The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
7
|
sequence length |
79
|
structure length |
79
|
Chain Sequence |
GSSGSSGRLCKALYSFQARQDDELNLEKGDIVIIHEKKEEGWWFGSLNGKKGHFPAAYVEELPSNAGNTATKASGPSSG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution structure of the SH3 domain of human Nostrin
rcsb |
| molecule keywords |
Nostrin
|
| molecule tags |
Protein transport
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
7
|
| structure length |
79
|
| sequence length |
79
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-04-06 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF14604 | SH3_9 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2CT3 A; 1X69 A; 1WXB A; 1AWX A; 1GRI A; 2EYX A; 1T0H A; 2RF0 A; 1J3T A; 1K9A A; 1WFW A; 4CC4 B; 1I1J A; 1BU1 A; 1X2Q A; 2HSP A; 1FYN A; 1VYT A; 4JZ4 A; 2GTJ A; 3M0Q A; 1I0C A; 2LMJ A; 1V1C A; 1GCQ C; 3A98 A; 2W0Z A; 3VS6 A; 2A37 A; 4AFS C; 2RQT A; 2BTT A; 2DF6 A; 2KGT A; 1WA7 A; 2OAW A; 1AOJ A; 4AG2 C; 2YDL A; 2SRC A; 3PVQ A; 1SSH A; 4GLM A; 2FRW A; 1YCS B; 2NUZ A; 1AZE A; 2FPF A; 4DEY A; 1ZUU A; 1T3S A; 5IHK A; 4JJC A; 3UF4 A; 4JZ3 A; 1X6G A; 2RNA A; 4ORZ A; 1PWT A; 1ZBJ A; 2JMA A; 1CSK A; 4LE9 A; 1K0X A; 2K3B A; 2KXC A; 5GJV B; 4K11 A; 1AWJ A; 2J05 A; 2DVJ A; 5I11 A; 4JPB W; 2FPE A; 4J9H A; 2FPD A; 4F14 A; 1OEB A; 2LJ1 A; 2GNC A; 4OML A; 1M3C A; 2KE9 A; 3M0P A; 2K6D A; 2CH4 W; 2L3P A; 4QT7 A; 1Y0M A; 1QLY A; 2EYY A; 2LQN A; 2J6K A; 1Z9Q A; 2ECZ A; 1SRL A; 4ZNX A; 2DRM A; 4JJB A; 2K79 A; 1JXM A; 1JQQ A; 2O88 A; 4OMO A; 1WXT A; 2FEI A; 2ED0 A; 2DRK A; 1KIK A; 2DE0 X; 2NWM A; 3H0I A; 2GTO A; 2FRY A; 3GBQ A; 1NLP C; 2P4R A; 1CKA A; 5FW9 A; 2L3Q A; 4IIM A; 3U23 A; 3NPF A; 1NYF A; 4CC3 A; 2DNU A; 1NEG A; 2EBP A; 1K0S A; 1TG0 A; 1KJW A; 4RTX A; 1K76 A; 1AD5 A; 3REA B; 1AWO A; 1W6X A; 4X1V A; 1OOT A; 2DA9 A; 2C0I A; 3EGU A; 1OPK A; 1GFD A; 2ENM A; 3EG2 A; 4OMM A; 1CKB A; 4R0K A; 2C0O A; 1MV3 A; 1E6H A; 1T3L A; 2O9V A; 3TVT A; 2YUQ A; 2DL5 A; 1WYX A; 1X27 A; 2KEA A; 2KBT A; 2D8J A; 1ZUK A; 2LQW A; 4J9C A; 1M30 A; 2ED1 A; 5HCK A; 4E6R A; 4M4Z A; 2O31 A; 3M0R A; 1UG1 A; 2QDL A; 1T0J A; 3I5S A; 2RQU A; 2F2X A; 4AFZ C; 4F17 A; 1X2K A; 1SPK A; 3EHQ A; 1X43 A; 1GFC A; 1LCK A; 1W1F A; 4J9G A; 4LNP A; 2KRS A; 2JM8 A; 1G83 A; 2L0A A; 2HBW A; 4OMQ A; 2I0N A; 4J9D A; 4RTU A; 1NG2 A; 1RLP C; 2JT4 A; 1AVZ C; 3NHN A; 2CRE A; 1NEB A; 5I22 A; 3EG0 A; 2EGE A; 1UHF A; 2J6F A; 2DBM A; 1VYV A; 2PZ1 A; 1QKW A; 3THK A; 1S1N A; 1XOV A; 1KSW A; 1M27 C; 3H0F A; 2K7A A; 4Z8A A; 1SHF A; 2KYB A; 4Z88 A; 1ARK A; 2G6F X; 3PE0 A; 2O2O A; 3JV3 A; 1RI9 A; 3REB B; 4CC7 A; 3KFV A; 1UTI A; 4J9B A; 3M0S A; 1TUD A; 2E5K A; 1ZLM A; 4IIO A; 1BB9 A; 1E7O A; 2KRN A; 1SRM A; 2MCN A; 3QWY A; 1HSQ A; 1X6B A; 1VA7 A; 2H8H A; 1HD3 A; 1PRM C; 1Z9Z A; 4RTT A; 2J06 A; 1PNJ A; 2JW4 A; 2YUP A; 4OMN A; 1RUW A; 4Z89 A; 3VRZ A; 2RQV A; 4HVW A; 5IH2 A; 2RMO A; 2F2W A; 2L2P A; 2CSI A; 3I9Q A; 4J9F A; 1ZSG A; 2GGR A; 2LP5 A; 3ZL7 C; 2DL4 A; 4J9I A; 1UUE A; 2YT6 A; 4J9E A; 3RBB B; 2DJQ A; 1PRL C; 4WCI A; 1MUZ A; 1ABQ A; 2FG0 A; 2JS0 A; 1GBR A; 3LH5 A; 2DM1 A; 2OI3 A; 2LX7 A; 2K2M A; 2EW3 A; 2HEQ A; 2BZY A; 2EQI A; 1YWP A; 3PVL A; 4EIK A; 1YWO A; 2CT4 A; 1BBZ A; 2JTE A; 1B3Q A; 1W70 A; 2D0N A; 1BK2 A; 2K9G A; 1HJD A; 5IHI A; 2AZV A; 5FWC A; 2AK5 A; 3VRY A; 3VS0 A; 2F2V A; 4ESR A; 1WLP B; 1JXO A; 2A28 A; 4RUG A; 2EGA A; 2O9S A; 3TSZ A; 2DMO A; 2D8H A; 2LJ0 A; 2ROL A; 2RPN A; 2W10 A; 1ZUY A; 1U3O A; 1UDL A; 1M3B A; 3M0U A; 3EG3 A; 2KYM A; 1NYG A; 3O5Z A; 1YNZ A; 1PHT A; 2DBK A; 3UA7 A; 1VYU A; 3SHW A; 1M3A A; 1H92 A; 4OMP A; 1K1Z A; 2JXB A; 2KR3 A; 3TSW A; 1NLO C; 5GJW B; 1RLQ C; 3I5R A; 1QWE A; 3QWX X; 2XMF A; 2VVK A; 3VS4 A; 5EC7 A; 2C0T A; 4AG1 C; 3NGP A; 2VWF A; 1UFF A; 2B86 A; 4LUE A; 1JEG A; 1QKX A; 1QWF A; 4Y92 A; 2GQI A; 1WDX A; 1IO6 A; 4F16 A; 1ZX6 A; 1H8K A; 1SHG A; 2EKH A; 2DLP A; 2EVR A; 4RTZ A; 2IIM A; 1AZG B; 2LZ6 B; 3UAT A; 2A08 A; 2EGC A; 2RN8 A; 1EFN A; 2CDT A; 2EPD A; 2SEM A; 3EHR A; 1UHC A; 1ABO A; 1WXU A; 5IXF A; 2DIL A; 2KNB B; 2PTK A; 3M0T A; 4RTW A; 1UE9 A; 3CQT A; 1PKT A; 2JMC A; 4AFQ C; 2AKK A; 2PNI A; 4AFU C; 4FSS A; 1E6G A; 4GBQ A; 1WX6 A; 2DL8 A; 2AZS A; 2M0Y A; 1A0N B; 2ABL A; 2X3X D; 4D8K A; 1WIE A; 2AKL A; 4D8D A; 3H0H A; 2KXD A; 3VS5 A; 4RTV A; 1B07 A; 3VS2 A; 2DL7 A; 2KT8 A; 4JJD A; 5FWB A; 2YUN A; 2CH4 A; 2RQR A; 4HVU A; 2GBQ A; 4DEX A; 2V1R A; 3VS3 A; 1H3H A; 1UJY A; 1I07 A; 1WI7 A; 3EG1 A; 2KT1 A; 2X3W D; 3IQL A; 2RQW A; 1YN8 A; 1SEM A; 2YUO A; 5IXB A; 1GL5 A; 1AEY A; 1U5S A; 3C0C A; 2VKN A; 2MIO A; 2EYZ A; 2FO0 A; 2DYB A; 2M51 A; 5ECA A; 3ULR B; 1GBQ A; 2EYW A; 1AWW A; 4HVV A; 1G2B A; 2J7I A; 2OJ2 A; 4HCK A; 1K4U S; 1FMK A; 2CUB A; 3FJ5 A; 2JM9 A; 3UA6 A; 3RNJ A; 1N5Z A; 2ROT A; 4A63 B; 1PKS A; 1UJ0 A; 3NMZ C; 1Y57 A; 1JO8 A; 1TUC A; 1OPL A; 2BZ8 A; 1UGV A; 2KRM A; 4KRT A; 4LN2 A; 2CSQ A; 3I35 A; 2LJ3 A; 4CC2 A; 3R6N A; 2KRO A; 2V1Q A; 5L23 A; 2HCK A; 1OV3 A; 2DX1 A; 1KFZ A; 2A36 A; 3SEM A; 2HDA A; 4HXJ A; 1MV0 B; 2D1X A; 2LNH B; 2CUD A; 1M8M A; 2ESW A; 2L3S A; 5IHN A; 2JS2 A; 1QCF A; 1YP5 A; 4RTY A; 2J6O A; 1U06 A; 2YSQ A; 4LUD A; 2LCS A; 1GCP A; 3H41 A; 3VS1 A; 2DL3 A; 1NM7 A; 3VS7 A; 1GCQ A; 1UEC A; 2BZX A; 2MOX A; 1JU5 C; #chains in the Genus database with same CATH topology 4A4F A; 3QUI A; 1WXB A; 3OYD A; 2KVQ G; 4KGV B; 5KCH A; 1GRI A; 2EYX A; 2RF0 A; 1J3T A; 1K9A A; 1WFW A; 1Y96 B; 4HA8 A; 1I1J A; 1VQP Q; 4ATO A; 3OMG A; 3M0Q A; 1I0C A; 2LMJ A; 4HT8 A; 4PJO C; 2QQ9 A; 4PJO D; 2GFU A; 4IUV A; 4PJO B; 2OAW A; 2XG8 D; 1KQS S; 5GAM j; 3PFS A; 4M7D A; 2HL3 A; 1SSH A; 4GLM A; 3TQ7 P; 5GAN j; 2JOY A; 2FPF A; 4HT9 A; 4MDW A; 2O4X A; 1DJ7 B; 1QP2 A; 2NUT A; 3CCV T; 3UF4 A; 2RB6 A; 1M4Z A; 4LD6 A; 2RJD A; 1PWT A; 4C5I A; 2JMA A; 3P8B B; 1TH7 A; 4NL3 A; 4M7D C; 2KXC A; 5GJV B; 1AWJ A; 4M7D D; 1NPR A; 2FPE A; 4JPB W; 4F14 A; 1OEB A; 1I81 A; 3UT1 A; 4IKF A; 4M7D B; 4C0G A; 5DY9 A; 3KUF A; 4KH1 B; 2K6D A; 2CH4 W; 2O4X B; 3GPL A; 2PUK B; 3DKM A; 4IUQ A; 3EFO A; 4X9D A; 2J6K A; 1M1K R; 5GAN 4; 1JB0 E; 1RAC B; 2DYI A; 1SRL A; 4ZNX A; 3I56 T; 4JRQ A; 1M9S A; 2JJ9 A; 4PFZ A; 4KH0 B; 2KMT A; 1QVF P; 2WSC E; 2EIF A; 1KC8 U; 2IPO B; 1U1T A; 3UPU A; 2DRK A; 2P0K A; 4DBF A; 4M75 G; 5CCA A; 1VQ8 Q; 3GBQ A; 1Y7X A; 3EFO B; 3G4S T; 2DTO A; 4JS5 A; 2P4R A; 4RG2 A; 4LD9 K; 2DXC A; 3R6O A; 4RG8 A; 4LDY A; 3L2W A; 3U23 A; 4J6X A; 1M90 C; 3QJY A; 1OZ2 A; 3OS0 A; 2DNU A; 4XTV A; 4IUT A; 4BE0 A; 1VQ5 A; 1K76 A; 1W6X A; 2HQE A; 4X1V A; 3ZBD A; 2MWP A; 1WJR A; 2ENM A; 1G3S A; 2RHU A; 3AHU A; 3BDU A; 2L5Q A; 2FL7 A; 2D8J A; 4XQ3 A; 4J9C A; 1VQN A; 4JJN K; 4QW2 A; 4M78 A; 1IZ6 A; 2F2X A; 3WVE B; 1Q82 R; 1QVG P; 1JJ2 P; 4A4E A; 4RKU E; 4ZGE B; 3JCM b; 2VC8 A; 4BD3 A; 3HRS A; 5KE2 A; 4KBM B; 4J9G A; 2OTL A; 5KYN A; 3JCM W; 4F7U B; 3HHT B; 1ZA2 B; 3QHS A; 1G83 A; 4JUV A; 2HBP A; 2I0N A; 4J9D A; 4RTU A; 1NG2 A; 4M78 C; 4N0A C; 2QQS A; 2CRE A; 1C6V X; 1NEB A; 3E9F A; 4M78 D; 5I22 A; 3CCJ A; 9ATC B; 1YJ9 A; 1ZBX A; 4P5N A; 2EGE A; 2J6F A; 2P0P A; 4VUB A; 5CK9 A; 4QQD A; 2LX9 A; 2DKG A; 3M59 A; 3OYG A; 1QKW A; 1XOV A; 1AT1 B; 3M58 A; 1KSW A; 4F04 B; 1QVF A; 4Z8A A; 3X20 B; 2E6Z A; 1U1S A; 1Y07 A; 4ZGD B; 3CPW P; 1RI9 A; 5LJ3 d; 3H9N A; 4CC7 A; 4J9B A; 1TUD A; 3CCR Q; 1VQ9 T; 1BB9 A; 4FIB A; 3ER0 A; 3BFM A; 5GAN 3; 3OSV A; 2YUP A; 4PL6 A; 1M2O A; 4HVW A; 1FWZ A; 1FMV A; 5IH2 A; 2RMO A; 2F2W A; 1VOM A; 4LXC A; 4J9F A; 1OI1 A; 4BI4 A; 5LJ3 g; 4PLL A; 1K73 R; 4C92 G; 4M77 A; 3OYF A; 3L42 A; 2YT6 A; 2X35 A; 4WCI A; 2QEX T; 2JS0 A; 2E10 A; 3G71 T; 1JBM A; 4OB0 B; 2CS7 A; 2OI3 A; 4M7A A; 2HMA A; 1QVG A; 1JJ2 A; 2EW3 A; 2BZY A; 4M77 C; 4Q5W A; 1VQP A; 2COY A; 3CPF A; 3CCU T; 3PVL A; 1UGS B; 1YWO A; 1EIF A; 5LJ3 e; 1BBZ A; 4M7A C; 3GNF B; 1R8O B; 2E5Q A; 2AZV A; 3VRY A; 1ZSZ A; 1W2B P; 4FW1 A; 2F2V A; 1XJW B; 2K5F A; 2E3I A; 2FVU A; 1VIF A; 4E7I A; 5GMK l; 1TSF A; 2D8H A; 2RPN A; 2EQU A; 3CMA T; 2KYM A; 2H3J A; 1ZSZ C; 3JCM f; 5GAN 6; 5FU6 B; 2MYS A; 5FRO A; 3CPW A; 2DIQ A; 2R5A A; 1ZSZ B; 3SHW A; 1IB8 A; 1RAA B; 3MO8 A; 5CR2 A; 3QKJ A; 1Q86 C; 3MKD A; 1Q81 U; 4XTY A; 5KYU B; 3M57 A; 2B8A A; 4AG1 C; 1VQK Q; 2QA4 T; 3NGP A; 1JEG A; 2HKN A; 1YBY A; 1QKX A; 2P4T A; 5LJ3 h; 2GQI A; 2CZ6 B; 3G6E T; 2LVM A; 1PC0 A; 1VQ4 Q; 3HRU A; 4PNO A; 2LZ6 B; 5LJ5 j; 3DB3 A; 4MML A; 1VQ8 A; 3CCM Q; 5IXF A; 2DIL A; 3F70 A; 3C94 A; 3URG A; 3EGX A; 4AFQ C; 3MCA B; 1BIA A; 1Q7Y R; 3CCS T; 2AZS A; 3V7R A; 2M0Y A; 2CYZ B; 1VQO T; 1QCO A; 2AKL A; 1YIT T; 3SDZ A; 4XTW A; 4J8O A; 2M9U A; 4D8D A; 2RHI A; 1QVF S; 5KYX A; 2KXD A; 2P84 A; 1YI2 T; 1UGQ B; 2KT8 A; 1Q82 C; 4XTX A; 4JJD A; 5FWB A; 3JCM J; 1VQ7 T; 4LDU A; 5CKD A; 2YUN A; 1WJQ A; 1W2B A; 3EG1 A; 1WI7 A; 2X3W D; 2RQW A; 2YUO A; 5IXB A; 5M9O A; 4EPC A; 1PG5 B; 1P92 A; 5GAO r; 4PJN A; 2FO0 A; 5D6Y A; 5ECA A; 1X6O A; 4BDY A; 2EYW A; 3MP1 A; 3GIB A; 2J7I A; 4D6W A; 2OJ2 A; 5DM7 R; 4KGX B; 3OMC A; 1JRI A; 3FJP A; 4XU1 A; 1LPL A; 2QG9 B; 4M75 F; 2JM9 A; 3UA6 A; 3RNJ A; 4B9X A; 1N5Z A; 4A63 B; 1PKS A; 2DVE A; 3NMZ C; 1TUC A; 1OPL A; 3CEY A; 2V8I A; 2CSQ A; 1YJN T; 3C95 A; 2IG0 A; 2LJ3 A; 2L8D A; 3CCU Q; 1YIJ Q; 1KFZ A; 2A36 A; 4ELY C; 1QVG S; 4XAX B; 3JCM c; 3JB9 G; 4II1 A; 2LNH B; 1M8M A; 4QKU A; 5IHN A; 1QCF A; 3OBY A; 7AT1 B; 4C8Q G; 1U06 A; 3ZEH A; 4FYX B; 4OB1 B; 4LUD A; 2LCS A; 4C5G A; 3CC4 Q; 1GCP A; 3H41 A; 3JCM d; 4FSX A; 3CCR A; 1K73 C; 3VJP A; 3VKI A; 4BE1 A; 1KQ2 A; 1BYM A; 1Y71 A; 5DLQ E; 2WSF E; 3RIR A; 2YWW A; 1PSF A; 4CC4 B; 1K8A C; 1MGQ A; 3CC7 T; 1O9S A; 1OUL A; 1VYT A; 1I8F A; 5GAN 7; 3V7S A; 2GTJ A; 2EKO A; 4J7F A; 4FYY B; 3JCM g; 3CPW S; 2QYZ A; 2A37 A; 3WXM B; 4JLI A; 1VQM Q; 2RQT A; 1C1A A; 2DF6 A; 2A3L A; 2KGT A; 1WA7 A; 4C5E A; 2M16 A; 1VQL T; 3PVQ A; 2XDB A; 1X75 C; 3OYL A; 4E7H A; 2NUZ A; 1ZUU A; 5GAO p; 4J6W A; 5IHK A; 3JSC A; 4ORZ A; 1W4S A; 4PLI A; 2RJC A; 1K0X A; 1OX8 A; 4E7L A; 2K3B A; 4ZTF A; 1KG1 A; 3KXT A; 4PKC C; 4HCB A; 2J05 A; 1TXQ A; 5I11 A; 4J9H A; 1KD1 R; 2LJ1 A; 3JB9 I; 4QQ6 A; 3JCM e; 3OS1 A; 3J81 E; 1V29 B; 2DFU A; 1RAF B; 1SKU B; 1SSF A; 3CCL T; 5A0G A; 3M0P A; 2L3P A; 4QT7 A; 1QLY A; 4LDW A; 4WTO B; 2EYY A; 4EMK A; 8ATC B; 4PJO E; 1QP3 A; 3GP8 A; 3GLX A; 3FEO A; 2K5L A; 2RI3 A; 1D3B B; 4OMO A; 2ED0 A; 4EMK C; 1YHQ Q; 1G8X A; 1OU9 A; 4HCZ A; 4C92 F; 2OAU A; 2FRY A; 4O6J A; 2GFA A; 1UGR B; 2ZAE A; 1NLP C; 1CKA A; 5FW9 A; 4M7D E; 2NYS A; 1VQK A; 4IIM A; 1NYF A; 1N27 A; 3EH1 A; 2MPX C; 4KT0 E; 2YRC A; 1NEG A; 1QVP A; 3JCM h; 1KJW A; 3L2Q A; 3REA B; 1AWO A; 1WNL A; 4E7Z A; 2DA9 A; 1VQ4 A; 3RMS A; 1I4K 1; 1CKB A; 4OMF B; 3CCM A; 4MMK A; 3M5A A; 3MET A; 2ZPF B; 1QMC A; 1M2V B; 3EAE A; 2RHY A; 2KBT A; 1F1B B; 3GF5 A; 5CAI A; 4E7K A; 2A0F B; 4M4Z A; 4UC4 A; 2QDL A; 2VYT A; 3I5S A; 3V7C A; 1X2K A; 3VU3 C; 3QZ5 B; 5L8R E; 1IXD A; 3VUZ A; 1X43 A; 4A54 A; 1IHW A; 1LCK A; 2LCL A; 1W1F A; 3QJ6 A; 6AT1 B; 4R55 A; 2DEQ A; 3HFN A; 5LL6 S; 4LNP A; 3QXE B; 2CZ7 B; 4DBQ A; 2L0A A; 2ZPE B; 2XDD A; 4OMQ A; 4FYW B; 5C0M A; 1AVZ C; 4NS5 A; 3NHN A; 1D1C A; 4ME7 A; 3FLG A; 3CBM A; 2EJ9 A; 2G3R A; 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