The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
12
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sequence length |
58
|
structure length |
58
|
Chain Sequence |
NATFGMGDRVRKKSGAAWQGQIVGWYCTNLTPEGYAVESEAHPGSVQIYPVAALERIN
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal structure of a type II dihydrofolate reductase catalytic ternary complex.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Dihydrofolate reductase type 2
|
| molecule tags |
Oxidoreductase
|
| total genus |
12
|
| structure length |
58
|
| sequence length |
58
|
| ec nomenclature |
ec
1.5.1.3: Dihydrofolate reductase. |
| pdb deposition date | 2007-10-16 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 type barrels. |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2RH2 A; 2RK1 A; 3UDC A; 2P4T A; 2OAU A; 2GQV A; 1VIE A; 3SFM A; 2VV5 A; 1VIF A; 2RK2 A; 3T9N A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4J9F A; 2QEX A; 1WHG A; 1YJW A; 4OMN A; 3G6E T; 5FLX E; 1YJ9 A; 5GJW B; 3H0F A; 1GCQ C; 5KYY A; 4OVA A; 2KRM A; 4F7U F; 4YTL A; 4JJN K; 4C92 G; 4JRK A; 2M16 A; 2CT4 A; 4EIK A; 3LYI A; 4NL3 A; 3DB4 A; 4M7D F; 2GGR A; 3VRZ A; 3R6N A; 1RAC B; 1WXU A; 1M5Q 1; 2ZAE A; 4M77 A; 2RQV A; 3JRZ A; 2EQK A; 3CXC P; 1N27 A; 3M58 A; 1MV3 A; 1M90 R; 2IPO B; 4ESR A; 1NEB A; 1PHT A; 2X3X D; 1Q86 C; 2MOX A; 1UHF A; 2GFA A; 1G3T A; 4C5G A; 3VYG A; 4JZ4 A; 1IHV A; 2L5Q A; 2HL5 C; 4XTZ A; 4EDU A; 5HY6 A; 4A4F A; 1BU1 A; 1QP2 A; 5A0D A; 3ULR B; 2QI2 A; 4J7I A; 5LJ3 h; 3T9N A; 2DO3 A; 2DXT A; 1VQ5 Q; 2ZPE B; 4LDV A; 3QPH A; 3CME T; 1QVF S; 3VV0 A; 4DEY A; 1OEB A; 1B3Q A; 2Y4X A; 3G71 T; 1I07 A; 2HL3 A; 3OBW A; 2QXF A; 2O01 E; 1ZUU A; 1Q7Y C; 4FIB A; 3VS3 A; 3CC7 A; 1EZZ B; 1WHK A; 1Y57 A; 1Q81 U; 5IH2 A; 2KT8 A; 3MEU A; 5IXB A; 2DF6 A; 5LJ5 f; 2XU8 A; 2KBT A; 5D7U A; 2QG9 B; 3I55 A; 1QCF A; 4QKU A; 2YRV A; 3WVD B; 3HL8 A; 2RI5 A; 3F70 A; 1I8F A; 4F7U G; 4D8D A; 3MP8 A; 3JCM J; 1A0N B; 2B86 A; 2EGC A; 2DL8 A; 1B07 A; 3C4S A; 3G6E Q; 2XK0 A; 2AIR B; 4LXC A; 3CC2 T; 4M7D G; 4PKC C; 2PVD B; 3JB9 D; 3BDU A; 1N8R R; 4J9E A; 4M78 D; 4MMK A; 3CEY A; 1G8X A; 2VB6 A; 2KR3 A; 4C0Z A; 4ELZ C; 2JW4 A; 1QWF A; 4NS5 A; 3OA6 A; 3M0T A; 5LJ3 g; 4B9X A; 1VQ7 A; 1KC8 C; 2HSP A; 1S72 Q; 1W1F A; 1JO8 A; 4DA4 A; 1VQ5 A; 1K8A C; 2OI3 A; 2KI7 A; 4HCC A; 2DTI A; 2EGA A; 1X6B A; 2R58 A; 2RF0 A; 1Y7X A; 1WHM A; 4X34 A; 2FHD A; 4PL6 A; 3CCU Q; 4KBM B; 4DOV A; 1X6G A; 3OYL A; 1YIJ A; 1WPY A; 2HDA A; 4XTY A; 1M4Z A; 1M90 C; 2F1L A; 4IUU A; 4LN2 A; 2JS2 A; 2EQU A; 2DTH A; 3CME Q; 2K7A A; 3OYH A; 4C92 B; 2ROT A; 4M75 E; 2KYB A; 1OUL A; 1GCQ A; 4D8K A; 1K9M C; 2KXD A; 2LMJ A; 5GAN h; 2G3R A; 2JMA A; 1U1S A; 1V76 A; 1JEG A; 1OOT A; 3ASK A; 2YLC A; 4PJO G; 2NUT A; 4RKU E; 4KUL A; 4BI3 A; 5GMK i; 1D1A A; 1T0J A; 2RNA A; 2EQJ A; 5GAO n; 2F69 A; 3I56 T; 1CSK A; 1QKX A; 3GF5 A; 1WGS A; 3KUF A; 1TG0 A; 5GAN 3; 2EVR A; 4ZTJ A; 3E9G A; 4XTU A; 5I22 A; 4ANJ A; 3WVE B; 1BIA A; 2C0I A; 1BI2 A; 1G3W A; 1RAG B; 2L3Q A; 3CCJ T; 4XTW A; 4CC7 A; 3GNG A; 5CQX A; 2PUK B; 3OYB A; 1VQL T; 2C0T A; 4UC4 A; 3EFS A; 3CCQ A; 4WCI A; 2J6K A; 2VVK A; 2VXF A; 2RHX A; 1MMD A; 3CC2 Q; 2IG0 A; 1VQP Q; 5J39 A; 1D1C A; 4OF1 A; 1IXD A; 3PVL A; 4QVC A; 2CGH A; 2DET A; 4RTY A; 1Q95 G; 4Z89 A; 4PJM A; 4EMK A; 1QMC A; 2FG0 A; 3CCU A; 1JQQ A; 2BKD N; 2YHT A; 5CKB A; 1K76 A; 2DRM A; 2GQV A; 1IRX A; 2B8A A; 1Q82 C; 2DEU A; 1VQK T; 3V8K A; 5GAN g; 5IT9 E; 2J6O A; 1YJN T; 2ABL A; 2COW A; 3PNW C; 1ZBX A; 4JPB W; 1M30 A; 2HMA A; 2CDT A; 1UGQ B; 2W10 A; 1WX6 A; 1M1K R; 1E7O A; 2BE9 B; 1YIT T; 5GAO m; 4CRI A; 5CKD A; 2DL3 A; 2LT1 A; 3V8J A; 2EYW A; 4A4H A; 4IUQ A; 2LTO A; 3A8O B; 5CK9 A; 5GAM h; 4E7H A; 8AT1 B; 4QW2 A; 3O5Z A; 1OU8 A; 1KIK A; 2RK2 A; 2VWF A; 3NPF A; 2E1H A; 2HQH A; 2GTJ A; 1OYX A; 1VOM A; 2O31 A; 4GBQ A; 4LE9 A; 3H6Z A; 1KQ2 A; 1UE9 A; 2A0F B; 1U5S A; 2J7I A; 5GAN 4; 1PC0 A; 3CCR Q; 2QA4 T; 1VQP A; 1QVP A; 2GFU A; 3OMG A; 2ZCF B; 1AWJ A; 4RTX A; 3CPW S; 1VQM T; 2ROL A; 3EG9 B; 4X9D A; 2DK3 A; 2FPD A; 2E12 A; 3CCS T; 2M51 A; 2OTJ Q; 1MUZ A; 3C12 A; 3MHX A; 1PKS A; 1GBQ A; 1OU9 A; 4KH1 B; 3VS2 A; 2VGN A; 4C8Q G; 2DRK A; 2OAW A; 4RCB A; 3G4S T; 1BKB A; 2MYS A; 1M8M A; 4PK4 A; 2VKN A; 1R0B G; 1OX9 A; 5FWC A; 3OYN A; 3Q1J A; 4ZGD B; 4PJO B; 3MEV A; 6AT1 B; 2QEX T; 1K73 C; 3CQT A; 3CMA Q; 1YJW T; 1ZA1 B; 5D6W A; 3OY9 A; 1WI7 A; 2COZ A; 3JCM e; 1YWO A; 3M0U A; 4FYY B; 3FIF A; 2PZ1 A; 3L2W A; 1FYN A; 2LCL A; 5GMK l; 2DD5 A; 2ZPH B; 4RTV A; 1OPL A; 2K9G A; 4E47 A; 5GAM g; 5KYU B; 3PIO A; 4M78 E; 4M75 A; 1CKB A; 1UEC A; 2CP3 A; 2KDS A; 4M7D D; 1NBE B; 4RTZ A; 2LRQ A; 2YUQ A; 2JS0 A; 1G2B A; 1TU0 B; 4AG1 C; 1FMW A; 1GL5 A; 1QVG S; 2KRS A; 2X9H A; 2H3E B; 1AVZ C; 2FB7 A; 3H8Z A; 4E7J A; 2HKN A; 2NYS A; 7AT1 B; 3BDL A; 2K2V A; 3GOX A; 2JM9 A; 5HCK A; 2BZX A; 1UB4 A; 3C95 A; 4QQD A; 3JCM P; 3EH1 A; 1Q81 R; 4M77 C; 4FL6 A; 4M77 G; 2FRW A; 3NGP A; 1RAI B; 3QDF A; 3OYF A; 1LVK A; 5GJV B; 2CP6 A; 3JSC A; 4JUV A; 2JTM A; 5ECA A; 2QA4 Q; 2CUB A; 5LJ3 d; 3V7S A; 3VS1 A; 2DL7 A; 1RAH B; 3EH2 A; 3CC7 T; 3OW2 S; 3QHS A; 2EYZ A; 2KQW A; 2EKH A; 3CCS Q; 1GXI E; 2CSI A; 5FRO A; 1BI1 A; 1JJ2 A; 3CMA A; 3M0P A; 2Z0W A; 1T0H A; 3I55 T; 1E6G A; 1VYU A; 4XU2 A; 3CD6 Q; 3FJ5 A; 1KFZ A; 3QWY A; 4IUP A; 2X35 A; 4ZGE B; 4M7A D; 1MNE A; 1SHF A; 3OSS C; 4L59 A; 3JB9 I; 1UGP B; 2ZPB B; 2QEX Q; 4QQ6 A; 2ZZD A; 4A53 A; 1ACM B; 4M75 D; 1F1B B; 1YJW Q; 3JCM c; 3JCM f; 3OYD A; 2YUN A; 3ME9 A; 1YJ9 Q; 3PTA A; 2D9T A; 4E2F B; 1BYM A; 1KSW A; 3M59 A; 4DBH A; 1WA7 A; 5EG2 A; 3X20 B; 1H92 A; 2X4J A; 2PUO B; 3JB9 H; 1VQ7 T; 2ATC B; 3X26 B; 4C8Q B; 1GRI A; 4HKE A; 3CCL A; 4ELY C; 1O75 A; 3OS5 A; 1VQ5 T; 2CP2 A; 2R5A A; 3RUX A; 1ABO A; 2X51 A; 1TUC A; 3HP9 A; 3PGG A; 4HT9 A; 4IUR A; 1OQK A; 3SWN A; 2V8J A; 1GBR A; 1RI9 A; 2BIV A; 1YIJ T; 2E70 A; 3EHR A; 1QCN A; 1K9A A; 2CZ1 B; 4RG2 A; 4XTX A; 2YSQ A; 3MP6 A; 1OZ3 A; 1BI3 A; 3L2Z A; 5KE3 A; 3MEA A; 3OYE A; 4ORZ A; 2M9U A; 3I35 A; 2CT3 A; 2EGE A; 4HT8 A; 3QZ9 B; 4ZGJ B; 5KYW B; 4C92 E; 2DKG A; 2JMC A; 2RN8 A; 1AEY A; 5GAN d; 2P0Q A; 1BB9 A; 3MPU B; 1FMV A; 3V8L A; 2FVU A; 8ATC B; 5KYY B; 2LT4 A; 5LJ5 h; 2K3Y A; 3I55 Q; 2ZPF B; 2NUP A; 2RHY A; 4OMF B; 1FMK A; 2RA2 A; 4RCC A; 1KQS A; 1AWW A; 2P4R A; 1UHC A; 3HRU A; 2DJZ A; 2VGM A; 3QYG B; 4F14 A; 4CC2 A; 3EFO A; 2D0Q B; 3EG3 A; 2AHJ B; 1R8O B; 2EWN A; 3CC4 Q; 2HNI A; 4M77 B; 1S72 T; 4LD9 K; 5CKE A; 1X27 A; 3L1A A; 2JOY A; 4BE2 A; 4M78 A; 4QVZ A; 2CRE A; 3OYJ A; 2DJQ A; 3M57 A; 2E6N A; 1OV3 A; 4J9D A; 4JS4 A; 3V7R A; 1JB0 E; 1E6H A; 3EHQ A; 3DB3 A; 2PVG B; 3QJY A; 3CCU T; 4HCK A; 2LDM A; 4BE0 A; 5CQY A; 2D1X A; 3VJP A; 3INZ A; 4JLI A; 1VQ7 Q; 2IVW A; 1TWB A; 5LJ3 e; 3NTK A; 3E1S A; 1JRI A; 5A0L A; 1KHI A; 1WHJ A; 2RHZ A; 2L3S A; 5HKC A; 1M2V A; 5FU7 C; 4L5G A; 3JCM b; 5L23 A; 4EMK C; 5CO7 A; 3E19 A; 1OZ2 A; 4JJC A; 1YIJ Q; 1YHQ Q; 1ZA2 B; 3O8V A; 2ZGW A; 1JJ2 P; 1YFN A; 2K6D A; 2HBW A; 3LX7 A; 4F7U E; 1YCY A; 4RTU A; 2YUO A; 5LJ5 g; 2EQM A; 2QTX A; 4J8O A; 1VQ6 A; 2RQU A; 2EFI A; 4JDS A; 2K79 A; 2RHI A; 2DMO A; 1VYV A; 3C0C A; 2DE0 X; 4M7D E; 4O6J A; 4PJO F; 1IHW A; 3J7A F; 2MWO A; 4OML A; 2MF2 A; 4LDY A; 5GMK h; 3CCV Q; 3VU3 C; 1Z9Z A; 3J80 E; 2FL7 A; 2L3P A; 4JS5 A; 3CC4 A; 1VQ4 Q; 5I11 A; 2V1R A; 2CH4 A; 4OGE A; 2CZ0 B; 3CBM A; 5GAM d; 2JNG A; 2MAM A; 1UDL A; 1VQP T; 3GNF B; 1W2B S; 1ZSZ C; 3GP8 A; 4ATO A; 4J7F A; 3JAM E; 3UF4 A; 2L3R A; 5FRN A; 3A8G B; 5KYX A; 3DLL A; 2QGF B; 1X2Q A; 1UG1 A; 4RTW A; 4Q5W A; 2DXC A; 2KT1 A; 1W70 A; 1RLP C; 3CCQ Q; 1PRL C; 2JZ2 A; 4HA8 A; 3JCM Q; 5FU6 C; 2A36 A; 2RH2 A; 4FT2 A; 1NYF A; 2PQW A; 3MP1 A; 3PMI A; 4A63 B; 1QVF A; 1PCX A; 4KGX B; 2COY A; 1Q86 U; 3QWX X; 1PSF A; 2KMT A; 3QBY A; 3LW5 E; 3MO8 A; 3L2Q A; 5D6X A; 2A3L A; 2RI3 A; 2LQ8 A; 2AKK A; 2DZ9 A; 2LQN A; 3N5B B; 4R0K A; 1U3O A; 1YHQ A; 2LJ1 A; 3M5A A; 2QDY B; 3G7Z A; 2AKL A; 4M7A E; 3M56 A; 2GNC A; 1PWT A; 3CCE Q; 2E10 A; 3LLR A; 1N9S A; 4J9H A; 1MMA A; 3HSB A; 3M4G A; 4BDY A; 5GAN e; 2KXC A; 4HVV A; 2F5K A; 1KD1 U; 4J9I A; 2NUT B; 3EGX A; 1Q7Y U; 2QQB A; 4Y91 A; 4JJD A; 4ME7 A; 2PVO B; 1TS9 A; 1WHH A; 1ZHI A; 5CKH A; 3CCV A; 1BCM A; 1ABQ A; 4BI4 A; 3HFO A; 3HKS A; 3RDV A; 1MMG A; 4OB0 B; 1VQO A; 2H8H A; 1VQ4 A; 2LX7 A; 2FO0 A; 1KQS P; 2J05 A; 2L0A A; 4QQG A; 1NYG A; 3ZEH A; 3SB2 A; 2M1H A; 4C92 A; 2CKK A; 3CCR T; 3L42 A; 4HXJ A; 2DAQ A; 2A08 A; 4M7A C; 2XDP A; 3M0S A; 1RLQ C; 1VQ8 A; 4M75 C; 4RG8 A; 2LC4 A; 4OMP A; 3RER A; 2OTJ T; 2FZG B; 1NG2 A; 1UJ0 A; 1AT1 B; 4C5E A; 1ZLM A; 4TVR A; 1K0S A; 3CCM A; 2LQK A; 3RKX A; 4KUD K; 1LJO A; 5FU7 B; 4MDX A; 4AFQ C; 1XQH A; 1HD3 A; 4LDX A; 4MZT A; 3FC3 A; 1VQ9 A; 4EMK B; 2EBP A; 5CCA A; 3P8H A; 4A54 A; 1CKA A; 2BZY A; 4C8Q F; 1T3L A; 1KC8 U; 2XI9 A; 5CAI A; 3CMA T; 3OYM A; 2E41 A; 3TSW A; 1N8R C; 4V2S A; 5IHI A; 1K8A U; 1UGS B; 1FXX A; 3CCE A; 3S3O A; 5D6Y A; 1TH7 A; 4OMO A; 2PU9 B; 1C6V X; 5IXF A; 1AWO A; 1W4S A; 2LVM A; 3A8L B; 2EYX A; 4FCY A; 2X4W A; 3QII A; 4M4Z A; 4HCB A; 1QP3 A; 4EMH A; 3P8D A; 3MET A; 5GAN 2; 4P5N A; 3PMT A; 2HAX A; 3OYA A; 1T3S A; 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4M7A A; 3PFS A; 5GMK m; 1YP5 A; 1X75 C; 2DBM A; 1TSF A; 2HQE A; 3QKJ A; 2FPF A; 2QQ9 A; 2CP0 A; 3LWH A; 5IAY A; 2A7Y A; 2DEQ A; 3JCM h; 3H41 A; 3LWI A; 5I21 A; 2DYI A; 3ZBD A; 1YI2 Q; 1BI0 A; 1M9S A; 2ECZ A; 2ED1 A; 4BUG A; 5CR2 A; 2SRC A; 2K5L A; 4LNP A; 2HSE B; 3CPW A; 1HJD A; 4AFS C; 3OS1 A; 1M1K C; 3BFM A; 3LH0 A; 3CCL Q; 3NFC A; 4JJB A; 2DZC A; 3EG0 A; 1GFD A; 1NLP C; 4A4G A; 3L2U A; 4M78 C; 3JB9 G; 4OB3 B; 2AK5 A; 1WYX A; 4M78 G; 5GAN j; 3HRS A; 4KH0 B; 3OMC A; 2F2W A; 3FRN A; 1NJI U; 2F5T X; 2G6F X; 1S1N A; 2DX1 A; 1SG5 A; 2F2V A; 2MMP A; 4C5I A; 4BI8 B; 2BE7 D; 2GF7 A; 1RAE B; 4EMG A; 1VQ6 T; 1NPR A; 2E4H A; 1PKT A; 3OS0 A; 2EJF A; 3QO3 A; 2DNU A; 2KVQ G; 4Y28 E; 1VQN A; 2D0N A; 2DTO A; 4FT4 A; 4PJO D; 1WXB A; 2O88 A; 1AZE A; 3CC4 T; 4FSX A; 5KH6 A; 2DIG A; 3EFR A; 3L2R A; 1G5V A; 1JXM A; 3RMS A; 4OMQ A; 1BBZ A; 1WIE A; 1PG5 B; 3JCM g; 3S3M A; 1ZX6 A; 3JV3 A; 1MV0 B; 1VQK A; 1M1F A; 3BY7 A; 4BD3 A; 2E3H A; 1QVG A; 4FSS A; 4MML A; 1YI2 A; 3JCM W; 1R0C B; 4X1V A; 1XOV A; 5DY9 A; 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