The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
12
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sequence length |
58
|
structure length |
58
|
Chain Sequence |
NATFGMGDRVRKKSGAAWQGQIVGWYCTNLTPEGYAVESEAHPGSVHIYPVAALERIN
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structure of the Q67H mutant of R67 dihydrofolate reductase-NADP+ complex reveals a novel cofactor binding mode.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Dihydrofolate reductase type 2
|
| molecule tags |
Oxidoreductase
|
| source organism |
Escherichia coli
|
| total genus |
12
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| structure length |
58
|
| sequence length |
58
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| ec nomenclature |
ec
1.5.1.3: Dihydrofolate reductase. |
| pdb deposition date | 2007-03-13 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 type barrels. |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1VIF A; 3UDC A; 2P4T A; 1VIE A; 3T9N A; 3SFM A; 2GQV A; 2RK1 A; 2RK2 A; 2VV5 A; 2RH2 A; 2OAU A; #chains in the Genus database with same CATH topology 5HKC A; 2RNA A; 3BY7 A; 1Y07 A; 2LRQ A; 1I8F A; 1YHQ A; 4WTO B; 4XU1 A; 4ELY C; 3I55 Q; 3CPW A; 4BAC A; 2QTV A; 2KYM A; 4M75 D; 4RTW A; 1MMG A; 1VQN A; 5GAN j; 4M77 E; 2KEA A; 2Y90 A; 4EIK A; 2X35 A; 1IRX A; 1TTH B; 3RUX A; 3MPU B; 2DEU A; 4NL3 A; 4EMG A; 3OYI A; 2LZ6 B; 1VQL T; 1GBR A; 1ZSZ A; 3TRE A; 3H6Z A; 1JJ2 A; 5GAN f; 1RAF B; 1Q82 R; 4M77 C; 4FT2 A; 4B9W A; 3A8O B; 2LQN A; 3CCM A; 3ASK A; 2MCN A; 3REB B; 4EMH A; 3G1J A; 2HNI A; 4F7U F; 4FSS A; 4MDW A; 5GMK m; 3CC7 T; 4HKE A; 3I35 A; 3OYH A; 1JU5 C; 3JCM X; 2P4T A; 2VGM A; 4M78 C; 1D1C A; 2RQR A; 4RTT A; 3JCM g; 2QYZ A; 5GAO q; 2DJZ A; 2G6F X; 1KQS P; 1WHM A; 3L2V A; 4C92 B; 2E10 A; 2DZC A; 2K2V A; 4HCZ A; 1T3L A; 1M1K R; 2EW3 A; 4M7D D; 2DL7 A; 1VQ8 A; 2LJ1 A; 4LD6 A; 2GBQ A; 2NUT B; 4OP0 A; 5D7U A; 2KSS A; 2BTT A; 2HKN A; 4PJO B; 3EFO B; 4DOW A; 5KE2 A; 1Q86 U; 3QHS A; 2MMP A; 2QQR A; 2XK0 A; 2Y4Y A; 5CR2 A; 3CC4 Q; 2OTL Q; 1QWE A; 2E5K A; 3LGL A; 3CCL Q; 1Q95 G; 3OYF A; 3EHR A; 1ZBJ A; 4M4Z A; 4P5N A; 2QEX T; 1XNI A; 1PHT A; 4F7U G; 4M77 F; 5I2M A; 1BB9 A; 1YJN Q; 2DIG A; 3RNJ A; 2DE0 X; 1NJI C; 4L59 A; 5I11 A; 1WIE A; 1YIT A; 2ATC B; 5GAN h; 2DTH A; 1X69 A; 5KYW B; 1M2V A; 2EBP A; 2QI2 A; 3LWI A; 4D6W A; 3CCE T; 3L2Q A; 1FMK A; 5GAM f; 4M78 F; 1N9S A; 1WXB A; 2DIL A; 2PVD B; 3JB9 F; 4XTV A; 2F5K A; 2M1H A; 2HQX A; 2Z0W A; 2J6F A; 1U8R A; 1OI1 A; 2COW A; 1SPK A; 3OYL A; 3CPW P; 2QXF A; 2O4X A; 2YRV A; 1VQO A; 1R0C B; 5LJ3 g; 2ED1 A; 4KRT A; 3P8D A; 4X9C A; 2EQM A; 4AMC A; 4F04 B; 1S1N A; 2O2O A; 4OF1 A; 3CME Q; 1Q82 C; 4LDU A; 4CC4 B; 2EFI A; 3MP1 A; 4M77 G; 3CCS T; 3VS1 A; 2J06 A; 4E7S A; 3CCQ T; 4HVV A; 4J9F A; 1U3O A; 2G3R A; 1YJ9 A; 4FU6 A; 3JAM E; 4OMN A; 1KHI A; 2BZX A; 4M78 G; 9ATC B; 1XTD A; 3JB9 G; 2RQT A; 1Y71 A; 3L42 A; 1TU0 B; 1BKB A; 2L3S A; 1WXU A; 2DL4 A; 1SEM A; 5GAN 6; 3CPF A; 4A4E A; 3WVD B; 2KRS A; 1VQ9 Q; 2PZ1 A; 3CCU T; 1VQ8 Q; 1VQ4 A; 1KD1 C; 3L2W A; 3OYE A; 2DXT A; 3QYG B; 2FB7 A; 2DF6 A; 3M5A A; 2LP5 A; 1BI0 A; 3EGD B; 4QVD A; 1PKS A; 3EAE A; 1WZO A; 4QVC A; 3MKD A; 4Y92 A; 3JB9 I; 2JVV A; 3INZ A; 3HHT B; 2RHY A; 1N8R R; 1K9M C; 4KUL A; 2HKQ B; 2RO0 A; 2KRN A; 4DBQ A; 2DTO A; 2QAZ A; 2BE9 B; 3E9F A; 4N4I A; 2M51 A; 5KYY B; 4FW2 A; 1Y7X A; 1WPY A; 2DYI A; 1TH7 A; 5GAN 2; 2YUQ A; 1Q81 R; 4PLI A; 4M75 E; 2M16 A; 4RTU A; 4FSX A; 1YIT Q; 1VQ5 T; 2XDD A; 4NS5 A; 4J9G A; 4M7A C; 4AFS C; 1UJY A; 1JXM A; 3CD6 A; 2EQK A; 1JQQ A; 1WHL A; 2K79 A; 2VC8 A; 4X34 A; 3TSW A; 2CUB A; 2LT1 A; 3MP6 A; 1PM3 A; 3KFV A; 4NL2 A; 1K73 C; 3R6O A; 5ECA A; 4LXC A; 1V76 A; 3M4Y A; 1MHN A; 1UJ0 A; 4CRI A; 1VYT A; 4C92 A; 1O75 A; 2CSI A; 1VQO Q; 3C0C A; 5CKH A; 3AT1 B; 1QW1 A; 3MHX A; 2JJ9 A; 2JXB A; 2NUT A; 2KNB B; 1G2B A; 5DM7 R; 2EJF A; 3OS5 A; 2XD0 A; 3JCM f; 3WVE B; 4PJO A; 3PVQ A; 4JRQ A; 3OMG A; 3G4S A; 1GFC A; 4A4F A; 1W4S A; 4BDZ A; 2PVO B; 1XQH A; 1KSW A; 3OYD A; 3PTA A; 4F17 A; 2LCL A; 2VUB A; 1G3W A; 2A36 A; 2DJQ A; 4M7D E; 1KC8 C; 2KRM A; 1S72 Q; 1M90 R; 1H64 1; 2GTJ A; 2DEQ A; 5LJ5 g; 4ZN1 A; 2MWP A; 4HVU A; 3EFS A; 4OMO A; 1IGQ A; 1M4Z A; 2E6N A; 2KRO A; 4M77 D; 4M7A F; 3UWN A; 2RD1 A; 1NG2 A; 2RJF A; 3L2R A; 3VS2 A; 3L1A A; 1N27 A; 1VQ4 Q; 4KUI A; 2CH4 W; 1MND A; 4J9B A; 1HYO A; 3OMC A; 4LUD A; 1WJS A; 5I21 A; 4FYX B; 5J26 A; 3CC2 A; 1QKX A; 4XTW A; 3JRZ A; 2JTE A; 2W0Z A; 1R77 A; 3M0S A; 3RMS A; 1VQP Q; 4M78 D; 4Z89 A; 2CP7 A; 3QII A; 2NUZ A; 3JB9 D; 4KGZ B; 2ABL A; 3L2Z A; 4C8Q E; 5I22 A; 1GCQ A; 1EFN A; 1AVZ C; 2XG8 D; 3M4G A; 4XTZ A; 3DLL A; 1VQK A; 2DFU A; 1ZSZ B; 2IVW A; 2KXD A; 3VYG A; 5LJ3 j; 3PNW C; 3HSB A; 1OQK A; 2BUD A; 2V8J A; 1XOV A; 3S3N A; 5GMK j; 3S3M A; 4YTL A; 3JCM h; 4FCY A; 4UC4 A; 3OBY A; 5LJ3 f; 1M30 A; 2CRE A; 1WDX A; 1BIA A; 3GLX A; 1YI2 T; 1YFN A; 3P8H A; 2K3Y A; 2FO0 A; 4M7A G; 3KBG A; 2AKL A; 3CD6 Q; 5GAO m; 4IUV A; 4ZGJ B; 3DB3 A; 2P0P A; 3PFS A; 1YIJ Q; 1SSF A; 2F2W A; 3NTH A; 3GF5 A; 4J9D A; 4J9E A; 2K57 A; 3SDZ A; 4OMQ A; 1G3Y A; 3M54 A; 1TOV A; 3F70 A; 3EHQ A; 5A0D A; 2KVQ G; 3JCM Q; 3G71 A; 5GJW B; 3JCM P; 3HL8 A; 3OYJ A; 4FYY B; 2HSE B; 4MDX A; 5GAN e; 3A5Z B; 3CXC S; 1W1F A; 1CSK A; 1UGQ B; 1AZG B; 5CK9 A; 1OOT A; 2EIF A; 1PG5 B; 2X4X A; 4BE1 A; 3MJX A; 4JRI A; 4OB2 B; 3MET A; 2D0Q B; 3G4S Q; 4D8D A; 3HRT A; 5GMK l; 5DY9 A; 3RBB B; 3TEE A; 2NWM A; 4C5E A; 2X3W D; 3PGG A; 4V2S A; 1X01 A; 4O6J A; 4LDV A; 2GQV A; 5GAN 4; 2ZPH B; 3QO3 A; 3VKI A; 3AHU A; 3QWX X; 4BI4 A; 5GAM g; 2HDA A; 4MZT A; 2QGF B; 1UHC A; 3M53 A; 2JTM A; 5FW9 A; 1PSE A; 4AT1 B; 1ZQ1 A; 1I0C A; 4C0D C; 1EX4 A; 2E1H A; 4OMM A; 2KBT A; 3QYH B; 5FLX E; 3V7C A; 3JV3 A; 5LJ3 h; 3KXT A; 4CC7 A; 3I55 T; 5GMK h; 2QA4 Q; 2D1X A; 2E6Z A; 1D1A A; 1HSQ A; 3V7R A; 2OAU A; 1V1C A; 4OB0 B; 3VRZ A; 2RI2 A; 5DLQ E; 2V26 A; 3FIF A; 2QQA A; 2VV5 A; 3JCM J; 4ANJ A; 2D6F A; 2AT1 B; 5C0M A; 5A2Q E; 4C0Z A; 4ZGE B; 3BW1 A; 2K3X A; 1VQK Q; 1Q7Y C; 4Q5W A; 1RI9 A; 1CKB A; 1ARK A; 4F7U E; 5A0G A; 3OYB A; 3QXE B; 3CCL A; 2ROT A; 1K9A A; 2HL5 C; 1KJW A; 2V1R A; 4JJN K; 3EFR A; 3M58 A; 1G5V A; 2O9S A; 1VUB A; 3TQ7 P; 1YJN A; 4BD3 A; 2JW4 A; 2LMJ A; 4RUG A; 1NJI R; 2WSF E; 2BKD N; 2C0I A; 1PC0 A; 2DK3 A; 1VIF A; 3ZBD A; 4PNO A; 2EGE A; 1TWB A; 1NYF A; 2RQW A; 3MEA A; 3ME9 A; 2ENM A; 2M0O A; 5LJ5 j; 5GAN d; 1M1F A; 3A8H B; 2DET A; 4C5G A; 2RJD A; 4RMO A; 4ZTF A; 1ZHI A; 2JUF A; 3QDF A; 3ZEH A; 4HT8 A; 4JDS A; 4M7A D; 1SSH A; 2HEQ A; 4E7K A; 3CC4 T; 2OTL T; 3V8J A; 2FHD A; 2RK1 A; 5CIU A; 5LJ5 f; 1X2K A; 4A53 A; 1UE9 A; 1UG1 A; 5GJV B; 3EH1 A; 3RKW A; 1EZZ B; 1BCM A; 2R5A A; 1WGS A; 1IHW A; 1H92 A; 3E2U A; 4OML A; 5FU6 C; 2FPF A; 4M77 A; 4DQ2 A; 2W10 A; 1FXX A; 5J39 A; 3RDV A; 3CME A; 1WJQ A; 2YWW A; 1K8A R; 2RJC A; 1Y57 A; 2H8H A; 4DOV A; 2WSE E; 4KGV B; 5IXB A; 2XU8 A; 2VB6 A; 1SG5 A; 2QQS A; 4M78 E; 1TUD A; 3FC3 A; 1SKU B; 1M27 C; 1K1Z A; 4XTX A; 4JS5 A; 3UPU A; 1VQ6 T; 1YJW Q; 3HFN A; 2DXC A; 1Q86 C; 4M78 A; 1OV3 A; 1YHQ T; 4BI8 B; 1B7T A; 4II1 A; 3S3O A; 3LYI A; 2EPD A; 2CP3 A; 3A98 A; 4E2F B; 3OYG A; 3RER A; 1VQN T; 2EQI A; 1UTI A; 1OU9 A; 1VQM Q; 4J7F A; 3OYC A; 4N0A A; 4CC2 A; 3NHN A; 2F2X A; 1VQ9 A; 2V1Q A; 4QQ6 A; 2PU9 B; 2YLC A; 1KD1 R; 4HT9 A; 1QLY A; 3CCM T; 1IXD A; 2NYS A; 2EGA A; 3BDU A; 2YRC A; 2LNV A; 1TUC A; 2JMC A; 2HCK A; 5GAM d; 1JEG A; 2BZY A; 2VXE A; 3GNF B; 3WXM B; 5LJ5 h; 4XU0 A; 3CXC A; 2PTK A; 3HRU A; 2HL3 A; 1K9M R; 4E7I A; 2P0Q A; 4IUQ A; 3UA7 A; 1VA7 A; 4GBQ A; 1RAA B; 2D9T A; 3V7S A; 2RPN A; 3T9N A; 1CKA A; 3E9G A; 3VV0 A; 2K5I A; 1GXI E; 2CZ1 B; 5GAM j; 1MUZ A; 3EGX A; 5KYU B; 2P84 A; 4BUG A; 2LNH B; 1U1T A; 2CT3 A; 3ER0 A; 3OW2 S; 4C8Q D; 2E12 A; 1WQW A; 4JJB A; 1M3B A; 4IKF A; 1VQL Q; 3JCM e; 1VQ8 T; 3VUB A; 3O5Z A; 4KT0 E; 3CEY A; 3M0Q A; 3J80 E; 3QG1 A; 4OB3 B; 4BB7 A; 2K4Y A; 1K73 R; 1OEB A; 3I56 A; 3PT9 A; 3PMT A; 1OZ3 A; 2VWF A; 2OTJ A; 3PE0 A; 5CQY A; 5A0L A; 1Z9Q A; 3FRN A; 4RTY A; 3KUF A; 5FWB A; 3A8G B; 1BI2 A; 2AIR B; 2A7Y A; 4KGX B; 3RKX A; 4KH1 B; 1RAD B; 1LNX A; 2EKH A; 4AFQ C; 3OS0 A; 1PWT A; 5L23 A; 4A54 A; 2DIQ A; 1K8A C; 2VVK A; 1YIT T; 1IB8 A; 4DA4 A; 1JO8 A; 2DRM A; 1MGQ A; 4J6W A; 2OI3 A; 4JZ3 A; 1G8X A; 2KGT A; 1VYV A; 2LX7 A; 1KC8 R; 5IHK A; 2JZ2 A; 1NLO C; 1S72 A; 2VGN A; 2E41 A; 2MK5 A; 4FT4 A; 2DL5 A; 3CCV A; 3QDR B; 1LPL A; 3BFM A; 4J9I A; 3EG3 A; 3LLR A; 1VQO T; 4JS4 A; 2DL3 A; 2XID A; 4J5Y A; 4A63 B; 2EGC A; 2EKO A; 1PD1 A; 3JB9 H; 2DVE A; 2CUD A; 5AYF A; 5IXF A; 5EC7 A; 1IZ6 A; 3TU4 K; 2CP6 A; 1UB4 A; 2FZG B; 2FL7 A; 1KHC A; 8AT1 B; 3GNG A; 5GAM h; 1Q82 U; 1ZBX A; 1UEC A; 2V8I A; 1UEB A; 5LJ3 e; 1WNL A; 1VQP A; 1MNE A; 2YXY A; 1X75 C; 1BYM A; 5M9O A; 5GMK e; 5FU7 B; 2ZCF B; 1TUG B; 5GAO l; 1QVG S; 4BE2 A; 3CXC P; 2QGG A; 1SRM A; 2DXU A; 2QDL A; 1C0M A; 4QW2 A; 2DD4 A; 4BY6 B; 1YJ9 T; 4MZM A; 2RH2 A; 1UUE A; 4M7A E; 1XJW B; 4ZTJ A; 4L5G A; 2VYT A; 2PUO B; 2DRK A; 1OU8 A; 2RHI A; 2YUN A; 2RN8 A; 2EYZ A; 2FPD A; 1W6X A; 1AEY A; 2A37 A; 2DL8 A; 3HTR A; 2PUK B; 3JCM b; 1PRM C; 4X1V A; 4Y28 E; 3JCM d; 1M1K U; 4M75 A; 1VQ4 T; 1YIJ A; 1R0B G; 1SRL A; 1WLP B; 3EGU A; 3N5B B; 1QMC A; 1EIF A; 1HK9 A; 3CCS Q; 2X4Y A; 3ZL7 C; 4J8O A; 3I56 Q; 3JB9 J; 2OAW A; 3R6N A; 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2YDL A; 4XAX B; 2X4W A; 3HFO A; 1E6G A; 1WHG A; 4PFZ A; 4M78 B; 1YBY A; 1FMV A; 5LJ5 e; 2CP0 A; 2LC4 A; 3UT1 A; 4PJO F; 2LDM A; 1M9S A; 2K6D A; 4KBM B; 2IIM A; 3CC2 T; 2KXC A; 4RCB A; 1QP2 A; 3CMA A; 4JJC A; 4AG2 C; 3QWY A; 1T3S A; 3CCR A; 2KQW A; 5CVI A; 4IUU A; 3THK A; 1YWP A; 2O01 E; 2RA2 A; 1N8R U; 1H3H A; 1VQK T; 3M0R A; 1KG1 A; 2E70 A; 2XI9 A; 3S6W A; 3P8B B; 2RI3 A; 4J9C A; 2M9U A; 2SRC A; 1QCF A; 2KT8 A; 1N6A A; 1AHJ B; 1Q81 U; 2JMA A; 3CBM A; 4C92 G; 1HJD A; 2B86 A; 4RG2 A; 3EG9 A; 4ZN3 A; 1BK2 A; 1RUW A; 1E7O A; 2NUP B; 3QSU A; 2CGH A; 3X24 B; 5KYN A; 3BDL A; 3VJP A; 5HK3 A; 4FW1 A; 1D3B A; 1YNZ A; 1VQ7 Q; 3EGX B; 4PJO G; 3CCJ Q; 3G71 T; 1M2O A; 1UHF A; 4OB1 B; 3FEO A; 1ZA1 B; 1YJW A; 3G6E A; 1Y0M A; 3OBW A; 1QVF S; 4WF2 A; 4RTV A; 1Q86 R; 1OX9 A; 1OYX A; 1OUL A; 5CKD A; 4BY6 C; 2J05 A; 4Y91 A; 4LNP A; 1WJR A; 2KDS A; 4JUV A; 5FRN A; 2DXB A; 2YUO A; 2MPX C; 2D0N A; 1C1A A; 3PMI A; 3NGP A; 5KE3 A; 1VYU A; 3OW2 P; 1RAB B; 2I2L A; 1VQM A; 2LCS A; 4XTY A; 1NYG A; 1WX6 A; 1D09 B; 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