The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
12
|
sequence length |
58
|
structure length |
58
|
Chain Sequence |
NATFGMGDRVRKKSGAAWQGQIVGWYCTNLTPEGYAVESEAHPGSVQIYPVAALERIN
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal structure of a type II dihydrofolate reductase catalytic ternary complex.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Oxidoreductase
|
| molecule keywords |
Dihydrofolate reductase type 2
|
| total genus |
12
|
| structure length |
58
|
| sequence length |
58
|
| ec nomenclature |
ec
1.5.1.3: Dihydrofolate reductase. |
| pdb deposition date | 2007-10-16 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 type barrels. |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1VIE A; 1VIF A; 2RK1 A; 2GQV A; 2VV5 A; 3UDC A; 3SFM A; 2P4T A; 2RK2 A; 3T9N A; 2OAU A; 2RH2 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 5GAM g; 3V8J A; 2OAU A; 1WHG A; 2LQ8 A; 3JCM X; 2O2O A; 3REA B; 4AG1 C; 3G71 Q; 4Y28 E; 2YWW A; 1NPP A; 3C4S A; 2CP0 A; 3HHT B; 3VUB A; 4BB7 A; 1XOV A; 4M78 E; 1ZLM A; 2EGC A; 1R77 A; 2E5K A; 1Y07 A; 3E2U A; 2A37 A; 1U06 A; 1TTH B; 5LJ3 f; 2R5A A; 3G6E T; 2DK3 A; 1WQW A; 2LMJ A; 4AFQ C; 2PVO B; 4R0K A; 4RTV A; 4J9H A; 1VQ8 A; 4NL3 A; 3THK A; 3TRE A; 1VOM A; 2FZK B; 1G3T A; 3OYI A; 1OI1 A; 2KR3 A; 4OMQ A; 3C95 A; 3DLM A; 2GCX A; 1MUZ A; 1W2B S; 4ZTF A; 1NG2 A; 3PIO A; 4FYX B; 3HRS A; 3CBM A; 1NLP C; 4GLK A; 2X4Y A; 2R58 A; 2E5Q A; 3QUI A; 5CKD A; 5CKF A; 2LDM A; 4JRP A; 5LJ3 g; 1RAI B; 1VYV A; 1PKS A; 5GAN h; 4FT2 A; 4QQ6 A; 4E7K A; 1KC8 U; 2CZ0 B; 1TU0 B; 1G3Y A; 1QVF S; 4M7D C; 5IHN A; 1YWP A; 2LCS A; 3CC4 Q; 2QK0 A; 2EWN A; 4JLI A; 1OU8 A; 1IHW A; 2XIC A; 4WCI A; 2RK1 A; 1Q86 R; 3I5S A; 2QXF A; 3VS1 A; 2X4J A; 5GAO l; 2Y4Y A; 4EPC A; 2XU8 A; 5GAM d; 4FYV B; 1KHC A; 4F04 B; 3I56 A; 3ZEH A; 3OYM A; 2AZS A; 1QQJ A; 4C8Q D; 4QQD A; 3G4S T; 3GIB A; 3VS7 A; 4EMG A; 3BFM A; 1K9M R; 5HKC A; 1VQ4 Q; 4XQ3 A; 1KK7 A; 3JCM f; 2HL5 C; 1IXD A; 4MDX A; 4JLG A; 1ZUY A; 4M78 D; 3UDC A; 1N8R U; 3M0T A; 4JPB W; 2E41 A; 5LJ5 j; 4DBF A; 3TU4 K; 3CC7 Q; 1D1C A; 3KFV A; 3JV3 A; 1VQM T; 3SWN B; 1WXB A; 3VYH B; 1JXM A; 4OMN A; 3E19 A; 1KQ2 A; 5LJ5 e; 1T3S A; 2VC8 A; 3SEM A; 3AT1 B; 2E64 A; 3CD6 T; 4C92 A; 3VRZ A; 1X6G A; 4JDS A; 5CO7 A; 1WNL A; 3JCM g; 4ZN3 A; 2MI6 A; 4IUU A; 5LJ3 d; 2BE9 B; 1RAC B; 3D7S B; 3Q1J A; 5I21 A; 5DY9 A; 5FRN A; 3CCE T; 1GL5 A; 3OS1 A; 1RUW A; 1NJI R; 4WTO B; 3QXE B; 2YUO A; 3OS0 A; 2DJZ A; 1NBE B; 2DAQ A; 2YSQ A; 2BTT A; 5FU7 B; 3CME Q; 1M1K R; 7AT1 B; 5GAO n; 2PVD B; 4PK4 A; 3QHS A; 3RER A; 1YHQ T; 1BIB A; 2KT8 A; 3BE3 A; 4J6Y A; 1VQ8 Q; 2O01 E; 4PJO F; 2JMC A; 2KRO A; 4JJB A; 2QAZ A; 1G3S A; 2OTL A; 4FU6 A; 5A2Q E; 2FZG B; 2GFU A; 2JVV A; 1X43 A; 1PSF A; 4DA4 A; 2YUN A; 4C5H A; 2X51 A; 1AVZ C; 2MYS A; 1NPR A; 2FPF A; 4XU2 A; 3LH0 A; 1K4U S; 4JRI A; 1YI2 Q; 2QA4 Q; 1H3H A; 3G71 T; 4OB3 B; 1J3T A; 4J9C A; 2L2P A; 2P0K A; 3CXC P; 1M1G A; 2KYB A; 2O4X A; 1YJN A; 2VKN A; 3CCL Q; 1G8X A; 1AZG B; 2A7Y A; 2JJ9 A; 4C5E A; 2YXY A; 3M58 A; 1KC8 C; 4N0A C; 2XDD A; 1VQ5 Q; 3OYJ A; 4M4Z A; 2E3I A; 3BDU A; 2YHT A; 1T0J A; 3HRU A; 2M0Y A; 1M3C A; 5GAM j; 4F7U G; 3LWI A; 2LJ1 A; 4MZP A; 1I1J A; 1OYX A; 3CBP A; 2XI9 A; 4PFP A; 2LCC A; 4IKF A; 1SEM A; 2KI7 A; 3EFR A; 3OYC A; 4NL2 A; 3OW2 P; 4BDY A; 2Z0W A; 2PZ1 A; 2D0N A; 1UHC A; 3VS2 A; 2F2V A; 2NUP B; 1K9M C; 5GAO m; 2ZGW A; 3VS5 A; 2JTM A; 4X34 A; 3JCM d; 3RMQ A; 1YJW Q; 3G4S A; 2WSE E; 4M7D D; 3M53 A; 1K73 R; 1WA7 A; 2IPO B; 2X3X D; 2CT4 A; 3MPU B; 5GAN f; 1SG5 A; 2BIV A; 1IO6 A; 4PJO C; 1VIF A; 2KNB B; 2LCL A; 4M75 A; 1ZX6 A; 4RTY A; 1Y7X A; 2XDB A; 4AG2 C; 1M30 A; 4RCB A; 2CSQ A; 2LTO A; 2EVR A; 1FMV A; 3UT1 A; 1Y57 A; 2DM1 A; 2X3W D; 4E7S A; 4JS5 A; 1H3Z A; 2W0Z A; 4BE0 A; 1UJ0 A; 1ZBX A; 1LCK A; 2JW4 A; 2RHU A; 5LJ3 j; 4C0F A; 1GCQ A; 4EMH A; 1T0H A; 1AWJ A; 2K5F A; 3NHN A; 2LC4 A; 5CKE A; 1NJI C; 4C5I A; 4UC4 A; 2GQV A; 2D9T A; 5GAN g; 2HD0 A; 1VQ4 T; 1KQS P; 2QGF B; 4KT0 E; 2C06 A; 2J6K A; 1X01 A; 3OS5 A; 1PD0 A; 5DLO A; 4OB0 B; 1YWO A; 1YHQ A; 2DXB A; 3JCM b; 3OMG A; 2AKK A; 2CUB A; 1YJ9 Q; 4ZGJ B; 3CC7 T; 2PUO B; 2HNI A; 5GMK h; 4X9D A; 1C0M A; 2OTL Q; 3LW5 E; 3CXC S; 2I0N A; 2DNU A; 3FIF A; 1WGS A; 2RD1 A; 1EFN A; 4RG8 A; 4C0D B; 3OYK A; 3PT9 A; 1MV3 A; 2RI5 A; 3OYD A; 5I2S A; 1JXO A; 2BZ8 A; 3JCM V; 2A36 A; 4M77 B; 1AZE A; 4Q5W A; 4BUG A; 2EQJ A; 1KC8 R; 3DB3 A; 3OYN A; 4DOV A; 1N9S A; 2L3R A; 2DBM A; 2CP2 A; 3MEV A; 4KRT A; 3RBB B; 2GNC A; 4J7I A; 4IUT A; 5KE2 A; 2O9V A; 4CC7 A; 1YJN Q; 1VQP T; 3U23 A; 1MMN A; 2OTJ Q; 3OW2 S; 3CME T; 2EKO A; 2EGE A; 1P92 A; 4TVR A; 4EMK B; 1VQ8 T; 3UF4 A; 4LUD A; 4C8Q G; 3HKS A; 4HCK A; 1NJI U; 1OOT A; 1TXQ A; 1UGS B; 3RMS A; 1RAG B; 2D0Q B; 3VRY A; 1NM7 A; 3M55 A; 4DEX A; 5FLX E; 4P5N A; 2CUD A; 2RN8 A; 5M9O A; 4KUL A; 2RK2 A; 2KXD A; 2WSF E; 2WAC A; 3TVT A; 1AEY A; 1YI2 T; 2QA4 T; 2OI3 A; 4RG2 A; 1FX7 A; 2GTO A; 4MDW A; 4CI0 C; 4M78 G; 4CC2 A; 5IN1 A; 4KGZ B; 3G4S Q; 1G2B A; 5GAN d; 4OP0 A; 2X35 A; 3CCL T; 5GJV B; 1N8R R; 2KQW A; 4D8K A; 5AT1 B; 3EG0 A; 4IIM A; 3JB9 J; 1UG1 A; 2GTJ A; 4J7F A; 1FXX A; 4J9D A; 1H64 1; 1VQ5 T; 1BIA A; 1D0Z A; 4A4K A; 3EG1 A; 1QLY A; 3A98 A; 1V76 A; 1RAA B; 4DQ2 A; 5D7U A; 4VUB A; 2NWM A; 3LLR A; 3HPW A; 1D1A A; 3FEO A; 1SSH A; 1OPK A; 3EHR A; 1KQS S; 1HXD A; 3TCJ A; 1I0C A; 2VGN A; 2RQV A; 1ZA1 B; 2I2L A; 1PM3 A; 2L0A A; 3EGX B; 2KYM A; 2W10 A; 3EAE A; 4M77 A; 5IH2 A; 4HVV A; 2YRD A; 5J26 A; 3E1S A; 1OX9 A; 1HJD A; 2QG9 B; 4BDZ A; 4QVC A; 1YJW T; 4OMO A; 4QKU A; 2KE9 A; 3QJY A; 2FPD A; 4J6W A; 4HCZ A; 2BUD A; 1JJ2 S; 1UGV A; 1VQ4 A; 1WQ7 A; 4M7A A; 3NMZ C; 2PVG B; 4PJO D; 2YUP A; 3DB4 A; 2RQU A; 4MZM A; 2AT1 B; 3BY7 A; 2EW3 A; 1D0X A; 3CPW P; 2K4Y A; 2GBQ A; 4EMK A; 4ME7 A; 1LJO A; 1AWW A; 4PFZ A; 1V1C A; 2GQI A; 3S3M A; 4B9X A; 1VQL Q; 1VYT A; 3BW1 A; 1QVP A; 4ZGD B; 2Y4X A; 1MMD A; 3MET A; 4R56 A; 2CH4 A; 2V26 A; 4HT8 A; 2K79 A; 5J3B A; 2VXF A; 4J9G A; 1O75 A; 2DVE A; 2K6D A; 1TUD A; 2FL7 A; 3EG3 A; 5IHI A; 1WHL A; 3OYH A; 1JBM A; 1GFC A; 3HFO A; 1JRI A; 3C0C A; 3PE0 A; 1QP3 A; 3MHX A; 1BU1 A; 1QCF A; 2QQS A; 3A5Z B; 5FRM A; 5HCK A; 3HSB A; 3NPF A; 2MMP A; 3MEW A; 3V7C A; 1Q95 G; 4OB2 B; 1D0Y A; 1I07 A; 4FL6 A; 2DYB A; 1F1B B; 2CKK A; 3WVE B; 4BY6 B; 4C92 F; 1M90 R; 2CP3 A; 1ZUK A; 2H3E B; 1VQP A; 2O88 A; 5IHK A; 1AWO A; 5GAO p; 3KBG A; 4Z8A A; 1MHN A; 3X26 B; 3CME A; 1BI2 A; 5KYW B; 1G3W A; 1WHH A; 1YJ9 T; 1ACM B; 2DF6 A; 3HRT A; 3ZL7 C; 3OS2 A; 1U8R A; 4Y91 A; 5GAN 6; 3ZFJ A; 2OTL T; 2DYI A; 4M7D G; 4FW1 A; 2QTV A; 2BE7 D; 4X1V A; 2EBP A; 3AHU A; 3EGX A; 4IUR A; 1Y0M A; 2F1L A; 2EYW A; 5GAN j; 4AFZ C; 5FU6 B; 1YI2 A; 2QA4 A; 3J81 E; 1N8R C; 3GP8 A; 1QKX A; 4C0G A; 4C92 B; 1YN8 A; 2ECZ A; 4KH1 B; 3CCL A; 3H6Z A; 1YJN T; 5GAN e; 2OTJ T; 3GBQ A; 1X69 A; 4OMM A; 5D6W A; 4RUG A; 1VQ5 A; 3EH2 A; 2PTK A; 3PVQ A; 4XTZ A; 4L5G A; 2ZCF B; 4F17 A; 1MV0 B; 3M54 A; 2LQN A; 1HYO A; 1K8A C; 2DTH A; 3N5B B; 3CCM A; 3M57 A; 1IRX A; 2C0I A; 4JZ3 A; 4K11 A; 1UUE A; 4QVZ A; 4OGE A; 5FW9 A; 1OV3 A; 1H92 A; 4B6M A; 4BE2 A; 1E6H A; 3QII A; 2O31 A; 2DJQ A; 1W6X A; 3HP9 A; 5D6X A; 2RHZ A; 3OYB A; 2RHX A; 3UWN A; 3SFM A; 3DLL A; 1NYG A; 2DZ9 A; 2JXB A; 3MJX A; 2QEX A; 5CVI A; 1KFZ A; 2KSS A; 4C0Z A; 5GJW B; 1YJW A; 2EFI A; 1BBZ A; 3CPW A; 3CCR T; 3HFN A; 3BDL A; 1AWX A; 2PQW A; 5KYX A; 5LL6 S; 3CPF A; 2FHD A; 3QO3 A; 2D8J A; 4A53 A; 2O4X B; 2R5M A; 3EHQ A; 2COZ A; 3V7S A; 1GRI A; 3JB9 H; 1VA7 A; 3LGF A; 1EIF A; 5KYW A; 3M0P A; 4OB1 B; 2MIO A; 4KUD K; 2YRC A; 2E10 A; 1FMK A; 2IG0 A; 2DA9 A; 4Z88 A; 4YTL A; 2NLU A; 3J7A F; 4M7D A; 2CDT A; 2KMT A; 2FRY A; 3QBY A; 2H8H A; 4M75 F; 2WSC E; 2NUT A; 4FCY A; 2KXC A; 2DLP A; 5FRO A; 1C6V X; 1UTI A; 2Y90 A; 4RTX A; 1W70 A; 3A8G B; 3OSV A; 3JB9 I; 4FIB A; 2D8H A; 4ESR A; 1M90 C; 2F5T X; 1MND A; 1CKB A; 3C12 A; 1M27 C; 1K8A U; 1ZA2 B; 4NOY A; 3QYG B; 1ABQ A; 2HSE B; 3E9G A; 4A4E A; 3VKI A; 2XK0 A; 1LOJ A; 3VU3 C; 1VQP Q; 1NE8 A; 2DL5 A; 4ORZ A; 2XDP A; 2L3S A; 4AMC A; 4HA8 A; 5GAN 4; 4N4H A; 1TWB A; 1W4S A; 1I5O B; 1RLP C; 1TUC A; 1YJ9 A; 1NZ9 A; 1PRM C; 2DEQ A; 5KCO A; 4RTZ A; 1VQL T; 4M75 B; 4F16 A; 2IIM A; 3TEE A; 1PCX A; 2RF0 A; 4XTW A; 1PRL C; 1NLO C; 5KCH A; 3I9Q A; 4C92 E; 2QGG A; 3EG2 A; 3PFS A; 3QYH B; 1N6A A; 2QQB A; 5AYF A; 3SWN C; 2CS7 A; 3MEU A; 4Z89 A; 1FWZ A; 1ABO A; 3KXT A; 5KYU B; 2M02 A; 5KH6 A; 3WVD B; 3S6W A; 2EJF A; 4QQG A; 4MMK A; 3H0H A; 3H41 A; 1PNJ A; 5CKH A; 1CSK A; 1UGR B; 3FLG A; 1BI1 A; 3OBW A; 3TQ7 P; 4WF2 A; 5CAI A; 2K3X A; 2BZY A; 2OTJ A; 2FG0 A; 1ZBJ A; 4OGC A; 1BYM A; 2KRS A; 2XHC A; 3GOX A; 3P8D A; 2K3Y A; 1M8V A; 2EQU A; 2C0T A; 4HCC A; 4GBQ A; 2LT1 A; 5FU7 C; 2HAX A; 3HTR A; 4E7Z A; 5A0L A; 3OQ5 A; 1M90 U; 3CCM Q; 4ZNX A; 1WZO A; 4LDU A; 3OYY A; 1AHJ B; 2DIG A; 4KBM B; 2OJ2 A; 4EDU A; 2RI2 A; 1Q82 U; 4V2S A; 1UJY A; 1VIE A; 1M5Q 1; 2DL8 A; 9ATC B; 4PJO G; 5GAM e; 3S3N A; 4LE9 A; 2EYQ A; 2QEX Q; 1GCQ C; 1VQO A; 3MKD A; 5IXF A; 2G6F X; 3CCR A; 1QWF A; 1N9R A; 2A08 A; 2X4X A; 3JB9 F; 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4GY5 A; 3JAM E; 3OYL A; 3LX7 A; 2L3P A; 1QCO A; 1YP5 A; 3L1A A; 3GNF B; 3JRZ A; 3QWX X; 2EYZ A; 2P0P A; 5HY6 A; 2KDS A; 2SEM A; 1Q81 C; 4D6W A; 2B8A A; 1QWE A; 4KUI A; 2JT4 A; 2L89 A; 4M7A B; 1O9S A; 2A0F B; 3A8L B; 2JUF A; 5LJ5 f; 4C8Q B; 2J7I A; 3A8O B; 4AFU C; 3CC2 Q; 3WXM B; 2BZX A; 1MGQ A; 3OYA A; 3EG9 A; 2PU9 B; 2V8J A; 2QYZ A; 5GAN 2; 2L5Q A; 3OYE A; 2K2M A; 2L8D A; 3RIR A; 3VUZ A; 3FRN A; 3CMA T; 2D6F A; 2A28 A; 4M78 B; 1A0N B; 4QVD A; 4C0D C; 2KEA A; 2HBW A; 3L2W A; 1XJW B; 2AK5 A; 2FEI A; 4M77 C; 3H0I A; 1VQO Q; 2EIF A; 1VQK A; 2J6O A; 3M9Q A; 3CCR Q; 3JCM e; 2J6F A; 2OAW A; 3RUX A; 1PWT A; 2DL7 A; 3VV0 A; 2ZPF B; 2RI3 A; 2E3H A; 1UGP B; 3CCV A; 1ZSZ A; 3VYG A; 4E7J A; 2E4H A; 5ECA A; 1K0S A; 1Q7Y U; 2JOY A; 3H0F A; 5HK0 A; 4OMP A; 4M75 D; 3CCM T; 1NEB A; 1R0C B; 1VQN A; 2CZ7 B; 3OB9 A; 3GF5 A; 1MMA A; 2FPE A; 4EMK C; 3L2U A; 5CR2 A; 3VS0 A; 2NUZ A; 2LZ6 B; 3KUF A; 3JCM W; 1UHF A; 4HKE A; 3EFS A; 2E65 A; 2M0O A; 3CCU Q; 1Q81 U; 2NYS A; 1K8A R; 1WIE A; 2RPN A; 1TUG B; 1TSF A; 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