The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
59
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structure length |
59
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Chain Sequence |
APWATAEYDYDAAEDNELTFVENDKIINIEFVDDDWWLGELEKDGSKGLFPSNYVSLGN
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structures of invisible, excited protein states by relaxation dispersion NMR spectroscopy
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Structural protein
|
| source organism |
Saccharomyces cerevisiae
|
| molecule keywords |
Actin-binding protein
|
| total genus |
11
|
| structure length |
59
|
| sequence length |
59
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2008-04-30 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2FRY A; 2D8H A; 4R0K A; 2G6F X; 2NUZ A; 4LUD A; 5L23 A; 2FG0 A; 1PRM C; 1QLY A; 2AZS A; 2RQW A; 2YUP A; 1SRL A; 2MOX A; 2EGC A; 2VKN A; 4J9E A; 2KXD A; 1YWO A; 5I22 A; 1LCK A; 1JEG A; 2M51 A; 4LN2 A; 1B3Q A; 2MCN A; 1QKW A; 2D0N A; 4HVU A; 4CC4 B; 1K76 A; 4HXJ A; 2GBQ A; 1G83 A; 2O9V A; 2KRM A; 3I5S A; 4Y92 A; 1ZBJ A; 1K1Z A; 2JMA A; 1B07 A; 1SSH A; 2OI3 A; 3NPF A; 4OMN A; 2DL5 A; 1WA7 A; 4JJB A; 3UA7 A; 1AZE A; 2EGA A; 4AG1 C; 4RTX A; 2DA9 A; 1X2K A; 2RN8 A; 1OOT A; 2ED1 A; 4RTT A; 1PWT A; 4J9B A; 1RUW A; 2YUQ A; 1TG0 A; 1GFC A; 1MV0 B; 1SPK A; 2C0T A; 1TUC A; 3PVQ A; 2CH4 A; 1U5S A; 3EG2 A; 2CUB A; 1T0H A; 1YN8 A; 1U3O A; 1KSW A; 1QCF A; 1VYT A; 4ZNX A; 1J3T A; 1ZLM A; 2K6D A; 1NEB A; 1QWE A; 1RLQ C; 2BZY A; 3H0H A; 3VS0 A; 1H3H A; 1IO6 A; 1U06 A; 2ROL A; 3ULR B; 5ECA A; 2O9S A; 1AZG B; 3TVT A; 2RMO A; 4DEX A; 4LNP A; 2PNI A; 1UG1 A; 3A98 A; 2AKL A; 1W1F A; 3H41 A; 2LJ1 A; 1I07 A; 1S1N A; 2P4R A; 2AZV A; 3U23 A; 2RPN A; 4CC2 A; 4OMQ A; 3EGU A; 1ZUK A; 1WIE A; 1WXB A; 4GBQ A; 1BU1 A; 2CRE A; 2EYY A; 1AEY A; 2K2M A; 2A37 A; 2DBM A; 3FJ5 A; 1WXU A; 2KYB A; 2PZ1 A; 4RUG A; 2RNA A; 4WCI A; 4J9I A; 1ZX6 A; 2L3P A; 2CSI A; 1UHC A; 2EVR A; 4RTW A; 3REA B; 3VRY A; 2O2O A; 2HSP A; 2LJ3 A; 1OPL A; 2LMJ A; 2DIL A; 4Z88 A; 1K4U S; 4RTZ A; 2A08 A; 1KIK A; 4X1V A; 3JV3 A; 3VS2 A; 2GTJ A; 4QT7 A; 2W0Z A; 3SHW A; 1QKX A; 3VS5 A; 2FPE A; 1E7O A; 2EYZ A; 4LE9 A; 2BZX A; 3M0Q A; 4F17 A; 1W6X A; 3RBB B; 1M3B A; 2FO0 A; 2A28 A; 4K11 A; 1GBR A; 2RQR A; 1PNJ A; 1X6B A; 2ED0 A; 2F2V A; 4KRT A; 1UGV A; 2ABL A; 5GJW B; 1WI7 A; 4HCK A; 2DLP A; 1OEB A; 1E6G A; 4DEY A; 1VA7 A; 2J6F A; 2EBP A; 4HVW A; 4F14 A; 1QWF A; 2DNU A; 1HJD A; 1Y57 A; 2EGE A; 2OAW A; 2RQT A; 4J9C A; 2V1Q A; 4J9F A; 2FEI A; 3UF4 A; 5IH2 A; 4J9G A; 3EG3 A; 2HEQ A; 2EQI A; 2QDL A; 1H8K A; 3ZL7 C; 2JT4 A; 3QWX X; 4Z8A A; 3I9Q A; 2CSQ A; 2JW4 A; 1WFW A; 3H0I A; 3THK A; 4GLM A; 1TUD A; 1NM7 A; 1X6G A; 4D8D A; 1X2Q A; 1CKB A; 1GBQ A; 1G2B A; 2V1R A; 2LCS A; 2B86 A; 2X3W D; 1SHG A; 1M3A A; 3EHR A; 1RLP C; 4IIO A; 1NLO C; 1CKA A; 1PKT A; 2FRW A; 1AOJ A; 2CT3 A; 1JXO A; 3M0R A; 3NHN A; 2GNC A; 1ABO A; 2A36 A; 1ABQ A; 2HDA A; 1UHF A; 2KNB B; 2C0O A; 5IHN A; 2KT1 A; 1GCP A; 2DL8 A; 2OJ2 A; 3EHQ A; 1VYV A; 1W70 A; 2JTE A; 2J05 A; 5IXF A; 2F2X A; 1NYF A; 2JS0 A; 1MUZ A; 2GTO A; 2YUO A; 3TSZ A; 1I1J A; 2IIM A; 1NYG A; 1ARK A; 1KFZ A; 4OMO A; 2LQN A; 1XOV A; 1AD5 A; 1UDL A; 4JZ3 A; 2KR3 A; 1X27 A; 1FYN A; 2SRC A; 3R6N A; 1UUE A; 1MV3 A; 5I11 A; 1JXM A; 2JM8 A; 2J06 A; 4EIK A; 1HD3 A; 4CC7 A; 4F16 A; 2DL7 A; 1ZUU A; 4IIM A; 4ORZ A; 1BB9 A; 3M0S A; 4A63 B; 4AFU C; 3PVL A; 1WDX A; 2ROT A; 2FPF A; 1T3L A; 4HVV A; 2DM1 A; 3RNJ A; 3O5Z A; 1HSQ A; 4JJC A; 1K0S A; 1UJY A; 2ECZ A; 2GGR A; 1YCS B; 2DRK A; 3TSW A; 1GRI A; 2SEM A; 1UFF A; 1AWJ A; 2MIO A; 2E5K A; 5HCK A; 3I5R A; 2HCK A; 4RTU A; 4D8K A; 5IXB A; 2BTT A; 1M30 A; 2CUD A; 4M4Z A; 3GBQ A; 4ESR A; 1FMK A; 3VRZ A; 2BZ8 A; 3KFV A; 1SHF A; 4JPB W; 2XMF A; 2KBT A; 1H92 A; 2DYB A; 2KRS A; 2RF0 A; 5FWB A; 1X43 A; 1Z9Z A; 3NMZ C; 2AKK A; 1NLP C; 5EC7 A; 1AWO A; 2GQI A; 2F2W A; 1BK2 A; 1BBZ A; 2X3X D; 2KE9 A; 2DX1 A; 1OV3 A; 2VVK A; 2D1X A; 1A0N B; 2ENM A; 2K9G A; 1JU5 C; 4AFS C; 4AFZ C; 1KJW A; 5IHI A; 1OPK A; 1E6H A; 2I0N A; 2J7I A; 3VS1 A; 3SEM A; 2K3B A; 4LUE A; 4J9D A; 1PHT A; 2JS2 A; 1YWP A; 2LP5 A; 1WYX A; 3VS3 A; 2YSQ A; 2AK5 A; 1UEC A; 2EYW A; 1ZUY A; 2KRO A; 2CT4 A; 3VS6 A; 1EFN A; 1AWX A; 1SEM A; 1K0X A; 2C0I A; 4Z89 A; 1GL5 A; 2W10 A; 2DF6 A; 2YT6 A; 2KT8 A; 2J6K A; 2RQV A; 2EPD A; 1T3S A; 2L0A A; 2VWF A; 2DBK A; 3C0C A; 2O88 A; 5GJV B; 2EW3 A; 3NGP A; 2KYM A; 1Y0M A; 2L2P A; 4AG2 C; 5FW9 A; 2EYX A; 4FSS A; 1ZSG A; 2NWM A; 2ESW A; 1UJ0 A; 3QWY A; 2DL4 A; 1AWW A; 2KXC A; 1VYU A; 1WLP B; 2YDL A; 1N5Z A; 3LH5 A; 1JQQ A; 3M0P A; 3M0U A; 4E6R A; 2CDT A; 4JJD A; 2RQU A; 4OML A; 2LQW A; 1K9A A; 1WX6 A; 2DJQ A; 1UTI A; 1M8M A; 1CSK A; 1GCQ A; 2DRM A; 1GFD A; 1M3C A; 2H8H A; 1AVZ C; 1YNZ A; 2DVJ A; 2FPD A; 3VS4 A; 2L3Q A; 2LZ6 B; 2JXB A; 2LNH B; 4OMM A; 2CH4 W; 2LJ0 A; 1JO8 A; 1NG2 A; 3I35 A; 2HBW A; 1PKS A; 5FWC A; 4J9H A; 1PRL C; 1X69 A; 4JZ4 A; 2JMC A; 3M0T A; 2LX7 A; 2L3S A; 2KGT A; 4CC3 A; 2J6O A; 2DE0 X; 3VS7 A; 1I0C A; 2M0Y A; 4OMP A; 4AFQ C; 3H0F A; 2K79 A; 3IQL A; 2PTK A; 2JM9 A; 1T0J A; 2KEA A; 2D8J A; 2YUN A; 1Z9Q A; 3EG0 A; 5IHK A; 1GCQ C; 1WXT A; 3PE0 A; 2KRN A; 4RTY A; 1RI9 A; 2EKH A; 2DL3 A; 2O31 A; 3REB B; 1M27 C; 1V1C A; 2K7A A; 3CQT A; 3UA6 A; 1YP5 A; 1NEG A; 1SRM A; 4RTV A; 1UE9 A; 3EG1 A; 2DMO A; 3UAT A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2D8H A; 4FSX A; 3AT1 B; 4LUD A; 5L23 A; 1W2B A; 3G1J A; 5KYY B; 1QLY A; 5LJ5 d; 2BUD A; 2YUP A; 4LD6 A; 1SRL A; 5FRM A; 5I21 A; 4QVD A; 1N9R A; 1R8O B; 2L8D A; 1YWO A; 5I22 A; 1TTH B; 4E7I A; 1SKU B; 5GAO p; 5LJ5 e; 2CP5 A; 3CC4 Q; 3O8V A; 1ZQ1 A; 6AT1 B; 2GBQ A; 4FL6 A; 2O9V A; 2QGF B; 4Y92 A; 1PG5 B; 1ZBJ A; 4M75 D; 1SSH A; 2HKQ B; 2PUK B; 2WAC A; 3CCL A; 4RTX A; 2DA9 A; 2DKG A; 3M54 A; 1M9S A; 3TEE A; 3CCV Q; 1RUW A; 1VQ6 A; 3INZ A; 4FT2 A; 1SPK A; 2OAU A; 3CCM Q; 1D3B A; 2JVV A; 4J83 A; 1TUC A; 2CH4 A; 3EG2 A; 1T0H A; 3QPH A; 4RMO A; 3S3N A; 1J3T A; 4XU0 A; 1K8A U; 3P8D A; 4FW1 A; 4XTU A; 1QWE A; 4GLK A; 3GF5 A; 1EIF A; 1H3H A; 3GNG A; 2ROL A; 3MEW A; 1I8F A; 2O9S A; 1C1A A; 4NS5 A; 3OYE A; 4M7D B; 3A98 A; 1BI1 A; 2DXU A; 1YIT A; 3LGF A; 4X34 A; 3VJP A; 2PVO B; 4PJO G; 2RPN A; 2E12 A; 3EGU A; 3EGD B; 1OZ3 A; 4GBQ A; 2EYY A; 2A37 A; 2EQK A; 4J6X A; 2PZ1 A; 1IXD A; 2RNA A; 3RKY A; 2ZPF B; 4WCI A; 1QP2 A; 2RHI A; 1MND A; 4LDX A; 1Q86 R; 3VRY A; 4N4H A; 1S72 A; 3CPF A; 2LMJ A; 1OPL A; 2DIL A; 1M4Z A; 5GAN f; 2LRQ A; 1K4U S; 3WVD B; 3HKS A; 4X9D A; 1V76 A; 4ZGJ B; 4X1V A; 2R57 A; 3JCM V; 4M7D F; 4ZN3 A; 1MHN A; 2V8I A; 1VQP T; 1JRI A; 2JZ2 A; 3SHW A; 3EFO B; 3VS5 A; 2FPE A; 2D9T A; 4LE9 A; 3LYI A; 4E7Z A; 2LCC A; 2KI7 A; 4OF1 A; 2A0F B; 1IB8 A; 1QCO A; 2FO0 A; 2A28 A; 4C0D B; 4K11 A; 4C5H A; 1Q7Y C; 2F2V A; 4CI0 C; 4LDV A; 2CYZ B; 3JCM g; 3JCM W; 2E6Z A; 1G3S A; 5GJW B; 2DLP A; 2KMT A; 3NTI A; 1E6G A; 1KC8 U; 2P0Q A; 3DB4 A; 4HA8 A; 1VA7 A; 3GIB A; 2EBP A; 2FYK A; 4F14 A; 2OTL A; 1Y57 A; 2YHT A; 3V7S A; 1VQ5 Q; 3CCJ A; 2NUT B; 4J9C A; 3ZEH A; 1VQN A; 3J80 E; 1LNX A; 2XID A; 3GNF B; 4HKE A; 5IH2 A; 2VGM A; 2EQM A; 1VQ8 T; 4XTW A; 2QDL A; 3MP8 A; 2JT4 A; 2V8K A; 4LD9 K; 1BI0 A; 3CC2 Q; 1PD1 A; 1R77 A; 4Z8A A; 2QEX T; 5DY9 A; 4AMC A; 1SG5 A; 3BDU A; 4DBF A; 1LVK A; 3A8G B; 2DZ9 A; 4D8D A; 2V1R A; 4JRQ A; 2B86 A; 3FRN A; 4IIO A; 1NLO C; 1KQS A; 2H3J A; 4XK8 E; 4M7A B; 3CC4 A; 1RAH B; 1UGR B; 3OYY A; 3M9Q A; 3QUI A; 4A54 A; 1ABQ A; 2ZPE B; 3MO8 A; 1GCP A; 3JCM c; 2DL8 A; 1W70 A; 2J05 A; 5GMK e; 5D6W A; 1MUZ A; 1W2B S; 2X4Y A; 4LDY A; 2JNG A; 2IIM A; 3CBO A; 3CCV A; 4OMO A; 3CCM A; 1UDL A; 4JZ3 A; 5GMK i; 1UUE A; 1KD1 U; 1D0Z A; 4A53 A; 4JS4 A; 4CC7 A; 2VYT A; 2CZ7 B; 3GOX A; 4M7A F; 1EZZ B; 4BE0 A; 5A0D A; 2G3R A; 4C5G A; 2HZY A; 3G6E T; 4EPC A; 1T3L A; 3RNJ A; 4ZTF A; 3O5Z A; 5FU6 C; 4ZGD B; 3HRS A; 1YCS B; 3TSW A; 4GY5 A; 2SEM A; 3QSU A; 1YJ9 T; 3OB9 A; 1TU0 B; 1Q82 C; 1M30 A; 4RCB A; 4BE1 A; 4ESR A; 1VOM A; 1FMK A; 1KHC A; 4FYW B; 2BZ8 A; 4M77 A; 1SHF A; 4JPB W; 1H92 A; 2K57 A; 2KRS A; 2COW A; 3RMQ A; 5IN1 A; 2DTO A; 1X43 A; 3QO3 A; 1Z9Z A; 3G71 T; 4HCZ A; 3QZ5 B; 2F2W A; 1BK2 A; 4EMG A; 2RJC A; 1JJ2 A; 4M78 A; 2X3X D; 1RAD B; 2OTJ Q; 2KSS A; 2VVK A; 4MZT A; 4KUL A; 2D1X A; 2K9G A; 4RG2 A; 4AFS C; 3UWN A; 2CKK A; 2K3Y A; 3JSC A; 1OU8 A; 2I0N A; 3CCE A; 1O9S A; 4M77 C; 1ZHI A; 5HKC A; 3OQ5 A; 4J9D A; 4JRI A; 4XTZ A; 1YWP A; 1ZA1 B; 1WYX A; 4ZN1 A; 3CCS T; 2AK5 A; 3JB9 I; 2EYW A; 5CAI A; 4EMH A; 3VS6 A; 3HRT A; 4KGV B; 4OB2 B; 3OMG A; 3MCA B; 1VQ9 Q; 2QG9 B; 1N8R C; 3ZFJ A; 3R6O A; 1X6O A; 2C0I A; 2ZPH B; 3FLG A; 1YJW A; 4A4H A; 1VQ5 A; 1K73 R; 3I56 T; 2DF6 A; 1ZSZ B; 2J6K A; 1WHL A; 7AT1 B; 2MK5 A; 4IUP A; 3I55 A; 1NJI C; 2O88 A; 2EW3 A; 3V8J A; 2DAQ A; 3CCU A; 3CC2 A; 4F04 B; 5FW9 A; 2EYX A; 2QK0 A; 5HY6 A; 2P4T A; 1UJ0 A; 1RAI B; 1N5Z A; 3D7S B; 2M9U A; 1F1B B; 1JQQ A; 1RAG B; 1IGQ A; 4JRP A; 1QVG P; 2H8H A; 1AVZ C; 2FPD A; 2PU9 B; 1WGS A; 5GAM f; 1UEB A; 2LNH B; 2CH4 W; 2LJ0 A; 1WJR A; 2HL5 C; 1OI1 A; 2RHY A; 1B34 B; 4M75 G; 1X69 A; 4MZM A; 2JMC A; 2LX7 A; 3GP8 A; 1GXI E; 3MEA A; 5LJ3 f; 2OTL T; 2HBP A; 3T9N A; 2DE0 X; 1XQH A; 3SDZ A; 1VQ7 T; 4AFQ C; 1VQ4 A; 3H0F A; 2K79 A; 2JUF A; 4XU1 A; 2QI2 A; 2HMA A; 2FVU A; 3X28 B; 3DLL A; 3EFS A; 1Z9Q A; 3P8B B; 3QJY A; 5KYU B; 3CCL Q; 4N0A A; 3PE0 A; 2KRN A; 1YI2 A; 2M16 A; 4L59 A; 1YP5 A; 1YHQ T; 1NEG A; 2YRD A; 3QII A; 2E4H A; 2XU8 A; 1WJQ A; 2KQW A; 2GQV A; 2FRY A; 1K9M R; 4C92 A; 1BIB A; 1TSF A; 2QXF A; 4R0K A; 3CCQ Q; 1BI2 A; 4M7D G; 1PRM C; 5GAN j; 3OBY A; 1SSF A; 3EAE A; 2RQW A; 2MOX A; 3OYI A; 1HYO A; 3CC4 T; 3OYB A; 4BAC A; 2VKN A; 4J9E A; 4IUQ A; 1W2B P; 3L2V A; 1BCO A; 2NUP A; 2E3I A; 2R5M A; 5GAN 3; 1K76 A; 4N0A C; 2YLC A; 3CD6 T; 4WTO B; 1K1Z A; 3VU3 C; 4ELY C; 1AZE A; 3UA7 A; 5GAO r; 5KYW A; 2KVQ G; 3QDR B; 3CCM T; 2RN8 A; 4C92 C; 1OOT A; 3JAM E; 1YIT Q; 1Q86 C; 1FXX A; 3MEV A; 4A4E A; 2K5L A; 1ACM B; 1WQ7 A; 4PFZ A; 2YUQ A; 1TG0 A; 2RM4 A; 2QA4 T; 2OTJ A; 2XKO C; 3JCM h; 3PVQ A; 3JCM b; 2C06 A; 2CP3 A; 1ZA2 B; 2CUB A; 2XDD A; 1BKB A; 2P84 A; 4M77 D; 1KSW A; 1ZLM A; 2K6D A; 2F5K A; 2M02 A; 1RLQ C; 2DYI A; 3OW2 A; 2M1H A; 4XAX B; 4M78 D; 5ECA A; 1AZG B; 2JJ9 A; 2RMO A; 3UDC A; 4DEX A; 2VC8 A; 1VQ9 A; 4MMK A; 3H41 A; 2VB6 A; 1S1N A; 2EKO A; 1I5O B; 5KYX B; 2R5A A; 4M78 B; 3JB9 F; 3H6Z A; 3C4S A; 4N4G A; 2K2M A; 2XI9 A; 4J6Y A; 3OYF A; 5GAM d; 1PSE A; 2O4X B; 1KQ1 A; 4IUR A; 5D7U A; 3CPW S; 1UHC A; 5GAM e; 2LJ3 A; 3CCJ Q; 1UB4 A; 2ZPB B; 1NE8 A; 4HCB A; 2V26 A; 1N8R U; 1Q81 C; 4M7A G; 4EMK B; 3JCM X; 4BDZ A; 1M90 R; 3PTA A; 1B7T A; 3QZ9 B; 1VQK Q; 1E7O A; 2EYZ A; 2YRV A; 4FYX B; 3M55 A; 5GAO m; 5LJ3 g; 2BE7 D; 1M3B A; 1NJI U; 3M5A A; 2E1H A; 2DEU A; 1D0Y A; 2RQR A; 1PNJ A; 1X6B A; 5GAN 6; 1V29 B; 3HSB A; 1UGV A; 1WI7 A; 1VQO Q; 1OEB A; 4N4I A; 4DEY A; 4QQG A; 4F7U B; 3LWI A; 1YJN A; 2DNU A; 3RIR A; 2H3E B; 2V1Q A; 3X24 B; 5LJ5 g; 3UF4 A; 3CC2 T; 4J9G A; 3S3M A; 3QJ6 A; 1LJO A; 1M5Q 1; 1EX4 A; 2MYS A; 3PMI A; 2ZPI B; 4M75 B; 4MDW A; 2MI6 A; 2EAY A; 3CCQ A; 3G4S T; 4GLM A; 1TUD A; 5GAN 7; 3Q1J A; 2RHZ A; 5GAN h; 1CKB A; 4PJN A; 1GBQ A; 1G2B A; 4PJL A; 2I2L A; 4M75 E; 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