The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
13
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sequence length |
60
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structure length |
60
|
Chain Sequence |
GPLGSPQCKALYAYDAQDTDELSFNANDIIDIIKEDPSGWWTGRLRGKQGLFPNNYVTKI
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Myosin 1E SH3
rcsb |
| molecule keywords |
MYOSIN 1E SH3
|
| molecule tags |
Motor protein
|
| source organism |
Mus musculus
|
| total genus |
13
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| structure length |
60
|
| sequence length |
60
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-07-27 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3NHN A; 2DRK A; 3VS6 A; 2BZY A; 2PZ1 A; 4CC2 A; 1WLP B; 3KFV A; 3JV3 A; 4RTZ A; 2DLP A; 1PKT A; 1SHG A; 2A37 A; 2DA9 A; 2EGA A; 2LQW A; 2DL3 A; 1PRM C; 1MUZ A; 1JU5 C; 2J06 A; 2G6F X; 2JW4 A; 4LE9 A; 1HJD A; 4FSS A; 1SRL A; 4JZ4 A; 3M0Q A; 1RI9 A; 2DMO A; 3PE0 A; 4AG2 C; 1KIK A; 1GRI A; 2EW3 A; 1KJW A; 4AFZ C; 1QWE A; 5GJV B; 4J9E A; 1T3L A; 4RTU A; 1V1C A; 2NWM A; 5IHI A; 3RNJ A; 2RF0 A; 2MOX A; 1ZSG A; 3VS4 A; 2DL8 A; 2KR3 A; 4D8K A; 2AZV A; 1NLO C; 1Z9Q A; 2K6D A; 1GFC A; 1TUD A; 1VA7 A; 4J9H A; 2CUD A; 2NUZ A; 2L0A A; 4OML A; 3VS0 A; 2SEM A; 4RUG A; 1UG1 A; 4QT7 A; 1U3O A; 2RQV A; 1OOT A; 2DM1 A; 2JTE A; 2H8H A; 1IO6 A; 1RUW A; 1VYT A; 2KXC A; 1UJ0 A; 2HCK A; 1WX6 A; 4OMP A; 1PWT A; 5IHN A; 2YUO A; 1PNJ A; 1B07 A; 3RBB B; 1UFF A; 2KT8 A; 1T0J A; 1CSK A; 2AZS A; 2DIL A; 1BBZ A; 2M0Y A; 1OV3 A; 2FO0 A; 2JT4 A; 1YN8 A; 2X3W D; 1ABQ A; 3LH5 A; 2O2O A; 2KBT A; 2BZX A; 2A28 A; 5FWC A; 1QKX A; 1X6G A; 3M0S A; 2LJ1 A; 4J9F A; 1AWX A; 1YWP A; 2GNC A; 3NMZ C; 2DBK A; 2OI3 A; 2VKN A; 1E6H A; 3C0C A; 2GTJ A; 3H0H A; 1SEM A; 1ZUU A; 1FMK A; 3THK A; 1UEC A; 2J7I A; 4AG1 C; 2FG0 A; 5HCK A; 3O5Z A; 5GJW B; 4OMO A; 1VYV A; 2E5K A; 3VS2 A; 1A0N B; 1B3Q A; 2C0O A; 2LJ0 A; 2EQI A; 3R6N A; 4CC4 B; 5FW9 A; 2O9S A; 3CQT A; 2J6O A; 2YSQ A; 1QLY A; 2SRC A; 3U23 A; 2CH4 A; 2DYB A; 5IXF A; 1GCP A; 2ABL A; 1K0X A; 2OJ2 A; 1M30 A; 2EBP A; 2RPN A; 5FWB A; 3EG1 A; 2JS2 A; 2KEA A; 2DF6 A; 2BTT A; 2D0N A; 3A98 A; 4JZ3 A; 4ZNX A; 2O9V A; 2RQU A; 2L2P A; 2RMO A; 2KRN A; 2L3P A; 4HVU A; 3M0P A; 4JJD A; 1NYG A; 1M3C A; 2RQR A; 4ORZ A; 2K79 A; 2EVR A; 2K7A A; 1WXU A; 1W70 A; 1E7O A; 1I07 A; 2FRY A; 1WI7 A; 1X6B A; 4JJC A; 1GL5 A; 1H8K A; 1QKW A; 4ESR A; 1OEB A; 2DL7 A; 2GBQ A; 1RLQ C; 2DE0 X; 3ZL7 C; 2BZ8 A; 1GBR A; 2DJQ A; 4DEY A; 1W6X A; 1UE9 A; 2FEI A; 1K0S A; 3I5R A; 2EYZ A; 3FJ5 A; 3UF4 A; 2EGC A; 4E6R A; 2CT4 A; 1AOJ A; 1G83 A; 1AWO A; 3I35 A; 4WCI A; 4DEX A; 4X1V A; 2JXB A; 2HDA A; 4J9B A; 3UAT A; 1QCF A; 3VS3 A; 3TSZ A; 2FPD A; 1AEY A; 4AFS C; 3PVL A; 2LZ6 B; 4HXJ A; 1H3H A; 1X2Q A; 1WXT A; 2V1R A; 4GLM A; 2C0T A; 1ARK A; 2YUP A; 1NLP C; 3NGP A; 2X3X D; 2KXD A; 2DL4 A; 1JO8 A; 1Z9Z A; 4J9G A; 1Y57 A; 2JS0 A; 2K2M A; 1CKB A; 3EG3 A; 2LX7 A; 3REA B; 1TUC A; 1EFN A; 1KFZ A; 2J05 A; 2ROT A; 1ZLM A; 2LNH B; 2B86 A; 2CH4 W; 1M27 C; 1NG2 A; 2DRM A; 2J6F A; 2KRS A; 2YT6 A; 4A63 B; 4EIK A; 2KNB B; 1SSH A; 2FRW A; 2VWF A; 1WYX A; 4R0K A; 2KRO A; 1K76 A; 1NEB A; 5IXB A; 1K9A A; 2F2V A; 2YDL A; 2F2W A; 1YWO A; 1QWF A; 2RNA A; 2LCS A; 2AKL A; 2A36 A; 2ROL A; 2KYM A; 1NYF A; 4LUE A; 1W1F A; 4J9D A; 2CUB A; 2CDT A; 5I22 A; 1WIE A; 1SHF A; 1WDX A; 1S1N A; 4Z89 A; 1BB9 A; 1I0C A; 1T3S A; 1MV0 B; 2D8J A; 2LJ3 A; 1KSW A; 2ECZ A; 1BU1 A; 3SEM A; 5L23 A; 2EPD A; 3EHQ A; 3VRZ A; 1CKA A; 4HCK A; 4HVV A; 2GTO A; 1AZG B; 2OAW A; 2CSI A; 1OPK A; 1H92 A; 4CC3 A; 1LCK A; 3QWY A; 3TSW A; 3EHR A; 1FYN A; 1ZUY A; 1YP5 A; 1AWJ A; 2V1Q A; 1RLP C; 2F2X A; 2P4R A; 1JXO A; 1SPK A; 2ESW A; 1K1Z A; 1YCS B; 4JJB A; 1ZX6 A; 4OMM A; 1UHC A; 3PVQ A; 1GCQ C; 1G2B A; 2ED1 A; 3I9Q A; 1YNZ A; 2JM9 A; 2KT1 A; 2K3B A; 4RTY A; 3NPF A; 1VYU A; 1UTI A; 1J3T A; 1AWW A; 3EG0 A; 3H0F A; 4OMN A; 1E6G A; 2AK5 A; 3EG2 A; 1GFD A; 3M0U A; 4F14 A; 4F17 A; 2YUN A; 1N5Z A; 4J9C A; 1AVZ C; 1ZBJ A; 4LNP A; 5ECA A; 1BK2 A; 4Z88 A; 1M8M A; 2D1X A; 2DL5 A; 2EKH A; 4LUD A; 3VS7 A; 2KE9 A; 2FPF A; 4GBQ A; 5EC7 A; 4D8D A; 3I5S A; 2I0N A; 1UGV A; 1WFW A; 4CC7 A; 2ENM A; 1MV3 A; 3UA7 A; 2YUQ A; 1Y0M A; 2PNI A; 3M0R A; 2HBW A; 4IIO A; 1X2K A; 1ABO A; 2GQI A; 1M3A A; 3M0T A; 2KGT A; 2MCN A; 3EGU A; 2ED0 A; 2JMA A; 1JEG A; 3SHW A; 4Z8A A; 4RTT A; 2J6K A; 2L3S A; 2D8H A; 2RN8 A; 3GBQ A; 1JQQ A; 2EYX A; 2KRM A; 1U06 A; 2CRE A; 1TG0 A; 1HSQ A; 4HVW A; 3TVT A; 2FPE A; 2EYY A; 2W0Z A; 2DX1 A; 2CSQ A; 1WA7 A; 4RTX A; 2W10 A; 4AFQ C; 2DBM A; 2HSP A; 4OMQ A; 1UHF A; 1GCQ A; 1X27 A; 2JMC A; 4RTV A; 2HEQ A; 2L3Q A; 5IH2 A; 1X69 A; 1AZE A; 1PRL C; 2LQN A; 2VVK A; 1M3B A; 2XMF A; 2EYW A; 2A08 A; 1PKS A; 4JPB W; 1T0H A; 4AFU C; 2EGE A; 2QDL A; 2O88 A; 4F16 A; 4Y92 A; 5I11 A; 1SRM A; 1ZUK A; 2AKK A; 1I1J A; 1UDL A; 2O31 A; 4J9I A; 3VS5 A; 2JM8 A; 3QWX X; 1WXB A; 1OPL A; 2KYB A; 4RTW A; 2C0I A; 1UJY A; 1PHT A; 3UA6 A; 5IHK A; 2DVJ A; 4M4Z A; 2K9G A; 2GGR A; 1U5S A; 2IIM A; 1K4U S; 1HD3 A; 1X43 A; 1AD5 A; 2RQT A; 2CT3 A; 1UUE A; 2MIO A; 2LP5 A; 2DNU A; 3ULR B; 1GBQ A; 2LMJ A; 2PTK A; 1NEG A; 3VRY A; 4K11 A; 4IIM A; 2RQW A; 3H0I A; 3VS1 A; 1NM7 A; 1XOV A; 3REB B; 1JXM A; 4LN2 A; 3IQL A; 3H41 A; 2M51 A; 4KRT A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3NHN A; 3CCE A; 2CZ0 B; 5GAO r; 4JRK A; 3OQ5 A; 3CD6 T; 3P8H A; 5GAN 6; 2H3J A; 2DL3 A; 3LWH A; 3JB9 F; 1HK9 A; 3V7R A; 3PMT A; 2XDD A; 4JZ4 A; 1JJ2 P; 1LOJ A; 1K8A R; 4A4F A; 1PCX A; 5IHI A; 3BW1 A; 3A1P A; 3V8J A; 4L6V 5; 5CK9 A; 2RF0 A; 2DL8 A; 1YJN A; 2RJC A; 2AZV A; 1M2V A; 4M77 F; 2EQK A; 2HQX A; 1FWZ A; 1GFC A; 1TUD A; 3TQ7 P; 4OML A; 2SEM A; 4PK4 A; 4RUG A; 3A5Z B; 2ZAE A; 1U3O A; 3CCJ A; 1S72 Q; 1IGQ A; 1EX4 A; 4N0A C; 2H8H A; 2AHJ B; 2EJF A; 1QVF S; 1ZHI A; 1Q81 R; 1WX6 A; 5IHN A; 3LLR A; 2LVM A; 4XTW A; 2EQU A; 2QTV A; 2VGM A; 4J6Y A; 5KCH A; 1CSK A; 2DIL A; 2JT4 A; 2X3W D; 3I55 T; 3GIB A; 1N9R A; 2LJ1 A; 2R57 A; 2F5K A; 4J83 A; 1PC0 A; 1BI1 A; 2GNC A; 3OYD A; 1NZ9 A; 2VKN A; 4IUT A; 1E6H A; 4GY5 A; 3C4S A; 3OYE A; 2DK3 A; 1MHN A; 1M8V A; 1Q95 G; 4PJO D; 4BD3 A; 2MYS A; 5L8R E; 1ZSZ B; 3I56 Q; 1B34 A; 2KVQ G; 4KGZ B; 2HAX A; 4ME7 A; 2K3Y A; 1Q86 C; 4JS5 A; 1BKB A; 1B3Q A; 2LJ0 A; 3R6N A; 2O9S A; 5GAO p; 4R55 A; 4J6X A; 2BE9 B; 1M1F A; 3FEO A; 2DTI A; 2YSQ A; 1VQP T; 3U23 A; 2YRD A; 2DYB A; 1K0X A; 2OJ2 A; 1YJW Q; 2RPN A; 3EG1 A; 1VQ4 T; 8ATC B; 4QQG A; 2JJ9 A; 3A8O B; 5CQX A; 4FYV B; 2DF6 A; 4XU3 A; 4X9C A; 5I2M A; 3VJP A; 4ZNX A; 1AT1 B; 1KQS P; 4DOV A; 5GAO n; 2L2P A; 1MNE A; 3V8K A; 1YJ9 Q; 1W2B A; 5D6X A; 2L3P A; 3CCV Q; 1DJ7 B; 3HSB A; 4MMK A; 1WHH A; 2ZPF B; 3OW2 A; 4PJO G; 1N8R C; 2K7A A; 2RO0 A; 1X6B A; 2D9T A; 4JJC A; 2E65 A; 2F69 A; 3CD6 Q; 4QVZ A; 2VYT A; 4BDY A; 5LJ5 h; 1RLQ C; 2DE0 X; 1KD1 U; 2BZ8 A; 1IZ6 A; 4DEY A; 4FM4 B; 1W6X A; 1PG5 B; 2ZPH B; 1OQK A; 2MPX C; 3I5R A; 3FJ5 A; 2XI9 A; 1RAI B; 1K9M U; 2X4J A; 4E6R A; 2CT4 A; 3C12 A; 1G83 A; 1EZZ B; 3I35 A; 4A54 A; 4DEX A; 4X1V A; 3HRU A; 1QCF A; 1AEY A; 1QP3 A; 1TH7 A; 3GNG A; 1W4S A; 2QQ9 A; 3QJY A; 2COZ A; 1OUL A; 4GLM A; 1NLP C; 3NGP A; 2L89 A; 5KYX B; 5D6Y A; 2KXD A; 1YHQ A; 1JO8 A; 1Z9Z A; 2E10 A; 1Y57 A; 2JS0 A; 5C0M A; 5I21 A; 2X4Y A; 3SDZ A; 1FMW A; 4M7D D; 2XG8 D; 4DBQ A; 2EKO A; 2FZK B; 4PJO F; 3NTH A; 3REA B; 3Q1J A; 1XJW B; 1M27 C; 3KBG A; 2CS7 A; 3CBO A; 1NG2 A; 2KRS A; 1X6O A; 1RAD B; 1K73 C; 4F7U G; 1SG5 A; 2DD4 A; 2K5L A; 1Q82 U; 2JTF A; 1G5V A; 3HRS A; 2VWF A; 2YRV A; 2KRO A; 3I55 Q; 5IXB A; 1K9A A; 1UEB A; 2DJZ A; 2RK2 A; 3CCM T; 4GLK A; 4RKU E; 3H9N A; 5DLO A; 2AKL A; 2A36 A; 1W1F A; 4C8Q D; 3JCM b; 1WQW A; 5I22 A; 5GAM e; 2KK4 A; 1SHF A; 1WDX A; 3CCS A; 2V26 A; 5GAM f; 5A2Q E; 3G6E T; 2PVD B; 5GMK e; 2KDS A; 5CKH A; 2YLC A; 1VQM T; 2ECZ A; 5GAO l; 4LDU A; 3SEM A; 5L23 A; 2EPD A; 5KYY A; 4M7D G; 2HL5 C; 1TOV A; 1BCM A; 2VUB A; 5I2S A; 5KYW B; 1H92 A; 1OPK A; 4CC3 A; 3JSC A; 1FYN A; 1ZUY A; 1VQP Q; 1WQ7 A; 2V1Q A; 2RJF A; 1TWB A; 1SPK A; 1QVG S; 2IVW A; 1YCS B; 3OYF A; 1WHM A; 3QDR B; 4IUQ A; 1VQ4 Q; 1Q7Y C; 3EFR A; 1YNZ A; 1M2O A; 3GNF B; 3EGD A; 2KT1 A; 2K3B A; 5FU7 C; 4RTY A; 3O8V A; 3JCM P; 3L2W A; 4BI4 A; 4M75 E; 1AWW A; 4NS5 A; 3CPF A; 5KYN A; 2AK5 A; 4C92 A; 2ATC B; 3OYG A; 2YUN A; 3A8M B; 4J9C A; 1AVZ C; 4KT0 E; 5HY6 A; 5GAN 5; 2LTO A; 2QQS A; 3QZ5 B; 1KQ2 A; 1M8M A; 1VQK A; 2QK0 A; 2O4X A; 2K3X A; 2KE9 A; 4GBQ A; 5EC7 A; 3CCE T; 4CC7 A; 1N8R U; 4DA4 A; 4M7D F; 2RHI A; 1R77 A; 2LCL A; 2HBW A; 4HCB A; 1X2K A; 1ABO A; 1U8R A; 4FW1 A; 4OGC A; 2MCN A; 1LJO A; 2EJG A; 3C95 A; 3SHW A; 4RTT A; 2FB7 A; 1VQN A; 4B9X A; 1D0Y A; 1QP2 A; 3PNW C; 4PJL A; 2DXC A; 2NUP A; 2RHU A; 4PJN A; 1JQQ A; 3BE3 A; 2AT1 B; 2YWW A; 4C8Q F; 2D6F A; 2W0Z A; 4FYY B; 4ZGD B; 1WA7 A; 3CCJ T; 3HP9 A; 3LGL A; 4UC4 A; 3CC7 A; 2M02 A; 4RTV A; 1W2B P; 3MEV A; 3OYJ A; 2HEQ A; 3MO8 A; 2MF2 A; 3QO3 A; 5GAM h; 3NTK A; 1YIJ A; 5GMK h; 2YHT A; 1TSF A; 2PQW A; 4M78 B; 2C06 A; 3BDU A; 1VQP A; 2LQN A; 2IG0 A; 2VVK A; 3CXC S; 1M3B A; 2EYW A; 5GMK m; 3OYH A; 1T0H A; 4AFU C; 3CCM Q; 1SKU B; 2EGE A; 3LH0 A; 2QI2 A; 4Y92 A; 1NBE B; 3HHT B; 2FL7 A; 4MML A; 5I11 A; 1RAF B; 1I1J A; 1UDL A; 2VV5 A; 2O31 A; 3G6E Q; 2JM8 A; 2LC4 A; 3QWX X; 1TS9 A; 1OPL A; 2KYB A; 3L2V A; 1VQM Q; 1PHT A; 4M75 C; 4BE1 A; 4M4Z A; 1RAH B; 3TU4 K; 2K9G A; 2M1H A; 4FCY A; 3QKJ A; 3EGX B; 3DB4 A; 1K4U S; 2K4Y A; 3QYH B; 2RQT A; 3M4G A; 1UUE A; 2XK0 A; 1WPY A; 4RCC A; 3ULR B; 1KD1 R; 3OSV A; 1NEG A; 3VRY A; 1JB0 E; 2XU8 A; 2VXF A; 3CCL A; 1HYO A; 2EQM A; 3VS1 A; 2DZC A; 1NM7 A; 1XOV A; 3REB B; 3RMS A; 1UB4 A; 1TXQ A; 1K9M R; 2M51 A; 4BY6 C; 2F5T X; 2FZG B; 3VS6 A; 4C0Z A; 2XID A; 2BIV A; 4CC2 A; 3KFV A; 1ZSZ A; 4PFZ A; 2JVV A; 2EGA A; 1XNI A; 1MUZ A; 2J06 A; 2PVG B; 2DYI A; 2JW4 A; 1HJD A; 4X9D A; 4FSS A; 1SRL A; 3CCE Q; 1IGU A; 2DXB A; 3M56 A; 4A4E A; 3CCR A; 2DMO A; 3PE0 A; 4AG2 C; 1PD1 A; 1KJW A; 3CEY A; 1QWE A; 4J9E A; 2NWM A; 3RNJ A; 5LJ3 e; 3OYA A; 1G3S A; 4L5G A; 5LJ3 f; 2BUD A; 2E6N A; 2MOX A; 4FYW B; 3VS4 A; 2KR3 A; 3MPU B; 3ZFJ A; 2EFI A; 5GMK i; 2CUD A; 2L0A A; 3V7C A; 2RI5 A; 4HA8 A; 4BE0 A; 4AT1 B; 4M77 B; 2L8D A; 4QT7 A; 1ZA2 B; 3DB3 A; 2DM1 A; 2JTE A; 2EIF A; 1V29 B; 3JB9 J; 2KXC A; 1ZSZ C; 2OX7 A; 2JN0 A; 2XD0 A; 3X28 B; 5KH6 A; 4OB0 B; 1PNJ A; 2CKK A; 1U1S A; 4EMK C; 4XK8 E; 2KT8 A; 4NL2 A; 1YHQ T; 2AZS A; 1I8F A; 3MCA B; 1M1K U; 3M54 A; 1ABQ A; 4FT2 A; 3EFO B; 3CCJ Q; 3FIF A; 4E2F B; 1X6G A; 5GAM j; 1C0M A; 1R8O B; 5GMK j; 4J9F A; 5GAN e; 2QQA A; 3JCM Q; 5GAN f; 2DBK A; 2OI3 A; 3J80 E; 2ZPG B; 1G3T A; 2D0Q B; 4KUL A; 4TVR A; 4ANJ A; 4KUD K; 2GTJ A; 3J81 E; 3RUX A; 1FMK A; 4J6W A; 1Y71 A; 2ZCF B; 3THK A; 2J7I A; 5HCK A; 3PIO A; 4E7J A; 1C1A A; 5KYX A; 4LDW A; 5GJW B; 5GAN d; 2E5K A; 3E9G A; 5GAN 8; 1UGS B; 3HFO A; 4CC4 B; 2KMT A; 1VIE A; 5CVI A; 1KQ1 A; 1ZBX A; 3CCS T; 2HZY A; 2DD5 A; 4E7H A; 5IXF A; 2E41 A; 2EBP A; 1QVP A; 2JS2 A; 4ZTJ A; 4VUB A; 2FHD A; 4C92 D; 1PSE A; 1N8R R; 3R6O A; 2BTT A; 2DKG A; 2O9V A; 4IUV A; 2RMO A; 4N0A A; 4M75 B; 4LD9 K; 3BFM A; 1O75 A; 4ORZ A; 4BB7 A; 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