The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
8
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sequence length |
56
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structure length |
56
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Chain Sequence |
VRVRALYDYDGQEQDELSFKAGDELTKLGEEDEQGWCRGRLDSGQLGLYPANYVEA
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Molecular Basis for SH3 Domain Regulation of F-Bar-Mediated Membrane Deformation.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
PROTEIN KINASE C AND CASEIN KINASE SUBSTRATE IN NEURONS PROT
|
| molecule tags |
Endocytosis
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| source organism |
Mus musculus
|
| total genus |
8
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| structure length |
56
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| sequence length |
56
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| chains with identical sequence |
E
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-01-28 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| D | PF14604 | SH3_9 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1T3L A; 2RQW A; 3TSZ A; 2L3P A; 2NWM A; 2KYB A; 2C0I A; 2EW3 A; 2FEI A; 1I07 A; 2G6F X; 2LQN A; 2H8H A; 2X3W D; 4JJC A; 1X2K A; 1VYU A; 2GGR A; 1WDX A; 1SHG A; 4AFS C; 4HVV A; 1WX6 A; 1GRI A; 2EYW A; 3KFV A; 1GBQ A; 1WXT A; 2DRK A; 2YSQ A; 2V1Q A; 2JMA A; 2FPF A; 1K4U S; 1WYX A; 4E6R A; 1YWP A; 3ZL7 C; 2LP5 A; 2OI3 A; 1OPL A; 4LUE A; 1QCF A; 1SRM A; 1OPK A; 4DEX A; 2HBW A; 1M27 C; 2C0T A; 2YT6 A; 2DBK A; 3NPF A; 3LH5 A; 2EVR A; 1ABQ A; 1XOV A; 5IHK A; 2O2O A; 2DX1 A; 1G83 A; 2DL8 A; 4KRT A; 1WFW A; 4ZNX A; 2KR3 A; 4Z88 A; 2A08 A; 1UHC A; 2L0A A; 3I35 A; 2P4R A; 1GCP A; 2DJQ A; 2FPE A; 1FYN A; 1N5Z A; 3H41 A; 4OMP A; 2FO0 A; 2KRM A; 2VWF A; 2A28 A; 2BTT A; 2XMF A; 1UTI A; 2GBQ A; 2JTE A; 2EKH A; 2BZ8 A; 3ULR B; 1Y0M A; 4JZ4 A; 3VS7 A; 4ORZ A; 1JEG A; 1K76 A; 3QWX X; 1RLP C; 1UEC A; 1M8M A; 2LQW A; 2KXD A; 1K1Z A; 3GBQ A; 3REA B; 2CT4 A; 2DL7 A; 1M3B A; 1PKT A; 2CSQ A; 2MIO A; 3VS4 A; 4AG2 C; 1TUC A; 2DNU A; 2CUB A; 2JS0 A; 2DMO A; 5I11 A; 5I22 A; 1M3A A; 1LCK A; 1E7O A; 2J6F A; 1X27 A; 4J9E A; 2PZ1 A; 1GL5 A; 1U06 A; 1U5S A; 2YUP A; 2CSI A; 4HCK A; 1ZSG A; 2KYM A; 2FRY A; 1Z9Z A; 2MCN A; 1AZG B; 1JXM A; 1RLQ C; 1V1C A; 3THK A; 1X6B A; 2K7A A; 4J9C A; 5IHI A; 4CC2 A; 2D0N A; 4Z89 A; 2VVK A; 4AG1 C; 3I5S A; 3VRY A; 1T3S A; 1ZUY A; 2DYB A; 3SHW A; 2PTK A; 1A0N B; 1X69 A; 1FMK A; 3UF4 A; 4RTX A; 5FWB A; 1PNJ A; 2D8J A; 1OEB A; 2QDL A; 2EPD A; 4D8D A; 1QWF A; 1RI9 A; 4K11 A; 2DBM A; 1RUW A; 2GTO A; 4LN2 A; 4CC4 B; 1G2B A; 5HCK A; 2DA9 A; 2F2V A; 1CSK A; 4R0K A; 4OMO A; 1UUE A; 1H8K A; 2RMO A; 4J9B A; 3VS6 A; 2AZS A; 2EGC A; 4GLM A; 1JQQ A; 4HVU A; 1ZBJ A; 2LJ3 A; 4JPB W; 2J05 A; 2J6K A; 4EIK A; 3H0I A; 1BU1 A; 2L3Q A; 1WA7 A; 4RTZ A; 1SPK A; 2EBP A; 3H0F A; 1I0C A; 1QKX A; 1KSW A; 3H0H A; 2JXB A; 1ARK A; 1AD5 A; 2KE9 A; 4RTW A; 1KFZ A; 4J9G A; 2J06 A; 5FWC A; 2ESW A; 2LMJ A; 1T0H A; 1YWO A; 2SRC A; 5IHN A; 3C0C A; 5FW9 A; 1JU5 C; 4RTT A; 1WIE A; 2KBT A; 2CUD A; 2J7I A; 2CH4 W; 1WXU A; 2KXC A; 1MV3 A; 1B3Q A; 1E6H A; 2ENM A; 2VKN A; 3O5Z A; 4F17 A; 1J3T A; 1W1F A; 2L2P A; 4Z8A A; 2D8H A; 5GJV B; 1AEY A; 2YUN A; 2BZX A; 2JMC A; 3JV3 A; 1H3H A; 1VYV A; 2KEA A; 4JZ3 A; 4CC3 A; 3UA6 A; 2EYZ A; 3EG3 A; 2K3B A; 3M0S A; 2SEM A; 1QLY A; 1AOJ A; 3CQT A; 4D8K A; 1NM7 A; 4QT7 A; 3I5R A; 2GTJ A; 2ROL A; 1AVZ C; 4AFZ C; 1CKB A; 3FJ5 A; 1GFC A; 4OML A; 3EG2 A; 3EG1 A; 4F14 A; 2AK5 A; 1NEB A; 4HXJ A; 2OAW A; 2L3S A; 3VS5 A; 2RQT A; 1UHF A; 2V1R A; 2RN8 A; 2ECZ A; 4IIO A; 2IIM A; 4M4Z A; 2KT1 A; 1K0X A; 1EFN A; 1SEM A; 2X3X D; 4LNP A; 2AKK A; 1W70 A; 2A37 A; 4J9I A; 1BBZ A; 1AWO A; 2M51 A; 2DF6 A; 3VRZ A; 3M0P A; 1BK2 A; 3M0Q A; 5IXB A; 1AWJ A; 2EGA A; 2C0O A; 2GNC A; 3NGP A; 1UE9 A; 4J9F A; 4OMM A; 2CT3 A; 3EHR A; 2JM9 A; 2ED0 A; 4DEY A; 1AWW A; 2OJ2 A; 2FG0 A; 1IO6 A; 4A63 B; 3EGU A; 1YNZ A; 3VS1 A; 2KT8 A; 1T0J A; 2F2X A; 1NLP C; 1UFF A; 2LJ1 A; 1UG1 A; 2DVJ A; 4J9D A; 4OMN A; 2DRM A; 4CC7 A; 1Y57 A; 1UGV A; 2HDA A; 1NLO C; 2DM1 A; 2LX7 A; 1E6G A; 1PRL C; 2KRO A; 2ABL A; 2AKL A; 3PVL A; 2K79 A; 1ZUK A; 1PWT A; 2B86 A; 3M0R A; 1OOT A; 4GBQ A; 2O9V A; 4J9H A; 5IH2 A; 3VS3 A; 4FSS A; 1GCQ A; 2JS2 A; 2DIL A; 2RQR A; 2EYY A; 4Y92 A; 1CKA A; 1OV3 A; 1M3C A; 1X6G A; 2MOX A; 1YP5 A; 2YUQ A; 3IQL A; 2KRN A; 2EYX A; 2RF0 A; 4RUG A; 1GCQ C; 3TVT A; 3UAT A; 3NHN A; 2EQI A; 1PKS A; 1WXB A; 1GBR A; 2YUO A; 2HEQ A; 2KRS A; 3U23 A; 4LUD A; 2ROT A; 1PHT A; 4AFQ C; 3NMZ C; 4ESR A; 2I0N A; 2BZY A; 2CH4 A; 1NEG A; 2E5K A; 1PRM C; 1SRL A; 2PNI A; 2DL5 A; 2EGE A; 1S1N A; 2W10 A; 2LZ6 B; 5ECA A; 1TG0 A; 1VA7 A; 2HSP A; 2O31 A; 3I9Q A; 2HCK A; 3EHQ A; 2KGT A; 4HVW A; 1WI7 A; 4LE9 A; 4F16 A; 4RTY A; 1K0S A; 1W6X A; 1KJW A; 2JW4 A; 2AZV A; 1ZUU A; 3QWY A; 2J6O A; 2O88 A; 2DL3 A; 1B07 A; 2FPD A; 5IXF A; 1MUZ A; 1WLP B; 1UDL A; 2FRW A; 3REB B; 1NG2 A; 1ZX6 A; 1NYG A; 4AFU C; 5EC7 A; 3UA7 A; 1AZE A; 2JM8 A; 3A98 A; 1KIK A; 4JJB A; 2K9G A; 4RTV A; 2RQV A; 1HJD A; 2DE0 X; 1YN8 A; 3PVQ A; 2O9S A; 2LCS A; 2LJ0 A; 2GQI A; 3R6N A; 2CDT A; 2RPN A; 1ABO A; 1MV0 B; 4OMQ A; 3M0T A; 3SEM A; 5L23 A; 2YDL A; 3VS0 A; 1AWX A; 2NUZ A; 3M0U A; 1GFD A; 4X1V A; 3TSW A; 2ED1 A; 1I1J A; 3RBB B; 4IIM A; 1M30 A; 1X43 A; 1U3O A; 3RNJ A; 1HSQ A; 2A36 A; 1K9A A; 1SHF A; 1H92 A; 2M0Y A; 1HD3 A; 1X2Q A; 1UJY A; 2JT4 A; 3PE0 A; 4JJD A; 1SSH A; 2D1X A; 2LNH B; 1ZLM A; 2F2W A; 5GJW B; 2RQU A; 1YCS B; 1TUD A; 1Z9Q A; 2K6D A; 3EG0 A; 1NYF A; 2K2M A; 4WCI A; 1JXO A; 2W0Z A; 2RNA A; 2DLP A; 1BB9 A; 1JO8 A; 1VYT A; 2CRE A; 3VS2 A; 2KNB B; 1QWE A; 1UJ0 A; 2DL4 A; 4RTU A; 1QKW A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2RQW A; 4XTZ A; 1VQL T; 4HCC A; 5J3B A; 2NWM A; 1I07 A; 4FCY A; 2LQ8 A; 2H8H A; 2X3W D; 1X2K A; 1VYU A; 3S6W A; 3M59 A; 1VQ7 T; 1XQH A; 5GAO n; 4N4H A; 2DRK A; 1K4U S; 3GOX A; 5GAO l; 1YWP A; 4J83 A; 2XDB A; 2DTI A; 3M55 A; 2HBW A; 5A2Q E; 2C0T A; 2YWW A; 2DBK A; 1ZSZ B; 4PJM A; 1HXD A; 3NPF A; 5D7U A; 3OBW A; 2COY A; 1I4K 1; 4BDY A; 2MPX C; 2DX1 A; 1RAG B; 5J26 A; 1QCO A; 2A08 A; 2L0A A; 1ZSZ A; 3MHX A; 2DPP B; 1OU8 A; 2QQS A; 3CCE Q; 4DBR A; 3DLL A; 1IHW A; 3QG1 A; 6AT1 B; 4PJJ A; 2VWF A; 3HRT A; 4LDX A; 2VGN A; 4ZN1 A; 1IZ6 A; 1KK7 A; 4M7A C; 2GBQ A; 4M7A D; 3I55 T; 3FLG A; 1RLP C; 1M8M A; 2YHT A; 2KXD A; 4A53 A; 3GBQ A; 3REA B; 2CT4 A; 1IB8 A; 1X01 A; 3VS4 A; 3CCM A; 1VOM A; 4KH1 B; 2J6F A; 2L3R A; 5HKC A; 2QQR A; 2PZ1 A; 4XTV A; 1U5S A; 3DB4 A; 2CSI A; 5C0M A; 1ZSG A; 4PJO E; 4WF2 A; 1AHJ B; 5I2M A; 3QJ6 A; 1AZG B; 1JXM A; 2MMP A; 4DA4 A; 2GCX A; 2K7A A; 2A7Y A; 2D0N A; 4EPC A; 1LJO A; 4B9W A; 3VRY A; 1WPY A; 2AIR B; 4II1 A; 3CCQ A; 1ZUY A; 2DYB A; 4C92 F; 3CPF A; 1H64 1; 1MGQ A; 4EMK A; 3NTI A; 1NZ9 A; 2L89 A; 4PKC C; 3UF4 A; 1RAC B; 3JCM X; 1VQ9 T; 1PNJ A; 1OEB A; 5GAN j; 1WHG A; 2EPD A; 5HK3 A; 5LJ5 f; 5FLX E; 1RI9 A; 4K11 A; 1PD1 A; 1D0Y A; 2R5A A; 5IAY A; 3PIO A; 2VV5 A; 5HCK A; 3EFS A; 2E12 A; 3CME T; 2KMT A; 1NJI U; 3BE3 A; 2ZPB B; 4R0K A; 3G6E Q; 3VU3 C; 3FC3 A; 4XU2 A; 4C92 B; 1W2B A; 2AZS A; 3G4S Q; 3JCM d; 3JCM W; 2EIF A; 1YJ9 Q; 1YBY A; 1Q82 U; 3H0I A; 5GAN 8; 1BU1 A; 1YJW A; 3INZ A; 3BY7 A; 1PSE A; 2QAS A; 1AD5 A; 1M2V A; 4ANJ A; 2DET A; 1NE8 A; 5AT1 B; 1IGQ A; 2BE9 B; 4A4K A; 3CCR A; 1KFZ A; 2ESW A; 1T0H A; 2SRC A; 3C94 A; 3SB2 A; 3X20 B; 3OYF A; 2KXC A; 3OYD A; 1W1F A; 3QXE B; 3X28 B; 1D1B A; 4Z8A A; 1JJ2 S; 2D8H A; 3EFR A; 2DAQ A; 5LJ3 h; 4OF1 A; 3CC4 T; 2P84 A; 2BZX A; 2YUN A; 3JV3 A; 1H3H A; 4PLI A; 2KEA A; 4JZ3 A; 3GPL A; 4BY6 C; 3UA6 A; 3G1J A; 5GMK e; 1B7T A; 3EG3 A; 1K8A C; 3M0S A; 3OS1 A; 1VQM A; 3WVD B; 4ZN3 A; 2DYI A; 4JUV A; 5GAM h; 4QT7 A; 2XDP A; 1LNX A; 4AFZ C; 1WNL A; 1QCN A; 3P8H A; 4M78 F; 5I2S A; 3J80 E; 4GLK A; 1NEB A; 4HT9 A; 2QQ9 A; 3L42 A; 1QVG P; 3GP8 A; 3JB9 I; 3CC7 A; 1UHF A; 2V1R A; 3QZ9 B; 3PT9 A; 2IIM A; 2KT1 A; 1RL2 A; 2KSS A; 3CCU A; 2O01 E; 1W70 A; 2RHX A; 3OYI A; 1K73 R; 1OI1 A; 2PVO B; 2L8D A; 3CCM Q; 1WHK A; 5IXB A; 1AWJ A; 1X75 C; 2EGA A; 5C6S A; 1WHM A; 4N4I A; 4QVZ A; 4Q5W A; 2PUO B; 4M78 B; 3EHR A; 4Y91 A; 2PU9 B; 2OJ2 A; 2FG0 A; 4N0A C; 3EGU A; 2MK5 A; 4E7I A; 2KQW A; 2KT8 A; 1NLP C; 3DLM A; 2LJ1 A; 2DVJ A; 4M75 F; 3RUX A; 2DVE A; 3JB9 D; 4MDX A; 4M78 A; 3G71 A; 5GAN g; 1NJI C; 4FYY B; 4F7U G; 1MMD A; 5GAO r; 5GAO q; 2B8A A; 2QGG A; 1G8X A; 2ABL A; 3HP9 A; 3CCQ Q; 3HTR A; 1K8A R; 1PWT A; 2E10 A; 5IH2 A; 3CXC A; 5CKE A; 3OQ5 A; 1GCQ A; 1OZ2 A; 1M1K R; 2JS2 A; 1O75 A; 1Q82 C; 2EYY A; 4KH0 B; 3R6O A; 1MHN A; 2LT1 A; 2RJF A; 5LJ3 e; 5LL6 S; 1I5L A; 2EYX A; 1VQ8 A; 2RF0 A; 4M75 B; 1R0C B; 4C5H A; 2RHU A; 2YUO A; 1YIJ Q; 2OTL T; 2HEQ A; 2KI7 A; 3NTK A; 2XKO C; 2YRD A; 3NMZ C; 4ESR A; 4RCC A; 4PJL A; 2EFI A; 1PC0 A; 5GAM e; 3VUZ A; 5AYF A; 4M75 A; 1PRM C; 5CVI A; 1SRL A; 2DL5 A; 2QA4 A; 1S1N A; 2W10 A; 4M7D C; 2LZ6 B; 5FRM A; 1TG0 A; 1YJW Q; 4CI0 C; 1N6A A; 4AT1 B; 2QTV A; 3CCE T; 4M7D D; 3I9Q A; 9ATC B; 2CP3 A; 3G7Z A; 4FYV B; 3A8H B; 1QVF S; 2AT1 B; 4ELZ C; 2HQE A; 1K0S A; 3CCR Q; 1U1T A; 1VQ4 A; 1IRX A; 1B07 A; 2PQW A; 2FPD A; 3VKI A; 4FL6 A; 1MUZ A; 2JTM A; 2Y4X A; 5GMK j; 3JCM J; 2YLC A; 5LJ5 h; 1OX9 A; 4C8Q C; 4LDU A; 4EDU A; 2NUT B; 4JS5 A; 4DOV A; 1NYG A; 4AFU C; 3A98 A; 1MMN A; 4C8Q D; 5CO7 A; 1B34 A; 5FU7 C; 3CCL A; 1BYM A; 3BFM A; 1HJD A; 3MEV A; 2RI5 A; 2LCS A; 2LJ0 A; 3RMQ A; 1VQM Q; 3R6N A; 1RAF B; 2CDT A; 4BB7 A; 1I8F A; 3FDR A; 1JBM A; 2NUT A; 3M0T A; 2E65 A; 4PJO G; 1KQ2 A; 1KQS S; 3M0U A; 2QYZ A; 2HMA A; 4X1V A; 1I1J A; 4FSX A; 4XU0 A; 3SWN B; 4C0G A; 5L8R E; 3OY9 A; 2DIQ A; 5GAN 5; 1ZHI A; 1X43 A; 1N27 A; 3CC7 Q; 1U3O A; 2QGF B; 1HSQ A; 3RNJ A; 2E6N A; 2M0Y A; 1X2Q A; 2HQX A; 2JT4 A; 3PE0 A; 4JJD A; 3CCU Q; 2RQU A; 2LCC A; 1Z9Q A; 1NYF A; 3SWN A; 4TVR A; 2YRC A; 4E7L A; 4HT8 A; 1JO8 A; 3CCV A; 2M9U A; 1WHH A; 3RKY A; 1T3L A; 2BIV A; 4KUL A; 4M7A F; 3JCM f; 2C0I A; 3DB3 A; 2DD5 A; 3V7C A; 3G4S T; 4M77 F; 2IPO B; 3I56 Q; 3TQ7 P; 1YJ9 T; 4X34 A; 3VYG A; 4DBQ A; 4AFS C; 2VGM A; 3KFV A; 1GRI A; 2EYW A; 1WXT A; 4QKU A; 3G71 Q; 1YI2 A; 2JMA A; 1BI1 A; 2LP5 A; 5LJ3 j; 4LDW A; 3JCM Q; 1M8V A; 1OPL A; 1VQ5 A; 1QCF A; 3ME9 A; 1M27 C; 3A5Z B; 2MI6 A; 4M7A B; 5LJ5 e; 3OYB A; 1TTH B; 1ABQ A; 1XOV A; 5IHK A; 2O2O A; 2E41 A; 4M77 B; 1VQ8 Q; 5GAM j; 2DL8 A; 2CP2 A; 4ZNX A; 1NBE B; 5GMK i; 1WQW A; 3OYL A; 2MF2 A; 1VQO T; 3OSV A; 1GCP A; 3SFM A; 4C0D C; 4ZGJ B; 2FPE A; 3QKJ A; 3D7S B; 4M77 A; 2MYS A; 1PG5 B; 1N5Z A; 3M53 A; 4LXC A; 2FO0 A; 2HBP A; 2QAZ A; 5CKB A; 1KD1 R; 1PM3 A; 4C8Q E; 2DZ9 A; 2QA4 Q; 1KHC A; 1SF9 A; 1FMV A; 4ATO A; 1Y0M A; 4JZ4 A; 3BDU A; 4QQ6 A; 4OMF B; 2ZAE A; 1K1Z A; 2DL7 A; 1M3B A; 3KXT A; 2CSQ A; 4AG2 C; 1QQJ A; 1VQ4 Q; 2DNU A; 3TRE A; 1QVG A; 2DMO A; 1E7O A; 4KUI A; 1X27 A; 1ZA1 B; 3E2U A; 1GL5 A; 1U06 A; 3CD6 T; 4HCK A; 2QK0 A; 4FW2 A; 3BW1 A; 2DJZ A; 4JS4 A; 1NPR A; 3CCM T; 1YHQ Q; 1N8R R; 3OYA A; 1D3B A; 3CCL Q; 5GAN d; 2LQK A; 4J9C A; 4LDY A; 4QVD A; 2LNV A; 2KK4 A; 4Z89 A; 1D09 B; 1PD0 A; 5D6X A; 3MP1 A; 2F1L A; 3M56 A; 3CMA T; 2PTK A; 5HK0 A; 4A4E A; 1SG5 A; 3E9G A; 4E7S A; 1MNE A; 5FWB A; 1DJ7 B; 4O6J A; 3CCQ T; 1VQN T; 2PUK B; 4UC4 A; 2EQJ A; 5GAN 7; 3JCM P; 1QP3 A; 1WGS A; 2GTO A; 4LN2 A; 5GMK m; 3CXC P; 4IUT A; 1G2B A; 1Q81 R; 2DA9 A; 1W4S A; 4M78 E; 1TXQ A; 4BI4 A; 1H8K A; 3CBO A; 4J9B A; 2HD0 A; 3VS6 A; 2XHC A; 4HVU A; 1ZBJ A; 2ZPI B; 5CKH A; 3CCV Q; 2LJ3 A; 3QO3 A; 4JPB W; 4YTL A; 2O4X B; 2M1H A; 2DXT A; 4RTZ A; 3PMI A; 2DXB A; 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