The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
9
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sequence length |
70
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structure length |
70
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Chain Sequence |
MDETGKELVLALYDYQEKSPREVTMKKGDILTLLNSTNKDWWKVEVKITVNGKTYERQGFVPAAYVKKLD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution structure and dynamics of the chimeric SH3 domains, SHH- and SHA-"Bergeracs".
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Spectrin alpha chain, brain
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| molecule tags |
Protein binding
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| source organism |
Gallus gallus
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| total genus |
9
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| structure length |
70
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| sequence length |
70
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2008-04-10 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2PTK A; 4WCI A; 2FG0 A; 1GCP A; 1AVZ C; 1GCQ A; 2LNH B; 3I5R A; 2ED1 A; 1YWP A; 1WXT A; 1W1F A; 4LN2 A; 4RTU A; 3UAT A; 4AG2 C; 3UA6 A; 3TVT A; 1GBR A; 2YT6 A; 1X2K A; 2KRN A; 4X1V A; 4KRT A; 2GGR A; 4LE9 A; 4HVV A; 1QKW A; 1JEG A; 1T0J A; 2AZV A; 3ZL7 C; 2FRW A; 4HXJ A; 2XMF A; 2D1X A; 2F2V A; 1W70 A; 2DM1 A; 3JV3 A; 1PRL C; 3EHQ A; 2HEQ A; 4LUD A; 2HDA A; 1NG2 A; 4JJB A; 4DEY A; 1M27 C; 2RNA A; 1H92 A; 1NYG A; 3M0T A; 2BZX A; 1UE9 A; 1NM7 A; 2F2X A; 2FO0 A; 2PZ1 A; 1G2B A; 1M30 A; 1M3C A; 2DVJ A; 2RQV A; 4Y92 A; 4CC3 A; 1K0S A; 4CC7 A; 2ESW A; 2RQR A; 4RTX A; 2KE9 A; 1IO6 A; 3R6N A; 1ZUY A; 2CRE A; 1K9A A; 3NMZ C; 2EYZ A; 1JXM A; 2VKN A; 4Z88 A; 1X6B A; 1HSQ A; 2L3Q A; 2OJ2 A; 4ZNX A; 4Z8A A; 2KRO A; 3VS7 A; 1H3H A; 1Z9Z A; 1AOJ A; 3PVL A; 1NLP C; 1RUW A; 1GL5 A; 1WI7 A; 3RBB B; 4JZ4 A; 2ROT A; 2ENM A; 2W10 A; 1K1Z A; 2EQI A; 2X3W D; 4J9G A; 2ECZ A; 4J9I A; 2BZ8 A; 4DEX A; 2KT8 A; 2CT4 A; 5I22 A; 4JJD A; 1ZUK A; 1TUD A; 4J9F A; 2JMC A; 4JZ3 A; 2LQN A; 3M0P A; 1WFW A; 2EGA A; 2RN8 A; 2AKL A; 2GBQ A; 4J9H A; 2DL7 A; 1WA7 A; 2EKH A; 1PNJ A; 1OPL A; 2K9G A; 1AWO A; 1FMK A; 2DRM A; 3RNJ A; 4D8D A; 1UDL A; 2MOX A; 2K2M A; 1YNZ A; 5GJV B; 4LUE A; 2YDL A; 4OMN A; 1OOT A; 2KRM A; 1QCF A; 2SRC A; 2C0O A; 3M0R A; 2HCK A; 2KRS A; 2H8H A; 4AFQ C; 2CUB A; 1KFZ A; 4CC4 B; 2O88 A; 2DF6 A; 4AFS C; 2V1Q A; 3LH5 A; 1GFC A; 1AWJ A; 2RQW A; 4D8K A; 4ESR A; 1CSK A; 2CUD A; 3VS1 A; 2LJ0 A; 2JS0 A; 2MIO A; 2JT4 A; 4E6R A; 1E7O A; 1A0N B; 4GLM A; 2EYW A; 1J3T A; 2RQU A; 1SEM A; 2GNC A; 1PHT A; 2JW4 A; 2A08 A; 3I9Q A; 1XOV A; 1SHG A; 1PWT A; 2J6F A; 1N5Z A; 1MUZ A; 1HJD A; 5FWB A; 2C0T A; 1M8M A; 1JU5 C; 4JJC A; 2M0Y A; 2J7I A; 2FPD A; 2CSQ A; 2LX7 A; 2AKK A; 1WYX A; 4OML A; 3U23 A; 1TG0 A; 3SEM A; 4A63 B; 1GBQ A; 2YUO A; 2V1R A; 1B3Q A; 1BK2 A; 2KYM A; 2DL3 A; 2FPE A; 2KEA A; 2KYB A; 1NYF A; 2NUZ A; 2K79 A; 1CKA A; 3EHR A; 2L3P A; 3VS4 A; 2B86 A; 1UG1 A; 1H8K A; 2BTT A; 1SRL A; 2DBM A; 1T3L A; 2VVK A; 4RTT A; 2VWF A; 2O31 A; 5EC7 A; 4OMQ A; 3I5S A; 2A37 A; 4M4Z A; 1ABQ A; 2EVR A; 1SSH A; 2EGE A; 2LJ3 A; 4JPB W; 3A98 A; 2J05 A; 5IHK A; 2NWM A; 1ZSG A; 3GBQ A; 1AD5 A; 2LZ6 B; 1WX6 A; 2GTO A; 4J9B A; 1GFD A; 5ECA A; 1QKX A; 1W6X A; 3ULR B; 3EG1 A; 4OMP A; 2O2O A; 2HBW A; 1UGV A; 2A36 A; 2O9S A; 2YUP A; 3H0F A; 5HCK A; 4CC2 A; 1JO8 A; 1ZX6 A; 5FW9 A; 2BZY A; 1Y0M A; 2YSQ A; 3VS3 A; 2ABL A; 1X69 A; 1YN8 A; 4F14 A; 1U06 A; 2RPN A; 3REB B; 2DJQ A; 1UJ0 A; 1K76 A; 2DA9 A; 2D8J A; 2L0A A; 3TSW A; 1E6G A; 4GBQ A; 1KIK A; 2KNB B; 3THK A; 1UEC A; 2K7A A; 2SEM A; 3EG3 A; 1AWW A; 2EYY A; 3VRY A; 1FYN A; 4F17 A; 2YUQ A; 3KFV A; 4IIM A; 1GCQ C; 2MCN A; 1NEB A; 1VYT A; 3QWX X; 1GRI A; 1OPK A; 3NGP A; 4AFZ C; 4HVW A; 2FPF A; 3VS2 A; 2D8H A; 1ABO A; 3C0C A; 2GTJ A; 2JS2 A; 2I0N A; 3REA B; 1YCS B; 1M3B A; 1PRM C; 3QWY A; 2ED0 A; 2KR3 A; 1B07 A; 2JM8 A; 4FSS A; 1UHF A; 2DE0 X; 1QLY A; 2EYX A; 1PKS A; 1ZBJ A; 2DBK A; 2L3S A; 3VS0 A; 1RLP C; 1YP5 A; 3I35 A; 2DIL A; 4EIK A; 2DL8 A; 5IHI A; 1TUC A; 5L23 A; 2J6O A; 1V1C A; 2LP5 A; 2K3B A; 4R0K A; 5GJW B; 2LQW A; 1MV0 B; 1I07 A; 1UJY A; 3FJ5 A; 2A28 A; 3VS5 A; 2YUN A; 2M51 A; 5FWC A; 4LNP A; 4RTW A; 3NHN A; 2F2W A; 4ORZ A; 2QDL A; 1WXU A; 1RLQ C; 2OAW A; 2KXD A; 2CSI A; 2DYB A; 2EPD A; 2DMO A; 1YWO A; 3M0S A; 2RF0 A; 2C0I A; 2JTE A; 2E5K A; 1K0X A; 3NPF A; 2J06 A; 2GQI A; 3EG0 A; 4HCK A; 1UUE A; 1JXO A; 2AK5 A; 1G83 A; 1MV3 A; 5IH2 A; 2KT1 A; 4RTV A; 1LCK A; 1AZE A; 1CKB A; 2EW3 A; 1OEB A; 1WLP B; 2JMA A; 1KSW A; 1EFN A; 3PE0 A; 1AWX A; 2LCS A; 4K11 A; 4AG1 C; 1AEY A; 4IIO A; 1RI9 A; 2RMO A; 1QWF A; 2AZS A; 4OMO A; 2JXB A; 1VYV A; 2KBT A; 1KJW A; 1WIE A; 1ZUU A; 1UFF A; 4OMM A; 2CDT A; 3EGU A; 2IIM A; 1I0C A; 3IQL A; 1E6H A; 3CQT A; 5IXB A; 2X3X D; 4J9D A; 4HVU A; 2DRK A; 1ZLM A; 1QWE A; 1SRM A; 2HSP A; 1NEG A; 3M0U A; 2G6F X; 2O9V A; 4RTY A; 1X6G A; 2DL5 A; 4AFU C; 3UA7 A; 1HD3 A; 2JM9 A; 4J9E A; 1PKT A; 1UHC A; 1JQQ A; 1U3O A; 2FEI A; 1UTI A; 1BU1 A; 1X27 A; 5IHN A; 3O5Z A; 2OI3 A; 2LMJ A; 1Z9Q A; 2CH4 W; 1BBZ A; 2P4R A; 1M3A A; 1WDX A; 2K6D A; 2KXC A; 5IXF A; 1OV3 A; 2L2P A; 1K4U S; 1U5S A; 2ROL A; 2FRY A; 2KGT A; 4RUG A; 3SHW A; 2W0Z A; 1Y57 A; 3M0Q A; 3EG2 A; 3H0I A; 2DNU A; 1T0H A; 4F16 A; 2CH4 A; 4RTZ A; 2DX1 A; 2J6K A; 1X2Q A; 1X43 A; 4QT7 A; 1WXB A; 1NLO C; 3UF4 A; 2EBP A; 3VRZ A; 5I11 A; 2D0N A; 3VS6 A; 1S1N A; 4J9C A; 1ARK A; 3H41 A; 2PNI A; 1AZG B; 4Z89 A; 1T3S A; 1VA7 A; 3H0H A; 1SPK A; 3TSZ A; 2LJ1 A; 2RQT A; 2DL4 A; 3PVQ A; 1I1J A; 1VYU A; 1BB9 A; 2DLP A; 1SHF A; 2EGC A; 2CT3 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3QZ5 B; 4WCI A; 4M7A G; 2DEQ A; 4OVA A; 2ZPF B; 4LDY A; 1WXT A; 4ZGD B; 2JUF A; 4A4G A; 1MGQ A; 3UAT A; 4AG2 C; 3PFS A; 2P0Q A; 1OU8 A; 4GY5 A; 1X2K A; 2NYS A; 3M5A A; 4KRT A; 3P8H A; 1VQ6 T; 2EJ9 A; 1JEG A; 5IN1 A; 3NFC A; 1WZO A; 1NZ9 A; 5I2S A; 2XMF A; 4M77 G; 2QQR A; 1YJN Q; 1B34 B; 5HK3 A; 4DEY A; 2QQB A; 1H92 A; 1VQN T; 1NYG A; 1VIE A; 1WQW A; 4N4H A; 1NM7 A; 3CCQ Q; 2F2X A; 5GAN 5; 2RA2 A; 3GF5 A; 3OBY A; 3UPU A; 3JCM d; 2RQV A; 1K0S A; 2HKN A; 3LWI A; 2L89 A; 2COW A; 2HAX A; 4B9X A; 3R6N A; 4OMF B; 1ZUY A; 1RAG B; 2COZ A; 2NUP A; 2DEU A; 5GAN g; 4FYW B; 4FYV B; 5KYW B; 4BE2 A; 3CCR A; 3HL8 A; 2Y90 A; 2L3Q A; 3DB3 A; 4ZNX A; 4Z8A A; 3T9N A; 1Z9Z A; 1AOJ A; 3PVL A; 1VQO Q; 1GL5 A; 3CBO A; 2CZ1 B; 1VQL T; 4ELY C; 3CC4 Q; 4MDW A; 2YHT A; 5CQY A; 3H9N A; 3F70 A; 4J9G A; 1O9S A; 2ECZ A; 3E9F A; 4MMK A; 2PU9 B; 2MWP A; 2R5M A; 4DEX A; 3LYI A; 2YRD A; 1M2V A; 1AHJ B; 4JJD A; 1Q81 R; 1TUD A; 2E3H A; 4J9F A; 3M58 A; 4LDU A; 1VQ5 T; 1VQ9 Q; 1PD1 A; 4A4H A; 5GAN 8; 4DBQ A; 1TU0 B; 2GBQ A; 2MF2 A; 1M9S A; 2CZ6 B; 5GAN f; 2DL7 A; 2EKH A; 1PNJ A; 4E7L A; 2K9G A; 4JUV A; 1FMK A; 5CK9 A; 4ME7 A; 5GAO q; 3CC2 A; 1WHG A; 4B6M A; 2NUP B; 4OMN A; 1OOT A; 3C95 A; 2KRM A; 4C92 A; 4C8Q D; 1RAD B; 2EQJ A; 4CC4 B; 3OSV A; 4PJO D; 2VGN A; 2DPP B; 2CP6 A; 2MAM A; 1QVF S; 1GFC A; 4D8K A; 2CZ7 B; 4A4K A; 7AT1 B; 3OYG A; 1C0M A; 2VC8 A; 3G6E T; 2MIO A; 4M7A A; 5CKF A; 4J6Y A; 1A0N B; 1M2V B; 1SEM A; 4M78 E; 1M90 C; 2DZC A; 2A08 A; 3PNW C; 2CP5 A; 4E7I A; 2J6F A; 1N5Z A; 1C6V X; 2F1L A; 5FWB A; 1JU5 C; 3FB9 A; 1RAB B; 1U8R A; 1I8F A; 3QYG B; 2AIR B; 4M75 D; 4OML A; 3QKJ A; 3SEM A; 4A63 B; 4C92 B; 1B3Q A; 4M77 A; 2KEA A; 4C0G A; 2NUZ A; 5LJ5 d; 5FU6 B; 4JLG A; 2L3P A; 3CCE Q; 4BDZ A; 1S72 T; 3EH1 A; 2DBM A; 4RTT A; 2VWF A; 2O31 A; 5GAN j; 4OMQ A; 3LW5 E; 4M4Z A; 2F5T X; 2E6N A; 2DVE A; 1VQN Q; 1ABQ A; 2I2L A; 3P8B B; 4M7A B; 5D6X A; 2LJ3 A; 2VXF A; 4NL2 A; 3QJY A; 3JCM b; 2LZ6 B; 2GTO A; 4QQD A; 4J9B A; 1VQ7 A; 1QKX A; 2V8I A; 1W6X A; 3E1S A; 2CP3 A; 2BUD A; 3JCM J; 2O2O A; 5LJ3 d; 2KI7 A; 5KE2 A; 1SSF A; 2A36 A; 2O9S A; 4CC2 A; 1ZX6 A; 5FW9 A; 2BZY A; 3H6Z A; 3OMG A; 3SDZ A; 3CCS Q; 4M77 B; 3VS3 A; 1VQL Q; 1X69 A; 4F14 A; 1M1K C; 3DB4 A; 5EG2 A; 1K76 A; 2D8J A; 3OB9 A; 2QTV A; 2V8J A; 1KIK A; 3EFO A; 1VQ5 Q; 3THK A; 1UEC A; 1KC8 U; 4FT2 A; 4M7D F; 1AWW A; 1D1C A; 2EYY A; 3I55 A; 1LNX A; 1YJW A; 4F17 A; 1V29 B; 1NEB A; 1BIB A; 3M56 A; 4LDW A; 3NGP A; 1G3Y A; 2HKQ B; 4NL3 A; 5GAN 4; 1ABO A; 2EIF A; 2I0N A; 3L2V A; 5GMK h; 1PRM C; 2R5A A; 2KR3 A; 2JM8 A; 1I4K 1; 3C12 A; 2YXY A; 4PK4 A; 3HTR A; 2L3S A; 5CR2 A; 2BE7 D; 1WJR A; 4EPC A; 4EIK A; 2DXU A; 2MMP A; 5L23 A; 2E12 A; 2RB6 A; 2K3B A; 3CEY A; 3CD6 T; 3EFO B; 1XJW B; 4F7U F; 3OW2 S; 1IXD A; 1NPP A; 2LTO A; 3FJ5 A; 2A28 A; 3VS5 A; 5GAN e; 1WJS A; 2LQK A; 3NHN A; 3CC7 T; 2F2W A; 2DKG A; 1RLQ C; 2QQA A; 3RKX A; 2OAW A; 2DYB A; 2LRQ A; 1YWO A; 2RHY A; 2RF0 A; 2E65 A; 2ZPE B; 2E5K A; 4PFO A; 1M1F A; 5CAI A; 4JRP A; 3JSC A; 1UUE A; 4KUI A; 3CXC A; 4L5G A; 1XQH A; 3FIF A; 3BY7 A; 2KT1 A; 4E7J A; 3CC2 Q; 4E2F B; 4C8Q C; 2EJF A; 3QBY A; 4BI8 B; 2RD1 A; 3L2Q A; 3QG1 A; 4JS4 A; 4PJO C; 5DLO A; 1TUG B; 1AWX A; 4K11 A; 4BY6 B; 1VQ4 A; 1TWB A; 2K5L A; 2QEX T; 1BYM A; 3RMQ A; 5KYN A; 1JRI A; 1KJW A; 4Z02 A; 2ZCF B; 2CDT A; 3EGU A; 2IIM A; 4M78 C; 3IQL A; 1NPR A; 2DRK A; 1QWE A; 1SRM A; 4C5I A; 3O8V A; 4NOY A; 2O9V A; 5FRN A; 4BE1 A; 3LGF A; 4L59 A; 4M75 C; 4E47 A; 5I2M A; 2QK0 A; 4AFU C; 1HD3 A; 1UHC A; 3OYA A; 1U3O A; 4XTV A; 2XDP A; 1BU1 A; 2V8K A; 3OS5 A; 2KDS A; 2OI3 A; 1ZHI A; 3E2U A; 4XTU A; 4C0D B; 4OB3 B; 3RES A; 5A0L A; 3A8H B; 1OV3 A; 1KK7 A; 1OU9 A; 2A3L A; 5J26 A; 2ROL A; 4KUD K; 3SHW A; 2W0Z A; 3M0Q A; 3OYF A; 3CCU T; 3EG2 A; 4UC4 A; 4FIB A; 3I56 T; 4JLI A; 3TCJ A; 2DX1 A; 1X2Q A; 2HBP A; 5GAO l; 4M78 G; 1LJO A; 5C0M A; 4M7D E; 3VYH B; 3V7R A; 2OTJ T; 4Z89 A; 1VA7 A; 2QGF B; 1D09 B; 2RQT A; 1BCM A; 3OYK A; 1I1J A; 5GAO m; 5GAM e; 1G3S A; 2DD5 A; 2MI6 A; 2E70 A; 2EGC A; 2X35 A; 1D0Y A; 1VQK A; 4Y28 E; 2FG0 A; 3DLL A; 1GCP A; 4PLL A; 1QVG A; 2KSS A; 2VV5 A; 2LNH B; 3I5R A; 1PD0 A; 1NJI C; 3NTK A; 4ZN1 A; 1W1F A; 1PCX A; 1R0C B; 1GBR A; 3A8L B; 1WNL A; 2A0F B; 2E1H A; 4X1V A; 4F7U E; 5IT9 E; 4KUL A; 1M90 R; 1PSF A; 3M55 A; 4LE9 A; 4HVV A; 1QKW A; 2PVD B; 1QQJ A; 1FMW A; 1T0J A; 2AZV A; 3ZL7 C; 2FRW A; 1N8R U; 1MMD A; 2D1X A; 2F2V A; 2EFI A; 4FM4 B; 1KQ1 A; 2DM1 A; 3JV3 A; 3OYB A; 3EHQ A; 1K9M C; 4C5E A; 1MMN A; 1NG2 A; 1M27 C; 4L6V 5; 2P0P A; 3M0T A; 3FRN A; 4QQ6 A; 1RAE B; 1M30 A; 3QPH A; 4Y92 A; 4CC7 A; 2ESW A; 2RQR A; 2XD0 A; 2E3I A; 4CRI A; 3QZ9 B; 5A0G A; 3NMZ C; 2EYZ A; 5GAN h; 4X9C A; 3GNF B; 2O4X A; 2AT1 B; 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