The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
13
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sequence length |
67
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structure length |
67
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Chain Sequence |
GIDPFTGEAIAKFNFNGDTQVEMSFRKGERITLLRQVDENWYEGRIPGTSRQGIFPITYVDVIKRPL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Second SH3 domain of ponsin solved from powder diffraction
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Signaling protein
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| molecule keywords |
Ponsin
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| total genus |
13
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| structure length |
67
|
| sequence length |
67
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2006-11-30 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2RN8 A; 2RQR A; 2EPD A; 3O5Z A; 1H92 A; 2FEI A; 1ZUU A; 4GBQ A; 4J9D A; 2G6F X; 2DL3 A; 3VS7 A; 4RTZ A; 3IQL A; 2RQW A; 3H0I A; 2D1X A; 3RNJ A; 2L3Q A; 4RTW A; 1RI9 A; 1YWP A; 1UG1 A; 1X6G A; 1SHF A; 4F14 A; 1QCF A; 1EFN A; 1ZUK A; 3I9Q A; 1YNZ A; 2HBW A; 2L0A A; 4J9F A; 1WA7 A; 3VS0 A; 2JMC A; 4E6R A; 1V1C A; 1WXT A; 2JM9 A; 1TUC A; 2GTO A; 1MUZ A; 3H41 A; 1K76 A; 1M3A A; 5FWC A; 2EYY A; 3NPF A; 1UUE A; 2DYB A; 1H3H A; 2YDL A; 4RTT A; 1ZLM A; 2DBK A; 2V1Q A; 1LCK A; 4KRT A; 2D8H A; 2EBP A; 1E6G A; 4LE9 A; 2D0N A; 4GLM A; 2DRM A; 2V1R A; 2DL5 A; 2FPD A; 2W0Z A; 1CKB A; 4J9H A; 4EIK A; 4HXJ A; 1AZG B; 2MIO A; 2FPF A; 1HJD A; 3ULR B; 4JJB A; 2LMJ A; 1XOV A; 1PHT A; 2LZ6 B; 4AFZ C; 2L3S A; 1BK2 A; 2DF6 A; 2EW3 A; 1K9A A; 3VS6 A; 1X69 A; 1G83 A; 1GL5 A; 3SEM A; 4X1V A; 4DEY A; 1IO6 A; 4Y92 A; 2DE0 X; 4ESR A; 1YCS B; 1OEB A; 1U5S A; 2LQW A; 1AZE A; 2OAW A; 4QT7 A; 1S1N A; 1SRL A; 1U3O A; 2CT4 A; 4A63 B; 4CC3 A; 2M0Y A; 2JT4 A; 2J05 A; 4FSS A; 2HEQ A; 2DMO A; 1OPK A; 1UJY A; 3TVT A; 1AD5 A; 1WDX A; 2K6D A; 2KT1 A; 1X27 A; 2J7I A; 2ABL A; 2C0T A; 2JS0 A; 3M0S A; 1JEG A; 1AEY A; 1B07 A; 1UE9 A; 3PE0 A; 3NGP A; 2RPN A; 4AFS C; 2X3X D; 1WLP B; 1PRM C; 2KRS A; 1NEB A; 5IXB A; 1FYN A; 2A28 A; 1CSK A; 1UFF A; 1SSH A; 2CRE A; 1YP5 A; 2EKH A; 1VYU A; 4OMM A; 1RUW A; 2YUQ A; 3ZL7 C; 1SHG A; 2DNU A; 1K0X A; 3NHN A; 2FRW A; 1UHF A; 1WI7 A; 3C0C A; 2HSP A; 3QWX X; 1M3B A; 2EGC A; 1NYF A; 1VYT A; 1ZSG A; 1GFC A; 3H0H A; 2ENM A; 2F2X A; 1WIE A; 2C0O A; 2VWF A; 1ZX6 A; 2DA9 A; 2PTK A; 2O9V A; 5IHK A; 2O9S A; 4CC4 B; 1HD3 A; 1RLQ C; 2AZV A; 5I22 A; 1VA7 A; 2K3B A; 2RQU A; 4M4Z A; 2DL8 A; 2ED0 A; 3EGU A; 3M0P A; 4OMN A; 4IIO A; 1PKT A; 2VVK A; 5GJW B; 1NLO C; 2DLP A; 1QKX A; 5EC7 A; 2K7A A; 2AKL A; 4LN2 A; 2EGA A; 2K2M A; 2L2P A; 2JTE A; 1I1J A; 4Z89 A; 1WFW A; 1M8M A; 2BZY A; 3A98 A; 2RF0 A; 3I35 A; 2ESW A; 3REA B; 1UJ0 A; 2NUZ A; 4JZ3 A; 1N5Z A; 1M27 C; 2A37 A; 2DRK A; 2OI3 A; 2ECZ A; 2GBQ A; 1QWF A; 2O31 A; 4OMQ A; 3R6N A; 1J3T A; 2O2O A; 1Z9Z A; 2JW4 A; 1G2B A; 2KE9 A; 2KXC A; 1ABQ A; 2AKK A; 5L23 A; 4HVW A; 2LX7 A; 4Z8A A; 1W6X A; 2XMF A; 2LJ0 A; 1AVZ C; 1JXO A; 2EVR A; 3VS5 A; 4D8D A; 5IHN A; 1KSW A; 3RBB B; 5FWB A; 1YWO A; 3QWY A; 1UEC A; 2PNI A; 4CC7 A; 1AOJ A; 5IXF A; 1KIK A; 1GCP A; 3M0Q A; 3TSZ A; 4F17 A; 4RTY A; 4JZ4 A; 1U06 A; 2P4R A; 2F2W A; 2CSI A; 3TSW A; 3I5S A; 4JJD A; 4LNP A; 4J9E A; 4RUG A; 2J6F A; 2NWM A; 1M30 A; 1K0S A; 2KXD A; 2DL4 A; 2FO0 A; 1PNJ A; 4R0K A; 2EYX A; 2CT3 A; 2GQI A; 2FPE A; 1E6H A; 4HVU A; 4OMO A; 1ABO A; 1AWX A; 2KGT A; 2EGE A; 1TUD A; 2A36 A; 2IIM A; 3SHW A; 2FG0 A; 2HDA A; 4IIM A; 1NYG A; 4RTX A; 1TG0 A; 2SEM A; 1JQQ A; 1BB9 A; 3EG0 A; 5FW9 A; 2JXB A; 1BU1 A; 1QWE A; 4J9I A; 1W1F A; 3THK A; 3PVQ A; 1GBR A; 2CH4 W; 2ROL A; 2X3W D; 2K79 A; 2KEA A; 4LUE A; 2YT6 A; 1OV3 A; 4JJC A; 1X6B A; 1GCQ A; 5ECA A; 3EG1 A; 2KRM A; 2CDT A; 2KBT A; 2CSQ A; 3PVL A; 1UGV A; 3EHR A; 1B3Q A; 3VRZ A; 1GCQ C; 1AWW A; 4OMP A; 2L3P A; 2OJ2 A; 1WX6 A; 1SEM A; 1JU5 C; 4J9B A; 1NLP C; 2AZS A; 2PZ1 A; 2DVJ A; 2RNA A; 1T3L A; 4LUD A; 2J06 A; 2JM8 A; 2DIL A; 3M0U A; 3UAT A; 4Z88 A; 1NEG A; 1OPL A; 1QKW A; 4K11 A; 3VRY A; 4ORZ A; 4AFQ C; 1PWT A; 2AK5 A; 1GBQ A; 2VKN A; 3JV3 A; 2YSQ A; 4J9G A; 3UF4 A; 1NG2 A; 2B86 A; 2C0I A; 2KYM A; 4F16 A; 1FMK A; 2O88 A; 2HCK A; 1GRI A; 3NMZ C; 2EQI A; 2DJQ A; 2LNH B; 2QDL A; 2RQT A; 1WXU A; 1Y0M A; 1T0H A; 1H8K A; 1MV0 B; 2KT8 A; 1MV3 A; 2KR3 A; 1PKS A; 2EYW A; 1W70 A; 4CC2 A; 4ZNX A; 1PRL C; 3KFV A; 1I07 A; 5GJV B; 2YUN A; 2DM1 A; 2CUB A; 1OOT A; 2KNB B; 2LCS A; 1ZUY A; 1BBZ A; 1T0J A; 2CH4 A; 1E7O A; 2BTT A; 2W10 A; 1UHC A; 1SPK A; 2MOX A; 2KRO A; 2H8H A; 4AG2 C; 1WYX A; 2LJ1 A; 2FRY A; 3VS4 A; 2ED1 A; 2F2V A; 2A08 A; 3UA7 A; 3M0R A; 2I0N A; 4JPB W; 2DBM A; 4AFU C; 1AWJ A; 1X2K A; 2KYB A; 2DX1 A; 3I5R A; 3REB B; 2GNC A; 1RLP C; 2RMO A; 1JO8 A; 3LH5 A; 1GFD A; 4HCK A; 2LP5 A; 1AWO A; 1Y57 A; 3VS2 A; 2J6K A; 1VYV A; 2YUO A; 1KJW A; 3EHQ A; 1UTI A; 1NM7 A; 2D8J A; 4OML A; 1K1Z A; 2YUP A; 1K4U S; 2SRC A; 1X43 A; 1ARK A; 1SRM A; 2DL7 A; 5I11 A; 3CQT A; 4WCI A; 3M0T A; 3EG3 A; 1HSQ A; 4J9C A; 4HVV A; 4AG1 C; 1ZBJ A; 2K9G A; 1KFZ A; 4RTU A; 1Z9Q A; 2LQN A; 1A0N B; 4D8K A; 3VS1 A; 2E5K A; 2GGR A; 2MCN A; 1X2Q A; 1JXM A; 4RTV A; 3GBQ A; 2BZX A; 2JMA A; 3H0F A; 4DEX A; 3VS3 A; 5IHI A; 1T3S A; 3UA6 A; 5HCK A; 5IH2 A; 2M51 A; 2CUD A; 2RQV A; 2EYZ A; 1WXB A; 1CKA A; 1M3C A; 1YN8 A; 3EG2 A; 2LJ3 A; 1I0C A; 2GTJ A; 1QLY A; 3FJ5 A; 1UDL A; 2JS2 A; 2J6O A; 2KRN A; 2BZ8 A; 2ROT A; 3U23 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3O5Z A; 1BCM A; 3CBP A; 3A5Z B; 4GBQ A; 4JRI A; 4J9D A; 3VS7 A; 2HKN A; 1VQ6 Q; 2DVE A; 3JB9 D; 2OAU A; 1YJ9 A; 2L3Q A; 1SHF A; 4DBF A; 1OUL A; 4QW2 A; 4OGC A; 2DXB A; 2OTL T; 3BE3 A; 2HBW A; 1WA7 A; 5CVI A; 2JMC A; 3SWN A; 2QG9 B; 4EMK B; 1V1C A; 1WXT A; 3M59 A; 1Q82 R; 1TUC A; 2FYK A; 2KAF A; 2GTO A; 3QBY A; 4M7A A; 1M3A A; 5FWC A; 3MJX A; 1VQN Q; 2ZCF B; 3NPF A; 4M78 D; 2FHD A; 3SWN C; 1QP3 A; 1UUE A; 1S72 Q; 5A0L A; 1H3H A; 1AHJ B; 4JLI A; 5DY9 A; 4PNO A; 3CCS Q; 4A54 A; 5GAN j; 3M58 A; 2D0N A; 4M7A C; 1R0B G; 2COY A; 3EFR A; 4GLM A; 2DRM A; 1H64 1; 2FPF A; 3JCM h; 4PJN A; 2EW3 A; 4HKE A; 1K9A A; 4N4G A; 5D7U A; 1VQP A; 4M75 A; 3SEM A; 3EFO B; 3JCM b; 3VUB A; 1X75 C; 1IO6 A; 4YTL A; 4ESR A; 2BE9 B; 4E7Z A; 4ZGJ B; 1I5L A; 2Z0W A; 4M75 C; 4MZT A; 4QT7 A; 3WXM B; 5GAM d; 1ZBX A; 3QII A; 2HEQ A; 1UJY A; 2DYI A; 1AD5 A; 1WDX A; 3OYD A; 2EAY A; 1IGU A; 2RHU A; 2K5I A; 5GAN e; 4RMO A; 1Q7Y C; 9ATC B; 2J7I A; 2ABL A; 2C0T A; 5M9O A; 2BIV A; 2DXC A; 2ZPF B; 1JEG A; 3PE0 A; 3NGP A; 2IG0 A; 1Y71 A; 3DLL A; 3BFM A; 2A28 A; 4E7I A; 1SSH A; 2HBP A; 1KG1 A; 2K3X A; 3VJP A; 2DNU A; 1K0X A; 2HSE B; 5KCH A; 4KT0 E; 1X01 A; 1OU9 A; 1UHF A; 2VUB A; 3CXC A; 1VOM A; 2YWW A; 2RHZ A; 4E7H A; 1WI7 A; 3C0C A; 1GXI E; 2DTI A; 3CME A; 1GFC A; 3PMI A; 4C0D C; 2F2X A; 3M57 A; 3OYF A; 1W4S A; 3SDZ A; 3VUZ A; 3DB3 A; 2VWF A; 1ZX6 A; 3D7S B; 2PTK A; 2EYQ A; 2LCL A; 3CCV A; 5GAO n; 2EQU A; 1VA7 A; 3TCJ A; 3FLG A; 5LJ5 e; 4E7S A; 1YIT Q; 4OMN A; 1VUB A; 3CC4 Q; 1OX8 A; 5CAI A; 2I2L A; 2PUO B; 5GJW B; 2DLP A; 2NUP B; 2O4X B; 1WHH A; 2CP3 A; 1QKX A; 3CCU T; 3LGF A; 3MCA B; 3CCE Q; 4LN2 A; 4R56 A; 4JRQ A; 2DTO A; 3NTK A; 2L2P A; 1PC0 A; 1I1J A; 3CPW P; 3JCM d; 2PVO B; 2BZY A; 3A98 A; 3CMA A; 2RF0 A; 3I35 A; 3L2V A; 2MF2 A; 3OMC A; 3E1S A; 3CD6 T; 1B7T A; 1VQ9 Q; 1JRI A; 2ZZD A; 3GPL A; 1M27 C; 5GMK h; 4M78 G; 1TOV A; 4FL6 A; 3V7C A; 2OI3 A; 1QVP A; 1KQ1 A; 2ECZ A; 4M75 F; 3HKS A; 2CZ6 B; 2QAZ A; 2O31 A; 4OMQ A; 2OTJ Q; 4BUG A; 3PMT A; 1Z9Z A; 4XQ3 A; 3EG9 B; 2YRD A; 1ABQ A; 1YJW Q; 3OYA A; 3G71 T; 1W6X A; 3OQ5 A; 4OB1 B; 2EVR A; 1KSW A; 3RBB B; 5FWB A; 3X26 B; 3CCR A; 5IT9 E; 1C1A A; 5DM7 R; 4KH1 B; 4C92 G; 2M1H A; 1YI2 Q; 2KMT A; 3DLM A; 4J6Y A; 4TVR A; 4WF2 A; 4PJO A; 2L89 A; 4KBM B; 4DBQ A; 3TSW A; 1SSF A; 4RUG A; 4BB7 A; 1RAD B; 2NWM A; 5KYN A; 1M30 A; 4BY6 C; 4C8Q A; 1VIE A; 1XNI A; 5J39 A; 4IKF A; 2FPE A; 2VAS A; 1Q81 C; 2RI5 A; 4ZTJ A; 2EGE A; 3TQ7 P; 4NL3 A; 2A36 A; 4C8Q C; 5D6W A; 1NYG A; 2GCX A; 1QCO A; 1I81 A; 1YIJ Q; 3RR6 A; 2FZG B; 1IZ6 A; 2JXB A; 1BU1 A; 2JUF A; 4ELY C; 2LCC A; 1WHL A; 1GBR A; 2CH4 W; 3LYI A; 4M7D D; 2KEA A; 4LUE A; 4XTU A; 1Y7X A; 2CDT A; 2RI2 A; 3JB9 J; 1G3S A; 3FB9 A; 1VQK A; 3RUX A; 3EAE A; 2L5Q A; 1VQM A; 3L2Q A; 1AWW A; 5J3B A; 5LJ3 f; 1SG5 A; 1SEM A; 2QQB A; 1JU5 C; 8AT1 B; 2E5Q A; 2AZS A; 4J5Y A; 1XJW B; 3V8J A; 3X25 B; 4PJM A; 1VQ6 A; 1OPL A; 1Q81 U; 5GAN 3; 4K11 A; 1M1K C; 1TWB A; 4ORZ A; 5DLO A; 1PWT A; 3UDC A; 3JV3 A; 2YSQ A; 3EFS A; 3Q1J A; 2C0I A; 5GAN 6; 2CZ7 B; 4JRK A; 2QDY B; 3ME9 A; 3CC7 T; 1MMD A; 1W2B A; 1ZA1 B; 1VQ5 T; 1WZO A; 2QEX T; 4ZN3 A; 2HQH A; 3QKJ A; 4C92 F; 1VQN A; 1S72 A; 1K8A C; 4C0G A; 1MV0 B; 4A4H A; 3CCS A; 1QVF A; 1PKS A; 1MGQ A; 5EG2 A; 2O01 E; 3KFV A; 4V2S A; 3MP8 A; 5LJ5 g; 5A2Q E; 5GAO m; 1KQS A; 2KNB B; 5KCO A; 3PTA A; 2CH4 A; 1WQW A; 5AT1 B; 3TU4 K; 1M1K U; 5KYW B; 1UHC A; 5FU6 B; 3KUF A; 2RO0 A; 2F2V A; 2RJF A; 1V76 A; 1YHQ T; 2WAC A; 4JPB W; 2DBM A; 1X2K A; 4QQG A; 4C8Q F; 3BY7 A; 2DX1 A; 2OX7 A; 3O8V A; 3GNF B; 2KSS A; 1GFD A; 1KHC A; 1Y57 A; 2QYZ A; 1VYV A; 2H3E B; 1KJW A; 1K8A U; 4M78 E; 1K4U S; 2COZ A; 4OF1 A; 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1VQ8 T; 4Y92 A; 4F7U F; 2DXU A; 1YJW A; 2DE0 X; 4OB0 B; 2JOY A; 1YCS B; 2GFU A; 4M75 D; 5CQX A; 1OEB A; 1M1K R; 1AZE A; 2X9H A; 4IUV A; 2R5M A; 3INZ A; 3KXT A; 1SRL A; 3LH0 A; 4HCZ A; 1MHN A; 4FIB A; 5KYU B; 4CC3 A; 3HHT B; 1OI1 A; 2M0Y A; 1PG5 B; 1ZA2 B; 2J05 A; 1FMW A; 3VU3 C; 1YI2 A; 3ZEH A; 1OU8 A; 4MDX A; 3EGX A; 4X9C A; 4M77 A; 2DTH A; 3WVD B; 2YRC A; 3M0S A; 1AEY A; 1B07 A; 2NLU A; 1WLP B; 1PRM C; 2QK0 A; 4M77 C; 2IPO B; 2RHX A; 1OYX A; 1NPP A; 1CSK A; 4EMG A; 3FRN A; 4CRI A; 2EKH A; 1D0X A; 4B6M A; 2YUQ A; 3OA6 A; 3OW2 A; 5GAN 5; 5CK9 A; 3LW5 E; 1XTD A; 4X34 A; 2DO3 A; 2FB7 A; 4FCY A; 3M56 A; 1YJ9 T; 1PCX A; 4NL2 A; 1WIE A; 2C0O A; 2P0Q A; 3OYN A; 3QZ9 B; 3S3O A; 4C0Z A; 2O9S A; 4MDW A; 1HD3 A; 2AZV A; 4J6X A; 1Y07 A; 5I22 A; 4JS4 A; 2EFI A; 2RQU A; 4M4Z A; 2R58 A; 2HAX A; 4RG8 A; 3GIB A; 1NBE B; 3J81 E; 2DEU A; 2VB6 A; 4IIO A; 4B9W A; 3GP8 A; 2X51 A; 1TUG B; 3I55 Q; 2K7A A; 2RH2 A; 2AKL A; 3P8H A; 1VQ4 T; 2YXY A; 3N5B B; 4XU3 A; 2CGH A; 1NZ9 A; 4DOV A; 3RKW A; 3QPH A; 2JZ2 A; 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