The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
8
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sequence length |
67
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structure length |
67
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Chain Sequence |
MAIVNQRAVALYDFEPENDNELRLAEGDIVFISYKHGQGWLVAENESGSKTGLVPEEFVSYIQPELE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Transferase, signaling protein
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| molecule keywords |
NAP1-binding protein 2
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| publication title |
Distinct Peptide Binding Specificities of Src Homology 3 (SH3) Protein Domains Can Be Determined by Modulation of Local Energetics across the Binding Interface.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Saccharomyces cerevisiae
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| total genus |
8
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| structure length |
67
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| sequence length |
67
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2011-05-07 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1QWF A; 2FEI A; 3UA6 A; 1E6H A; 1JO8 A; 2DBK A; 2GNC A; 1QKX A; 1M8M A; 2M0Y A; 1QLY A; 2LZ6 B; 1U3O A; 1UJY A; 1X43 A; 1ZUY A; 1HD3 A; 2ABL A; 1U06 A; 4DEX A; 1B07 A; 2LJ0 A; 2VKN A; 3M0P A; 4Z88 A; 1AOJ A; 4RTZ A; 5FW9 A; 1ABQ A; 2J6K A; 1M30 A; 1Z9Z A; 2FO0 A; 2AZV A; 2GBQ A; 3VS2 A; 4X1V A; 2M51 A; 1WX6 A; 3QWX X; 3M0R A; 4FSS A; 2FPD A; 1NLP C; 1WIE A; 2BZY A; 3IQL A; 2JS2 A; 1WA7 A; 1TUC A; 3PVQ A; 1WI7 A; 3I9Q A; 4CC7 A; 1VA7 A; 4CC4 B; 4D8K A; 1TG0 A; 2VWF A; 2QDL A; 1GCP A; 2L3Q A; 2DL5 A; 1K4U S; 2YUN A; 5IH2 A; 1K0X A; 1SRM A; 1SHG A; 1PWT A; 1ZUU A; 1V1C A; 2C0I A; 1AWX A; 2RPN A; 1X6G A; 4RTX A; 4JJD A; 1X27 A; 2X3W D; 2GTJ A; 4HVV A; 2RQT A; 2GQI A; 3A98 A; 2RF0 A; 1OEB A; 2CH4 W; 1E7O A; 1VYT A; 1UG1 A; 2O31 A; 3SHW A; 3H0H A; 1J3T A; 2A08 A; 1M3B A; 1UTI A; 4RTU A; 1AVZ C; 4RTY A; 2ENM A; 1X2Q A; 5FWB A; 1ABO A; 2H8H A; 1AWO A; 1BU1 A; 1T0H A; 4R0K A; 1OPL A; 4J9D A; 2DJQ A; 1I1J A; 4EIK A; 4HVW A; 2HSP A; 4M4Z A; 1IO6 A; 1KSW A; 2FRW A; 2LJ3 A; 4A63 B; 2DVJ A; 1JXM A; 2KR3 A; 3H0I A; 2YDL A; 5FWC A; 4J9G A; 4OMQ A; 1OOT A; 3O5Z A; 3TSZ A; 4ESR A; 3H41 A; 4Z89 A; 2JS0 A; 4JPB W; 3VS6 A; 3LH5 A; 2A37 A; 1AWW A; 3UF4 A; 1RI9 A; 1ARK A; 2EYY A; 1QKW A; 5L23 A; 2DMO A; 1JQQ A; 3TSW A; 5ECA A; 3C0C A; 2MIO A; 2D8J A; 1S1N A; 4F16 A; 4K11 A; 2B86 A; 3RNJ A; 4GLM A; 1Z9Q A; 3H0F A; 3VS7 A; 1I07 A; 1FMK A; 2JMC A; 2EGA A; 2P4R A; 1AEY A; 4RTT A; 1EFN A; 1KJW A; 1PRL C; 1G2B A; 1FYN A; 1RLP C; 4OMM A; 2EPD A; 2EVR A; 4HXJ A; 4AFS C; 2L3P A; 1GL5 A; 2YUQ A; 4QT7 A; 2J6O A; 2JM8 A; 1AD5 A; 2KRM A; 1WLP B; 1AWJ A; 1PRM C; 1NEB A; 2F2W A; 3R6N A; 2EW3 A; 2LX7 A; 1SSH A; 1ZLM A; 2JT4 A; 2X3X D; 1ZBJ A; 4E6R A; 1CSK A; 1NYF A; 2ECZ A; 2MOX A; 1CKA A; 2CT4 A; 2DF6 A; 2RQV A; 2ROL A; 2ED1 A; 4IIM A; 1B3Q A; 2CT3 A; 1Y57 A; 4HVU A; 2CRE A; 3VRY A; 3KFV A; 2CUB A; 1YWO A; 1MUZ A; 1GFC A; 2RQU A; 2FPF A; 2LMJ A; 4OML A; 2A36 A; 2EYX A; 3ZL7 C; 2HDA A; 2L0A A; 3VS1 A; 1E6G A; 1GFD A; 3ULR B; 3CQT A; 1K0S A; 1UUE A; 3NPF A; 2LQW A; 4RUG A; 2C0O A; 2DE0 X; 2KEA A; 1AZE A; 1U5S A; 1M3C A; 2CDT A; 1NYG A; 2PTK A; 1JXO A; 3PVL A; 2HEQ A; 1HJD A; 2AZS A; 2D8H A; 4JJC A; 4ORZ A; 2V1R A; 2DX1 A; 2FG0 A; 4GBQ A; 2C0T A; 4D8D A; 3EG3 A; 5IHI A; 1X2K A; 1YWP A; 2DA9 A; 2F2V A; 1YP5 A; 2K7A A; 2OJ2 A; 3U23 A; 5IXF A; 1UHF A; 3M0S A; 1X69 A; 5I11 A; 2JW4 A; 4CC3 A; 1CKB A; 1XOV A; 2DBM A; 1ZX6 A; 1SRL A; 1RLQ C; 3VS4 A; 3I5R A; 3M0T A; 3FJ5 A; 1K1Z A; 4J9I A; 3EG1 A; 4LE9 A; 2DL4 A; 2NWM A; 4AG1 C; 3EG0 A; 4WCI A; 2BZ8 A; 2ESW A; 2CH4 A; 1ZSG A; 3EG2 A; 4AFU C; 3VS3 A; 2E5K A; 2EYW A; 1H92 A; 3REA B; 1JU5 C; 2FRY A; 2OI3 A; 3NGP A; 3VRZ A; 1YNZ A; 2V1Q A; 4F14 A; 1SPK A; 1WXT A; 3TVT A; 2KBT A; 4LNP A; 2J6F A; 2DNU A; 2CUD A; 1I0C A; 3QWY A; 4AG2 C; 1H3H A; 2KYM A; 1UJ0 A; 2DL3 A; 2NUZ A; 2YSQ A; 1X6B A; 2KXD A; 3NHN A; 1PKS A; 1WXU A; 1G83 A; 3UA7 A; 2VVK A; 2RQR A; 1K76 A; 2LCS A; 4LUE A; 2IIM A; 1BK2 A; 1BB9 A; 1A0N B; 2AK5 A; 2KE9 A; 2KRS A; 1WXB A; 2D1X A; 2RNA A; 1W1F A; 4LUD A; 3JV3 A; 1Y0M A; 2DIL A; 2K2M A; 2A28 A; 4OMP A; 2PNI A; 1W6X A; 2JTE A; 2F2X A; 2PZ1 A; 4AFQ C; 3M0Q A; 3PE0 A; 2GGR A; 1M27 C; 1PHT A; 5EC7 A; 4OMO A; 2DYB A; 2RN8 A; 2KXC A; 4OMN A; 4J9E A; 5I22 A; 2W10 A; 2BTT A; 4F17 A; 1SEM A; 2DRK A; 2EBP A; 4JJB A; 2O9S A; 4Y92 A; 2GTO A; 2W0Z A; 2SEM A; 3I35 A; 4J9F A; 1NM7 A; 2O2O A; 2RQW A; 1UDL A; 1UHC A; 1QCF A; 4RTV A; 3EHQ A; 3GBQ A; 2ROT A; 1K9A A; 1GBQ A; 2BZX A; 4KRT A; 1TUD A; 3NMZ C; 1YCS B; 2I0N A; 4HCK A; 3EGU A; 2K79 A; 2MCN A; 1T3S A; 2O88 A; 1PNJ A; 1KFZ A; 5HCK A; 2LP5 A; 1OPK A; 2K3B A; 2KRN A; 4LN2 A; 2HCK A; 2LQN A; 1UGV A; 2JMA A; 2YT6 A; 2EGE A; 2G6F X; 3RBB B; 1VYV A; 2DM1 A; 2FPE A; 4J9C A; 1AZG B; 1HSQ A; 2K6D A; 2O9V A; 1LCK A; 1SHF A; 2CSQ A; 3REB B; 2ED0 A; 1OV3 A; 4JZ4 A; 1M3A A; 5IHN A; 2KT8 A; 2JXB A; 2AKL A; 1RUW A; 4DEY A; 1WDX A; 4IIO A; 2RMO A; 2KT1 A; 4J9H A; 1T3L A; 2EGC A; 4J9B A; 4Z8A A; 5IHK A; 1MV0 B; 1WYX A; 2DL8 A; 2AKK A; 2J7I A; 1GCQ C; 5GJV B; 1UE9 A; 1NLO C; 2KGT A; 1UEC A; 1UFF A; 2D0N A; 3UAT A; 1YN8 A; 1T0J A; 1BBZ A; 1JEG A; 3I5S A; 4RTW A; 2L2P A; 2KRO A; 5GJW B; 2K9G A; 1GBR A; 1KIK A; 3EHR A; 2KYB A; 2L3S A; 1N5Z A; 2CSI A; 1PKT A; 2EKH A; 2YUO A; 1MV3 A; 2DLP A; 3VS0 A; 4AFZ C; 2EYZ A; 3VS5 A; 2OAW A; 4JZ3 A; 2KNB B; 2HBW A; 1W70 A; 2LNH B; 4ZNX A; 2YUP A; 1QWE A; 3SEM A; 3THK A; 1NEG A; 1VYU A; 2J06 A; 4CC2 A; 1WFW A; 2SRC A; 2EQI A; 2DRM A; 2XMF A; 5IXB A; 1H8K A; 2JM9 A; 2DL7 A; 3M0U A; 2J05 A; 1GRI A; 1NG2 A; 1GCQ A; 2LJ1 A; 1ZUK A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3CCE Q; 2MWP A; 4PJO F; 4PK4 A; 1E6H A; 1JO8 A; 2D9T A; 2GNC A; 1YJ9 A; 1VQK A; 1M8M A; 1QLY A; 2RHU A; 5CKE A; 1U3O A; 1C1A A; 1ZHI A; 4F04 B; 1Q81 C; 3GNF B; 2M0O A; 1OUL A; 1B07 A; 3SWN A; 1AOJ A; 2BE9 B; 4RTZ A; 5FW9 A; 3A8M B; 2FO0 A; 2LT1 A; 3VS2 A; 1I4K 1; 3CCJ A; 4OVA A; 4ZN3 A; 3M57 A; 2FPD A; 3BDL A; 1G5V A; 1NLP C; 2JOY A; 3VJP A; 1RAE B; 4XTU A; 2JS2 A; 1WJR A; 3SWN B; 5GAO n; 1VUB A; 2MWO A; 5HKC A; 2FZK B; 4CC4 B; 2L3Q A; 2XK0 A; 3MPU B; 2VUB A; 3OS1 A; 2YUN A; 5IH2 A; 1N6A A; 2JN0 A; 2OTL Q; 3FJP A; 1C0M A; 2VGN A; 2LNV A; 1RAC B; 2V8K A; 3S3M A; 1X27 A; 2QA4 T; 5KYX A; 3CD6 Q; 3S3O A; 3UT1 A; 1PM3 A; 2FVU A; 1VQL T; 3A98 A; 2RF0 A; 4DBH A; 5A2Q E; 2LCC A; 3C12 A; 1VYT A; 3MKD A; 2ZPI B; 4FW1 A; 3SHW A; 3A8H B; 5KYX B; 1WJS A; 5L8R E; 1X2Q A; 1UGP B; 2H8H A; 1Y96 B; 3OSS C; 3CCE A; 1N9R A; 3CCV Q; 4C8Q C; 5FU7 C; 4M7A C; 4R0K A; 4J9D A; 4EIK A; 1HXD A; 3CMA Q; 2HSP A; 2QGF B; 4FYW B; 1KQS A; 2FRW A; 3SB2 A; 4JDS A; 4A63 B; 4BY6 B; 5CQX A; 4LDY A; 3A8L B; 2YDL A; 5FWC A; 4J9G A; 3PTA A; 3A8O B; 4KUI A; 1OOT A; 4QVC A; 2A37 A; 2E64 A; 3P8B B; 1BI2 A; 5GMK l; 2EYY A; 2M1H A; 1JQQ A; 1AT1 B; 1OZ2 A; 3DB4 A; 2D8J A; 1VQN T; 4QQ6 A; 1MMG A; 3RNJ A; 3NFC A; 3X25 B; 2E4H A; 1Z9Q A; 4FT4 A; 2RB6 A; 3VS7 A; 2V8J A; 1FMK A; 1LVK A; 5A0L A; 1GXI E; 4C0Z A; 3QKJ A; 2DD4 A; 2OTL A; 1G2B A; 3TRE A; 3JB9 D; 1NBE B; 2ZZD A; 1QVF A; 3L2U A; 2O4X A; 3CXC A; 4OMM A; 2JM8 A; 3OW2 S; 1D0Y A; 1NEB A; 3OYG A; 4JS4 A; 2A7Y A; 3OYF A; 3OYN A; 2EW3 A; 1W4S A; 2JT4 A; 4E7L A; 4E6R A; 1CSK A; 2CKK A; 2ECZ A; 1QCO A; 2ROL A; 3QG1 A; 2O4X B; 4BAC A; 3G71 T; 1B3Q A; 1XJW B; 4DBQ A; 4MDX A; 3VRY A; 2P0Q A; 5KYY A; 1YWO A; 4QW2 A; 2R5A A; 5LJ3 e; 2HBP A; 1Q95 G; 4OB1 B; 2EAY A; 2LQK A; 4BI8 B; 3RES A; 1M1K U; 2COZ A; 3CMA A; 1E6G A; 1IZ6 A; 2DTI A; 3HRS A; 5KYU A; 3CC2 T; 5LJ3 j; 2C0O A; 4FSX A; 3BY7 A; 2KEA A; 2YRD A; 5CK9 A; 1EZZ B; 2HEQ A; 1HJD A; 4JJC A; 3JCM f; 4ORZ A; 1QVG P; 4M75 C; 3PMT A; 2LQ8 A; 3EH2 A; 3GF5 A; 4EMK C; 3EG3 A; 4HKE A; 5HK3 A; 5KYU B; 2JTM A; 1VQ9 Q; 3X24 B; 3EAE A; 1WHJ A; 1VQP T; 1X69 A; 2V8I A; 3OS0 A; 4HT9 A; 2JVV A; 2DXT A; 2DBM A; 1ZX6 A; 3PMI A; 1SRL A; 1RLQ C; 3VS4 A; 1B34 A; 4ZGJ B; 3FJ5 A; 1YFN A; 3TQ7 P; 4FYY B; 4LE9 A; 1K9M R; 1K8A R; 3EG0 A; 1RL2 A; 4PKC C; 5I21 A; 1D3B A; 2E6N A; 4PJO C; 1LPL A; 4PLL A; 1MHN A; 2KVQ G; 1F1B B; 1B34 B; 1MMD A; 1YJW Q; 1JU5 C; 2FRY A; 3NGP A; 2X51 A; 2CS7 A; 1Y7X A; 3CC4 T; 4OP0 A; 1N27 A; 1KG1 A; 3QUI A; 2M02 A; 4PJL A; 3CPW S; 1M2V A; 2E65 A; 4LNP A; 4QKU A; 2J6F A; 2CUD A; 2YXY A; 3QWY A; 3M54 A; 1H3H A; 4J6Y A; 2ATC B; 1X6B A; 3N5B B; 3EGX B; 3J80 E; 4X9D A; 1M2V B; 4M77 E; 5KCH A; 3LW5 E; 1JJ2 S; 5I2M A; 2IIM A; 4M77 D; 1BB9 A; 2A3L A; 4C8Q A; 4M7A A; 4QVD A; 2AK5 A; 2D1X A; 2RNA A; 3LH0 A; 4OGC A; 2VV5 A; 3JV3 A; 1Y0M A; 4OMP A; 1YIT T; 2JTE A; 2KMT A; 3M0Q A; 2K2V A; 2EJF A; 1OX8 A; 2DIQ A; 4C8Q B; 1PHT A; 5FU7 B; 4M7A B; 5EC7 A; 1S72 T; 4OMO A; 1VQ9 A; 1KQS P; 4VUB A; 1H64 1; 2JUF A; 4J9E A; 3HFO A; 2OAU A; 5I22 A; 2K5I A; 2BTT A; 4RMO A; 1Q82 U; 3HPW A; 2H3J A; 4F17 A; 4IKF A; 2DRK A; 4JJB A; 4J83 A; 2SEM A; 1NM7 A; 2RQW A; 3DB3 A; 1W2B A; 1G3T A; 4IUT A; 1UDL A; 2IG0 A; 4RTV A; 1KHC A; 3ZBD A; 3GBQ A; 4XTX A; 4KRT A; 2CP3 A; 2CP2 A; 1YJW A; 5AYF A; 1FXX A; 1YJN Q; 4KUD K; 1YCS B; 4ZTF A; 3KUF A; 4HCK A; 3EGU A; 3C94 A; 2OTJ Q; 2MCN A; 3QBY A; 4N4H A; 3O8V A; 1QVF P; 2KI7 A; 1PNJ A; 3I56 T; 2NUT A; 3QDR B; 2K3B A; 1SF9 A; 2HCK A; 2LQN A; 1M1G A; 1UGV A; 2KAF A; 2YT6 A; 3OYL A; 1PSF A; 3J7A F; 1OYX A; 3E1S A; 4OB0 B; 4J9C A; 1HSQ A; 2K6D A; 5GAN 2; 2AT1 B; 2NUT B; 2QQB A; 1BCM A; 3REB B; 3X26 B; 1M3A A; 5D6X A; 3EFS A; 5IHN A; 3HFN A; 3C4S A; 1MMA A; 1WDX A; 2NUP A; 2O01 E; 1DJ7 B; 1T3L A; 2EGC A; 1VQO T; 2AKK A; 4RCC A; 4IUV A; 4M75 A; 2KGT A; 1VQ5 T; 1YN8 A; 1BBZ A; 4EMK A; 2EJG A; 1WQW A; 3I5S A; 2K9G A; 4E7H A; 1GBR A; 2LDM A; 2NUP B; 1NJI C; 3MET A; 1Q7Y U; 2YUO A; 1MV3 A; 2QEX Q; 2JTF A; 4M75 B; 1KD1 R; 4EMK B; 3CCQ T; 3BDU A; 4KGV B; 3RER A; 2WAC A; 4BB7 A; 3M4Y A; 4ZNX A; 5CO7 A; 4PFO A; 3THK A; 2XDB A; 1YJN A; 5DM7 R; 1QVF S; 4M78 E; 3CXC S; 5IXB A; 2JM9 A; 2QTV A; 1TUG B; 2DL7 A; 4C8Q F; 4JRP A; 4M7A F; 2OTJ A; 1GCQ A; 2LJ1 A; 1ZUK A; 3LX7 A; 1QWF A; 3UA6 A; 1WGS A; 1WJQ A; 2HD0 A; 2ZPE B; 4DBR A; 4FIB A; 3CBO A; 1UJY A; 1ZUY A; 2BKD N; 4M7D E; 3HSB A; 2R57 A; 3FRN A; 4M7D D; 5GAM h; 4DEX A; 3L2W A; 4XQ3 A; 2L89 A; 4PL6 A; 1HK9 A; 4B9X A; 2J6K A; 1UB4 A; 4HCZ A; 1K9M U; 2RJD A; 4O5V A; 4X1V A; 2M51 A; 2DET A; 3OA6 A; 4BY6 C; 2P84 A; 3QO3 A; 1KK7 A; 4KT0 E; 1BI0 A; 1K73 R; 5I2S A; 1TUC A; 5GAN 5; 4XTW A; 4CC7 A; 3VYG A; 3WVD B; 3ER0 A; 5IT9 E; 2LT4 A; 4EMH A; 3QZ5 B; 1V1C A; 3OYE A; 2QEX A; 4RTX A; 5CKB A; 1ACM B; 1I5L A; 3CCL T; 2X3W D; 4DQ2 A; 1FWZ A; 2GTJ A; 4JUV A; 5C6S A; 4N0A C; 3MCA B; 2DFU A; 1BKB A; 1E7O A; 2RJE A; 3CBM A; 3OS5 A; 4Q5W A; 4JRK A; 3UWN A; 5AT1 B; 3UPU A; 3L2V A; 3PNW C; 2MI6 A; 1W2B P; 1VIF A; 3HRU A; 1ABO A; 1IB8 A; 5GAO q; 1M4Z A; 2XID A; 1NPR A; 1M90 R; 4F7U A; 2WSC E; 1O9S A; 4M4Z A; 1KSW A; 1UGS B; 3M4G A; 4XU2 A; 1VIE A; 2KR3 A; 5CCA A; 3A1P A; 1SSF A; 1K9M C; 4OMQ A; 4J7F A; 1K8A C; 3O5Z A; 4M75 F; 2DD5 A; 4JRI A; 3H41 A; 5GAO l; 1JBM A; 2XU8 A; 3VS6 A; 1VQ6 Q; 4IUR A; 2VB6 A; 1RI9 A; 1RI0 A; 4A4F A; 4BE1 A; 2DMO A; 3OYJ A; 3C0C A; 1S1N A; 4F16 A; 1WNL A; 4GLM A; 4GLK A; 2EGA A; 2F5T X; 1PCX A; 3OBY A; 3MEU A; 3QSU A; 1G3S A; 1KJW A; 3CCM T; 1JRI A; 4BD3 A; 3PFS A; 4C92 E; 2XHC A; 5D6W A; 3MJX A; 4C92 D; 4MML A; 2QAZ A; 2YUQ A; 3EG9 B; 4BDZ A; 1PRM C; 3CC4 Q; 1RAD B; 2XG8 D; 3UDC A; 2RHI A; 4R56 A; 1ZLM A; 4M78 A; 4BUG A; 5KE2 A; 1W2B S; 2D0Q B; 1ZBJ A; 3I55 T; 3WVE B; 4OMF B; 2YLB A; 1YBY A; 2ED1 A; 4IIM A; 3KBG A; 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