2EBP A; 2FRY A; 5IXB A; 4J9F A; 1CKA A; 5IHK A; 2LJ0 A; 1YWO A; 2EVR A; 2EYW A; 2KGT A; 2CSI A; 4DEY A; 3VRY A; 1HD3 A; 4RTW A; 2HEQ A; 3EG1 A; 1X6G A; 2DX1 A; 2PTK A; 2M0Y A; 1OV3 A; 2J7I A; 1H92 A; 2CDT A; 1M30 A; 1RI9 A; 1WLP B; 1X43 A; 4QT7 A; 1OEB A; 4JJC A; 1UDL A; 2IIM A; 1ARK A; 2O2O A; 4Y92 A; 4OML A; 2DYB A; 3QWY A; 2P4R A; 2PNI A; 1PRL C; 1X2Q A; 2NUZ A; 2YUP A; 1UJ0 A; 2KYB A; 2X3W D; 4Z89 A; 1K9A A; 1I0C A; 2DL5 A; 1RLP C; 1M8M A; 2YUQ A; 1JQQ A; 2D8J A; 4HVV A; 1I1J A; 3REA B; 1UFF A; 4OMN A; 1Y0M A; 1UUE A; 1GCQ A; 2FPD A; 1OPL A; 4HXJ A; 1A0N B; 2ENM A; 1JXO A; 2LMJ A; 2ROL A; 1U5S A; 1OOT A; 3I5S A; 4Z8A A; 5GJW B; 3I5R A; 4J9H A; 5L23 A; 3EGU A; 4F17 A; 4JZ3 A; 2A28 A; 3NHN A; 2L0A A; 5HCK A; 2JMC A; 1GL5 A; 1PWT A; 2J6F A; 2GTJ A; 1MUZ A; 2HSP A; 2K2M A; 3NPF A; 2GNC A; 2SEM A; 2AZS A; 1NLP C; 4LNP A; 2MOX A; 2KXC A; 1CKB A; 2RNA A; 3PVQ A; 2DF6 A; 2DL7 A; 1K1Z A; 1ABO A; 1UJY A; 4RTV A; 2MIO A; 2RQR A; 3UA6 A; 3NGP A; 1WDX A; 1AVZ C; 1ZUY A; 3THK A; 2K3B A; 3LH5 A; 2DJQ A; 5IH2 A; 3GBQ A; 4CC3 A; 2F2X A; 2A37 A; 2LCS A; 4CC4 B; 1T0J A; 1ABQ A; 3PVL A; 1ZX6 A; 3FJ5 A; 1FYN A; 1KSW A; 1NEB A; 3SHW A; 3TSW A; 2KE9 A; 2SRC A; 4M4Z A; 3QWX X; 5IXF A; 4HCK A; 2RPN A; 1ZLM A; 1BB9 A; 4KRT A; 2BZ8 A; 1X27 A; 2EKH A; 2ABL A; 1U06 A; 2FRW A; 3TVT A; 2KR3 A; 3M0P A; 5IHI A; 1AWJ A; 3A98 A; 1NLO C; 1FMK A; 4IIM A; 2LJ1 A; 3I35 A; 2DM1 A; 4EIK A; 1XOV A; 2KRN A; 1TUD A; 1WXU A; 3UA7 A; 3R6N A; 1ZSG A; 3TSZ A; 1G2B A; 1T3L A; 1UEC A; 1UHF A; 4A63 B; 1NM7 A; 4J9I A; 3RBB B; 4OMM A; 2K9G A; 2ROT A; 2FPF A; 2BZX A; 2JMA A; 2D8H A; 2RQU A; 4IIO A; 2JTE A; 1I07 A; 1LCK A; 2KRS A; 2RMO A; 1WX6 A; 2VKN A; 2DNU A; 1SHF A; 1OPK A; 3SEM A; 2GGR A; 1W1F A; 1RLQ C; 1SHG A; 1QCF A; 4RUG A; 2YUN A; 1MV0 B; 2HDA A; 2BZY A; 4J9E A; 1IO6 A; 1X69 A; 1WXB A; 3U23 A; 1M3C A; 1X6B A; 3O5Z A; 1H8K A; 2DL8 A; 4RTY A; 2GQI A; 1WXT A; 2FEI A; 2DVJ A; 1BBZ A; 4X1V A; 1WYX A; 2EPD A; 1VYV A; 2AZV A; 4J9G A; #chains in the Genus database with same CATH topology 5GAM g; 1B34 B; 1Y7X A; 2MAM A; 1EFN A; 4QVD A; 3VS4 A; 2DTI A; 1U3O A; 2VVK A; 1BK2 A; 1OZ3 A; 1E6H A; 4JPB W; 3IQL A; 3JB9 J; 5A0D A; 2OTL Q; 2NUT B; 4II1 A; 2E3I A; 4IUQ A; 2O88 A; 4OB3 B; 5CKD A; 1VQ9 T; 2QAZ A; 2HD0 A; 2K57 A; 1SG5 A; 1YIJ T; 3CCS Q; 3V8J A; 5GAO p; 4FIB A; 2NWM A; 4PJO A; 3CCJ Q; 2ED0 A; 2F5T X; 2EGC A; 4Z88 A; 2QDL A; 2Y90 A; 4C92 F; 4D8K A; 1VQL A; 1NEG A; 2F1L A; 3GIB A; 3OYI A; 5LJ5 g; 2P84 A; 4FW1 A; 3CXC A; 1VQ5 T; 2KAF A; 2EW3 A; 3FLG A; 2Y4X A; 1C6V X; 1MV3 A; 3RKW A; 1QVF S; 1PHT A; 2YRD A; 2HQH A; 5DY9 A; 4PFZ A; 2A3L A; 1HXD A; 1I5O B; 3UT1 A; 2BE9 B; 1K73 U; 2EFI A; 3HSB A; 3LLR A; 3M54 A; 2EAY A; 4J7F A; 1Y96 B; 1G5V A; 2OAW A; 2J6K A; 1VQO Q; 2BIV A; 2JVV A; 1VQN T; 4BY6 C; 1JEG A; 3N5B B; 2EJF A; 3AT1 B; 3GLX A; 2X4W A; 1LVK A; 4A4G A; 3PFS A; 1AWX A; 3HPW A; 5KYU A; 1WNL A; 5LJ3 j; 3REB B; 1XTD A; 2WSC E; 3M56 A; 1WZO A; 1H3H A; 4OGE A; 2RHI A; 4J9D A; 3E2U A; 2DRM A; 2K7A A; 2AK5 A; 2IVW A; 2EYY A; 1WHG A; 1YIT Q; 3LH0 A; 2QA4 Q; 3HP9 A; 2LX7 A; 5AT1 B; 3H0H A; 3RUX A; 3FJP A; 3S3O A; 4DEX A; 1F1B B; 3F70 A; 4DBF A; 3NTH A; 1BIA A; 2DXB A; 2H3E B; 4N0A A; 1K9M R; 2QK0 A; 6AT1 B; 3QPH A; 2OTJ A; 4PK4 A; 3OYB A; 3I9Q A; 1OUL A; 4Q5W A; 1LNX A; 1P92 A; 4OVA A; 1NJI U; 2OX7 A; 2HBW A; 1MND A; 3CC4 Q; 2OJ2 A; 4PFP A; 3CCU T; 4MMK A; 2EQJ A; 2I0N A; 4ORZ A; 2JOY A; 4XTV A; 1YIT A; 1O9S A; 2A08 A; 2DER A; 5KYY B; 1IGQ A; 2QA4 A; 3OW2 S; 4IUT A; 4MZM A; 3HFN A; 1JJ2 S; 4JJD A; 3KUF A; 4DBR A; 4AFU C; 1QW1 A; 2DL4 A; 2L89 A; 2LNV A; 2AT1 B; 1WA7 A; 2DBK A; 1ZHI A; 2CZ1 B; 4C0G A; 4ELY C; 2PZ1 A; 3RES A; 4VUB A; 3CQT A; 2JTF A; 2RI3 A; 2LNH B; 2LQN A; 2A7Y A; 2KRO A; 1LOJ A; 1U8R A; 5KCH A; 3GNF B; 4XTZ A; 3VS2 A; 3PE0 A; 2MCN A; 3TEE A; 3DB3 A; 3M4Y A; 2GFU A; 1PC0 A; 2Y4Y A; 3C0C A; 3KFV A; 3OYJ A; 3VS6 A; 3DLM A; 4K11 A; 1GXI E; 1QCO A; 4BI4 A; 1NPP A; 1K4U S; 2ESW A; 4PJO E; 1VQ8 A; 3J80 E; 1PKT A; 3QZ5 B; 2CP3 A; 3NTI A; 1NG2 A; 2DIG A; 4D8D A; 1D1C A; 1T3S A; 2JXB A; 3CCE T; 3FDR A; 1KIK A; 3O8V A; 2AKL A; 1O75 A; 4M7D E; 4QQD A; 4QQ6 A; 5GAM e; 1BCO A; 1GBQ A; 3I55 T; 4EMK B; 1JO8 A; 4J9F A; 3UWN A; 3QO3 A; 5LJ3 d; 1PM3 A; 2QTV A; 1YWO A; 2EYW A; 2CSI A; 4C92 G; 1HD3 A; 2YLB A; 4RTW A; 2KQW A; 1D1B A; 2L5Q A; 2M0Y A; 1TSF A; 4OGC A; 1NJI C; 1QVF A; 2DIQ A; 1WLP B; 1RI9 A; 1X43 A; 1BI1 A; 3M5A A; 1U1S A; 1OEB A; 2IIM A; 1ARK A; 2O2O A; 2CP2 A; 4OML A; 2ZPB B; 5LJ5 e; 2PVO B; 5J26 A; 1VQ7 A; 2FZK B; 4CI0 C; 3X26 B; 4ZN3 A; 5KYN A; 2LTO A; 2KMT A; 3FB9 A; 1VQM T; 4Z89 A; 1IRX A; 2C06 A; 1R77 A; 1K9A A; 1I0C A; 1VUB A; 2DL5 A; 3VV0 A; 1RLP C; 5GAO l; 5GMK i; 1JQQ A; 5IAY A; 3EFR A; 1KC8 U; 2YWW A; 3CME T; 3CC7 Q; 2CYZ B; 3REA B; 3P8H A; 3LWH A; 5LJ3 g; 3M4G A; 4JLI A; 1A0N B; 4NOY A; 2LMJ A; 2EQK A; 4X9C A; 1NZ9 A; 4J5Y A; 1OOT A; 1OU9 A; 3JB9 D; 2MMP A; 4J9H A; 4PJO F; 2DO3 A; 1K73 R; 1WGS A; 5I2M A; 2A28 A; 3NHN A; 9ATC B; 1UEB A; 4ME7 A; 1K8A C; 5HCK A; 5KH6 A; 2JMC A; 5AYF A; 1ACM B; 2J6F A; 3HHT B; 1MUZ A; 1VQP Q; 4HCZ A; 2HSP A; 2K2M A; 2GCX A; 3NPF A; 4M7D F; 1VQ4 Q; 4LNP A; 2CS7 A; 4R56 A; 2D0Q B; 5I21 A; 2KXC A; 1CKB A; 3EG9 A; 3OYE A; 2ZZD A; 1UJY A; 3CC7 A; 2RHZ A; 2DXT A; 1FX7 A; 2D9T A; 1VQ6 Q; 3CCV T; 3TU4 K; 1ZUY A; 4RG2 A; 3LH5 A; 2DJQ A; 4PNO A; 2F2X A; 2E41 A; 4XQ3 A; 2DK3 A; 3EGD B; 2K5F A; 4BB7 A; 3PVL A; 3CCR T; 1MMD A; 2KE9 A; 2SRC A; 3QWX X; 1KQS P; 2PQW A; 4HCK A; 3OW2 A; 1BB9 A; 1JJ2 A; 3QDR B; 5GAM f; 1N8R C; 4PJO C; 2EKH A; 5FU6 C; 2WAC A; 1ZSZ A; 2ABL A; 4MML A; 2XK0 A; 5CK9 A; 1VQ4 A; 2DZC A; 3QG1 A; 1MMG A; 4FT4 A; 4C0F A; 3P8D A; 3A98 A; 1NE8 A; 3JAM E; 1FMK A; 4EIK A; 1RAA B; 1JRI A; 5GAN 4; 4PJJ A; 4M7D C; 3R6N A; 4OP0 A; 3OYM A; 1RAI B; 2HQX A; 1UEC A; 4A63 B; 2O4X A; 2NUP A; 1LJO A; 4C5H A; 3M9Q A; 2GQV A; 2K9G A; 4RMO A; 1KHC A; 2RJC A; 1QP2 A; 3M58 A; 3QDF A; 4E47 A; 2JTE A; 2VGN A; 3QXE B; 3HFO A; 5KYX A; 5LJ5 f; 2KK4 A; 3R6O A; 2COW A; 3D7S B; 4JRI A; 5GAN 2; 3OYC A; 1MGQ A; 1M1G A; 1RLQ C; 4JRK A; 3OS2 A; 1TWB A; 4RUG A; 1MV0 B; 2HDA A; 5FU7 C; 5C0M A; 4J9E A; 5KYW A; 3CXC S; 4XU0 A; 4FW2 A; 1VQK T; 3TQ7 P; 1X6B A; 2DL8 A; 1MNE A; 8ATC B; 3WVE B; 3CCM A; 1WXT A; 4ATO A; 3ZBD A; 2D6F A; 3J81 E; 1BBZ A; 2EPD A; 1VYV A; 2DYI A; 3EH2 A; 4DOV A; 1HJD A; 5HK3 A; 1YJN T; 4C92 B; 3H0I A; 1UG1 A; 1GFC A; 1WHM A; 5D6X A; 5D7U A; 4JJB A; 3LW5 E; 4E7S A; 4CC2 A; 4R55 A; 1YHQ A; 1PCX A; 3CBO A; 1S72 A; 4FSS A; 5FRM A; 3CC2 T; 2E5K A; 1KJW A; 1PNJ A; 4R0K A; 3G71 Q; 4WTO B; 1KG1 A; 4HA8 A; 5A2Q E; 2RI2 A; 4N0A C; 2CGH A; 4NS5 A; 1QVG S; 1SF9 A; 2JM8 A; 4PLL A; 4KUL A; 1W2B S; 3VS0 A; 1N6A A; 2YXY A; 1M27 C; 3WXM B; 4A54 A; 1D3B A; 3EFS A; 4HVW A; 2CH4 A; 3G6E Q; 1D1A A; 3H41 A; 2I2L A; 1BCM A; 4RTU A; 1IB8 A; 2ATC B; 2COY A; 3CCQ A; 1AOJ A; 3G4S T; 1B3Q A; 3NFC A; 1K76 A; 1GRI A; 3CCL A; 1UTI A; 4IUV A; 4KUD K; 5GAN 7; 1UGP B; 1TG0 A; 3RMS A; 3G71 A; 4C92 D; 2NUP B; 3L2V A; 2EIF A; 3HRT A; 1RI0 A; 2KXD A; 2EYX A; 1I5L A; 3A8L B; 3QHS A; 3QYG B; 1BIB A; 5A0G A; 2L3P A; 3I56 T; 2K79 A; 2VUB A; 2H8H A; 1AZE A; 3VUZ A; 1GFD A; 4M75 A; 2QTX A; 1Z9Z A; 2E65 A; 4PJO G; 2E5Q A; 5LJ3 e; 2YSQ A; 2HSE B; 3NMZ C; 4PKC C; 2VAS A; 1KC8 R; 3QJ6 A; 1VYT A; 3GOX A; 5KYW B; 3EHQ A; 1QLY A; 2LQK A; 1EZZ B; 4F14 A; 1C1A A; 2G6F X; 4NL3 A; 2LVM A; 3EHR A; 1VQ5 Q; 2CZ7 B; 1BU1 A; 1SEM A; 3H0F A; 3M59 A; 4V2S A; 3TCJ A; 4M77 E; 3MHX A; 4JRQ A; 3OS0 A; 1E7O A; 4OB0 B; 3PMT A; 3OQ5 A; 3FRN A; 4OF1 A; 4BE2 A; 1YN8 A; 4RTZ A; 3VS5 A; 4CC7 A; 2P4T A; 1VQ9 A; 1VQL Q; 5D6Y A; 5GAN j; 4AG2 C; 4HCC A; 3JSC A; 4LDV A; 2JS0 A; 2EGE A; 2YDL A; 3WVD B; 4PFO A; 3VU3 C; 4ZTJ A; 2C0I A; 4QVZ A; 4C5G A; 4FYW B; 2K5L A; 2KRM A; 2O9V A; 2F2V A; 3URG A; 1RAB B; 3CBM A; 4HT9 A; 2VWF A; 1VQ5 A; 4KGX B; 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