The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
5
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sequence length |
80
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structure length |
80
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Chain Sequence |
GSSGSSGATSYMTCSAYQKVQDSEISFPAGVEVQVLEKQESGWWYVRFGELEGWAPSHYLVLDENEQPDPSGKESGPSSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution structures of the SH3 domain of human KIAA0418
rcsb |
| molecule tags |
Signaling protein
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| molecule keywords |
SH3 and PX domain-containing protein 2A
|
| total genus |
5
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| structure length |
80
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| sequence length |
80
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-03-23 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4HVU A; 2KXD A; 3TVT A; 1TG0 A; 1Z9Z A; 1AWX A; 2DYB A; 1W6X A; 4F14 A; 3NGP A; 2YUQ A; 2EVR A; 2A36 A; 1I07 A; 2CH4 A; 2GTJ A; 2DL3 A; 4F17 A; 1K76 A; 1UJY A; 2KYB A; 2EYY A; 1UJ0 A; 2AZS A; 1SRL A; 2MCN A; 1GL5 A; 4LUE A; 1WXU A; 4LNP A; 4CC7 A; 2FPE A; 3UF4 A; 2RNA A; 2RF0 A; 1OV3 A; 1JQQ A; 1HSQ A; 2O9S A; 1X27 A; 1KJW A; 2QDL A; 1YCS B; 4AFZ C; 3VS2 A; 1YNZ A; 2E5K A; 1RLQ C; 1I1J A; 5FWC A; 3VRZ A; 3M0R A; 3IQL A; 4K11 A; 3TSW A; 1A0N B; 1E7O A; 2FRW A; 3UA7 A; 3PE0 A; 1AVZ C; 1EFN A; 2CH4 W; 2YSQ A; 2F2V A; 4ESR A; 2J6F A; 1NM7 A; 2FO0 A; 1WI7 A; 2VVK A; 1UG1 A; 3QWY A; 4CC4 B; 1AZG B; 1M27 C; 2PZ1 A; 2YT6 A; 2CT4 A; 3M0Q A; 1UHC A; 2BZ8 A; 1NG2 A; 4IIO A; 2GTO A; 1B07 A; 1WA7 A; 3LH5 A; 1VYV A; 2ECZ A; 1AEY A; 2FEI A; 3VS5 A; 2LJ0 A; 2LJ3 A; 4J9H A; 2G6F X; 2KNB B; 4JJB A; 2CRE A; 3H0F A; 2BTT A; 3VS6 A; 2EQI A; 2KGT A; 3KFV A; 2C0T A; 5IXF A; 2L0A A; 2O31 A; 3SEM A; 1GRI A; 2V1R A; 3ULR B; 1RLP C; 1T3L A; 2W0Z A; 1JEG A; 3VS7 A; 2EW3 A; 5GJV B; 1H92 A; 1RUW A; 3EG1 A; 3EHR A; 4AG1 C; 3EG2 A; 1W70 A; 1T3S A; 4JZ4 A; 1TUC A; 5EC7 A; 2XMF A; 4AFU C; 2P4R A; 1NYF A; 2DRK A; 1CKA A; 3CQT A; 2OAW A; 1UHF A; 1OPK A; 3REB B; 2KXC A; 4A63 B; 1GCQ C; 2SRC A; 1ZBJ A; 2DNU A; 2KYM A; 1H8K A; 4RTV A; 4HVW A; 1GBR A; 3U23 A; 4ORZ A; 2KRS A; 2LQW A; 1Y57 A; 1WXT A; 2KRO A; 1WYX A; 1JO8 A; 3I35 A; 3EG3 A; 3VS0 A; 4DEX A; 1IO6 A; 5FWB A; 2D1X A; 2PTK A; 2DL4 A; 1GBQ A; 3EHQ A; 2JXB A; 2OJ2 A; 4AFQ C; 2IIM A; 1LCK A; 2HEQ A; 1UUE A; 2YDL A; 2RQW A; 3M0S A; 2HCK A; 2X3X D; 3NHN A; 3R6N A; 1RI9 A; 1YP5 A; 4OMO A; 2FG0 A; 4ZNX A; 2D0N A; 1X2K A; 2LX7 A; 2I0N A; 4Z8A A; 2DL5 A; 2LP5 A; 4E6R A; 2L3P A; 1X2Q A; 1I0C A; 2M51 A; 2GBQ A; 1K1Z A; 1U3O A; 1VA7 A; 1WFW A; 3TSZ A; 2F2W A; 4DEY A; 4X1V A; 2L3S A; 1AOJ A; 2DX1 A; 2LQN A; 1ZLM A; 1CKB A; 4CC3 A; 1JXO A; 2RPN A; 2M0Y A; 1X6B A; 1QCF A; 4JJC A; 1AWJ A; 1WXB A; 1U06 A; 2RMO A; 1CSK A; 3I5R A; 4AG2 C; 3M0P A; 1M8M A; 5IH2 A; 1PNJ A; 2JW4 A; 2YUN A; 2J05 A; 2RQU A; 1M3B A; 1SSH A; 5ECA A; 4JPB W; 1SPK A; 2DJQ A; 3RNJ A; 5I11 A; 1J3T A; 1SEM A; 2CUD A; 1V1C A; 2KEA A; 4M4Z A; 1U5S A; 1UE9 A; 1QKW A; 4J9F A; 1PRL C; 2JM9 A; 2JS0 A; 1SHF A; 2KT1 A; 2BZX A; 1VYT A; 1QLY A; 2A08 A; 4GBQ A; 5GJW B; 1WX6 A; 1NEB A; 2J6O A; 2CSI A; 3PVQ A; 4J9B A; 2X3W D; 1B3Q A; 2ROT A; 1UDL A; 2FRY A; 4RTY A; 1W1F A; 4HXJ A; 3NPF A; 3EGU A; 1ZUY A; 3M0U A; 4OML A; 2C0I A; 2J06 A; 1X6G A; 1PKS A; 2DM1 A; 3H0I A; 3RBB B; 1MUZ A; 3M0T A; 2AK5 A; 1S1N A; 4LE9 A; 1MV0 B; 2ED1 A; 1KFZ A; 1UGV A; 2YUO A; 2F2X A; 1AD5 A; 2DBK A; 4EIK A; 3H0H A; 1TUD A; 1ZX6 A; 2V1Q A; 4RTZ A; 2HDA A; 1Y0M A; 5IHN A; 2CSQ A; 2JMA A; 1OEB A; 4RTW A; 2EGC A; 2L3Q A; 1G83 A; 4RUG A; 2RQR A; 1ARK A; 4Z89 A; 2K79 A; 2J6K A; 2CUB A; 1AWW A; 2DL7 A; 4HVV A; 3REA B; 1FMK A; 2D8H A; 4J9E A; 3UAT A; 1G2B A; 4J9I A; 3A98 A; 1YWP A; 1QKX A; 1SRM A; 1T0J A; 4J9G A; 4R0K A; 3GBQ A; 1ZUK A; 4F16 A; 2JM8 A; 2B86 A; 1OOT A; 2CT3 A; 4OMQ A; 1GCQ A; 2NWM A; 5L23 A; 4JJD A; 2ESW A; 2VKN A; 5IHI A; 1N5Z A; 2C0O A; 2DL8 A; 2EGE A; 2BZY A; 1QWF A; 1OPL A; 1YWO A; 1BBZ A; 2LJ1 A; 2KT8 A; 2K7A A; 1NYG A; 1PHT A; 1GFD A; 2AKK A; 2DF6 A; 2AKL A; 5I22 A; 3FJ5 A; 1ZUU A; 2DA9 A; 2MOX A; 1M30 A; 1JXM A; 4Y92 A; 1ZSG A; 4OMM A; 2EYW A; 2AZV A; 2EYX A; 2KE9 A; 1GFC A; 2ROL A; 4JZ3 A; 2FPD A; 2O88 A; 3JV3 A; 1ABQ A; 4J9C A; 2NUZ A; 2D8J A; 1X43 A; 2EYZ A; 2K3B A; 2OI3 A; 2ENM A; 3VS1 A; 2DVJ A; 1NLO C; 2VWF A; 2A28 A; 2EKH A; 1UEC A; 3ZL7 C; 2FPF A; 1VYU A; 1T0H A; 2ABL A; 4RTX A; 1NLP C; 2SEM A; 2KRM A; 2L2P A; 2H8H A; 2O9V A; 1PRM C; 4D8D A; 2KR3 A; 2K9G A; 4LUD A; 3PVL A; 3QWX X; 1UFF A; 3C0C A; 4RTT A; 3VS4 A; 2RQV A; 2GNC A; 2JT4 A; 1BB9 A; 1WLP B; 1NEG A; 2EPD A; 1PWT A; 1QWE A; 2RN8 A; 1WDX A; 4KRT A; 4AFS C; 4LN2 A; 1JU5 C; 2DMO A; 2DBM A; 2W10 A; 2O2O A; 2LMJ A; 5IHK A; 1KIK A; 1HD3 A; 1BK2 A; 5FW9 A; 4D8K A; 2ED0 A; 3EG0 A; 4J9D A; 4OMN A; 2LZ6 B; 1SHG A; 2HBW A; 2J7I A; 2PNI A; 2KBT A; 2EBP A; 3H41 A; 3SHW A; 1M3A A; 2DIL A; 2JTE A; 3I9Q A; 3VRY A; 2MIO A; 1K4U S; 1ABO A; 1Z9Q A; 2DLP A; 2DE0 X; 1GCP A; 2KRN A; 3UA6 A; 1X69 A; 2GQI A; 1WIE A; 1M3C A; 1PKT A; 1BU1 A; 4Z88 A; 1XOV A; 1HJD A; 2YUP A; 2LNH B; 3NMZ C; 1H3H A; 4WCI A; 4HCK A; 2K6D A; 4RTU A; 3O5Z A; 2A37 A; 2LCS A; 4IIM A; 3I5S A; 3THK A; 1E6H A; 4OMP A; 1FYN A; 2K2M A; 5HCK A; 3VS3 A; 1E6G A; 4CC2 A; 2RQT A; 1MV3 A; 2JMC A; 1K9A A; 1AZE A; 1UTI A; 1YN8 A; 1K0X A; 2HSP A; 1KSW A; 4QT7 A; 4GLM A; 2DRM A; 2GGR A; 5IXB A; 4FSS A; 2EGA A; 2CDT A; 1AWO A; 2JS2 A; 1K0S A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1M2V B; 4XTV A; 4M78 G; 1Z9Z A; 1C0M A; 2JZ2 A; 5FU6 B; 2Z0W A; 3AT1 B; 4RG8 A; 2GCX A; 4M77 D; 2M0O A; 3H9N A; 3NGP A; 1QP2 A; 3GLX A; 4DBQ A; 3X24 B; 2ZPB B; 2EYY A; 4PK4 A; 4FL6 A; 1SRL A; 4C0G A; 3G4S T; 4LUE A; 3RMQ A; 2MI6 A; 4CC7 A; 2E64 A; 4FCY A; 1JQQ A; 2X4X A; 3LWI A; 1X27 A; 4AFZ C; 2E5K A; 1RLQ C; 3QPH A; 2QYZ A; 3VRZ A; 2K3Y A; 3M0R A; 3IQL A; 2FRW A; 3QZ9 B; 3UA7 A; 1M1K C; 4PJO A; 3CMA A; 4M7A B; 2J6F A; 1UGS B; 3JCM J; 1NM7 A; 1WI7 A; 3QHS A; 1WHK A; 2QDY B; 1U8R A; 4R55 A; 2PZ1 A; 2CT4 A; 3M0Q A; 3RES A; 1QW1 A; 2RJF A; 4E7L A; 2HL5 C; 1VYV A; 3RDV A; 1KK7 A; 5IN1 A; 4C5H A; 2IVW A; 3VS5 A; 4OB3 B; 2LJ0 A; 2EQU A; 4JJB A; 3JCM V; 1K73 C; 4EDU A; 2IPO B; 2BTT A; 2P4T A; 4M78 B; 4HA8 A; 3MP8 A; 5I2M A; 3OA6 A; 4C0D B; 2L0A A; 2VXE A; 1K8A C; 4BE0 A; 5DLQ E; 2V1R A; 2NYS A; 5I2S A; 4M7A F; 2CP6 A; 3EG1 A; 3BDU A; 4PFO A; 3EG2 A; 3CC2 Q; 1W70 A; 1T3S A; 4AFU C; 2RO0 A; 1LPL A; 2AT1 B; 3QYG B; 1CKA A; 3CQT A; 3REB B; 3GIB A; 4LXC A; 4HKE A; 1QCO A; 2XHC A; 3M4Y A; 4A63 B; 2SRC A; 1ZBJ A; 3RUX A; 1P92 A; 3JB9 G; 4M75 D; 2LQK A; 2KSS A; 4RTV A; 3TU4 K; 1M2O A; 1NPP A; 4ORZ A; 2LQW A; 3L2R A; 1WHH A; 1Y57 A; 1WXT A; 2X4W A; 4PLI A; 4M78 F; 3EFO B; 4BY6 C; 3MKD A; 4O5V A; 1Q86 C; 3VS0 A; 2KVQ G; 2KI7 A; 1VQ5 A; 3I55 T; 2VGM A; 2IIM A; 4DBF A; 2YDL A; 3NHN A; 1QVF P; 1RI9 A; 4XAX B; 4E7J A; 2F5K A; 1X2K A; 2E6N A; 4FIB A; 3EGD A; 1H3Z A; 3M9Q A; 4E6R A; 2E12 A; 1MGQ A; 2L3P A; 1U3O A; 1VA7 A; 4MML A; 3CCS Q; 1VIE A; 4OGC A; 1TU0 B; 4BI3 A; 4X1V A; 1WHL A; 5IT9 E; 2JTM A; 4CC3 A; 2A0F B; 2QQA A; 4JJC A; 3R6O A; 2EKO A; 1IHW A; 1YI2 T; 2RMO A; 4MZT A; 1W4S A; 1YJ9 T; 4OGE A; 5IH2 A; 1PNJ A; 4LDU A; 2J05 A; 1YHQ Q; 1VQ9 T; 3QUI A; 5I11 A; 1J3T A; 4M7D G; 3UT1 A; 2DZ9 A; 1KQS S; 1V1C A; 2KEA A; 5CKH A; 1N8R C; 4M4Z A; 1U5S A; 2X35 A; 2EQJ A; 1PRL C; 1FMV A; 2LCL A; 2QA4 T; 1QVF A; 3EGX B; 2O01 E; 2A08 A; 4GBQ A; 4M75 G; 3JCM h; 1PM3 A; 1NEB A; 2E70 A; 2XIC A; 1B3Q A; 3CXC P; 1RAE B; 1UDL A; 4EMK B; 1YJN A; 4RTY A; 3CC4 A; 1W1F A; 2EFI A; 3C94 A; 2LX9 A; 1VQK T; 1WJS A; 3EGU A; 4XU0 A; 4OF1 A; 4A4H A; 3HRT A; 3M0U A; 2PVG B; 3G6E T; 4OML A; 3X20 B; 2C0I A; 1O75 A; 3RBB B; 5J39 A; 2AK5 A; 4LE9 A; 1MV0 B; 3JB9 F; 1R8O B; 3LGF A; 3J81 E; 1UGP B; 4B6M A; 1ZBX A; 1WHJ A; 1M1G A; 2QAZ A; 1MMD A; 4C8Q E; 3OS0 A; 2EQM A; 1TUD A; 2V1Q A; 3QDR B; 2JMA A; 1YIJ Q; 3MHX A; 4QW2 A; 1UGR B; 3OYL A; 1HYO A; 4F7U A; 4M7D B; 3OYC A; 1EZZ B; 5GAN 8; 2RQR A; 2CP2 A; 3Q1J A; 2K79 A; 4PJO D; 4ANJ A; 2DL7 A; 3WVD B; 4HVV A; 2NUT A; 3CC7 T; 2VV5 A; 1FMK A; 3A5Z B; 2JTF A; 5LJ5 g; 1SG5 A; 1VQ4 T; 1T0J A; 4C92 E; 2CP0 A; 3BE3 A; 3L2Z A; 3CCE A; 3JCM d; 4A4E A; 2KMT A; 1X01 A; 5IHI A; 3VKI A; 8AT1 B; 4IUQ A; 1Q7Y R; 4ME7 A; 2ZPI B; 8ATC B; 1AHJ B; 2EGE A; 2XG8 D; 1BBZ A; 2KT8 A; 3OBY A; 2YLB A; 1GFD A; 4M7D F; 4OVA A; 5I22 A; 3FC3 A; 3A8O B; 2MOX A; 3BY7 A; 1YBY A; 4QQD A; 1M30 A; 4Y92 A; 4OMM A; 1VQ8 T; 2EYW A; 1Y96 B; 4IUT A; 3L2W A; 4LDV A; 5CKB A; 4M75 F; 2HQX A; 3OYN A; 2DO3 A; 5FU7 C; 1N27 A; 1X43 A; 4XQ3 A; 2EYZ A; 3WVE B; 2K3B A; 4JRP A; 3VS1 A; 2DVJ A; 2FZC B; 2CKK A; 2EKH A; 3ZL7 C; 4GY5 A; 3VUZ A; 1OZ3 A; 1NLP C; 1PSE A; 2L2P A; 2PU9 B; 3A8G B; 4RTT A; 1K9M U; 4PJO G; 2GNC A; 2JT4 A; 2K5F A; 1FXX A; 3HL8 A; 2DTI A; 4NL3 A; 1PWT A; 5KYY A; 3EFO A; 1WDX A; 1X75 C; 4AFS C; 3OS1 A; 1W2B P; 2QEX T; 1VQM Q; 5IHK A; 1Q82 U; 5CCA A; 5FW9 A; 2YRD A; 3ME9 A; 3NTH A; 1WZO A; 4NS5 A; 1SHG A; 4BB7 A; 1RAG B; 1M3A A; 2WSC E; 3LLR A; 3I9Q A; 3VRY A; 5HK0 A; 3G71 T; 4XU1 A; 2ZPG B; 3E9G A; 3SB2 A; 4M77 E; 2F69 A; 5LL6 S; 2LCC A; 1GCP A; 2KRN A; 1B7T A; 2GQI A; 3DB3 A; 3HTR A; 3BW1 A; 4KUI A; 3CPW A; 3CCU Q; 1XOV A; 1MMA A; 2PQW A; 1M1F A; 3NMZ C; 1Q7Y C; 1U1T A; 1H3H A; 4WCI A; 4HCK A; 2K6D A; 1D09 B; 2OTJ A; 3QXE B; 2K5I A; 3I5S A; 1W2B A; 3THK A; 3GPL A; 1FYN A; 2K2M A; 5HCK A; 2RA2 A; 1I5O B; 3EGX A; 3VS3 A; 3GF5 A; 2JMC A; 3M59 A; 4ELY C; 3MO8 A; 5LJ5 j; 3CCL T; 4XTY A; 1VQN A; 2DFU A; 4EMG A; 4IUP A; 1XJW B; 1VQ7 A; 2JOY A; 2GGR A; 2R5M A; 1AWO A; 2JS2 A; 2XKO C; 4HVU A; 2D0Q B; 2DYB A; 4ATO A; 4II1 A; 1W6X A; 2DXU A; 2X4J A; 1NJI U; 1PSF A; 3HRS A; 5GAN d; 2EVR A; 2A36 A; 2HD0 A; 3H6Z A; 2GTJ A; 1K76 A; 1UJY A; 1RAC B; 1UJ0 A; 3E19 A; 2E6Z A; 4N4G A; 3RKY A; 4PJO F; 5GAM f; 2RNA A; 2RF0 A; 1YHQ A; 3GOX A; 1D3B A; 2CP5 A; 1KJW A; 4GLK A; 1YIJ T; 3CCJ Q; 1YNZ A; 5GAO r; 3TSW A; 5LJ5 h; 1A0N B; 3JCM Q; 1E7O A; 4MDW A; 1Q81 U; 3ZBD A; 2XDD A; 1S72 T; 2M16 A; 4KGZ B; 1YJN Q; 4WF2 A; 1D1C A; 5J3B A; 3E1S A; 3X26 B; 2EYQ A; 1M27 C; 4M75 E; 3OQ5 A; 3LW5 E; 4IIO A; 1RAF B; 2QQ9 A; 1WA7 A; 2X4Y A; 1YJW Q; 1LVK A; 2FEI A; 1M1K R; 3JCM c; 2KNB B; 1V76 A; 4EMH A; 3CCR Q; 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