The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
57
|
structure length |
57
|
Chain Sequence |
ATFGMGDRVRKKSGAAWQGQIVGWYCTNLTPEGYAVESEAHPGSVQIYPVAALERIN
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal Structure of a Type II Dihydrofolate Reductase Catalytic Ternary Complex
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Dihydrofolate reductase type 2
|
| molecule tags |
Oxidoreductase
|
| source organism |
Escherichia coli
|
| total genus |
11
|
| structure length |
57
|
| sequence length |
57
|
| ec nomenclature |
ec
1.5.1.3: Dihydrofolate reductase. |
| pdb deposition date | 2007-10-05 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 type barrels. |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1VIF A; 2GQV A; 1VIE A; 2RK1 A; 2RK2 A; 2OAU A; 3T9N A; 2VV5 A; 3UDC A; 2RH2 A; 3SFM A; 2P4T A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1Y0M A; 5IHI A; 1B34 A; 2LCL A; 5GMK h; 4JRK A; 2RO0 A; 1X6B A; 3L2R A; 3EH2 A; 3DB4 A; 3BE3 A; 2GQV A; 5I21 A; 3EFO A; 2XK0 A; 3VU3 C; 5CKD A; 3JCM J; 2L8D A; 4FW1 A; 3EGD A; 5HK0 A; 1WJR A; 2DNU A; 4AG1 C; 4FT4 A; 5GAN 2; 3L1A A; 1QVF A; 5GAN f; 1WJQ A; 1M5Q 1; 1P92 A; 2GGR A; 4MZP A; 2ECZ A; 5CKE A; 3REA B; 2VYT A; 2YT6 A; 1YIJ Q; 2EYZ A; 4QW2 A; 5FU7 C; 3VRY A; 1S1N A; 1Q7Y C; 1RAI B; 2F5K A; 4HVW A; 3M54 A; 1TOV A; 3CCL T; 3CCQ A; 3L2U A; 1VQ7 A; 2W0Z A; 2DYI A; 2XIC A; 1M1K U; 2FPD A; 1C0M A; 4OB1 B; 3PNW C; 4N0A C; 4FIB A; 1U5S A; 2X3X D; 2CP0 A; 1YHQ Q; 2EW3 A; 2HD0 A; 2C06 A; 4EDU A; 2K2V A; 2B86 A; 1OX9 A; 3CC4 T; 2CUB A; 1VQN A; 1M2V B; 3GLX A; 5DY9 A; 2K57 A; 1Q86 R; 4C5I A; 2XDB A; 3A98 A; 5GMK j; 2BZ8 A; 5CKF A; 4F7U F; 2KVQ G; 1MGQ A; 4TVR A; 1E7O A; 4O6J A; 4F04 B; 2O4X A; 3UT1 A; 1FMV A; 1RAH B; 2O88 A; 1VQ8 T; 1NG2 A; 2F2X A; 3D7S B; 4AG2 C; 1IB8 A; 2MYS A; 3RES A; 1WI7 A; 3G4S Q; 2A08 A; 1EZZ B; 2K79 A; 3DB3 A; 2R58 A; 2QEX A; 3CC2 A; 3CCE A; 2FPE A; 2DEU A; 3G6E Q; 1KHI A; 2MI6 A; 1K1Z A; 3CD6 T; 1AZG B; 5CVI A; 4MML A; 1VQL T; 2RD1 A; 2O31 A; 4M78 B; 3HFN A; 1UHC A; 2KT8 A; 3M59 A; 2DAQ A; 1AZE A; 4ZGE B; 2YDL A; 1RLQ C; 1ZLM A; 1KC8 C; 1KG1 A; 5KYX A; 3ASK A; 4FW2 A; 1IRE B; 1YJW Q; 4PL6 A; 2RI5 A; 3CCM Q; 1VYU A; 2AKL A; 4E7K A; 4OMQ A; 1QVF P; 2CH4 A; 2LMJ A; 1WPY A; 2RJD A; 4BDY A; 4M75 B; 5GJW B; 5LJ3 d; 3QDR B; 2EBP A; 4M7A C; 3G71 T; 1SHG A; 4L6V 5; 1KD1 C; 1AEY A; 3VS2 A; 1WHJ A; 2A36 A; 1H64 1; 1XTD A; 2X4W A; 5DLQ E; 2LX9 A; 4BI8 B; 1BI0 A; 5GJV B; 4B6M A; 3EFR A; 4JRI A; 2A0F B; 2QXF A; 1X6O A; 2CZ0 B; 2PZ1 A; 1S72 Q; 3E9G A; 3FRN A; 1R0C B; 5LJ5 d; 4M7D D; 4OMF B; 2EGC A; 1I4K 1; 2VXF A; 4L59 A; 4KH1 B; 4GY5 A; 4CC2 A; 2DM1 A; 2KY9 A; 1Q81 R; 2JZ2 A; 4CC3 A; 4R0K A; 1KQS S; 3RKY A; 4LDX A; 2HL3 A; 1W4S A; 3URG A; 4EMK C; 1FX7 A; 3NPF A; 1UG1 A; 4N0A A; 1ARK A; 3VS5 A; 4KGV B; 1K8A R; 4E7I A; 2ED1 A; 2MCN A; 4M7D F; 3MEU A; 5CAI A; 3JCM h; 3M0Q A; 3OYH A; 1M4Z A; 1C6V X; 4DOV A; 3S3O A; 3CCU T; 1OI1 A; 3QWX X; 3LWH A; 4C8Q C; 2CGH A; 2A7Y A; 3R6O A; 1HJD A; 2YHT A; 1X43 A; 4Y28 E; 1OEB A; 2DJZ A; 3OY9 A; 3RMQ A; 2MWO A; 4ZTF A; 3KFV A; 1LVK A; 3EH1 A; 4M75 C; 1WIE A; 5IHK A; 2CKK A; 2MWP A; 3NTH A; 2NUT B; 2KI7 A; 1WXU A; 2KR3 A; 1NEG A; 4PFP A; 5GAO p; 1UGQ B; 4JZ3 A; 1OYX A; 4QVZ A; 3S3N A; 3MP1 A; 3X28 B; 1AWO A; 1G3T A; 2HBP A; 2W10 A; 2DRM A; 2WSF E; 3KBG A; 5FLX E; 3QYH B; 1NPR A; 1WA7 A; 1CKA A; 2EYX A; 1D0Y A; 4NL3 A; 1AOJ A; 2EQU A; 1WHH A; 2GTO A; 5KYW B; 2EAY A; 4PK4 A; 2O01 E; 2JM9 A; 4M7A A; 4HA8 A; 2EPD A; 2J06 A; 1N8R C; 4F7U B; 4OGE A; 2FEI A; 3C4S A; 2LNH B; 4DA4 A; 1TTH B; 5CKB A; 1M90 R; 2QGF B; 4BB7 A; 4FT2 A; 1EX4 A; 4JJC A; 1VQ4 T; 3I55 Q; 4KGX B; 2CP2 A; 2OX7 A; 1GCQ C; 2YWW A; 4RTV A; 1MHN A; 1GXI E; 5HY6 A; 1JJ2 S; 1N9R A; 3EG1 A; 1VQ7 Q; 5LJ3 h; 3VS3 A; 2CP3 A; 4DBQ A; 3VS6 A; 4D6W A; 1ZSG A; 2DX1 A; 5GAM e; 1H92 A; 2VB6 A; 4F16 A; 1X6G A; 3CME Q; 2X9H A; 4JLG A; 1LCK A; 2DL3 A; 6AT1 B; 3CXC P; 3OYK A; 4EMK A; 1NEB A; 1BYM A; 2HMA A; 1PKT A; 2JNG A; 5LJ3 f; 2JT4 A; 4XU0 A; 3C94 A; 4M4Z A; 4XAX B; 4N4I A; 1B7T A; 4XTV A; 1AWX A; 3PE0 A; 1PNJ A; 3I5S A; 3OS1 A; 4D8D A; 1TUC A; 3RBB B; 4C92 E; 2FRW A; 2G3R A; 2Y90 A; 3AT1 B; 1U1S A; 2LQ8 A; 1SSH A; 2EQM A; 4C8Q A; 4KRT A; 4PJO A; 3JB9 H; 2YUP A; 3VV0 A; 2LP5 A; 2GFA A; 1ZA2 B; 2AZV A; 2M51 A; 2R5A A; 2RJC A; 4M78 E; 1VQO Q; 3CCE Q; 1VQ5 T; 2P4R A; 5LJ5 f; 1BI3 A; 3M56 A; 1YIT T; 1VIF A; 2R57 A; 4CC7 A; 2M0Y A; 2EKO A; 3NGP A; 2QA4 A; 2E3H A; 1D1B A; 3SWN A; 1MMD A; 1RAA B; 2LQW A; 1M9S A; 5D7U A; 5FRM A; 3CMA A; 3LWI A; 5FRN A; 1UGP B; 2X3W D; 3P8D A; 5KYU A; 3M55 A; 1Q82 C; 1UJY A; 1VQP A; 2CUD A; 3C95 A; 4PJM A; 3JB9 G; 2Y4X A; 3FJ5 A; 2DO3 A; 3TSZ A; 1W1F A; 4PNO A; 4E7Z A; 1M8M A; 3JB9 I; 5IXF A; 4ZTJ A; 2GQI A; 3CPW S; 4J5Y A; 1VQM Q; 5GAN e; 3SB2 A; 1R77 A; 4M7D B; 1D3B A; 4RTT A; 3RIR A; 1N9S A; 3RR6 A; 2QQA A; 2YRC A; 4NL2 A; 4JRQ A; 2P0P A; 1RAF B; 1AHJ B; 4AFU C; 4LN2 A; 1K73 R; 4JRP A; 2RI2 A; 1VIE A; 4XU2 A; 3GNG A; 4N4H A; 3TEE A; 2K7A A; 3QYG B; 3REB B; 3OA6 A; 2XG8 D; 2JTF A; 3SD4 A; 1J3T A; 4RG8 A; 1WHM A; 3RMS A; 2E10 A; 1RUW A; 5A0G A; 1OV3 A; 1Y07 A; 4IUU A; 2KRS A; 4J8O A; 2XD0 A; 4C92 D; 3CCL A; 1IHV A; 2OTJ Q; 1NZ9 A; 2EYY A; 3QPH A; 4ESR A; 3EG9 B; 1RLP C; 3N5B B; 3OYF A; 4XTY A; 1HSQ A; 4M77 B; 3PIO A; 2OAW A; 2E1H A; 4KGZ B; 4ELZ C; 4XU3 A; 3H0F A; 3KUF A; 4M78 D; 2V8K A; 1W2B P; 4XU1 A; 1GRI A; 1RAC B; 3DLM A; 2COY A; 1ZQ1 A; 1Q7Y U; 2KBT A; 5AYF A; 3OBY A; 1MV0 B; 4IKF A; 5IT9 E; 5KE2 A; 4C92 F; 1WQ7 A; 4OMP A; 2ZPF B; 4C0Z A; 2ZPE B; 4E7J A; 2F69 A; 2K9G A; 3CC7 T; 2VUB A; 5IAY A; 2LRQ A; 2M0O A; 4FSS A; 1B3Q A; 3UA7 A; 4RG2 A; 1VQ8 A; 3A8L B; 1QKW A; 3JCM W; 4ZNX A; 2VGM A; 1QQJ A; 4P5N A; 2XU8 A; 3CCS T; 1QMC A; 4F14 A; 3VRZ A; 3QZ9 B; 1HXD A; 2JTM A; 1Q86 C; 1QVG A; 3CD6 A; 3M0S A; 5HK3 A; 1VQL A; 2QG9 B; 5DLO A; 3QO3 A; 3GPL A; 1TXQ A; 1OX8 A; 4ZGD B; 4HCB A; 3CCJ Q; 1X2K A; 2CP5 A; 2O9V A; 4F7U E; 2P0Q A; 2FPF A; 5GAO r; 1I0C A; 2LZ6 B; 4RUG A; 3OW2 A; 4IUQ A; 3OYM A; 3SHW A; 2M02 A; 1LPL A; 4M78 G; 2DL8 A; 1TH7 A; 4A54 A; 1RAD B; 3G71 A; 4Y91 A; 1BCM A; 3OYC A; 5KYY B; 2YSQ A; 1AT1 B; 2QDY B; 1KC8 U; 4C5G A; 4FL6 A; 3HRS A; 4BI4 A; 3BY7 A; 4M75 G; 5GAN 4; 1M3C A; 3I9Q A; 2EQK A; 1WYX A; 1KFZ A; 1Y7X A; 1KD1 U; 1I5L A; 2FZK B; 3S3M A; 3LGF A; 3G1J A; 9ATC B; 1E6H A; 2F5T X; 1QVF S; 5GAM j; 2KRM A; 4MZM A; 5C0M A; 3JV3 A; 1NJI C; 1AD5 A; 2NWM A; 4Y92 A; 2RQR A; 3QII A; 1VQ6 T; 2RI3 A; 2YUQ A; 3RDV A; 2JTE A; 2M1H A; 1ZUY A; 2L3R A; 4MZT A; 4N4G A; 3CCU A; 4GLK A; 2DRK A; 2P0K A; 1RAB B; 1XOV A; 4D8K A; 1JQQ A; 3HRU A; 3PVL A; 2XDP A; 1IXD A; 3PMT A; 1U1T A; 1PWT A; 2BE7 D; 2LJ3 A; 2HKN A; 2O9S A; 1G3W A; 2D9T A; 2RF0 A; 2DD4 A; 4II1 A; 2JS2 A; 3JCM d; 1QVG P; 1Q95 G; 2KRO A; 1WQW A; 4BY6 C; 2CT4 A; 3V7C A; 1K8A C; 2DMO A; 2NLU A; 3G6E T; 2KNB B; 1ZSZ B; 3CMA Q; 2KEA A; 2MIO A; 3JCM g; 1ZX6 A; 1UJ0 A; 1Y96 B; 1O75 A; 3UA6 A; 4E7L A; 2QI2 A; 3A8H B; 1ZUK A; 4LNP A; 1V1C A; 1YI2 T; 1ZBX A; 5CQX A; 3OYN A; 2QQR A; 4M7D E; 1VQK Q; 3EG0 A; 3OW2 P; 4Z02 A; 2E5K A; 5GMK m; 4E2F B; 2FZG B; 4EPC A; 3H0I A; 3CCM T; 2AK5 A; 1GL5 A; 4GBQ A; 1R0B G; 4DBF A; 2JM8 A; 2ZAE A; 4HCK A; 1SHF A; 4IUV A; 1ABO A; 4FSX A; 4MDX A; 2KSS A; 4LXC A; 4C92 B; 3HL8 A; 5L23 A; 4XTW A; 4LE9 A; 4O5V A; 4LUD A; 2DA9 A; 2QDL A; 1VQ4 A; 4E7H A; 4M77 E; 2CS7 A; 4B9W A; 1LNX A; 3X25 B; 3CCL Q; 1PD1 A; 2EJ9 A; 3QWY A; 2DVE A; 2CZ1 B; 4F7U G; 1D1C A; 2FZC B; 1N8R U; 2COZ A; 3EGX A; 2DZ9 A; 2COW A; 3PTA A; 1K0S A; 1M90 C; 1FMW A; 1TS9 A; 3WVD B; 3MET A; 2YRD A; 2PNI A; 1PC0 A; 3CC4 Q; 2YUO A; 4PJO B; 5LJ3 g; 2PUK B; 4DEX A; 2KT1 A; 3LX7 A; 2ENM A; 4RTZ A; 1TUD A; 5CKH A; 4ZN3 A; 1ABQ A; 4J9B A; 4OMO A; 2BZX A; 2A3L A; 3CCR A; 3I56 Q; 3MHX A; 1W70 A; 1VQ8 Q; 2WSE E; 5EG2 A; 2WAC A; 3MEV A; 2LTO A; 4PLI A; 4ME7 A; 2E70 A; 2RNA A; 3CBO A; 2GTJ A; 2QYZ A; 2I2L A; 5J26 A; 1VQ5 A; 5LJ5 g; 1MV3 A; 2KGT A; 4C92 C; 1YIT A; 1VQL Q; 4JZ4 A; 2DBM A; 1NLO C; 2A28 A; 2CP6 A; 1KIK A; 3VUB A; 1BI1 A; 2HEQ A; 1H3Z A; 3CXC S; 1I8F A; 1JXM A; 2EQJ A; 4M78 C; 3KXT A; 3GNF B; 3M0R A; 2HBW A; 3OYG A; 3OYA A; 4WTO B; 3VS0 A; 2ROL A; 4EIK A; 3WVE B; 4A4F A; 3M58 A; 4A53 A; 3EG2 A; 1UB4 A; 1G2B A; 4A4E A; 3OS5 A; 4RCC A; 4OVA A; 4M77 D; 3OYB A; 4RCB A; 1F1B B; 1UE9 A; 2CZ6 B; 1NM7 A; 4XK8 E; 1WHK A; 2AIR B; 4GLM A; 4LDW A; 3OSV A; 2RK2 A; 3JCM f; 2JUF A; 3I55 T; 1WZO A; 1UTI A; 1BCO A; 2D0N A; 4C0F A; 3P8B B; 4RKU E; 5IHN A; 1YJN T; 4ELY C; 3SDZ A; 3HSB A; 1JB0 E; 1ZUU A; 4M7D G; 3RKW A; 5GAO n; 2YXY A; 4M77 F; 1N6A A; 4ORZ A; 2JXB A; 4IUR A; 4R56 A; 4JUV A; 1PSE A; 4HVU A; 3THK A; 3CME T; 2DL5 A; 5GAN 7; 1W6X A; 4BUG A; 5A2Q E; 3L2Q A; 5J39 A; 2DEQ A; 2FVU A; 1T0H A; 4OP0 A; 2CDT A; 1K73 C; 4KBM B; 1JBM A; 1NPP A; 2JVV A; 3AHU A; 3A8O B; 2V8J A; 2EIF A; 2XI9 A; 2RQT A; 1JU5 C; 3V8K A; 1OU9 A; 2ATC B; 3H8Z A; 3PGG A; 3RKX A; 2RJE A; 3PMI A; 3TCJ A; 5KCO A; 2K2M A; 2L0A A; 2X4X A; 4C5E A; 2DXU A; 2HSP A; 1M2V A; 2D0Q B; 1K9M R; 2J6O A; 3O8V A; 3LYI A; 3CCQ Q; 2DXT A; 1OZ2 A; 3IQL A; 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5FW9 A; 4QQ6 A; 1YHQ A; 5A0D A; 2D1X A; 2ABL A; 1RAE B; 3CCV T; 2IIM A; 1MMN A; 2QGG A; 1VQ6 A; 2ZPH B; 2RHZ A; 1K9A A; 4M7A D; 2OI3 A; 3MPU B; 1TU0 B; 1GCQ A; 3V7S A; 2PU9 B; 4DBR A; 4J9F A; 5I22 A; 2E4H A; 1X2Q A; 3M0P A; 2RJF A; 4FU6 A; 2SEM A; 2PVG B; 1NJI U; 1JJ2 P; 3EGU A; 2K3X A; 5M9O A; 1GCP A; 2BIV A; 2IVW A; 3FC3 A; 1MUZ A; 4KT0 E; 1AVZ C; 3G6E A; 2NUT A; 1RL2 A; 4M7A F; 1K76 A; 1M27 C; 2DPP B; 2AZS A; 2L2P A; 3CCJ T; 5FWB A; 2O4X B; 1BU1 A; 1QCN A; 1YI2 A; 1YWO A; 2QAZ A; 2LT4 A; 1YJ9 T; 1Z9Q A; 1D0Z A; 3Q1J A; 4VUB A; 2EGA A; 4KUI A; 3P8H A; 4PJL A; 2HAX A; 3GIB A; 1K8A U; 3QKJ A; 1EFN A; 1XJW B; 3CCM A; 4LDU A; 2DTH A; 3SFM A; 1BKB A; 1M2O A; 1VYV A; 2DBK A; 2FG0 A; 4M7D C; 5IXB A; 2RHY A; 5CQY A; 2F1L A; 5KYW A; 2ROT A; 2RQW A; 4BE0 A; 4PJO D; 1QVG S; 3F70 A; 1YN8 A; 3NFC A; 2L5Q A; 5KYX B; 2DIQ A; 2EKH A; 4F7U A; 4QKU A; 5GAM h; 2EYW A; 5GAO q; 4LD9 K; 4Z89 A; 2YRV A; 1SEM A; 2Y4Y A; 3QBY A; 3OYJ A; 1T3S A; 1K0X A; 2C0O A; 3HP9 A; 5CR2 A; 3FLG A; 2FO0 A; 2E6N A; 3MCA B; 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