The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
6
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sequence length |
68
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structure length |
68
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Chain Sequence |
GPLGSGALKWVLCNYDFQARNSSELSVKQRDVLEVLDDSRKWWKVRDPAGQEGYVPYNILTPYPAAAS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structural basis of PxxDY motif recognition in SH3 binding.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Signaling protein
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| molecule keywords |
Eps8-like protein 1
|
| total genus |
6
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| structure length |
68
|
| sequence length |
68
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2008-04-02 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3VS4 A; 4OMP A; 2ROL A; 2AKL A; 3M0T A; 2KYM A; 2FPE A; 1AWO A; 1VYT A; 4RTU A; 1SHF A; 5I11 A; 2DRM A; 1AEY A; 2KRO A; 1WLP B; 1M27 C; 3M0Q A; 2KRN A; 2YUP A; 2DL8 A; 2K79 A; 1RI9 A; 4HVV A; 1GFD A; 4KRT A; 2YDL A; 1BBZ A; 1XOV A; 2JS2 A; 2PNI A; 1M3C A; 2DX1 A; 5GJV B; 1H8K A; 2A36 A; 2LQW A; 2KXD A; 3M0P A; 2O31 A; 3H0F A; 4E6R A; 1WX6 A; 2W10 A; 2F2V A; 4LNP A; 2JM9 A; 4F17 A; 2EGA A; 2JTE A; 5ECA A; 1CKA A; 3EG2 A; 3UAT A; 2MCN A; 1B3Q A; 2VVK A; 2QDL A; 1AZE A; 2BZY A; 1JQQ A; 1K9A A; 2K7A A; 4F16 A; 3SHW A; 3EHQ A; 4RTW A; 1TUC A; 1T3S A; 2L3Q A; 2DL7 A; 2EGC A; 1QLY A; 2KR3 A; 1UEC A; 1TG0 A; 4HVU A; 1HJD A; 5L23 A; 1MV0 B; 1UFF A; 2DE0 X; 2RN8 A; 2K6D A; 2DL4 A; 5FW9 A; 2LP5 A; 3TVT A; 1PNJ A; 2B86 A; 3JV3 A; 4JJD A; 1X2Q A; 2CRE A; 1ABQ A; 1U06 A; 2KXC A; 4OMQ A; 4AFQ C; 3TSW A; 1NLP C; 1W6X A; 2CUD A; 3THK A; 1AWX A; 2LZ6 B; 3EG0 A; 1Z9Z A; 2C0T A; 2EYY A; 1J3T A; 4D8D A; 2SRC A; 2FO0 A; 1K76 A; 1Y0M A; 4RTZ A; 4LN2 A; 1OPK A; 2KT1 A; 4CC3 A; 4K11 A; 2FRY A; 1AWJ A; 2M51 A; 1SPK A; 2ED0 A; 4JJC A; 4OMM A; 1QKW A; 4LUD A; 2GTO A; 1KSW A; 5IHI A; 4JZ4 A; 2X3X D; 3NGP A; 2DVJ A; 3RBB B; 2JXB A; 2D8H A; 1HD3 A; 2AK5 A; 1PWT A; 2L2P A; 1ZBJ A; 1ZSG A; 2FPF A; 2NUZ A; 4RUG A; 1UTI A; 4OML A; 3VS7 A; 2DA9 A; 3I5R A; 2AZS A; 2EGE A; 2GGR A; 2XMF A; 4AG2 C; 2A37 A; 2CT4 A; 1PRL C; 2DM1 A; 2BZX A; 2YSQ A; 4AFZ C; 1X6B A; 2YUO A; 2GQI A; 1UJ0 A; 2K9G A; 2V1R A; 1WFW A; 2EYW A; 2P4R A; 1H3H A; 4ESR A; 1PKT A; 1UE9 A; 1GBR A; 1PHT A; 1M8M A; 1X2K A; 1YWO A; 2EKH A; 4AFS C; 2K2M A; 2GNC A; 4ORZ A; 1NEG A; 1NLO C; 2RQU A; 1TUD A; 1QWF A; 2M0Y A; 1WYX A; 4D8K A; 2FG0 A; 1ZLM A; 2LX7 A; 4RTY A; 2O2O A; 1EFN A; 2LNH B; 1YN8 A; 3M0R A; 3O5Z A; 1B07 A; 4HXJ A; 2RQR A; 2MOX A; 5IHK A; 2OI3 A; 2LJ0 A; 5IXF A; 3ZL7 C; 2KBT A; 2L3S A; 2HEQ A; 1YCS B; 3SEM A; 4J9F A; 2KRM A; 2CSI A; 1RLQ C; 1LCK A; 4Y92 A; 3U23 A; 1T0J A; 1YNZ A; 2EPD A; 2W0Z A; 1FMK A; 1VYU A; 1T3L A; 2BTT A; 3UF4 A; 2DMO A; 5EC7 A; 3IQL A; 2L3P A; 2AKK A; 3VS6 A; 1AVZ C; 1JEG A; 1ZUU A; 1HSQ A; 2J6O A; 4GBQ A; 3UA6 A; 1M3A A; 1WXU A; 5FWC A; 4J9H A; 5GJW B; 4Z89 A; 3VRY A; 1NYG A; 2RMO A; 1MV3 A; 3FJ5 A; 4J9D A; 1A0N B; 2JMC A; 4X1V A; 3NPF A; 1RUW A; 1N5Z A; 3NHN A; 4JJB A; 1CSK A; 3VS5 A; 2ED1 A; 1CKB A; 1WXB A; 5I22 A; 2RPN A; 3EG1 A; 5IHN A; 2F2X A; 1KIK A; 1UDL A; 2HDA A; 2KE9 A; 3VS3 A; 3REB B; 2YUQ A; 2LMJ A; 1ARK A; 2EYX A; 2KNB B; 1X43 A; 3H0H A; 2IIM A; 3QWX X; 4JZ3 A; 3EHR A; 2O9V A; 3I35 A; 2CH4 A; 2D0N A; 2KT8 A; 1BU1 A; 2DBM A; 2J06 A; 2YT6 A; 1UG1 A; 2CT3 A; 2RQT A; 4ZNX A; 2I0N A; 2LCS A; 4J9B A; 2RQV A; 4OMO A; 2JW4 A; 1AZG B; 1GCQ C; 2ROT A; 1K4U S; 1W70 A; 1AD5 A; 1NG2 A; 2EVR A; 2KGT A; 2FEI A; 3CQT A; 1GRI A; 4J9E A; 1I07 A; 2OJ2 A; 2DIL A; 2JT4 A; 4CC7 A; 2HSP A; 2VKN A; 3R6N A; 2C0O A; 2JMA A; 2PZ1 A; 3M0S A; 3QWY A; 2DL3 A; 4F14 A; 1UGV A; 2DNU A; 1QCF A; 4LUE A; 1YWP A; 2L0A A; 1V1C A; 3VS0 A; 4EIK A; 4JPB W; 1H92 A; 1I0C A; 1U5S A; 2DLP A; 4R0K A; 5IH2 A; 2J6K A; 2LQN A; 5FWB A; 1E6H A; 3PVL A; 2EBP A; 1GL5 A; 3TSZ A; 2AZV A; 4DEY A; 2X3W D; 1SRM A; 2OAW A; 2DL5 A; 1YP5 A; 2ECZ A; 2JM8 A; 1UHC A; 1ZUY A; 2CUB A; 4LE9 A; 2J05 A; 2SEM A; 3VRZ A; 1SHG A; 1AWW A; 2H8H A; 1QWE A; 1UJY A; 1JXO A; 1PRM C; 1JXM A; 4IIM A; 1GFC A; 2MIO A; 1G2B A; 4DEX A; 2K3B A; 3I5S A; 1X27 A; 4OMN A; 2KRS A; 2A08 A; 1E7O A; 1K1Z A; 2J6F A; 2DBK A; 2KYB A; 1UHF A; 1X6G A; 4FSS A; 3A98 A; 1I1J A; 1SRL A; 2C0I A; 2A28 A; 1OOT A; 1WIE A; 1T0H A; 1VA7 A; 4GLM A; 4RTV A; 3RNJ A; 3GBQ A; 2G6F X; 1Y57 A; 2D8J A; 4J9I A; 3H0I A; 2NWM A; 3C0C A; 2J7I A; 2RF0 A; 2CH4 W; 1AOJ A; 4WCI A; 1PKS A; 2VWF A; 1OPL A; 1W1F A; 1OV3 A; 4J9G A; 4IIO A; 2ESW A; 1Z9Q A; 1KJW A; 3NMZ C; 4RTT A; 5HCK A; 4M4Z A; 1BK2 A; 1GCP A; 4Z8A A; 2FRW A; 4CC4 B; 1X69 A; 3M0U A; 3LH5 A; 1BB9 A; 3PVQ A; 2RNA A; 3VS2 A; 2KEA A; 1KFZ A; 2V1Q A; 4RTX A; 2PTK A; 1NYF A; 1RLP C; 1UUE A; 1ZX6 A; 2DRK A; 5IXB A; 1JU5 C; 1NM7 A; 4AFU C; 1VYV A; 2EYZ A; 2GTJ A; 3VS1 A; 2EQI A; 1FYN A; 2GBQ A; 4CC2 A; 2DYB A; 2DF6 A; 1M3B A; 1JO8 A; 2FPD A; 2DJQ A; 3KFV A; 4HCK A; 4Z88 A; 3UA7 A; 1G83 A; 1WA7 A; 2EW3 A; 1U3O A; 1OEB A; 1IO6 A; 4AG1 C; 2YUN A; 3I9Q A; 4A63 B; 4HVW A; 2O9S A; 1GCQ A; 1K0S A; 3EG3 A; 1WXT A; 2LJ3 A; 1ABO A; 1S1N A; 3H41 A; 1MUZ A; 1K0X A; 3REA B; 2JS0 A; 2RQW A; 3EGU A; 1WDX A; 2BZ8 A; 1SEM A; 2D1X A; 2HCK A; 1QKX A; 2LJ1 A; 3ULR B; 1WI7 A; 2HBW A; 1E6G A; 1ZUK A; 1NEB A; 2ENM A; 2O88 A; 1SSH A; 2CDT A; 2ABL A; 2CSQ A; 2F2W A; 1M30 A; 4QT7 A; 4J9C A; 2E5K A; 3PE0 A; 1GBQ A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4E7J A; 4OMP A; 2AKL A; 3JCM b; 1YHQ T; 2QQ9 A; 3C12 A; 1AWO A; 1VYT A; 3G71 Q; 4C0F A; 2O4X B; 1M27 C; 4M7A B; 4LD6 A; 2K79 A; 3GP8 A; 2E6Z A; 3MHX A; 1M1K U; 5GAN 8; 1LNX A; 3ZBD A; 3H0F A; 2RJE A; 5HK3 A; 3KXT A; 2LQ8 A; 2F2V A; 3LYI A; 4LNP A; 2EGA A; 2JTE A; 1CKA A; 3EG2 A; 5A2Q E; 4R55 A; 3JCM e; 1V29 B; 1JQQ A; 3EAE A; 2CGH A; 4ELY C; 1N6A A; 3TU4 K; 2A3L A; 5HKC A; 1YHQ Q; 4PLI A; 2GFA A; 1I8F A; 5L23 A; 2RN8 A; 1PNJ A; 3JV3 A; 3V7C A; 3SWN A; 4JJD A; 2JTM A; 1YIJ T; 3QKJ A; 3MP1 A; 4AFQ C; 3OYN A; 5CKH A; 1YBY A; 1OI1 A; 1G3T A; 5GAN j; 2CUD A; 1YJ9 T; 1AWX A; 2XDD A; 2PUK B; 1HK9 A; 3EG0 A; 5D6X A; 5GAO m; 2EYY A; 2A0F B; 4II1 A; 1MMG A; 1X01 A; 4M7A G; 2QGG A; 4RTZ A; 2XK0 A; 4N0A A; 3JCM f; 4CC3 A; 2FRY A; 2M51 A; 3LGF A; 4EMK A; 1KHI A; 3V8L A; 3LLR A; 4JJC A; 2LX9 A; 3V8J A; 1Q81 U; 3LW5 E; 2MI6 A; 1KSW A; 5IHI A; 3CPW S; 4JZ4 A; 3RR6 A; 5GAO l; 4F7U F; 3RBB B; 5CR2 A; 2JXB A; 4NL2 A; 2DER A; 4LDU A; 3ME9 A; 4FYX B; 4BE1 A; 2FPF A; 4L5G A; 3VS7 A; 4J8O A; 2DA9 A; 2EGE A; 2XMF A; 2CT4 A; 5FRM A; 1PRL C; 2YSQ A; 2JVV A; 4ANJ A; 2K9G A; 1D09 B; 4C8Q A; 4MZP A; 2EYQ A; 5GAO p; 2K2M A; 3WXM B; 1TUD A; 4XTU A; 1QWF A; 4BE2 A; 1D1C A; 3OY9 A; 5AT1 B; 4RTY A; 1LOJ A; 2K3Y A; 2V8I A; 4ZGE B; 2NUP B; 4ZTF A; 3JCM X; 3RKY A; 3OYY A; 1VQ4 T; 4B6M A; 5IXF A; 2XDB A; 3L2V A; 2BIV A; 2MPX C; 4E7Z A; 1RLQ C; 3MEU A; 4M75 A; 1LCK A; 3GIB A; 3V7S A; 3CCM T; 1ZA1 B; 1OU8 A; 3S3O A; 1QQJ A; 3O8V A; 4RKU E; 3BDU A; 4ELZ C; 3OBY A; 2W0Z A; 3HTR A; 1FMK A; 1T3L A; 1D0Z A; 3I56 T; 2HQE A; 3WVD B; 5FU7 B; 2FYK A; 4M7D D; 4JRK A; 3VS6 A; 3BW1 A; 3CCV A; 1VOM A; 1HSQ A; 4GBQ A; 3CCU A; 1BI3 A; 1I4K 1; 2HAX A; 2COZ A; 4PKC C; 1EZZ B; 4KGV B; 3CC7 T; 3QG1 A; 4A4H A; 2JJ9 A; 1VQ4 Q; 3GNF B; 3NPF A; 4XQ3 A; 1RUW A; 5FRN A; 1N5Z A; 1CSK A; 2ED1 A; 3GOX A; 1CKB A; 5I22 A; 2RPN A; 3EG1 A; 2E64 A; 2KE9 A; 3M54 A; 1VQ6 T; 1U1T A; 3JAM E; 3REB B; 2LMJ A; 2DD4 A; 4LDW A; 5LJ3 h; 1ARK A; 2KVQ G; 3MET A; 2E10 A; 4MDX A; 1VUB A; 3H0H A; 3CXC P; 2XD0 A; 2IIM A; 3EGD B; 4QW2 A; 1OUL A; 2NYS A; 3QWX X; 4M7A F; 2R5M A; 1UGS B; 3OQ5 A; 4XTV A; 3I56 Q; 2M02 A; 3QDR B; 1QVF S; 1OX8 A; 2P0K A; 2MF2 A; 2CT3 A; 4ZNX A; 1VQK A; 4X9C A; 4OMO A; 2JW4 A; 4FYY B; 3OYK A; 2DIQ A; 1NG2 A; 2OTL A; 2EVR A; 3CQT A; 3OYD A; 1I07 A; 3CC7 Q; 2VKN A; 3MKD A; 3D7S B; 4JUV A; 2YLC A; 2PZ1 A; 3M0S A; 4F14 A; 1BI1 A; 4C92 D; 2DNU A; 4M77 A; 1WHM A; 1D0Y A; 1K8A R; 1B34 A; 5EG2 A; 3VS0 A; 3CCQ T; 2HSE B; 1LJO A; 3KBG A; 1U5S A; 4M78 C; 1VQ6 Q; 5IH2 A; 1Y07 A; 2DFU A; 1Q82 U; 3PVL A; 1N8R C; 1QP3 A; 3CC4 T; 4A4F A; 2DVE A; 1GL5 A; 1OX9 A; 3G7Z A; 2DL5 A; 2CUB A; 2XG8 D; 4LE9 A; 4PJN A; 4GY5 A; 1K9M U; 1SHG A; 2QA4 T; 1KQS P; 3VYG A; 2PVD B; 3OSV A; 1QWE A; 5KYX A; 1TS9 A; 4NOY A; 4DEX A; 2K3B A; 1S72 T; 2X4W A; 1ZQ1 A; 5KCO A; 1G5V A; 3RKW A; 1E7O A; 2J6F A; 2LT4 A; 5KYW A; 3BY7 A; 5GMK l; 1X6G A; 2KI7 A; 3OMG A; 1OOT A; 1T0H A; 1VA7 A; 4XTZ A; 2RHY A; 4RTV A; 3GBQ A; 1PD1 A; 1RAG B; 1IRX A; 3CCR Q; 1NPP A; 5GMK h; 4M75 E; 2CS7 A; 3J81 E; 5DM7 R; 3CCE T; 3SWN B; 4PJO D; 3CC4 Q; 1PKS A; 2EQU A; 4PL6 A; 4J9G A; 3JCM Q; 3OSS C; 1Z9Q A; 1KJW A; 3MJX A; 4RTT A; 1M5Q 1; 5D7U A; 2B8A A; 2DTH A; 3NTH A; 2QA4 Q; 2X4Y A; 5CKE A; 2MWO A; 3PMI A; 4KUL A; 1X69 A; 2LVM A; 5KYY A; 3LH5 A; 2RJD A; 2YXY A; 1K73 C; 1S72 Q; 2QI2 A; 1BKB A; 2LCL A; 1PM3 A; 1KFZ A; 3VV0 A; 4EMK B; 3QDF A; 4J7F A; 1UUE A; 4V2S A; 4AFU C; 2EYZ A; 4JRQ A; 4MDW A; 3HP9 A; 3MP6 A; 1NE8 A; 3CMA Q; 1FYN A; 4XTX A; 1WNL A; 2DF6 A; 1JB0 E; 4PFP A; 2FPD A; 2EW3 A; 3CCE Q; 1IO6 A; 3I9Q A; 4A63 B; 2EQK A; 1FXX A; 3LWH A; 1QMC A; 2DK3 A; 3EG3 A; 5D6W A; 1WXT A; 2Y4Y A; 3WVE B; 3N5B B; 5LJ3 j; 4C8Q B; 1K0X A; 1PSE A; 3DB4 A; 2RQW A; 2PVO B; 2D1X A; 2RHI A; 3ULR B; 3VKI A; 2QEX T; 1KQ2 A; 5GAN 3; 5DLQ E; 2XID A; 1ZUK A; 1UEB A; 1SSH A; 2CDT A; 4J9C A; 2E5Q A; 1M9S A; 2L5Q A; 3P8H A; 1M1K C; 3TEE A; 4M77 E; 3PGG A; 1VQO T; 4OVA A; 5CO7 A; 3SFM A; 4RTU A; 5FU6 C; 3OYM A; 1AEY A; 1WLP B; 4M75 B; 5I2M A; 3QBY A; 4M78 E; 1KC8 U; 1M8V A; 2QTV A; 2F5T X; 1QVG A; 4HVV A; 1GFD A; 3G6E A; 5CKD A; 1BYM A; 2K5F A; 3CXC S; 1QCN A; 1M3C A; 2E3H A; 5GJV B; 7AT1 B; 5GAN g; 1H8K A; 1VQ9 A; 1WZO A; 2QEX Q; 2RK1 A; 2OX7 A; 4C8Q G; 2KSS A; 4DOV A; 1IRE B; 5ECA A; 3C4S A; 3UAT A; 4A54 A; 1BIA A; 1B3Q A; 4FM4 B; 4M7D C; 2QDL A; 5DLO A; 2BZY A; 1VIE A; 1GXI E; 1K9A A; 3OA6 A; 2P84 A; 4F16 A; 3SHW A; 3E2U A; 5KYN A; 4RTW A; 1TUC A; 1T3S A; 1VQO Q; 4KGZ B; 1UEC A; 4HVU A; 5GAM e; 1MV0 B; 2G3R A; 5CIU A; 4E7H A; 3DKM A; 3TVT A; 1VQ8 A; 2B86 A; 2KXC A; 4PFO A; 4OMQ A; 4XTW A; 1SKU B; 4EDU A; 1NLP C; 4KH1 B; 1Z9Z A; 4M75 G; 8AT1 B; 5HK0 A; 3L2Z A; 3TQ7 P; 3SD4 A; 2CP0 A; 4RCB A; 4JRI A; 1W2B P; 5GAM j; 1KQ1 A; 3L2W A; 5HY6 A; 1KQS S; 1OPK A; 2HD0 A; 3CEY A; 1YJN T; 2KK4 A; 1QKW A; 2DPP B; 3RER A; 3NGP A; 3HHT B; 2MWP A; 2YWW A; 4DBR A; 4M77 B; 1HD3 A; 1PWT A; 1ZSG A; 2XIC A; 2NUZ A; 1UTI A; 1B34 B; 1JJ2 P; 2RJF A; 2GGR A; 3CCU T; 4MML A; 4C92 C; 1X6B A; 3J80 E; 1KD1 U; 1M1F A; 4L59 A; 3CCS A; 2VGN A; 1PHT A; 3X24 B; 4AFS C; 4ZGJ B; 3JB9 I; 2GNC A; 3H6Z A; 2NLU A; 3CC2 A; 1QVF A; 2RQU A; 2OTJ A; 2VC8 A; 1M1G A; 5FRO A; 1WYX A; 5KYX B; 3CCL A; 2LX7 A; 2DTO A; 2LNH B; 1YN8 A; 2EJ9 A; 3O5Z A; 3EFS A; 1YJN Q; 1XQH A; 1N8R R; 2RQR A; 1IZ6 A; 2MAM A; 1Y96 A; 2OI3 A; 2E12 A; 3MEV A; 5KYW B; 2EJF A; 3E9F A; 4QVD A; 3SEM A; 4IUT A; 1BCM A; 2CSI A; 2DZ9 A; 2E70 A; 3L2U A; 2WSF E; 4C0D B; 1M90 U; 3CD6 A; 4M77 G; 4M7A D; 2QQS A; 1VQM A; 2CKK A; 1O9S A; 2ZCF B; 4C8Q F; 1LPL A; 4HCC A; 5IAY A; 1AVZ C; 1YFN A; 2A7Y A; 4M78 G; 1YJW A; 4EPC A; 3AHU A; 1UGP B; 4BE0 A; 4PJO C; 1M3A A; 1MNE A; 5KYY B; 2XU8 A; 3EH2 A; 1LVK A; 1NYG A; 2CZ7 B; 4J9D A; 3G4S A; 2QGF B; 3M55 A; 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