The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
10
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sequence length |
56
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structure length |
56
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Chain Sequence |
VRVRALYDYDGQEQDELSFKAGDELTKLGEEDEQGWCRGRLDSGQLGLYPANYVEA
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Molecular Basis for SH3 Domain Regulation of F-Bar-Mediated Membrane Deformation.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
PROTEIN KINASE C AND CASEIN KINASE SUBSTRATE IN NEURONS PROT
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| molecule tags |
Endocytosis
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| source organism |
Mus musculus
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| total genus |
10
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| structure length |
56
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| sequence length |
56
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-01-28 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| D | PF14604 | SH3_9 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3NPF A; 2KBT A; 2BZ8 A; 2K6D A; 1X6G A; 2DL3 A; 4HVU A; 1G83 A; 3EG3 A; 4RTT A; 1TUC A; 5IH2 A; 2F2V A; 2KR3 A; 1UHC A; 4J9I A; 1VYU A; 2JS0 A; 1IO6 A; 3KFV A; 1ABQ A; 3EG0 A; 1X69 A; 2P4R A; 2V1Q A; 2LZ6 B; 3I35 A; 2XMF A; 1W1F A; 1ZBJ A; 2PTK A; 4IIO A; 2DRM A; 3NMZ C; 5IHI A; 1K1Z A; 2DIL A; 2CSQ A; 4LE9 A; 3UF4 A; 2FRW A; 2J6O A; 2KNB B; 1ZLM A; 3VS1 A; 2EGE A; 1MV3 A; 1K4U S; 2L0A A; 1OPK A; 3EG2 A; 2YT6 A; 2LJ3 A; 1E7O A; 2JTE A; 2L2P A; 2J05 A; 5GJV B; 2I0N A; 5IXF A; 1BB9 A; 1NM7 A; 3VS0 A; 4A63 B; 1HSQ A; 2JMA A; 1E6H A; 2A36 A; 2YUP A; 1GBQ A; 1GL5 A; 2HDA A; 2LNH B; 4JZ4 A; 1MUZ A; 1ZSG A; 1UGV A; 3NGP A; 1AWW A; 1KFZ A; 2CH4 W; 1U5S A; 4AFQ C; 2KXC A; 1PKS A; 1CSK A; 3FJ5 A; 1YP5 A; 1WI7 A; 2M0Y A; 3A98 A; 1H92 A; 3VS4 A; 4LN2 A; 4Z88 A; 3VS6 A; 2MIO A; 3M0S A; 5I22 A; 4HCK A; 3REA B; 5L23 A; 3U23 A; 4X1V A; 1RLP C; 1BU1 A; 2HEQ A; 1NLP C; 1GFC A; 3M0U A; 2F2X A; 4CC7 A; 4Z89 A; 2W0Z A; 1ZUK A; 4AG2 C; 2ECZ A; 2EYW A; 2NUZ A; 3PVQ A; 2CT3 A; 1GFD A; 3O5Z A; 1I1J A; 2AKL A; 4LUD A; 4OML A; 1M3A A; 2LP5 A; 1WDX A; 1TUD A; 1Z9Z A; 2EVR A; 1YN8 A; 2ABL A; 4RTX A; 3SHW A; 1QCF A; 1RLQ C; 2VVK A; 2J06 A; 2QDL A; 2GTJ A; 2O9S A; 1MV0 B; 2ESW A; 2JXB A; 3VS3 A; 2HSP A; 2EGA A; 2KEA A; 1U06 A; 2EW3 A; 2C0O A; 4R0K A; 2GTO A; 2K79 A; 1WX6 A; 5IHN A; 4OMM A; 2C0I A; 1X27 A; 2KGT A; 1M3B A; 4RTU A; 5IXB A; 2DX1 A; 3M0P A; 2DVJ A; 1X6B A; 2EBP A; 2IIM A; 4JJB A; 2AK5 A; 1AVZ C; 2LJ0 A; 2YUN A; 4FSS A; 1KSW A; 2GGR A; 1UHF A; 1M3C A; 2DF6 A; 2ROT A; 1A0N B; 1SEM A; 4J9F A; 4F16 A; 1WIE A; 2J7I A; 2DM1 A; 2VWF A; 1ZX6 A; 2DLP A; 2SRC A; 1QKW A; 2RQV A; 1WYX A; 2RNA A; 1UEC A; 2JM9 A; 1JQQ A; 2O2O A; 4OMN A; 4WCI A; 1H3H A; 1ZUU A; 1I07 A; 2K3B A; 2BZX A; 2KRS A; 4K11 A; 4AFS C; 1OV3 A; 1TG0 A; 1K9A A; 2HBW A; 4J9D A; 2DE0 X; 2ENM A; 1M30 A; 2OJ2 A; 2FO0 A; 1FYN A; 1JEG A; 3TSW A; 2CDT A; 2J6K A; 2D1X A; 2O31 A; 2RQT A; 1QWF A; 3LH5 A; 2OI3 A; 3I9Q A; 3EHQ A; 1PHT A; 4ESR A; 2LQW A; 2KYM A; 3H0H A; 2KXD A; 1W6X A; 4QT7 A; 2ED0 A; 5IHK A; 1SPK A; 3QWX X; 1GCP A; 1K0X A; 1E6G A; 5FWB A; 1SRL A; 1X2K A; 2B86 A; 2RMO A; 5HCK A; 2JT4 A; 1GCQ C; 4HVW A; 3ULR B; 2FPD A; 1B3Q A; 1AOJ A; 1NEB A; 2G6F X; 4AFU C; 2EKH A; 1UDL A; 4ORZ A; 1NG2 A; 4Z8A A; 1CKB A; 2X3W D; 2EYZ A; 1GRI A; 2FEI A; 4JJC A; 1RUW A; 1RI9 A; 5FW9 A; 3I5S A; 2EPD A; 1JXO A; 1AD5 A; 1WXT A; 2AKK A; 5EC7 A; 1VYV A; 2RN8 A; 1YCS B; 1PKT A; 1ZUY A; 4M4Z A; 1UUE A; 2DRK A; 2DJQ A; 1SRM A; 2CUB A; 4HXJ A; 3UA6 A; 4AG1 C; 1AWX A; 2C0T A; 3RNJ A; 4HVV A; 1HJD A; 3SEM A; 1UTI A; 1PNJ A; 3TSZ A; 1X43 A; 2AZS A; 4EIK A; 1QWE A; 1FMK A; 2O9V A; 1NYF A; 2K7A A; 3UA7 A; 2KT8 A; 3UAT A; 1NYG A; 3JV3 A; 4D8D A; 1BK2 A; 3VRZ A; 3EHR A; 2O88 A; 1WXB A; 2SEM A; 2CT4 A; 1WA7 A; 2FRY A; 4ZNX A; 2NWM A; 1EFN A; 1BBZ A; 4F17 A; 1OEB A; 2DNU A; 2D8J A; 4JZ3 A; 2GQI A; 3REB B; 5I11 A; 1ABO A; 5ECA A; 2DL8 A; 2H8H A; 2GNC A; 4OMP A; 1WLP B; 4J9E A; 1ARK A; 1T0H A; 3M0T A; 4LNP A; 4RUG A; 1M8M A; 1VYT A; 2CH4 A; 1AEY A; 2X3X D; 1T0J A; 1T3S A; 1T3L A; 3GBQ A; 2E5K A; 2JW4 A; 2PZ1 A; 1UJY A; 1PRM C; 1WFW A; 2FPE A; 1UFF A; 4GLM A; 4CC3 A; 2W10 A; 4DEY A; 3ZL7 C; 2GBQ A; 2DMO A; 2KYB A; 1M27 C; 2ED1 A; 4D8K A; 1U3O A; 3NHN A; 3PVL A; 2LJ1 A; 1QLY A; 1KIK A; 2LCS A; 2A37 A; 3VS7 A; 1GBR A; 4CC4 B; 4GBQ A; 2JS2 A; 3H41 A; 1AZG B; 1SSH A; 2YSQ A; 1Y57 A; 2DBM A; 1UG1 A; 4RTW A; 5FWC A; 1GCQ A; 3R6N A; 4AFZ C; 4OMO A; 4RTV A; 3VS2 A; 2DL7 A; 4JJD A; 4F14 A; 2RQU A; 1H8K A; 2MCN A; 1PRL C; 1NLO C; 1SHF A; 1YWO A; 2DYB A; 4CC2 A; 4Y92 A; 1W70 A; 1K76 A; 2MOX A; 3QWY A; 4DEX A; 1LCK A; 2KRN A; 1AWO A; 2EQI A; 4J9H A; 1AZE A; 3H0I A; 2V1R A; 3C0C A; 1X2Q A; 2D8H A; 2FG0 A; 2CRE A; 1B07 A; 2EGC A; 2LQN A; 2HCK A; 1JO8 A; 2YDL A; 2D0N A; 1OPL A; 3I5R A; 2OAW A; 1Z9Q A; 3H0F A; 2DL4 A; 2YUQ A; 2K9G A; 4RTZ A; 2DBK A; 4J9G A; 2KRO A; 4E6R A; 4JPB W; 2AZV A; 1J3T A; 3VRY A; 1JXM A; 2A28 A; 2DL5 A; 2A08 A; 2M51 A; 4KRT A; 2KE9 A; 2VKN A; 2RPN A; 2RQR A; 1NEG A; 2KT1 A; 1PWT A; 1WXU A; 2EYY A; 1Y0M A; 2LMJ A; 2ROL A; 1OOT A; 2F2W A; 2KRM A; 3M0R A; 1UJ0 A; 2CUD A; 3RBB B; 1N5Z A; 1K0S A; 2L3S A; 1S1N A; 4IIM A; 2YUO A; 2PNI A; 3IQL A; 4RTY A; 1YNZ A; 4J9C A; 1CKA A; 1UE9 A; 2LX7 A; 3M0Q A; 3EG1 A; 2L3Q A; 1KJW A; 3TVT A; 4J9B A; 2BZY A; 1SHG A; 1XOV A; 1QKX A; 1HD3 A; 2RF0 A; 1V1C A; 2CSI A; 3THK A; 2RQW A; 3CQT A; 2JM8 A; 2FPF A; 1JU5 C; 4OMQ A; 3PE0 A; 5GJW B; 2L3P A; 4LUE A; 2JMC A; 1YWP A; 3VS5 A; 1VA7 A; 3EGU A; 2BTT A; 2K2M A; 2J6F A; 1G2B A; 1AWJ A; 1I0C A; 2EYX A; 2DA9 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1QP2 A; 3VV0 A; 4M77 C; 2XDD A; 2DL3 A; 1Q86 C; 1UHC A; 2JS0 A; 4B9W A; 4HCZ A; 4M7A A; 1ABQ A; 2CKK A; 2LZ6 B; 2K5F A; 1D0Y A; 1W1F A; 4PJN A; 3OSS C; 3NMZ C; 4M78 F; 2DIL A; 1N8R R; 2LCL A; 1JRI A; 4E7S A; 3UF4 A; 4WF2 A; 3MEA A; 3PMT A; 1ZLM A; 4M77 D; 1KD1 U; 3CXC A; 2VXF A; 3RMS A; 2L0A A; 5GMK i; 1KC8 U; 3ASK A; 1U1S A; 2I0N A; 3VS0 A; 3GNG A; 1E6H A; 2A36 A; 2YUP A; 4BDZ A; 3AT1 B; 5D7U A; 1VQ8 A; 4ELY C; 1I5O B; 1BCM A; 1KFZ A; 3CME T; 2CH4 W; 3CPW P; 2VV5 A; 2LT4 A; 5C0M A; 3QHS A; 2DPP B; 4NL3 A; 2LC4 A; 5A0G A; 4AMC A; 3VUB A; 3SWN B; 5DM7 R; 1G3W A; 4MMK A; 4X1V A; 2RHY A; 2DJZ A; 1WGS A; 4DBR A; 3MHX A; 3GLX A; 4Z89 A; 2CP5 A; 5L8R E; 3M57 A; 2ECZ A; 3HTR A; 2RB6 A; 1YIJ Q; 2A3L A; 3C12 A; 4A4E A; 4ZTF A; 2QAS A; 2QA4 A; 1M3A A; 4M75 F; 1RAE B; 1Z9Z A; 2DKG A; 3CCV Q; 1YN8 A; 4RTX A; 1Q86 R; 3FDR A; 1D1A A; 3GPL A; 2J06 A; 5FRM A; 2O9S A; 1MV0 B; 2JXB A; 2IG0 A; 4QVC A; 3DB3 A; 2KEA A; 1U06 A; 4PJL A; 3OYJ A; 1TU0 B; 2EYQ A; 5D6W A; 5IXB A; 3OYN A; 1FX7 A; 3CC7 Q; 2DX1 A; 4BY6 C; 2BE7 D; 2EBP A; 2IIM A; 2RJD A; 5KYX B; 4JJB A; 3GIB A; 2QTX A; 4J8O A; 2YUN A; 4LDY A; 2H3E B; 2GGR A; 3DLM A; 1SEM A; 1N27 A; 1WIE A; 1WZO A; 1QVP A; 3HFO A; 3G4S T; 3TQ7 P; 2VYT A; 2RQV A; 3WVE B; 2RNA A; 3NTH A; 4C5H A; 4PFZ A; 2JM9 A; 2HAX A; 4HT9 A; 1EX4 A; 2O2O A; 2E3H A; 2PVO B; 1H3H A; 1QVF P; 4Z02 A; 2YRD A; 2DE0 X; 2E12 A; 1VQ7 A; 2FO0 A; 3TSW A; 1IGQ A; 2CDT A; 2J6K A; 2OAU A; 2O31 A; 5HY6 A; 3LH5 A; 2RJC A; 2JZ2 A; 4J6Y A; 1YIT Q; 1MMD A; 3VUZ A; 2HL3 A; 2KYM A; 4BD3 A; 4KUD K; 1V29 B; 1Q95 G; 5LJ5 d; 1V76 A; 1W6X A; 4QT7 A; 4A4H A; 4F7U G; 3HFN A; 3H6Z A; 1M1K U; 1ZSZ A; 3GF5 A; 2B86 A; 1KQS P; 2EQK A; 2JT4 A; 4OVA A; 5CCA A; 3CCQ A; 2FPD A; 1NEB A; 3QDR B; 2QGG A; 2CP3 A; 2EKH A; 1UDL A; 4ZGJ B; 4X9C A; 1SSF A; 3SB2 A; 1YJ9 Q; 1WJS A; 1RI9 A; 3I5S A; 3CCJ T; 2LNV A; 5GAO l; 1YHQ Q; 4LD9 K; 2HBP A; 4PJJ A; 1WXT A; 1VYV A; 2RN8 A; 4F04 B; 2RI5 A; 2ZPH B; 2MMP A; 1PKT A; 1R0B G; 1S72 T; 2DRK A; 3RUX A; 3JB9 D; 2PU9 B; 1K73 C; 2HSE B; 4RCC A; 4LDU A; 3RER A; 5KE2 A; 3QYH B; 4M7D G; 4AG1 C; 3RNJ A; 1VQ5 Q; 4OB1 B; 3OYA A; 4PJO F; 4RMO A; 4QQ6 A; 1MMA A; 4FCY A; 4X9D A; 2O9V A; 2ZCF B; 2KT8 A; 3UAT A; 1NYG A; 4PNO A; 4XTU A; 5HK0 A; 1RAA B; 4M7D E; 3EHR A; 1Q82 C; 2SEM A; 3A1P A; 3CC4 A; 1FMW A; 4FSX A; 3CC2 Q; 4N0A C; 4NOY A; 1TSF A; 4F17 A; 1YJN T; 1VQ6 Q; 1VQO Q; 4HT8 A; 4KGV B; 3CCU A; 1NPR A; 2H8H A; 2DVE A; 2E41 A; 3JCM W; 2G3R A; 1IZ6 A; 3M0T A; 2DIG A; 1O75 A; 3OB9 A; 1VQP A; 3CCS A; 4J5Y A; 2DD5 A; 2IPO B; 3GOX A; 1T3S A; 3GBQ A; 1Q81 R; 2JW4 A; 2PZ1 A; 5GAN g; 1UJY A; 1PRM C; 1WFW A; 2LX9 A; 4M78 D; 4GLM A; 4F7U A; 3QDF A; 2DMO A; 3NTI A; 3OQ5 A; 2KYB A; 2QEX T; 1JB0 E; 4D8K A; 3NHN A; 2LJ1 A; 1QLY A; 4LD6 A; 3OYI A; 1C1A A; 4OB3 B; 1MGQ A; 4AT1 B; 1RAG B; 4EPC A; 1IB8 A; 2BUD A; 1SSH A; 5GAN j; 2YSQ A; 1D3B A; 1K8A C; 1Y96 B; 1K73 R; 3C4S A; 2YLC A; 1M2V B; 3R6N A; 4AFZ C; 2VGM A; 2DL7 A; 1H8K A; 2X35 A; 2QQR A; 3I56 T; 1WNL A; 1YWO A; 1G8X A; 2DK3 A; 3JCM c; 4E7Z A; 3ME9 A; 4Y92 A; 1VQK T; 4M75 C; 3WVD B; 2F69 A; 5FU6 B; 3EGX B; 1FMV A; 1Q82 R; 4M7D A; 3M59 A; 4FW2 A; 1H64 1; 3CCM T; 3G71 A; 3EFS A; 2EQI A; 1AZE A; 2QAZ A; 5CIU A; 1BI2 A; 2DXU A; 2P0Q A; 3C0C A; 3RKY A; 4M7D C; 1LVK A; 1B07 A; 4M75 D; 2HCK A; 3CCE A; 2YDL A; 5CKE A; 2KAF A; 2R5A A; 4C0G A; 2DXC A; 2E6N A; 2OAW A; 2DET A; 5CQX A; 3EG9 B; 1KHI A; 3OYG A; 3QSU A; 4OP0 A; 2DBK A; 1QCO A; 3CD6 A; 3EFO B; 2KVQ G; 2A28 A; 2O4X B; 4VUB A; 5GMK e; 3OS2 A; 2QA4 T; 4X34 A; 1MND A; 2ZPG B; 2RQR A; 1NEG A; 2XU8 A; 2BE9 B; 2LMJ A; 2ROL A; 3FJP A; 4FL6 A; 1W4S A; 2F2W A; 2DIQ A; 3M0R A; 3CME Q; 2CUD A; 3QZ5 B; 1S1N A; 3CMA A; 4IIM A; 4C92 B; 1K8A R; 3IQL A; 3QXE B; 4J9C A; 5A2Q E; 3M0Q A; 3M55 A; 1LJO A; 1Y7X A; 4FIB A; 4J9B A; 3X25 B; 1XOV A; 3LWH A; 2KQW A; 2L5Q A; 5FU7 B; 2JTM A; 4M78 B; 4OB0 B; 2COW A; 2FPF A; 2RJE A; 4OMQ A; 3V8L A; 3VYG A; 4LUE A; 2JMC A; 3DB4 A; 2E6Z A; 2BTT A; 3MCA B; 1D09 B; 1I0C A; 2EYX A; 1M4Z A; 5KYW A; 2Y4Y A; 1M2O A; 1X6G A; 1G83 A; 4RTT A; 4FYY B; 4J9I A; 5J3B A; 3URG A; 3L2R A; 5A0L A; 3EG0 A; 3JCM e; 2Z0W A; 3RIR A; 2XMF A; 4RCB A; 3LLR A; 2QDY B; 2K2V A; 4M77 G; 5IHI A; 1K1Z A; 4E47 A; 1YJW T; 4FYX B; 1P92 A; 4PFO A; 1I8F A; 2RH2 A; 2DXB A; 2KNB B; 2EGE A; 2XIC A; 1PSF A; 1MV3 A; 1K4U S; 3EG2 A; 4M77 E; 5CK9 A; 1E7O A; 2JTE A; 2L2P A; 5GJV B; 1M9S A; 2HL5 C; 1BB9 A; 4A63 B; 2WSE E; 4KBM B; 4BE0 A; 1GBQ A; 3JSC A; 3SWN C; 2YRC A; 2LNH B; 4J6W A; 3G4S Q; 1MUZ A; 3JCM J; 3H8Z A; 4Y91 A; 4JRQ A; 2NYS A; 1WHM A; 1KQ2 A; 1YP5 A; 1QCN A; 2OTL A; 2I2L A; 1VUB A; 2FYK A; 2M0Y A; 4PLL A; 4LN2 A; 3M0S A; 3REA B; 5KYU A; 2ZPB B; 1GFC A; 4CC7 A; 2W0Z A; 1ZUK A; 2E4H A; 4AG2 C; 2K5I A; 3SDZ A; 5GMK h; 1EIF A; 2EYW A; 3VU3 C; 1HK9 A; 3MP8 A; 3QUI A; 4EMH A; 1VQM T; 4OML A; 2LP5 A; 1TUD A; 2EVR A; 4BAC A; 2ABL A; 1QCF A; 3M53 A; 2VVK A; 1N9S A; 2QDL A; 5GAN 7; 2ESW A; 1BYM A; 2YWW A; 2HSP A; 2EGA A; 1WHK A; 5LL6 S; 2GTO A; 3CC4 T; 3L2Q A; 2K79 A; 1YI2 A; 5IHN A; 4OMM A; 1VQN T; 3V7C A; 1X27 A; 2KGT A; 1M3B A; 5GAM g; 4XU3 A; 3A5Z B; 3M0P A; 2XDB A; 4O6J A; 3CCJ Q; 2QQS A; 5KH6 A; 2FZK B; 1QMC A; 1G3T A; 3A8L B; 2NUP A; 2ZZD A; 3VJP A; 3T9N A; 5IAY A; 4M77 A; 1AVZ C; 2LJ0 A; 1UGP B; 4ELZ C; 1S72 Q; 1M3C A; 1I5L A; 4C92 F; 2ROT A; 3KBG A; 4J7F A; 4F16 A; 5GAM j; 5LJ3 g; 2K3Y A; 1PM3 A; 4XK8 E; 2SRC A; 1QKW A; 1WYX A; 4WCI A; 1M5Q 1; 4IUR A; 3QBY A; 5LJ5 h; 3ZEH A; 1K9A A; 1NPP A; 1ZA1 B; 5GAO m; 1KC8 R; 1C0M A; 4FT4 A; 4E7L A; 4EMG A; 3MPU B; 1YJN Q; 1JEG A; 2QYZ A; 5LJ3 j; 2K3X A; 2HZY A; 4KT0 E; 1OZ2 A; 3I9Q A; 4IKF A; 1VQ9 T; 1KK7 A; 4O5V A; 2DTH A; 1B7T A; 4ESR A; 1G3S A; 1YIJ A; 1M1G A; 2KDS A; 2EJ9 A; 4A4K A; 5IHK A; 4BI3 A; 1E6G A; 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