The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
12
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sequence length |
62
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structure length |
62
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Chain Sequence |
MDETGKELVLALYDYQEKSPREVTMKKGDILTLLNSTNKDWWKVEVNDRQGFVPAGYVKKLD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Cooperative propagation of local stability changes from low-stability and high-stability regions in a SH3 domain
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Signaling protein
|
| source organism |
Gallus gallus
|
| molecule keywords |
Spectrin alpha chain, brain
|
| total genus |
12
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| structure length |
62
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| sequence length |
62
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-11-18 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2FG0 A; 4AFS C; 1I07 A; 4QT7 A; 4DEY A; 2O9S A; 2ENM A; 4R0K A; 1NEB A; 2MCN A; 2EKH A; 2EYX A; 1AZE A; 4AFQ C; 2KEA A; 1X27 A; 3VS5 A; 1YN8 A; 1GL5 A; 2DBM A; 4CC3 A; 1K9A A; 5GJW B; 2LJ1 A; 2JXB A; 1QWF A; 4Z89 A; 1BBZ A; 1PHT A; 1OPL A; 4ESR A; 3NPF A; 2AZS A; 1M27 C; 2ED1 A; 2DL7 A; 2E5K A; 5FWC A; 2HBW A; 1W6X A; 2EVR A; 2F2W A; 2JW4 A; 1GFD A; 3NMZ C; 2D8H A; 2AKK A; 1WXT A; 1TUD A; 2JT4 A; 1ZUK A; 2EYZ A; 2M51 A; 2RMO A; 4J9E A; 3ZL7 C; 4LN2 A; 1J3T A; 2KRO A; 3EG2 A; 4HVU A; 3LH5 A; 2IIM A; 2DMO A; 1IO6 A; 5I11 A; 3RBB B; 4OMN A; 2JMC A; 2LX7 A; 2L3Q A; 2EGA A; 2F2V A; 2HCK A; 3EHR A; 4OMM A; 2CT3 A; 2ROT A; 4LUE A; 2MOX A; 1Z9Q A; 4F14 A; 1H3H A; 1UEC A; 2DVJ A; 2XMF A; 3NGP A; 1GFC A; 1VYU A; 3TVT A; 4GLM A; 1OOT A; 4OML A; 4RTV A; 1FMK A; 1Y57 A; 2CH4 A; 4RUG A; 2X3W D; 2RN8 A; 2I0N A; 4Y92 A; 1MV0 B; 2LQW A; 4RTY A; 1BB9 A; 2O2O A; 1AVZ C; 2KXC A; 1WA7 A; 1OEB A; 4FSS A; 2DX1 A; 1H8K A; 1OV3 A; 2D1X A; 3I5R A; 2V1R A; 4IIM A; 1WYX A; 1AD5 A; 4CC2 A; 2SRC A; 2O31 A; 2RPN A; 4RTZ A; 2K3B A; 5IHK A; 2L2P A; 1OPK A; 2LQN A; 2LCS A; 1NM7 A; 3I5S A; 1QWE A; 4RTT A; 2G6F X; 2HSP A; 2RQV A; 2J6F A; 2L3S A; 1UJ0 A; 1I1J A; 5IH2 A; 4RTU A; 2OAW A; 1RLQ C; 2JM8 A; 1K0S A; 2KR3 A; 1AZG B; 1ABO A; 4J9C A; 4AG1 C; 2L3P A; 4J9D A; 2YDL A; 1X43 A; 1VA7 A; 1ARK A; 2RQW A; 1K1Z A; 2KRN A; 2KNB B; 2DA9 A; 2EGC A; 2DNU A; 2RNA A; 1ZUU A; 3M0P A; 3H0I A; 2YUQ A; 3SEM A; 1T0H A; 5EC7 A; 3UF4 A; 2GGR A; 1U06 A; 2EYW A; 1SHF A; 3UAT A; 2RQT A; 2GTO A; 2L0A A; 1GRI A; 3QWY A; 1KJW A; 3EG3 A; 2YT6 A; 1AWW A; 2VVK A; 2B86 A; 2HEQ A; 3VS6 A; 1JXO A; 2DIL A; 4J9B A; 2DLP A; 3I9Q A; 2K2M A; 2DBK A; 1A0N B; 1WI7 A; 2K7A A; 3EG1 A; 1M8M A; 4HVW A; 4LUD A; 2EPD A; 4LE9 A; 4ORZ A; 1JQQ A; 2EGE A; 1SRL A; 1XOV A; 1WX6 A; 3PE0 A; 1X6G A; 1UDL A; 4OMO A; 2FPF A; 3M0U A; 4Z88 A; 2FRW A; 4J9F A; 2GQI A; 1ZSG A; 1M3C A; 2OJ2 A; 2FO0 A; 1ZUY A; 2GNC A; 1UJY A; 1NYF A; 3VS0 A; 1S1N A; 1SEM A; 2KRM A; 4JZ3 A; 1ABQ A; 2PTK A; 4CC4 B; 2FEI A; 1UFF A; 2DYB A; 4RTX A; 1YWO A; 3VS2 A; 1Y0M A; 2BZ8 A; 3EGU A; 3M0R A; 3C0C A; 1NYG A; 1WDX A; 4JJB A; 1T3L A; 2DRK A; 4D8K A; 2O88 A; 1PRM C; 4X1V A; 3UA7 A; 2DL8 A; 2CT4 A; 2LJ0 A; 3ULR B; 1G2B A; 2AZV A; 1YP5 A; 4EIK A; 2JTE A; 4HVV A; 2FPE A; 4JZ4 A; 1RI9 A; 1WLP B; 3R6N A; 3RNJ A; 1MUZ A; 1JEG A; 2RQR A; 1AWX A; 2CSI A; 4HXJ A; 4K11 A; 1WXU A; 3VS4 A; 2EW3 A; 2RF0 A; 1V1C A; 3M0T A; 4IIO A; 1NLP C; 5FWB A; 2YUN A; 3JV3 A; 4JJD A; 3M0S A; 1T3S A; 3SHW A; 1HJD A; 2DM1 A; 3REA B; 2LP5 A; 2M0Y A; 5L23 A; 2JM9 A; 1M3A A; 1PKT A; 2KYB A; 4HCK A; 4KRT A; 4DEX A; 1SSH A; 1QKX A; 1YNZ A; 2KGT A; 3VS3 A; 1SHG A; 2A37 A; 2ESW A; 1U5S A; 3GBQ A; 3THK A; 1GCQ C; 2PZ1 A; 1MV3 A; 2J06 A; 1HD3 A; 1WFW A; 1E6H A; 3IQL A; 4OMQ A; 1CKA A; 1GCQ A; 5IXF A; 1GBR A; 5FW9 A; 2DRM A; 2KYM A; 3H0F A; 1VYV A; 3I35 A; 2J6O A; 3REB B; 1AWJ A; 2D0N A; 2CUB A; 1YWP A; 2W0Z A; 1JU5 C; 1NG2 A; 1UGV A; 2AK5 A; 3NHN A; 1BK2 A; 1E6G A; 2CSQ A; 2KT8 A; 1ZBJ A; 1JXM A; 1PRL C; 4J9I A; 4RTW A; 2SEM A; 1GCP A; 1M3B A; 1K76 A; 2DL5 A; 2NWM A; 4GBQ A; 2K6D A; 2KT1 A; 1RUW A; 2EBP A; 2X3X D; 2CUD A; 1GBQ A; 1H92 A; 1M30 A; 1KSW A; 1UUE A; 2YUO A; 1AOJ A; 1WIE A; 4M4Z A; 2LMJ A; 1N5Z A; 2AKL A; 2C0I A; 2C0O A; 3H41 A; 1CKB A; 4J9G A; 2GTJ A; 4A63 B; 2J05 A; 2C0T A; 1HSQ A; 2JS2 A; 4F17 A; 1ZX6 A; 3VS7 A; 2CH4 W; 2DJQ A; 2A28 A; 1X6B A; 1B3Q A; 3UA6 A; 3PVQ A; 2BZY A; 5I22 A; 1LCK A; 2VWF A; 5ECA A; 1UE9 A; 1BU1 A; 5IHN A; 1KIK A; 3U23 A; 1X2Q A; 2KE9 A; 3KFV A; 1UTI A; 2YUP A; 1E7O A; 4Z8A A; 2RQU A; 1NLO C; 4OMP A; 2P4R A; 3VS1 A; 2D8J A; 2BTT A; 2DF6 A; 4LNP A; 2DE0 X; 1B07 A; 4WCI A; 4ZNX A; 4D8D A; 1KFZ A; 1TG0 A; 1X69 A; 2DL3 A; 2LZ6 B; 2OI3 A; 1X2K A; 3PVL A; 4AFZ C; 2HDA A; 3VRY A; 3TSZ A; 5GJV B; 2J6K A; 2ABL A; 3CQT A; 4JPB W; 1WXB A; 2W10 A; 2ROL A; 5IXB A; 2QDL A; 2ECZ A; 3TSW A; 1QCF A; 1PNJ A; 2VKN A; 1Z9Z A; 1EFN A; 5HCK A; 2LNH B; 3EG0 A; 2NUZ A; 2ED0 A; 1PKS A; 3EHQ A; 2FRY A; 1UHF A; 1K4U S; 1RLP C; 2KRS A; 4F16 A; 2EQI A; 2JMA A; 1SPK A; 2KXD A; 2A36 A; 2J7I A; 3A98 A; 2JS0 A; 4JJC A; 2PNI A; 1NEG A; 1SRM A; 1G83 A; 1AWO A; 4J9H A; 4AFU C; 3O5Z A; 2O9V A; 2CRE A; 1UHC A; 3H0H A; 1ZLM A; 3VRZ A; 1CSK A; 1I0C A; 2K9G A; 2BZX A; 2A08 A; 1K0X A; 1JO8 A; 2GBQ A; 2KBT A; 2LJ3 A; 4E6R A; 1TUC A; 2MIO A; 2V1Q A; 1VYT A; 1U3O A; 1UG1 A; 2FPD A; 1YCS B; 2DL4 A; 1QLY A; 2F2X A; 3FJ5 A; 2EYY A; 3QWX X; 5IHI A; 1T0J A; 4AG2 C; 1FYN A; 1W70 A; 4CC7 A; 2H8H A; 3M0Q A; 2K79 A; 2CDT A; 2YSQ A; 1QKW A; 1PWT A; 1W1F A; 1AEY A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3MET A; 2MMP A; 4XU3 A; 3GIB A; 2P0P A; 3I55 T; 4DEY A; 2YWW A; 4RCC A; 2NLU A; 2EYX A; 2MYS A; 2M9U A; 1X27 A; 2AT1 B; 2MWO A; 2CP7 A; 2BE9 B; 4CC3 A; 1K9A A; 4M7D C; 4Z89 A; 3PNW C; 5GAO l; 1Q86 U; 3A8G B; 3NPF A; 3QYG B; 2DL7 A; 1ZA1 B; 5I21 A; 5CAI A; 1VQM A; 1WJR A; 3JCM b; 3I55 Q; 4QQD A; 3ZBD A; 2WSF E; 2MF2 A; 2JT4 A; 1KD1 U; 2VV5 A; 4J6Y A; 2JNG A; 3V8K A; 2ZPB B; 3PTA A; 1WHM A; 5LJ3 e; 4C92 A; 2G3R A; 4XU1 A; 3Q1J A; 3VJP A; 2K5F A; 5J39 A; 1VQ7 Q; 5KYU A; 2ZPE B; 5CIU A; 4OMN A; 2COW A; 2XID A; 2JMC A; 2LX7 A; 4IUP A; 1D3B A; 2EGA A; 1RAE B; 3MP8 A; 2HCK A; 3EHR A; 3BFM A; 3JCM f; 4OMM A; 1R0C B; 2CT3 A; 2MOX A; 1PD0 A; 3NGP A; 5A0G A; 1M9S A; 2D0Q B; 4DOW A; 4RTV A; 1Y57 A; 1FXX A; 4M78 D; 4PKC C; 5HY6 A; 2LQW A; 4N4H A; 5FLX E; 2E1H A; 1VQ7 A; 1AVZ C; 2KXC A; 4ELZ C; 1WA7 A; 1YJN T; 1UGS B; 2KK4 A; 1HXD A; 4EMH A; 4F04 B; 2QA4 T; 3MEV A; 4M77 C; 3I5R A; 2HSE B; 1AD5 A; 1WHK A; 3S3O A; 5LJ5 f; 2AHJ B; 2SRC A; 2O31 A; 2RPN A; 4E7K A; 4JS5 A; 5IHK A; 1S72 T; 5KYW B; 1NM7 A; 3TQ7 P; 1P92 A; 5A2Q E; 1VQO T; 2G6F X; 2J6F A; 2K57 A; 2P0K A; 5KH6 A; 3QZ9 B; 2P4T A; 2JTM A; 6AT1 B; 4MDX A; 4AG1 C; 2L3P A; 1HK9 A; 3L2U A; 1YJN Q; 1OUL A; 2RQW A; 2KRN A; 1TWB A; 4KGX B; 2VXF A; 1OYX A; 1ZUU A; 2GGR A; 3X28 B; 1I5O B; 5KYX B; 2XU8 A; 2GTO A; 3HRS A; 1EIF A; 3LYI A; 2YT6 A; 3VS6 A; 1VQ5 T; 2DIL A; 4J9B A; 2DBK A; 1VQO Q; 1WI7 A; 2K7A A; 3EG1 A; 1V29 B; 4IUU A; 2EPD A; 2H3E B; 4LE9 A; 5LL6 S; 2E65 A; 2I2L A; 2GFU A; 5GAN g; 1QP2 A; 1SRL A; 3TU4 K; 5CCA A; 3HFO A; 3PE0 A; 4A4F A; 4OGC A; 1M90 U; 5KYN A; 1Q86 C; 1M3C A; 2E5Q A; 1VQ8 T; 3OS2 A; 4UC4 A; 2FO0 A; 3OW2 A; 1KD1 R; 4EMK A; 2HQX A; 1UJY A; 1K73 U; 2KI7 A; 4PFP A; 1S1N A; 1M1K U; 4C0D C; 3WXM B; 4PFZ A; 1VQ5 Q; 4M7D B; 3GPL A; 4OMF B; 3VS2 A; 1Y0M A; 5GAN 6; 1M2O A; 4FU6 A; 1FMV A; 3M0R A; 2COZ A; 4LDV A; 3A8H B; 1WHH A; 3OMC A; 1UGR B; 4E7Z A; 1KD1 C; 1YCY A; 4IUQ A; 3TRE A; 2X4J A; 2ZAE A; 5CVI A; 1OX8 A; 3OYY A; 4LD6 A; 3UA7 A; 2CT4 A; 2Y90 A; 3CCR Q; 3ULR B; 1G2B A; 1YP5 A; 1PC0 A; 1PM3 A; 3G71 T; 2FPE A; 8AT1 B; 1RI9 A; 2JTF A; 1WLP B; 3RNJ A; 2XDP A; 3V7C A; 3VS4 A; 1V1C A; 3M0T A; 5FWB A; 2YUN A; 3JV3 A; 3M5A A; 1HJD A; 4AT1 B; 2DM1 A; 2LP5 A; 1XJW B; 1M3A A; 2KYB A; 4C92 D; 5GAM h; 4DEX A; 3N5B B; 3CCR A; 1RAH B; 2LQK A; 1FX7 A; 2E10 A; 4ZGD B; 3GBQ A; 3THK A; 1NJI R; 2KVQ G; 3NTK A; 2EQJ A; 2PZ1 A; 1HD3 A; 5GMK m; 5GAN 8; 4FYW B; 4HCB A; 2O4X B; 3IQL A; 1V76 A; 2DTO A; 3BY7 A; 1GCQ A; 2E4H A; 1WHL A; 4KGV B; 2LRQ A; 4CRI A; 5FW9 A; 1BI0 A; 2AIR B; 2KYM A; 4MZM A; 1LJO A; 1NJI C; 2J6O A; 2Z0W A; 2RB6 A; 1YWP A; 2W0Z A; 4O6J A; 3OYK A; 3OMG A; 4M77 B; 1YJ9 T; 2GF7 A; 2WAC A; 1ZBJ A; 1RAC B; 2KT8 A; 3OYN A; 4RTW A; 1TOV A; 1M3B A; 1K76 A; 4WF2 A; 5GAM d; 2HL5 C; 1RUW A; 2EBP A; 2X4X A; 1QVG A; 2X3X D; 3CCJ T; 3JB9 J; 1H92 A; 3VUB A; 2VAS A; 4GY5 A; 1UUE A; 4E47 A; 4PJL A; 4M4Z A; 3FDR A; 3ASK A; 2YXY A; 4FYV B; 2XD0 A; 2O01 E; 4RG8 A; 4ANJ A; 1X01 A; 1N8R U; 4OB3 B; 2FVU A; 1JJ2 A; 2E41 A; 2L8D A; 2XG8 D; 2A28 A; 1B3Q A; 3QII A; 5ECA A; 2VWF A; 1YIJ T; 3JAM E; 1QW1 A; 3GP8 A; 1YJ9 Q; 3LGL A; 2PQW A; 2VXE A; 3U23 A; 1G3S A; 1X2Q A; 1PG5 B; 1IHV A; 3KFV A; 1K8A U; 4KT0 E; 4JRP A; 3NTH A; 3X26 B; 1K73 R; 1RL2 A; 1M1K R; 4FL6 A; 3CCJ Q; 1Y96 B; 1B07 A; 3CC7 Q; 2CP2 A; 2RJE A; 4FW1 A; 2OI3 A; 3PVL A; 2NYS A; 4RCB A; 1C1A A; 2CS7 A; 2J6K A; 1K73 C; 2QXF A; 3CQT A; 2EJ9 A; 1YJ9 A; 4M7D F; 3M58 A; 1M1K C; 2HZY A; 2ECZ A; 3TSW A; 2X4W A; 4J7I A; 3G6E A; 5GAO m; 1EFN A; 1YIJ Q; 5KYW A; 2NUZ A; 1PKS A; 1QVF S; 3CCJ A; 1UHF A; 2CZ6 B; 3CC7 A; 4F16 A; 2QI2 A; 2EQI A; 2KXD A; 4C0D B; 1SG5 A; 4JJC A; 4BI8 B; 3CXC A; 2QYZ A; 3OYD A; 3V8J A; 1VQK T; 1RAF B; 2CRE A; 3MP6 A; 4MMK A; 3VRZ A; 4R56 A; 1JRI A; 4E2F B; 2GBQ A; 2M1H A; 4E6R A; 5KYX A; 4R55 A; 2QGG A; 1NPP A; 2HAX A; 3JB9 F; 2QQ9 A; 4OB2 B; 5IHI A; 2VYT A; 5LJ3 f; 2CDT A; 2YSQ A; 1QKW A; 4BE2 A; 1JXO A; 4JS4 A; 2EAY A; 3G4S Q; 1BKB A; 3RKX A; 4QT7 A; 1D09 B; 4PJO G; 5GAM j; 1YBY A; 3DB4 A; 1YHQ T; 1VQ4 A; 1AZE A; 3CPW A; 1VQK Q; 1IRX A; 4AFQ C; 4NOY A; 4XTW A; 3OW2 P; 4M77 F; 3QHS A; 4D6W A; 5DM7 R; 2RI3 A; 3VYG A; 2LJ1 A; 2JXB A; 1QWF A; 2P0Q A; 1ZHI A; 3EGD B; 4A4K A; 4JRI A; 5DY9 A; 3L42 A; 3RUX A; 2RHI A; 3PIO A; 4ESR A; 3G4S A; 1Y07 A; 4M7D A; 3FLG A; 2ED1 A; 5GMK h; 2E5K A; 2HBW A; 2JW4 A; 3FB9 A; 2A7Y A; 2X4Y A; 1VQK A; 2QAS A; 1YIT T; 2D8H A; 4RMO A; 2F69 A; 4F7U B; 1WXT A; 2E6N A; 2DXC A; 3ZFJ A; 2DET A; 2K5I A; 2EYZ A; 1N8R C; 2RMO A; 3ZL7 C; 2KAF A; 3LW5 E; 5GAN h; 1JB0 E; 5FU7 C; 2RHU A; 2KRO A; 3EG2 A; 5GMK l; 4OP0 A; 1VQP A; 3GNF B; 4PJO E; 1YJW Q; 1BI2 A; 2HNI A; 2RHY A; 2L3Q A; 2HL3 A; 2F2V A; 1YI2 Q; 2ROT A; 2E12 A; 1K8A C; 1M1F A; 1Z9Q A; 4F14 A; 3L2Z A; 4V2S A; 2XMF A; 4M7A E; 1RAA B; 2Y4Y A; 4XTX A; 1VYU A; 1MMD A; 3ME9 A; 1AT1 B; 1YIT Q; 4RUG A; 2X3W D; 1AHJ B; 1YJW A; 3CC2 Q; 4RTY A; 1BB9 A; 2O4X A; 5GAN 7; 1OV3 A; 1VQM T; 2WSC E; 1YI2 A; 2V1R A; 4IIM A; 1WYX A; 2E70 A; 4FT4 A; 2OX7 A; 1OU8 A; 2YRC A; 1C6V X; 4CC2 A; 5IAY A; 2K3B A; 3JCM c; 1JBM A; 2YRV A; 4M77 A; 5CKF A; 1BIB A; 3OQ5 A; 2LQN A; 3I5S A; 2HQH A; 1NBE B; 3CC2 A; 4A54 A; 4FIB A; 7AT1 B; 2L3S A; 1UJ0 A; 4BD3 A; 1I1J A; 5IH2 A; 5IT9 E; 2OAW A; 4KH0 B; 2KR3 A; 3A5Z B; 2EJG A; 4J9D A; 2M02 A; 5KCO A; 4C8Q E; 1JJ2 P; 1SSF A; 1K1Z A; 1VQM Q; 2EGC A; 2DNU A; 2RNA A; 3SEM A; 4XTU A; 3H0I A; 4II1 A; 5EC7 A; 4E7J A; 2EYW A; 1GRI A; 1I8F A; 2CYZ B; 3QWY A; 1VQ7 T; 1KJW A; 3EG3 A; 1AWW A; 2DVE A; 2B86 A; 2HEQ A; 1KQS A; 2H3J A; 4PL6 A; 4Q5W A; 3I9Q A; 5LJ5 d; 1A0N B; 4LDU A; 4OB0 B; 1IHW A; 5GAM e; 4LD9 K; 1PSF A; 4LUD A; 2LCL A; 2R58 A; 1Y96 A; 2CP3 A; 1JQQ A; 5HK0 A; 1UDL A; 4OMO A; 2FPF A; 3QJY A; 5AYF A; 5EG2 A; 2OJ2 A; 3KBG A; 4Y28 E; 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