The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
7
|
sequence length |
77
|
structure length |
77
|
Chain Sequence |
GSSGSSGQYFVALFDYQARTAEDLSFRAGDKLQVLDTSHEGWWLARHLEKKGTGLGQQLQGYIPSNYVAEDSGPSSG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution structure of the SH3 domain of Fyn-related kinase
rcsb |
| molecule tags |
Transferase
|
| source organism |
Mus musculus
|
| molecule keywords |
fyn-related kinase
|
| total genus |
7
|
| structure length |
77
|
| sequence length |
77
|
| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 2005-12-06 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2IIM A; 2FO0 A; 1PKT A; 1SRM A; 1X43 A; 2DE0 X; 1T3L A; 3UA6 A; 1TUD A; 1Y0M A; 2J06 A; 2LX7 A; 1AZE A; 5I11 A; 2GGR A; 1K76 A; 2CT3 A; 3UF4 A; 1KFZ A; 2LQN A; 1X2Q A; 3TVT A; 2H8H A; 1SRL A; 1RI9 A; 2ESW A; 1U06 A; 1SHF A; 2DRM A; 3I5S A; 1QKW A; 2O31 A; 1UFF A; 1AD5 A; 2CUD A; 4HCK A; 1HD3 A; 2MCN A; 2B86 A; 3VS4 A; 2KRN A; 2PNI A; 2EVR A; 5IHI A; 2XMF A; 3THK A; 2SRC A; 1GCQ A; 2DL4 A; 2M51 A; 2YDL A; 3H0I A; 4Z88 A; 2EQI A; 2RQU A; 4F14 A; 4D8K A; 3NMZ C; 4LNP A; 1LCK A; 2CSI A; 1AWX A; 2RQV A; 1NLP C; 2ROL A; 1KIK A; 4Y92 A; 2JMC A; 1AZG B; 2FEI A; 1SSH A; 3UAT A; 1HJD A; 4JJC A; 2JW4 A; 2KRS A; 1SEM A; 2DRK A; 2ED1 A; 1QCF A; 1NM7 A; 2OJ2 A; 2E5K A; 1UUE A; 4DEX A; 2J6O A; 2W0Z A; 2C0I A; 2EYZ A; 2C0T A; 4KRT A; 1G2B A; 2EYW A; 1N5Z A; 1JXM A; 2MOX A; 1Y57 A; 1GCP A; 2KRM A; 2JTE A; 1VA7 A; 1VYU A; 2DX1 A; 4IIM A; 1ZUK A; 1TG0 A; 1JU5 C; 2X3W D; 4RTT A; 1KSW A; 1QWF A; 1YWP A; 2AZS A; 2A28 A; 3H0F A; 1AWO A; 2LMJ A; 2OAW A; 2YT6 A; 4K11 A; 1UDL A; 2DLP A; 3RBB B; 3ZL7 C; 2RPN A; 2VWF A; 4Z89 A; 1VYV A; 4JZ3 A; 1X69 A; 1AOJ A; 5IXB A; 2GTO A; 1W6X A; 3EHQ A; 1M3A A; 1WI7 A; 1UGV A; 2DA9 A; 3O5Z A; 2JT4 A; 1WYX A; 1U5S A; 1M8M A; 2F2V A; 5I22 A; 2LQW A; 2EBP A; 3SEM A; 2CH4 W; 2I0N A; 1W1F A; 2M0Y A; 4RTU A; 5FWC A; 2GBQ A; 2JM9 A; 2K2M A; 2HSP A; 1AEY A; 2DNU A; 4AFZ C; 4RTV A; 1HSQ A; 2EPD A; 2RQW A; 1NEG A; 1SPK A; 2J7I A; 1AWW A; 1ABO A; 2RF0 A; 1MUZ A; 1ZUU A; 2EGA A; 1RUW A; 2BZY A; 1K0X A; 1M30 A; 2JXB A; 3VRZ A; 2RMO A; 2RNA A; 4M4Z A; 4AG1 C; 1UHF A; 2DJQ A; 1PNJ A; 1BB9 A; 2PZ1 A; 1XOV A; 2F2X A; 1OOT A; 1K1Z A; 2LJ1 A; 4LN2 A; 1QWE A; 2RQT A; 4A63 B; 1GL5 A; 2DL8 A; 2HDA A; 2L3Q A; 2KRO A; 5IH2 A; 2CT4 A; 5IHN A; 1IO6 A; 2A08 A; 4AFU C; 1RLP C; 2YUP A; 4GLM A; 2FPE A; 2V1R A; 2GTJ A; 3H0H A; 3NPF A; 4OMO A; 3KFV A; 1YP5 A; 2CSQ A; 2FG0 A; 2LJ3 A; 4QT7 A; 2AK5 A; 1WXT A; 1X2K A; 2L3S A; 2OI3 A; 2DBM A; 3VS2 A; 2D8H A; 1NG2 A; 1FMK A; 1PHT A; 4IIO A; 2LZ6 B; 1PRM C; 1G83 A; 2DVJ A; 2BZ8 A; 3EG3 A; 3TSZ A; 1MV3 A; 1H3H A; 1GCQ C; 1QLY A; 4J9E A; 4HVV A; 2J6K A; 4JJB A; 1WXB A; 2L3P A; 1WXU A; 2L2P A; 1ZLM A; 3UA7 A; 1CKA A; 2K79 A; 3LH5 A; 1FYN A; 2RQR A; 1X27 A; 2JS0 A; 3H41 A; 1A0N B; 3I5R A; 1M27 C; 3C0C A; 1JXO A; 1K4U S; 4OMP A; 1WDX A; 4RTY A; 2SEM A; 1GRI A; 2KE9 A; 4RUG A; 1YCS B; 2A36 A; 2ED0 A; 1M3B A; 1CSK A; 2CRE A; 2D8J A; 4JPB W; 4AFQ C; 4J9G A; 1W70 A; 1EFN A; 3NHN A; 1YN8 A; 1VYT A; 2FPF A; 4JZ4 A; 3PVQ A; 2KGT A; 2J6F A; 2DYB A; 1J3T A; 4CC7 A; 4F16 A; 2YUN A; 3VS0 A; 2KEA A; 2DIL A; 3I35 A; 1K0S A; 2GQI A; 1BU1 A; 5EC7 A; 2QDL A; 4RTZ A; 1I0C A; 2VVK A; 3VS3 A; 2DMO A; 4CC4 B; 2ECZ A; 4J9C A; 1S1N A; 2CUB A; 2K6D A; 3R6N A; 1E6G A; 1JEG A; 1BBZ A; 1WA7 A; 3TSW A; 2J05 A; 2LNH B; 2G6F X; 5IHK A; 3EG2 A; 4WCI A; 1RLQ C; 4OML A; 1NYF A; 4J9D A; 4LUE A; 4AFS C; 1QKX A; 3M0R A; 1ZX6 A; 3EHR A; 1K9A A; 2A37 A; 1Z9Q A; 2JMA A; 4R0K A; 2RN8 A; 3EGU A; 3FJ5 A; 1T0J A; 4J9F A; 3IQL A; 4HVW A; 4J9H A; 1JQQ A; 2DL5 A; 4OMM A; 2KR3 A; 1H8K A; 2EKH A; 1OPK A; 4Z8A A; 2KXC A; 2KYM A; 2O9S A; 4F17 A; 3PVL A; 2CH4 A; 1H92 A; 4FSS A; 1B07 A; 1WFW A; 3SHW A; 2EYY A; 2CDT A; 1NEB A; 2PTK A; 2ABL A; 1SHG A; 1GFD A; 2W10 A; 2DL7 A; 3A98 A; 4RTX A; 2K3B A; 5FW9 A; 2O9V A; 1AVZ C; 2AKK A; 3M0U A; 4ORZ A; 2C0O A; 1ZUY A; 1BK2 A; 1X6B A; 1ZSG A; 2D1X A; 3EG0 A; 4GBQ A; 5HCK A; 1WIE A; 3REA B; 1CKB A; 2JM8 A; 4HVU A; 3RNJ A; 1E6H A; 1NLO C; 2EGC A; 2K9G A; 4AG2 C; 2BZX A; 2DBK A; 2HEQ A; 2KBT A; 2EGE A; 4RTW A; 1UJY A; 5ECA A; 1ARK A; 3JV3 A; 1UE9 A; 4J9I A; 2ROT A; 4LUD A; 1UTI A; 3M0S A; 2AKL A; 2D0N A; 4EIK A; 4D8D A; 1X6G A; 3M0T A; 1WX6 A; 3U23 A; 2YUQ A; 1T0H A; 2YSQ A; 5IXF A; 2F2W A; 4ESR A; 1T3S A; 2EW3 A; 2HBW A; 4J9B A; 1I07 A; 1UG1 A; 5GJV B; 2KT8 A; 1OV3 A; 2LP5 A; 2MIO A; 1PWT A; 4OMN A; 1KJW A; 5L23 A; 2EYX A; 2O2O A; 1PRL C; 2DF6 A; 2FRW A; 3REB B; 1AWJ A; 2DM1 A; 1MV0 B; 4CC2 A; 3CQT A; 1ZBJ A; 3I9Q A; 3VS1 A; 2P4R A; 4X1V A; 1UEC A; 1UJ0 A; 1Z9Z A; 3M0P A; 2JS2 A; 2HCK A; 2GNC A; 4JJD A; 1JO8 A; 1E7O A; 1GFC A; 3QWX X; 5GJW B; 4E6R A; 1OEB A; 3GBQ A; 2NWM A; 1WLP B; 2LJ0 A; 2L0A A; 5FWB A; 1YWO A; 2KT1 A; 2FPD A; 3VS5 A; 1UHC A; 2V1Q A; 3VS7 A; 1I1J A; 4DEY A; 4CC3 A; 3NGP A; 1OPL A; 2AZV A; 2FRY A; 2KYB A; 2DL3 A; 1YNZ A; 2KNB B; 3M0Q A; 1B3Q A; 2LCS A; 3PE0 A; 1TUC A; 2K7A A; 2O88 A; 1GBR A; 3ULR B; 1NYG A; 1PKS A; 1V1C A; 1M3C A; 2NUZ A; 3EG1 A; 2ENM A; 4HXJ A; 2KXD A; 3QWY A; 2X3X D; 3VRY A; 1GBQ A; 2VKN A; 4OMQ A; 4LE9 A; 1U3O A; 3VS6 A; 4ZNX A; 2YUO A; 1ABQ A; 2BTT A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3AHU A; 1SRM A; 1X43 A; 2RJF A; 1M1K U; 3UA6 A; 1T3L A; 2EQK A; 5HY6 A; 2JJ9 A; 2LX7 A; 2E1H A; 2XHC A; 3QPH A; 2D6F A; 2LQN A; 2CZ0 B; 3DB4 A; 1U8R A; 4IUT A; 1RI9 A; 5GMK i; 4C8Q D; 4RG2 A; 4PNO A; 1SHF A; 1RI0 A; 2DRM A; 3I5S A; 1QKW A; 1YBY A; 1UFF A; 1BCM A; 4XQ3 A; 2CP2 A; 4C5I A; 2XKO C; 1HD3 A; 2NYS A; 4QQD A; 5GAN f; 2LCC A; 5IHI A; 3A5Z B; 1B7T A; 1GCQ A; 4PJN A; 3CPW S; 4JRK A; 3H0I A; 4HKE A; 1X75 C; 5KCO A; 2FB7 A; 1RAD B; 3NMZ C; 1LCK A; 4QVC A; 1ZHI A; 3LW5 E; 1AWX A; 4NL3 A; 1SSH A; 2QQ9 A; 1HJD A; 4JJC A; 4X34 A; 3CPW P; 4M7A A; 1SEM A; 1QCF A; 2OJ2 A; 2HMA A; 3S6W A; 1PD0 A; 3CCE T; 3MP8 A; 1YIT T; 2XID A; 2YRD A; 4KRT A; 1G2B A; 3I55 A; 5A0G A; 1Q81 C; 1JXM A; 1M2V B; 1YJ9 T; 5GAM d; 1WJQ A; 1K73 U; 4M75 E; 4KUL A; 3KXT A; 1SSF A; 2EYQ A; 1VQM T; 2LMJ A; 1YJN T; 1FMV A; 4MZT A; 4HT8 A; 2DLP A; 2OTL Q; 2RPN A; 2OAU A; 3DKM A; 4C92 B; 1X69 A; 4P5N A; 2DTI A; 2NUT B; 1YIJ Q; 3EG9 B; 3EGX B; 1UGV A; 3OS0 A; 2DA9 A; 2JT4 A; 1UGP B; 3DLM A; 1JJ2 S; 1QCN A; 2EBP A; 3SEM A; 3CC7 A; 2M0Y A; 5FWC A; 3SWN C; 3M57 A; 2JOY A; 3A1P A; 4EMK B; 4M77 G; 1DJ7 B; 3CD6 T; 5GAM g; 5IT9 E; 4E7H A; 1NEG A; 3A8G B; 2K3X A; 1NE8 A; 4C8Q F; 1MUZ A; 1ZUU A; 4BAC A; 5LJ3 d; 2MWO A; 2RM4 A; 3V7S A; 5GMK l; 3HP9 A; 2EGA A; 3OYB A; 4ZGJ B; 3VRZ A; 2RNA A; 1BB9 A; 2F2X A; 2QEX A; 4OMF B; 4TVR A; 4LN2 A; 1QWE A; 4ANJ A; 3C95 A; 2HZY A; 1GL5 A; 2FL7 A; 4M7A G; 3OYG A; 2QA4 Q; 2L3Q A; 1TS9 A; 2Y4Y A; 1HYO A; 3FB9 A; 3MEA A; 1BYM A; 5IH2 A; 4C5H A; 1YI2 Q; 5CVI A; 2YUP A; 4GLM A; 2V1R A; 2GTJ A; 1G3T A; 2CGH A; 2RO0 A; 2LJ3 A; 2XD0 A; 3CCS T; 5FRO A; 1UB4 A; 2E3H A; 4M77 B; 1X2K A; 5GAN 4; 1VQ5 Q; 4ZTF A; 5FLX E; 1PHT A; 2LZ6 B; 1PRM C; 1D0Z A; 4B9X A; 1VQN Q; 2DVJ A; 5LJ3 g; 3EG3 A; 4N4H A; 3SDZ A; 1QLY A; 4J9E A; 4ZGE B; 4XTX A; 4PFP A; 3JCM e; 3TU4 K; 2VXE A; 1IZ6 A; 1MMN A; 2J6K A; 5D6W A; 1VQ4 Q; 5CCA A; 3CCM Q; 2KMT A; 2K79 A; 1VIE A; 2JS0 A; 4KGZ B; 4EDU A; 3C0C A; 1JXO A; 4ZGD B; 2HKN A; 5KYU A; 1VQ6 T; 1Q7Y U; 4M7A B; 1QW1 A; 4YTL A; 3VKI A; 5A0L A; 1YCS B; 1FMW A; 1M3B A; 4OB2 B; 3VUB A; 1W70 A; 1ZSZ B; 3QJY A; 1VYT A; 5KYY A; 2K57 A; 3PVQ A; 4BD3 A; 3CCL T; 2J6F A; 1J3T A; 3GPL A; 4Z02 A; 2JVV A; 4LD9 K; 2RHZ A; 3OBW A; 3GOX A; 1OU9 A; 1IRX A; 2FZG B; 2GQI A; 1YJW A; 2QDL A; 4FW2 A; 3CCQ Q; 3QYH B; 2VVK A; 3VS3 A; 3OYY A; 3V7C A; 4F04 B; 1KC8 C; 4C92 C; 2RK1 A; 1WJS A; 5LJ5 j; 2I2L A; 4F7U G; 4J9C A; 2K6D A; 1JEG A; 1K9M U; 2J05 A; 3M56 A; 3BDL A; 3P8D A; 2E70 A; 2JTM A; 1BCO A; 5IHK A; 3KUF A; 5GAN 3; 4C0D C; 3CCR A; 1KQ1 A; 1QKX A; 3M0R A; 2KSS A; 2HSE B; 2BE7 D; 1K9A A; 4QKU A; 1VQK T; 2PU9 B; 1G8X A; 2RHU A; 3HSB A; 2RN8 A; 4MML A; 2P4T A; 2RHI A; 4M77 D; 2EKO A; 2FZC B; 2EKH A; 1IB8 A; 2B8A A; 2KXC A; 2KYM A; 1H92 A; 2E5Q A; 4F7U E; 2ZCF B; 1QVF S; 1Q86 C; 1VQ8 A; 1SHG A; 1GFD A; 1MMA A; 2W10 A; 2DL7 A; 3A98 A; 4MDX A; 5FW9 A; 4AMC A; 2AKK A; 4ZN1 A; 4DBR A; 2X51 A; 2O01 E; 2A7Y A; 1X6B A; 3EG0 A; 1QVF P; 4M78 E; 4J6W A; 1N8R C; 1Y96 B; 3M9Q A; 1NLO C; 2BZX A; 2HEQ A; 4M75 F; 4QVZ A; 4PFZ A; 2KQW A; 4DBF A; 1LOJ A; 1UJY A; 2D9T A; 2ZZD A; 2MMP A; 1M90 U; 1UTI A; 3O8V A; 4IUQ A; 4C8Q A; 3EGD B; 3X28 B; 2PVG B; 3G1J A; 2DXU A; 4II1 A; 2EQJ A; 3QSU A; 2LNV A; 4XU1 A; 3JCM Q; 2YXY A; 4OF1 A; 1I07 A; 5GMK e; 2E3I A; 4XTV A; 1OV3 A; 2LP5 A; 1RAB B; 4M7A C; 4OMN A; 2DF6 A; 3OYJ A; 2DM1 A; 5KYU B; 2X4X A; 1PG5 B; 2ZPI B; 3P8B B; 1M5Q 1; 1ZSZ C; 2P4R A; 3CCE A; 1YIT A; 4XK8 E; 1Z9Z A; 3M0P A; 1OI1 A; 1IGQ A; 3QWX X; 3GBQ A; 2NWM A; 1WLP B; 1WGS A; 3L2U A; 1YJ9 A; 3A8O B; 2DXT A; 3OSV A; 5FWB A; 1YWO A; 2EQM A; 1UHC A; 5IN1 A; 4V2S A; 4BI4 A; 4EPC A; 3X24 B; 1VQM A; 2P0Q A; 1OPL A; 4XTW A; 2KI7 A; 1OYX A; 2OTL T; 2HL3 A; 2MWP A; 2DL3 A; 2PVO B; 3M5A A; 3PMI A; 1YIJ T; 3JCM f; 3CC2 A; 1OUL A; 3CCJ Q; 1V1C A; 3EG1 A; 2ENM A; 2KXD A; 1NJI U; 1GBQ A; 3MHX A; 3CME A; 3G4S Q; 4M78 D; 4A4G A; 1GXI E; 3OMC A; 3HRS A; 5LJ3 h; 1D09 B; 2FO0 A; 1IHV A; 2E6Z A; 2DE0 X; 2X9H A; 1D3B B; 1WHG A; 3JRZ A; 3MCA B; 4FM4 B; 2J06 A; 3URG A; 2CZ7 B; 3OYA A; 1AZE A; 1VIF A; 2CT3 A; 3UF4 A; 3RKX A; 1KFZ A; 3QYG B; 4DBH A; 1X2Q A; 3VYG A; 4BY6 B; 2YWW A; 3TVT A; 3JAM E; 2H8H A; 1SRL A; 3CC4 Q; 4J8O A; 1U06 A; 1RAF B; 2FYK A; 4E47 A; 2WSE E; 2KDS A; 3VU3 C; 2QA4 T; 4LDX A; 2CUD A; 1M8V A; 4HCK A; 4BI3 A; 1YI2 T; 3VS4 A; 4PJO E; 2PNI A; 2EVR A; 4E7J A; 4M7D E; 3HHT B; 5GAM e; 2M51 A; 3CCS A; 2YDL A; 1VQ5 T; 3EAE A; 1XTD A; 3G6E Q; 1MHN A; 3HKS A; 1VQN T; 1V76 A; 5GAO l; 1NLP C; 2ROL A; 1D0X A; 4Y92 A; 1AZG B; 2FEI A; 3CCV Q; 3BW1 A; 2GCX A; 5A0D A; 2JW4 A; 2QGF B; 1QVG S; 1M1K R; 1VQ4 T; 3CCM T; 2DRK A; 4GLK A; 4RKU E; 1OZ2 A; 1NM7 A; 2E5K A; 2RI2 A; 2JN0 A; 2LT4 A; 4DEX A; 1M2V A; 3CEY A; 2W0Z A; 2P84 A; 1VQ6 A; 4E7S A; 2C0I A; 2PUO B; 2K2V A; 2EYW A; 2QQR A; 2HQH A; 4C0G A; 1MMD A; 3HFO A; 4F7U F; 1VYU A; 3CCL A; 2NUT A; 1QWF A; 1YWP A; 5CKH A; 2AZS A; 2A28 A; 3H0F A; 3CXC P; 3EG9 A; 1VQL Q; 1M1G A; 4LXC A; 4FIB A; 1RAE B; 2F5K A; 4XTU A; 2YT6 A; 4FW1 A; 5J3B A; 3CCQ T; 1UDL A; 3ZL7 C; 2QDY B; 2VWF A; 4JZ3 A; 1OZ3 A; 3PT9 A; 2MI6 A; 5IXB A; 1VQ7 Q; 2RK2 A; 3L2Z A; 3NFC A; 4KT0 E; 4M78 F; 4EMK A; 1WHK A; 1KQ2 A; 5LJ5 e; 1WYX A; 1M8M A; 5I22 A; 3NTK A; 3PGG A; 1W1F A; 2JM9 A; 2K2M A; 2HSP A; 1AEY A; 1TU0 B; 2CP6 A; 4KGV B; 3X20 B; 3LX7 A; 3ZFJ A; 4E2F B; 1VQK A; 2EPD A; 2RQW A; 5IAY A; 4PJO D; 2J7I A; 1AWW A; 3WVD B; 2KK4 A; 2K5F A; 5FU7 B; 4QVD A; 2COZ A; 3CCU Q; 3PIP A; 3M59 A; 3A8L B; 4R56 A; 1M30 A; 5J39 A; 1K73 R; 2RMO A; 4M4Z A; 2PZ1 A; 4BY6 C; 2KAF A; 1OOT A; 2QXF A; 3L2W A; 4E7Z A; 4A63 B; 2LTO A; 3CPF A; 4B9W A; 2DL8 A; 1ZA1 B; 2QTX A; 5GAN d; 4M77 A; 1UGQ B; 1TWB A; 2E4H A; 3CPW A; 2CT4 A; 1KD1 U; 2R58 A; 3NPF A; 2JNG A; 1YP5 A; 2QTV A; 4O6J A; 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