The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
7
|
sequence length |
64
|
structure length |
64
|
Chain Sequence |
GSMGTAGKWVLCNYDFQARNSSELSVKQRDVLEVLDDSRKWWKVRDPAGQEGYVPYNILTPYPG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structural basis of PxxDY motif recognition in SH3 binding
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Epidermal growth factor receptor kinase substrate 8-like pro
|
| molecule tags |
Splicing/signaling protein
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
7
|
| structure length |
64
|
| sequence length |
64
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2008-04-02 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1BK2 A; 2K6D A; 2OAW A; 1I07 A; 1CKA A; 1RUW A; 2JS2 A; 2ENM A; 1QWF A; 2GTJ A; 3I5S A; 4JJC A; 1GCP A; 2HBW A; 4J9C A; 3EG2 A; 1AWX A; 4HXJ A; 1HD3 A; 1TUD A; 4EIK A; 1H8K A; 3ZL7 C; 1JEG A; 2AZV A; 1UTI A; 2HSP A; 2A28 A; 4E6R A; 1PNJ A; 2CUB A; 2YUN A; 3U23 A; 4HCK A; 5FWC A; 1GCQ A; 4AFU C; 3EG3 A; 1I0C A; 1K0X A; 1Y0M A; 2KR3 A; 3SHW A; 3UF4 A; 1FMK A; 4AFS C; 5I11 A; 1MUZ A; 2DL8 A; 1WIE A; 2JXB A; 2DVJ A; 1UHF A; 1LCK A; 1GRI A; 2KNB B; 3REB B; 2O31 A; 1BU1 A; 1FYN A; 3EGU A; 1QWE A; 1RI9 A; 4JPB W; 1WA7 A; 1UUE A; 5IHI A; 2DRK A; 2V1R A; 3FJ5 A; 2A08 A; 3PVQ A; 1NLO C; 1SRM A; 2JM8 A; 3EG1 A; 1SPK A; 1SEM A; 2RPN A; 1PRM C; 3M0S A; 2NWM A; 2D8H A; 2KE9 A; 2EYX A; 2KRN A; 3KFV A; 4D8K A; 1PKT A; 2RQT A; 2EGE A; 1QLY A; 2J06 A; 1T3S A; 2DRM A; 2DF6 A; 4J9D A; 4ORZ A; 1ARK A; 2J6F A; 2W0Z A; 1WI7 A; 2VWF A; 2EYY A; 2DYB A; 2IIM A; 5FW9 A; 2LJ3 A; 3I35 A; 1ZLM A; 3SEM A; 2X3W D; 5ECA A; 4HVU A; 3VS6 A; 2C0O A; 2JTE A; 1VYU A; 2KXC A; 2C0I A; 3UA6 A; 1SHF A; 1WLP B; 3M0P A; 2KGT A; 5EC7 A; 1JXO A; 1PRL C; 2YUO A; 4OMQ A; 2JMC A; 3THK A; 2CH4 A; 4LE9 A; 4DEY A; 2EGA A; 4AG1 C; 2CH4 W; 4RTY A; 4CC7 A; 1Z9Z A; 1X6B A; 4D8D A; 2KEA A; 4Z89 A; 4FSS A; 2JS0 A; 2PZ1 A; 1G83 A; 2RMO A; 1EFN A; 1J3T A; 3VS2 A; 2ROT A; 1E7O A; 1UDL A; 1QCF A; 2KT1 A; 4HVV A; 2OJ2 A; 4IIM A; 3H0F A; 3VRY A; 2E5K A; 3H41 A; 2P4R A; 4LUE A; 2YT6 A; 2VVK A; 2EVR A; 2AZS A; 1E6H A; 3TVT A; 1T0J A; 2L0A A; 2ECZ A; 3M0Q A; 2ESW A; 1NYG A; 1PKS A; 1K0S A; 2M51 A; 2DE0 X; 1V1C A; 3UAT A; 3VS4 A; 1AZE A; 2J6K A; 2DJQ A; 3R6N A; 3UA7 A; 1WDX A; 1SSH A; 3H0I A; 2DBM A; 2MOX A; 1YNZ A; 2K3B A; 2NUZ A; 1X2K A; 1AWJ A; 2I0N A; 1T0H A; 2CSQ A; 4GLM A; 1QKW A; 2CSI A; 2JW4 A; 5GJW B; 1VA7 A; 2KRS A; 4GBQ A; 2GGR A; 2BZX A; 2EQI A; 2K79 A; 2KBT A; 2J7I A; 4AFQ C; 4IIO A; 1NG2 A; 2YSQ A; 1WX6 A; 2F2W A; 4J9H A; 2ABL A; 2MCN A; 4QT7 A; 2BZY A; 1X27 A; 2AKK A; 1X43 A; 1MV0 B; 2RQU A; 2YUQ A; 5IHN A; 3RNJ A; 4JJD A; 4F14 A; 2EYW A; 3JV3 A; 1ZUK A; 1NM7 A; 4Z88 A; 1QKX A; 4J9B A; 2KYB A; 2EYZ A; 4AG2 C; 1UEC A; 5IXB A; 2LX7 A; 4A63 B; 2EBP A; 1M3B A; 1SRL A; 1I1J A; 2RNA A; 4ESR A; 4LNP A; 2DX1 A; 1TUC A; 1JXM A; 1UG1 A; 1JU5 C; 2FPF A; 2L3S A; 4ZNX A; 2CT4 A; 1CSK A; 1VYV A; 5I22 A; 4WCI A; 1U06 A; 2GTO A; 1OOT A; 2DBK A; 2F2V A; 2RF0 A; 2GNC A; 2EGC A; 2LZ6 B; 1AEY A; 5GJV B; 1WXU A; 2QDL A; 2XMF A; 2DLP A; 2O88 A; 2C0T A; 3PE0 A; 2PNI A; 5IXF A; 1AWO A; 3TSW A; 1IO6 A; 1W1F A; 2G6F X; 1H3H A; 2DL4 A; 1WFW A; 2MIO A; 2K9G A; 5IH2 A; 4JZ3 A; 1GBR A; 2H8H A; 3NMZ C; 1GL5 A; 3O5Z A; 2J6O A; 4R0K A; 3QWX X; 2W10 A; 1JQQ A; 2CDT A; 1NLP C; 4F16 A; 2O2O A; 1KJW A; 2LQW A; 3EHQ A; 1A0N B; 5L23 A; 2HEQ A; 2RQV A; 1NYF A; 1GFC A; 4J9E A; 1GBQ A; 1B07 A; 1NEG A; 1GFD A; 3A98 A; 2EPD A; 4Z8A A; 4JZ4 A; 2GBQ A; 3VRZ A; 1WXT A; 2FRY A; 1AOJ A; 1G2B A; 1ZX6 A; 4Y92 A; 2D8J A; 1GCQ C; 3I5R A; 4F17 A; 2CT3 A; 2DL5 A; 1XOV A; 2RN8 A; 1M27 C; 3PVL A; 1ZUY A; 1OPK A; 2SRC A; 1ABQ A; 1YWP A; 1UJY A; 1AVZ C; 4KRT A; 2LJ0 A; 4HVW A; 1YWO A; 1UE9 A; 1Z9Q A; 1ZBJ A; 1WXB A; 2J05 A; 4AFZ C; 1K9A A; 1E6G A; 2EW3 A; 2VKN A; 3VS1 A; 1YN8 A; 1YP5 A; 4JJB A; 1JO8 A; 2BTT A; 4OMM A; 3I9Q A; 2LMJ A; 3H0H A; 3EHR A; 4RTX A; 2F2X A; 2PTK A; 4K11 A; 1KFZ A; 4J9F A; 2JMA A; 3QWY A; 4J9I A; 2FPE A; 2L3P A; 1B3Q A; 3M0U A; 2SEM A; 4RTU A; 1KSW A; 1SHG A; 3EG0 A; 4M4Z A; 5HCK A; 1AZG B; 2B86 A; 4RTV A; 1ZSG A; 2ED1 A; 1T3L A; 1MV3 A; 2DL3 A; 1HSQ A; 2KYM A; 2HDA A; 1YCS B; 3M0T A; 1W70 A; 3NGP A; 4DEX A; 1UJ0 A; 3VS7 A; 1BB9 A; 2DM1 A; 2LQN A; 1M8M A; 4RTT A; 1TG0 A; 2HCK A; 2LCS A; 3VS5 A; 3NPF A; 2O9V A; 2K7A A; 1NEB A; 1W6X A; 2LNH B; 4X1V A; 1VYT A; 1BBZ A; 2D1X A; 3C0C A; 3VS0 A; 3IQL A; 4RTW A; 1WYX A; 2DIL A; 2KRM A; 2A37 A; 1ABO A; 1HJD A; 2D0N A; 2FPD A; 2O9S A; 2X3X D; 2RQR A; 4OMP A; 1AD5 A; 1H92 A; 1ZUU A; 2DMO A; 5IHK A; 1OV3 A; 1U3O A; 2JM9 A; 2ED0 A; 1PHT A; 2M0Y A; 1AWW A; 5FWB A; 4J9G A; 2EKH A; 1S1N A; 4RTZ A; 1UHC A; 2CUD A; 4OML A; 3CQT A; 2DNU A; 1OEB A; 2RQW A; 1N5Z A; 1Y57 A; 3GBQ A; 2L2P A; 4CC4 B; 2DL7 A; 4CC3 A; 4CC2 A; 2FEI A; 2YDL A; 2V1Q A; 4OMN A; 1KIK A; 2AKL A; 1X2Q A; 2KT8 A; 2BZ8 A; 2OI3 A; 1M3A A; 2FRW A; 2A36 A; 3TSZ A; 3LH5 A; 2LJ1 A; 1K76 A; 3M0R A; 3ULR B; 2CRE A; 1U5S A; 1UFF A; 3NHN A; 2DA9 A; 1PWT A; 4RUG A; 1OPL A; 1K4U S; 4LN2 A; 2ROL A; 2FO0 A; 2GQI A; 3RBB B; 2AK5 A; 2FG0 A; 2YUP A; 2JT4 A; 1UGV A; 1RLQ C; 3VS3 A; 2LP5 A; 1RLP C; 1M30 A; 2KXD A; 2L3Q A; 4OMO A; 1M3C A; 2K2M A; 3REA B; 2KRO A; 4LUD A; 1K1Z A; 1X69 A; 1X6G A; 1CKB A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1BK2 A; 4F7U E; 2K6D A; 2FZG B; 2EAY A; 8ATC B; 3M4G A; 5KYY A; 4HCZ A; 4F7U G; 4PJM A; 3EG2 A; 4C5H A; 4A4H A; 3JCM c; 3ZL7 C; 2DYI A; 5GAM d; 1OYX A; 3CC7 A; 3HP9 A; 3X20 B; 1UTI A; 4M77 D; 4O6J A; 2A28 A; 3J7A F; 1M5Q 1; 1PNJ A; 5J3B A; 5CO7 A; 3I55 T; 3UWN A; 3U23 A; 4AFU C; 1I0C A; 2KR3 A; 2HQX A; 5GAN 4; 2DL8 A; 5CAI A; 5KCO A; 2XID A; 2DVJ A; 4M77 F; 3H9N A; 1HYO A; 1MHN A; 1GRI A; 3I56 T; 4JRQ A; 2KNB B; 3REB B; 3VU3 C; 2O31 A; 5A0G A; 5HK3 A; 4JPB W; 2LCL A; 1UUE A; 1VQ7 T; 3BDU A; 2DRK A; 3FJ5 A; 5GMK m; 4E47 A; 1PG5 B; 1LNX A; 3JB9 J; 1SPK A; 2E1H A; 1PRM C; 1VQM T; 2G3R A; 3CPW S; 2VC8 A; 1M90 C; 2KE9 A; 1D0X A; 2RJD A; 3UDC A; 5GAO l; 2J06 A; 2VV5 A; 5GAM j; 4F7U B; 5A0L A; 3CCS Q; 5FU7 B; 2J6F A; 3CCM Q; 3CCV Q; 4ELY C; 1PCX A; 4RCB A; 5GAO p; 1VQO A; 2KAF A; 3SEM A; 5KYX B; 5ECA A; 2IPO B; 5IAY A; 4PFO A; 3QDF A; 2C0O A; 2JTE A; 1ACM B; 4PJJ A; 1WLP B; 4XTW A; 4N4G A; 1D09 B; 4M77 E; 2YUO A; 4OMQ A; 1NJI R; 4AG1 C; 2DTI A; 3EGX B; 2F1L A; 3CCJ Q; 1X6B A; 4M77 G; 1M4Z A; 2KEA A; 2L3R A; 2PZ1 A; 4ZTJ A; 2Y4Y A; 1OU8 A; 4JDS A; 2ROT A; 1VQ9 Q; 2QAZ A; 4IIM A; 4E7K A; 2E12 A; 2XD0 A; 2E5K A; 1VQ6 Q; 3S3N A; 2VVK A; 3TVT A; 2EKO A; 4FYV B; 3CME Q; 1NYG A; 1K0S A; 1V1C A; 1IHV A; 3VS4 A; 4A54 A; 4C0G A; 3MJX A; 2H3J A; 4PJO D; 1SSH A; 1QVF S; 2QEX A; 2KY9 A; 2V26 A; 2MWP A; 2V8I A; 2K3B A; 1X2K A; 3CPF A; 3QHS A; 1T0H A; 4GLM A; 1U1S A; 2JW4 A; 2CSI A; 4XU1 A; 5GJW B; 1VA7 A; 3HKS A; 5GAN g; 1YIJ T; 4GBQ A; 2K79 A; 4QVC A; 4Z02 A; 1VQ4 T; 1Q7Y U; 2J7I A; 4PJO F; 3MPU B; 5FU6 C; 2YSQ A; 3D7S B; 4QT7 A; 1JJ2 P; 1MMA A; 2OTJ T; 4KGZ B; 4OF1 A; 1BI1 A; 3OBW A; 1MV0 B; 4FW1 A; 3MEW A; 2NUP A; 4J5Y A; 1YHQ T; 2L8D A; 1NM7 A; 4XU2 A; 2DTO A; 3INZ A; 3CXC P; 4WF2 A; 3OYJ A; 1PSE A; 3V8K A; 1WQW A; 2LX7 A; 3S3O A; 4A63 B; 3ASK A; 3TQ7 P; 3PNW C; 2HMA A; 2RNA A; 4ESR A; 4IKF A; 5FRM A; 3CD6 T; 1JJ2 A; 3PT9 A; 4M75 A; 2FPF A; 2HKQ B; 3PMT A; 4XK8 E; 1Y96 A; 5GMK h; 4IUT A; 1WHM A; 1NZ9 A; 4RG2 A; 1M90 R; 2E64 A; 4EMG A; 3CXC A; 3QJY A; 3S3M A; 5IXF A; 3CC2 A; 4LD6 A; 2NUT B; 5C0M A; 1AWO A; 1ZQ1 A; 2G6F X; 1Q81 R; 3MEU A; 3JCM h; 3CMA Q; 1I8F A; 1GBR A; 1PD1 A; 2CS7 A; 4E7Z A; 2J6O A; 4R0K A; 2W10 A; 2MK5 A; 2CDT A; 2CP6 A; 3L2U A; 4KUL A; 3EH1 A; 3EHQ A; 2XDB A; 4M7A A; 3BY7 A; 1WHJ A; 1QMC A; 2JZ2 A; 4JUV A; 4JZ4 A; 2GBQ A; 4RG8 A; 4NOY A; 1N8R C; 2FRY A; 1AOJ A; 2VUB A; 5A0D A; 1YFN A; 1G2B A; 2D8J A; 1GCQ C; 4MDW A; 3OYA A; 2HL5 C; 3RKX A; 3RMS A; 3AT1 B; 3MP1 A; 3QKJ A; 4RCC A; 1IRE B; 1NPP A; 3ZBD A; 4DBH A; 1IB8 A; 2SRC A; 1OPK A; 3BE3 A; 1IRX A; 3MO8 A; 1IXD A; 1UJY A; 4KRT A; 4IUU A; 3OB9 A; 2R57 A; 2LCC A; 2LQ8 A; 1YWO A; 1VQ5 T; 1Z9Q A; 2ZPH B; 1TUG B; 4AFZ C; 2J05 A; 3GLX A; 1E6G A; 2PQW A; 1RAE B; 1TTH B; 2COZ A; 3EFR A; 2LMJ A; 2F2X A; 4K11 A; 2XDP A; 2A3L A; 2QAS A; 1Q7Y C; 3QWY A; 2L3P A; 5CCA A; 1QQJ A; 2KSS A; 2WAC A; 1XQH A; 3CCU Q; 1SHG A; 2CP2 A; 4C5E A; 3JCM f; 2EQM A; 2DL3 A; 2R58 A; 1N27 A; 3X28 B; 1K8A R; 2F5T X; 2HDA A; 2RO0 A; 4M7D C; 1UJ0 A; 4NL3 A; 1BI3 A; 4X9D A; 4WTO B; 2PUO B; 2LCS A; 2QQS A; 1NEB A; 1W6X A; 4M7D D; 1VQ8 T; 1WYX A; 2DIL A; 3JRZ A; 1XNI A; 3EG9 B; 4IUP A; 2BE9 B; 2KMT A; 2GQV A; 3FC3 A; 1RAD B; 3JCM W; 2LRQ A; 1ZUU A; 4LDU A; 3FLG A; 2LQK A; 4X34 A; 3J81 E; 1AWW A; 5FWB A; 4J9G A; 3HL8 A; 1VQN A; 1S1N A; 1TXQ A; 1ZHI A; 1TS9 A; 1UHC A; 2XU8 A; 4RMO A; 4M75 B; 4M78 B; 1JBM A; 3M53 A; 2GCX A; 1HXD A; 4HT9 A; 1NBE B; 2DPP B; 2L2P A; 1KQS P; 4LDX A; 2CGH A; 3EFO B; 4CC2 A; 2RK2 A; 2YDL A; 1N9R A; 4JLG A; 2KT8 A; 2FRW A; 2JJ9 A; 2LJ1 A; 2COW A; 3FDR A; 1RAI B; 3ULR B; 4C92 A; 2I2L A; 3J80 E; 4BDZ A; 1PWT A; 3C4S A; 5CQY A; 5CKH A; 2DIQ A; 4RUG A; 2DER A; 1OPL A; 4LN2 A; 2DFU A; 2ZGW A; 5GAM e; 3GF5 A; 4PFZ A; 5GMK i; 1S72 T; 1KQS A; 4ATO A; 3RKW A; 3VS3 A; 1H3Z A; 4M7A B; 1M3C A; 3G4S A; 1CKB A; 3HHT B; 2OAW A; 4M7D E; 2JS2 A; 4HT8 A; 1YI2 A; 4C8Q A; 1QWF A; 1YJW T; 3I5S A; 4JJC A; 3SWN C; 3QZ5 B; 1N8R R; 2R5M A; 2Y4X A; 3DLM A; 4M7D G; 2K5F A; 2LTO A; 4CRI A; 3M5A A; 1TUD A; 1U1T A; 1H8K A; 3WXM B; 3EGD A; 3G1J A; 1VUB A; 4EMK C; 1JEG A; 4N0A A; 3GNG A; 2X4Y A; 5GAN h; 3EG3 A; 1Y0M A; 3SHW A; 1XTD A; 5I11 A; 5LJ5 d; 5FU7 C; 2FYK A; 3QSU A; 4FL6 A; 2DZC A; 2LX9 A; 3PGG A; 1OQK A; 2MMP A; 1M1K R; 3BDL A; 1YIT A; 2JTM A; 3RR6 A; 3V8J A; 3OYE A; 1RI9 A; 1Q7Y R; 2BIV A; 3KBG A; 3CCR Q; 2B8A A; 4CI0 C; 2R5A A; 3OYN A; 2A08 A; 7AT1 B; 3JCM d; 4QVZ A; 3OA6 A; 1VQN Q; 1SEM A; 5CKF A; 4KBM B; 2EFI A; 3MKD A; 4QW2 A; 4F7U F; 4ZGJ B; 2MI6 A; 2D8H A; 2RQT A; 2V8J A; 1QLY A; 4J83 A; 1Q81 U; 3HSB A; 3O8V A; 3G6E A; 3QBY A; 5C6S A; 1JJ2 S; 4HCC A; 3RES A; 3JCM g; 4A4K A; 2VWF A; 3QYH B; 3CCS A; 1RAA B; 5D6W A; 2IIM A; 5FW9 A; 3CCM A; 2LJ3 A; 3I35 A; 3CCV A; 2OTL Q; 1ZLM A; 5CKE A; 5GMK j; 3FIF A; 5IN1 A; 3OYL A; 4HVU A; 2AT1 B; 3QDR B; 4HA8 A; 3UA6 A; 1VQL A; 3ZEH A; 2KGT A; 1TSF A; 2JMC A; 2CH4 A; 2EGA A; 1Q95 G; 3TRE A; 1IGQ A; 5AYF A; 2LNV A; 2A7Y A; 4Z89 A; 4FSS A; 2JS0 A; 2RMO A; 3OMG A; 3CC7 T; 4ZN1 A; 1YI2 Q; 1QCF A; 3CCL A; 1B34 B; 2KT1 A; 4HVV A; 1D3B A; 3H0F A; 2FZC B; 2RH2 A; 4XTX A; 3X26 B; 3VRY A; 4LUE A; 3C95 A; 1VQ9 A; 4PJN A; 1VQ6 A; 3OBY A; 1UB4 A; 2CP3 A; 9ATC B; 3CME A; 2CP5 A; 4B9W A; 1K8A U; 4DQ2 A; 2NLU A; 2DBM A; 3QZ9 B; 3ZFJ A; 2ATC B; 2I0N A; 3CCQ A; 3PIO A; 2CSQ A; 1QKW A; 3LW5 E; 4E7I A; 2DTH A; 3QPH A; 4XU3 A; 2BZX A; 2RJC A; 1YIT Q; 4QKU A; 4BI8 B; 2VGN A; 2VYT A; 5GAO n; 3SB2 A; 1WZO A; 2DO3 A; 4J9H A; 5KYW B; 4HCB A; 2HZY A; 3TU4 K; 4J6Y A; 3X25 B; 1TOV A; 2AKK A; 3QYG B; 4LDV A; 3SWN B; 2QI2 A; 2X4W A; 3RNJ A; 4PLL A; 1WHK A; 3MCA B; 1I5O B; 4M77 A; 4F14 A; 5GAN 6; 4EMK B; 5HY6 A; 4Z88 A; 1VQO T; 4J9B A; 2KYB A; 5IXB A; 3G6E Q; 2ZPB B; 1KG1 A; 3L1A A; 2EBP A; 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